我国部分省份(地区)汉族人群HLA-Ⅰ类基因多态性地区差异分析

目的 探讨我国部分省份(地区)汉族人群HLA-Ⅰ类经典基冈座位HLA-A、HLA-B、HLA-Cw位点的群体遗传学特点及其基因频率分布的地区差异.方法 选取1014例无关汉族拟行造血干细胞移植治疗患者及其健康家系供者的血液样本,提取基因组.DNA后,采用序列特异性引物聚合酶链式反应(PCR-SSP)分型技术进行HLA-A、HLA-B、HLA-Cw位点基因分型,分析不同地区汉族人群及不同种族间的基因频率分布特征.基于文献报道的我国不同地区汉族人群及不同种族的HLA-Ⅰ类基因频率资料,计算种群间遗传距离(D),比较不同地区汉族人群及不同种族间遗传距离差异.结果 Hard-Weinberg吻合度检验表明,本研究抽样群体适于进行遗传学统计分析.HLA-A位点共检测出14种基因型,最常见的是A*02(0.330)、A*11(0.240)、A*24(0.155)、A*33(0.075);HLA-B位点共检测出27种基因型,最常见的是B*13(0.134)、B*15(0.143)、B*40(0.133)、B*46(0.102);HLA-Cw位点共检测出13种基因型,最常见的是Cw*01(0.157)、Cw*03(0.247)、Cw*07(0.181)、Cw*08(0.106).群体汉族与其他人种间HLA-A、HLA-B基因频率差异均有统计学意义(P<0.05);除兰州汉族人群仅同南方汉族、湖南、山东、江苏、台湾汉族人群间HLA-A、HLA-B基因频率差异有统计学意义(P<0.05)外,其余各地区汉族人群间HLA-A、HLA-B基因频率差异均有统计学意义(P<0.05).各地区汉族人群间平均遗传距离D=0.164,辽宁和北方汉族人群间遗传距离(D=0.064)最小,江苏与湖南汉族人群间遗传距离(D=0.299)最大;不同地区汉族人群间遗传距离普遍小于种族间遗传距离.结论 我国不同地区汉族人群HLA-Ⅰ类基因频率分布存在显著差异,但其差异要明显小于世界不同人种间的分布差异.我国汉族人群所特有的HLA-Ⅰ类基因频率分布格局资料对区域性疾病的个性化治疗、遗传易感性及疾病防治等研究具有很好的理论及应用价值.     

贵州地区汉族人群GDF5基因单核苷酸多态性与成人终身高的关系

目的 探讨生长分化因子5(GDF5)基因rs143383、rs143384、rs6060369和rs224331位点单核苷酸多态性(SNPs)与贵州地区汉族人群成人终身高的相关性.方法 对贵州地区1 069例汉族健康体检者进行体格检查及问卷调查,收集抗凝血标本并提取DNA.用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)方法检测GDF5基因的SNPs,并分析其与身高的相关性.结果 成年女性中,GDF5基因rs143383、rs143384、rs6060369和rs224331基因型分布可分别解释身高变异的1.4％、0.9％、1.1％和1.0％(P＜0.05);在GDF5基因rs143383和rs143384位点,携带GG基因型的个体平均身高均为最高,分别比AG和AA基因型个体高1.7 cm (P＜0.01)、2.3 cm (P＜0.05)和1.6 cm (P＜0.05)、2.1 cm(P＜0.01);在GDF5基因rs6060369位点,携带CC基因型的个体平均身高分别比CT和TT基因型个体高1.7 cm (P＜0.05)和2.2 cm (P＜0.01).但是在成年男性中未发现GDF5基因上述SNPs位点与身高的相关性.结论 GDF5基因单核苷酸多态性与贵州地区成年汉族女性身高有关,GDF5基因可能是影响中国汉族成人女性身高个体差异的基因.     

