应用基因芯片研究环孢素对大鼠肝脏基因表达的影响

目的研究环孢素对大鼠肝脏基因表达谱的影响。方法大鼠予以环孢素灌胃1次,摘取肝脏提取总RNA。用Cy3和Cy5 两种荧光物质分别标记阴性对照组和环孢素组肝组织cDNA,制备成探针与表达谱芯片进行杂交,获得的荧光信号图象用计算机扫描后进行数据分析,计算每点的Cy5和Cy3信号强度比值。结果在被检测的4096个基因中,环孢素组差异表达基因50个,占芯片基因总数 1．22％,其中表达上调的基因17个,表达下调的基因33个。结论环孢素的免疫抑制、抗肿瘤作用以及与其他药物的相互作用可能与一系列代谢相关基因的表达变化有关。     

肝细胞黏附分子对膀胱移行癌细胞基因表达谱的影响

目的利用Affymetrix基因表达谱芯片探讨肝细胞黏附分子(hepaCAM)对膀胱移行癌细胞基因表达谱的影响及作用的分子机制。方法运用Affymetrix Human plus 2.0全基因组芯片检测膀胱移行癌细胞株EJ细胞腺病毒-绿色荧光蛋白-hepaCAM感染组与腺病毒-绿色荧光蛋白感染组的基因表达谱,用SAM法进行差异基因分析、DAVID软件进行基因本体论分析及wikiPathway分析,并用RT-PCR和Western blot验证芯片结果。结果 hepaCAM能引起EJ细胞系基因表达谱的广泛变化,表达差异超过2倍以上的基因共2469个,其中上调基因1602个、下调基因867个。这些差异表达的基因功能主要涉及细胞周期、细胞增殖调节等方面。用RT-PCR对差异基因DNA修复蛋白,肝脏激酶B1和细胞周期蛋白D1进行验证,结果与基因芯片相符;进一步在3细胞株中用Western blot佐证DNA修复蛋白、肝脏激酶B1变化与芯片结果一致。结论 hepaCAM能够诱导EJ细胞基因表达谱的广泛变化,在基因水平通过多条通路作用于膀胱癌细胞。     

人参多糖对K562细胞基因表达谱的影响

目的 利用基因表达谱芯片研究人参多糖对体外培养的人红白血病K562细胞基因表达谱的影响。方法 人参多糖处理K562细胞48 h后,分别提取给药组和对照组K562细胞总RNA,将两组RNA纯化为mRNA,逆转录成cDNA,用2种不同的荧光染料Cy3和Cy5进行线性扩增标记,与Illumina全基因组表达谱基因芯片杂交,采用生物信息学方法分析人参多糖处理后K562细胞基因表达谱的改变。结果 共发现差异基因306个,其中上调基因220个,下调基因86个,并对其进行生物学功能分类。结论 诱导肿瘤细胞分化是多基因作用的综合结果,筛选的基因对研究肿瘤发生、发展与逆转分化,以及寻找潜在的抗肿瘤药物作用靶点可能有意义。     

神经再生素对皮层细胞基因表达影响的基因芯片研究

目的：采用基因芯片技术，观察神经再生素对体外培养的胚鼠大脑皮质细胞基因表达的影响。方法：取ICR胚鼠（15d)大脑皮层细胞，无血清培养。实验组加入神经再生素（2μg/ml）,对照组加入等量基础培养液。培养6h后，抽提实验组和对照组皮层细胞总RNA，经反转录分别用Cy5、Cy3荧光标记成cDNA探针。将荧光标记的cDNA与MGEC－40s基因表达谱芯片杂交，芯片扫描、数据处理。结果：实验组与对照组大脑皮质细胞出现64条差异性表达的基因。呈现上调的基因有：钙调素结合蛋白、锌指蛋白激酶、核糖体蛋白等基因；下调基因有：抑制细胞分裂因子等基因。结论：神经再生素可作用于体外培养的胚鼠大脑皮层细胞，从基因调控水平促进脑细胞生长。     

CDX2基因过表达促进胃癌细胞凋亡的分子机理研究

目的:利用基因表达谱芯片技术筛选CDX2高表达的胃癌MGC803/CDX2细胞和对照组MGC803/EV细胞中差异表达的基因,探讨CDX2高表达促进胃癌细胞凋亡的分子机理.方法:Trizol一步法提取高表达CDX2的MGC803/CDX2细胞和对照组MGC803/EV细胞的总RNA,并纯化mRNA,反转录合成荧光分子(Cy3/Cy5)标记的cDNA探针,与22 k基因表达谱芯片进行杂交;采用LuxScan 3.0图像分析软件对芯片图像进行分析,把图像信号转化为数字信号,最后以差异为>2倍或<0.5倍的标准来确定差异表达基因.结果:在23 238个基因中筛选出与细胞凋亡有关的差异性表达基因15条,其中8条基因表达上调和7条基因表达下调.结论:CDX2基因过表达促进胃癌细胞凋亡可能与这15条差异表达基因关系密切.     

