基于网络药理学及体外实验探讨青黄散抗急性髓系白血病的分子机制

目的:基于网络药理学与分子对接技术预测青黄散治疗急性髓系白血病(AML)的潜在活性靶点与信号通路,通过体外细胞实验进一步验证其作用机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)、TargetNet、SwissTargetPrediction数据库获取青黄散活性成分和作用靶点...     

基于网络药理探讨四妙散治疗骨性关节炎的作用机制

目的:基于网络药理学探讨四妙散治疗骨性关节炎(OA)的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中检索四妙散中黄柏、苍术、薏苡仁、牛膝的活性成分,以口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18为条件进行筛选,通过Uniprot数据库进行靶点预测;通过TTD、Drugbank、CTD、Gencards、OMIM、PharmGKB、GAD、KEGG数据库获取OA的相关靶标,并进一步对药物和疾病靶点相映射得到四妙散治疗OA的潜在靶点,运用Cytoscape和STRING软件构建“中药-成分-靶点”与蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,筛选可能发挥治疗作用的重要成分及靶点,并对相关靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析获知其潜在的作用机制。结果:从四妙散中共筛选出活性成分67个,包括槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇、汉黄芩素、非洲防己碱等,与骨关节炎相关的作用靶点524个,包括TNF、IL6、MAPK1、PTGS2、MAPK8等。四妙散主要通过调节TNF信号通路、HIF-1信号通路、NOD样受体、Toll样受体信号通路等发挥治疗骨关节炎的作用。结论:本研究运用网络药理学预测了四妙散治疗OA可能的活性成分、关键靶点及作用通路,体现了中药治疗疾病具有“多成分、多靶点、多途径”的特点,为其药效物质基础和作用机制研究提供了理论基础。     

柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的网络药理学研究

目的用计算机网络药理学技术分析柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的有效成分,并预测其作用机制。方法从中药系统药理学分析平台(TCMSP)中获取柴胡疏肝散的化学成分和靶点,同时利用OMIM、TTD和Pharm Gkb数据库获取治疗卒中和抑郁的共有靶标。采用Excel筛选分子和靶标,Cytoscape软件建立柴胡疏肝散的中药成分-靶点网络图,通过生物学信息注释数据库(DAVID)对基因功能及代谢通路进行分析。结果从数据库筛选出柴胡疏肝散122个中药成分与卒中后抑郁的42个靶蛋白相互作用,其中雌激素受体(ESR1)、前列素内环氧化物合成酶2(PTGS2)、糖原合成酶激酶3β(GSK3β)、SLC6A4和白三烯A4水解酶(LTA4H)为柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的作用靶点,主要涉及花生四烯酸代谢通路、5-羟色胺能突触通路、催乳素信号通路和甲状腺激素信号通路,通过调节炎症应答、突触合成、雌激素应答、记忆、生物合成、药物反应和昼夜节律从而治疗卒中后抑郁。结论通过网络药理学研究揭示了柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的可能机制,为进一步阐明其作用靶点奠定了基础。     

基于网络药理学探讨丹红化瘀口服液治疗深静脉血栓的作用机制

目的 基于网络药理学方法探讨丹红化瘀口服液治疗深静脉血栓(deep vein thrombosis,DVT)的作用机制.方法 利用中药系统药理学技术平台数据库(TCMSP)获取丹红化瘀口服液的主要化学成分及作用靶点,利用Uniprot数据库对获取的作用靶点进行规范化处理;通过DisGeNet、GeneCards、OMI...     

基于网络药理学及分子对接研究益气养阴清热方治疗2型糖尿病的作用机制

目的:运用网络药理学及分子对接预测益气养阴清热方治疗2型糖尿病的作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM数据库获取益气养阴清热方6味中药的化学成分和作用靶点.通过Gene-Cards数据库获取治疗2型糖尿病相关靶点;利用R软件获取有效成分与疾病相关靶点之交集;利用Cytos...     

