昆明汉族人群D21S1411、IFNAR位点多态性及其在唐氏综合征基因诊断中的应用

目的 调查昆明汉族人群第21号染色体上D21S1411和IFNAR两个短串联重复序列（short tandem repeat，STR）的遗传多态性，探讨该2个STR基因座在唐氏综合征基因诊断中的应用价值。 方法 随机抽取100名昆明地区无血缘关系汉族正常个体及2名唐氏综合征患者的静脉血，应用PCR技术扩增D21S1411和IFNAR位点的STR片段，采用聚丙烯酰胺凝胶电泳，硝酸银染色分型，结合图像分析系统测定等位基因片段大小。 结果 昆明汉族人群D21S1411和IFNAR等位片段分别为6、7；2个位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡；各位点杂合度分别为0.87、0.82，多态信息含量分别为0.8062、0.8365。2例Down综合征患者，在IFNAR位点上，均出现DNA含量为2：1的2条带；在D21S1411位点上，1名出现DNA含量为1：1：1的3条带，1名出现2：1的2条带。 结论 D21S1411、IFNAR是两个多态信息含量比较高的基因座，在法医学及唐氏综合征基因诊断中具有较高的应用价值。     

应用D21S11、D21S1440和Penta D短串联重复序列诊断唐氏综合征

目的 探讨应用短串联重复序列(short tandem repeat,STR)诊断唐氏综合征(Down's syndrome,DS)的可行性,为建立一种快速、准确诊断DS的技术提供依据.方法 用定量荧光聚合酶链反应扩增719份样本(包括外周血389例、羊水282例和绒毛48例)21号染色体上D21S11、D21S1440和Penta D STR基因座,通过对扩增产物条带的分析达到诊断DS的目的.结果 核型正常的652份样本中,635份表现为荧光强度为1∶1的2条带或1条带,17例表现3条带,为假阳性.67份DS样本均得到了诊断,53份样本出现1∶1∶1的3条带(峰),14份样本出现2:1的2条带(峰).D21S11、D21S1440和PentaD STR基因座诊断DS的灵敏度和特异度分别为76.12％和98.62％、71.64％和98.93％、89.55％和99.85％.联合应用3个基因座诊断DS的灵敏度为100％(67/67),特异度为97.39％(635/652).结论 用定量荧光聚合酶链反应扩增STR基因座具有灵敏度高、特异度强、简便、快速等优点,在临床上有广阔的应用前景,是大规模产前筛查DS的理想工具.     

广东汉族人群21号染色体4个短串联重复序列多态性

目的调查广东地区汉族人群4个短串联重复序列D21S1433、D21S1442、D21S1444、D21S2051的多态性分布。方法采用荧光定量PCR（quantitative fluorescence PCR，QF-PCR）技术，对广东地区200份无亲缘关系样本进行等位基因分型，计算4个短串联重复序列的基因频率、基因型频率，等位基因杂合度，期望杂合性、多态信息含量和非父排除率。结果D21S1433、D21S1442、D21S1444、D21S2051分别检出9、10、9、5个等位基因，等位基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡（P〉0．05）。D21S1433和D21S1442的杂合度较高，分别为0．818和0．820，D21S2051的杂合度最低，为0.261。结论D21S1433、D21S1442、D21S1444具有较高的杂合度和多态信息量，作为遗传标记较为理想；D21S2051杂合度较低，不能作为遗传标记物。     

应用PCR-STR分型技术快速产前基因诊断Down综合征

目的探讨应用PCR-STR分型技术,快速产前基因诊断Down综合征(Down syndrome,DS)方法.方法选择21号染色体上的4个短串联重复序列D21S2055、D21S1244、D21S1435和D21S1809,进行PCR扩增,尿素非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染分型.根据谱带的条数及浓度判断是否为21三体,根据父母基因型判断额外21号染色体的亲代来源,选择30例高危孕妇进行21三体的产前基因诊断.结果应用此方法可检出所有的由核型分析确诊的单纯型21三体,并可判定额外染色体的亲代来源.30例产前诊断筛出2例21三体患儿.结论该方法不用细胞培养,避免放射性标记,并可进行早期产前诊断.该方法比传统的方法操作简单、速度快,是一种产前诊断和大规模筛查21三体的良好的方法.     