人胎盘基因表达谱芯片的初步研究

目的：制备人胎盘基因表达谱芯片，并用于基因差异表达分析。方法：用基因芯片点样仪将胎盘基因文库探讨打印在氨基包被的玻片上制备表达谱芯片。分别提取对照组与三氧化二砷处理的K562细胞总RNA，纯化mRNA后反转录成cDNA，再以限制性显示技术进行荧光标记，将两组荧光标记的样品混合后与芯片进行杂交，杂交后清洗芯片，干燥后对芯片进行扫描，分析杂交结果。结果：建立了较可靠的制备与检测基因表达谱芯片的方法，并筛选出45个差异表达基因片段，结论：制备的人胎盘基因表达谱芯片可有效地应用于基因的差异表达分析。     

结肠黑变病相关基因的cDNA芯片筛查分析

目的 应用基因芯片技术研究结肠黑变病(MC)和正常成人结肠组织基因的差异表达. 方法 分别用Cy5和Cy3两种不同的荧光染料通过逆转录反应将MC组和对照组结肠组织的mRNA分别标记成探针,并与载有一组靶基因的基因表达谱芯片进行杂交.通过扫描荧光强度,计算机软件分析,寻找两组差异表达基因. 结果 MC组和正常对照组之间共筛选出93条差异表达基因,其中表达增加的基因有53条(2.0倍以上),表达降低的基因有40条(0.5倍以下). 结论 基因表达谱芯片筛选MC与正常成人结肠组织差异表达基因具有样品用量少、高速度、高敏感、高通量等特性.通过筛选所得差异基因提示MC的发病可能涉及细胞增殖、酯类代谢、能量代谢、细胞毒等多种因素,为进一步阐明MC的发病机制提供了新线索.     

毛脉酸模中二苯乙烯类成分对HepG2细胞肿瘤相关基因表达的影响

目的:探讨毛脉酸模提取物二苯乙烯类成分与肝癌发生、发展的关系及其作用机制.方法:用二苯乙烯类成分处理人肝癌细胞株HepG2 48 h后,提取药物处理组和对照组细胞的总RNA,将两组RNA纯化为mRNA,逆转录成cDNA,用Cy3和cy5两种不同的荧光染料进行线性扩增标记,然后与人肿瘤相关基因表达谱芯片杂交,扫描后埘获得的数据用LuxScan 3.0软件分析.结果:经二苯乙烯类成分诱导后HepG2细胞的2474个肿瘤相关基闪中,有GADD153,HPRG等5个基因表达明显上调,PRL-1,PAI-1等9个基因明显下调.结论:二苯乙烯类成分能改变细胞周期进程、细胞增殖、细胞凋亡、血管生成等相关基凶的表达,此可能是其抗肿瘤作用的机制.     

应用基因芯片技术对2型糖尿病胰岛素抵抗脂肪信号转导相关基因的研究

目的 应用基因芯片技术比较2型糖尿病胰岛素抵抗(IR)患者与正常人大网膜脂肪组织信号转导相关基因表达谱的差异,以进一步阐明IR的发病机制并探索新的治疗方法。方法 分别以Cy5和Cy3两种荧光染料通过逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)将IR组和对照组脂肪组织的mRNA标记成探针,并与载有1组靶基因的基因表达谱芯片进行杂交。通过扫描荧光强度,经计算机软件分析,寻找两组差异表达基因。结果 IR组和对照组之间共筛选出82条差异表达基因。其中信号转导相关差异表达基因19条,表达增加的基因12条,表达降低的基因7条。RT-PCR验证,IR组MKP-4表达明显升高。结论 基因表达谱芯片筛选提示IR的发病涉及多个方面,并与受体信号转导密切相关,为阐明IR的信号转导机制提供强有力的工具。     

Gene expression profile differences in high and low metastatic human ovarian c ancer cell lines by gene chip

