Ptgs2基因在BXD重组近交系小鼠海马组织中的遗传基因组学分析

目的 研究前列腺素内过氧化物合酶(Ptgs)2基因在BXD重组近交系(RI)小鼠海马组织中的基因表达变化及表达调控.方法 使用基因芯片检测BXDRI小鼠海马组织的基因表达.应用遗传基因组学研究方法进行基因表达数量性状基因座(eQTL)定位分析,寻找Ptgs2基因的上游调控位点、下游调控基因以及协同作用的基因.结果 Ptgs2基因在BXD RI小鼠海马组织中特异性高表达,且控制该基因的eQTL为顺式eQTL,该区域同时还是反式eQTL的富集区,偏相关系数分析发现其中有8个基因为Ptgs2基因的下游调控候选基因.皮尔森相关系数分析显示,BXD RI小鼠基因组中有151个基因与Pgs2密切相关,其中前20个基因与Ptgs2的遗传相关度到达0.59以上.结论 遗传基因组学研究能够有效筛选出Ptgs2基因的上游调控位点、下游调节基因及与之高度协同作用的基因,这部分基因是深入研究Ptgs2基因在多种精神类疾病中分子机制的重要靶点.     

基因芯片分析银杏叶提取物对小鼠肾缺血再灌注损伤的保护作用机制

目的：用基因芯片分析银杏叶制剂（Ginkgo biloba extract，EGb）对肾脏缺血再灌注损伤小鼠的基因表达影响，探讨其保护作用机制。方法：昆明种小鼠30只，随机分为假手术对照组、单纯缺血再灌注组、缺血再灌注＋银杏叶提取物处理组。以香港城市大学基因组科技应用研究中心制作的包含7500个小鼠已知基因和ESTs的cDNA基因表达谱芯片，研究肾脏缺血45min再灌注24h的小鼠肾脏组织基因表达谱，并观察EGb对小鼠肾脏缺血再灌注损伤的基因表达影响。结果：单纯缺血再灌注组的小鼠肾脏组织基因共筛选出差异表达基因255条，其中115条基因表达上调，140条表达下调；缺血再灌注＋银杏叶提取物处理组小鼠肾脏组织共筛选出差异表达基因244条，其中108条基因表达上调，136条表达下调。结论：银杏叶制剂对小鼠肾脏缺血再灌注损伤后的许多基因表达变化都有调节作用，这一综合性作用可能是其保护肾脏缺血再灌注损伤的机制。     

肝硬化及肝癌组织共同差异基因表达的筛选

目的 筛选肝硬化和肝细胞癌(HCC)共同表达的差异基因.方法 按TRIzol法分别抽提2例肝硬化、2例HCC和1例正常肝组织总RNA,逆转录合成掺人生物素标记cDNA合成探针,应用基因芯片进行肝硬化及HCC的相关基因表达谱差异分析,扫描芯片荧光信号图像,计算机分析,比较三种组织基因表达谱差异.结果 发现2例肝硬化组织中共有1424条基因(9.82%)表达差片;2例HCC组织中共有2756条基因(19.01%)表达差异;而2例肝硬化与2例HCC组织中有851条基因(5.87%)共同表达差异,其中共同上调基因有649条,共同下调基因有202条.结论 基因芯片技术能快速筛选肝硬化及HCC相关基因,分析这些共同差异性表达的基因,为阐明肝硬化及HCC复杂的生物学特性与基因表达之间的内在联系,寻找识别肿瘤的标记物提供了可能.     

四氯化碳损伤小鼠肝脏基因表达谱的变化四氯化碳损伤小鼠肝脏基因表达谱的变化

目的研究CCl₄肝损伤小鼠肝脏的基因表达谱，筛选与CCl₄肝损伤相关的基因网络，探讨其肝损伤机制。方法提取小鼠的肝组织总RNA，经反转录分别用Cy3和Cy5荧光标记，制备用于芯片杂交的cDNA探针；cDNA探针与联合基因公司BioStarM-141S小鼠基因表达谱芯片进行杂交，结果由扫描仪扫描并用软件进行分析统计。结果 在CCl₄肝损伤小鼠的基因表达谱中，有379条基因发生了差异性表达(2.69％)。其中，163条基因表达量明显上调，另外216条基因表达量明显下调。结论CCl₄引起小鼠肝脏基因表达谱变化，利用小鼠基因表达谱芯片能大规模、高通量筛选与CCl₄肝损伤相关基因，对进一步阐明CCl₄及类似的化学肝毒物对肝脏的损伤机制有十分重要的意义。     

