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1.
目的 通过生物信息学方法筛选人肝癌耐药细胞株Bel-7402/5-FU、Bel-7402/ADR与亲本细胞株Bel-7402差异表达的微小RNA(miRNA),分析差异表达miRNA的生物学功能。方法 利用miRNA芯片分析亲本细胞和耐药细胞中miRNA的差异表达情况,筛选差异倍数较高的10个miRNA进行靶基因预测,对获取的靶基因进行GO富集分析、KEGG信号通路富集分析。采用实时定量PCR法验证差异表达显著的miRNA。结果 与Bel-7402细胞比较,Bel-7402/5-FU细胞中存在58个差异表达miRNA,其中上调27个、下调31个;Bel-7402/ADR细胞中存在87个差异表达miRNA,其中上调17个、下调70个。对耐药细胞中差异倍数较高的10个miRNA进行靶基因预测,GO分析发现,这些靶基因主要涉及RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录调控、生物合成过程正向调控和氮化合物代谢过程负向调控、酶结合、大分子复合物结合和核酸结合转录因子活性、高尔基体、催化复合物和转移酶复合物等过程;KEGG分析发现,靶基因富集通路涉及轴突引导、泛素介导的蛋白水解、PAR1通路、神经营养因子信号通路...  相似文献   

2.
目的 探讨短发夹(sh)RNA-芳香烃受体核易位蛋白(ARNT)2i慢病毒表达载体对高转移肝癌细胞HCCLM6侵袭和迁移的影响.方法 以ARNT2为目的基因,化学合成4条干扰RNA,与经Mlu Ⅰ和Cla Ⅰ酶切后的pLVTHM载体连接过夜,筛选并鉴定阳性克隆.利用脂质体2000将shRNA-ARNT2i,pCMV-dR8.74,pMD2G共转染293T细胞,获得shRNA-ARNT2i慢病毒颗粒,进一步感染HCCLM6靶细胞,并分为转染shRNA-ARNT2i组、未转染的空白对照组和转染阴性对照序列组.用荧光实时定量PCR和Western blot检测ARNT2基因的干扰效率.应用划痕和Boyden小室法观察ARNT2表达下调对HCCLM6侵袭和迁移能力的影响.用SPSS16.0统计软件对数据进行独立样本t检验和方差分析,其中多组资料两两比较采用LSD法.结果 荧光实时定量PCR检测转染shRNA-ARNT2i组,未转染的空白对照组和转染阴性对照序列组3组ARNT2mRNA相对表达值分别为0.154±0.024、0.860±0.145、1.004±0.009,F=113.14,P<0.01,差异有统计学意义;Western blot显示转染shRNA-ARNT2i组ARNT2蛋白的表达量为16.45±1.6,转染阴性对照序列组ARNT2蛋白的表达量为4_4.56±2.07,两组比较,t=18.58,P<0.01,差异有统计学意义;转染shRNA-ARNT2i组细胞在划痕48 h后基本愈合,而转染阴性对照序列组和未转染的空白对照组划痕依然可见;转染shRNA-ARNT2i组穿膜细胞数为(13.25±1.04)个,而未转染的空白对照组和转染阴性对照序列组的穿膜细胞数分别为(6.50±2.56)个、(6.75±2.05)个,F=29.645,P<0.01,差异有统计学意义.结论 shRNA-ARNT2i载体能显著下调HCCLM6细胞ARNT2基因和蛋白的表达,促进HCCLM6细胞的运动和侵袭.  相似文献   

3.
目的:检测B细胞异位基因2(BTG2)在胰腺癌组织的表达情况,分析其与胰腺癌临床病理特征和预后的关系。方法:收集2015年6月至2020年12月间湖北医药学院附属国药东风总医院病理科石蜡封存的46例胰腺癌组织、对应的癌旁组织及肝胆胰外科9例行手术切除的新鲜胰腺癌组织、对应的癌旁组织,采用免疫组织化学染色法检测46例胰腺...  相似文献   

