2008-2013年福建省HIV-1毒株耐药基因变异研究

目的 分析2008-2013年福建HIV-1毒株耐药基因变异情况。方法 收集2008-2013年福建省病毒载量大于1 000 copy/mL艾滋病患者,采用自建HIV-1基因型耐药检测进行耐药检测和分析。结果 共收集226例病毒载量大于1 000 copy/mL样本,平均载量值1.62×10⁵copy/mL;124例样本扩增及测序后获得蛋白酶以及部分反转录酶基因序列,亚型分析显示92例(74.2%)为CRF_01AE亚型,14例(11.3%)为B亚型,C和BC亚型各有7例,另4例为其他亚型。77对反转录酶以及蛋白酶抑制剂有不同程度耐药;对核苷类和非核苷类反转录酶抑制剂的耐药分别有63例(50.8%)和74例(59.7%),对蛋白酶抑制剂耐药9例(7.3%);核苷类反转录酶抑制剂主要耐药突变包括了M184V、M41L、D67N、L70R、T219F、K219Q等,造成对3TC、AZT、D4T等不同程度耐药;非核苷类反转录酶抑制主要耐药突变包括K101E、Y181C、K103N、G190A等,造成对NVP和EFV不同程度耐药。结论 福建省HIV-1感染者总体耐药率较低,但是随着治疗人数增加以及治疗时间延长,对反转录酶抑制剂出现较高程度耐药,仍需加强艾滋病患者耐药检测。     

临沧市2012年高效抗反转录病毒治疗失败的AIDS患者耐药基因变异分析

目的：了解临沧市2012年经高效抗反转录病毒治疗（highly active antiretroviral therapy, HAART）失败的AIDS患者耐药基因的变异情况。方法调查HAART失败AIDS患者的流行病学特征,检测CD4＋T淋巴细胞计数和病毒载量,对HIV RNA＞1×10^3 copies/ml的患者行HIV-1耐药基因检测。结果66例中有53例检出基因耐药突变。最常见的核苷类反转录酶抑制剂耐药突变位点为M184V、D67N和K70R,非核苷类反转录酶抑制剂耐药突变位点为K103N、G190A和V179D。仅发现3个蛋白酶抑制剂突变位点,分别为D33F、M46I和L76V。结论临沧市AIDS患者出现较多反转录酶抑制剂突变位点是一线抗反转录病毒治疗失败的主要原因。在选择二线治疗方案时,增加蛋白酶抑制剂可避免多重耐药导致的治疗失败。     

云南省红河州地区60例人类免疫缺陷病毒-1患者分子流行病学研究

目的 对云南省红河州地区部分HIV-1感染者进行分子流行病学调查,为确定该地区流行的HIV-1分子生物学特征提供监测依据.方法 应用反转录(RT)-PCR扩增HIV-1多聚酶基因,DNA测序后进行进化系统树分析,确定基因亚型,并与国际耐药数据库比对,辨别耐药性突变位点.结果 60例患者中,男39例,女21例,平均年龄35.5岁.静脉注射毒品感染34例,性传播感染12例,采供血和输血感染2例,感染途径不详12例.基因亚型分别为08-BC亚型53例,占88.3%;07-BC亚型6例,占10.0%;01-AE亚型1例,占1.7%.耐药相关基因总突变率为33.3%.与蛋白酶抑制剂(PRI)和反转录酶抑制剂(RTI)耐药相关的基因突变率分别为5.0%和31.7%;蛋白酶基因主突变位点为1541M、V82VFIL、M46MI,各占1例.反转录酶基因突变位点分别为T69D 4例,A62V 6例,D67DE 1例,E44D 1例,V179D 2例,V179E 1例,K238KN 1例,L234T+P236S 1例,V106E 1例.结论 云南省红河州地区HIV-1感染以静脉注射毒品为主.HIV-1基因亚型以08-BC亚型为主;已存在与PRI和RTI耐药相关的基因突变.     

德宏地区艾滋病病人ART后的耐药性观察

目的了解德宏地区艾滋病（AIDS）病人在进行抗反转录病毒治疗（ART）后,发生耐药的情况。方法为德宏地区进行ART的病人检测CD4＋T淋巴细胞计数、病毒载量及基因型耐药性,以SPSS 17.0分析病人的耐药数据。结果 78例病人中,男49例,女29例,以汉族（41.0%）和景颇族（34.6%）病人为多,农民占71.8%。随访地点主要在陇川（43.6%）和潞西（37.2%）。性传播、静脉吸毒传播和母婴垂直传播分别占53.8%（42/78）、30.8%（24/78）和15.4%（12/78）。ART 24个月后最常见的核苷类反转录酶抑制剂的耐药突变是M184I/V、D67N/S、T69F和T215F/Y,非核苷类反转录酶抑制剂耐药突变中K101E/I/Q、K103N/R/S/V、Y181C和G190A/S发生率最高,蛋白酶抑制剂耐药突变较少。结论德宏地区AIDS病人ART后出现较多反转录酶耐药位点,ART规范应加强并提高服药依从性。     