IL1RN基因在胶质母细胞瘤放疗前后表达变化研究

目的 探讨多形性胶质母细胞瘤(GBM)组织放射治疗前后基因表达谱中相关基因表达差异的变化及意义.方法 采用BioStarH-141s含13929条人类全长基因cDNA表达谱芯片,对5例多形性胶质母细胞瘤组织进行放疗前及放疗60 Gy后检测,并分析它们之间免疫相关基因表达差异.结果 多形性胶质母细胞瘤放疗60 Gy后与放疗前比较,表达差异基因中改变最明显的功能群是免疫系统相关的基因,IL1RN基因上调.细胞增殖、细胞调亡、细胞周期、DNA修复系统也有部分基因发生明显变化.结论 提示对多形性胶质母细胞瘤组织照射60 Gy后基因表达谱改变的研究可以更好地阐明放射敏感性差异机制,为放疗前或放疗早期寻找到预测放射敏感性分子标志提供理论依据.     

IGLV1-44、SLPI、CXCL14在胶质母细胞瘤放疗前后表达及意义

目的研究胶质母细胞瘤(GBM)组织照射60Gy后基因表达谱中免疫相关基因表达差异的变化及意义。方法采用BioStarH-141s(2004)型含13929条人类全长基因cDNA表达谱芯片,对两例胶质母细胞瘤组织进行放疗前及放疗60Gy后检测,并分析它们之间的基因表达差异。结果胶质母细胞瘤放疗60Gy后与放疗前比较,表达差异基因中改变最明显的功能群是免疫系统相关的基因,如IGLV1-44、SLPI、CXCL14等上调。细胞增殖、细胞调亡、细胞周期、DNA修复系统也有部分基因发生明显变化,如MLL5上调、POLR2B下调等。结论提示对胶质母细胞瘤组织照射60Gy后基因表达谱改变的研究可以更好地阐明放射敏感性差异机理。     

六味地黄汤对快速老化小鼠海马差异表达基因的影响

目的研究六味地黄汤(LW)对快速老化小鼠(senescenceacceleratedmouse,SAM)海马差异表达基因的影响,揭示LW增强认知功能的分子作用机制。方法应用快速老化小鼠亚系SAMP8和SAMR1海马差异表达cDNA芯片,比较SAMP8和SAMR1、SAMP8阴性对照和SAMR1阳性对照、石衫碱甲处理的SAMP8和SAMP8阴性对照以及LW处理的SAMP8和SAMP8阴性对照8个基因表达谱,并对LW的药物效应基因进行比较。结果给予SAMP8LW后,基因DUSP12、NSF、STUB1、CAMKⅡα、AMFR、UQCRFS1和11个新基因的表达出现显著差异,这些基因涉及蛋白酪氨酸磷酸酶家族、苏氨酸/丝氨酸蛋白激酶家族、泛素连接酶和线粒体功能等,LW对SAMP8海马的基因表达具有明显的调控作用。结论提示LW作用于认知功能也许是通过维持正常的细胞增殖和分化、保护正常的突触传递、调节Ca2+信号转导、改善线粒体的功能等途径实现的,基因DUSP12、NSF、STUB1、CAMKⅡα、AMFR、UQCRFS1和11个新基因可能是LW改善学习记忆功能的潜在作用靶标。     

施普睿达对荷H22肝癌小鼠基因表达谱的影响

目的研究苦豆子生物碱衍生物施普睿达对荷H22肝癌小鼠基因表达谱的影响,探讨施普睿达抗肝癌的分子机制。方法应用包含4096个小鼠基因的cDNA芯片检测施普睿达对荷H22肝癌小鼠基因表达谱的影响,并对差异基因进行GO聚类和统计分析。结果施普睿达治疗前后共有358个基因出现差异表达,83个基因的表达差异达到3倍以上,表达差异在2倍以上的基因共有275个。经GO分析,差异表达基因包括许多与细胞凋亡、细胞周期、代谢、免疫应答和DNA修复等相关的基因。结论施普睿达主要是通过调控肿瘤细胞周期进程、影响代谢和免疫应答、调节肿瘤细胞凋亡相关基因的表达等多种途径抑制肿瘤的增殖和转移。     

