福建省未经抗病毒治疗的HIV-1毒株耐药基因变异研究

目的研究福建省未经抗逆转录病毒治疗的艾滋病病毒感染者伎滋病患者（HIV／AIDS患者）HIV的逆转录酶和蛋白酶耐药基因变异情况，为福建省开展HIV-1抗病毒治疗提供本底资料。方法采集福建省未经抗病毒治疗的HIV／AIDS病例的抗凝全血，分离血浆，用逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）扩增HIV—lpol区序列并直接进行序列测定，提交Web站点http：／／hivdb．stanford．edu进行耐药突变分析。结果选取74份流行病学资料及序列资料完整的样本进入耐药基因分析，结果显示，蛋白酶基因的次要耐药突变广泛存在，以M36I、L63P、193L等多态性突变类型为主，未发现与蛋白酶抑制剂耐药相关的突变。逆转录酶区的耐药突变分布较为分散，发生率为20．27％（15．74）。依据耐药性解释，发现3例样本（4．05％）表现为对部分逆转录酶抑制剂的潜在或低度耐药。结论福建省未用药的HIV感染者中，耐药相关突变尚处于低流行状态，在开展抗病毒治疗后应当定期进行耐药性检测以期获得较好的效果。     

广州市2004-2005年HIV-1感染者亚型分析

目的 了解广州市艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)流行株的亚型及分布情况.方法 从2004-2005年采集的92份HIV-1抗体阳性者抗凝全血中,提取前病毒DNA,经套式聚合酶链反应(Nested-PCR)扩增gag和env区基因并测定序列,与国际标准参考序列比较确定亚型.结果 经系统进化树分析,92份样本中34份为CRF01AE,40份为CRF07BC,7份为CRF08BC,3份为欧美B,6份为泰国B(B'),2份为C.结论 广州市HIV-1流行株以CRF01AE和CRF07BC为主,也存在CRF08BC、B、B'及C亚型.     

广西柳州16～25岁HIV-1感染者中流行毒株亚型及耐药分析北大核心

目的通过对广西壮族自治区柳州市,2011-2013年艾滋病病毒Ⅰ型（HIV-1）新近感染者毒株基因特征的研究,了解当地HIV毒株流行及耐药毒株发生传播的情况。方法采集当年新确证的、16~25岁未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的血浆样本,共176份。提取病毒核糖核酸（RNA）,通过扩增HIV-1 pol区片段,进行测序和耐药基因变异分析。结果 3年共获得pol区序列176条,主要以CRF01_AE为主（86.9%,153/176）;其次也发现了少量CRF07_BC、CRF08_BC和B亚型。共有5例（2.8%,5/176）出现耐药突变,4例为异性性传播,1例为注射吸毒传播,其中1例针对蛋白酶类抑制剂（PI）,3例针对非核苷类抑制剂（NNRTIs）,另有2例针对核苷类抑制剂（NRTIs）发生耐药突变。结论当地主要流行毒株为CRF01_AE,广西柳州HIV-1新近感染者耐药传播目前处于低度传播水平,但仍要进一步加强对新近感染者的耐药监测和病人的治疗管理。     

2018年新报告HIV-1感染者省际传播特征分析

目的 分析省际1 型艾滋病病毒(HIV-1)的传播特征,为实施精准防控进而减少HIV-1在我国的流行提供科学数据.方法 对2018年当年新报告的HIV-1感染者进行抽样调查.收集血样并提取病毒核糖核酸,获得pol区部分片段的序列,构建系统进化树.运用HIV-TRACE构建分子网络并筛选出跨省分子簇.结果 共调查31个省...     