4.
目的 观察肝细胞癌(HCC)中AXIN2 mRNA表达水平,分析AXIN2基因甲基化水平对mRNA表达的影响及在HCC发生、发展中的意义.方法 收集手术切除的53例HCC和配对癌旁组织标本、7例正常肝组织标本和5种人肝癌细胞系.应用荧光定量PCR方法检测AXIN2mRNA水平的表达和AXIN2基因启动子区甲基化状态.结果 AXIN2在癌组织中的mRNA表达水平(0.1629±0.0679)低于癌旁组织(0.4155±0.2330),差异有统计学意义(Z=-2.567,P=0.010).HCC和癌旁组织中AXIN2基因甲基化水平(39.77%±3.89%和36.92%±2.81%)均高于正常肝组织(7.38%±2.40%,t 值分别=-3.663和-4.591,P值分别=0.009和0.007).5种人肝癌细胞系中AXIN2基因均呈高甲基化状态.AXIN2 mRNA表达水平与甲基化程度呈负相关(r=-0.458,P=0.032).TNMⅢ期HCC患者的AXIN2甲基化水平高于TNM Ⅰ和Ⅱ期患者(P=0.008).结论 AXIN2 mRNA表达水平下降与其高甲基化状态相关,AXIN2 mRNA低表达和启动子区异常甲基化可能是HCC发生、发展的重要机制之一.
Abstract:
Objective To investigate AXIN2 mRNA expression level in hepatocellular carcinoma (HCC) , and to analyze the effect of AXIN2 gene methylation status on its mRNA expression and HCC genesis and development. Methods Fifty-three surgical excised HCC specimens and paired adjacent non-cancerous specimens, seven normal liver specimens and five HCC cell lines were collected. The expression of AXIN2 at mRNA level and the methylation status of AXIN2 gene promoter were determined by quantitative PCR. Results The expression of AXIN2 mRNA was lower in HCC tissues (0.1629 + 0.0679) than that in adjacent non-cancerous tissues (0. 4155 + 0. 2330), and there was significant difference (Z= -2. 567, P = 0. 010). The methylation level of AXIN2 gene in HCC and adjacent non-cancerous tissues (39. 77% ±3. 89%, and 36. 92% ±2. 81%) was significantly higher than that in normal liver tissues (7. 38% ±2. 40% , t=-3. 663 ,P = 0. 009;t= -4. 591 ,P = 0. 007).AXIN2 gene was hypermethylated in all five HCC cell lines. There was a negative correlation between AXIN2 mRNA expression level and the degree of methylation ( r = -0. 458, P = 0. 032). The methylation level was higher in TNM Ⅲ patients of HCC than that in TNM Ⅰ and Ⅱ patients (P =0.008). Conclusion The down-regulation of AXIN2 gene mRNA expression is correlated with its hypermethylation status. The low expression of AXIN2 mRNA and the abnormal methylation of promoter may be one of the important mechanism of HCC genesis and development.  相似文献   

