维吾尔族人群抗原处理相关转运体（TAP）基因多态性及与类风湿...

目的：探讨新疆维吾尔族人群抗原处理相关转运体（ＴＡＰ）基因多态性及与类风湿关节炎（ＲＡ）的相关性。方法：采用ＰＣＲ－ＡＲＭＳ，－ＲＦＬＰ，－ＳＳＯＰ检测ＲＡ患者３９例及健康献血者４１例ＴＡＰ１－３３３和６３７位，ＴＡＰ２－３７９、５６５、６５１、６６５、６８７等位氨基酸等位基因多态性。结果：健康维吾尔族人群ＴＡＰ１－３３３位和６３７位等位基因基因型分别以Ｉ和Ｄ为主，表现型以Ｉ和Ｄ为主，表现型主要为     

云南人群中PTPN22和PADI4基因多态性与类风湿关节炎的关联研究

目的 探讨云南人群PTPN22和PADI4基因的7个SNP多态与类风湿关节炎易感性的相关性.方法 选取192例类风湿关节炎患者和288名正常人进行病例对照研究.分别用PCR-RFLP法检测PTPN22基因的rs33996649和1858位点、PADI4基因的rs11203366和rs874881位点,用焦磷酸测序法检测PADI4基因的rs1635579、rs2428736和rs2240340共7个SNP位点的基因型.结果 在7个SNP位点中,PADI4基因的rs2240340位点的等位基因频率和基因型频率在病例组和对照组间差异有统计学意义(P＜0.05).结论 在云南人群中PADI4基因的rs2240340多态性与类风湿关节炎的易感性存在相关性.     

类风湿关节炎易感基因多态性研究进展

类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种常见于中青年人群的自身免疫性疾病。有研究报道,该病发病呈逐年升高态势,并且会给患者、家庭与社会带来严重后果,因而对RA的早期诊断、治疗和预防十分重要。目前研究虽然对该病发病机制暂不是十分明了,但随着分子技术的发展以及对该病研究的逐渐深入,对其发病有了更加深入的了解。近年来诸多资料表明,某些基因多态性位点很可能增加了RA的易感性,且与疾病的病理生理进展及预后判断具有显著相关性。因此了解RA与相关基因多态性的关系,将会对该病发生机制有更深入的理解,并为今后临床治疗RA提供根据。本文总结了目前有关RA易感性与相关基因多态性的研究进展,并作如下综述。     

维吾尔族人群抗原处理相关转运体(TAP)基因多态性及与类风湿关节炎的相关性

目的：探讨新疆维吾尔族人群抗原处理相关转运体（ＴＡＰ）基因多态性及与类风湿关节炎（ＲＡ）的相关性。方法：采用ＰＣＲＡＲＭＳ,ＲＦＬＰ,ＳＳＯＰ检测ＲＡ患者３９例及健康献血者４１例ＴＡＰ１３３３和６３７位,ＴＡＰ２３７９、５６５、６５１、６６５、６８７等位氨基酸等位基因多态性。结果：健康维吾尔族人群ＴＡＰ１３３３位和６３７位等位基因基因型分别以Ｉ和Ｄ为主,表现型主要为Ｉ和ＤＤ,有１Ａ～１Ｄ４个亚型,以１Ａ和１Ｂ为主;ＴＡＰ２３７９、５６５、６５１、６６５、６８７等位基因型分别以ＶＡＲＴＱ为主,表现型以ＶＶＡＴＲＲＴＴＱＱ为主,有２Ａ～２Ｈ共８个亚型,以２Ａ和２Ｂ为主。ＲＡ患者ＴＡＰ２３７９Ｉ,５６５Ｔ和６８７Ｓ频率,５６５ＴＴ,６８７ＳＳ及ＴＡＰ１Ｂ频率显著升高,并且ＴＡＰ１Ｂ可使ＤＲ４阳性者患ＲＡ的相对危险性增加５．３３倍。结论：维吾尔族健康人群及ＲＡ患者ＴＡＰ基因多态性有不同于其他民族人群的基本特点。ＴＡＰ１Ｂ可使ＤＲ４阳性者患ＲＡ的相对危险性增加,并可能是维吾尔患者ＲＡ的易感基因。     