基于网络药理学的辛夷治疗过敏性鼻炎作用机制研究

目的 基于网络药理学探讨辛夷治疗过敏性鼻炎的活性成分及作用机制.方法 检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取辛夷活性成分,并借助SwissTargetPrediction、PubChem进行辛夷成分的作用靶点预测和筛选,构建成分-靶点网络.通过TTD、DrugBank、DisGeNET、OMIM数据库获取...     

苍耳子散治疗季节性变应性鼻炎的药理实验与作用机制研究变应性鼻炎

目的：基于网络药理学方法分析苍耳子散治疗季节性变应性鼻炎的作用机制,为经典方剂临床拓展运用及疗效评价提供参考。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取苍耳子、辛夷、白芷、川芎的主要化学成分及其靶点,根据毒药物动力学(ADME)筛选中药活性组分,并应用网络图像化软件CytoScape 3.7.2构建苍耳子散活性成分及作用靶点网络;通过人类基因信息数据库(GeneCards)获取季节性变应性鼻炎相关靶点;应用CytoScape 3.7.2构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,将网络提取的关键靶点提交至STRING 11.0数据库,分析其参与的生物过程。将药物靶点与疾病靶点取交集基因后,利用注释、可视化和富集分子功能数据库(DAVID)进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,构建“成分-靶点-通路”网络。通过构建卵清蛋白(VOA)大鼠变应性鼻炎模型对筛选的靶点应用酶联免疫吸附试验(ELISA)进行验证。结果：苍耳子散治疗季节性变应性鼻炎的核心的活性成分为柚皮苷、谷甾醇、木犀草素等,核心靶点有前列腺素内过氧化物合酶(PTGS)2、磷...     

基于网络药理学、分子对接及实验验证探讨加味升降散治疗IgA肾病的作用机制

目的:基于网络药理学初步预测加味升降散治疗免疫球蛋白(Ig)A肾病(IgAN)的活性成分、作用靶点及信号通路,通过分子对接及动物实验验证探讨其可能作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),蛋白质数据库(UniProt Knowledge base)数据库,查阅文献及成分靶点预测数据库(Swiss...     

结合网络药理学探讨扶正化瘀方对肺纤维化小鼠PI3K-Akt信号通路的影响

目的 通过网络药理学方法及小鼠肺纤维化实验,探讨扶正化瘀方治疗肺纤维化的潜在关键靶点和信号通路.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取扶正化瘀方各味药的主要化学成分及其靶点,通过GeneCards、OMIM数据库获取肺纤维化疾病相关靶点,二者取交集后,利用STRING平台对交集靶点进行蛋白相互作用(...     

基于网络药理学的左金丸治疗肝癌机制探讨

目的 运用网络药理学研究左金丸治疗原发性肝癌的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取左金丸的化合物及靶点,以口服生物利用度(OB)≥30％和类药性(DL)≥0.18为阈值进行化合物筛选,将靶点输入Uniprot获取靶点对应的基因Symbol;从人类基因数据库(GeneCards:The H...     

基于网络药理学探讨党参治疗2型糖尿病的作用机制

目的:基于网络药理学方法探讨党参治疗2型糖尿病(T2DM)的潜在作用机制.方法:通过中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)及OMIM、TTD、Drugbank等网络数据库分别获取药物有效成分、活性靶点、疾病靶点,并取药物成分和疾病的交集靶点,构建药物活性成分与关键靶点网络、蛋白质相互作用(PPI)网络,并对靶蛋白进...     

基于网络药理学探究二至丸治疗白癜风作用机制

目的:基于网络药理学方法探究二至丸治疗白癜风的作用机制.方法:通过TCMSP(中药系统药理学技术平台)数据库获取"墨旱莲"、"女贞子"的主要化学成分,根据ADME筛选出其活性成分及作用靶点,并上传至Cytoscape 3.8.2软件构建"药物-成分-靶点网络".同时通过Gencards、OMIM和DRUGBANK数据库...     