辽宁汉族人群HLA-DRB1基因多态性分布

目的调查HLA-DRB1基因位点遗传多态性在辽宁汉族人群中的分布。方法应用聚合酶链反应．序列特异性引物方法和反向聚合酶链反应．序列特异性寡核苷酸探针杂交的方法对13265名辽宁汉族人进行中低分辨率HLA-DRB1基因分型。结果共检出HLA-DRB1位点的13种等位基因，其中以HLA-DRB1＊15频率最高（17．49％），其次为HLA-DRB1＊09、＊12和HLA-DRB1＊07，基因频率分别为13．40％、11．87％和11．8l％。HLA-DRB1＊03（18）和HLA-DRB1＊14（8）等位基因未检出。对观察值和期望值进行X^2检验，符合Hardy-Weinberg平衡（X^2=73．34，af=78，P〉0．5）。该人群与南北方汉族人群、日本人、白人和黑人分别进行X^2值检验差异有统计学意义，X^2值分别为112．053、8．514、692．141、70．558和121．755。结论辽宁汉族人群HLA-DRB1基因分布有自身特点。     

β2—肾上腺素能受体基因单核苷酸多态性及在汉族人群中的分布

目的 研究中国人β2－肾上腺素能受体（beta2-adrenoceptor,β2－AR）基因单核苷酸多态性（single nucleotide Polymorphism.SNP),并观察这些SNPs在汉族人群中的多态性分布。方法 应用荧光标记自动测序法测定来自安徽大别山地区80名非亲缘关系人群β2－AR基因序列,确定单核酸多态位点及基因型。结果 在3．8kb长度范围内共发现8个SNPs,其中5个位于编码区,平均274bp出现一个SNP,3个位于调控区,平均721bp出现一个SNP,与国外报告相比－468－G,－367T－C,4．－47C－T,－20T－C,＋79C→G,＋100G→A, 491C→T, 1098T→C未在研究人群中检测到,各SNPs等位基因频率在人群中的分布符合Hardy-Weinberg平衡,结论 β2－AR基因SNPs呈不均匀分布,且具有很大的种族差异,其等位基因频率在人群中分布符合Hardy=-Weinberg 平衡。     

TIM-4基因多态性与湖北地区汉族人群支气管哮喘易感性的研究

目的 探讨T细胞免疫球蛋白域及黏蛋白域蛋白-4(T cells immunoglobulindomain andmucindomain protein-4,TIM-4)基因外显子2区Lys65Lys(G/A)、外显子9区Val1365Met(G/A)的单核昔酸多态性(SNP)与湖北地区汉族人群支气管哮喘易感性的关系.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法对湖北地区185例哮喘患者和162例健康者TIM-4基因外显子2区Lys65Lys(G/A)、外显子9区Vai365Met(G/A)的多态性进行分析,计算基因型和等位基因频率.结果 (1)湖北地区汉族人群健康者TIM-4基因外显子2区Lys65Lys(G/A)位G/G、G/A、A/A基因型频率分别为0.840、0.160、0,而哮喘人群其频率分别为0.859、0.141、0,其基因型和等位基因型频率与对照组相比差异均无统计学意义(P=0.603,P=0.618);(2)本试验未检测到TIM-4外显子9区Va1365Met(G/A)的多态性.结论 湖北地区汉族人群TIM-4基因外显子2区Lys65Lys(G/A)存在单核苷酸多态性变异,但该位点的变异与湖北地区汉族人群支气管哮喘易感性无关;TIM-4基因外显子9区Va1365Met(G/A)在湖北地区汉族人群中未发现单核苷酸多态性.     

中国汉族人群DC-SIGN和DC-SIGNR基因遗传多态性

目的了解中国汉族人群DC-SIGN和DC-SIGNR基因颈区重复序列的遗传多态性分布，获得相应位点的汉族人群的遗传学数据。方法应用PCR技术、琼脂糖凝胶电泳结合测序对DC-SIGN和DC-SIGNR基因的颈区重复序列分型，计算DC-SIGNR的多态信息含量。结果DC-SIGN多态性低，颈区绝大多数为等位基因7重复，该等位基因频率为0．9808，但亦检出少量的等位基因4、5、6、8等变异，而美国白人只含有等位基因6、8变异；DC-SIGNR存在高度多态性，多态信息含量为0．5312，存在4、5、6．7、8、9等位基因，检出16种基因型。6／5、7／4、7／5、7／6、7／7、9／5、9．／7、9／9基因型和5、6、7、9等位基因频率在中国汉族人群和美国白人中的分布构成差异有统计学意义（P〈0．01），与美国白人比较，中国汉族人群似乎存在更多的插入突变。结论中国汉人的DC-SIGN和DC-SIGNR基因型分布和基因频率与美国白人相比其差异有统计学意义，并有其独特的群体遗传学特征。     

