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目的:基于已发表的芯片数据通过生物信息学方法筛选差异表达基因,以发现前列腺癌诊断/预后和耐药相关分子标志物。方法:筛选GEO数据库中已发表的前列腺癌mRNA芯片数据GSE6956和前列腺癌细胞多烯紫杉醇耐药mRNA芯片数据GSE33455进行差异表达分析;通过生物学功能注释、基因通路富集分析、蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)分析等生物信息学方法发现和识别与差异表达基因相关的生物学功能和信号通路;比对TCGA数据库,验证差异表达基因在前列腺癌组织及癌旁组织中的表达,并通过Kaplan-Meier分析差异表达基因对前列腺癌患者生存率的影响;用qPCR方法验证差异表达基因在前列腺癌细胞株PC3及多烯紫杉醇耐药细胞PC3-DTX中的表达情况。结果:共筛选出227个在前列腺癌和前列腺癌多烯紫杉醇耐药细胞芯片数据中共同差异表达基因。差异表达基因主要富集到了癌症相关通路(Lysosome、Sphingolipid、FoxO、Acute myeloid leukemia),并主要参与细胞黏附、自噬和胞内蛋白转运等生物学过程。构建PPI网络选取18个连接度最高的基因作为Hub基因。Hub基因和共同差异表达基因中,上调基因CITED2、LRP12和RPL17-C18orf32与前列腺癌患者的不良预后显著相关。qPCR验证显示CITED2在多烯紫杉醇耐药细胞PC3-DTX中高表达。结论:通过生物信息学方法筛选出在前列腺癌组织和耐药细胞中共同差异表达,且与前列腺癌患者的不良预后密切相关的基因,为前列腺癌诊断/预后和耐药分子标志物的研究提供了新的思路。 相似文献
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钱立庭 《国外医学(肿瘤学分册)》2002,29(5):390-393
直肠癌的预后除了与分期、分化程度、治疗方法等有关外,其内在生物学特征起了重要作用。直肠癌标本中p53、bcl-2,p21,c-myc,k-ras等基因表达以及PCNA标记指数、端粒酶活性、血清中CA19-9含量与预后相关。p53,c-myc,k-ras异常表达和PCNA标记指数高、端粒酶活性高、CA19-9含量高预示肿瘤对放化疗敏感性低,预后不良。p21的表达提示较好的预后。 相似文献
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膀胱癌是泌尿系统中的一类恶性肿瘤,中国的膀胱癌发病率逐年升高,病死率更是在泌尿系统恶性肿瘤中居第一位.膀胱癌可以发生在任何年龄段,并且发病率随年龄增长而提高.膀胱癌的症状包括前期出现血尿,少数患者出现膀胱刺激综合征.临床常用检查方法有B超检查、尿常规检查等,确诊一般需要做膀胱镜检查或活组织检查,这两项检查是确诊膀胱癌的标准,但会对患者造成伤害,且价格较为昂贵,不适宜作为常规检查,且细胞学检查的灵敏度也较低,检查结果容易出现错误.因此,临床上需要一种灵敏度较高的检查方式来确诊膀胱癌,以便于治疗.目前临床出现了肿瘤分子标志物检查可诊断膀胱癌,包括DNA/RNA类标志物、蛋白质类标志物等.肿瘤分子标志物中,DNA和RNA及其他抑癌基因或原癌基因都可以作为检测项目,对膀胱癌的确诊提供依据. 相似文献
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宫颈癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,严重影响女性健康,尤其以发展中国家更甚。其导致死亡的主要原因是局部复发和转移,因此,选择合理治疗方案,准确评估其预后,减少复发转移是降低宫颈癌死亡率的关键。目前宫颈癌的预后评估指标主要包括FIGO分期、淋巴结转移、间质浸润深度、肿瘤大小、脉管瘤栓等高危因素,但这些临床病理特征在预后评估方面尚不够精准,有必要寻找新的预后标志物来准确指导治疗。近年来肿瘤分子标志物被广泛研究,部分与预后有相关性的分子标志物已逐渐被证实。本文综述与宫颈癌预后相关的分子标志物的现况,旨在为后续研究开拓新思路,为宫颈癌的综合治疗提供更为合理依据。 相似文献
