基于网络药理学与分子对接探讨沉香治疗缺氧性肾损伤的作用机制

目的:基于网络药理学探究沉香治疗缺氧性肾损伤的潜在机制。方法:通过TCMSP数据库筛取沉香活性组分及作用靶点；从GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank数据库获取肾缺氧相关靶点，利用String平台构建PPI网络并挖掘潜在蛋白质功能模块。Metascape平台分析所涉及的生物过程及通路，Cytoscape 3.8.2软件构建“沉香成分—肾脏缺氧靶点—通路”网络，Autodock软件进行分子对接验证。结果:沉香改善肾脏缺氧的核心成分包括槲皮素、β-谷甾醇、6,7-二甲氧基-2-(苯乙基)色酮等，核心靶点有BAX、IL6、AKT1、BCL2、TP53等，对接结果中Affinity小于-5者占93.3%,提示靶点和成分间较好的结合活性。关键靶点主要富集于AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化通路、HIF-1信号通路以及p53信号通路等20个显著相关通路，涉及细胞凋亡、炎症反应、免疫调节、缺氧及氧化应激等100多个显著相关生物学过程。结论:本研究初步探析了沉香治疗缺氧性肾损伤的潜在机制，为沉香在肾脏疾病中的应用提供科学依据。     

基于网络药理学探究肾康栓治疗糖尿病肾病作用机制

目的:应用网络药理学探究肾康栓治疗糖尿病肾病的药物作用机制。方法:通过TCMSP现有数据库查询肾康栓的活性成分及靶点，在GeneCards数据库查询糖尿病肾病的靶点，制作韦恩图得到二者共同靶点。利用Cytoscape3.9.1软件制作药物-活性成分-靶点-疾病网络，在String平台得到PPI网络并进行拓扑分析，利用Metascape平台做GO和KEGG富集分析。结果:肾康栓活性成分117个，活性成分靶点226个，糖尿病肾病靶点1 191个，二者交集靶点108个，918条成分与靶点相互作用。JUN、STAT3、AKT1、RELA、MAPK1为肾康栓治疗糖尿病肾病关键靶点，AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、肿瘤信号通路等为重要通路。结论:肾康栓在多成分、多靶点、多通路的机制上治疗糖尿病肾病，为后续研究奠定理论基础。     

淫羊藿治疗糖皮质激素性骨质疏松症分子机制的网络药理学分析

目的利用网络药理学方法探索淫羊藿治疗糖皮质激素性骨质疏松症(glucocorticoid-induced osteoporosis,GIOP)的分子作用机制。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选淫羊藿的活性成分及相关靶点;运用Gene Cards数据库、OMIM数据库获取GIOP的疾病靶点;通过R语言将药物靶点与GIOP疾病靶点取交集;利用Cytoscape 3.7.0软件构建"淫羊藿-活性成分-GIOP靶点"网络;运用String数据库构建"淫羊藿-GIOP"共同靶点蛋白互作网络;运用R语言进行GO生物功能和KEGG通路富集分析。结果通过筛选获得淫羊藿的23个主要活性成分,一共涉及GIOP相关的65个靶点;槲皮素(quercetin)、山奈酚(kaempferol)、木犀草素(luteolin)和淫羊藿苷(anhydroicaritin)能与10个以上相关靶点连接,是淫羊藿治疗GIOP的主要成分;白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、丝裂原激活蛋白激酶-8(MAPK8)、胱冬酶-3(CASP3)和雌激素受体-1(ESR1)是"淫羊藿-GIOP"共同靶点蛋白互作关系中连接次数最多的5个靶点,为核心靶点基因。结论淫羊藿有可能是通过前列腺癌信号通路、细胞凋亡信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、TNF信号通路和糖尿病并发症中AGE-RAGE信号通路等多个途径发挥治疗GIOP的作用。为后期的药效机制研究提供了新的思路和方向。     

基于网络药理学及分子对接探究麻黄附子甘草汤合肾着汤治疗膜性肾病的作用机制

目的:通过网络药理学探讨麻黄附子甘草汤合肾着汤治疗膜性肾病(MN)的作用机制。方法:通过TCMSP平台收集麻黄附子甘草汤合肾着汤的活性成分与靶点信息;在GeneCards、OMIN、TTD、DrugBank数据库获得MN相关靶点;利用STRING分析两者交集靶点的相互作用关系并筛选核心靶点;核心靶点输至Metascape数据库进行GO及KEGG富集;使用AutoDock进行分子对接验证。结果:共获得253个复方靶点,4 092个疾病靶点及170个交集靶点;在PPI网络中共获得23个核心靶点并通过Matescape平台得出靶点通路信息;分子对接结果表明主要成分与核心靶点具有良好的结合能力。结论:网络药理学研究得出,方中槲皮素、山奈酚等核心成分作用与AKT1、TNP、TP53、JUN等核心靶点通过直接或间接调控AGE-RAGE、IL-17、TNF等信号通路发挥治疗MN的作用。     

