巢式PCR检测外周血血浆和白细胞中人巨细胞病毒核酸

目的比较用巢式PCR检测外周血血浆和白细胞中人巨细胞病毒（HCMV）DNA的阳性率。方法93例外周血标本分离血浆和白细胞，分别提取DNA后进行巢式PCR检测，同时进行荧光定量PCR以及HCMV IgM测定。结果白细胞HCM VDNA检出率为32．3％，明显高于血浆的16．1％（P〈0．017），巢式PCR检测敏感度高于荧光定量PCR（检出率8．6%，P〈0．017）；9例具有系列标本的患者中，用白细胞DNA检测的阳性例数和频度均高于血浆DNA。结论检测HCMV DNA时，以白细胞作为检测材料的阳性率高于血浆，巢式PCR敏感度高于荧光定量PCR。     

巢式聚合酶链式反应检测布鲁氏菌核酸DNA方法的建立

目的建立一种具有灵敏性高,特异性强的巢式聚合酶链式反应(PCR)方法检测血液标本中布鲁氏菌核酸DNA。方法使用细菌基因组提取试剂盒提取纯菌核酸DNA;使用血液等组织基因组核酸DNA提取试剂盒提取血液标本核酸DNA,对提取的核酸DNA先行常规PCR预扩增,以扩增的PCR产物为模板进行荧光定量PCR第二次扩增(即巢式PCR)。对纯菌提取的核酸DNA进行灵敏度和和特异性测试,构建巢式PCR的Ct值与核酸DNA拷贝数之关系曲线;检测临床血液标本核酸DNA,同时比较常规两种PCR方法检测结果。结果常规PCR检测的灵敏度为512个核酸DNA拷贝数;巢氏PCR检测有效范围为921.6 ng/μl^6.8 fg/μl,对应的Ct值为12.04~37.50,其指数关系为:y=(e-0.695x)×1012;R2=0.9986,巢式PCR扩增效率为2.28×109倍,检测限为2个布鲁氏核酸DNA拷贝数。巢式PCR的灵敏度为91.67%,特异度为93.10%,阳性预测值为91.67%,阴性预测值为93.10%。对一起羊养殖场采集的25份血液标本应用巢式PCR方法检测,结果阳性率为92.00%(23/25);27份健康人群血液标本没有检测出(无Ct值)。结论巢式PCR具有较好的灵敏性和特异性,特别适合于血液标本布鲁氏菌核酸DNA的检测。     

荧光定量PCR法检测鼻咽癌患者全血和血浆标本EB病毒DNA的比较研究

目的 研究全血和血浆标本对荧光定量PCR方法检测鼻咽癌患者EB病毒DNA的差异.方法 收集40例鼻咽癌患者的全血和血浆标本,用荧光定量PCR方法检测其EB病毒DNA含量,并对结果进行比较分析.结果 全血和血浆标本的EBV-DNA阳性率(含弱阳性)分别为85.0%和72.5%,差异无统计学意义(χ2=3.20,P>0.05),但不含弱阳性则阳性率分别为62.5%和32.5%,差异有统计学显著性意义(χ2=10.08,P<0.01);全血和血浆标本EB病毒DNA浓度几何平均浓度分别为3.58±1.42和4.72±1.53logcopies/ml,差异有统计学显著性意义(t=10.48,P<0.001);全血和血浆标本EB病毒DNA浓度有一定相关性(r2=0.787),但97.5%的患者全血载量高于血浆载量.结论 荧光定量PCR法检测EB病毒DNA全血标本好于血浆标本,更适合在临床实验室应用.     

荧光定量PCR检测血清巨细胞病毒DNA的临床应用

目的建立一种区分巨细胞病毒(cytomegalovirus,CMV)潜伏性感染与活动性感染并适于临床大量标本CMV DNA检测的常规检测方法。方法利用血清作为待检标本,通过优化实验方案,建立血清CMV DNA的荧光定量PCR(fluorogenic quantitative polymerase chain reaction,FQ-PCR)检测方法;并利用FQ-PCR技术对54例疑似CMV感染的患儿(1个月～15岁,抗CMV IgM阳性或IgM与IgG双阳性)及32例患非感染性疾病的患儿(3个月～14岁,抗CMV IgM检查均阴性,部分患儿抗CMV IgG阳性)血清CMV DNA进行检测。结果54例CMV疑似感染患儿中,CMV DNA检测大于1×10~3拷贝/ml者占40.74%,而32例非感染性疾病患儿中,CMV DNA检测大于1×10~3拷贝/ml者只占18.75%,两者比较有显著性差异(P<0.05)。采用FQ-PCR技术,在LightCycler和Rotor-Gene检测仪上检测具有相同的灵敏度,且具有可比性。结论FQ-PCR定量检测血清CMV DNA的方法能够更灵敏地反映CMV活动性感染,假阴性率低,重复性好,结果可靠。FQ-PCR定量检测血清内CMV DNA的方法可作为临床CMV DNA的检测的常规方法。     

