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相似文献
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1.
Bai X  Li SY  An P  Yu B  Cai HY 《中华医学杂志》2005,85(30):2128-2131
目的探讨结直肠癌发生和肝转移相关蛋白及其与肝转移的关系。方法采用等电聚焦/SDS聚丙烯酰胺双向凝胶电泳法,对比分析结直肠癌原发灶、癌旁肠黏膜和肝转移灶中蛋白质组表达差异,经质谱分析、鉴定差异蛋白点;采用细胞转染方法,将差异蛋白基因导入到结直肠癌细胞,观察细胞生物学行为改变。结果结直肠癌原发灶、肝转移灶与正常肠黏膜蛋白质组分在PH7.0—9.5范围内有明显差别。分析13个差异蛋白点,其中2个蛋白点在癌原发灶组织中表达下调,5个蛋白点在原发灶组织中表达上调,6个蛋白点在肝转移组织中表达上调。经质谱鉴定,碳酸酐酶Ⅱ(CAⅡ)在癌组织中表达下调,磷酸甘油酸激酶Ⅰ、延胡索酸水合酶、醛缩酶A在原发灶中表达上调。精氨酸酶,谷胱甘肽S-转移酶A3在肝转移灶中表达上调。将碳酸酐酶ⅡcDNA克隆转染HR-8348细胞后,癌细胞侵袭、趋化运动能力及耐药性均明显减弱。结论结直肠癌原发灶和肝转移灶蛋白质组表达有显著差异,碳酸酐酶Ⅱ表达下调和精氨酸酶、谷胱甘肽S-转移酶A3增强表达可使结直肠癌细胞生物学行为发生改变并促进肝转移发生。  相似文献   

2.
目的 利用血清蛋白质组学技术分析结直肠癌患者与正常人血清蛋白质表达谱的差异,寻找结直肠癌相关血清标志物.方法 分别采用pH3~10和pH4~7的IPG干胶条,在优化的实验条件基础之上,利用双向凝胶电泳(2-DE)分离结直肠癌患者和正常人血清蛋白质,硝酸银染色,获取图像后PDQuest软件分析差异表达的血清蛋白质点.结果 采用pH值3~10的胶条分离血清蛋白共有17个,结直肠癌组表达量上调的蛋白质点7个,表达量下调的蛋白质点7个.采用pH值4~7的胶条分离血清蛋白共有13个,结直肠癌组表达量上调的蛋白质点8个,表达量下调的蛋白质点5个.结论 所筛选的差异蛋白质点为进一步结直肠癌相关血清蛋白质的鉴定和其他肿瘤血清蛋白质学研究奠定了良好的基础.  相似文献   

3.
目的应用双向电泳联合质谱技术筛选大肠癌肝转移血清特异性标志物,并利用这些标志物以数据挖掘技术构建人工神经网络大肠癌肝转移诊断模型。方法收集大肠癌无肝转移、伴肝转移患者各12例血清样本,同组血清等量混合进行双向电泳,用ImageMaster V5.0软件分析两组蛋白质的差异,差异蛋白质进行MALDI-TOF-MS鉴定。ELISA法测定差异蛋白及CEA含量。用受试者工作曲线评价其对大肠癌肝转移的诊断价值,以人工神经网络方法,筛选出准确度最高者作为大肠癌肝转移诊断模型。结果双向电泳显示,大肠癌伴肝转移组与无肝转移组相比较有4个蛋白有统计学意义,其中2个上调的蛋白质分别是Transferrin和Complement component C9;2个下调的蛋白质分别是Haptoglobin和Isoform 1 of Serum albumin。受试者工作曲线分析与大肠癌肝转移相关性依次为Transferrin>Haptoglobin>CEA。人工神经网络的诊断方法以Transferrin和Haptoglobin这两个蛋白联合建立的模型预测准确度最高,为88.57%,其敏感度为63.64%,特异度为100%。结论利用蛋白质组学与人工神经网络构建了Transferrin与Haptoglobin联合的大肠癌肝转移诊断模型,横断面验证有较高的准确度,开辟了诊断大肠癌肝转移的新方法。  相似文献   