滋肾降糖丸治疗糖尿病骨质疏松的作用机制探索

目的 通过网络药理学及分子对接的方法探讨滋肾降糖丸治疗糖尿病骨质疏松的作用机制。方法 首先分别在TCMSP及BATMAN-TCM数据库中检索滋肾降糖丸(Zishen Jiangtang Pill, ZJP)的活性成分及作用靶点,GeneCards和OMIM数据库中检索DOP的相关靶点,并利用Venny系统获取ZJP作用于DOP的靶点;然后通过String数据库制作蛋白互作网络,运用Cytoscape软件构建“有效成分-靶点”网络图并利用插件CytoNCA获取网络核心靶点;再通过DAVID数据库对靶点进行GO功能及KEGG富集分析;最后通过PubChem数据库、PDB数据库、ChemOffice软件,进行分子对接,分析结合活性。结果ZJP中主要活性成分236个,关键活性成分5个,ZJP作用于DOP的靶点151个,核心靶点16个,GO富集条目66条,KEGG通路富集条目104条,分子对接良好。结论 ZJP可能作用于TNF、IL-6、VEGF、mTOR、ESR1、PPARG等靶点,通过糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、Wnt/β-cat...     

基于网络药理学和分子对接技术探究左卡尼汀治疗附睾炎的作用机制

目的:基于网络药理学及实验研究探究左卡尼汀治疗附睾炎的潜在作用机制。方法:通过多个数据库联用检索出附睾炎与左卡尼汀相关的靶蛋白,在Venny软件获得两者的共同靶点。应用STRING数据库获得蛋白-蛋白之间的相互关系。利用Cytoscape软件进行可视化,拓扑分析后筛选出关键靶点。使用DAVID数据库进行GO与KEGG通路富集分析。使用Autodock Vina进行分子对接。结果:共获得药物靶点130个,疾病靶点2 151个,共同靶点47个。PPI网络分析得到左卡尼汀治疗附睾炎的核心靶点包括AKT1、HSP90AA1、ALB、CASP3、GSK3B和GSR等。KEGG通路分析提示代谢途径、脂质与动脉粥样硬化、癌症途径、流体剪切应力与动脉粥样硬化、麻疹、化学致癌物质-活性氧物质、嘌呤代谢、P13K-Akt等信号通路可能与左卡尼汀治疗附睾炎的机制有关。结论:本研究通过网络药理学揭示了左卡尼汀可能作用于AKT1、HSP90AA1、ALB、CASP3、GSK3B、GSR等靶点调节多条信号通路,从而可能发挥对附睾炎的治疗效果。     

基于网络药理学的济生肾气丸治疗骨质疏松症的分子机制研究

目的应用网络药理学分析技术研究济生肾气丸治疗骨质疏松症(OP)的分子作用机制。方法通过TCMSP数据库查询并筛选出济生肾气丸全方共10味中药的活性成分及有效靶点;检索Comparative Toxicogenomics Database (CTD)、Gene Cards、Online Mendelian Inheritance in Man(OMIM)三大疾病靶点数据库查询骨质疏松症相关靶点;利用Venny 2.1统计复方与疾病的交集靶点,并绘制Venn图。利用Cytoscape 3.6软件,绘制活性成分-交集靶点网络图。将交集靶点导入String数据库后获得的数据经Cytoscape的Cyto Hubba插件构建蛋白互作网络图。通过DAVID数据库进行基因功能GO分析和KEGG通路富集分析,并利用R-studio软件进行气泡图绘制。利用Cytoscape绘制核心靶点与KEGG通路的网络图。结果济生肾气丸中共得到63个活性成分,预测出211个相关靶点;经过三大数据库共检索出OP相关靶点3 126个;复方与疾病交集靶点132个。通过Cytoscape构建交集基因蛋白互作网络图与核心靶点-通路网络图,按照连接节点(degree)大小排列显示济生肾气丸主要通过作用于AKT1、MAPK1、IL6、MAPK8、JUN、VEGFA等靶基因及调控肿瘤坏死因子信号通路、白细胞介素17信号通路、AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化信号通路等发挥治疗OP的作用。结论济生肾气丸治疗OP具有多成分、多靶点、多系统的特点,其作用机制可能通过抑制破骨细胞的生成、刺激成骨细胞的活性、调节骨代谢平衡、降低炎症反应等途径有关。     

