全基因组关联分析散发性阿尔茨海默病的研究进展

阿尔茨海默病（AD）的发生和发展涉及到复杂的环境因素-遗传因素的相互作用,目前尚无有效的治疗药物。利用全基因组关联分析对AD的风险基因进行遗传学研究可以为揭示这一复杂疾病的致病机制和为指导药物开发提供重要的信息。本文从AD的遗传学研究现状、风险基因及其AD的生物学关联性、遗传学研究对治疗阿尔茨海默病的提示等方面进行综述。     

肥胖的全基因组关联研究

肥胖是2 型糖尿病和某些癌症的重要危险因子, 同时也是影响世界范围内公众健康的重要负担。作为一种传统的复杂疾病, 肥胖症被认为是基因与环境交互作用的产物。然而上述两个因素中哪一个对肥胖的产生发挥更大的作用尚存争议。近年来, 通过全基因组关联分析(GWAS) 发现了一些影响肥胖进展的基因位点。GWAS 研究对探寻基因变异在复杂疾病中的潜在作用发挥日益重要的作用。为进一步了解遗传因素导致肥胖的风险, 笔者回顾并收集Pubmed 上近期有关GWAS 研究报道的基因, 总结已发表的关于GWAS 的研究论文, 共找出与人类肥胖患病风险强相关的49 个候选基因。尽管该发现与当前的研究存在相似性, 但这一研究领域的许多单核苷酸多态性(SNPs) 的详细信息和潜在机制尚未阐明。因此, 有必要对人类肥胖症患病风险进行更为深入的研究。     

精神分裂症全基因组关联研究进展

精神分裂症属于多基因复杂遗传病,对其易感基因的研究策略主要包括传统的候选基因策略和新兴的全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,或者Whole-Genome Association Study,GWA).候选基因研究常难以彼此重复或验证,应在严格纯化样本临床表型基础上,突破单个候选基因关联研究思路,从全基因组范围内筛选易感基因.本文简要介绍了GWA的研究内容、研究设计方法以及近两年来其在精神分裂症研究领域的主要进展;总结了GWA在精神分裂症研究中的优势和不足;并对未来的工作重点和待解决的问题进行了展望.     

失眠的全基因组关联分析研究进展

<正>失眠障碍(insomnia disorder, ID)主要表现为睡眠起始、维持困难或睡眠质量差,同时伴有一定的功能损害。世界卫生组织定义失眠为一周内至少有三个晚上出现入睡困难和(或)难以维持睡眠,或者有无法恢复精力的睡眠引起的不适,伴随白天的苦恼或影响社会功能,病程持续1个月以上。流行病学调查显示,我国失眠的发生率约为45.4%,严重的睡眠缺少不仅会对个体的健康及社会功能造成损害,而且容易导致各种意外事故,给社会带来沉重负担^[1]。     

类风湿关节炎易感基因的全基因组关联分析研究进展

类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种炎性侵润关节及其周围结缔组织的系统性自身免疫疾病,也是一种具有复杂遗传模式的多基因遗传病。环境因素和遗传因素共同影响RA的发生、发展。它的易感基因研究给临床的诊断、治疗提供了理论基础。新兴的全基因组关联分析作为寻找易感基因的高通量技术,是发现多基因遗传性疾病包括RA易感基因的强大工具。它不仅能够验证已有的易感基因位点,还能够发现新的候选易感位点。近5年来,用全基因组关联分析研究易感基因取得了很多新的进展,为探明RA的发病机制和治疗RA提供了新的契机。本文就近年来全基因组关联分析技术研究RA易感基因的进展做一综述。     

国际全基因组关联研究引文特征的可视化分析

利用引文编年可视化软件HistCite对国际全基因组关联研究文献进行处理,输出期刊列表、作者列表、机构列表、生成可视化引文编年图,了解全基因组关联研究领域核心期刊、重要研究力量和全基因组关联研究的历史发展轨迹,为研究人员提供有价值的信息,促进全基因组关联研究工作的进展。     