4.
目的 应用血清蛋白组学技术,对比分析燃煤污染型砷中毒患者与正常人血清中差异蛋白的表达,筛选与燃煤污染型砷中毒发生发展密切相关的蛋白质.方法 2008年收集经临床诊断的贵州燃煤污染型砷中毒患者和健康人空腹血清标本各6例,用双向凝胶电泳(2-DE)分离砷中毒患者血清和健康人血清的总蛋白质,银染显色后经图像分析识别差异表达的蛋白质,再应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定差异表达的蛋白质点.结果 两组血清2-DE图谱平均点数分别为779±35和865±30,匹配率为90.1%.筛选出两组间的差异蛋白点60个,砷中毒组表达上调25个,表达下调35个.对其中表达量差异3倍以上的35个蛋白点进行MALDI-TOF-MS分析,鉴定出包括角蛋白10、载脂蛋白A-V、转铁蛋白、α1抗胰蛋白酶、锌α2糖蛋白、细胞外信号调节激酶3、空泡分选蛋白33、O-GlcNAc糖基转移酶等13个蛋白质,其中5个蛋白质在砷中毒组表达上调,8个蛋白质在砷中毒组表达下调.结论 本研究建立了分辨率高、重复性较好的燃煤污染型砷中毒患者血清双向凝胶电泳图谱,识别并鉴定了一些与健康人血清差异表达的蛋白质,为进一步探讨地方性砷中毒发病机制,筛选燃煤污染型砷中毒早期特异性血清分子标志物奠定了初步基础.  相似文献   

5.
目的初步分析具有不同肝转移能力的胃癌细胞株XGC9811和XGC9811-L的差异蛋白质位点,为阐述与胃癌肝转移有关的差异蛋白质提供线索。方法以自发性多脏器转移胃癌细胞XGC9811和肝高转移潜能胃癌细胞XGC9811-L为实验对象,利用双向凝胶电泳技术,建立并优化两种细胞株的蛋白质表达图谱;之后利用M elan ieⅢ2-D软件分析两种蛋白质组的差异表达。结果获得了分辨率和重复性均较好的双向电泳银染图谱,在两组细胞所有凝胶均有相同变化的差异点19个,其中5个仅在XGC9811-L中表达,3个仅在XGC9811中表达,与XGC9811相比,有7个蛋白位点表达下调,4个蛋白位点表达上调。结论两种不同肝转移能力的胃癌细胞具有不同的蛋白位点。这些差异蛋白质位点为进一步鉴定胃癌肝转移的相关蛋白及建立胃癌肝转移性细胞株的2-DE数据库奠定基础。  相似文献   

6.
池宏波  杨英梅 《浙江医学》2022,44(1):25-27,32
目的对结直肠癌患者血液外泌体差异表达非编码RNA(ncRNA)进行筛选及功能分析,探索结直肠癌的发病机制,为结直肠癌早期诊断分子标志物的筛选及治疗靶点提供理论依据。方法从exoRBase数据库中选取12例结直肠癌患者和32例正常对照者血液外泌体的RNA-seq数据,利用R软件的Limma包筛选差异表达ncRNA和信使RNA(mRNA),预测其结合的微小RNAs(miRNA),构建竞争内源性RNA(ceRNA)网络,并利用R软件的clusterProfiler包和enrichplot包对差异表达mRNAs进行基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果结直肠癌组和正常对照组外泌体差异表达基因筛选,共筛选出125个差异表达mRNAs,其中上调表达117个,下调表达8个;52个差异表达长链非编码RNAs(lncRNAs),均为上调表达;81个差异表达环状RNAs(circRNAs),其中上调表达47个,下调表达34个。预测mRNAs和lncRNAs、circRNAs结合的共同miRNAs,构建miRNAs为中心的ceRNA调控网络,包含16个lncRNAs、13个circRNAs、62个miRNAs和25个mRNAs。差异表达mRNAs主要涉及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、胰高血糖素信号通路、Fcγ受体介导的吞噬作用等。结论通过生物信息学方法构建ceRNA调控网络,可揭示差异表达基因调控结直肠癌发生、发展的分子机制,有助于临床上指导结直肠癌的早期诊断和精准治疗。  相似文献   