基于网络药理学探讨藤梨根治疗结直肠癌的作用机制

目的 基于网络药理学的研究方法探讨中药藤梨根治疗结直肠癌的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)以及中医药整合药理学研究平台(TCMIP)获取藤梨根的主要活性成分和药物作用靶点,通过GeneCards数据库和OMIM数据库获取结直肠癌的疾病靶点,再通过R语言及VennDiagram作图数据包映射筛选得出药物与疾病的交集靶点,即为藤梨根治疗结直肠癌的潜在治疗靶点。利用Cytoscape 3.7.1软件、String数据库分别构建藤梨根治疗结直肠癌的潜在治疗靶点的“药物-成分-疾病-靶点”网络图和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图。最后通过David数据库对潜在治疗靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并将富集结果可视化。结果 筛选到藤梨根药物主要活性成分6个,药物作用靶点154个,结直肠癌相关疾病靶点10 622个,两者取交集得到藤梨根治疗结直肠癌的潜在治疗靶点145个;藤梨根的6种活性成分芦荟大黄素(aloe-emodin)、ent-表儿茶素(ent-Epicatechin)、(+)-儿茶素[(+)-cat...     

基于网络药理学及实验验证探讨山慈菇-漏芦药对治疗乳腺癌作用机制

目的:应用网络药理学的研究方法筛选山慈菇-漏芦药对治疗乳腺癌的作用靶点及相关信号通路,通过体外实验明确其作用机制.方法:通过运用中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库检索获取山慈菇-漏芦的主要化学成分及相关作用靶点;使用GendCards筛选乳腺癌疾病的相关靶标基因;通过Venn软件筛选出药物与疾病的共同作用靶点;...     

基于网络药理学探究黄药子对甲状腺结节的作用机制

目的:通过网络药理学构建黄药子治疗甲状腺结节的作用靶点及信号通路,以探究其治疗的作用机制.方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)以及文献报道,获取并筛选黄药子的主要有效成分和相关靶点.通过UniProt数据库检索靶点基因名.检索GeneCards数据库,筛选甲状腺结节相关的基因靶点.将药物与疾病的交集靶...     

钩藤散活性成分治疗阿尔茨海默病作用机制的网络药理学分析

目的利用网络药理学方法研究钩藤散治疗阿尔茨海默病(AD)的作用机制。方法从中药系统药理学数据库(TCSMP)、中药信息数据库(TCMID)中筛选钩藤散治疗AD的活性成分,并构建药物-靶标-疾病网络、蛋白与蛋白相互作用(PPI)网络,运用生物信息学分析方法进行GO分析、通路富集分析和PPI网络分析。结果通过网络药理学方法筛选出钩藤散活性成分65种,显示其活性化合物的预测靶点473个,215个靶点与AD相关,钩藤散活性化合物的药效作用靶点高度富集到与AD相关的信号通路和生物学过程,PPI网络结果显示JUN、TNF、VEGFA、ESR1、APP可能是钩藤散治疗AD的重要作用靶点。结论钩藤散活性化合物以协同的方式与多个靶点、多种途径相互作用,主要通过抗炎、抗凋亡、增强代谢和增强免疫系统等途径对AD产生重要的治疗作用。     

基于网络药理学和实验验证分析鸡血藤治疗卵巢癌的分子机制

通过网络药理学和分子对接及体外细胞实验,对鸡血藤Spatholobi Caulis治疗卵巢癌(ovarian cancer,OC)的主要活性成分及其潜在的作用机制进行探讨.运用中药药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取鸡血藤的主要活性成分及其预测靶点,通过GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、Dru...     