全杜仲胶囊辅助治疗高血压肾病作用机制的网络药理学研究

目的:采用网络药理学方法,探讨全杜仲胶囊治疗高血压肾病的潜在作用机制。方法:应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)、中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)结合文献挖掘获取全杜仲胶囊的活性成分和作用靶点;通过GeneCards、OMIM数据库获取高血压肾病的疾病靶点;筛选出与全杜仲胶囊共同的靶点,进而利用Venny 2.1绘制共同靶点韦恩图;利用STRING构建共同靶点互作网络(PPI);应用Cytoscape 3.7.1软件构建成全杜仲胶囊-高血压肾病-靶点交集的网络;通过R语言软件对共同靶点进行GO分析和KEGG富集分析,筛选出潜在通路并分析其作用机制。结果:从全杜仲胶囊中共获得22个生物活性成分,通过筛选交集得到103个全杜仲胶囊作用于高血压肾病的共同靶点,核心靶点为AKT1、MAPK1、IL6、FOS、VEGFA,主要富集在AGE/AGE受体、流体剪切应力与动脉粥样硬化、醛固酮调节的钠再吸收、肿瘤坏死因子等信号通路。结论:全杜仲胶囊可能通过多靶点、多途径发挥其整体调节效应而治疗高血压肾病,为后续实验研究提供可靠的理论基础及有益参考。     

基于网络药理学的排毒保肾丸治疗慢性肾衰竭作用机制研究

目的:通过网络药理学筛选排毒保肾丸治疗慢性肾功能衰竭(chronic renal failure,CRF)的作用靶点和相关信号通路,明确其作用机制。方法:应用TCMSP、BATMAN-TCM数据库结合文献挖掘获取排毒保肾丸的活性成分和作用靶点;通过Gene Cards、OMIM数据库获取慢性肾功能衰竭的疾病靶点;筛选出与排毒保肾丸共同的靶点,进而利用Venny 2.1绘制共同靶点韦恩图;利用STRING构建共同靶点互作网络(PPI);应用Cytoscape 3.7. 1软件构建成排毒保肾丸丸活性成分-CRF-靶点交集的网络;通过R语言软件对共同靶点进行GO分析和慢性肾功能衰竭作用靶点的KEGG分析,筛选出潜在通路并分析其作用机制。结果:筛选出排毒保肾丸中生物活性成分44个,作用于22个CRF的共同靶点,核心靶点为IL-6、CCND1、CASP3、VEGFA、FOS,主要涉及类固醇受体活性、DNA转录活性、核受体活性等生物过程,主要富集在IL-17、TNF、AGE-RAGE、NF-κB等信号通路。结论:排毒保肾丸通过多成分、多靶点、多通路的整体调节作用而治疗CRF,为后续实验研究提供可靠的理论基础及参考。     

基于网络药理学探析金钱草作为石淋要药治疗肾结石的作用机制研究

目的:基于网络药理学方法探讨金钱草作为石淋要药治疗肾结石的作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选金钱草的有效成分及相应的靶蛋白,通过Genecards、OMIM数据库筛选出肾结石的靶点,利用R语言获取药物与疾病的共同靶点并作出Venn图,运用Cytoscape3.7.1软件构建“化合物-靶点-疾病”网络图。使用String数据库绘制蛋白互作(PPI)网络,并对其有效作用靶点进行GO功能、KEGG通路富集分析。结果:在已知61种金钱草有效成分中共筛选出10个,对应有效作用靶点305个。通过Venn图获得81个药物-疾病共同靶点,PPI网络发现AKT1、IL6、JUN、MAPK1、VEGFA等可能是金钱草治疗肾结石的关键靶点。GO功能分析发现81个靶基因影响了100个生物功能,体现在分子的功能上对分子的代谢与合成等生物学功能普遍具有正向调节作用。KEGG通路分析发现81个交集靶点显著富集在141条通路上(P0.05),其中金钱草主要活性成分相关靶点富集最多的通路为AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications,其中包含了钙信号通路、MAPK信号通路等经典信号通路。结论:该研究初步揭示了金钱草治疗肾结石的关键靶点和涉及的生物学过程以及信号通路,发现其作用是多靶点、多通路的,从分子层面对金钱草作为“石淋之要药”治疗肾结石提供了一定的参考依据。     

