生物样本库冷冻样本的质量控制新进展

生物样本库作为基础研究成果向临床应用转化的平台,在疾病诊断、新药研发、疾病相关基因检测及流行病学研究中均有重要作用。对生物样本库全程进行质量管理和控制,制定标准化操作流程,收取临床资料及随访资料完整的患者血清、血浆、血细胞、组织等样本,并按照各自的标准化操作流程进行处理、分装、储存和使用。质量管理既是样本库建设的关键,也是样本库运转的中心环节,还是高质量规范化医学研究的基础保障。本文旨在探讨生物样本库冷冻样本质量管理体系的构建。     

国家级生物样本库的建设思考

生物信息越来越受到重视。国内建立国家级生物样本库已有成熟的理论基础,国家临床医学研究中心的成立提供了实质操作的平台。通过分析国内外现有的大型样本库建设模式,探讨国内建设资源优化、成效显著的国家级生物样本库的可行方案。     

精神疾病生物样本库建设的实践与探讨

随着精准医学和转化医学的快速推进,生物样本库在精神疾病研究中的作用日益凸显。本文从精神疾病的特征出发,探讨生物样本捐献者的权益、知情同意书签署、隐私保护和保密等伦理问题,以及生物样本的同质化判断、信息化建设等影响精神疾病生物样本库质量的关键问题。同质化是精神疾病生物样本库建设的一大难点。笔者认为可以通过标准化质量管理体系以及标准化、结构化的信息化语言予以克服,为样本及其数据信息的共享奠定基础。此外,人工智能、区块链等技术的引入,也将为精神疾病生物样本库的深度挖掘、合作共享带来更多的发展空间,推动精神疾病生物样本库从“规范化、标准化”走向“集约化、共享化”,最终实现其价值化目标。     

新疆特高发肿瘤资源库中冷冻组织质量鉴定标准的研究

目的在新疆特高发肿瘤资源库中建立冷冻组织质量鉴定体系。方法选取肿瘤资源库中食管癌、宫颈癌、肝癌冷冻组织及正常对照组织各10例,利用HE染色技术检测标本取材的准确性,琼脂糖凝胶电泳鉴定DNA质量,琼脂糖凝胶电泳检测RNA质量,Western-blot鉴定蛋白质质量。结果 HE染色观察检测标本肿瘤部分占80%以上,28s/18s为1.8~2.0,蛋白质及DNA质量均完整无降解。结论建立了一个规范化的冷冻组织质量控制体系,可以作为肿瘤资源库标本质量鉴定的常规方法。     

关于建设我国生物样本库标准化体系框架的构想

阐述生物样本库的定义及构建我国生物样本库标准化体系的意义,通过对比国内外生物样本库的发展历程和经验,分析我国生物样本库标准化体系构建中存在的问题和原因,提出我国建设生物样本库标准化体系的建议。     

生物样本库的现状及研究进展

随着临床医学和生命科学研究的深入以及转化医学的需要,生物样本库的建设越来越受到重视.文章通过对国内外生物样本库的现状和研究进展的论述,发现国内生物样本库仍存在生物样本库规模尚小、管理措施和法规还有待制定和完善、缺乏统一的建设标准、资源无法共享、公共关系建设不完善等诸多问题.并提出在完备的法规指南、监管机制以及标准的指引下,通过大规模的样本采集、处理和储存、管理,建设完备的基础设施,临床数据资源的整合与利用以及安全稳定的信息系统等手段建设高质量的生物样本库等对策.实现合理高效利用样本资源,实现资源共享,促进转化医学的发展,为下一步实现商业化和集中化运作打下良好基础.     

生物样本库信息管理系统的设计和实现

基于生物样本库的海量数据,使样本信息和资源共享利用困难。结合可视化信息管理数据库的采集,应用Web技术的数据检索、查询和管理,建立生物样本库信息管理系统的信息整合和共享平台。     

临床生物样本库发展的机遇与挑战

精准医学计划和“健康中国2030”规划战略的提出,使生物样本库迎来了难得的发展机遇.目前我国生物样本库建设依然面临诸多挑战,包括样本库标准难以统一、电子信息系统标准不统一、临床治疗标准不同、相关的法律法规不完善和可持续发展障碍等.需要通过样本库行业人员的不懈努力,才能使中国的生物样本库发展走上标准化、信息化和规范化的正轨.     

