基于双硫死亡相关lncRNA的宫颈癌预后模型构建及验证

目的:构建预测宫颈癌生存期的双硫死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)预后模型。方法:从TCGA数据库下载307个宫颈癌RNA测序数据及临床信息,随机分为训练集和测试集。使用共表达分析和回归分析得到双硫死亡相关lncRNA并构建预后模型。根据风险评分中位数将患者分为高风险组和低风险组。使用Kaplan-Meier生存分析、Cox回归分析、受试者工作特征(ROC)曲线、主成分分析、列线图和校准曲线评估模型的预测效能。结果:共得到3个双硫死亡相关lncRNA并构建预后模型。Kaplan-Meier生存分析结果显示高风险组的总生存期短于低风险组。风险曲线显示高危患者的死亡率高于低危患者。Cox回归分析显示风险评分是独立预后因子。该模型预测患者1年、3年、5年存活率的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.780、0.701、0.716。列线图和校准曲线表明预后模型接近于理想模型。结论:本研究构建了宫颈癌的双硫死亡相关lncRNA预后模型,该模型预测效能良好。     

基于生物信息学筛选影响前列腺癌预后的脂代谢基因

目的 通过生物信息学筛选影响前列腺癌预后显著的脂质代谢基因。方法 从TCGA数据库下载前列腺癌的临床资料及mRNA测序数据;利用R语言筛选正常组与前列腺癌组的差异基因,利用KEGG数据库检索脂质代谢基因,并筛选出差异表达的脂质代谢基因。结合患者的生存状态、生存时间与筛选的差异代谢基因的表达量,利用uniCOX函数筛选与前列腺癌预后密切相关的脂代谢基因。根据上述基因表达量的中位数,把患者分为高低风险组行生存分析。利用GSEA软件对关键基因进行富集分析。结果 共筛选出1973个差异基因,其中包括83个差异的脂质代谢基因,使用uniCOX分析预后,共发现5个促癌脂质代谢基因,包括：CPT1B,AKR1C4,AKR1C2,UGT1A10,CYP4F3。对这5个基因进行生存分析,发现肉毒碱棕榈酰基转移酶1B(CPT1B)与前列腺癌的生存显著相关。通过富集分析发现,CPT1B与亚油酸、α亚麻酸代谢呈显著正相关,与WNT信号通路呈显著负相关。结论 CPT1B高表达与前列腺癌的预后不良显著相关。     

基于谷氨酰胺代谢相关基因构建肝细胞癌预后模型及治疗方案分析

目的：谷氨酰胺代谢在肿瘤的发生、发展过程中起着重要作用,通过筛选谷氨酰胺代谢相关的特征基因鉴定肝细胞癌,以及抗癌药物治疗效果。方法：从TCGA数据库和GEO数据库获取正常肝组织和肝细胞癌的基因表达样本,筛选出差异表达的谷氨酰胺代谢相关基因（GMRGs）,之后通过lasso回归和step cox分析构建了预后模型,并评估了高低危组的免疫治疗和药物治疗差异。结果：通过差异分析筛选出23个差异表达的GMRGs,相关性环图和PPI蛋白互作网络表明这些差异基因具有很强的相关性。单因素cox筛选出14个P<0.05的GMRGs。通过lasso回归和step cox得到4个最具有特征的基因（CAD、PPAT、PYCR3和SLC7A11）,构建了风险模型,并在TCGA数据集和GEO数据集中证实该模型可靠预测能力。最后,高危组的的免疫治疗优于低危组,低危组化疗药物和靶向药治疗优于高危组。结论：综上所述,本研究建立了谷氨酰胺代谢相关基因为特征的可靠的预后风险模型,该模型可为肝细胞癌患者的预后和治疗方案提供可行的依据。     

基于整合生物信息学构建的肺腺癌内质网应激相关预后模型

目的 通过整合生物信息学建立内质网应激风险模型,预测肺腺癌(LUAD)患者的预后。方法 本文从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载数据集,采用单因素、多因素Cox回归分析和Lasso回归分析等方法,筛选和LUAD预后有关的内质网应激相关基因,建立预后风险模型。结果 本研究筛选出8个关键基因,其中,MBTPS2、SEC61G、FURIN和PKP2表达水平与LUAD预后良好呈负相关(P<0.05),EIF2AK3、CAV3、SELENOK和NLRP1表达水平与LUAD预后良好呈正相关(P<0.05)。结合临床特征建立内质网应激风险模型并绘制受试者工作特征曲线,预测1、2、3 a总生存期的曲线下面积分别为0.75、0.75和0.77,提示模型对患者总生存期的预测准确性。结论 本研究提出了1个可作为LUAD独立预后因素的内质网应激风险模型,有助于了解LUAD的致病分子机制及开发新的治疗靶点。     