IL1RN和IGLV基因与多形性胶质母细胞瘤放疗关系的研究

目的多形性胶质母细胞瘤(GBM)组织放射治疗前后基因表达谱中相关基因表达差异的变化及意义。方法采用BioStarH-141s含13929条人类全长基因cDNA表达谱芯片,对5例胶质母细胞瘤组织进行放疗前及放疗60Gy后检测,并分析它们之间免疫相关基因表达差异。结果多形性胶质母细胞瘤放疗60Gy后与放疗前比较,表达差异基因中改变最明显的功能群是免疫系统相关的基因,IL1RN和IGLV上调。细胞增殖、细胞调亡、细胞周期、DNA修复系统也有部分基因发生明显变化。结论提示对胶质母细胞瘤组织照射60Gy后基因表达谱改变的研究可以更好地阐明放射敏感性差异机理,为放疗前或放疗早期寻找到预测放射敏感性分子标志提供理论依据。     

异相睡眠剥夺对大鼠学习记忆能力及海马基因表达谱的影响

目的观察96 h异相睡眠剥夺(PSD)对大鼠学习记忆能力及海马基因表达谱的影响。方法利用改良多平台水环境法制备PSD动物模型,六角迷宫行为学范式评价大鼠学习记忆能力;在此基础上利用基因芯片技术研究PSD对大鼠海马全集因表达谱的影响,对差异基因(上调或者下调倍数变化值≥2.0,且P值≤0.05)进行GO和KEGG富集分析;并对部分差异表达基因进行RT-PCR验证。结果与大平台对照组(TC)比较,PSD大鼠认知率明显降低(P<0.05);两组大鼠海马差异表达基因共100个:其中25个基因上调,75个基因下调;GO分析结果表明,上调基因主要与细胞生长及分化的负性调节、学习记忆、炎症反应、氧化应激、突触传递等生物学过程有关;下调基因主要与免疫应答、神经系统发育、突触传递、代谢过程、信号转导、递质分泌、细胞凋亡、转录过程等过程有关;利用KEGG数据库对差异基因进行信号通路分析,发现差异基因主要参与c GMP-PKG、代谢、NF-κB、癌症等多条信号通路过程。结论 PSD可引起大鼠记忆能力的下降,并伴随海马多种基因表达异常;PSD导致的学习记忆能力下降可能与多种基因表达及信号通路的变化有关。     

酸枣仁-柏子仁组分调控睡眠障碍中神经递质的研究

目的:探讨宁心安神中药酸枣仁-柏子仁对小鼠下丘脑5-HT能神经通路表达的影响。方法:首先,实验通过检测酸枣仁-柏子仁有效组分对小鼠海马区、下丘脑部位以及前额叶皮质区色氨酸羟化酶(TPH)和5-HT含量变化,考察酸枣仁-柏子仁有效组分对小鼠海马区、下丘脑部位以及前额叶皮质区TPH和5-HT生成的影响;其次通过TRIZOL法提取小鼠下丘脑RNA进行逆转录,最后运用Real-time PCR技术检测5-HT转运体的编码基因Slc6a4基因及5-HT1A受体编码基因Htr1a表达比值,以此探讨酸枣仁-柏子仁有效组分对小鼠下丘脑5-HT转运体编码基因及5-HT1A受体编码基因表达的影响。结果:实验结果显示,与空白组相比,给药组小鼠下丘脑部位、海马区以及前额叶皮质区TPH和5-HT的含量均显著升高(P<0.05);酸枣仁-柏子仁有效组分能使小鼠下丘脑部位Slc6a4基因表达明显降低,而Htr1a基因表达明显增加。结论:实验结果表明酸枣仁-柏子仁有效组分能通过影响色氨酸羟化酶(TPH)、5-HT转运体编码基因Slc6a4基因及5-HT1A受体编码基因Htr1a基因来增强5-HT能神经系统的效应...     

三氧化二砷对小鼠小脑氧化还原相关酶基因表达谱的影响

目的 应用基因芯片技术观察三氧化二砷(As2O3)对小鼠小脑组织氧化还原相关酶基因表达谱的影响.方法 昆明种小鼠30只随机分为3组,即生理盐水对照组、低剂量组(1 mg/L As2O3染毒组)和高剂量组(4 mg/L As2O3)染毒组),连续染毒60 d,断头法处死小鼠,利用基因芯片技术检测基因表达谱的变化.结果 基因芯片筛选结果显示,与对照组比较,染砷组中差异表达2倍及以上的基因有18条,其中表达上调的基因有12条,表达下调的基因有6条.高剂量组与低剂量组及对照组比较,表达上调的基因有Ndufa4、Ndufa6、Gpx3、Adil、Rrm2b,表达下调的基因有Spr、Hsd17b11、Ogfod1、Ndufab1.与对照组比较,染砷组中Cyp51、Phgdh、Dhrs4、Prdx4、Aldh1a、1810063805Rik、Glrx表达上调,Prdx2、1110020P15 Rik表达下调.结论 As2O3对小鼠小脑的氧化还原相关酶基因表达谱具有明显的影响,提示这些小脑氧化还原相关酶基因很可能是砷的神经毒作用的靶点.     