鄂西北地区汉族人群CD40基因单核苷酸多态性分析

目的研究CD40-E1SNP和E4SNP单核苷酸多态性在鄂西北部地区汉族人群中的分布,并探讨CD40基因单核苷酸多态性与血浆可溶性CD40水平的关系。方法 318例汉族人,其中男性187例,女性131例;平均年龄31.2岁。应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)及测序的方法,CD40-E1SNP和E4SNP并计算其基因型频率及等位基因频率,酶联免疫吸附分析检测血浆可溶性CD40浓度,并与文献报道不同种族人群比较。结果鄂西北地区汉族人群CD40-E1SNP基因型频率:CC型29.2%,CT型54.1%,TT型16.7%,C、T等位基因频率分别为56.3%、43.7%,这种多态性分布在男女间差异无统计学意义(P>0.05),与英国、波兰比较,发现不同种族间CD40-E1SNP基因型分布及等位基因频率差异均存在统计学意义(P<0.01);CD40-E1SNP各基因表型之间可溶性CD40含量分别为:CC(57.3±6.6)pg/mL,CT(34.2±4.5)pg/mL,TT(28.8±4.2)pg/mL,差异存在统计学意义(P<0.01)。在实验中未检测到CD40-E4SNP单核苷酸多态性。结论鄂西北地区汉族人群中存在CD40-E1SNP单核苷酸多态性,其基因型在不同种族间存在较大的差异,并且可能影响CD40的表达,而不存在CD40-E4SNP单核苷酸多态性。     

温州地区汉族人群 N-乙酰基转移酶2基因多态性分析

目的探讨温州地区汉族人群N-乙酰基转移酶2（NAT2）基因多态性分布规律。方法，应用聚合酶链反应（PCR）及测序技术对174名温州地区汉族健康人群NAT24个突变位点的基因多态性进行检测，并与其它人群进行比较。结果NAT2等位基因频率分别为：Wt（59.77％），M2（21．83％），M3（14．36％），M1（4．02％）。未检测到M4突变等位基因。各基因型频率分别为：Wt／Wt（39．08％），Wt／M2（22．99％），Wt／M3（14．94％），M2／M3（9．20％），M2／M2（4．60％），Wt／M1（3．45％），M1／M2（2．30％），M3／M3（1．72％）M1／M3（1．15％），M1／M1（0．57％）。结论温州地区汉族人群NAT2突变基因中，以M2为主，主要以Wt／M2形式存在，M1突变最少，未发现M4。基因多态分布与日本人接近，与其他地区显著不同。     

广东汉族人群HLA-Cw基因多态性分析

检测HLA Cw在广东汉族人群中的基因频率 ,与其他人群进行比较 ,分析该人群HLA Cw等位基因多态性及其特点。骨髓移植供者 15 8例 ,抗凝血提取DNA ,半量全自动PCR RSSO分型检测Cw。结果显示 ,广东汉族人群HLA Cw基因频率分布由高至低依次为 :Cw 0 3(0 2 5 80 ) >Cw 0 7(0 1887) >Cw 0 1(0 1732 ) >Cw 0 8(0 10 70 ) >Cw 14 (0 0 6 5 4 ) >Cw 0 4(0 0 5 87) >Cw 15 (0 0 4 5 3) >Cw 12 (0 0 387) >Cw 0 6 (0 0 32 2 ) >Cw 0 5 (0 0 12 7) >Cw 16 (0 0 0 32 )。Hardy Weinberg平衡检验 χ2 =6 0 35 ,υ =5 4 ,P >0 1。表明广东汉族群体Cw 0 3、 0 7、 0 1、 0 8出现频率较高 ,该人群Cw等位基因处于遗传平衡状态 ,具有较为丰富的多态性及特点。     