实时荧光定量PCR检测布鲁氏菌核酸DNA的应用评价

目的探讨实时荧光定量PCR检测布鲁氏菌核酸DNA浓度的检测范围和检测健康人全血中核酸DNA的Ct本底值。方法采用试剂盒提取纯菌、健康人和临床患者血液中的核酸DNA,应用实时荧光定量PCR进行检测。结果经检测,40份健康人群血液标本Ct值平均值为37.0,标准差为1.9,Ct值95%置信区间为33.0 ~ 38.8。 将布鲁氏菌核酸DNA标准品倍比稀释（56.2 ng ~ 0.026 5 fg）,实时荧光定量PCR检测灵敏度为6.7 fg。结论实时荧光定量PCR检测纯菌核酸DNA的灵敏度相当于2个基因组DNA拷贝数,但用于检测血液标本尚待进一步研究。     

实时荧光PCR检测结核杆菌DNA的分析灵敏度验证及临床应用

目的以结核杆菌DNA检测为切入点,建立实时荧光PCR定性方法分析灵敏度验证的方法并进行评价。方法取5个低浓度标本分别平行检测16次,计算每个标本的检出率,分别以浓度的对数(以10为底)、Ct值和检出概率作曲线拟合,得到结核杆菌DNA荧光PCR检出率为50%和95%所对应的浓度及Ct值,并据此建立结果报告策略。以巢式PCR和实时荧光PCR同时检测52例临床标本,评价所建立的结果报告策略的适用性。结果结核杆菌DNA检出率为50%和95%所对应的浓度分别为69copy/mL,2.46×10~3 copy/mL。所建立的结果报告策略为结果大于2.46×10~3 copy/mL时报告阳性,结果小于2.46×10~3 copy/mL而大于69copy/mL时进行复查,如果复查为阳则报告阳性,如果复查结果为阴性时报告为阴性,结果小于69copy/mL报告为阴性。52例临床标本经检测后,荧光PCR检出6例阳性,巢式PCR检出4例阳性,计算kappa值经u检验(kappa=0.78,u=3.58,P0.05)表明两种方法报告的结果具有良好的一致性。结论依据检出概率-浓度曲线制定结核杆菌-DNA荧光PCR定性方法结果报告策略具有较好的临床适用性,依据最低检出限制订结果报告策略可应用于基于定量数据的定性PCR。     

巢式聚合酶链式反应检测脑脊液标本中病原体的方法评价

目的探讨巢式聚合酶链式反应(PCR)检测脑脊液标本中病原体的可行性,为疾病的快速临床诊断提供参考。方法源自细菌16S rRNA基因序列设计的巢式PCR技术方法,包括2对引物,2次PCR扩增,第1对引物首次PCR扩增脑脊液标本提取的核酸DNA,第2对引物再次PCR扩增,其DNA模板为第1轮PCR扩增产物。将第2轮PCR扩增产物进行测序,对序列进行比对分析,从而确定感染的病原体。使用DNA微量分光光度测定布鲁氏菌纯菌核酸DNA,将DNA进行倍比稀释,用于巢式PCR敏感性测试。结果巢式PCR能够检测的最低限约为1个核酸DNA拷贝数。应用巢式PCR检测40份临床患者的脑脊液标本,扩增结果表明有37份标本获得约1 460 bp的预期扩增条带(不同细菌扩增片段有差异),测序比对结果显示,检出脑膜炎奈瑟菌7份、产碱假单胞菌1份、草假单胞菌22份、嗜麦芽窄食单胞菌2份、肺炎链球菌1份、未知细菌性病原体4份、未检出3份。结论巢式PCR能够快速检测与鉴定脑脊液标本中的细菌性病原体。     

应用巢式PCR检测HIV感染者血中的肺孢子虫DNA

肺孢子虫病为HIV感染者最常见的肺部并发症。检测肺泡子虫DNA可了解其感染史和解决诊断问题。作者采用一种快速而简单的巢式PCR对84例HIV感染者和35名免疫损伤对照病人血标本进行了检查。结果发现35名免疫损伤的对照病人血中并未查到肺抱子虫DNA，而84例HIV感染者血清中则有16例查到肺抱子虫DNA，故作者认为从HIV感染者的全血中可以检出肺抱子虫的DNA。应用巢式PCR检测HIV感染者血中的肺孢子虫DNA     