舒郁胶囊对经前期综合征肝气郁证模型大鼠不同脑区μ-阿片受体基因分布与表达的影响

目的 分析大鼠额叶、海马、下丘脑和杏仁核脑区μ-阿片受体(MOR)基因的分布与表达变化,探讨舒郁胶囊的中枢作用机制。方法 复制经前期综合征(PMS)肝气郁证大鼠模型并用舒郁胶囊和纳洛酮进行药物干预,利用原位杂交技术和实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)技术分别对大鼠不同脑区MOR基因进行定性和定量检测。结果 与正常组大鼠比较,PMS肝气郁证模型组大鼠海马、额叶、下丘脑、杏仁核组织MOR基因过量表达,差异有统计学意义(P 0.05);与PMS肝气郁证模型组大鼠比较,纳洛酮组额叶组织MOR基因表达无改变,差异无统计学意义(P 0.05),舒郁胶囊及纳洛酮药物干预组其他各相应脑区MOR基因表达均显著下降,差异有统计学意义(P 0.05)。结论 海马、额叶、下丘脑和杏仁核MOR基因表达异常升高可能是PMS肝气郁证的中枢发病机制之一,舒郁胶囊可通过拮抗该受体基因表达而具有抗抑郁样作用。     

酸性寡糖对阿尔茨海默病模型小鼠脑内基因表达的影响

目的应用基因芯片检测酸性寡糖971对阿尔茨海默病(AD)模型小鼠脑内基因表达谱的影响。方法 Balb/c小鼠随机分为对照组、AD模型组(β-AP_25-35侧脑室注射)和971给药组，采用Morris水迷宫测试小鼠行为学改变；提取各组小鼠大脑皮层总RNA，与含有1 176个基因的cDNA表达谱芯片进行杂交。并用RT-PCR对其中5个基因表达进行验证。结果AD模型组寻找平台潜伏期比对照组显著延长，给予971可使其明显缩短。基因芯片结果显示，模型组与对照组存在表达差异的基因共有31个，其中上调19个，下调12个；给药组与模型组存在表达差异的基因共有17个，其中上调13个，下调4个。RT-PCR结果显示基因变化趋势与芯片结果相符。结论酸性寡糖971改善AD模型小鼠学习记忆功能可能与DNA损伤修复、神经生长、突触可塑性、免疫应答等相关基因的表达变化有一定关系。     

双侧嗅球切除对小鼠行为、海马神经递质及抑郁相关基因表达的影响

目的研究双侧嗅球切除对C57BL/6小鼠行为和海马神经递质及抑郁相关基因表达的影响。方法用探针捣毁并用负压吸出小鼠嗅球建立嗅球切除模型,术后18 d开始分别进行强迫游泳、悬尾、旷场、高架迷宫行为学测试,同时应用LC-MS/MS液质联用法检测海马内7种神经递质的变化,实时定量PCR法检测海马抑郁相关基因的表达。结果嗅球切除后小鼠在旷场中的水平运动明显增加(P<0.05),进入高架迷宫开臂的时间明显延长(P<0.01),海马组织中的5-HIAA/5-HT明显降低(P<0.01),Glu/GABA明显增高(P<0.01)。同时海马组织中的BDNF、Trkb、GDNF、CD11b、TNF-α基因表达明显升高(P<0.05),而TPH2基因表达下调(P<0.05)。结论嗅球切除导致小鼠多种行为学改变,是多种神经传递以及神经营养因子、炎症因子和合成蛋白基因综合作用的结果,提示将该模型作为抗抑郁药物的研发及筛选工具时需要综合考虑多方面因素的影响,从而对实验结果作出科学合理解释。     

银耳多糖的抗肿瘤作用及其机制

目的 观察银耳多糖对荷H22 肝癌小鼠的抑瘤作用,应用基因表达谱芯片研究其抗肿瘤作用的机制. 方法 建立荷H22 肝癌的小鼠模型,用肿瘤抑制率评价银耳多糖对肿瘤的抑制作用;用基因表达谱芯片研究其抗肿瘤作用的机制. 结果 银耳多糖在6 mg&#8226;kg-1时抑制肿瘤效果最好,抑瘤率为72.3%.基因表达谱芯片分析 结果 表明,共有324个基因有表达差异.其中表达上调基因185个,表达下调基因139个.经初步分析,主要为信号转导基因、DNA损伤检测/p53和ATM通路基因、抗原递呈基因、化疗应答相关基因等. 结论 银耳多糖对肿瘤有较好的抑制作用,其抗肿瘤作用是多靶点、多因素作用的 结果 ,既与癌症相关基因有关,又与免疫调节、信号传导等基因有关.     