温州汉族人群短串联重复序列D6S477位点多态性研究

目的获得D6S477基因座在中国温州汉族群体中基因型及等位基因频率数据,探讨其在法医学应用价值.方法应用聚合酶链式反应(PCR)、聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染显带技术对温州地区汉族140名无关个体的D6S477位点进行分型,并检验D6S477基因型频率分布是否符合Hardy-Weinberg平衡,计算法医学常用的各种概率.结果D6S477位点检出7个等位基因,19种基因型.基因型频率的分布符合Hardy-Weinberg平衡(x2=13.6,P＞0.05,df=15),观测杂合度h0为83.6 2.21%,偶合机率为0.074,亲子关系指数为3.04,个体识别率为0.926,期望排除率为0.667,多态信息含量为0.78.结论不同人群基因频率分布存在一定的差异,所得到的等位基因频率数据可为温州汉族人群法医个体识别,亲子鉴定及遗传学研究提供更多依据.     

天津地区D21S1411和D21S1413 2个STR基因座遗传多态性的研究

目的研究天津地区D21S1411和D21S14132个STR基因座的遗传多态性,探讨其在唐氏综合征基因诊断及产前基因诊断应用的可行性。方法随机选择301例天津地区无亲缘关系的汉族个体及313例染色体核型分析正常的胎儿样本,盐析法提取DNA,聚合酶链式反应扩增,非变形聚丙烯酰胺凝胶电泳,硝酸银染色,凝胶图像分析管理系统分析扩增产物。结果D21S1411基因座共发现9种等位基因、45种基因型;D21S1413基因座共发现7种等位基因、28种基因型。外周血样本D21S1411基因座的PIC、DP、PE和Ho分别为0．85、0．967、0．483和73．4％,D21S1413基因座的PIC、DP、PE和Ho分别为n83、0．949、0.719和86．20k;胎儿样本D21S1411基因座的PIC、DP、PE和H0分别为0．80、n927、0．494和78．5％,D21S1413基因座的PIC、DP、PE和Ho分别为0．76、0．915、0．808和87．2％。结论D21S1411和D21S14132个STR基因座基因杂合度高、具有高鉴别力,是21号染色体上理想的遗传标记,可用于DS的基因诊断及产前基因诊断。     

河北汉族人群五个基因座遗传多态性研究

目的调查DXS6801，DXS6809，DXS7423，DXS7424，DXS9902五个基因座在河北汉族人群中的遗传多态性。方法用PCR和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及DNA序列分析河北汉族114名无关男性及118名无关女性个体DXS6801，DXS6809，DXS7423，DXS7424，DXS9902五个基因座的遗传多态性。结果5个基因座共发现了31个等位基因，男性个体共检出了101种单倍型，男性单倍型多样性为0．9975。论结5个基因座在河北汉族人群中有较高的多态信息含量，有潜在的法医学应用价值。并为X染色体短串联重复序列数据库的建立提供了河北汉族人群的遗传学数据。     

河南汉族人群短串联重复D8S384的遗传多态性研究

目的：研究人类短串联重复序列D8S384在河南汉族人群中的遗传多态性,并探讨该基因座在法医学和基因诊断中的应用可能性。方法：采集河南无血缘关系汉族个体血样,应用Chelex法提取DNA,聚合酶链式反应扩增,非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分型。结果：得到D8S384在河南汉族群体中的基因频率,有8个等位基因,19个基因型,杂合度为0．67,个体识别率为0．84,非父排除率为0．43。结论：该基因座多态性较好,分布符合Hardy-Weinberg平衡,可以用于个体识别和亲权鉴定。     

四川汉族、苗族人群D3S3045和D4S3354基因座的遗传多态性

目的:研究短串联重复序列D3S3045和D4S3354基因座在四川汉族、苗族人群中的群体遗传学数据。方法:采用PCR-STR、聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染显色结合核酸序列分析检测两基因座在汉族和苗族人群中的遗传多态性。结果:两个基因座均观测到8个等位基因,频率为0.004~0.314,两个群体中仅D4S3354基因座有显著性差异。两基因座分别观测到33和35种基因型,两个基因座在两个群体中的观测杂合度为0.758~0.834,个人识别率为0.923~0.943,非父排除率为0.523~0.665,多态信息量为0.77~0.82,基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律。结论:两基因座在四川汉族和苗族人群中具有高度遗传多态性,在群体遗传学研究及法医学个人识别应用中有很好的价值。     