实时荧光定量PCR检测HBV DNA的线性范围与最低检出限的验证

目的 试用实时荧光定量PCR定量检测乙型肝炎病毒核酸(HBV DNA),求出其线性范围与最低检出限,从而对本实验室检测HBV DNA的主要性能进行验证。方法 参照相关的文件,通过系列稀释高浓度标本得到超过厂家申明线性范围的系列浓度标本,进行线性范围的验证;通过系列稀释低浓度标本得到超过厂家申明最低检出限的系列浓度标本,进行最低检出限的验证。结果 HBV DNA检测的线性范围为8.58×102~8.41×107 IU/mL,最低检出限为4.07×102 IU/mL。结论 实时荧光定量PCR检测HBV DNA的线性范围与最低检出限达到预期要求,检测方法和验证方案简便、可行。     

肾移植术后受者人巨细胞病毒巢式PCR检测

目的探讨巢式PCR检测肾移植术后受者人巨细胞病毒（HCMV）DNA的方法，并与ELISA法进行比较。方法针对HCMVAD169株IEA基因设计两对巢式PCR引物，对50例肾移植术后受体血、尿标本进行HCMVDNA检测。分离血清作ELISA检测IgG、IgM。结果血液巢式PCR阳性率56％，尿液阳性率46％；ELISA法阳性率：IgG82％，IgM28％，IgG＋IgM28％。两种方法的阳性率进行统计学分析，P〈0．05，存在统计学差异。结论巢式PCR是一种敏感、快速诊断HCMV感染的方法，灵敏度及特异性均高于传统ELISA法，并能弥补ELISA的假阴性。不仅为临床HCMV疾病的诊断与治疗，同时也为选择普遍性预防抑或症状发生前的预先治疗提供可靠的实验室依据。     

三种HBV DNA提取方法对荧光定量PCR检测结果影响的比较

目的 研究3种核酸提取方法对黄疸、溶血和脂血标本HBV DNA荧光定量结果的影响,为进一步提高临床检验质最和改进检测技术提供理论依据.方法 采用目前临床常用的多聚糖病毒沉淀浓缩法(PEG法)、碱液直接裂解和微量核酸释放剂(Micro-Nucleic-Releaser,MNR)等3种核酸提取方法,对含有HBV的黄疸、溶血和脂血标本进行荧光定量PCR检测,研究不同标本对荧光PCR定量结果和扩增效率的影响.选择酚一氯仿提纯法作为核酸提取对照方法.结果 黄疸、溶血和脂血标本,对3种不同核酸提取方法的荧光PCR定量结果和扩增效率都产生不同程度的影响,其中完全溶血的标本对PCR扩增效率的影响最大,如定量值为4×103拷贝/ml的低拷贝完全溶血标本,MNR法测定结果为2.21×103拷贝/ml,PEG法为1.02×103拷贝/ml,碱性直接裂解法的定量值为阴性,临床自然溶血较重的标本对荧光定量检测影响较小,脂血和黄疸标本对荧光定量PCR扩增效率有明显抑制作用,但对实际定最值无明显影响;其中,MNR法在不同标本的定量重复性和荧光PCR扩增效率最好,碱液直接裂解法较差.酚.氯仿提纯法虽然获得较高的扩增效率,但存在大约有1个数量级的核酸丢失.结论 基于MNR核酸提取方法的荧光定量PCR检测,对不同的临床标本均可获得较好的扩增效率、敏感性和重复性,操作简便、快速且无核酸丢失和污染,适合临床检验应用.     