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本文对65例肝癌、54例良性肝病进行HAG_(?)、LCA—AAT、SF及β_2—MG的血清学检测,发现在AFP阴性低浓度肝癌中,单项标志物的敏感度以SF最高(7%~88.2%),HAg_(18)最低(70%~76.5%),特异性及诊断效率均以LCA—AAT最高(73.5%~81.8%和49.1%~60.6%),β_2-MG最低(45.5%~61.8%和31.8%~50.9%).多项标志物的敏感度、特异性及诊断效率以HAg_(18)、LCA—AAT及SF联合为佳(50%~58.5%、94.1%~100%和50%~55.1%).结果表明,多项标志物联检优于单项标志物,尤其对AFP阴性、低浓度肝癌的诊断具有重要价值. 相似文献
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目的:研究多肿瘤标志物蛋白芯片诊断系统用于原发性肝癌的诊断价值。方法:采用多肿瘤标志物蛋白芯片诊断系统,检测分析72例原发性肝癌患者、64例良性肝病患者和30例门诊体检者血清的12种常见肿瘤标志物,包括糖原199(CA199)、神经原特异性烯醇化酶(NSE)、癌胚抗原(CEA)、糖原242(CA242)、铁蛋白(FER)、β-人绒毛膜促性腺激素(β-HCG)、甲胎蛋白(AFP)、游离前列腺特异抗原(f-PSA)、前列腺特异抗原(PSA)、糖原125(CA125)、人生长激素(HGH)、糖原153(CA153)。主要从真实性、可靠性两方面评价其诊断效能。结果:多肿瘤标志物蛋白芯片诊断系统诊断原发性肝癌的真实性评价指标:灵敏度93.1%、特异度29.7%、误诊率(α)70.3%、漏诊率(β)6.9%、阳性似然比1.32、阴性似然比0.23、诊断指数123%、Youden指数0.23、粗符合率63.2%;可靠性评价指标(一致性相关系数):CA199(0.846P〈0.01)、NSE(0.858P〈0.01)、CEA(0.906P〈0.01)、CA242(0.864P〈0.01)、FER(0.913P〈0.01)、β-HCG(0.881P〈0.01)、AFP(0.894P〈0.01)、f-PSA(0.836P〈0.01)、PSA(0.875P〈0.01)、CA125(0.866P〈0.01)、HGH(0.887P〈0.01)、CA153(0.875P〈0.01)。结论:多肿瘤标志物蛋白芯片诊断系统对原发性肝癌有一定的辅助诊断价值,进一步改进其肿瘤标志物组合,对原发性肝癌的诊断效能会更好。 相似文献
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直肠癌的预后除了与分期、分化程度、治疗方法等有关外,其内在生物学特征起了重要作用。直肠癌标本中p53、bcl-2、p21、c-myc、k-ras等基因表达以及PCNA标记指数、端粒酶活性、血清中CA19-9含量与预后相关。p53、c-myc、kras异常表达和PCNA标记指数高、端粒酶活性高、CA19-9含量高预示肿瘤对放化疗敏感性低,预后不良。p21的表达提示较好的预后。 相似文献
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目的探讨肿瘤标志物水平变化对胃癌诊断及预后评估的价值。方法经手术与病理学确诊的198例胃癌患者作为病例组,同时选择198例于我院体检均为健康者为对照组。采用电化学发光法检测2组患者血清中肿瘤标志物CEA、CA724、CA199的水平,并评价3种肿瘤标志物的灵敏度、特异度。结果病例组3种肿瘤标志物的含量均高于对照组,且差异均有统计学意义。同时术后该3种肿瘤标志物的水平均低于术前,差异均有统计学意义。同时(Ⅲ+Ⅳ)期患者肿瘤标志物水平明显高于(Ⅰ+Ⅱ)期,差异均有统计学意义。病例组患者CEA、CA724、CA199的灵敏度分别为50.9%,51.3%,47.8%;特异度分别为92.1%,91.4%,89.5%;三者联合检测的灵敏度和特异度分别达90.1%,73.4%。结论血清CEA、CA724、CA199对于胃癌的诊断有一定的辅助诊断价值,同时三者联合检测可以提高其诊断的敏感度,对于预后胃癌患者的预后有较高的评估价值。 相似文献