浙南汉族人群18号染色体上三个STR位点的遗传多态性研究

目的研究浙南汉族人群18号染色体上三个STR位点D18S865、D18S1364和D18S535的遗传多态性分布,获得相应的群体遗传学数据.方法应用聚合酶链式反应(PCR)、聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)及银染显带技术对浙南地区汉族184名无关个体的D18S865、D18S1364和D18S535位点进行分型.结果D18S865观察到6个等位基因及17种基因型,D18S1364观察到9个等位基因及35种基因型,D18S535观察到8个等位基因及29种基因型,多态性分布都符合Hardy-Weinberg平衡.各基因座的杂合度(H)分别为:0.723、0.848、0.783;多态性信息含量(PIC):0.72、0.81、0.79.结论三个STR基因座具有较高杂合度和多态性信息含量,在遗传学研究和法医学应用中有较高的价值.     

牡丹江地区汉族群体6个STR基因座的遗传多态性研究

目的 调查牡丹江地区汉族群体6个基因座的基因多态性。方法 应用扩增片段长度多态性（Amp-FLP）分型技术，检测牡丹江地区100名无血缘关系汉族个体CSFlPO，TPOX，TH01， D16S539，D7S820，D13S317 6个基因座等位基因频率和基因型分布。结果 经χ2检验表明6个STR基因座基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡；6个基因座的总偶合率为1.98618E-06，总个体识别率达1.000，三联体累计非父排除率OCE=0.9878，二联体累计非父排除率0.9160。结论 6个基因座在牡丹江地区汉族群体中有较高的非父排除率和个人识别机率，可应用于法医学亲子鉴定和个体识别。牡丹江地区的汉族与朝鲜族基因频率相比较，TPOX、TH01和D16S539基因座有显著性检差别，CSFlPO、D7S820和D13S317基因座无显著性差别。     

四川汉族群体8个Y-STR的遗传分析

目的 调查四川汉族群体8个Y染色体STR的遗传多态性,分析8个Y染色体STR的等位基因序列.方法 利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对8个Y-STR基因座进行分型.结果 DYS443、DYS453、DYS455、DYS456是简单重复序列的Y-STR,DYS444、DYS448、DYS457、DYS458是复杂重复序列的Y-STR.108位男性个体观察到106种单体型.8个Y-STR的基因变异度在0.355～0.821之间,单体型变异度为0.9996.结论 在四川汉族群体,8个基因座构成的单体型具有较好的个人识别能力和非父排除率.     

潮汕地区汉族人群9个新Y-STR基因座多态性研究

目的 分析9个新Y染色体短串联重复序列(Y short tandem repeats,Y-STR)基因座的序列结构,及其在潮汕地区汉族人群中的遗传多态性分布,评价其法医学应用价值.方法 应用PCR反应,对潮汕地区汉族159名无关男性个体的血样进行基因分型,采用直接计数法计算9个Y-STR基因座的等位基因频率和单体型频率.结果 9个Y-STR基因座(DYS522、DYS549、DYS556、DYS565、DYS568、DYS570、DYS594、DYS593、DYS588)均为单拷贝,并分别检测出7、5、5、4、6、9、4、4、8个等位基因,基因多样性(gene diversity,GD)在0.1434～0.7994间;共检出136种单体型;累计单体型GD值为0.997.另对30个2代父子家系调查显示:同一家系成员9个Y-STR基因座单体型一致,未观察到基因突变.结论 9个Y-STR基因座具有较高的鉴别效能,适合作为法医学应用的遗传标记.     

人类Y染色体STR位点在群体遗传学中的应用

Y染色体STR位点在群体遗传学研究中是线粒体DNA的有益补充,是研究男性进化历史的绝好工具.本文介绍了Y-STR位点的遗传学特点以及多态性研究进展;总结了应用Y-STR位点进行群体遗传学研究的常用方法:直接比较法、分子变异分析构建系统树、分层聚类分析、主成分分析等;同时指出了应用Y-STR位点用于群体遗传学研究存在的问题和今后的发展方向.     