云南汉族人群HLA-B基因多态性与类风湿性关节炎的相关性研究

目的 探讨HLA-B基因多态性与类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的关联性.方法 采用DNA测序和序列特异性引物聚合酶链式反应(polymerase chain reaction-sequencespecific primer,PCR-SSP)方法检测云南汉族中271例类风湿性关节炎患者和264例正常人群的HLA-B基因多态性并进行关联性分析.结果 女性类风湿性关节炎患者的HLA-B*40基因频率(8.84％)明显低于女性对照组(18.33％)(P=0.000),HLA-B*51基因频率(9.53％)明显高于对照组(2.83％)(P=0.000),HLA-B*48基因频率(0.23％)明显低于对照组(2.33％)(P=0.007),差异均有统计学意义.HLA-B*40、HLA-B*51、HLA-B* 48的基因频率在男性类风湿性关节炎患者和男性对照中的分布无统计学差异(P值分别为0.535、0.691、0.289).结论 云南汉族人群中HLA-B基因分布存在多态性.HLA-B基因多态性与云南汉族人群女性类风湿性关节炎的发病相关,HLA-B*51可能是易感基因,HLA-B*40、HLA-B* 48可能是保护性等位基因.     

湖北汉族人群Tim-3基因多态性与类风湿关节炎的相关性研究

类风湿关节炎（rheumatoid arthritis，RA）是一种以关节滑膜炎症为特征的慢性全身自身免疫性疾病，环境因素和遗传因素在疾病的发生和发展过程中共同起作用，而遗传因素显得尤为重要。易感基因的研究有助于阐明RA的发病机制，有助于RA的诊断、治疗。多项研究表明T细胞免疫球蛋白域黏蛋白域蛋白基因-3（Tim-3）在自身免疫性疾病的发生及发展中起到了重要作用。     

PADI4单核苷酸多态性与中国河北汉族人群类风湿关节炎的相关性研究

肽酰基精氨酸脱亚胺酶4(Peptidylarginine deiminase 4,PADI4)是一种能够催化抗原性蛋白多肽脱去亚胺基形成瓜氨酸的酶,有研究发现这一被称为"瓜氨酸化"的过程可能与类风湿关节炎(Rheumatoid arthritis,RA)发病有关[1,2],目前尚无我国人群PADI4基因多态性的相关报道.     

广东汉族类风湿关节炎某些易感基因研究

为了探讨类风湿关节炎（ＲＡ）的遗传易感基因，用多聚酶链反应－聚丙烯酰胺凝胶电泳（ＰＣＲ－ＰＡＧＥ）和银染色作ＨＬＡ－ＤＱＡ１基因分型，对１０６例健康人和５０例ＲＡ患者进行检测。结果显示：广东汉族共检出６种ＤＱＡ１等位基因，ＲＡ患者组ＤＱＡ１＊０１０１等位基因显著增高（ＲＲ＝２．３３４、Ｐ＜０．００５、ＥＦ＝０．１５４）；ＤＱＡ１＊０１０２明显减少（ＲＲ＝０．０６８、Ｐ＜０．０１、ＰＦ＝０．５７７）；对ＲＡ组中的３１例ＤＲ４阳性患者的ＤＱＡ１基因分析显示，ＤＲ４与ＤＱＡ１＊０３０１连锁的频率显著高于健康人组（Ｐ＜０．００５）。提示ＤＱＡ１＊０１０１对ＲＡ有易感作用，而ＤＱＡ１＊０１０２有遗传抵抗作用；ＤＱＡ１和ＤＲ４基因型检测可能为预测ＲＡ易感者和估计预后提供理论依据。     

几种基因的单核苷酸多态性与类风湿关节炎

单核苷酸多态性(SNPs)是新一代的基因分子标记,随着人类基因组图谱的绘制成功,SNPs被应用于寻找各种致病基因。类风湿关节炎(RA)是一种全身自身免疫性疾病,到目前为止,其发病机制尚未完全清楚。本文简要介绍了SNPs及几种基因的SNPs与RA的关系。     

