淫羊藿治疗阿尔茨海默病作用机制的网络药理学与分子对接研究

目的 基于网络药理学与分子对接的方法探讨淫羊藿治疗阿尔茨海默病(AD)的潜在作用机制.方法 通过中医药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索和筛选淫羊藿的相关成分和作用靶点,从GeneCards数据库获取AD相关靶点,取两者共同靶点,运用Cytoscape 3.82对共同靶点进行拓扑学分析得到核心靶点,利用DAV...     

基于网络药理学和分子对接探讨当归建中汤治疗痛经的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨当归建中汤治疗痛经的有效成分、潜在靶点及作用通路,阐述其作用机制.方法:通过TCMSP网站建立当归建中汤有效成分与靶点数据库,利用CTD、DisGeNET、Drugbank数据库筛选痛经相关的靶点,对药物靶点与疾病靶点取其交集,利用STRING数据库构建PPI蛋白作用关系,clus...     

基于网络药理学研究血必净注射液治疗肝脏缺血再灌注损伤的作用机制

目的:运用网络药理学的方法预测血必净注射液治疗肝脏缺血再灌注损伤的主要活性成分、靶点及信号通路,探究其潜在作用机制.方法:通过TCMSP数据库筛选血必净注射液中丹参、赤芍、红花、川芎、当归五味中药的活性成分及其作用靶点,通过OMIM和GeneCards Suite数据库获取肝脏缺血再灌注损伤相关靶点,同时获取药物-疾病...     

基于网络药理学探讨七福饮治疗阿尔茨海默病的机制

目的:基于网络药理学方法探讨七福饮治疗阿尔茨海默病(AD)的活性成分及其作用机制。方法:应用中药系统药理学(TCMSP)分析平台、ETCM数据库、SymMap数据库筛选七福饮的活性成分及作用靶点。利用Genecards数据库、OMIM数据库、Pubmed-Gene数据库筛选AD相关靶点,取交集得到七福饮治疗AD的靶点。将上述靶点导入STRING数据库,利用Cytoscape软件构建"活性成分-作用靶点"网络和蛋白相互作用(PPI)网络,筛选出关键成分和关键靶点,并进行GO生物功能注释和KEGG通路分析。应用Schrodinger软件进行分子对接验证。结果:对七福饮共筛选出106个活性成分、511个作用靶点,AD相关靶点369个。"活性成分-作用靶点"网络分析显示,山柰酚、β-谷甾醇、豆甾醇可能是七福饮治疗AD的关键活性成分。PPI网络分析显示,丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、脑源性神经营养因子(BDNF)、胰岛素(INS)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、肿瘤蛋白p53(TP53)可能是七福饮治疗AD的关键靶点。通路分析提示,七福饮治疗AD的机制可能与多巴胺能突触、cAMP信号通路、白介素-17信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-AKT)信号通路等有关。分子对接显示,AKT1与腺嘌呤、BDNF与Inermine、INS与川芎内酯E、MAPK3与异甘草黄酮醇、TP53与7-乙酰氧基-2-甲基异黄酮的结合能力较强。结论:七福饮通过多成分、多靶点、多通路减轻神经元损伤,发挥治疗AD的作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨真武汤治疗慢性肾衰竭的作用机制

目的:利用网络药理学和分子对接方法探讨真武汤治疗慢性肾衰竭( CRF)的作用机制.方法:采用TCMSP数据库筛选真武汤中有效成分及靶点,并将靶点导入Uniprot数据库匹配基因名.利用OMIM、Drugbank、Genecards、CTD数据库筛选CRF靶点并与真武汤靶点取交集.将交集靶点导入STRING数据库进行PP...     

基于网络药理学探讨枸杞子-山药防治阿尔茨海默病的作用机制

目的 运用网络药理学的方法预测枸杞子-山药防治阿尔茨海默病(AD)的作用靶点,绘制蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图、核心靶点基因图并对预测出的信号通路进行分析,从系统水平深入探讨枸杞子-山药防治AD的作用机制.方法 通过检索中药系统药理数据(TCMSP)查找枸杞子-山药的所有化学成分后做出筛选,保留其有效成分及作用靶...     

基于网络药理学角度探讨当归四逆汤对子宫内膜异位症的干预机制

目的 基于网络药理学探讨当归四逆汤治疗子宫内膜异位症（EMS）的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选当归四逆汤有效活性成分及潜在靶点，在Genecard、OMIM和TTD数据库中寻找EMS相关靶点基因取当归四逆汤靶点基因与EMS相关靶点基因共同靶点。通过Cytoscape 3.5.0软件构建“当归四逆汤活性成分-潜在靶点-EMS”网络图。运用String数据库构建构建蛋白质互作（PPI）网络图。对潜在靶点基因进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路分析。结果 数据库筛选的得到当归四逆汤有效活性成分151个，与EMS相关潜在作用靶基因71个，KEGG富集通路分析主要包括化学致癌受体激活，脂质和动脉粥样硬化通路等。结论 当归四逆汤具有多活性成分，能通过多靶点，多通路发挥EMS保护作用。     

消炎膏外用干预血栓性浅静脉炎作用机制网络药理学研究

目的:利用网络药理学研究方法预测消炎膏外用干预血栓性浅静脉炎的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)挖掘消炎膏组成药物的入血成分及作用靶点,通过DisGeNET、基因卡片(GeneCards)、人类在线孟德尔遗传平台等数据库筛选出血栓性浅静脉炎的相关靶点.运用Cytoscape3.7.1软件构...     