磁珠分离纯化技术在实时荧光定量PCR检测HBV DNA中的应用

目的 评价磁珠分离纯化技术(简称磁珠法)提取核酸的重复性、提取效率一致性、线性范围、灵敏度及抗干扰性,初步探讨其在实时荧光定量PCR检测HBV DNA中的应用价值.方法 采用磁珠法提取HBV DNA log值分别为4.16,5.23和7.04的质控血清进行重复性试验,HBV DNA阳性血清10倍梯度稀释的系列标本评价其提取效率一致性,HBV DNA强阳性血清作10倍系列稀释后检测其线性范围,HBV DNA标准血清与含干扰成分(溶血、黄疸和脂血)的HBV DNA 阴性血清,按4∶0,3∶1,2∶2,1∶3和0∶4比例分别混合成5个不同浓度标本用于干扰试验.以提取方法为沉淀煮沸法的PCR 荧光诊断试剂作对照,应用磁珠法及配套扩增试剂检测288份乙型肝炎患者血清HBV DNA含量,并比较测定结果.结果 磁珠法批内和批间平均变异系数分别为3.66%和4.75%;HBV DNA含量不同的血清提取效率均在98%以上;在1.28×102IU/L～1.28×109IU/L之间有良好的线性关系;最低检出限为60.5 IU/L;不同浓度的黄疸和脂血对扩增曲线和实验结果无明显影响;血清中血红蛋白浓度至50 g/L时,HBV DNA结果相差约0.5～1.0个数量级.磁珠法和沉淀煮沸法的阳性率分别为88.19%和82.64%.当沉淀煮沸法检测结果log值处在2.699～4.000之间时,两法检测相应标本结果差异有统计学意义.结论 磁珠法高效、快速和易于自动化,应用于HBV DNA检测对乙型肝炎患者的临床诊断和疗效监测将有十分重要的意义.     

实时荧光定量 PCR 检测 HBV DNA 的线性范围与最低检出限的验证

目的：试用实时荧光定量 PCR 定量检测乙型肝炎病毒核酸（HBV DNA）,求出其线性范围与最低检出限,从而对本实验室检测 HBV DNA 的主要性能进行验证。方法参照相关的文件,通过系列稀释高浓度标本得到超过厂家申明线性范围的系列浓度标本,进行线性范围的验证;通过系列稀释低浓度标本得到超过厂家申明最低检出限的系列浓度标本,进行最低检出限的验证。结果 HBV DNA 检测的线性范围为8．58＆#215;102～8．41＆#215;107 IU/mL,最低检出限为4．07＆#215;102 IU/mL。结论实时荧光定量 PCR 检测 HBV DNA 的线性范围与最低检出限达到预期要求,检测方法和验证方案简便、可行。     

检测pp65抗原和IgM抗体对移植患者CMV活动性感染监测价值比较

目的　比较血pp6 5抗原和IgM抗体检测对移植患者巨细胞病毒 (CMV)活动性感染的诊断价值。方法　收集 5 8位移植患者的血标本 (共 2 0 8份 ) ,分离血浆和多形核白细胞 ,血浆用于CMVIgM抗体检测 (ELISA) ,白细胞用于pp6 5抗原血症检测(荧光免疫组化 )。同时随机取部分血浆标本进行荧光定量PCR分析 ,检测CMVDNA。结果　pp6 5抗原阳性细胞数与CMVDNA拷贝数呈正相关 (r=0 .87) ,也与病人的临床症状密切相关 ,可用于监测移植患者CMV的活动性感染。IgM抗体与pp6 5抗原阳性的一致率为 2 1.2 % ,对CMV感染的敏感性为 2 2 .3% ,特异性为 95 .6 %。结论　pp6 5抗原阳性细胞数能反映CMV的数量 ,可监测CMV活动性感染 ,检测方法特异、灵敏、操作简单 ,适宜临床实验室应用。血清IgM抗体检测因为敏感性较低 ,不适用于移植患者CMV活动性感染的监测。     

两种分子生物学试剂检测高危型HPV

目的 对杂交捕获2代试验(hc2)与荧光聚合酶链反应(PCR)检测高危型人乳头状瘤病毒(HPV)的9例不相符结果进行验证与比对.方法 用简并引物.巢式PCR检测样本中是否存在HPV DNA;用DNA测序及反向斑点杂交法对标本中的HPV进行分型.结果 通过引物MY09/11和GPS/6进行巢式PCR扩增,9例样本扩增产物电泳后均可见清晰单一的DNA条带.DNA测序证实,在9例样本中HPV高危型3例,低危型5例,另有1例测序结果不清晰者经反向斑点杂交法检测为高危型HPV59与低危型HPV40混合感染.结论 hc2法具备较高的真阴性率,其特异性较好;荧光PCR具较高的真阳性率,其敏感性较高.     

两种巢式PCR检测慢性粒细胞白血病患者骨髓移植后微小残留病的比较

目的　比较 2种巢式聚合酶链反应 (PCR)检测骨髓移植后慢性粒细胞白血病 (CML)患者微小残留病。方法　分别用一步法逆转录 PCR(RT PCR)和两步法RT PCR 2种巢式PCR检测骨髓移植后CML患者BCR ABL融合基因 ,并做 2种方法的灵敏度实验。结果　 2种巢式PCR灵敏度实验中 ,一步法RT PCR和两步法RT PCR的巢式PCR可分别检测出 0 .1和 1pgK5 6 2细胞总RNA中的BCR ABL融合基因 ;同时对 19份来自 12例骨髓移植后CML患者标本检测 ,一步法RT PCR的巢式PCR检测出阳性的最长移植时间为 6 90d ;两步法RT PCR的巢式PCR为 4 15d。结论　一步法RT PCR的巢式PCR检测骨髓移植后CML微小残留病具有较高灵敏度 ,操作简便快速 ,特别适用于临床检测。     

