云南省食源性沙门菌血清分型及脉冲场凝胶电泳的指纹图谱

目的 研究云南省食源性沙门菌的血清型, 用脉冲场凝胶电泳 (PFGE) 方法对优势血清型进行分子分型, 建立云南省食源性沙门菌PFGE指纹图谱资料库, 为食源性疾病溯源提供数据.方法 对2013年至2016年从云南省食源性疾病监测中分离到的322株食源性沙门菌进行血清学分型, 采用Bio Numerics软件对148株沙门菌DNA酶切图谱进行类聚分析, 通过聚类比较分析菌株间的相关性, 建立指纹图谱库.结果 322株沙门菌血清分型主要包括A、B、C、D、E、F、G群等7个群, 鼠伤寒沙门氏菌是主要血清型, 占11.4% (37/322) .采用Bio Numerics软件对148株沙门菌DNA酶切图谱进行类聚分析, 根据电泳产生条带的位置和数量的不同, 共分为102个不同的PFGE带型.按照90%的相似度, 这些PFGE带型可以分为39个大小不一的聚类群, 呈现多样性.结论 云南省食源性沙门菌分子分型复杂, 以鼠伤寒沙门氏菌为主, PFGE带型呈现多样性.     

深圳市布吉街道从业人员沙门菌PFGE分型分析

目的了解深圳市龙岗区布吉街道从业人员携带沙门菌的血清型、耐药特点及脉冲场凝胶电泳(pulsed fieldgel electrophoresis,PFGE)分子分型特点。方法对从深圳市龙岗区布吉街道2011~2012年健康从业人员肛拭子样品中分离的19株沙门菌进行生化及血清学分型鉴定、改良K-B法药敏试验和开展PFGE分子分型分析。结果 19株沙门菌以B群(11株)和C1群(4株)为主;19株沙门菌对四环素的耐药率最高,为57.9%,其次为甲氧苄氨嘧啶和磺胺甲基异恶唑(新诺明),均为42.1%,8株菌有多重耐药的现象,为42.1%;PFGE分子分型菌株之间的相似度在57.4%~94.1%,同一血清型的沙门菌相互间的相似度均低于85.0%,同一血清型别的沙门菌可对应多个PFGE型别。结论深圳市布吉街道从业人员携带的沙门菌的PFGE型别呈现多样性,PFGE指纹图谱与血清学型别无相关性;19株沙门菌对头孢类抗生素完全敏感,对其他抗生素存在中度敏感或耐药,耐药谱与PFGE分型无直接的关联。     

腹泻患者沙门菌脉冲场凝胶电泳分型及分布特征

目的了解2014年乌鲁木齐该市引起腹泻患者腹泻的沙门菌的分子流行病学特征,为追踪传染来源,查找传播途径提供线索。方法将分离获得的76株沙门氏菌进行血清型鉴定,采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对不同时间,不同地区的76株肠道沙门分离菌进行电泳分型,所得结果运用Bio Numerics 6.6软件进行聚类分析。结果 76株沙门菌血清分型检出最多的是肠炎沙门菌,占39.5%。所有76株沙门菌株酶切图谱分为41个PFGE型,分别命名为S-1~S-41,菌株间条带相似度为46.5%~100.0%。从时间分布上看,全年5~10月均能分离到沙门菌株,感染的高发季节为6月(27.6%,21/76)、7月(23.7%,18/76)和9月(23.7%,18/76)。结论 2014年乌鲁木齐市引起腹泻的沙门菌血清型以肠炎为主,PFGE分型较为分散;不同PFGE型别在时间及地区分布上均提示了一定的流行规律,应当引起重视。     