基于网络药理学探讨温胆汤治疗血管性痴呆作用靶点和作用机制研究

目的 基于中药网络药理学和分子生物学探讨温胆汤(WDT)治疗血管性痴呆(vascular dementia,VD)的作用靶点及分子机制.方法 应用BATMAN-TCM数据库及TCMSP数据库对温胆汤的活性成分及作用靶点进行筛选,在GeneCards、OMIM数据库中筛选VD的作用靶点,在通过Venn温恩图工具获取温胆汤...     

基于网络药理学探讨牛大力治疗抑郁症的活性成分及分子机制

目的:采用网络药理学方法研究牛大力治疗抑郁症的活性成分及作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)与文献资料检索筛选出牛大力活性成分;运用Swiss Target Prediction预测成分靶点,并从Gene Cards数据库中预测抑郁症相关靶点;同时,采用Cytoscape 3.2.1软件构建活...     

基于网络药理学及分子对接方法分析佩兰治疗2型糖尿病作用机制

目的 运用网络药理学及分子对接方法分析佩兰治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Drugbamk、UniProt数据库筛选出佩兰的活性成分及靶点;采用GeneCards、CTD及OMIM数据库获取T2DM相关基因,并与药物靶点相互映射,得到共同靶点;采用STRIN...     

基于网络药理学探讨生脉散治疗心律失常作用机制

目的:基于网络药理学探讨生脉散治疗心律失常的分子机制.方法:使用TCMSP和TCMID数据平台筛选生脉散的有效成分,TCMSP及STITCH数据库筛选药物作用靶点,通过TTD、DRUGBANK及DisGeNET数据库检索心律失常的疾病靶点.制作韦恩图获得相关交集,使用String数据库制作靶点间相互作用网络,并依据置信...     

当归平喘复方的优选及其治疗支气管哮喘的作用机制分析

目的 优选当归平喘复方并分析复方治疗支气管哮喘的作用机制。方法 检索中国知网(CNKI)全文数据库,收集临床及名中医治疗支气管哮喘的当归复方,对当归复方所涉及中药的频次、性味归经及功效进行统计分析,对频次较高的中药进行关联规则分析,从而筛选当归治疗支气管哮喘的优选复方。利用中药系统药理学数据库(TCMSP)、PubChem及Swiss Target Prediction数据库查询当归优选复方活性成分及对应靶点,采用DisGeNet、在线人类孟德尔遗传(OMIM)及美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库筛选支气管哮喘相关靶点,将二者靶点匹配映射得到当归优选复方治疗支气管哮喘的关键靶点,对关键靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络、基因本体(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析,利用Cytoscape 3.7.1软件构建中药-关键成分-关键靶点与通路-关键靶点网络,并借助Network Analyzer计算网络拓扑参数。结果 CNKI数据库近15年临床治疗支气管哮喘的复方共计578首,涉及中药302味,其中以补虚药、化痰止咳平喘药最为常见,归经以肺、脾、肝...     

三七花治疗阿尔兹海默病的网络药理学分析及分子对接

目的 用网络药理学及分子对接方法，研究三七花改善阿尔兹海默病(AD)的作用机制。方法 采用TCMSP数据库筛选三七花活性成分和相应靶点，利用DisGeNET数据库和GeneCards数据库查找AD的相关靶点、Cytoscape 8.0软件构建“活性成分-靶点”关联网络，并对关键靶点进行GO功能富集和KEGG通路分析。将筛选得到的三七花活性成分和作用靶点通过分子对接验证。结果 三七花活性成分中有23个成分对应AD靶点34个。主要通过西多糖苷(Sitogluside)、 β-谷甾醇(beta-sitosterol)、 β-榄香烯等活性成分调控CHRM1、CHRM2、PTGS2等靶点改善AD，特别是西多糖苷、 β-谷甾醇与PTGS2、CHRM2等靶点有较强的结合。结论 三七花的活性成分可能通过调控CHRM1、CHRM2、PTGS2、ADRB2、SLC6A4、PTGS1、RELA、IL10等靶标，PI3K-Akt信号通路等多个途径发挥干预AD的作用。     

芪苈强心胶囊治疗慢性充血性心力衰竭作用机制的网络药理学研究

目的:运用网络药理学分析芪苈强心胶囊治疗慢性充血性心力衰竭的作用机制.方法:从TCMSP平台获取芪苈强心胶囊的化学成分和作用靶点,利用TTD、Drugbank、DisGeNET数据库筛选慢性充血性心力衰竭(CHF)的靶点,将疾病靶点与药物靶点进行Venn分析,筛选二者共同靶点,应用string平台构建蛋白-蛋白相互作用...     