目的：用基因芯片技术研究高低转移人卵巢癌细胞系（HO-8910PM和HO-8910）基因表达谱差异,筛选与转移相关的基因。方法：按一步法分别抽提高低转移人卵巢癌细胞和对照正常卵巢组织的总RNA并纯化mRNA;分别将等量的高低转移人卵巢癌细胞及对照组织的mRNA逆转录合成以Cy5和Cy3标记的cDNA一链做探针,分别混合后在2张含有4096条双点人类全长基因的芯片上进行杂交。经洗片后用ScanArray3000扫描仪扫描芯片荧光信号图像,用ImaGene3.0软件对扫描图像进行数字化处理,计算机分析高低转移人卵巢癌细胞系之间及与正常卵巢上皮基因表达谱差异。结果：人卵巢癌细胞系HO-8910细胞与正常卵巢上皮比较差异3倍以上共有355个基因。高转移人卵巢癌细胞系HO-8910PM细胞与正常卵巢上皮比较差异3倍以上共有323个基因。高转移人卵巢癌细胞系HO-8910PM与母系HO-8910比较差异2倍以上共有165个基因,其中两株细胞系比较差异3倍以上共有21个基因。结论：两株人卵巢癌细胞系与正常卵巢上皮细胞基因表达谱存在差异,提示这些基因与卵巢癌的发生和发展及高转移特性有关。本实验说明利用基因芯片对基因表达谱的检测可以为人体卵巢癌的基因诊断、治疗和预防提供新的方向。     

曲古霉素A对人子宫内膜癌HEC-1B细胞增殖和凋亡的作用及相关机制

【目的】探讨组蛋白去乙酰化酶抑制剂曲古霉素A(trichostatin A,TSA)对人子宫内膜癌HEC-1B细胞增殖和凋亡的作用及其可能机制。【方法】应用不同浓度的TSA处理子宫内膜癌HEC-1B细胞72 h,Western blotting法检测细胞内组蛋白H4乙酰化水平及p21蛋白,荧光定量PCR方法检测p21基因mRNA表达,MTT法检测细胞增殖,流式细胞术检测细胞凋亡率。【结果】经TSA作用后,人子宫内膜癌HEC-1B细胞内组蛋白H4乙酰化水平增加,p21基因mRNA及蛋白表达增加;同时细胞生长受到抑制,细胞凋亡增加。【结论】TSA通过提高组蛋白乙酰化水平,增加p21基因表达,抑制子宫内膜癌HEC-1B细胞的增殖和诱导细胞凋亡。     

古抑菌素A对肝癌细胞HepG2中抑癌基因FHIT表达的影响

目的：探讨去乙酰化转移酶抑制剂古抑菌素A（trichostatin A,TSA）对人肝癌HepG2细胞生长的作用以及FHIT表达的影响。方法：体外培养人肝癌细胞株HepG2,分为对照组和不同浓度（5、50、250、500、1000nmol/L）TSA组,作用24h和48h后在倒置显微镜下观察细胞形态改变,CCK-8法检测TSA对HepG2细胞增殖的影响,实时荧光定量RT-PCR法检测FHIT基因的表达。结果：倒置显微镜下,经TSA处理的细胞增殖速度显著减慢,出现凋亡早期改变,与对照组相比,TSA可明显抑制HepG2的增殖,且呈时效和剂量依赖关系（P〈0.01）,荧光定量PCR结果显示TSA可以使FHIT表达上调（P〈0.01）。结论：TSA对肝癌HepG2细胞体外生长有明显抑制作用,可能与促进FHIT表达有一定关系。     

曲古抑菌素A诱导MOLT-4细胞凋亡的机制

目的 通过研究曲古抑菌素A（trichostatinA，TSA）作用前后MOLT-4细胞基因表达谱的差异，初步探讨TSA诱导细胞周期阻滞和凋亡的机制。方法 TSA以不同浓度和不同作用时间作用MOLT-4细胞，通过流式细胞仪检测其凋亡率的变化。提取细胞RNA，应用基因芯片方法分析TSA作用前后的基因表达变化，RT-PCR验证芯片结果的可靠性。结果 MOLT-4细胞对TSA非常敏感，纳摩尔级水平即可诱导显著的细胞凋亡，而且这种凋亡与TSA作用浓度及时间呈现明显的线性关系。基因芯片结果显示，200nmol／LTSA作用MOLT-424h后共有952个基因发生不同程度的变化，其中上调的有477种，下调的有475种，部分结果经RT-PCR证实。结论 TSA诱导肿瘤细胞周期阻滞和凋亡是一个多基因参与的复杂过程。     