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[摘要]复发和转移是影响鼻咽癌患者预后和生存质量的主要原因。目前临床上主要使用基于解剖学的TNM分期标准,并不能准确反映患者的预后情况,因此需要开发新的更为精准的鼻咽癌预后判断标准。通过对鼻咽癌发病机制的研究,分子标志物在鼻咽癌预后过程的预测价值日益引起关注。本文总结了近年来在鼻咽癌增殖、生存和侵袭转移等方面的研究进展,以及在这些研究过程中发现的相关分子标志物和它们在临床预后评估中的作用,综合分析这些分子标志物差异性表达与临床患者生存之间的相关性,证明了这些分子标志物在评估患者预后中的潜在价值。随着对鼻咽癌发病机制研究的深入,将会发现更多有价值的分子标志物,这为建立更为精准的鼻咽癌预后评估方法提供了可能。 相似文献
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目的:研究多肿瘤标志物蛋白芯片诊断系统用于原发性肝癌的诊断价值.方法:采用多肿瘤标志物蛋白芯片诊断系统,检测分析72例原发性肝癌患者、64例良性肝病患者和30例门诊体检者血清的12种常见肿瘤标志物,包括糖原199(CA199)、神经原特异性烯醇化酶(NSE)、癌胚抗原(CEA)、糖原242(CA242)、铁蛋白(FER)、β-人绒毛膜促性腺激素(β-HCG)、甲胎蛋白(AFP)、游离前列腺特异抗原(f-PSA)、前列腺特异抗原(PSA)、糖原125(CA125)、人生长激素(HGH)、糖原153(CA153).主要从真实性、可靠性两方面评价其诊断效能.结果:多肿瘤标志物蛋白芯片诊断系统诊断原发性肝癌的真实性评价指标:灵敏度93.1%、特异度29.7%、误诊率(α)70.3%、漏诊率(β)6.9%、阳性似然比1.32、阴性似然比0.23、诊断指数123%、Youden指数0.23、粗符合率63.2%;可靠性评价指标(一致性相关系数):CA199(0.846 P<0.01)、NSE(0.858 P<0.01)、CEA(0.906P<0.01)、CA242(0.864 P<0.01)、FER(0.913 P<0.01)、β-HCG(0.881 P<0.01)、AFP(0.894 P<0.01)、f-PSA(0.836 P<0.01)、PSA(0.875P<0.01)、CA125(0.866 P<0.01)、HGH(0.887 P<0.01)、CA153(0.875 P<0.01).结论:多肿瘤标志物蛋白芯片诊断系统对原发性肝癌有一定的辅助诊断价值,进一步改进其肿瘤标志物组合,对原发性肝癌的诊断效能会更好. 相似文献
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原发性肝癌在中国为第四大肿瘤,同时也是导致死亡的第二大肿瘤。尽管肝癌根治术是治疗早期肝癌患者的有效方法之一,但手术本身存在较高的并发症发生风险和预后不确定性。有研究表明,炎症与肝癌的发展密切相关。长期慢性炎症可导致肝细胞的持续损伤和修复,触发肝脏再生过程,同时也增加了突变和异常细胞增殖的机会,从而导致肝癌的发生。因此,寻找快速、准确评估肝癌进展的炎性相关标志物变得至关重要。通过监测和分析这些标志物的水平变化,可及早干预疾病进展,改善疾病转归,并延长患者生存期。近年来的研究已经发现了一些潜在的早期肝癌根治术后的炎性相关标志物,包括激活的炎症细胞、炎症介质以及与肿瘤相关的炎症信号通路分子等。它们的变化反映了炎症过程中特定分子和细胞因子的变化,对于肿瘤生成、侵袭和转移等过程起着重要作用。通过了解和研究这些炎性相关标志物,医师可以更好地了解肝癌的发展情况,并及时采取干预措施,有助于改善治疗效果,延长患者的生存期。因此,寻找能够快速、准确评估肝癌进展的炎性相关标志物对于肝癌的治疗具有重要意义。本文对近年来发现的早期肝癌根治术的炎性相关标志物进行归纳,以期为临床评估早期肝癌根治术后患者预后提供更多... 相似文献