5.
目的 评估长的反义RNA干扰片段在培养细胞株中对HBV复制的抑制效应.方法将HBV基因组S区的全部核苷酸序列插入至pTARGETTM载体中,并将重组载体转染入HepG2.2.15细胞中.用酶联免疫吸附法检测HBsAg与HBeAg水平,用荧光定量PCR法检测HBVDNA水平.对数据采用多个独立样本Kruskal-Wallis检验与两两比较的Mann-Whitney U检验.结果 经过处理后,HepG2.2.15细胞上清液中HBsAg表达量(A值)在HBS2组(携带长片段反义RNA)为0.621±0.027,在HBS4组(携带正义RNA)为3.399±0.018,对照组为2.232±0.187;HBeAg表达量(A值)在HBS2组、HBS4组和对照组分别为0.749±0.019、1.548±0.025和1.570±0.044; HBV DNA水平(×104拷贝/ml)在HBS2组、HBS4组、对照组分别为1.597±0.082、3.381±0.297和3.610±0.063.与对照组相比,HBS2组HBsAg、HBeAg和HBV DNA表达量均降低,统计量Z值均为-2.309,P值均<0.05; HBS4组HBsAg表达量增高(Z=-2.309,P<0.05),而HBeAg和HBV DNA表达量无明显差异,统计量Z值分别为-0.866、-1.155,P值均>0.05.结论 长片段反义RNA能抑制HBV基因的表达和病毒复制.
Abstract:
Objective To evaluate the inhibitory effects of long antisense RNA on HBV replication in HepG2.2.15 cells. Methods The coding region of HBV S gene was cloned into pTARGET vector in sense and antisense orientations and the recombinant plasmids were transfected into HepG2.2.15 cells which were divided into HBS2 (antisense RNA) group, HBS4 (sense RNA) group and control group. HBsAg and HBeAg in the culture supernant were detected by ELISA. The HBV DNA in the supernant was quantified by real-time PCR. Results After treatment, the levels of HBsAg in HepG2.2.15 cell supernatants of three groups were 0.621 ± 0.027, 3.399 ± 0.018 and 2.232 ± 0.187 respectively; the levels of HBeAg were 0.749 ± 0.019,1.548 ± 0.025 and 1.570 ± 0.044 respectively and the levels of HBV DNA were 1.597 ± 0.082, 3.381 ± 0.297 and 3.610 ± 0.063 respectively. The expressions of HBsAg and HBeAg and the HBV DNA level in HBS2 group were remarkably reduced as compared to the control (Z = -2.309, P < 0.05); whereas the sense plasmid transfection (HBS4) did not affect HBeAg (Z= -0.866) and HBV DNA (Z = -1.155) levels in the culture supernant but slightly increased the HBsAg level (Z = -2.309). Conclusion Antisense RNA might be a useful tool to repress HBV replication.  相似文献   

6.
短发夹状RNA抑制SMYD3基因在HepG2细胞中的表达   总被引:4,自引:0,他引:4  
目的构建针对人SET-和MYND-结构域含有蛋白3(SMYD3)基因的短发夹状RNA (shRNA)表达载体pGenesil-1-s,观察其对人肝癌细胞株HepG2细胞SMYD3基因表达的特异性抑制效应。方法设计合成针对SMYD3 mRNA编码序列267~288、302~323靶位点之间的核苷酸片断,并定向克隆到仅表达EGFP的空载体pGenesil-1的U6启动子下,构建重组质粒pGenesil-1-s1、pGenesil-1-s2;不针对任何序列的重组质粒pGenesil-1-hk作为对照。通过脂质体介导转染人肝癌细胞株HepG2,应用逆转录聚合酶链反应,western blot蛋白免疫印迹法分别从mRNA、蛋白水平检测阻抑效应。结果酶切鉴定和测序结果证实了pGenesil-1-s1、pGenesil-1-s2、pGenesil-1-hk的成功构建,转染HepG2细胞后,pGenesil-1- s1、pGenesil-1-s2组SMYD3 mRNA和蛋白表达均明显下调,与pGenesil-1-hk组及pGenesil-1对照组比较差异有统计学意义(P<0.01)。结论构建的重组质粒pGenesil-1-s1、pGenesil-1-s2能特异性抑制SMYD3 在HepG2细胞中的表达。  相似文献   

7.
目的探讨亚砷酸(AA)对人肝癌BEL-7402细胞增殖、凋亡及其Bcl-2表达的影响。方法采用MTT比色法检测从作用后的BEL-7402细胞增殖抑制率,流式细胞术检测BEL-7402细胞周期及凋亡细胞,HE染色法观察凋亡细胞的形态,RT-PCR检测BEL.7402细胞的Bcl-2 mRNA,免疫组化法检测细胞的Bcl-2蛋白。结果1.0—8.0μmol/L的AA可使BEL-7402细胞增殖抑制率上升,能诱导BEL-7402细胞凋亡并阻滞细胞周期于S、G2/M期,呈剂量依赖性;8.0μmol/L的AA作用BEL-7402细胞48h后,细胞呈现明显的凋亡形态改变,其Bcl-2 mRNA及蛋白表达明显减弱。结论AA体外有抑制BEL-7402细胞增殖及诱导凋亡的作用,且呈时间、剂量依赖性,其作用机制可能与降低其Bcl-2表达有关。  相似文献   