2008-2010年深圳市HIV-1耐药警戒线调查及耐药趋势分析

目的根据世界卫生组织(WHO)推荐的Ⅰ型艾滋病病毒(HIV-1)耐药警戒线调查方案,调查分析深圳HIV感染者的病毒株耐药突变情况,并分析耐药株传播水平的3年发展趋势。方法通过连续3年系列横断面调查,于2008年至2010年,每年采集<25岁未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者血浆样本,提取病毒RNA,采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增HIV-1 pol区片断,进行序列测定和耐药基因变异分析。结果 2008年检测耐药传播率为0(0/45),2009年检测耐药传播率上升至6.1%(3/49),其中1份对核苷类反转录酶抑制剂耐药(T215S),2份对蛋白酶抑制剂出现耐药(M46L);2010年检测耐药传播率为4.0%(2/50),其中1份对核苷类反转录酶抑制剂耐药(T215S),1份对蛋白酶抑制剂出现耐药(M46I)。所有耐药株均来自经性传播人群,其中,蛋白酶抑制剂耐药株全部来自男男性行为人群。核苷类反转录酶抑制剂耐药株全部属于重组亚型CRF07_BC,而蛋白酶抑制剂耐药毒株全部属于CRF01_AE。结论深圳地区HIV-1耐药已经进入或即将进入中度传播水平,应该为深圳地区发现的HIV感染者提供耐药检测,尤其是针对性传播人群。     

239例治疗失败的HIV感染者HIV-1亚型及耐药分析

目的分析辽宁地区抗病毒治疗失败的艾滋病病毒(HIV)感染者HIV-1亚型特征及耐药情况。方法收集2018年接受抗病毒治疗满6个月且HIV-1病毒载量≥1 000拷贝/mL的治疗失败病例血浆样本239份,通过核酸提取、pol基因区扩增和测序,进行亚型分析及基因型耐药检测。结果 239份样本中,HIV-1亚型中CRF01_AE占75.7%,B亚型占10.9%,CRF07_BC占7.5%;有148例发现耐药位点突变,总耐药率为61.9%(148例);最常见的突变位点为G190、M184和K65,突变率分别为32.6%(78例)、30.1%(72例)和29.7%(71例);对蛋白酶抑制剂(PIs)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)及非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)的耐药率分别为5.9%(14例)、49.0%(117例)和59.0%(141例)。结论辽宁地区治疗失败的感染者HIV-1基因亚型以CRF01_AE为主,耐药突变率处于中等水平,但已出现蛋白酶抑制剂类药物耐药情况,需加强耐药监测及抗病毒治疗管理,以防止耐药毒株传播。     

温州地区未治疗AIDS病人的HIV毒株耐药基因变异研究

目的对温州地区未治疗艾滋病(AIDS)病人体内艾滋病病毒(HIV)毒株耐药基因的突变情况进行调查分析,了解该地区AIDS病人的本底耐药情况。方法对50例未接受抗病毒治疗的AIDS病人HIVpol区的蛋白酶(PR)全长和部分反转录酶(RT)基因进行扩增、脱氧核糖核酸(DNA)测序、亚型鉴定,并与国际HIV耐药数据库比对分析。结果共获得38份有效序列,根据pol区亚型分析发现,CRF01_AE占36.8%(14例),CRF07_BC重组占36.8%(14例),C亚型占18.4%(7例),B亚型占7.89%(3例)。未检出针对蛋白酶抑制剂(PIs)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)的耐药病例。针对非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)检出3例耐药病例,突变类型分别为V179D、E138A和K103N。同时,2015年温州HIV耐药毒株的传播水平5%,处于低传播水平。结论对于未经抗病毒治疗组,耐药基因型以CRF01_AE重组、BC重组为主,HIV耐药毒株在温州仍处于低度传播水平,发现一个重要耐药基因突变位点是K103N。     