β_2-肾上腺素能受体基因单核苷酸多态性及在汉族人群中的分布

目的　研究中国人β2 -肾上腺素能受体 (beta2 - adrenoceptor,β2 - AR)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP) ,并观察这些 SNPs在汉族人群中的多态性分布。方法　应用荧光标记自动测序法测定来自安徽大别山地区 80名非亲缘关系人群β2 - AR基因序列 ,确定单核苷酸多态位点及基因型。结果　在 3.8kb长度范围内共发现 8个 SNPs,其中 5个位于编码区 ,平均 2 74bp出现一个SNP;3个位于调控区 ,平均 72 1bp出现一个 SNP,与国外报道相比 ,- 46 8C→ G,- 36 7T→ C,- 47C→ T,- 2 0 T→ C, 79C→ G, 10 0 G→ A, 491C→ T, 10 98T→ C未在本研究人群中检测到。各 SNPs等位基因频率在人群中的分布符合 Hardy- Weinberg平衡。结论　β2 - AR基因 SNPs呈不均匀分布 ,且具有很大的种族差异 ;其等位基因频率在人群中分布符合 Hardy- Weinberg平衡     

中国北方汉族HLA基因C位点遗传多态性研究

目的：研究北方汉族人群HLA(人类白细胞抗原)基因c位点的遗传特征。方法：采用序列特异性引物扩增(Polymerase Chain Reaction-Sequence-Specific Primers PCR-SSP)方法对205个样本进行HLA-C及-A、-B基因特异性分析。结果：检出C位点特异性14个，其中Cw*01、*07基因表现频率最高，分别为30．73％和27．80％；血清学方法检测不出的HLA-Cw*12、*14、*15表现频率分别为13．17％、4．88％、8．78％。统计显示显著性连锁不平衡的HLA-B-C单倍型24个，HLAs-A-C单倍型5个。结论：作为中国北方人HLA遗传多态性群体调查，提供了一套比较完整准确的基因频率和连锁不平衡参数，为人类学及疾病相关性等研究提供了较为完整的正常参考数据。     

汉族人群血管紧张素原基因的新单核苷酸多态性位点

应用改进的PCR－SSCP技术、多种聚丙烯酰胺凝胶电泳和PCR产物直接测序等方法，分析人的血管紧张素原（AGT）基因启动子区5远侧端的单核苷酸多态性（SNP）。在非变性胶上，发现不同样品的PCR产物（双链DNA分子）电泳迁移率不同；而在变性胶上，对应的单链DNA分子电泳迁移率相同；PCR产物直接测序的结果表明，在同一PCR扩增片段中同时存在两个SNPs位点（G－1074T，A－1179G）；通过476个不同样品的实验结果，进一步证实两个SNPs位点处于完全的连锁不平衡关系。GenBank同源性比较结果显示：A－1179G为中国汉族人群所特有。     

膜型/可溶型MHC Ⅰ类链相关分子A及其受体NKG2D在骨肉瘤中的表达及其意义

目的探讨膜型／可溶型MHCI类链相关分子A（MICA）及其受体NKG2D在骨肉瘤中的表达及其意义。方法采用免疫组织化学（LSAB法）检测膜型MICA（mMICA）在43例骨肉瘤组织中的表达;用流式细胞仪检测上述病例中的16例患者外周血淋巴细胞NKG2D的表达;用ELISA法检测患者血清中可溶型MICA（sMICA）的水平。结果骨肉瘤细胞广泛表达mMICA（37／43）,外周血淋巴细胞NKG2D的表达普遍下降,两者的表达水平均与骨肉瘤的分化呈正相关（P〈0．05）,与临床分期呈负相关（P〈0．05）。检测16例骨肉瘤患者血清中sMICA含量,其中5例升高,且与骨肉瘤的远处转移及临床分期呈正相关（P〈0．05）。结论（1）骨肉瘤细胞表达mMICA,外周血淋巴细胞NKG2D的表达以及血清中sMICA的含量与骨肉瘤的分化及临床分期相关,因此可望作为骨肉瘤病理诊断和估计预后的生物学指标。（2）MICA-NKG2D介导的免疫监视障碍可能促进了骨肉瘤的进展。     