KIM-1基因多态性与中国山东汉族人群糖尿病肾病的相关性研究

目的探讨肾脏损伤因子(KIM-1)基因2个SNP位点与中国山东汉族人群糖尿病肾病(DKD)的相关性,为糖尿病肾病的早期预防提供理论依据。方法收集2型糖尿病肾病(DKD)患者274例,健康对照(NC)个体248例。提取以上样品的全血基因组DNA,用聚合酶链式反应—限制性酶切片段长度(PCR-RFLP)多态性技术进行检测,对KIM-1基因启动子区的-416G>C和-1454G>A两个SNP位点的基因型频率、等位基因频率进行比较和分析。结果健康对照组与DKD组的-416G>C基因频率和基因型频率分布的差异有统计学意义(P=0.004,P=0.001)。健康对照组与DKD组的-1454G>A基因频率和基因型频率没有统计学差异。结论 -416G>C位点的多态性与中国汉族人群DKD的发生有关,GG基因型可能增加DKD的发病风险。     

广东汉族人群脂联素基因多态性与2型糖尿病相关性研究

目的探讨脂联素基因外显子2基因多态性与广东地区汉族人群2型糖尿病的关系。方法以聚合酶链式反应-限制性内切酶长度多态性（PCR-RFLP）技术观察200名健康人与200例2型糖尿病基因外显子2基因多态性。结果2型糖尿病组G/G基因型频率明显高于正常对照组（P〈0.01）,G等位基因频率明显高于正常对照组（P〈0.01）,T等位基因频率明显低于正常对照组（P〈0.01）。结论脂联素基因可能是广东地区汉族人群中2型糖尿病的易感候选基因。     

温州永嘉汉族人群3个Y-STR基因座的遗传多态性研究

目的研究3个Y染色体STR基因座及其单倍型在温州永嘉人群中的遗传多态性分布,获得相应的群体遗传学数据。方法用复合扩增的方法扩增DYS435、DYS436和DYS4373个基因座,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染显带技术进行分型,检测140名无关男性个体单倍型分布。结果3个基因座在该群体中分别检出3、3、4个等位基因,GD值分别是0.5100,0.1490,0.4056,观察到11种单倍型,其单倍型的变异度为0.7042。结论Y-STR基因座复合扩增体系和建立的Y染色体STR数据库,在法医学鉴定中有帮助意义。     

温州汉族人群D3S1754基因座遗传多态性研究

目的研究D3S1754的遗传多态性及法医学应用价值.方法应用聚合酶链式反应(PCR)、聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染显带技术对温州地区汉族184名无关个体的D3S1754位点进行分型,并检验D3S1754基因型频率分布是否符合Hardy-Weinberg平衡,计算法医学常用的各种概率.结果D3S1754位点检出8个等位基因,19种基因型.基因型频率的分布符合Hardy-Weinberg平衡(x2=10.1,P＞0.05,df=11),观测杂合度h0为75.0±1.37%,偶合机率为0.099,亲子关系指数为2.0,个体识别率为0.901,期望排除率为0.510,多态信息含量为0.73,不同人群基因频率分布存在一定的差异.结论所得到的等位基因频率数据可为温州汉族人群法医个体识别,亲子鉴定及遗传学研究提供更多依据.     

福建汉族人群胰蛋白酶原基因多态性与胰腺炎风险的关联

目的 探讨胰蛋白酶原基因(protease serine 1,PRSS1)的多态性与福建汉族人群胰腺炎风险的关系.方法 收集正常对照120例,胰腺炎患者56例,对所有受试者的PRSS1基因5个外显子进行PCR扩增,产物纯化后测序,比较不同基因型与胰腺炎风险的关系,用HWE软件和SPSS13.0软件分别进行遗传平衡检验和统计学分析.结果 5例胰腺炎患者和1例健康体检者的PRSS1基因4号外显子区32位碱基存在C＞T多态,C＞T多态频率在正常人和胰腺炎患者中分别为0.84%、8.92%,C＞T多态等位基因频率符合Hardy-Weinberg平衡.携带T/T基因与携带C/C基因者比较,罹患胰腺炎的风险增加10.67倍(11.67,CI=1.45～94.21).结论 PRSS1基因4号外显子32位碱基C/T多态与福建地区汉族人群胰腺炎可能具有相关性.