用mRNA差异显示技术筛选和克隆小鼠海马有关基因

目的　建立筛选和克隆小鼠海马有关基因的方法。方法　采用mRNA差异显示技术筛选和克隆了快速老化模型小鼠 (SAM )海马内有关基因。结果　采用mRNA差异显示技术从SAM海马内筛选和克隆了 6个基因片段 (W1～W 6 ) ;该方法的主要优点在于可同时比较两组以上的样品 ,具有灵敏度高、简便快速等特点 ,尤适合于寻找和克隆微量样品和表达水平较低的基因。结论　mRNA差异显示技术是一种较好的筛选和克隆小鼠海马有关基因的方法。     

铅对海马神经元型一氧化氮合酶及其基因表达的影响

目的　观察实验性铅中毒对小鼠海马神经元型一氧化氮合酶 (nNOS)及其基因表达的影响 ,探讨铅致学习记忆损害的分子毒理学机制。方法　小鼠用 5g L醋酸铅溶液染毒。采用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)方法 ,半定量分析染毒 2、4和 8周小鼠海马nNOS基因表达的变化。采用尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸黄递酶 (NADPH d)组织化学染色法分析铅染毒对小鼠海马NOS阳性神经元的影响。结果　nNOSmRNA存在于正常小鼠海马组织中 ;铅染毒后仅 2周 ,海马nNOSmRNA的含量显著减少 ;随着染毒时间的增加 ,海马nNOSmRNA的含量逐渐下降。镜下观察 ,视野中正常小鼠海马平均NOS阳性细胞数为 ( 5 7 63± 11 5 )个 ,而铅染毒组仅为 ( 2 9 3 5± 9 10 )个。结论　铅可使小鼠海马nNOS及其基因表达下降     

胚胎期砷暴露对成年小鼠海马神经炎症反应的影响

目的研究胚胎期砷暴露对成年小鼠海马组织神经炎症反应相关基因表达的影响,探讨砷影响认知发育的毒理学机制。方法 7周龄雌性和雄性ICR小鼠以2∶1的比例合笼交配,受孕小鼠随机分为4组,对照组饮用去离子水,低、中、高砷暴露组分别饮用含0.15 mg/L,1.5 mg/L,15 mg/L三氧化二砷的去离子水,攻毒处理至仔鼠出生,试验组母鼠停止砷暴露。各组分别选12只雌性仔鼠,于65日龄麻醉处死并分离海马组织,Trizol法提取总RNA,采用实时荧光定量-聚合酶链反应(qRT-PCR)技术检测相关基因的表达。结果与对照组相比,低浓度砷暴露组小鼠海马组织同种异体移植炎性因子-1(Aif-1)的表达显著升高(P<0.01);胶质纤维酸性蛋白(GFAP)的表达在低、中、高浓度砷暴露组均升高;CC趋化因子配体3(CCL3)的表达在中浓度砷暴露组中显著升高(P<0.05);N-甲基-D-天冬氨酸受体(NMDAR)亚基NR1的表达在中浓度砷暴露组中显著降低(P<0.05);NR2B的表达在中浓度砷暴露组中显著降低(P<0.01)。结论胚胎期砷暴露会引起小鼠成年期海马组织胶质细胞活化继而释放大量促炎症因子,并降低NMDAR有关亚基的表达,这是砷影响小鼠认知发育的分子机制之一。     

基因芯片筛选胶质母细胞瘤放疗前后相关基因表达谱的变化

目的使用基因芯片筛选胶质母细胞瘤组织照射60Gy后基因表达谱的变化。方法采用BioStarH-141s(2004)型cDNA表达谱芯片,对2例胶质母细胞瘤组织进行放射治疗前及放射治疗60Gy后检测,并分析它们之间的差异表达基因。结果胶质母细胞瘤放射治疗60Gy后与放射治疗前比较,组织表达差异基因上调10个,下调7个。表达差异基因中改变最明显的基因是NALP1、LDOC1、HLA-DOA等。部分基因功能涉及细胞调亡、细胞增殖、DNA修复系统等,如MLL5上调、POLR2B下调等。结论对胶质母细胞瘤组织照射60Gy后基因表达谱改变的研究可以更好地阐明放射敏感性差异机理,为放射治疗前或放射治疗早期寻找到预测放射敏感性分子标志提供理论依据。