中国湖北地区IL-1RN内含子2基因多态性分布的研究

目的 :探讨湖北地区汉族健康人群白细胞介素 1受体拮抗剂(IL 1Ra)内含子 2基因多态性的分布 ,比较其在不同种族间分布的差异。方法 :采用PCR方法检测了 2 5 1例湖北地区汉族健康人群IL 1Ra基因内含子 2的可变数串联重复 (VNTR)多态性 ,并结合文献进行不同种族间的比较分析。结果 :湖北地区汉族健康人群基因型以Ⅰ /Ⅰ型最为常见 ,其次为Ⅰ /Ⅱ型 ,Ⅰ /Ⅳ和Ⅱ /Ⅱ型较为罕见 ,分布频率依次为 0 .813、0 .167、0 .0 16、0 .0 0 4;其等位基因以Ⅰ型最为常见 ,其次为Ⅱ型 ,Ⅳ型较为罕见。与美、德和日本等国家人群相比 ,该VNTR多态性均存在显著性差异 (P <0 .0 0 5 ) ,与国内江苏和重庆地区人群相比虽无显著性差异 (P >0 .0 5 ) ,但在湖北地区发现了较为罕见的Ⅰ /Ⅳ和Ⅱ /Ⅱ基因型。结论 :湖北地区汉族人群IL 1Ra基因内含子 2存在VNTR多态性 ,其在不同种族间的分布存在显著性差异     

上海人群中TAP、LMP和HLA-DM基因多态性研究

调查上海人群中抗原处理相关基因TAP、LMP和HLA-DM的分布情况,并探索这些基因与自身免疫病类风湿关节炎(RA)、IgA肾炎(IgAN)和多发性硬化症(MS)的可能关联。应用PCR-SSO或PCR-RFLP技术对80名无血缘关系的上海地区正常人及156名RA患者、60名IgAN患者和21名MS患者作了TAP1、TAP2、LMP2、HLA-DMA和HLA-DMB基因分型。并作了两位点连锁不平衡分析。在该群体中,(1)共观察到4个TAP1、6个TAP2、2个LMP2、4个HLA-DMA和4个HLA-DMB等位基因;(2)在TAP1B-TAP2A、TAP1B-LMP2H和TAP2D-DMA*0101存在连锁不平衡(Pc<0.05);(3)本人群中IgAN和MS的遗传易感性与抗原处理相关基因无关,而RA患者中DMB*0101基因频率降低(P<0.01),TAP1C和DMB*0104等位基因频率显著升高(P<0.01)。比较分析表明,上海人群中抗原处理相关基因多态性与国外其他人种中的报道相似,本人群中IgAN和MS与抗原处理相关基因不关联,而TAP1C和DMB*0104等位基因可能是RA的遗传易感基因。     

Relationship between nerve injury-induced protein gene 2 polymorphism and stroke in Chinese Han population

The aim of present study was to investigate the relationship between nerve injury-induced protein 2 (NINJ2) gene polymorphism and stroke in Chinese Han population.Fifty-two patients with large-artery atherosclerosis (LAA) infarction,85 patients with small-artery occlusion lacunar (SAO) infarction,50 patients with intracerebral hemorrhage (ICH) and 66 controls were included.Genotypes and alleles frequencies of the two single nucleotide polymorphisms (SNPs) of NINJ2 among different groups were analyzed and compared.In regard to rs12425791,the frequencies of the AG and AA+AG genotypes of the LAA and SAO groups were significantly higher than those in the control group;the frequency of the A allele of the SAO group was significantly higher than that of the control group.In regard to rs11833579,there were not any significant differences between the case and the control groups.The SNP rs12425791 is significantly associated with ischemic stroke,and the A allele increases the susceptibility to stroke.The SNP rs11833579 is not significantly associated with stroke.     