同化疗药物刺激对HEPG2增殖蛋白表达的影响

目的探讨3种常用化疗药物连续刺激对人肝癌细胞株HEPG2增殖蛋白表达的影响。方法HEPG2细胞株经阿霉素（ADM）、氟尿嘧啶（5-FU）、顺铂（DDP）、联合化疗刺激。应用流式细胞术分别检测增殖相关蛋白erbB-2和c-myc的阳性细胞数及平均荧光强度，以此推算出不同药物连续作用细胞株后以上增殖蛋白总表达量。结果HEPG2细胞株正常培养过程中，各蛋白表达本身存在极大不确定性；各化疗药物组以及联合化疗药物纽连续刺激细胞株6个周期，erbB-2和c-myc蛋白表达总量变化无明显规律。将各组不同周期表达的增殖蛋白总量进行相关性分析，未发现组间相关有统计学意义（P〉0.05）。结论不同药物作用下肝癌细胞增殖蛋白表达完全不同，提示临床进行个体化精确化疗的必要性。     

C-myc siRNA抑制大鼠自体移植静脉再狭窄的研究

目的静脉移植术后c-myc基因持续高表达是导致血管内膜增生进而再狭窄的原因之一。文中探讨通过局部给药方法给予针对c-myc基因的小分子干扰RNA(siRNA)对自体移植静脉内膜增生的影响。方法建立SD大鼠自体颈外静脉-颈总动脉移植模型。32只大鼠按移植静脉外膜局部给药不同处理方式方法分为未处理组(No treatment组)、凝胶组(Gel组)、无义序列组(scramble sequence group,SCR组)、c-myc RNA干扰组(C-myc siRNA组),于术后3周处死大鼠取移植静脉,光学显微镜下测量内膜厚度,免疫组化染色检测移植静脉增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)、c-myc蛋白的表达,Q-RT-PCR检测移植静脉c-myc mRNA的含量。结果 C-myc siRNA组内膜厚度[(15.0±2.2)μm]显著低于No treatment组[(58.3±8.3)μm]、SCR组[(60.5±6.1)μm]和Gel组[(63.5±5.4)μm]。C-myc siRNA组静脉内膜区和中膜区PCNA阳性细胞率显著低于SCR组[分别为(8.4±2.2)%vs(68.5±5.0)%,P<0.05和(15.0±3.1)%vs(55.2±7.5)%,P<0.05],c-myc蛋白阳性细胞率C-myc siRNA组显著低于SCR组[(30.6±2.6)%vs(48.5±3.5)%,P<0.05]。C-myc siRNA组移植静脉中c-myc mRNA的表达相对量显著低于SCR组(0.48±0.05 vs 1.00±0.12,P<0.05)。结论C-myc siRNA能抑制移植静脉中平滑肌细胞的增殖,抑制内膜的增生,减轻移植静脉再狭窄程度。     

Effects of all-trans-retinoic acid on the expression and tyrosine phosphorylation of gap junction connexin 43 in HeLa cell line and its significance

Gapjunctionalintercellularcommunication(GJIC)areperformedbyintercellularhemichannelswhichareformedby6basicproteinsubunitsnamedconnexin(Cx)expressedinneighboringcells［1］.Sixconnexinsformaroundacentralpore,throughwhichadjacentcellscanexchangelow-molecular-weightmoleculesofinformationandenergydirectly.Atleast16membersoftheconnexinsuperanti-oncogenefamilyhavebeenidentified,whicharedividedinto2groupsaccordingtotheiraminoacidsequences.GJICmediatedviagapjunctionsplaysimportantrolesintissuehomeos…     

Co-transfection of MRP and bcl-2 antisense S-oligodeoxynucleotides reduces drug resistance in cisplatin-resistant lung cancer cells