7.
目的采用蛋白质组学技术研究有转移组和无转移组大肠癌组织蛋白质组表达的差异,分析和鉴定两组间特异表达的肿瘤蛋白质,探索大肠癌并肝转移发生的机制. 方法用等电聚焦/SDS聚丙烯酰胺双向凝胶电泳对比分析20例大肠癌患者原发灶、癌旁肠黏膜和肝转移灶中蛋白表达,经肽质量指纹谱分析、鉴定差异蛋白质.结果双向电泳图像对比分析表明,癌旁大肠黏膜组织、癌原发灶和肝转移灶中蛋白质表达有明显差异.在肝转移组中存在AnnexinA2蛋白和JE0350蛋白特异表达,磷酸丙酮酸水合酶和CAC15744蛋白表达上调;在无肝转移组存在CAD80231和A38983蛋白特异表达,AAH01166蛋白表达上调. 结论大肠癌并肝转移者与无肝转移者在蛋白质组表达上存在一定的差异.对这些差异蛋白质的进一步深入研究,可帮助了解大肠癌易发生远处转移的蛋白质组学机制及采取相应的处理对策.  相似文献   

8.
目的:寻找与丹参防治全胃肠外营养肝损害相关的蛋白质。方法:选取需要全胃肠外营养的患者,分别给予静脉全胃肠外营养(对照组)及全胃肠外营养+丹参(实验组)。治疗15d后收集两组血清,用二维凝胶电泳分离血清蛋白质获得差异表达蛋白质,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱和数据库分析鉴定两组差异表达蛋白质。结果:发现5个具有明显表达差异的蛋白质斑点,经鉴定确定为血清清蛋白前体、接联球蛋白、免疫球蛋白κ链C区、补体C4-B前体和血清铁传递蛋白前体。结论:丹参可能通过上调或下调上述蛋白质的表达,参与防治全胃肠外营养对肝脏的损害。  相似文献   

9.
为了解结直肠癌患者外周血中不稳定编码区结合蛋白(CRD-BP)RNA的表达与患者临床特征的相关性,应用荧光定量巢式逆转录聚合酶链反应方法检测32例结直肠癌患者和35例对照组人群外周血中CRD-BP RNA的表达.结果 结直肠癌组32个样本中有10个样本中检测到CRD-BP RNA表达,阳性表达率31.25%,对照组35个样本中均未检测到CRD-BP RNA表达,两组间阳性表达率差异有统计学意义(P<0.05);实验组中CRD-BP RNA的表达与临床分期及有无淋巴结转移密切相关(P<0.05).结直肠癌患者外周血中CRD-BP RNA表达可能与有无淋巴结转移、临床分期相关.  相似文献   

10.
《海南医学院学报》2019,25(8):566-571
目的:探索黄连温胆汤含药血清改善脂肪细胞胰岛素抵抗的可能机制。方法:将3T3-L1成纤维细胞分为空白组、模型组和中药组,对模型组和中药组3T3-L1成纤维细胞进行诱导分化,构建胰岛素抵抗3T3-L1脂肪细胞模型。空白组、模型组分别给予空白血清刺激,中药组给予黄连温胆汤含药血清。使用TMT标记、液相色谱-质谱联用分析,并运用GO分析和KEGG pathway分析方法对获得的差异表达蛋白进行生物信息学分析。结果:本实验中3组样本共鉴定到4 982个蛋白质,其中4238个蛋白质具有定量信息。模型组与空白组间上调蛋白210个,下调蛋白399个;中药组和空白组间上调蛋白221个,下调蛋白98个;中药组和模型组组间比较上调蛋白310个,下调蛋白142个。GO分析结果示中药组/模型组间差异表达上调蛋白显著富集于DNA复制、核染色质、蛋白结合等分类中,下调蛋白显著富集于氧化还原、脂肪酸β氧化等分类。KEGG pathway富集分析示,差异表达上调蛋白富集于10条通路中,富集较显著的通路为DNA复制、细胞循环、不匹配修复等通路;差异表达下调蛋白富集于25条通路中,富集较显著的通路为过氧化物酶体、脂肪酸降解、脂肪酸代谢等通路。结论:黄连温胆汤含药血清改善胰岛素抵抗效果确切,其机制是通过多靶点、多通路协同、整体调控作用完成的。  相似文献   