基于HER-2相关基因构建风险模型用于膀胱癌生存预后评估

目的：探讨HER-2相关基因(the human epidermal growth factor receptor-2-related genes, HRGs)与膀胱癌生存预后的相关性,并基于HRGs构建一种膀胱癌患者生存预后的预测模型。方法：从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)中下载膀胱肿瘤组织mRNA测序数据和临床数据,通过与分子签名数据库(the molecular signatures database, MSigDB)中HER-2相关的基因联合分析鉴定膀胱癌中的HRGs。利用单因素和多因素Cox回归分析进一步明确与膀胱癌生存相关的HRGs(P<0.05),并构建HRGs风险模型(HRGs risk score model, HRSM),根据风险评分取中位数将膀胱癌患者分成高风险组和低风险组。利用R语言对高风险和低风险组的患者进行生存分析,并对HRGs与临床特征的相关性进行分析。利用多因素Cox回归分析,验证影响膀胱癌患者预后的独立因素。计算HRSM的受试者工作特征曲线(receiver operating characteris...     

基于TCGA数据库的食管鳞癌代谢相关基因预后风险模型的建立

目的：探索影响食管鳞状细胞癌(ESCC)患者预后的代谢相关基因,构建ESCC患者的预后风险模型。方法：从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载食管癌的转录组数据和临床病例资料。从转录组数据中提取出代谢相关基因的数据,筛选ESCC组织和正常组织中差异表达的代谢基因。运用单因素COX分析、Lasso回归分析、多因素COX分析构建预后风险模型,并用受试者工作特征(ROC)曲线评估代谢相关基因预后模型的预测能力,并对高低风险组进行GSEA分析。结果：肿瘤组和对照组共存在280个差异表达的代谢相关基因,其中乙醛脱氢酶1A1(ALDH1A1)、黑酸1,2-二加氧酶(HGD)以及DNA引物酶多肽1(PRIM1)与ESCC的预后相关。Kaplan-Meier分析显示,相较于低风险组,高风险组的总体生存期降低(P<0.01)。ROC曲线分析及多因素COX回归分析表明,该预后模型具有良好的预测效能[曲线下面积(AUC)=0.741],可以作为一个独立的预后因素(HR=11.66,P<0.001)。结论：基于代谢相关基因构建的预后风险模型可以作为ESCC患者的预后因素,为寻找新的食管癌治疗靶点提供...     

miR-9在宫颈癌组织中的表达及其靶基因的预测和生物信息学分析

目的：探讨宫颈癌组织中miR-9表达,并对靶基因进行预测及生物信息学分析,为深入研究miR-9的调控机制及生物学功能提供理论依据。方法应用miRNAs芯片检测宫颈癌组织及正常宫颈组织中miRNAs表达,利用生物学软件对其中上调较明显的miR-9进行靶基因预测,同时利用基因芯片技术筛选转染miR-9后宫颈癌Hela细胞中差异表达的基因,将两者预测靶基因的交集作为miR-9的靶基因进行GO富集分析和生物通路富集分析。结果与正常宫颈组织比较,宫颈癌组织中有15个miRNAs表达为上调,10个miRNAs表达为下调,其中上调较明显的是miR-21和miR-9,下调较明显的是miR-376a和miR-218。芯片所示的miR-9调控的下调基因与软件预测的靶基因交集中共有148个基因,miR-9的预测靶基因富集在细胞内的生物学调控、合成和代谢等生物学过程以及转录调控和蛋白结合等分子功能上,其信号通路富集于调节肌动蛋白细胞骨架、脂质代谢和细胞黏附通路。结论 miR-9在宫颈癌组织中高表达,miR-9预测的靶基因富集于多个生物学功能和生物学过程及与肿瘤相关的信号通路。     