冷冻组织切片质量控制的体会

组织冷冻切片在病理工作中占有举足的重要作用。它是在手术过程中对于良恶性肿瘤做出正确诊断的方法之一,但因各种原因冷冻切片的质量,影响着病理诊断的及时性,准确性也间接影响着病人的预后。现将我们在如何做好冷冻切片的体会介绍如下。     

我国生物样本库建设管理中存在的问题及规范化管理策略

从法律法规、监管机制、伦理争议、资源和隐私保护等方面,分析我国生物样本库建设管理中存在的问题,参照国外发展生物样本库的管理措施和经验,提出发展我国生物样本库的一些具体建议,包括完善法律、法规体系,制定国家统一的人类研究伦理准则和伦理审查细则等方面。     

高质量脑组织快速冷冻切片的制作方法

冷冻切片由于其方法简便快捷,在临床术中快速病理诊断中起重要作用。尤其神经外科疾病的术中快速诊断,利用冷冻切片已成常规,由于术中送检脑病变组织较少,富含水份,易形成冰晶,快速冷冻切片的制作难度大,从而影响病理诊断的准确性,笔进行通过反复摸索,对常规方法加以改进,并对操作过程中的重要步骤进行规范,制作出了质量较高的冷冻切片,现介绍如下。     

眼科专科医院评估指标体系的研究与构建

目的:研究并构建眼科专科医院评估指标体系,为政府和行业对眼科专科医院进行评价时提供依据。方法:采用文献资料查询,专家咨询和国内、外眼科专科医院考察,收集各医院的资料,运用层次分析法,建立评价模型的方法,最后确定评估指标。结果:提出了《眼科专科医院评估指标》应包括三大类:一类指标(否决指标)4项,二类指标(准入指标)16项,三类指标(评分指标)4大项143个小项,内容涉及医院管理指标、医疗业务技术指标、资源配置指标和经济管理指标。     

三种DNA抽提方法对新鲜血细胞及冻血细胞DNA抽提效能的比较

目的 比较3种血细胞DNA提取方法（进口试剂盒、国产试剂盒和改良苯酚抽提方法）对新鲜血细胞及冻血细胞DNA的提取效率及差异。 方法 收集20例胰腺癌患者5 mL外周血标本,经低速离心获得血细胞沉淀后分装,根据保存方式分为新鲜血细胞和冻血细胞。新鲜血细胞不经冻存,在12 h内迅速抽提DNA;冻血细胞在-40℃保存72 h后,室温解冻后抽提DNA。抽提方法分别采用进口试剂盒（Qiagen公司）、国产试剂盒（天根生化科技有限公司）和改良苯酚方法。琼脂糖电泳检测DNA片段的完整性,核酸蛋白检测仪测定DNA纯度和浓度,计算不同抽提方法的DNA得率。 结果 在获得的DNA完整性方面,改良苯酚方法抽提的基因组DNA断裂和降解较少,而进口和国产试剂盒抽提的DNA均有一定程度的降解小片段。在获得DNA的纯度方面,部分冻存血细胞无论应用进口试剂盒、国产试剂盒和改良苯酚方法,均表现出一定的污染杂峰。在DNA得率方面,无论新鲜血细胞和冻存血细胞,均是进口试剂盒得率最高,其次为国产试剂盒;冻血细胞的改良苯酚法DNA得率与国产试剂盒相当,新鲜血细胞的改良苯酚法DNA得率最低。在耗时和成本分析中,试剂盒较快但成本较高。 结论 改良苯酚抽提法可获得较进口和国产试剂盒片段更长、更完整的基因组DNA,虽然在得率和耗时方面稍逊色,但其成本较低,可推荐用于大规模、分批次、低成本冻存血细胞的基因组DNA抽提。     