上海人群中TAP、LMP和HLA-DM基因多态性研究

调查上海人群中抗原处理相关基因TAP、LMP和HLA-DM的分布情况,并探索这些基因与自身免疫病类风湿关节炎(RA)、IgA肾炎(IgAN)和多发性硬化症(MS)的可能关联。应用PCR-SSO或PCR-RFLP技术对80名无血缘关系的上海地区正常人及156名RA患者、60名IgAN患者和21名MS患者作了TAP1、TAP2、LMP2、HLA-DMA和HLA-DMB基因分型。并作了两位点连锁不平衡分析。在该群体中,(1)共观察到4个TAP1、6个TAP2、2个LMP2、4个HLA-DMA和4个HLA-DMB等位基因;(2)在TAP1B-TAP2A、TAP1B-LMP2H和TAP2D-DMA*0101存在连锁不平衡(Pc<0.05);(3)本人群中IgAN和MS的遗传易感性与抗原处理相关基因无关,而RA患者中DMB*0101基因频率降低(P<0.01),TAP1C和DMB*0104等位基因频率显著升高(P<0.01)。比较分析表明,上海人群中抗原处理相关基因多态性与国外其他人种中的报道相似,本人群中IgAN和MS与抗原处理相关基因不关联,而TAP1C和DMB*0104等位基因可能是RA的遗传易感基因。     

骨保护素基因单核苷酸多态性与类风湿关节炎发病的相关性研究

 目的：探讨骨保护素（OPG）基因163A/G及245T/G单核苷酸多态性（SNPs）与我国汉族人群类风湿关节炎（RA）发病的相关性。方法：采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）技术检测我国南方汉族正常人群及RA患者的OPG 163A/G 和245T/G 2个SNP位点;进行Hardy-Weinberg平衡检验;计算基因型和等位基因频率,及这2个位点的连锁关系,并分析这2个SNP位点与RA的关系。结果：所研究基因分布符合Hardy-Weinberg平衡,163A/G 位点基因型AA、AG、GG分布频率在2组比较有显著差异（P<0.05）;等位基因A、G分布比较在2组有显著差异（P<0.05）,携带163GG基因型者发生RA的危险性是非携带者的1.219倍（OR=1219, 95％CI：1066~2.339, P<0.05)。但245T/G位点各基因型及等位基因频率在2组中均未见差异（P>005）。结论：OPG 基因 163A/G SNP可能与我国汉族人群RA发病相关,携带G等位基因可能是发病的危险因素。     

Analysis of TAP1 and TAP2 polymorphism of mother-infant in Chinese patients with pre-eclampsia

To analyze the polymorphism of TAP gene and the shared rates of alleles between mothers and their infants inChinese patients with pre-eclampsia,TAP1 and TAP2 genotyping was performed by the amplification refractorymutation system-polymerase chain reaction(ARMS-PCR)in 42 patients,106 normal pregnant women,and theirneonates.The allelic frequency of TAP and the alleles shared in maternal-fetus were compared and analyzed in thetwo groups.Our results showed that,with totally eight alleles of TAP1 and TAP2 examined in the samples,nosignificant difference was found in allelic frequencies between pre-eclampsia group and control group,as well asbetween mothers and their neonates.Similar finding was obtained in the comparison with shared alleles.Inconclusion,our results do not support a role for the polymorphisms of TAP in the etiology of pre-eclampsia.Cellular & Molecular Immunology.2005;2(2):141-144.     