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早期诊断、早期治疗是降低肿瘤死亡率的有效途径。microRNA是一类内源性的长约18~22个核苷酸的非编码小RNA,其在肿瘤组织以及循环中的特异表达,为肿瘤的早期诊断带来新的希望。肿瘤中microRNA的表达模式不但与肿瘤诊断有关,与肿瘤的分期、进展以及预后也密切相关。全文就microRNA在肿瘤早期诊断以及预后判断中的作用作一综述。 相似文献
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原发性肝癌肿瘤标志物的研究进展 总被引:2,自引:0,他引:2
林健敏 《中国医学文摘:肿瘤学》2006,20(1):66-69
原发性肝癌(primary hepatoeellular carcinoma,PHC)是我国常见的恶性肿瘤,占所有癌症的4%,其发病率和死亡率有逐年增高的趋势。对PHC的早期诊断和鉴别诊断一直是阻碍临床和研究的一大难题。甲胎蛋白(alpha-fetoprotein,AFP)多年来被作为诊断PHC的首选指标,使原发性肝癌得以早期诊断。随着科学技术的进展,肿瘤标志物的种类已扩展到包括蛋白类及基因类的标志物。本文就原发性肝癌肿瘤标志物的研究作一综述。 相似文献
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原发性肝癌是成年人最常见的恶性肿瘤之一,其中90%~95%为肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)。尽管肝癌的临床研究已取得较大进展,但由于其术后高复发和高转移率,治疗预后不佳。每年因肝癌死亡人数仍高居我国恶性肿瘤致死的第二位。肝癌的复发转移与其恶性程度、病理学特点、血管生成特点及宿主个体差异等均密切相关。对肝癌相关肿瘤标志物的研究,可增强对血液中游离肝癌细胞等的检测,有助于早期发现肿瘤转移、提前干预治疗及预测病情转归,提高肝癌患者的生存率。肝癌相关肿瘤标志物研究近年有较大进展,现将部分结果综述如下。 相似文献
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前列腺癌是老年男性常见的恶性肿瘤,内分泌治疗虽可使大多数患者的病情得到控制和改善,但在经过一段时间的缓解后,绝大多数患者会发展为预后极差的去势难治性前列腺癌(CRPC)。对CRPC患者如何实施个体化治疗,以最小的不良反应和最大的获益来延长生存已成为临床工作者亟待解决的难题。目前临床上采用的分级分期方法很难准确预测具有复杂生物学行为的CRPC患者的预后。近年许多肿瘤标志物相继被发现并用于CRPC患者的预后判断,本文对影响CRPC预后的分子标志物做一综述。 相似文献
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目的探讨甲胎蛋白异质体3(AFP-L3)、高尔基体蛋白73(GP73)和磷脂酰肌醇蛋白聚糖-3(GPC-3)及甲胎蛋白(AFP)联合检测在原发性肝癌诊断中的应用价值。方法采用酶联免疫吸附试验(EL1SA)检测100例原发性肝癌(HCC)、100例肝炎肝硬化患者血清AFP-L3、GP73、GPC-3,同时用电化学发光法检测血清甲胎蛋白(AFP),同期选择100例门诊正常体检者作为对照组。对各指标表达情况进行比较和分析。结果原发性肝癌血清AFP、AFP-L3、GP73、GPC-3含量均显著高于肝炎肝硬化组及健康对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);AFP、AFP-L3、GP73、GPC-3联合检测的阳性率达86.0%,明显高于单项检测AFP(54.0%)、AFP-L3(55.0%)、GP73(48.0%)和GPC-3(43.0%)(P<0.05);且AFP、AFP-L3、GP73、GPC-3联合检测的敏感性均高于单一检测指标,差异有统计学意义(P<0.05),但其特异性显著低于AFP-L3、GP73单项检测(P<0.05)。结论联合检测血清AFP、AFP-L3、GP73、GPC-3含量可以提高对原发性肝癌的阳性诊断率,对早期诊断具有重要的临床意义。 相似文献