基于生物信息学筛选卵巢癌预后的坏死性凋亡相关基因

目的 通过生物信息学筛选与卵巢癌患者预后的坏死性凋亡相关基因。方法 从公共数据库下载坏死性凋亡相关基因、卵巢癌的基因表达和相关临床数据,利用RStudio 4.1软件筛选出在卵巢癌组织与卵巢正常组织间差异表达的坏死性凋亡相关基因(差异表达基因),对差异表达基因进行基因本体论(GO)功能富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用多因素COX回归模型筛选出与卵巢癌患者预后有关的坏死性凋亡相关基因。根据多因素COX回归结果构建卵巢癌预后风险模型,根据该模型风险评分中位数将卵巢癌样本分为高风险组和低风险组,采用Kaplan-Meier法比较高风险组和低风险组患者的生存情况,采用受试者工作特征(ROC)曲线验证卵巢癌预后风险模型的评估效能。通过COX回归模型分析卵巢癌预后的独立影响因素,并通过列线图展示卵巢癌独立预后影响因素与卵巢癌患者总生存率的相关性。结果 (1)确定卵巢癌中有25个差异表达基因,包括13个上调基因与12个下调基因。(2)GO分析结果显示,差异表达基因涉及的生物学过程包括调节凋亡信号通路等,涉及的细胞组分主要为晚期内体膜等,涉及的分子功能主要包括细胞因子活...     

长链非编码RNA与宫颈癌预后关系研究进展

宫颈癌是妇科最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁着女性健康。虽然近年来其治疗取得了一定进展,但仍有部分患者在治疗后的2年内发生转移,且预后不良。而长链非编码RNA(lncRNA)在多种恶性肿瘤中异常表达,且与肿瘤的预后密切相关。因此,研究lncRNA在宫颈癌中的表达情况及其与宫颈癌预后的关系对宫颈癌的早期诊断、治疗及预后评价具有重要意义。目前关于宫颈癌lncRNA的研究较多,但大多数为lncRNA在宫颈癌中的表达、lncRNA与临床病理特征及预后关系的研究,其具体机制尚不清楚未来需进一步探索。     

吸烟对宫颈癌预后影响的病例对照研究

目的:通过临床配对研究,回顾性分析吸烟人群子宫颈癌患者的临床及病理资料,探讨吸烟对宫颈癌进展以及预后的影响。方法:选取年龄相差2岁以内;居住在同一地市区;就诊时间相差2个月以内共84例宫颈癌手术患者,按1∶2配对研究,分为吸烟组28例,非吸烟组56例。分析吸烟与宫颈癌临床病理因素之间的关系及与宫颈癌预后的关系。结果:吸烟与宫颈间质浸润深度(P=0.009)、盆腔淋巴结状态(P=0.025)、平均生存时间(P=0.003)、5年总生存率(OS)(P=0.008)、5年无进展生存率(PFS)(P=0.002)以及是否出现肿瘤复发(P=0.021)密切相关。与吸烟组相比,非吸烟组宫颈癌平均生存时间显著延长。特别针对Ⅰ-ⅡA期患者,吸烟组平均生存时间(104.133±14.328)个月,而非吸烟组为(140.073±7.204)个月,二者有显著性差异(P<0.05)。多因素分析显示,发现吸烟、淋巴结状态、临床分期是影响5年生存的独立预后因素。结论:吸烟可促进宫颈癌进展,进而影响宫颈癌预后。     

DWI在宫颈癌诊断及预后检测的价值

目的探讨DWI在宫颈癌诊断及预后检测的价值。方法选择我院2011年1月至2014年1月收治的100例宫颈癌患者。同期选择100例宫颈癌放疗后患者及100例健康体检者,对表观扩散系数值进行分析。结果与正常宫颈管腺体相比,宫颈纤维间质的表观扩散系数值为1.70±0.45×10~(-3)mm~2/s,对比分析后,差异有统计学意义(t=6.834,P0.05)。100例宫颈癌病灶在DWI均呈现高信号状态。根据患者侵犯深度,低信号的宫颈纤维间质将会出现消失。与正常宫颈对比分析后,宫颈癌患者的表观扩散系数值为1.02±0.32×10~(-3)mm~2/s,对比分析后,差异有统计学意义(t=12.412,P0.05)。与宫颈癌患者相比,预后恢复正常患者的表观扩散系数值为1.45±0.41×10~(-3)mm~2/s,对比分析后,差异有统计学意义(t=7.395,P0.05)。与初诊宫颈癌患者相比,宫颈癌复发患者的表观扩散系数值为0.82±0.20×10~(-3)mm~2/s,对比分析后,差异有统计学意义(t=8.295,P0.05)。结论 DWI能够显著的辨别正常宫颈及宫颈癌疾病,同时还能够显著地观察到放疗后宫颈组织变化,对宫颈癌的诊断及预后具有重要的价值。     