CSPG2和HSPG2基因单核苷酸多态性与中国汉族人颅内动脉瘤的相关性研究

目的 分析CSPG2和HSPG2基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与中国汉族散发颅内动脉瘤的相关性.方法 采用病例-对照关联研究方法,收集颅内动脉瘤患者537例以及年龄和性别匹配的正常对照1071名的外周血样各5 mL并提取基因DNA.通过聚合酶链式反应扩增目的DNA,用单碱基延伸(SNaPshot)法进行SNP分型.选取文献报道的CSPG2和HSPG2基因的两个标签SNPs位点rs251124和rs3767137,分析其与汉族散发颅内动脉瘤发病的关联性.结果 CSPG2和HSPG2基因的两个标签SNPs位点rs251124和rs3767137的基因型均满足Hardy-Weinberg平衡.CSPG2rs251124的等位基因频率在患者组与对照组之间差异无统计学意义(P=0.22);HSPG2 rs3767137的等位基因频率在两组之间亦差异无统计学意义(P=0.26),但其相应的OR值大于1(OR=1.12;95％CI=0.92～1.37).患者组与对照组rs251124、rs3767137的基因型频率均差异无统计学意义(P=0.46,0.53).结论 未发现CSPG2和HSPG2基因rs251124、rs3767137 SNPs与中国人颅内动脉瘤发病的相关性.     

AQP7和AQP9基因多态性与中国汉族人群2型糖尿病的相关性研究

目的探讨水通道蛋白7(aquaporin 7, AQP7)以及水通道蛋白9(aquaporin 9, AQP9)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)与中国汉族人群患2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus, T2DM)的相关性。方法随机纳入1194例T2DM个体和1274例非糖尿病个体(non-diabetic, NDM)进行对照研究, 采用MassArray质谱基因分型方法对3个SNP位点(AQP7基因rs3758269、AQP9基因rs16939881和rs57139208)进行基因分型。评估以上3个SNP位点与T2DM的相关性;探讨NDM组SNP位点处不同基因型与糖脂代谢指标的关联。结果 AQP7基因rs3758269、AQP9基因rs16939881和rs57139208的等位基因频率及基因型频率在T2DM组和NDM组中的分布无统计学差异(P > 0.05);且分析结果显示不同遗传模式与T2DM无相关性(P > 0.05)。在NDM组中, AQP7基因rs3758269、AQP9基因rs16939881和rs57139208的不同基因型与糖脂代谢指标无相关性(P > 0.05)。结论 AQP7基因rs3758269和AQP9基因rs16939881和rs57139208与中国汉族人群T2DM遗传易感性无关。     

AQP7和AQP9基因多态性与中国汉族人群2型糖尿病的相关性研究CSCD

目的探讨水通道蛋白7(aquaporin 7, AQP7)以及水通道蛋白9(aquaporin 9, AQP9)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)与中国汉族人群患2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus, T2DM)的相关性。方法随机纳入1194例T2DM个体和1274例非糖尿病个体(non-diabetic, NDM)进行对照研究, 采用MassArray质谱基因分型方法对3个SNP位点(AQP7基因rs3758269、AQP9基因rs16939881和rs57139208)进行基因分型。评估以上3个SNP位点与T2DM的相关性;探讨NDM组SNP位点处不同基因型与糖脂代谢指标的关联。结果 AQP7基因rs3758269、AQP9基因rs16939881和rs57139208的等位基因频率及基因型频率在T2DM组和NDM组中的分布无统计学差异(P > 0.05);且分析结果显示不同遗传模式与T2DM无相关性(P > 0.05)。在NDM组中, AQP7基因rs3758269、AQP9基因rs16939881和rs57139208的不同基因型与糖脂代谢指标无相关性(P > 0.05)。结论 AQP7基因rs3758269和AQP9基因rs16939881和rs57139208与中国汉族人群T2DM遗传易感性无关。     

Polymorphism of TAP1 and TAP2 in Japanese patients with rheumatoid arthritis

Contribution of polymorphism of transporter associated with antigen processing 1 and 2 (TAP1 and 2) alleles to pathogenesis of Japanese rheumatoid arthritis (RA) was studied in 92 RA patients by PCR-RFLP. The allele frequency of TAP2A was slightly low (38.0%) and the frequencies of TAP2B and TAP2C were slightly high (39.7% and 17.9%) in RA, but these differences were not significant. These increases and decrease were due to the positive or negative associations with HLA-DRB1*0405. It was very likely that slight differences in TAP2A, TAP2B and TA2C in RA were secondary phenomenon reflecting an increase in HLA-DRB1*0405. The prevalence of TAP2E allele was low (3.3%, P <0.01, P_c=not significant) and not correlated with HLA-DRB1*0405.     

