展望21世纪 从医药信息学到生命信息学

本文说明信息学与医学相结合的新趋势：从医药信息学到生命信息学。基于五年来的研究与探索，作者提出生命信息学的基本概念，主要原理和知识结构。生命信息学是生命科学与信息科学的边缘交叉学科。当前的医药信息学以传统的生物学为基础，以医疗信息化为目标。生命信息科学的任务是使传统生命科学信息化，全面修订传统的生命观、人体现、健康观、诊疗观及预防观。随着生命信息医学及其疗法的建立与完善，当前的医药信息学将逐步改观。生命信息学的基本原理包括：信息唯物论原理、一般信息学原理、信息决定论原理等。以生命信息运动的层次性为依据，生命信息学的主要分支为：分子信息学（包括遗传信息学），细胞信息学，器官信息学（包括神经系统信息学），个体信息学（包括人体心理学），种群信息学（包括社会心理学、管理科学等）。生命信息学将会成为２１世纪中的新兴带头学科，它不仅给生命科学和医学带来革命性的改变，而且对信息科学、哲学及人文科学也造成重大影响     

关于生命信息学研究的回顾与展望

本文的目的是回顾八年来关于生命信息学研究的基本过程，并就这个新兴边缘交叉学科在今后几年的发展提出若干设想。概略地说，可以把相关的研究分为三个阶段。一是关于生命信息学基本思想和概念的形成（１９９２～１９９５），二是其知识体系基本框架的逐步确认（１９９５～１９９８），三是作为学科特定术语集的初步建立（１９９８～２０００）。今后的几年内，关于生命信息学的研究任务是在深入、细化总论的同时，展开对各论的研究，构成生物分子信息学、细胞信息学、个体信息学、社会信息学四大分支，并逐步填平跨在自然科学和社会科学之间的鸿沟。     

响应时代的呼唤,开创关于生命信息学的研究

生命信息学是在生命科学和信息科学的交叉点上生长起来的新兴边缘交叉学科。随着社会生产的主流由物质产品转向信息产品，信息科技日益成为当代高新科技的主导与核心。生物学的重心正在由生命硬件转向生命软件，医学和农学已呈现出明显的“信息化”趋势。基因工程、癌细胞程序性死亡疗法、心理门诊等信息学疗法，迫切地需要理论上的支持与说明。计算机科学的并行分布式处理急需向生命信息处理过程学习。时代呼唤着生命信息学。生命信息学的创立和发展，不仅需要生命科学 、信息科学工作者的参与，而且需要数学、物理、化学、哲学、心理学、以及许多社会文化方面的学者的合作。     

理论信息学:概念、原理与方法(Ⅴ/Ⅵ)

9理论信息学的方法论任何一门科学都会因为研究对象的特殊性而需要特殊的研究方法,信息科学也不例外。如果说,整个物质科学的基本方法是还原论方法,那么整个信息科学的基本方法是涌现论方法。也就是说,在理论信息学层次上的一般的方法学是涌现论。而在各个领域信息学内有它们各     

生命信息科学的诞生

高度密集的信息，特别是以计算机开发和应用为主的现代模糊信息学包括文献信息学，管理信息学等，都应归属于非生命的信息学科学，而生命信息学则是学术领域的新生儿，它以独创一帜的科学依据，与众不同的崭新的思维方式，在信息科学基础理论研究中将领袖群雄，下文主要谈及生命信息科学诞生与发展有关的几个群为人知的问题。     

响应时代的呼吸,开创关于生命信息学的研究

生命信息学是生命科学和信息科学的交叉点上生长起来的新兴边缘交叉学科。随着社会生产的主流由物质产品转向信息产品，信息科技日益成为当代高新科技的主导与核心。生物学的重心正在由生命硬件转向生命软件，医学和农学已呈现出明显的“信息化”趋势。基因工程，癌细胞程序性死亡疗法，心理门诊等信息学疗法，迫切地需要理论上的支持与说明。     

生命信息学要走交叉的研究道路

生命信息学的学科体系决定了其研究方法与思路 ;走交叉研究的道路。本文着重论述生命信息学的主要内容 ,以及与各部门信息学的关系 ,最终得出其研究方法     

关于生命信息科学发展的一些见解

虽然生命信息学自诞生之日起就以其较高的学术价值得到国际学术界的认可，但毕竟还不够成熟，需要从事生命信息学研究的专家学者共同努力探索，完善其学科的理论体系。本论文对生命信息学发展的相关问题提出笔者粗浅的见解，期待与各位专家学者交流与商榷。     