CT灌注成像预测中晚期宫颈鳞癌同步放化疗疗效的价值

目的探讨CT灌注参数预测中晚期宫颈癌鳞癌同步放化疗疗效的价值。方法对44例进行为期1年的随访,按照实体肿瘤的RECIST标准将其分为有效组与无效组。对各组的灌注参数进行比较,并采用ROC曲线分析来评价灌注参数预测中晚期宫颈癌同步放化疗疗效的价值。结果 1、BV、PMB在两组间差异有统计学意义(t=3.667,P=0.001;t=3.047,P=0.004),并且有效组的BV值、PMB值较无效组高;BF、MTT、TTP在两组间没有统计学意义。2、经ROC曲线分析,BV的曲线下面积较PMB曲线下面积大,所以BV的评价效能较PMB高。结论 CT灌注成像在中晚期宫颈鳞癌同步放化疗疗效评价方面有预测价值。     

长链非编码RNA牛磺酸上调基因1表达水平在Ⅰ～Ⅱ期宫颈癌诊断和预后中的作用

目的 评估宫颈癌(CC)患者癌组织长链非编码RNA牛磺酸上调基因 1(lncRNA TUG1)的表达水平与CC诊断及预后的关系。 方法 前瞻性队列研究连续纳入137例接受手术治疗的CC患者。记录所有患者的人口学和临床病理特征并计算患者总体生存期(OS)。采用定量聚合酶链式反应(qPCR)检测CC患者癌组织和癌旁组织lncRNA TUG1的相对表达量。 结果 CC癌组织的lncRNA TUG1相对表达量显著高于配对的癌旁组织(P<0.001)。癌组织lncRNA TUG1表达水平与国际妇产科联盟(FIGO)分期(P=0.023)呈正相关。Kaplan-Meier(K-M)曲线显示,癌组织lncRNA TUG1高表达的患者OS显著低于癌组织lncRNA TUG1低表达的患者(P<0.001)。多元Cox比例风险模型分析显示,癌组织lncRNA TUG1高表达是CC患者OS较差的独立预测因素(P<0.001)。肿瘤大小≥4 cm(P<0.001)、FIGO Ⅲ期(P<0.001)、淋巴结转移阳性(P<0.001)和宫颈基层浸润深度≥2/3(P=0.002)也是CC患者OS较差的独立预测因素。 结论 癌组织lncRNA TUG1表达水平可作为辅助评估CC患者诊断和预后的潜在生物标志物。     

宫颈癌存活蛋白的表达及其与预后的关系

目的研究宫颈癌组织及癌旁组织存活蛋白的表达及其与患者预后的关系。方法收集2007年1月至2009年12月徐州市中心医院收治的70例手术切除的临床病理资料保存完整的宫颈癌石蜡切块,癌旁组织取自距癌组织0.5¹.0 cm,应用免疫组织化学S-P法检测宫颈癌组织及癌旁组织中存活蛋白的表达情况,分析其与宫颈癌临床病理特点及预后的关系。结果存活蛋白在宫颈癌组织中的表达阳性率高于癌旁组织(65.7%vs 21.4%),差异有统计学意义(P<0.05)。存活蛋白表达与患者性别、年龄、淋巴结转移、临床分期均无关(P>0.05),其阳性表达与肿瘤细胞分化程度、临床分期有关(P<0.05)。生存曲线提示存活蛋白低表达组与高表达组比较具有生存优势,差异有统计学意义(P<0.05)。结论存活蛋白可能与宫颈癌的发生、发展有关,对判断宫颈癌的预后有一定的价值。     