Objective To detect the influence of antisense s-oligodeoxynucleotides](S-ODNs) of bd-2 and multidrug resistamce-associated protein (MRP) genes multidrug resistance-associated protein gene and bcl-2 antisense S-oligodeoxynucleotides on cisplatin-resistant lung adenocarcinoma cell line A(549)(DDP)which overexpresses both bcl-2 and MRP.Methods A(549)(DDP)cells were treated with sense and antisense S-ODN mediated by lipofection. Expression of MRP and bcl-2 mRNA and protein in the treated cells was measured by RT-PCR and flow cytometry (FCM), respectively. Apoptosis was identified by DNA electrophoresis and terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT)-mediated biotin dUTP nick end-labeling(TUNEL). The degree of drug resistance of the treated cells was detected by a cell viability 3’-［4,5-dimethylthiazol-2-yl］-2,5-diphenyl-tefrazolium bromide thiazolylblue (MTT) assay. Results Expression of bcl-2 and MRP significantly decreased in the cells treated with bcl-2 or/and MRP antisense S-ODN for 48h as compared to the cells untreated and sense-treated (P&lt;0.05). Resistance to cisplatin in the cells treated with bcl-2 or/and MRP antisense S-ODN decreased by 60.6% (6.5 times), 56.4% (7.2 times) and 71.0% (4.8 times), respectively, which paralleled the decrease of bcl-2 and MRP expression. Similarly, the resistance to etoposide and epirubicin in antisense-treated cells also reduced in parallel to decreases of the two gene expressions. The drug resistance in sense-treated cells was similar to that in untreated cells. Statistically significant dose-and concentration-dependent increases of apoptotic cells were observed in the groups exposed to 100 μmol/L cisplatin for 48 h after treatment by bcl-2 or/and MRP antisense.Conclusion Bcl-2 and MRP were at least additive and possibly synergistic in conferring drug resistance in a cisplatin-resistant lung adenocarcinoma cell line. Antisense S-ODN could attenuate drug resistance by promoting cells apoptosis, which might lead to a new treatment for patients with non-small cell lung cancers (NSCLCs) who are refractory to conventional chemotherapy.     

邻苯二甲酸二乙基己酯体外对大鼠卵巢颗粒细胞Bax和Bcl-2基因表达的影响

【目的】通过对体外培养的大鼠卵巢颗粒细胞进行邻苯二甲酸二乙基己酯（di-2-ethylhexylphthalate,DEHP）染毒,探讨DEHP体外对大鼠卵巢颗粒细胞Bax和Bcl-2基因表达及细胞凋亡的影响。【方法】体外分离和原代培养未成熟大鼠卵巢颗粒细胞,用不同浓度的DEHP（10、50、nnmol／L）染毒24h。荧光定量PCR法检测Bax和Bcl-2基因mRNA表达水平,Weas[ernblot检测Bax和Bcl-2蛋白表达水平,流式细胞术检测细胞凋亡率。【结果】与对照组比较,大鼠卵巢颗粒细胞Bcl-2基因mRNA和蛋白表达下降（P〈0．05）,Bax基因mRNA和蛋F1表达增加（P〈0．05）,同时细胞凋亡率增加（P〈0．05）,呈浓度依赖关系。【结论】DEHP可通过下调Bcl-2基因表达和上调Bax基因表达而诱导大鼠卵巢颗粒细胞凋亡,进而影响卵巢功能。     

小檗碱对人肝癌Bel-7402细胞增殖和凋亡的影响

目的观察小檗碱对人肝癌Bel-7402细胞增殖抑制及诱导凋亡的作用.方法体外培养人肝癌Bel-7402细胞,台盼兰活细胞计数及集落形成抑制实验观察不同浓度小檗碱对Bel-7402细胞的增殖抑制作用,Hochest33258染色观察凋亡形态学变化,流式细胞仪分析细胞周期及凋亡率.结果小檗碱可显著抑制Bel-7402细胞生长,使集落形成能力明显下降,均呈时间、剂量依赖性.小檗碱处理后72 h,Hochest33258染色可观察到细胞核边集、固缩,有明显凋亡小体形成,流式细胞仪检测出现明显Sub-G1峰.结论小檗碱可以抑制人肝癌Bel-7402细胞增殖,诱导细胞凋亡,小檗碱可能具有治疗人肝细胞癌的潜在应用价值.     

乙胺丁醇处理前后耻垢分枝杆菌mc2155细胞蛋白双向电泳图谱的差异分析

[目的]利用蛋白质组学方法，识别乙胺丁醇处理前后耻垢分枝杆菌mc^2155细胞后差异表达的蛋白质，为进一步探讨乙胺丁醇抑制分枝杆菌生长的作用机制及寻找新的抗结核药物作用靶标奠定基础。[方法]采用载体两性电解质pH梯度双向凝胶电泳技术分离乙胺丁醇处理前后耻垢分枝杆菌mc^2155细胞的总蛋白质，用PDQuest7．3．1图像分析软件比较分析，以识别差异表达的蛋白质。[结果]空白对照组有268个斑点，Ethambutol（EMB）处理组有蛋白斑点195个，在相对分子质量和pI值分布的任一区域，EMB处理组蛋白斑点数均少于空白对照组，其中在EMB处理组中特异表达的蛋白质斑点有23个。[结论]乙胺丁醇处理前后耻垢分枝杆菌mc^2155细胞的蛋白质组具有差异，这种蛋白质组的差异分析有助于进一步研究乙胺丁醇抑制分枝杆菌生长的作用机制并为寻找新的抗结核药物作用靶标奠定基础。