Genetic polymorphisms in TNFSF13 and FDX1 are associated with IgA nephropathy in the Han Chinese population

IgA nephropathy (IgAN) is the most common primary glomerulonephritis worldwide, and its pathogenesis is influenced by both genetic and environmental factors. In this study, we evaluated 23 tag single-nucleotide polymorphisms (tSNPs) in 21 IgAN-associated genes, in 200 subjects with IgAN and 310 healthy gender- and age-matched unrelated control subjects with no history of renal disease or hypertension. Using the co-dominant model, we found that two genotypes of rs3803800 in TNFSF13 were associated with an increased risk of IgAN: “GA” (OR = 1.03, 95% CI = 0.71–1.51, p = 0.018) and “AA” (OR = 2.45, 95% CI = 1.29–4.65, p = 0.018). The “AA” genotype was also associated with an increased risk of IgAN in the recessive model (OR = 2.41, 95% CI = 1.30–4.46, p = 0.018), as was the genotype “AA” rs10488764 in FDX1 (OR = 1.88, 95% CI = 1.01–3.53, p = 0.048). Interestingly, we found that the allele “A” of rs3803800 in TNFSF13 is associated with a decreased risk of IgAN in females (OR = 0.43, 95% CI = 0.20–0.95, p = 0.009), but with an increased risk in males (OR = 1.78, 95% CI = 0.86–3.66, p = 0.009). Our findings, combined with previously reported results, suggest that TNFSF13 and FDX1 have potential roles in IgAN in the Han Chinese population. This information may be useful in the development of early prognostics for IgAN.     

中国四川汉族人群Y染色体单核苷酸多态性分析

目的 评估Y染色体单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)遗传标记的法医学应用价值.方法 用等位基因特异性PCR,限制性酶切和直接扩增法检测了161名中国四川汉族人Y染色体上10个SNPs位点M9,M15,M45,M89,M95,M122,M134,M145,M173和P25的多态性.结果 有8个位点发现遗传多态性,多态性频率0.988/0.012～0.752/0.248.个人识别能力0.094～0.373,累积个人识别能力为0.8308,M122和M134在中国四川汉族人群中的多态性最高.按照国际Y染色体学会的命名原则,10个位点命名了9种单倍组型,单倍组型频率1.2%～52.2%,其中75.2%的中国四川汉族人主要是K*(XO2a,O3,P),O3*(XO3e)和O3e 3种单倍组型.结论 该研究获得了中国四川汉族人群Y染色体的10个SNPs位点的多态性频率分布及其构建的9种单倍组型,为Y-SNPs做为法医遗传学个人识别和亲子鉴定的遗传标记奠定了基础.     

HLA-Cw在广东汉族人群中的分布频率及其意义的初步分析

目的 :检测HLA Cw在广东汉族人群的分布频率 ,初步分析该人群中KIR与HLA Cw之间识别方式的特点及意义。方法 :骨髓移植供者 12 2例 ,ACD抗凝血提取DNA ,半量全自动PCR RSSO分型检测Cw。结果 :广东汉族人群HLA Cw基因频率分布由高至低依次为 :Cw 0 3(0 2 371) >Cw 0 7(0 2 15 9) >Cw 0 1(0 175 2 ) >Cw 0 8(0 112 9) >Cw 0 4 (0 0 5 0 5 ) >Cw 14、15(0 0 4 19) >Cw 12 (0 0 376 ) >Cw 0 6 (0 0 333) >Cw 0 5 (0 0 0 82 ) >Cw 16 (0 0 0 4 1)。第一组Cw 0 2 ,0 4 ,0 5 ,0 6识别KIR分子中2DL 2DSI;第二组Cw 0 1,0 3,0 7,0 8识别KIR分子中 2DL2 2DL3;2DS2 2DS3。两组分布频率相比有显著性差异 (P <0 0 1)。结论 :广东汉族人群HLA Cw 0 1,0 3,0 7,0 8出现频率较高 ,其与KIR的识别方式均属第二组。