腰臀比性状的全基因组通路关联分析研究

目的:通过对欧洲裔美国人群腰臀比性状进行全基因组通路关联分析研究,以期寻找与腰臀比性状相关的信号通路。方法:以700例腹型肥胖患者（病例组）和358例正常人群（对照组）为研究对象,利用改良的基因富集分析法（GenGen软件）在全基因组大约550 000个SNP位点,1 347条通路/基因集合中对腰臀比性状进行全基因组通路关联分析。结果:腰臀比二分类变量（病例/对照）分析结果显示,65条通路/基因集合达到显著水平（empirical P<0.05）,其中rasPathway（empirical P=0.003,FDR=0.238）最为显著,该通路相关基因也包含于ceramidePathway（empirical P=0.004,FDR=0.196）和hcmvPathway（empirical P=0.005,FDR=0.203）信号通路中。结论:Ras信号通路可能与欧洲裔中美国人群的腰臀比性状相关。     

肝细胞癌的全基因组关联研究进展

目的 肝细胞癌(HCC)是一种十分常见的恶性肿瘤.作为一种复杂性疾病,环境因素和遗传因素共同影响着HCC的发生、发展.全基因组关联研究(GWAS)凭借高通量技术的日益成熟和对单核苷酸多态性(SNPs)的深入认识,已经成为发现复杂性疾病和特定遗传性状易感位点最重要的有效手段.HCC的GWAS为该疾病的病因预防、临床诊断和个性化治疗等领域提供了重要的线索.本文就近年来GWAS在HCC相关遗传易感位点研究中的进展做一综述.     

心房颤动的全基因组关联研究进展

心房颤动(房颤)的发病随年龄增长而增加,目前已经报道了大量的相关危险因素,而遗传对房颤的作用已达成共识。随着基因鉴定技术的进步,近年来通过全基因组关联研究(GWAS)发现了位于染色体多个区域中的多个遗传易患位点。该文将这些与房颤关联的单核苷酸多态位点(SNPs)及相关临床应用作一汇总,并以这些SNPs为线索探讨房颤的发病机制。     

自发性早产高危因素的分析

目的分析引起自发性早产的高危因素。方法自发性早产孕妇145例为早产组,同期足月自然分娩的孕妇290例为对照组。通过采用单因素、多因素Logistic回归分析,回顾性分析引起自发性早产的高危因素。结果孕妇孕期发生负性事件、产检次数少、胎膜早破、宫内感染、孕期阴道炎、妊娠期糖尿病、多胎妊娠是引起自发性早产的主要高危因素;孕期增长身体质量指数是自发性早产的主要保护性因素。结论自发性早产是多方面因素作用的结果。     

乳腺癌、甲状腺癌和黑色素瘤全基因组关联分析计量和热点研究

全基因组关联研究(GWAS)是利用高通量基因芯片技术,对人类全基因组范围内常见遗传变异-单核苷酸多态性(SNP)和拷贝数变异(CNV)进行总体关联分析的研究方法[1]。国际人类基因组测序和单体型图谱工程的完成,以及经济高效的高通量基因分型技术的开展,使全基因组范围内筛检与疾病相关的序列变异成为可能,通过比较全基因组范围内所有变异的等位基因频率,从中发现与疾病相关联的序列变异[2-3]。2007年,Duggan等[4]和Murabito等[5]利用Illumina及Affymetrix的基因芯片对前列腺癌进行了GWAS,此后,越来越多肿瘤方面的GWAS研究结果陆续发表。本研究使用最新的GWAS数据库之一—NHGRI,分析挖掘乳腺癌、甲状腺癌和黑色素瘤文献特征数据,以期为国内甲状腺、乳腺及皮肤肿瘤GWAS提供参考。     