广州市外籍HIV-1抗体阳性者的基因型耐药分析

目的了解广州市外籍人类免疫缺陷病毒Ⅰ型（HIV-1）抗体阳性者中,耐药毒株的流行情况。方法应用巢式聚合酶链反应（PCR）方法,从广州市2008-2010年新确证的外籍HIV-1抗体阳性样本中,扩增蛋白酶（PR）和反转录酶（RT）基因序列,并与斯坦福耐药数据库比对,辨别耐药突变位点,分析耐药性。结果共获得90例外籍HIV-1抗体阳性者的PR和RT序列,耐药率为23.33%（21/90）,其中对蛋白酶抑制剂（PIs）耐药率为15.56%（14/90）,且集中表现为对NFV/r耐药,对核苷类反转录酶抑制剂（NRTIs）耐药率为6.67%（6/90）,对非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）耐药率为5.56%（5/90）;发现1例对除DRV/r外的所有其他PIs耐药,4例对所有NNRTIs耐药,2例对所有NRTIs耐药;发生频率较高的突变是L10I/V和K20I。结论广州市外籍HIV-1抗体阳性病例中存在耐药株的流行,尤其是耐多药毒株的存在,增加了广州市耐药毒株传播的风险。     

天津市HIV/AIDS病人未治疗人群pol基因多态性及耐药性分析

目的了解天津市艾滋病病毒(HIV)感染者/艾滋病(AIDS)病人(简称HIV/AIDS病人)未治疗人群中,耐药基因的变异情况,比较不同基因亚型之间pol基因多态性耐药突变的分布差异。方法收集2010年天津市HIV/AIDS病人未治疗人群的血液样本,提取样本DNA,用巢式聚合酶链式反应扩增病毒pol基因,并进行亚型及耐药基因型分析。结果在79例样品中,扩增并得到有效pol基因序列的共有51例,共发现3种基因亚型。其中CRF01_AE为主要亚型,占49.02%(25/51);其次是B亚型,占41.18%(21/51)。检出耐药者8例,占15.69%(8/51),分别为低度和潜在低度耐药。耐药相关突变位点为K103R、V106I、V106IV、E138G、V179E和V179DINV。不同HIV-1基因亚型中,pol基因蛋白酶区和反转录酶区的基因突变差异较大。结论天津市HIV/AIDS病人未治疗人群中,存在一定程度的耐药问题,应加强对HIV-1耐药情况的监测,及时调整防治策略。     

CRF01_AE CRF07_BC和B''''亚型HIV-1 pol基因及耐药特征分析

目的 研究中国部分地区新发现未经抗病毒治疗的艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)感染者的耐药情况,及不同亚型毒株pol基因的多态性对耐药突变产生的影响.方法 选取2005-2006年湖南、云南、四川和新疆4省(自治区,下同)当年确认的部分样本,进行核酸扩增及测序,利用系统进化及重组分析的方法确定亚型;根据美国斯坦福大学HIV-1耐药数据库,分析不同亚型毒株蛋白酶基因和逆转录酶基因的多态性和耐药突变情况;利用荷兰乌得勒支大学Vijver等人使用的一种遗传障碍定量方法,计算并比较不同亚型间耐药突变产生的遗传障碍.结果 共得到84份样本PR基因区(1-99氨基酸)和RT基因区(1-272氨基酸)的序列,亚型分析显示:84份样本中B'亚型13份,01AE重组亚型27份,07BC重组亚型44份,其中18份样本在蛋白酶基因区的第10位和第71位存在次要耐药突变;来自云南省和湖南省的3份样本中,存在逆转录酶抑制剂相关耐药突变,分别是A62V、V179D和G190A.三种亚型在逆转录酶基因区的2个非核苷类抑制剂相关耐药突变位点V106M和V108I的遗传障碍存在差异,有显著的统计学意义(P＜0.001).结论 4个地区未冶疗感染者中耐药发生的水平较低.遗传障碍的比较,CRF01AE、CRF07BC与B'亚型病人经治疗后主要耐药突变的发展模式应基本一致.     

福建省未经抗病毒治疗的HIV-1毒株耐药基因变异研究

目的研究福建省未经抗逆转录病毒治疗的艾滋病病毒感染者伎滋病患者（HIV／AIDS患者）HIV的逆转录酶和蛋白酶耐药基因变异情况，为福建省开展HIV-1抗病毒治疗提供本底资料。方法采集福建省未经抗病毒治疗的HIV／AIDS病例的抗凝全血，分离血浆，用逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）扩增HIV—lpol区序列并直接进行序列测定，提交Web站点http：／／hivdb．stanford．edu进行耐药突变分析。结果选取74份流行病学资料及序列资料完整的样本进入耐药基因分析，结果显示，蛋白酶基因的次要耐药突变广泛存在，以M36I、L63P、193L等多态性突变类型为主，未发现与蛋白酶抑制剂耐药相关的突变。逆转录酶区的耐药突变分布较为分散，发生率为20．27％（15．74）。依据耐药性解释，发现3例样本（4．05％）表现为对部分逆转录酶抑制剂的潜在或低度耐药。结论福建省未用药的HIV感染者中，耐药相关突变尚处于低流行状态，在开展抗病毒治疗后应当定期进行耐药性检测以期获得较好的效果。