8.
目的 探讨小干扰RNA(SiRNA)抑制核转录因子(NF)-κB活化对肝癌细胞凋亡的影响.方法 化学合成NF-κB siRNA和阴性对照siRNA,脂质体法转染HepG2细胞,用巢式RT-PCR和荧光定量PCR检测NF-κB mRNA表达情况;免疫组织化学法、酶联免疫吸附法、Western b10t检测NF-κB蛋白表达情况;用磷脂结合蛋白V-异硫氰酸荧光素法检测细胞凋亡,分析NF-κB表达抑制和细胞凋亡间关系.多个样本均数间的比较先行方差齐性检验,方差齐时行单因素方差分析;计数资料比较采用确切概率法分析.结果 NF-κBp65 mRNA在HepG2细胞相对表达量为1.13±0.03,在正常肝细胞L02为0.29±0.07,两者比较,t=27.02,P<0.05,差异有统计学意义.利用NF-κB siRNA干扰可下调NF-κB表达,且呈剂量、时间依赖;NF-κB siRNA转染HepG2细胞72h后,NF-κBmRNA和蛋白表达分别下降了93%和62%,抑制NF-κB表达使HepG2细胞凋亡增加85%. 结论 NF-κB在肝癌细胞中高表达,NF-κB SiRNA能特异性抑制其在肝癌细胞中活化并促进癌细胞凋亡发生.  相似文献   

9.
大鼠肝癌细胞与胎肝细胞间抑癌微小RNAs的表达差异   总被引:4,自引:0,他引:4  
微小RNAs(miRNAs)是一类短序列、非编码、具有调控功能的单链小分子RNA[1],通过与其靶mRNA分子互补结合,在翻译水平上特异性抑制基因表达,参与调控生物生长和发育等许多复杂的生命过程[2,3],异常的miRNAs表达可能与人类许多疾病乃至肿瘤的发生和发展都密切相关[3,4].已知的miRNAs参与癌症发生的机制包括细胞黏附、血管生成、蛋白质水解、细胞信号系统、细胞增殖、侵袭转移和细胞死亡[5].miRNAs在肝癌组织中异常表达,它可能参与了肝细胞癌变及肝癌转移的病理过程[6].本研究应用Exiqon miRNA基因芯片技术,建立大鼠肝癌细胞和胎肝细胞之间miRNAs的差异表达谱,探索肝癌诊断和预后的新指标.DOI:10.3760/cma.j.issn.1007-3418.2009.02.016  相似文献   

10.
肝癌(HCC)的发生、发展与细胞凋亡有着密切的关系,肝细胞的凋亡受到多种基因、转录因子,生长因子、细胞因子和激素的调节[1].Pim-2基因是丝氨酸苏氨酸激酶Pim家族成员之一,属于一种钙/钙调蛋白调节激酶,在多种细胞组织的进化过程中高度保守,可通过磷酸化底物发挥抗凋亡,促进细胞维持自我生存作用[2].  相似文献   

11.
脆性组氨酸三联体基因异常转录与肝癌关系的研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:研究脆性组氨酸三联体(FHIT)基因异常转录与肝细胞癌(HCC)的相关性。方法:利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和单链构象多态性(SSCP)技术检测24对肝癌及癌旁组织、4例正常肝组织中FHIT的转录和突变情况。结果:11例肝癌组织(46%)标本、2例(8%)癌旁正常组织检测到异常转录本,正常肝组织无异常转录。结论:FHIT基因异常转录可能是导致肝细胞癌形成的一个重要因素。  相似文献   

12.
肝细胞癌中肿瘤坏死因子受体6的表达   总被引:1,自引:0,他引:1  
近来研究表明肿瘤坏死因子受体6(TR6)在人类多种恶性肿瘤的发生发展以及肿瘤的免疫逃逸中发挥重要作用,其表达量越高对细胞凋亡的抑制作用越显著。我们检测了TR6在39例HCC及癌旁肝组织的表达及与凋亡的关系,报道如下。[第一段]  相似文献   