生命诈学走交叉的研究道路

生命信息学的学科体系决定了其研究方法与思路;走交叉研究的道路,本文着重论述生命信息的主要内容,以及与各部门信息学的关系,最终得出其研究方法。     

开创临床诊断信息学的探索与研究

随着科学技术的飞速发展，从人体基因水平到社会和自然界对疾病的影响，极大地丰富了人的生命与生存信息。这些信息将为医学，特别是临床诊断提供了非常丰富的信息资源，如何存贮、管理、加工、传递和利用这一资源，这将是临床诊断信息学研究的课题。     

整个大自然是一个有目的的存在——理解自然信息学和社会信息学的目的论原理

上世纪中叶以来，曾经被物理学革命打入冷宫的目的论的自然观复活了，成为理解自然奥秘的研究纲领。对此．汉斯。约纳斯从三个角度对自然目的性进行了论证：人为事物的目的归根结底是人的目的；主体性存在者的目的则是属于生命体本身的；非人为而又非生命的事物整体可称为前意识的自然界，它也是有目的的，因为它是主体性存在的土壤，其目的通过主体性的存在者表现来。本文试图说明，由于控制论、系统论和信息科学所解释的目的论原理成为自然信息学和社会信息学研究的共同纲领，因此就构成理论信息学的目的论原理：“程序目的论”。     

论生命信息学与医学信息研究

生命信息学是在医学信息研究的基础上萌发的信息学科，而它对“母体”进行拓展、延伸，同时又进行了前所未有的创新，为信息科学理论体系的建立做出了努力的探索，显示出光明的学术前景。医学信息研究要建立起较为系统的科学理论体系，就要突破传统，用生命信息学的既得原理和思维方式去作指导，创立新说。     

信息科学及其发展简史探讨

本文概略地讨论信息科学的研究内容和基本结构,以及应用信息学和理论信息学在其中的地位和作用,简要地回顾信息科学发展的历史,指出它已经经历的信息科学的史前时期、工具信息学时期、领域信息学时期和理论信息学时期的若干重要史实.     

理论信息学在医学信息学领域的应用

理论信息学揭示宇宙间一切信息现象的基本规律,是信息科学的理论核心.医学信息学是医学、计算机学、信息学等学科的交叉学科,注重实践应用的研究而缺乏成形的基础理论.理论信息学为医学信息学提供理论基础,构建信息科学的研究范式等.     

理论信息学的发展现状

在当今社会,信息技术高速发展,许多传统的学科纷纷接受信息化,衍生出医学信息学等领域信息学.领域信息学的发展,"国家信息化"以及社会转型的提出催生了理论信息学.本文主要介绍了理论信息学的产生过程及其国内外发展现状,并提出理论信息学的发展需要改变以往的物理学科学范式,转向信息学科学范式.     

理论信息学视野中的软件范型

面向对象范型已经代替结构化范型成为了计算机软件工程方法学的主流．然而它并没有停滞不前，而是在不断的完善与发展中，本文从理论叶言息学方法论的角度论述了软件范型的发展过程及其意义，以及系统科学信息化对软件业发展的影响．从而指出了理论信息学在软件范型研究中的意义．     

医学信息学研究的某些进展

医学信息学是一门新兴的交叉学科，近年来的研究已取得重大进展，本文从医学信息学的沿革及现状，医学信息学研究的范围及内容，医学信息学教育及医学信息学的发展与人才培养等四方面进行论述。     

浅谈生物医学信息学专业课程的发展特点

本文旨在介绍生物医学信息学的概念和发展的历史,以及跟医学信息学和生物信息学的关系,分析生物医学信息学发达的美国高校该专业课程的体系的设计和内容,从而总结出该门课程的主要研究方向特点以及该门课程的发展趋势.     

人体系统中的信息学问题

本文的目的是探讨人体信息系统的层次特征，以及不同层次生命信息之间的关联和调控作用。人体是各种运动形式的统一体。信息学的方法是撇开其生物物质和生物化学能量的特性，侧重研究生命信息及其运动过程的规律性。它强调生命信息系统的组成和关联以及其间的通讯、编程与调控。最后，笔者提出一个有别于传统西方医学的概念，信息医学。     

论信息科学的世界观V／V

第九章信息现象的实证思维、理论思维与哲学思维 本章以物质科学知识体系的发展脉络为参照,讨论了信息科学大致相同的发展逻辑,阐述了信息现象的实证思维、理论思维和哲学思维.笔者自1979年从数学步人计算机领域以来的学术经历,大致从计算机软件工程,经过医学信息学(及生命信息学)、理论信息学,走到了信息哲学.所以这样走过来,并不自觉,是在"跟着感觉走".笔者体会到了某种学术行进的"惯性",好像"身不由己",有时欲停不能,欲罢不忍.本章中包含了笔者与合作伙伴们近三十年来的学术经历总结,其中渗透着指导教授们的心血.