广东省中山市2018—2019年沙门菌血清型分布、耐药性及分子分型

目的 了解中山市沙门菌的血清型分布、分子分型特征以及对抗生素的耐药情况。方法 对2018—2019年中山市哨点医院以及食物中毒事件采集检出的沙门菌进行血清型分型,采用微量肉汤稀释法（MIC）对15种药物进行药物敏感试验,应用脉冲场凝胶电泳法（pulse-field gel electrophoresis, PFGE）对3种优势血清型沙门菌进行分子分型。结果 509株沙门菌共鉴定出44种血清型,优势血清型为鼠伤寒沙门菌单相变种（173/509,34.0%）、鼠伤寒沙门菌（107/509,21.0%）、肠炎沙门菌（93/509,18.3%）和斯坦利沙门菌（21/509,4.1%）。179株沙门菌中耐药菌株占93.9%（168/179）,多重耐药菌株占85.5%（153/179）。共产生82种耐药谱,最常见的耐药谱为AMP-AMS-TET-CHL-SXT-CFZ-Sul和AMP-TET-CHL-SXT-Sul。暂未检出对亚胺培南耐药的菌株,对其余14种试验药物均存在耐药现象,其中对氨苄西林、四环素、磺胺异噁唑、氯霉素、复方新诺明耐药率均超过60%。耐受10种及以上抗生素的菌株有22株,占12.3%（22/179）。42株鼠伤寒沙门菌单相变种分出40个PFGE带型,各型别相似度为52.2%~100.0%;32株鼠伤寒沙门菌分出24个PFGE带型,各型别相似度为48.9%~100.0%;21株肠炎沙门菌分出9个PFGE带型,各型别相似度为55.5%~100.0%。结论 中山市沙门菌血清型主要为鼠伤寒沙门菌单相变种、鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌,多重耐药现象严重,PFGE分子分型结果呈多样性。     

上海市宝山区2015—2018年腹泻病人沙门菌血清分型和分子分型

目的 揭示上海市宝山区腹泻病人分离沙门菌的血清型和分子分型分布特征。方法 对2015—2018年分离的118株沙门菌进行血清分型和脉冲场凝胶电泳（pulsed-field gel electrophoresis,PFGE）分型,通过构建聚类树揭示不同血清型菌株的分子分型特征。结果 118株沙门菌分为25种血清型,前三位为肠炎沙门菌（45株,38.1%）、鼠伤寒沙门菌（26株,22.0%）、伦敦沙门菌（11株,9.3%）。其余22种血清型分别只包含1~3株菌。118株沙门菌通过PFGE分为71个PFGE带型,每个带型分别包含1~19株菌。45株肠炎沙门菌分为8个PFGE带型,相似度为75.0%~100.0%,在聚类树上形成一个簇;26株鼠伤寒沙门菌分为21个PFGE带型,相似度为48.0%~100.0%,在聚类树上形成两个簇;11株伦敦沙门菌分为8个PFGE带型,相似度为80.0%~100.0%,在聚类树上形成一个簇。结论 肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌是上海市宝山区腹泻病人沙门菌优势血清型,但近年伦敦沙门菌有增多的趋势。肠炎沙门菌在本地区传播流行过程中的遗传变异相对比较保守,鼠伤寒沙门菌基因型多态性大,而且存在两个克隆。     

食品中副溶血弧菌血清学分型与分子分型的研究

目的分析深圳市2007～2010年监测食品中副溶血弧菌存在的优势血清型与基因型之间的相似性,初步建立深圳市食源性副溶血弧菌脉冲场凝胶电泳分子分型监测网络。方法选择2007～2010年监测食品中分离出来的副溶血弧菌主要血清群（O1-O4）55株,基因组DNA经Sfi1酶切,通过脉冲场凝胶电泳PFGE获得图谱,利用BioNumerics分析软件对图谱进行聚类分析。结果相似性在90%以上的有15株,其中有9株相似性为100%,分别是2株O2：K28;1株O1：KUT与1株O4：K42;5株O3：K6,其余菌株谱型差异较大。结论监测食品中分离的副溶血弧菌PFGE型别多,且相互之间关系分散。PFGE分子分型监测网络的建立,有助于食源性疾病发生时的主动监测,爆发调查和传染源追踪。     