13.
Autotaxin mRNA在人肝细胞癌中的表达   总被引:3,自引:0,他引:3  
目的了解自分泌运动因子Autotaxin(ATX)mRNA在肝癌中的表达及其与肝癌临床病理特征之间的关系。方法应用半定量逆转录聚合酶链反应(RTPCR)研究5例正常肝组织、32例肝癌组织中AutotaxinmRNA的表达,以βactin为内参照。结果5例正常肝组织及32例肝癌中均有AutotaxinmRNA表达;但Autotaxin基因表达值(x±s)癌组织显著高于正常肝组织(68.23%±15.31%对31.97±8.05%,P<0.001)。高表达ATX肝癌与癌细胞肝内转移、门静脉癌栓形成、肿瘤的分化程度有关,而与年龄、性别、病因、肿瘤大小等无关。结论Autotaxin基因过度表达与肝细胞癌的进展、转移有关。  相似文献   

14.
原发性肝癌为高度恶性肿瘤,其病死率在我国各种恶性肿瘤中仅次于胃癌和食管癌,居第三位。虽然目前临床治疗方法较多,但疗效欠佳,预后不良。4′,5,7-三羟基异黄酮(Genistein)是近年来受到广泛关注的非营养素成分。本实验采  相似文献   

15.
目的 观察KiSS-1基因表达对肝癌细胞体外增殖、黏附及侵袭能力的影响,为进一步探讨其抗肝细胞癌侵袭转移的机制奠定基础.方法 培养具有高转移潜能的人肝癌细胞株MHCC97-H,瞬时转染KiSS-1基因的细胞为实验组,转染空载体pcDNA3.1/HisC的细胞为空白对照组,未转染细胞为阴性对照组,采用流式细胞术与四甲基偶氮唑盐法、基质黏附实验、Transwell体外侵袭和趋化运动实验检测KiSS-1表达对MHCC97-H细胞体外增殖、黏附、侵袭和运动能力的影响.应用SPSS13.0统计软件包进行统计分析,组间差异以两样本t检验分析. 结果 转染组、空载体组和未转染组与Matrigel基质的黏附能力(A值)分别为0.257±0.029、0.374±0.016和0.394±0.031,转染组明显低于空载体组(t=-7.90345,P<0.01)和未转染组(t=-7.22752,P<0.01);与Fibronectin基质的黏附能力(A值)分别为0.292±0.004、0.394±0.010和0.412±0.023,转染组明显低于空载体组(t=-20.93138,P<0.01)和未转染组(t=-11.31371,P<0.01);趋化运动至Transwell小室下室表面的细胞数分别为65.80±1.92、93.80±2.28和96.40±2.07,转染组明显低于空载体组(t=-30.11750,P< 0.01)和未转染组(t=-24.19142,P<0.01);侵袭至Transwell小室下室表面的细胞数为42.40±1.14、66.00±1.58和67.80±1.92,转染组明显低于空载体组(t=-27.0711,P<0.01)和未转染组(t=-25.4,P<0.01).而转染组、空载体组和未转染组的细胞增殖能力(A值)分别为0.644±0.027、0.669±0.022和0.678±0.027,转染组略低于空载体组(t=-1.60371,P>0.05)和未转染组(t=-1.97828,P>0.05);同时,转染组较空载体组和未转染组未出现明显的G1期阻滞和S期阻滞,也未出现明显的凋亡峰.结论 KiSS-1表达虽不影响肝癌细胞的体外增殖能力,但可抑制其黏附、侵袭和运动能力,提示KiSS-1可作为一个候选的肝细胞癌转移抑制基因,可望成为肝癌侵袭转移治疗的新靶点.  相似文献   