Association of HLA-DQA1 (rs9272219) with susceptibility to rheumatoid arthritis in a Han Chinese population

HLA-DQA1 (rs9272219) has been previously reported that it is a susceptibility locus in rheumatoid arthritis (RA) of UK Caucasian population and North American; however, it has not reported in RA of Chinese population. Our study was to identify whether or not this relationship is reside between rs9272219 and RA in a Han Chinese population. 207 patients with RA and 199 control subjects were recruited. The single nucleotide polymorphism (SNP) of rs9272219 was tested in alleles and genotype frequencies and the data was analyzed by doing the statistic analysis of odds ratio (OR) and 95% confidence interval (CI) from multivariate unconditional logistic regression analyses after pairwise linkage disequilibrium (LD) was estimated. Finally, the Alleles and genotype frequencies distribution of rs9272219 locus among RA patients and control subjects were in accordance with Hardy-Weinberg equilibrium. We found significant association between rs9272219 and RA of Chinese population (OR 0.494, 95% confidence interval [95% CI] 0.354-0.688, P = 0 and OR 2.541, 95% CI 1.695-3.808, P = 0, respectively). In this study, we found that the SNP of rs9272219 in HLA-DQA1 is a potential susceptibility locus in RA of Han Chinese population; the results suggest that HLA-DQA1 may be related to the development of RA.     

云南汉族心肌梗死相关基因的多态性研究

目的 探索凝血因子Ⅶ(coagulation factor Ⅶ,FⅦ)、凝血因子Ⅻ(coagulation factor Ⅻ,FⅫ)、人血纤蛋白原( fibrinogen,FBG)及9p21的基因多态在云南汉族人群中的分布及其与心肌梗死的相关性.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态和焦磷酸测序分型技术对142例心肌梗死患者和192名对照者的FⅦ、FⅫ、FBG、9p21多个位点的基因进行检测分析.结果 R353Q、5′F7、C46T、-148C/T、rs1333049、rs4977574位点的多态性在心肌梗死组与对照组之间差异无统计学意义(P＞0.05),-455G/A的AA基因型、rs1333040的T等位基因和TT基因型、rs10116277的T等位基因和TT基因型、rs2383207的G等位基因和GG基因型频率均显著高于对照组(P＜0.05),而rs1333040的CT和rs10116277的GT基因型频率均显著低于对照组(P＜0.05).结论 FⅦ、FⅫ、FBG基因的-148C/T、9p21的rs1333049位点的多态性与云南汉族心肌梗死无显著关联,FBG基因的-455G/A和9p21的rs1333040、rs10116277、rs2383207位点的多态性可能与云南汉族心肌梗死有一定的相关性.     

海南汉族人群MICB等位基因多态性与类风湿性关节炎相关性研究

目的 研究海南汉族人群MHC I类链相关基因B(MHC class I chain-related gene B,MICB)等位基因多态性与类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的相关性.方法 用世界卫生组织推荐的标准盐析法提取外周静脉血DNA,采用PCR-序列特异性引物(PCR sequence specific primer,PCR-SSP)和PCR产物直接测序分型(PCR-sequence based genotyping,PCR-SBT)方法对样本MICB基因的多态性进行检测分析.结果 RA患者及对照组中共有10种MICB等位基因被检测出,两组中MICB*005:02等位基因频率分布最高,其频率为52.6％比42.0％,但MICB* 002等位基因频率在RA组明显低于对照组(13.1％比25.5％),差异具有统计学意义(Pc＜0.05),MICB* 014等位基因频率在RA组亦明显低于对照组(8.1％比15.3％),差异具有统计学意义(Pc＜0.05).结论 MICB* 002和MICB*014等位基因与RA的易感性之间存在负相关,可能是RA的保护性基因.