CRF01_AE CRF07_BC和B''''亚型HIV-1 pol基因及耐药特征分析

目的 研究中国部分地区新发现未经抗病毒治疗的艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)感染者的耐药情况,及不同亚型毒株pol基因的多态性对耐药突变产生的影响.方法 选取2005-2006年湖南、云南、四川和新疆4省(自治区,下同)当年确认的部分样本,进行核酸扩增及测序,利用系统进化及重组分析的方法确定亚型;根据美国斯坦福大学HIV-1耐药数据库,分析不同亚型毒株蛋白酶基因和逆转录酶基因的多态性和耐药突变情况;利用荷兰乌得勒支大学Vijver等人使用的一种遗传障碍定量方法,计算并比较不同亚型间耐药突变产生的遗传障碍.结果 共得到84份样本PR基因区(1-99氨基酸)和RT基因区(1-272氨基酸)的序列,亚型分析显示:84份样本中B'亚型13份,01AE重组亚型27份,07BC重组亚型44份,其中18份样本在蛋白酶基因区的第10位和第71位存在次要耐药突变;来自云南省和湖南省的3份样本中,存在逆转录酶抑制剂相关耐药突变,分别是A62V、V179D和G190A.三种亚型在逆转录酶基因区的2个非核苷类抑制剂相关耐药突变位点V106M和V108I的遗传障碍存在差异,有显著的统计学意义(P＜0.001).结论 4个地区未冶疗感染者中耐药发生的水平较低.遗传障碍的比较,CRF01AE、CRF07BC与B'亚型病人经治疗后主要耐药突变的发展模式应基本一致.     

石家庄市2015年新确诊HIV-1感染者流行毒株的亚型分布及原发性耐药分析北大核心CSCD

目的了解河北省石家庄市2015年新确诊1型艾滋病病毒（HIV-1）流行毒株的亚型分布和原发性耐药情况。方法 2015年石家庄市新报告HIV-1感染者433例,共收集到感染者血浆样本335份,经反转录巢式荧光定量聚合酶链反应（RT-PCR）方法扩增,最终获得311份样本的HIV-1 pol基因片段并测序。对获得的核酸序列用Neighbor.Joining Tree方法构建进化树,以Boot strap值〉70%来判定HIV-1的基因亚型。同时将序列提交至美国斯坦福大学HIV耐药数据库进行耐药基因型分析。结果 311例HIV-1感染者以男性（93.9%）、本市户籍（83.0%）、汉族（96.1%）为主。性接触是最主要的感染途径（98.1%）,其中同性性传播占77.5%。311例pol基因序列片段亚型分布显示,CRF01_AE占51.4%（160例）,CRF07_BC为28.6%（89例）,B亚型为13.2%（41例）,未定型CRF01_B为4.2%（13例）,CRF08_BC为1.3%（4例）,CRF55_01B为0.6%（2例）,CRF59_01B为0.3%（1例）,CRF65_cpx为0.3%（1例）和CRF01_AE/B为4.2%（13例）。CRF01_AE、CRF07_BC和B是主要的亚型。HIV-1基因亚型分布在性别之间（χ~2=14.039,P=0.005）、不同的职业类型之间（χ~2=21.716,P=0.041）以及不同的传播途径之间（χ~2=20.971,P=0.028）有统计学差异。311例中,14例感染者具有耐药位点,原发耐药率为4.5%,其中蛋白酶抑制剂和核苷类反转录酶抑制剂耐药相关突变率均为1.6%（各5例）,非核苷类反转录酶抑制剂耐药相关突变率为1.3%（4例）。结论石家庄市新报告的HIV-1感染者中,传播途径以同性性接触为主,病毒基因亚型以CRF01_AE为主,但具有多样化特点。原发耐药率为4.5%,处于低水平状态。     

2018年广西崇左边境ART人群HIV-1分子网络特征分析

目的 构建广西边境崇左市四个边境县接受ART的HIV/AIDS患者的本底分子网络并识别重点人群,为当地防控艾滋病进行重点干预提供依据.方法 纳入2018年1-9月在广西崇左市大新县、宁明县、凭祥市、龙州县四个地区进行常规CD4细胞检测的在治HIV/AIDS患者作为研究对象,并收集研究对象基本信息,使用HIV-TRACE...     

甘肃省HIV-1毒株基因序列测定和亚型分析

目的对甘肃省流行的艾滋病病毒（HIV）开展分子流行病学调查.方法用套式聚合酶链反应对23份甘肃省HIV-1感染者外周血淋巴细胞中前病毒脱氧核糖核酸（DNA）的膜蛋白基因进行扩增,并对C2-V3及其邻区300个核苷酸序列进行测定和分析.结果甘肃省流行的HIV-1分属B＇亚型（6例）、C亚型（1例）、CRF-BC亚型（16例）.其中CRF-BC亚型（70%）为主要流行毒株.结论甘肃省HIV-1流行亚型以重组毒株CRF-BC为主,在吸毒人群中广为流行;加强对高危人群监控,是遏制艾滋病在甘肃省蔓延的重中之重.     