腹腔镜下宫颈癌根治术治疗早期宫颈癌的Meta分析

目的评价腹腔镜下根治全子宫切除＋腹膜后淋巴清扫术治疗早期宫颈癌的疗效及预后影响。方法电子检索Cochrane图书馆,MEDLINE、EMBASE、PubMed、CBMdisc数据库,收集符合纳入标准的文献,提取资料,评价纳入研究的方法学质量,并提取有效数据进行Meta分析。结果符合纳入标准的文章8篇,无前瞻性随机对照研究,3篇为前瞻性非随机对照试验,5篇为回顾性病例对照研究,与传统的开腹宫颈癌根治术相比,腹腔镜下根治全子宫切除＋腹膜后淋巴清扫术具有术中出血量少、住院时间短、术后肠道排气时问短、术后并发症少等优点,而在复发率和术中并发症发生率上则无显著差异。结论腹腔镜下根治性子宫切除术＋盆腔淋巴结切除术是安全可行的,它能缩短住院时间,减少术中出血量,降低术后并发症的发生率,不增加手术后的复发率和术中并发症发生率。但由于纳入的文献的质量较低,这将会影响结果的可靠性。需要大样本的随机双盲对照试验的研究结果来进一步证实。     

B23和Ki67与宫颈癌患者预后的关系探讨

目的:探讨B23和Ki67与宫颈癌预后的关系。方法:免疫组织化学染色检测104例宫颈癌及20例正常宫颈组织中B23和Ki67的表达水平,统计学分析宫颈癌患者生存率与B23和Ki67的表达水平的关系。结果:B23在正常宫颈组织和宫颈癌组织中的阳性率分别为30.0%和76.9%(P<0.001)。Ki67在正常宫颈组织和宫颈癌组织中阳性率分别为15.0%和44.2%(P=0.014)。单因素分析显示B23及Ki67的表达与宫颈癌的无进展生存率呈负相关。B23和Ki67的表达存在正相关关系(P<0.05)。结论:联合检测B23和Ki67可能有助于判断宫颈癌的生存率,作为临床疗效的预后指标。     

中老年宫颈癌患者临床病理特征及预后分析

目的分析宫颈癌患者的临床病理特征和预后特点,比较年轻患者与中老年患者的差异,探讨中老年宫颈癌患者的病理特征和预后。方法回顾性分析安徽医科大学附属省立医院于2006年10月至2012年8月诊治的110侧宫颈癌患者的临床资料。将年龄≤35岁的患者作为年轻组,年龄〉35岁的患者作为中老年组,分析患者的临床病理特征以及可能的预后差异。结果两组患者都以接触性出血及不规则阴道出血为主,但年轻患者因处于性活跃期,有出血症状表现的比例比中老年患者高,中老年组的无症状确诊病例比年轻组高（P〈0．05）。病理特点两组在癌变种类方面无明显差异,鳞癌及腺癌占的比例类型两组差异不显著（P〉0．05）,中老年组Ia患者明显少于年轻组,差异有统计学意义（x2=5．88,P〈0．05）。结论中老年患者的宫颈癌分期比年轻患者高,病情发展情况较严重。     

硒结合蛋白表达对宫颈癌发生发展与预后的影响分析

目的 探讨硒结合蛋白1(SEBP1)对宫颈癌的发生发展与预后的影响.方法 选取2016年10月至2017年11月来恩施土家族苗族自治州中心医院住院的宫颈癌患者及同期住院的宫颈上皮内肿瘤病人与其他宫颈良性疾病切除病人为研究对象,每种病例70例,检测血清硒水平,采用免疫组化法检测组织蛋白表达水平,然后根据宫颈癌组织中SEBP1的表达情况,将病例分为高表达组与低表达组,观察疾病发展与预后相关指标;选择正常宫颈上皮细胞H8,以及宫颈癌细胞系Hela、SiHa和CaSki为研究细胞模型,采用免疫印迹检测细胞蛋白表达水平.结果 宫颈癌患者血清中,其血清硒含量最低,宫颈上皮内肿瘤血清硒含量次之,宫颈良性疾病患者的血清中硒含量最高;宫颈癌细胞系中SEBP1的表达明显降低;SEBP1的表达与促癌基因c-Myc的表达呈负相关,与抑癌基因p53呈正相关,SEBP1的高表达能降低宫颈癌的复发率和转移率,减小宫颈癌的恶性程度.结论 SEBP1的表达与宫颈癌的发生发展与预后密切相关,其高表达能抑制宫颈癌的发生,改善宫颈癌预后.