全基因组关联在研究疟原虫耐药基因中的应用

疟原虫多重耐药性的出现以及日趋扩散的耐药形势成为在疟疾防治工作中的最大挑战。新近发展起来的全基因组关联研究（Genome-wide association studies,GWAS）已经广泛应用于多种复杂疾病或性状易感基因分析的工作中。GWAS提供了一种高通量的在全基因组范围内筛选疟原虫耐药基因的强有力的工具,能够进一步明确耐药机制并指导合理用药。本文对GWAS在疟原虫耐药基因分析中的应用进行初步探讨,以期为疟原虫耐药性基因的研究提供参考。     

全基因组关联分析对银屑病遗传学研究的启示

银屑病是一种常见的免疫异常性增殖性皮肤病。临床特征为皮肤表面履盖大量厚实的鳞屑性斑片。虽然已有大量家族性研究资料表明银屑病的发病存在着遗传因素,但是该病的遗传模式至今尚不清楚。大量研究表明：复杂性疾病的遗传学研究除了MHC的一些位点的相关结果比较恒定外,绝大多数的研究结果变异较大。全基因组关联分析（genome—wide association study,GwAS）是一种对全基因组范围内的常见遗传变异（单核苷酸多态性和拷贝数变异）进行总体关联分析的方法,在全基因组范围内进行整体研究,能够一次性对疾病进行轮廓性概览,适用于包括银屑病在内的复杂疾病的研究。运用全基因组关联分析对银屑病进行的三个研究,刊登在今年2月的《自然一遗传学》杂志,结果发现了几个银屑病的遗传学易感位点,提示在免疫学和其它领域的几个信号通路可能参与了该病的发病机制。无论是以往的关联研究还是现在的全基因组关联分析研究,均提示银屑病与涉及人类免疫性疾病的免疫反应的MHC位点（如HLA—Cw6和其他MHC变异位点）紧密相关。还有两个与银屑病高度相关的与炎症反应密切关联的非MHC基因（IL-12B和IL23R）,也在银屑病的发病机制中起着重要作用。最近运用抗IL-12p40的生物制剂有效治疗银屑病的临床试验,进一步证实了IL-12／23在银屑病病理生理过程中关键作用。在中国人群中进行了银屑病易感基因的GWAS研究发现：位于1q21上的晚期角质化包膜（1atecornifiedenvelope,LCE）基因簇中LCE3A和LCE3D的区域异常与银屑病显著性相关。与此同时,国际上另一个研究小组对西班牙、荷兰、意大利和美国人群中进行的银屑病易感基因的GwAS研究发现,LCE基因簇中LCE3B和LCE3C区域的缺失与银屑病显著性相关。这些相互独立的研究有力地证实LCE基因参与银屑病的发病。到目前为止,虽然已经有了一些针对某些基因的有效靶向治疗手段,但是将诸如LCE等基因用于未来的靶向性治疗,可能更有意义。对LCE基因认识的不断深化,不仅有利于对新的药物靶位的确定,而且对治疗的个体化也有着十分重要的意义。为了阐明银屑病的内在发病机制,未来我们亟需对更大样本的研究,以及其他易感基因位点的鉴定及其下游的功能研究;同时可以预见,利用全基因组关联分析发现的银屑病的易感基因以及其后续的深入研究,将对阐明银屑病发病机制、疾病预警、临床诊断及新药开发起到决定性的作用。     