16.
目的探讨MicroRNA-218(miRNA-218)下调肝细胞癌中的E2F2基因表达,从而抑制细胞增殖的机制。方法从细胞库中取得人类肝癌细胞株HepG2、Huh7、MHCC-97H、BEL-7402和正常肝细胞株L02。随后进行细胞培养和转移、反转录多聚酶链反应、免疫印迹分析、细胞增殖和集落形成试验、细胞周期分析和相应的统计学处理。结果 miR-218表达水平在癌细胞中下调。MTT生长曲线表明,当miR-218过度表达时(Huh7中的miR-218 P=0.001;在MHCC-97中的miR-218 P=0.013)细胞增殖能力明显降低。双荧光素酶实验证实,转染了miRNA-218模拟物的细胞的荧光素酶活性显著降低(P0.01),荧光酶报告基因含有E2F2野生型的第3′非翻译区。这些结果表明E2F2是miR-218的直接作用对象。与阴性对照组相比,转染了miR-218模拟物的Huh7和MHCC-97细胞株中的E2F2的相对mRNA表达显著下调(P0.05)。结论 miR-218通过直接作用于E2F2基因的第3′非翻译区调节E2F2的表达,从而抑制HCC细胞增殖。  相似文献   

17.
肝细胞癌多基因表达异常的初步研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
在我国,HBV感染是导致HCC的主要原因,其发生涉及到多基因表达的改变,单基因研究很难代表HCC基因变化的全貌,借助于DNA芯片这一高通量基因表达谱分析手段,有可能揭示HCC多基因表达异常的变化状况,探讨其相互关系及作用机制。我们应用含有18993个已知基因的Affymetrix U133plus 2.0芯片研究HCC患者及正常人肝组织基因表达情况,初步分析差异基因表达及其在HCC中的可能作用。[第一段]  相似文献   

18.
目的 研究人肝癌组织及肝癌细胞株中父系表达基因10(PEG10)的遗传印记状态.方法 从40例肝癌及其癌旁组织、15例正常肝组织、5株肝癌细胞(PLC/PRF/5、SMMC 7721、HepG2、Hep3B、SK-HEP-1)、2株正常肝细胞(changliver、HL7702)中提取基因组DNA,针对PEG10基因单核苷酸多态性位点设计引物进行PCR,扩增片段经测序分析基因型;从杂合样本中提取总RNA进行RT-PCR,对扩增产物测序以检测等位基因表达状态,同时进行实时荧光定量RT-PCR检测PEG10表达水平.计量资料以均数±标准差(-x±s)表示,组间比较用t检验与方差分析;两组率的比较用x2检验.结果 40例肝癌及其癌旁组织中16例呈杂合状态,15例正常肝组织中3例呈杂合状态,肝癌细胞HepG2扩增片段测序检测到一杂合突变位点,其余组织及细胞株均为纯合状态.杂合样本中,82.4%(14/17)肝癌样本(包括组织及肝癌细胞株)中PEG10基因呈双等位基因表达,发生印记丢失;17.6%(3/17)肝癌样本呈单等位基因表达,提示印记存在.PEG10在癌旁及正常肝组织中几乎不表达.发生印记丢失的肝癌组织与印记存在的肝癌组织相比,PEG10表达水平的差异无统计学意义(t=1.311,P>0.05).结论 大多数肝癌组织中存在PEG10印记丢失现象,PEG 10印记状态与其在肝癌组织中的表达水平无明确关系.  相似文献   

19.
人宫颈癌基因蛋白在人肝细癌中的表达及其临床意义   总被引:9,自引:0,他引:9  
人宫颈癌基因(HCCR)是新近确定的一种癌基因,定位于人染色体12q,编码HCCR-1和HCCR-2两种蛋白。HCCR不仅在宫颈癌组织中表达,而且在人其他肿瘤如白血病、淋巴瘤、乳腺癌、肾癌、胃癌、结肠癌、肝癌和子宫癌中均有过度表达,可作为肝癌及乳腺癌诊断的标志物。本研究通过制备HCCR蛋白多克隆抗体,检测人肝细胞癌及肝癌细胞株中HCCR的表达,旨在了解HCCR的表达与肝细胞癌临床病理特征之间的关系。  相似文献   

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