浙江省2003-2005年HIV-1感染者分子流行病学研究

目的掌握浙江省2003-2005年新发现感染者艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)毒株基因亚型分布和变异情况。方法对2003-2005年浙江省境内检测新发现的HIV-1感染者进行一般流行病学调查并采集血样,提取前病毒DNA,使用套式聚合酶链反应对gag基因区进行扩增并测定其序列。结果采集143份血样,112份扩增阳性,检出CRF01-AE亚型43例,CRF07-BC 37例,CRF08-BC 11例,B亚型20例,CRF02-AG 1例。CRF01-AE分布在11个市中的9个市,主要存在于异性性途径感染者中(53.5%),并已成为外省籍注射吸毒感染者的主要构成(44.8%)。CRF01-AE和CRF07-BC的亚型组内平均离散率在静脉吸毒感染者和性传播感染者中比较,差异有统计学意义。结论浙江省2003-2005年新检出感染者HIV-1毒株呈现多重组型别特征,CRF01-AE成为分布最广的类别,呈现扩大流行的趋势。HIV-1在性乱人群之间的传播要比在注射吸毒人群复杂,变异更大。     

辽宁省2004-2011年抗病毒治疗人群HIV-1亚型分布及耐药分析

高效抗反转录病毒治疗（High-active antiretro-viral therapy,HAART）艾滋病的效果受多种因素的影响,其中艾滋病病毒（Human immunodeficiencyvirus,HIV）的耐药性是导致HAART失败的主要原因之一。辽宁省自2008年开展HIV病毒载量和基因型耐药检测以来,截至2011年底,累计对389例治疗年以上的病人进行了病毒载量检测,     

MSM人群急性HIV-1感染者病毒亚型分析

目的研究2007-2009年男男性行为人群（MSM）艾滋病病毒-1型（HIV-1）的基因亚型,以监测MSM人群HIV病毒株的最新流行情况。方法采集95例MSM急性HIV-1感染者的外周全血,从外周全血浓缩白细胞中提取脱氧核糖核酸（DNA）,用巢式聚合酶链反应（Nested-PCR）对HIV-1的前病毒DNA进行扩增,然后检测并分析PCR扩增产物的核苷酸序列,确定病毒的基因亚型。结果 95例感染者平均年龄为（35.02±9.15）岁,其中20～50岁的青壮年45例（94.74%）,未婚51例（53.68%）,大专或大学及以上文化程度者30例（占31.58%）。感染者中共发现CRF01_AE亚型、B亚型、BC重组亚型（包括CRF07_BC和CRF08_BC）及C亚型4种亚型。其中CRF01_AE重组亚型56例（占58.95%）,B亚型28例（占29.47%）,BC重组亚型10例（占10.53%）,C亚型1例（1.05%）。结论 MSM人群急性HIV-1感染者年轻化,文化程度普遍偏低。小样本流行病学调查显示,急性HIV-1感染者中有CRF01_AE亚型、B亚型、BC重组亚型及C亚型4种亚型病毒株流行,CRF01_AE亚型为MSM人群的主要亚型。     

河北省不同途径感染人群HIV-1基因亚型分析

目的了解河北省不同途径感染人群艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)亚型分布特点。方法从感染者的血浆样品中提取病毒RNA,反转录后采用套式聚合酶链反应(Nested PCR)扩增HIV-1 gag和env基因的部分片段,对PCR产物直接进行核苷酸序列测定,所获序列与各亚型国际参考株序列比对,进行系统进化树分析,确定基因型。结果对154份HIV-1感染者的样品进行扩增,得到了146份样品的HIV-1基因片段。发现6种HIV-1亚型和重组型,其中B’亚型61例(41.8%),CRF01_AE 59例(40.4%),CRF07_BC 16例(11.0%),CRF08_BC 6例(4.1%),C亚型和B01重组株各2例(1.4%)。血液途径传播为B’亚型,男男性行为传播以CRF01_AE和B’亚型为主。结论河北省不同途径感染人群HIV-1亚型分布具有明显的人群特征。血液途径传播者为单一B’亚型,性传播人群中亚型分布较广。     