肉苁蓉治疗慢性肾脏病和骨质疏松症的潜在双效成分及作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨肉苁蓉治疗慢性肾脏病合并骨质疏松症(CKD-OP)的潜在双效成分及作用机制。方法 通过多个数据库和文献检索筛选出肉苁蓉的活性成分及其对应靶点与慢性肾脏病(chronic kidney disease，CKD)和骨质疏松症(osteoporosis，OP)疾病相关靶点的交集，于STRING数据库构建PPI网络，经CytoHubba插件筛选核心靶点后在DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析，于Cytoscape构建活性成分-核心靶点-信号通路网络后获得关键成分、关键靶点和关键信号通路，最后在AutoDockTools进行分子对接验证。结果 得到肉苁蓉治疗CKD-OP关键成分3个(槲皮素、β-谷甾醇、红景天苷)，关键靶点6个(TNF、AKT1、MAPK1、JUN、RELA和PTGS2)，关键信号通路3条(TNF 、NF-κB 和Oxytocin 信号通路)。结论 初步揭示肉苁蓉通过“多成分-多靶点-多途径”的特点治疗CKD-OP的潜在分子药理机制，为中药现代化和CKD-OP的治疗提供了理论依据和思路。     

基于网络药理学的济生肾气丸治疗糖尿病肾病的机制研究

目的:采用网络药理学方法预测济生肾气丸治疗糖尿病肾病(DN)的活性成分和作用机制。方法:利用TCMSP平台获得济生肾气丸药物活性成分及基因靶点,利用GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD和DrugBank等数据库获取DN相关的基因靶点,利用Venny 2.1绘制共同靶点韦恩图;采用Cytoscape 3.9软件构建“药物-成分-靶点”相互作用网络;利用STRING构建PPI网络并进行拓扑分析;通过R/BioConductor对共同靶点进行GO及KEGG富集分析。结果:共获得济生肾气丸生物活性成分72个,筛选到济生肾气丸治疗DN的潜在靶点167个,核心靶点为AKT1、INS、PTGS2、IL6、CASP3等,主要富集在脂质与动脉粥样硬化、AGE-RAGE、流体剪切应力、HIF-1等信号通路。结论:济生肾气丸通过抗氧化应激、抗炎、抗凋亡、抗增殖等作用修复DN受损的肾脏微血管系统,保护肾功能。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨通关丸治疗良性前列腺增生的作用机制

目的:通过网络药理学及分子对接技术探讨通关丸治疗良性前列腺增生(BPH)的作用机制。方法:查询TCMSP、BATMAN-TCM及ETCM获取通关丸的药物成分,在Swiss Target Prediction对药物成分的ADME进行筛选,并预测筛选后的药物成分的作用靶点;运用DisGeNET、Genecards及OMIM获取BPH的疾病靶点,利用venny2.1获取通关丸治疗BPH的作用靶点。使用STRING平台及Cytoscape软件构建PPI网络,利用Metascape进行GO富集分析和KEGG信号通路分析。使用Cytoscape软件构建"有效成分-作用靶点-信号通路"网络图。利用PubChem、PDB及PyMoL、AutoDock软件进行分子对接。结果:通关丸中的27个有效成分通过多个通路作用于88个疾病靶点治疗BPH,其中槲皮素、黄柏酮、Kihadalactone A、鬃毛酮、Melianone是核心成分,AKT1、MAPK1、PIK3CA、PIK3CB、PIK3CD、EGFR、MAPK14是核心靶点。GO富集分析发现通关丸主要参与血液循环、转移酶活性的正向调节、细胞对氮化合物的反应等生物进程,膜筏、转移含磷基团的转移酶复合物、谷氨酸能突触等细胞组分,磷酸转移酶活性、以醇基团为受体的蛋白质酪氨酸激酶活性等分子功能。KEGG分析结果显示通关丸主要参与肿瘤、PI3K-Akt、肿瘤中的蛋白聚糖等信号通路。分子对接表明核心成分与核心靶点结合性较好。结论:通关丸主要通过调节PI3Ks家族、EGFR、AKT1等疾病靶点,干预血液循环、转移酶活性、氧化应激反应等生物学过程及PI3K-Akt等信号通路进而治疗BPH。     