街道饮食及服务行业从业人员携带沙门菌的病原学特征研究

目的分析龙岗街道饮食及服务行业从业人员健康体检分离的沙门菌的耐药性及分子分型。方法对分离到的11株沙门菌进行血清学分型鉴定,并采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）和改良K．B法分别进行分子分型和药敏试验。结果11株沙门菌鉴定出B群5株,E1群6株。对四环素的耐药率最高（63．64％）,其次为氨苄西林（54．55％）、链霉素（54．55％）,5株菌有多重耐药的现象（45．5％）。PFGE分子分型菌株之间的相似度在51．8％。96％之间．同一血清型的沙门菌相互间的相似度均低于85％。结论从业人员携带的沙门菌耐药比较严重,PFGE分型、血清型与耐药谱无直接关联。     

深圳市甲型副伤寒PulseNet数据库的建立与应用

目的建立深圳市甲型副伤寒PulseNet数据库,用于甲型副伤寒的实时监测和分子流行病学调查。方法采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术,对深圳市2002-2007年散发和爆发的243株甲型副伤寒沙门菌的染色体DNA进行酶切电泳,用BioNumerics软件对PFGE分型图谱电子化数据分析,建立分子分型数据库。结果深圳市甲型副伤寒菌株各年间差异较小,用Xba酶切仅呈现6种PFGE图谱。同一起甲副暴发的临床分离株具有相同的PFGE图谱。各区和各年代的分离株都存在有相同的PFGE带型。结论深圳市甲型副伤寒沙门菌变异较小,呈长期流行趋势,甲型副伤寒PulseNet数据库的初步建立,对直观地分析各起疫情之间的相互关系,对疫情的控制和传染来源的追踪具有重要意义。     

江苏省张家港市2017年人源沙门菌血清型特征及分子分型

目的 分析2017年张家港检出的92株人源沙门菌的血清学特征,用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术对优势血清群进行分子分型研究,为该地区沙门菌菌型库积累数据。方法 收集和提取2017年张家港地区人源沙门菌患者血清学特征,对优势群B群沙门菌进行PFGE分子分型检测,利用PulseNet China网络获得相关性指纹图谱并进行聚类分析。结果 92株沙门菌分离株分布7个血清群和16个血清型,以B群为主（33.70％）,30株B群沙门菌PFGE指纹图谱可分为26个基因型（相似值100% 为同一PFGE 型别）,19个克隆系（相似度在0.85~1.00的为同一PFGE的克隆系）。其中9株德尔卑沙门菌可分为5个克隆系7个基因型,7个基因型相似度60.92％~100％;7株阿贡那沙门菌PFGE指纹图谱5个克隆系6个基因型,6个基因型相似度0~100%;6株鼠伤寒沙门菌可分为3个克隆系5个基因型,5个基因型相似度48.51％~100％。结论 张家港市人源沙门菌血清型多样化分布,B群沙门菌为优势血清群。沙门菌PFGE带型较多,基因多态性较高,同一血清型可获得不同PFGE指纹图谱。其中德尔卑沙门菌亲缘关系近,鼠伤寒部分菌株存在较近的亲缘关系,阿贡那沙门菌各克隆系存在明显差异,亲缘关系较远。     

广东省中山市2018-2019年沙门菌血清型分布、耐药性及分子分型

目的了解中山市沙门菌的血清型分布、分子分型特征以及对抗生素的耐药情况。方法对2018—2019年中山市哨点医院以及食物中毒事件采集检出的沙门菌进行血清型分型,采用微量肉汤稀释法(MIC)对15种药物进行药物敏感试验,应用脉冲场凝胶电泳法(pulse-field gel electrophoresis, PFGE)对3种优势血清型沙门菌进行分子分型。结果 509株沙门菌共鉴定出44种血清型,优势血清型为鼠伤寒沙门菌单相变种(173/509,34.0%)、鼠伤寒沙门菌(107/509,21.0%)、肠炎沙门菌(93/509,18.3%)和斯坦利沙门菌(21/509,4.1%)。179株沙门菌中耐药菌株占93.9%(168/179),多重耐药菌株占85.5%(153/179)。共产生82种耐药谱,最常见的耐药谱为AMP-AMS-TET-CHL-SXTCFZ-Sul和AMP-TET-CHL-SXT-Sul。暂未检出对亚胺培南耐药的菌株,对其余14种试验药物均存在耐药现象,其中对氨苄西林、四环素、磺胺异噁唑、氯霉素、复方新诺明耐药率均超过60%。耐受10种及以上抗生素的菌株有22株,占12.3%(22/179)。42株鼠伤寒沙门菌单相变种分出40个PFGE带型,各型别相似度为52.2%～100.0%;32株鼠伤寒沙门菌分出24个PFGE带型,各型别相似度为48.9%～100.0%;21株肠炎沙门菌分出9个PFGE带型,各型别相似度为55.5%～100.0%。结论中山市沙门菌血清型主要为鼠伤寒沙门菌单相变种、鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌,多重耐药现象严重,PFGE分子分型结果呈多样性。     