2008-2010年深圳市HIV-1耐药警戒线调查及耐药趋势分析

目的根据世界卫生组织(WHO)推荐的Ⅰ型艾滋病病毒(HIV-1)耐药警戒线调查方案,调查分析深圳HIV感染者的病毒株耐药突变情况,并分析耐药株传播水平的3年发展趋势。方法通过连续3年系列横断面调查,于2008年至2010年,每年采集<25岁未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者血浆样本,提取病毒RNA,采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增HIV-1 pol区片断,进行序列测定和耐药基因变异分析。结果 2008年检测耐药传播率为0(0/45),2009年检测耐药传播率上升至6.1%(3/49),其中1份对核苷类反转录酶抑制剂耐药(T215S),2份对蛋白酶抑制剂出现耐药(M46L);2010年检测耐药传播率为4.0%(2/50),其中1份对核苷类反转录酶抑制剂耐药(T215S),1份对蛋白酶抑制剂出现耐药(M46I)。所有耐药株均来自经性传播人群,其中,蛋白酶抑制剂耐药株全部来自男男性行为人群。核苷类反转录酶抑制剂耐药株全部属于重组亚型CRF07_BC,而蛋白酶抑制剂耐药毒株全部属于CRF01_AE。结论深圳地区HIV-1耐药已经进入或即将进入中度传播水平,应该为深圳地区发现的HIV感染者提供耐药检测,尤其是针对性传播人群。     

重庆市HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析

目的对重庆市流行的艾滋病（AIDS）病毒1型（HIV-1）进行分子流行病学调查,为艾滋病预防控制策略的制定提供依据.方法用套式聚合酶链反应（nested-PCR）对31份重庆市HIV-1抗体阳性者外周血单个核细胞（PBMC）中前病毒DNA的膜蛋白基因的C2-V3区,及其邻区300个核苷酸序列进行测定和分析.结果31份标本中有21份扩增阳性并得到相应序列,扩增率为67.6%.经过基因离散率计算和系统树分析后证实：1份标本为CRF01-AE流行重组毒株,20份标本为HIV-1 BC重组毒株.结论目前重庆市HIV-1 BC重组病毒为优势流行株,为有效控制HIV流行,需要重点在吸毒人群中开展行为干预措施.     

九江市HIV-1流行毒株基因序列测定和亚型分析

目的了解九江市艾滋病病毒1型(HIV-1)流行毒株的亚型分布情况。方法对采集的6份九江市HIV-1感染者的血浆样品进行RT-PCR扩增,获得gag基因的核酸片断进行核苷酸序列分析。结果在6份样品中发现B’亚型HIV-1毒株4株,B亚型和A/E重组亚型HIV-1毒株各1株。结论HIV-1流行毒株亚型在九江市分布情况复杂,防控形势严峻。     

福建省HIV-毒株耐药基因变异分析

目的了解福建省I型艾滋病病毒（HIV-1）的耐药基因变异情况。方法选取2005-2012年福建省抗病毒治疗1年以上、病毒载量高于1000拷贝／mL的HIV感染者／艾滋病病人标本,进行基因型耐药性检测。同时收集前期研究中的耐药性检测数据进行对比分析。结果共检测73例病毒学治疗失败病人标本,其中60例（82.19％）成功扩增序列,结合125份未接受抗病毒治疗者的样本,共获得185份样本进行耐药分析。未治疗组和治疗组对蛋白酶抑制剂（PI）的耐药发生率均较低,分别为1.60％（2／125）和8.33％（5／60）;未治疗组对反转录酶抑制剂（RTI）的耐药发生率为4.80％（6／125）;治疗组对RTI耐药发生率较高,为61.67％（37／60）,尤其是对NVP、EFV、3TC和FTC。最常见的耐药突变有M184V、D67N、K70R、K219Q、T215F、G190A、Y181C和K103N。结论福建省HIV-1感染者的总体原发性耐药突变率较低,病毒学治疗失败病人对PI耐药发生率仍处于低水平,但对RTI耐药发生率较高。     

2018年至2019年浙江省绍兴市新确证人类免疫缺陷病毒1型感染者的分子传播网络特征分析

目的:分析浙江省绍兴市新确证人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)感染者传播关系的分子网络特征,为疫情流行趋势和防治提供依据。方法:纳入2018年8月至2019年12月绍兴市新确证未经抗病毒治疗的423份HIV-1感染/艾滋病病例血液样本,获得375份...     