基于网络药理学和分子对接探讨张氏腰痛方治疗腰椎间盘退变的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接的方法探讨张氏腰痛方治疗腰椎间盘退变（LIDD）的分子生物学机制。方法：通过检索数据库,筛选张氏腰痛方的活性成分和作用靶点,以及LIDD的相关基因。通过R软件筛选张氏腰痛方治疗LIDD的共同靶基因,构建“药物-成分-靶点-疾病”网络以及共同靶基因的蛋白质相互作用网络,同时挖掘网络中潜在的蛋白质功能模块。关键靶基因进行GO功能富集分析与KEEG通路富集分析,以揭示这些靶基因的潜在生物学功能和通路。结果：共筛选出202个有效成分和164个共同靶基因,包括10个核心靶基因。富集分析结果表明,张氏腰痛方治疗LIDD的靶点主要作用于晚期糖基化终产物及其受体（AGE-RAGE）信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、细胞凋亡和低氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路等。这些生物过程主要参与炎症反应、氧化应激和细胞凋亡的调控。分子对接结果显示,张氏腰痛方治疗LIDD的主要活性成分divaricatol、槲皮素、O-乙酰基哥伦比亚苷元、紫堇灵、黄芪紫檀烷苷与核心靶点TNF、AKT1、白细胞介素-6、TP53、血管内皮生长因子A具有良好的结合能力。结论：本研究初步证实了张氏...     

基于网络药理学和分子对接技术结合GEO芯片探究补中清利汤治疗IgA肾病的作用机制

目的:基于网络药理学、分子对接技术,并结合GEO芯片研究中药复方补中清利汤治疗IgA肾病的作用机制。方法:从TCMSP中药数据库中搜索补中清利汤各药物活性成分及靶点。借助多个疾病数据库并结合GEO基因芯片,获取IgA肾病疾病靶点。通过R语言4.2.2获取药物和疾病共同靶点后利用String数据库构建蛋白互作网络。通过Cytoscape 3.9.1(Cyto NCA插件)及Discovery Studio 2019对核心靶点进行筛选及完成分子对接。最后利用R语言4.2.2进行GO注释和KEGG富集分析。结果:补中清利汤治疗IgA肾病共筛选出70个有效活性成分,107个潜在作用靶点(核心靶点基因：JUN、MAPK1、TP53、HSP90AA1、MAPK14和HIF1A),主要涉及通路有：Lipid and atherosclerosis(脂质与动脉粥样硬化)、Fluid shear stress and atherosclerosis(流体剪切应激和动脉粥样硬化)、AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications(糖尿病并发症AGE-...     

基于网络药理学探讨健脾养血排毒方治疗慢性肾脏病的作用机制

目的:基于网络药理学探讨健脾养血排毒方治疗慢性肾脏病(chronic kidney disease, CKD)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库收集药物活性成分和潜在靶点,通过GeneCards和Disgenet数据库获取CKD靶点;利用软件Venny2.1获取药物-疾病交集靶点,采用STRING数据库构建PPI蛋白网络,并筛选核心靶点;通过DAVID数据库进行GO及KEGG富集分析,借助软件Cytoseape3.9.1构建活性成分-疾病-靶点-信号通路网络。结果:筛选得到健脾养血排毒方有效成分130种,主要为槲皮素、山柰酚、刺芒炳花素等,涉及257个靶点基因;疾病靶点1 817个,健脾养血排毒方-CKD交集靶点156个,经拓扑分析获得TNF、VEGFA、TP53等69个核心靶点;富集分析涉及PI3K-Akt、AGE-RAGE及MAPK信号通路。结论:本研究初步探析了健脾养血排毒方治疗CKD的活性成分、潜在靶点及信号通路,为其干预CKD的作用机制提供了理论依据。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨夏枯草治疗甲状腺癌的作用机制

目的 运用网络药理学联合分子对接技术分析夏枯草治疗甲状腺癌的分子机制。方法 利用TCMSP数据库预测夏枯草的主要活性成分,并用TCMSP和PubChem数据库获取所有活性成分对应靶点;通过GeneCards及OMIM数据库收集甲状腺治疗甲状腺癌的靶点。利用STRING数据库获取蛋白间的相互作用信息,并通过R语言进行拓扑学分析及可视化。利用R包clusterProfiler对上述取得的药物和疾病的交集靶点进行GO和KEGG pathway分析。利用Cytoscape 3.7.2构建活性成分-靶点-疾病网络,并进行拓扑学分析,得到核心化合物,用分子对接对核心靶点和化合物进行验证。结果 槲皮素、木犀草素、山奈酚、谷甾醇可能是夏枯草治疗甲状腺癌的核心成分,AKTI、VEGFA、CASP3、MYC、JUN、MAPK8、IL6、EGFR、MAPK1、EGF可能是治疗的重要靶点。结论 夏枯草治疗甲状腺癌体现了多成分、多靶点、多通路的特点,为夏枯草有效成分的筛选及进一步研究提供了理论基础。     