中央空调冷却塔水嗜肺军团菌PFGE分子分型

目的 了解中山市中央空调冷却塔水血清1型（LP1）及血清7型（LP7）嗜肺军团菌脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型情况。方法 对2012—2014年从中山市部分酒店、娱乐场所、商场、医院等公共场所中央空调冷却塔水样本中分离出的41株LP1型嗜肺军团菌和12株LP7型嗜肺军团菌进行脉冲场凝胶电泳,运用Bio Numerics6.6软件进行聚类分析。结果 按照100%的相似程度,41株LP1型嗜肺军团菌分为26种PFGE型别,每个带型包括1~6株菌,菌株之间的相似系数为16.6%~100%;12株LP7型嗜肺军团菌分为10种PFGE型别,每个带型包括1~2株菌,菌株之间的相似系数为19.3%~100%。不同地区和不同年份分离的菌株存在相同的PFGE型别;同一场所可存在相同的PFGE型别,也可跨月份或年份存在不同的型别。按照90%以上的相似程度, LP1型嗜肺军团菌有4个克隆群,包含的菌株数和PFGE带型占其血清型别分离株总数以及PFGE型别总数的51.2%（21/41）和30.8%（8/26）;LP7型嗜肺军团菌有2个克隆群,包含的菌株数和PFGE带型占其血清型别分离株总数以及PFGE型别总数的50.0%（6/12）和40.0%（4/10）。克隆群在空间和时间分布上无明显差异。结论 中山市中央空调冷却塔水中LP1型及LP7型嗜肺军团菌分离株存在广泛的PFGE基因型别,未形成某一优势基因群的地区优势及时间趋势。     

一起由两种型别沙门菌混合感染引起暴发疫情的病原特征

目的 对一起由科瓦利斯沙门菌和鼠伤寒沙门菌混合感染引起的食源性暴发的病原体进行耐药分析和分子分型。方法 参照 GB4789.4-2010标准对可疑菌落进行生化鉴定、血清学分型及药敏试验后,进行脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型。结果 从两份暴发病例粪便样品中同时检出科瓦利斯沙门菌（8,20∶z4,z23∶-）2株和鼠伤寒沙门菌（4,5,12∶i∶1,2）2株。选择13种常用的抗生素进行药敏试验, 4株沙门菌均对阿米卡星和庆大霉素耐药,其中2株科瓦利斯沙门菌还同时表现出对莫西沙星和四环素耐药。2株科瓦利斯沙门菌和2株鼠伤寒沙门菌的PFGE指纹图谱分别完全一致。结论 这是一起由科瓦利斯沙门菌和鼠伤寒沙门菌混合感染所致的食源性暴发,PFGE分子分型可有效应用于食物中毒的溯源分析。     

贵阳市甲型副伤寒沙门菌脉冲电场凝胶电泳分型分析

目的了解贵阳市甲型副伤寒沙门菌的分子流行病学特征,分析菌株的相似性,为追踪传染来源、查找传播途径提供线索。方法用脉冲电场凝胶电泳(pulsed field gelelectrophoresis,PFGE)方法进行分型。结果根据细菌染色体DNA的SpeI酶切图谱,将贵阳地区146株甲型副伤寒沙门菌分成10个PFGE带型,1型32株占21.9%,2型73株占50.0%,3型13株占8.9%,4型7株占4.8%,5型14株占9.6%,6型、7型、8型和9型各1株,各占0.7%,10型3株占2.7%,各型之间的相似性在98.1%～72.0%。暴发株24株被分为5个PFGE带型,1型占54.2%,带菌者1株为1型。各年菌株的PFGE带型不尽相同,1型和2型为常年流行带型。高流行区县的甲型副伤寒菌株被分为9个PFGE带型。结论贵阳地区甲型副伤寒沙门菌流行复杂以2型和1型为优势流行带型,提示存在同一克隆群的菌株广泛传播。该研究进一步证实PFGE是一种发现或预警暴发的可行服务手段。     