安徽省阜阳市新报告HIV感染者耐药及分子传播网络研究

目的 分析安徽省阜阳市2020-2021年新报告HIV感染者主要亚型毒株的分子流行特征及传播网络情况,为当地制订有效的干预措施提供依据。方法 2020年1月至2021年12月共收集阜阳市新报告感染HIV-1血液样本589份,扩增pol基因和测序,运用美国斯坦福大学耐药数据库进行耐药突变分析,构建系统进化树,提取传播网络并分析其特征,对研究对象进入网络的相关因素进行分析。结果 成功扩增获得589名HIV感染者的pol区基因序列,主要的亚型为CRF07＿BC(34.8%),B(30.4%)和CRF01＿AE(22.4%),新报告感染者总体耐药率为8.6%。三个主要亚型分别以0.5%作为基因距离阈值构建了分子传播网络,入网率分别为B(41.3%)、CRF07＿BC(34.6%)和CRF01＿AE(20.5%)。对进入网络的影响因素进行分析,多因素Logistic回归结果显示,年龄>50岁（与<30岁相比,a OR=2.419,95%CI:1.189～4.921）、CRF07＿BC（与CRF01＿AE相比,a OR=1.875,95%CI:1.085～3.242）、B亚型（与CRF...     

德宏州ART后HIV低病毒血症毒株基因亚型和耐药分析

目的 探究接受抗病毒治疗的HIV/AIDS低病毒血症患者耐药情况和影响因素,基因亚型与耐药位点突变情况。方法 纳入病毒载量50-999copies/mL的HIV/AIDS患者,巢式PCR扩增HIV-1的pol基因后进行耐药检测,根据世界卫生组织耐药标准和斯坦福大学耐药数据库判定耐药、确定突变位点以及毒株对ART药物的敏感性,Logistic回归分析耐药影响因素。结果 896例低病毒血症患者中65.6%(588例)pol基因扩增成功。总耐药率为24.7%(145/588),NNRITs耐药率最高,为21.3%(125/588),部分患者存在多重耐药。588例HIV/AIDS低病毒血症患者中HIV-1毒株BC重组亚型占25.2%(148人),B亚型占24.5%(144人),C亚型占23.5%(138人),CRF 01＿AE亚型占14.3%(84人)。Logistic回归分析发现,耐药与HIV-1病毒亚型有关。B亚型耐药率最高,为43.1%(62/144),CRFs、C亚型、URFs耐药率分别为22.7%(32/141)、18.8%(26/138)、15.2%(25/165)。所有亚型中K1...     

重庆市472名MSM中新发现HIV-1感染者分子传播网络特征

目的 分析2019-2021年重庆市MSM新发现472例HIV-1感染者分子网络特征,为精准干预相关人群中HIV-1传播提供实验室依据。方法 收集重庆市疾病预防控制中心性病门诊2019-2021年新报告的MSM感染者血浆样本,扩增pol区基因并测序,构建该人群HIV-1传播分子网络,采用χ2检验进行成簇相关因素分析。结果从580例感染者中,共获得pol区基因序列472条。472例感染者分别属于9种基因亚型,主要亚型为CRF07＿BC(344,72.88%)和CRF01＿AE(96,20.34%),其他亚型包括CRF55＿01B(18,3.81%)、B(4,0.85%)、CRF08＿BC(6,1.27%)等。在基因距离0.8%时,共产生32个分子簇,入网率27.33%(129/472),以CRF07＿BC入网最高,占82.95%(107/129)。结论MSM中新报告HIV-1感染者病毒基因呈现多样性,并存在传播活跃者。应对传播活跃者实施精准干预,以降低该人群的新发感染率。