从石蜡包埋的淋巴瘤组织提取DNA并定量检测EB病毒

目的 定量检测石蜡包埋的淋巴瘤组织中EB病毒（EBV）的表达，方法 对TES水浴DNA提取法进行了改良，从石蜡包埋的淋巴瘤组织中提取高质量的基因组DNA，以实时荧光定量PCR方法检测淋巴瘤组织EBV。结果在60例标本中平均提取DNA量为3．97ng（10／μm厚切片2片），86．7％（52／60）标本DNA的纯度（260nm／280nm）≥1．6，其中50％（30／60）淋巴瘤组织EBV呈阳性表达（10^0～10^6拷贝／ngDNA）。结论 采用改良TES水浴法能获取石蜡包埋组织中高质量基因组DNA，使用该新的实验技术可有效地利用现有的标本资源进行与疾病相关科学的研究。     

人类基因组DNA四种不同抽提方法比较

目的探讨四种不同人类基因组DNA抽提方法的最佳方法.方法分别用淋巴细胞分离液、红细胞裂解液处理全血样本,用经典酚醇法、盐析法、碘化钾法、煮沸法提取DNA,比较这些方法所获得的DNA模板对PCR法检测HLA的影响,并进行了标本放置不同时间对DNA抽提结果的影响的实验.结果在所比较的几种方法中,经典酚醇法、盐析法、碘化钾法提取的DNA有较高的纯度和浓度,以其为模扳所进行的PCR结果较好,其中以碘化钾法的操作最为简便可靠.结论常规抽提DNA以碘化钾法最为适用,一月内4.C放置全血标本对人类基因组DNA抽提结果无明显影响.     

肺炎链球菌多重巢式荧光PCR分型方法的建立和应用

目的建立一种敏感且节省标本的多重巢式荧光PCR方法，用于临床标本中肺炎链球菌的分型。方法以检测肺炎链球菌种属（lytA基因）和20组常见血清型的引物和探针为基础，分别采用92株不同血清型的肺炎链球菌菌株和系列稀释的参考DNA模板，建立多重巢式荧光PCR方法。 评价该方法的特异性和敏感性，同时与荧光PCR方法进行比较。 将该方法用于14份肺炎链球菌培养阳性和30份肺炎链球菌培养阴性的临床标本的检测，评价实际应用效果。结果多重巢式荧光PCR与荧光PCR方法能准确鉴定/区分大部分菌株（90/92）的血清型。 前者的检测灵敏度为1～100 fg/μl，9种血清型的灵敏度高于荧光PCR方法（10～100 fg/μl）。 44份临床标本中，多重巢式荧光PCR与荧光PCR方法分别检测出34和31份阳性（P＝0.778），2种方法的DNA模板使用量分别为15 μl和66 μl。结论多重巢式荧光PCR比荧光PCR方法节省标本且更加灵敏。     

侵袭性烟曲霉菌感染早期诊断的实验研究

目的：探讨巢式聚合酶链反应(PCR)方法和曲霉菌半乳甘露聚糖抗原酶联免疫吸附试验(ELISA)检测方法早期诊断侵袭性曲霉菌感染的可行性和临床应用价值。方法：(1)建立侵袭性曲霉菌感染的动物模型，收集不同时期实验动物的血样及各脏器标本，进行巢式PCR方法的检测。(2)对临床确诊或拟诊的侵袭性曲霉菌感染患者的血液标本进行巢式PCR方法的检测；对血清标本进行曲霉菌半乳甘露聚糖抗原nISA方法的检测。结果：(1)动物实验中，巢式PCR和血培养阳性率分别为77．8％和16．7％，两者差异具有显著意义；灵敏度和特异度分别为77．8％和：100％。(2)在临床确诊或拟诊的侵袭性曲霉菌感染患者的检测中巢式PCR方法的灵敏度和特异度分别为100％和83．3％；曲霉菌半乳甘露聚糖抗原ELISA检测的灵敏度和特异度分别为55．6％和88．2％。结论：巢式PCR方法具有良好的灵敏度和特异性，适用于临床早期诊断侵袭性曲霉菌感染。曲霉菌半乳甘露聚糖抗原ELISA检测可用于临床诊断侵袭性曲霉菌菌感染，有望辅助或替代传统方法。