基于网络药理学探讨“黄芪-当归”药对防治肿瘤疾病的物质基础及作用机制研究

目的:运用科学的网络药理学方法进行关于黄芪-当归药对与抗肿瘤疾病的物质基础及相关作用机制的分析讨论。方法:首先学习运用TCMSP(中药系统药理学技术平台)数据库,利用该数据库进行黄芪-当归两味药的有效活性成分以及关键靶点的预测及相关可靠条件的筛选,同时利用GeneCards网站(基因注释)操作得到肿瘤疾病相关的作用靶点,再利用数据分析网站进行Venn分析,将黄芪和当归药对的化学成分、成分所对应的靶点以及肿瘤疾病所对应的靶点进行相关连接使其形成"药物-主要活性成分靶点-疾病"药理学网络的体系。然后将筛选该药对中得到的有效活性成分的目标靶点导入Cytoscape 3.7.2软件进行分析整理得到靶点连接图。最后利用String数据库将该药对抗肿瘤疾病治疗的关键靶点分析获取蛋白相互作用关系网络,并进行GO功能分析和KEGG通路分析得到该药对中治疗肿瘤疾病的关键靶点中的分子功能及相关作用信号通路等分析结果。结果:通过查找及相关条件筛选后得到该药对共有22个有效活性成分,涉及到的相关作用靶点共计184个,包括"PTGS1""CHRM3""KCNH2""ADRB1"和"PGR"等,相关信号通路122条,相关的作用机制则主要通过调控抗恶性肿瘤与抗感染、钙离子等通路来进行。结论:利用网络药理学的方法可以得到黄芪-当归药对在肿瘤疾病的防治中体现出了中药成分-多靶点-不同途径-疾病的特点,并且为该药对的抗肿瘤治疗的物质基础及其相关的作用机制提供了可能的科学依据。     

基于网络药理学探究杏仁-桔梗药对治疗急性支气管炎的作用机制研究

目的:运用网络药理学方法,筛选"杏仁-桔梗"药对治疗急性支气管炎的作用靶点,探讨其作用机制.方法:借助中药系统药理数据库(TCMSP)分别检索中药杏仁、桔梗的活性化学成分并搜集对应靶点,通过GeneCards和OMIM数据库查询急性支气管炎的疾病靶点,利用维恩图分析得到药物和疾病的交集靶点,将交集靶点上传至String...     

基于网络药理学探讨知柏地黄汤治疗前列腺癌的作用机制

目的 基于网络药理学探讨知柏地黄汤治疗前列腺癌的作用机制.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和UniProt数据库获取知柏地黄汤有效成分及作用靶点,通过OMIM和CTD数据库筛选前列腺癌的相关靶点,将有效成分靶点与疾病靶点取交集,运用Cytoscape 3.7.1软件构建药物-有效成分-靶点-疾病网...     

基于网络药理学和分子对接探讨六味地黄丸治疗糖尿病的作用机制

目的:运用网络药理学和分子对接探究六味地黄丸治疗糖尿病的作用机制.方法:运用中药网络药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出六味中药的主要成分,通过SwissTargetPrediction、SEA和PharmMapper共同预测化合物的靶点,运用Cy-toscape构建成分-靶点网络.通过DisGeNET、T-HO...     

当归-川芎药对治疗脑梗死的“调控网络”和机制

目的:本研究借助网络药理学的方法预测当归-川芎药对治疗脑梗死的潜在靶点,探讨其调控网络及作用机制。方法:首先,本研究运用在线中医药生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)筛选当归-川芎作用的共同靶点;其次,通过OMIM数据库、GAD数据库、TTD数据库以及PharmGKB数据库筛选与脑梗死相关的靶点,并通过Cytoscape3.6.1软件筛选"药物-靶点-疾病"网络中的关键靶点;最后,利用DAVID 6.8在线分析工具对得到的关键靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集,并运用Omicshare在线分析工具对通路富集结果进行可视化。结果:通过筛选得到当归-川芎药对的共同靶点229个,脑梗死相关的作用靶点102个,通过网络合并和拓扑最终得到当归-川芎药对治疗脑梗死的关键靶点493个,其中涉及154个生物过程,65种细胞组成,51种分子功能及20条具有显著意义的通路(P0.01,FDR0.05)。结论:当归-川芎药对可能通过Thyroid hormone信号通路、Neurotrophin信号通路、MAPK信号通路及PI3K信号通路发挥治疗脑梗死的功效。其中,Thyroid hormone信号通路可能是治疗脑梗死的新方向。