兔荧光扩增片段长度多态性分析体系的建立

目的:建立兔荧光扩增片段长度多态性(fluorescent amplification fragment length polymorphism,fAFLP)分析方法并对其在实验动物科学中应用进行探讨。方法:本实验以5个品种(系)兔为实验材料,对DNA提取、预扩增和选择性扩增等步骤进行优化并对结果进行检测。结果:5个品种(系)兔的扩增片段数均在120条以上,各品种(系)特异性条带均能找出,5个品种(系)兔能据此进行区分。结论:fAFLP是一种以PCR为基础的DNA指纹技术,为兔的指纹分析提供了一种快速高效的方法,可用于兔的遗传质量检测。     

关于甲醛固定石蜡包埋组织提取DNA质量的探讨

目的:探讨甲醛固定石蜡包埋组织(FFPET)提取DNA后PCR扩增产物检测率的提高。方法:应用从FFPET提取的DNA,PCR反应扩增β-Globin(110bp),分析纯化前后DNAPCR产物的检测率。结果:纯化后的DNA模板PCR反应取得高质量目的基因。结论:纯化后能有效去除不能通过蛋白酶K消化和有机萃取法去除的PCR反应抑制因子,利于PCR反应成功。     

一种从石蜡包埋组织中获取高质量基因组DNA的改良方法

目的:比较现有的DNA制备方法,建立一种从甲醛固定石蜡包埋组织(formalin-fixed paraffin-embedded tissues,FFPET)提取高质量基因组DNA的方法。方法:将传统基因组DNA提取方法与市场供应的DNA亲和层析柱结合在一起,以水浴脱腊法替代二甲苯脱腊法,设计一种改良的基因组DNA快速提取方法,从石蜡包埋宫颈癌组织标本提取基因组DNA,并用琼脂糖凝胶电泳法和聚合酶链式反应法进行鉴定。结果:改良的基因组DNA提取法整合了水浴脱蜡与DNA亲和层析柱的优点,从石蜡包埋宫颈癌组织中获得了高质量的基因组DNA,特别是能以很高的效率回收大于20 kb的基因组DNA大片段。结论:改良的基因组DNA提取方法简单快捷,是一种从石蜡包埋组织中回收高质量基因组DNA的有效途径。     

一种改进的提取人外周血和组织线粒体DNA的方法

目的：建立一种简便、快捷地从人外周血和组织中制备高质量线粒体DNA的方法。方法：以差速离心法分离线粒体,用碱性SDS法裂解线粒体膜,释放线粒体DNA后用酚／氯仿抽提,TE或ddH2O溶解。然后将所得线粒体DNA进行纯度鉴定并和其他现有方法制备的线粒体DNA用PCR进行长片段扩增,比较扩增效果。结果：用改进的方法制备的线粒体DNA中没有检测到核DNA,并能有效扩增8kb长的目的片段。结论：改进后的方法简便、快捷,制备的线粒体DNA纯度高,也有利于长片段PCR扩增。     

人源细粒棘球蚴的RAPD分析体系建立

目的建立PCR—RAPD反应体系,提升细粒棘球蚴随机扩增多态性DNA（RAPD）遗传多态性研究的稳定性,为研究细粒棘球蚴的分类学以及包虫病的分子流行病学奠定基础。方法采用改进的酚-氯仿抽提法提取细粒棘球蚴基因组DNA,用单因素筛选方法建立PCR—RAPD分析体系。结果采用改进的酚／氯仿抽提方法提取细粒棘球蚴基因组DNA质量高,适用于PCR—RAPD扩增分析;在25μL体系中,RAPD—PCR扩增反应各成分的最佳浓度为：dNTP0．2—0．3mmol／L、Taq酶2．5U、随机引物0．8—1．4μmol／L,模板为60ng。PCR扩增最佳条件为：95℃预变性5min;94℃变性30s、32℃退火45s、72℃延伸1min、共35个循环;最后72℃延伸10min;初步从20条引物中筛选出11条带型丰富的随机引物。结论酚-氯仿适用于提取细粒棘球蚴基因组DNA,优化的RAPD反应体系和筛选出的随机引物适合进行细粒棘球蚴RAPD遗传多态性分析。