基于整合药理学结合GEO数据集分析开心散防治阿尔茨海默病分子机制

目的基于整合药理学平台联合GEO芯片差异基因分析的方法, 分析开心散治疗AD的作用机制。方法通过检索中医药整合药理学研究平台(TCMIP)和Drugbank数据库, 获得开心散组方药物活性成分和相关分子靶点。通过GEO数据库获取GSE4757芯片数据, 使用R语言获取其差异基因, 绘制热图和火山图。通过Cytoscape 3.7.2构建开心散与AD的差异基因分子靶点图, 使用Bisogenet和CytoNCA绘制靶点拓扑网络, 并进行开心散与AD基因的GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果获得开心散治疗AD的活性成分86个, 与GEO共有的差异基因29个, 构建PPI拓扑网络, 筛选出核心的候选基因6个, 与KEGG通路富集基因合并, 获得治疗疾病的重要基因为CHRM1、CHRM2、ACHE、CHRM3、CASP8、PTGS2、DRD1、CACN1S、ADRB1。GO功能条目获得375条, 主要涉及血管收缩、突触后膜可塑性, 神经递质传递等。KEGG富集分析主要涉及胆碱能突触信号通路、cAMP信号通路、钙信号通路、神经-配体-受体相互作用信号通路等。结论开心散治疗AD具有多成分、多靶...     

贝母瓜蒌散抑制炎症反应改善脂多糖诱导小鼠急性肺损伤的机制研究

目的：基于网络药理学和脂多糖诱导的小鼠急性肺损伤模型探究贝母瓜蒌散干预急性肺损伤（acute lung injury,ALI）的抗炎作用。方法：通过中医药系统药理学数据库和分析平台，以生物利用度和药物相似性为条件筛选贝母瓜蒌散活性成分和作用靶点；在GeneCards数据库获取ALI相关靶基因。通过STRING平台构建化合物靶点-ALI靶基因相互作用（protein-protein interaction,PPI）网络，运用Cytoscape 3.8. 0软件构建药材-成分-靶点-通路网络，利用Metascape平台进行基因本体（gene ontology,GO）分析，应用通路数据库Reactome进行信号通路富集分析，预测其分子机制。通过贝母瓜蒌散对脂多糖诱导的急性肺损伤小鼠的干预实验，对潜在靶点和通路进行验证。结果：获得贝母瓜蒌散活性成分44个、靶点606个，与ALI有关共同靶点258个。GO功能富集分析发现，贝母瓜蒌散对ALI的作用主要涉及激酶活性的正调控、受体复合物、蛋白激酶活性等过程；通路富集分析指出，贝母瓜蒌散可能从调控白细胞介素信号、白介素-4和白介素-13的信号、免疫系统中的细胞因子信号传递等信号通路发挥治疗作用。HE染色及胶原纤维阳性染色结果显示，贝母瓜蒌散能改善肺损伤；qPCR结果显示，贝母瓜蒌散能下调小鼠肺组织IL-1α、IL-2、IL6、IL-10、TNF-α mRNA表达。结论：贝母瓜蒌散可能通过抑制促炎细胞因子表达发挥治疗ALI的作用。     

基于网络药理学多数据库探讨“栀子-刺五加”药对调节重度抑郁症的作用机制

目的 通过网络药理学方法研究“栀子-刺五加”药对调节重度抑郁症(MDD)的药理机制，为MDD的治疗提供新的辅助治疗手段。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取栀子、刺五加的有效成分，并通过Pubchem数据库、Swiss Target Prediction数据库获取其作用靶点；通过GeneCards数据库获取MDD的疾病靶点，再通过Bioinformatic数据库绘制“栀子-刺五加”有效成分靶点与MDD疾病靶点韦恩图获取两者的交集靶点即为潜在治疗靶点；通过STRING获取潜在治疗靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络，通过Cytoscape 3.7.2软件构建PPI网络图并进行拓扑分析；借助David数据库及R语言包对潜在治疗靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析；通过R语言从GEO数据库获取MDD的差异表达基因(DEGs)并进行差异分析，再通过Bioinformatic数据库获取“栀子-刺五加”调节MDD的核心DEGs并进行统计学分析。结果 筛选出栀子有效成分32个，刺五加有效成分31个，有效成分靶点572个，M...