全基因组关联分析对银屑病遗传学研究的启示

银屑病是一种常见的免疫异常性增殖性皮肤病.临床特征为皮肤表面履盖大量厚实的鳞屑性斑片.虽然已有大量家族性研究资料表明银屑病的发病存在着遗传因素,但是该病的遗传模式至今尚不清楚.大量研究表明:复杂性疾病的遗传学研究除了MHC的一些位点的相关结果比较恒定外,绝大多数的研究结果变异较大.全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是一种对全基因组范围内的常见遗传变异(单核苷酸多态性和拷贝数变异)进行总体关联分析的方法,在全基因组范围内进行整体研究,能够一次性对疾病进行轮廓性概览,适用于包括银屑病在内的复杂疾病的研究.运用全基因组关联分析对银屑病进行的三个研究,刊登在今年2月的<自然-遗传学>杂志,结果发现了几个银屑病的遗传学易感位点,提示在免疫学和其它领域的几个信号通路可能参与了该病的发病机制.无论是以往的关联研究还是现在的全基因组关联分析研究,均提示银屑病与涉及人类免疫性疾病的免疫反应的MHC位点(如HLA-Cw6和其他MHC变异位点)紧密相关.还有两个与银屑病高度相关的与炎症反应密切关联的非MHC基因(IL-12B和IL23R),也在银屑病的发病机制中起着重要作用.最近运用抗IL-12p40的生物制剂有效治疗银屑病的临床试验,进一步证实了IL-12/23在银屑病病理生理过程中关键作用.在中国人群中进行了银屑病易感基因的GWAS研究发现:位于1q21上的晚期角质化包膜(late cornified envelope,LCE)基因簇中LCE3A和LCE3D的区域异常与银屑病显著性相关.与此同时,国际上另一个研究小组对西班牙、荷兰、意大利和美国人群中进行的银屑病易感基因的GWAS研究发现,LCE基因簇中LCE3B和LCE3C区域的缺失与银屑病显著性相关.这些相互独立的研究有力地证实LCE基因参与银屑病的发病.到目前为止,虽然已经有了一些针对某些基因的有效靶向治疗手段,但是将诸如LCE等基因用于未来的靶向性治疗,可能更有意义.对LCE基因认识的不断深化,不仅有利于对新的药物靶位的确定,而且对治疗的个体化也有着十分重要的意义.为了阐明银屑病的内在发病机制,未来我们亟需对更大样本的研究,以及其他易感基因位点的鉴定及其下游的功能研究;同时可以预见,利用全基因组关联分析发现的银屑病的易感基因以及其后续的深入研究,将对阐明银屑病发病机制、疾病预警、临床诊断及新药开发起到决定性的作用.     

孕早期乳酸脱氢酶与自发性早产相关性分析

目的 探讨孕妇血清乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase, LDH)与自发性早产(spontaneous preterm birth, SPTB)的相关性。方法 选取2018年8月～2020年10月在中国福利会国际和平妇幼保健院明确为SPTB的197例孕妇作为病例组,随机选择同期197例足月分娩(full term birth, FTB)的孕妇作为对照组。比较两组间的临床资料,采用多因素Logistic回归分析研究LDH与SPTB之间的相关性。结果 病例组LDH水平较对照组更高,差异有统计学意义(P=0.009),SPTB与LDH呈正相关(r=0.139、P=0.006),在校正了γ-谷氨酰转肽酶、年龄、孕前体重指数、教育水平、孕次、产次、不良妊娠史等协变量后,LDH与SPTB的发生仍存在独立相关性(P=0.008)。结论 LDH与SPTB的发生有密切相关性。     

脂肪肝患者血脂、肝功能检测结果分析

为了了解有关脂肪肝的发生与血脂、肝功能指标变化的关系，我们对312例脂肪肝患者进行了分析。     

全基因组关联研究在冠心病遗传学中的应用进展

冠心病的遗传因素研究是发病机制研究的重要组成部分,全基因组关联研究策略的发展使得其在探究冠心病的遗传因素及发病机制上具有巨大的价值,随着流行病学的进一步发展及应用,将遗传学和流行病学的研究设计方法相结合,已成为目前全基因组关联研究策略的重要方法。在此对近年国内外该方面的研究进展进行归纳总结,探讨存在的问题,并对未来发展趋势作一展望。     

全基因组关联研究在冠心病中的研究进展

目前认为冠心病( CAD)是一种由多因素交互作用的慢性复杂性疾病,是危害人类健康的重大疾病之一,对CAD遗传机制的研究一直备受关注。近些年,全基因组关联研究( GWAS)的引入使CAD易感基因的研究更加快速、可靠,世界各地的医学研究者应用此研究策略已成功发现了多个CAD遗传易感基因或易感位点。现就近些年 GWAS 的进展、面临的挑战及其发展趋势进行阐述。