一起多型别副溶血性弧菌引起的食物中毒病原学研究

目的对一起由多种血清型副溶血性弧菌引起的食物中毒病原菌进行毒力基因及分子分型研究。方法参照国家标准方法对事件中可疑样品进行病原菌分离鉴定,对分离的副溶血性弧菌进行血清学试验,采用荧光定量PCR检测菌株的毒力基因耐热直接溶血素基因（tdh）、耐热直接溶血素相关溶血素基因（trh）与不耐热溶血素基因（tlh）,并用脉冲场凝胶电泳（PFGE）对分离到的菌株进行分子分型。结果从24份病人标本和1份剩余食品中检出副溶血性弧菌25株;血清型分布为O4：K8 4株,O3：K6 19株,O4：KUT 1株和O3：KUT 1株;分离到的25株副溶血性弧菌毒力基因检测均为tdh＋tlh＋trh-;PFGE聚类分析显示,不同血清型菌株分为不同的簇,同一血清型菌株的PFGE条带型间存在1~2个条带的差异,菌株间存在关联。结论这是一起由多种血清型副溶血性弧菌引起的食物中毒。     

北京地区宋内志贺菌分子流行病学特征分析

目的 了解北京地区宋内志贺菌毒力基因分布及分子流行病学特征. 方法 采用实时荧光PCR方法检测毒力基因、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型,多位点序列分型(MLST)及多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)等方法对北京地区2001～2009年50株志贺菌菌株进行分子流行病学特征分析. 结果 50株菌中,ipaH、set1、sen三种毒力基因的携带率分别为98％,18％和78％.选取19株流行病学和遗传背景无关的菌株,进行MLST、MLVA与PFGE分型方法的比较,MLST为1个序列型ST152 complex:adk(11)、fumC (63)、gyrB(7)、icd(1)、mdh(14)、purA (7)、recA(7); MLVA被分成15个型别,D值为0.9708;PFGE分成12个型别,D值为0.9532.MLVA初筛得到的8个可变数目串联重复(VNTR)位点用于扩大菌株分析,发现50株志贺菌被分为21个MLVA的型别,TS002和TS001为主要型别. 结论 北京地区近年来流行的宋内志贺菌存在毒力基因的丢失,MLVA分子型别复杂,存在多克隆来源,提示需要进行连续系统的分子流行病学监测.     

广东省中山市2017年沙门菌耐药菌谱及分子分型分析

目的 了解中山市2017年沙门菌的耐药特征及分子分型,为临床合理用药和食源性疾病的溯源提供科学依据。方法 对中山市2017年食源性疾病监测（3个哨点医院）的沙门菌分离株采用微量肉汤稀释法进行14种抗生素药敏试验,运用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术对肠炎沙门菌进行分子分型。 结果 中山市2017年食源性疾病监测检出的285株沙门菌对14种抗生素敏感性试验结果显示,237株（占83.16％）沙门菌对13种抗生素呈现不同程度的耐药性,未发现对亚胺培南（IPM）耐药菌株。耐药抗生素最多的种类达到11种,耐药率较高（40 %以上）的抗生素为氨苄西林（AMP）、四环素（TET）、氨苄西林/舒巴坦（SAM）、氯霉素（CHL）;共有87类耐药谱型,其中多重耐药谱型75类（86.21%）,多重耐药菌株数为176株（61.75%）。25株肠炎沙门菌的PFGE分为5种带型,相似度为63.9%~100.0%。结论 中山市2017年食源性疾病监测显示沙门菌耐药状况较为严重,呈多重性和多态性,应采取综合措施控制耐药性;肠炎沙门菌PFGE的相似度较高,存在优势带型。