芪骨胶囊治疗绝经后骨质疏松症的分子机制

目的运用网络药理学的方法探究芪骨胶囊治疗绝经后骨质疏松症(postmenopausal osteoporosis,PMOP)的活性成分与潜在分子机制。方法从BATMAN-TCM数据库中获取芪骨胶囊的主要活性成分及其对应的靶点,在Gene Cards数据库和GEO数据库中筛选PMOP疾病靶点,将药物靶点与疾病靶点取交集,运用Cytoscape软件构建"药物-成分-靶点"网络图,同时将交集靶点导入String在线软件构建蛋白互作网络,筛选出核心靶点进行GO(gene ontology)生物过程及KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析。结果筛选获得67个活性成分,核心活性成分包括24-羟基-11-脱氧甘草次酸、菊油环酮、β-谷甾醇、γ-谷甾醇等;获得交集靶点共57个,其中核心靶点有胰岛素(INS)、白介素-6(IL-6)、胰岛素样生长因子-1(IGF-1)等。核心靶点GO生物过程和KEGG通路富集分析结果显示,GO生物过程主要涉及女性怀孕、多细胞生物过程等,KEGG通路主要涉及雌激素信号通路、卵巢甾体生成、流体剪切应力与动脉粥样硬化、白细胞介素17信号通路等。结论对于芪骨胶囊治疗PMOP的作用机制可能与菊花、黄芪、肉苁蓉中的主要成分如α-蒎烯、菊油环酮、β-谷甾醇等有关,并可能通过雌激素、白细胞介素等信号通路作用于人体INS、IL-6、IGF-1等靶点发挥疗效。     

桃红四物汤治疗骨质疏松性骨折的网络药理学和分子对接研究

目的 运用网络药理学和分子对接的技术,研究桃红四物汤作用于骨质疏松性骨折的潜在作用机制。方法 检索TCMSP,获取桃红四物汤药物的有效成分、潜在靶点,运用GeneCards、OMIM、DrugBank、DisGeNET数据库收集骨质疏松性骨折的相关靶点,获取药物和疾病的交集靶点,并通过Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”可视化网络图,筛选出药物关键成分。将交集靶点上传到STRING数据库,并绘制PPI网络图,筛选核心靶点;并使用Metascape数据库进行交集靶点的GO以及KEGG通路的富集分析。最后运用AutoDock Tools1.5.6和Pymol2.4.1软件,分子对接关键成分与核心靶点。结果 桃红四物汤与骨质疏松性骨折的交集靶点有152个,“药物-成分-靶点-疾病”网络图及PPI提示IL6、JUN、AKT1、MAPK1、TNF可能是桃红四物汤治疗骨质疏松性骨折的关键靶点。GO富集分析显示,桃红四物汤治疗骨质疏松性骨折的交集靶点的生物功能主要涉及炎症免疫、细胞增殖分化、细胞凋亡等方面。KEGG通路富集分析显示,桃红四物汤治疗骨质疏松性骨折的交集靶点主...     

基于网络药理学的半枝莲治疗膀胱癌相关作用机制研究

目的 通过网络药理学方法探讨半枝莲治疗膀胱癌的作用机制,为临床治疗提供理论依据。方法 利用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)数据库获得半枝莲化学成分及对应作用靶点基因,利用Gene Cards数据库获得膀胱癌相关靶点基因,利用Cytoscape软件构建半枝莲“成分-靶点-疾病”三者相互关系网络,采用STRING数据库对半枝莲作用于膀胱癌的潜在作用靶点进行蛋白相互作用网络分析并筛选关键靶点。利用在线工具Metascape对共同靶点进行基因本体功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果 半枝莲含29个活性成分、228个靶基因,膀胱癌含4 645个靶基因,共同靶点190个,关键靶点可能为AKT1、TP53、JUN、TNF、EGFR、MAPK1等。KEGG富集分析主要涉及癌症途径、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路等。结论 本研究借助网络药理学方法初步预测了半枝莲通过多靶点、多通路治疗膀胱癌,为临床治疗提供新靶点和新思路。