11.
目的:筛选、鉴定乙型肝炎病毒(HBV)相关肝癌的血清差异表达蛋白,探讨其可能的早期诊断价值.方法:采用蛋白芯片及表面增强激光解析电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术对正常人、HBV相关肝炎、肝硬化患者及原发性肝癌患者术前血清分别进行检测,筛选肝癌血清差异表达蛋白;通过离子交换柱分离纯化其中表达差异最明显的蛋白,并进行质谱鉴定.根据筛选结果,建立肝癌诊断决策树模型,评价其诊断肝癌的准确性和敏感度.结果:与正常组相比,肝癌组有44个差异蛋白质波峰(P<0.05),其中21个上调,23个下调;与肝硬化组相比,肝癌组有51个差异蛋白质波峰(P<0.05),其中47个上调,4个下调.质荷比为5 805的蛋白质表达在正常人群<慢性肝炎组<肝硬化组<肝癌组,在肝癌组中表达最高,差异具有统计学意义(P<0.01);对其酶解消化产物进行肽指纹谱(PMF)鉴定发现其中有2条肽段序列与硫酸软骨素合酶Ⅱ部分序列相匹配.根据筛选的差异表达蛋白成功建立肝癌诊断决策树模型,其判断肝癌的准确率为94.82%[(23 32)/58]、敏感性88.46%(23/26)、特异性100%(32/32).结论:成功筛选HBV相关肝癌血清差异表达蛋白,其中差异最显著蛋白(质荷比为5 805)酶解产物中有2条肽段与硫酸软骨素合酶Ⅱ部分序列相匹配;根据筛选结果建立的肝癌诊断决策树模型有助于早期诊断HBV相关肝癌.  相似文献   

12.
目的探究阳和汤对急性乳腺炎大鼠蛋白质组的影响,从而探索阳和汤治疗急性乳腺炎可能的途径。方法采用双向凝胶电泳(2-DE)对实验对照组、模型组、青霉素组和阳和汤组大鼠血清进行蛋白分离,经过图像分析识别差异表达蛋白质,由基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)得到差异表达蛋白的肽指纹图,用蛋白质数据库(SwissProt)搜索匹配的蛋白质。结果所获2-DE图谱分离效果较好,质谱分析共鉴定了12个差异蛋白质点,分别属于炎症相关蛋白、物质代谢相关蛋白和肿瘤相关蛋白,青霉素组的差异蛋白有三个上调,九个下调,阳和汤组的差异蛋白全部下调。结论阳和汤治疗急性乳腺炎可能与下调炎症相关蛋白、物质代谢相关蛋白和肿瘤相关蛋白有关。  相似文献   

13.
目的:用蛋白质组学技术比较重症急性胰腺炎(SAP)与轻症急性胰腺炎(MAP)患者血清的差异蛋白,探讨SAP特异蛋白的表达。方法:血清标本取自10例急性胰腺炎(AP)患者,其中5例SAP,5例MAP,用双向凝胶电泳检测两类患者的蛋白表达,并将这些差异表达蛋白点进行质谱鉴定,Mascot数据库检索。结果:比较双向电泳图谱发现15个差异表达蛋白点,经质谱分析,成功鉴定出10种蛋白质,在SAP患者其中4种表达上调,6种表达下调。数据库查询结果,4个表达上调蛋白分别为补体4A、结合珠蛋白亚型2、结合珠蛋白和载脂蛋白L1;6个表达下调蛋白分别为四连接素、谷胱甘肽过氧化物酶3、丝氨酸蛋白酶抑制剂亚型F1、丛生蛋白亚型-1、转甲状腺素蛋白、丝氨酸蛋白酶抑制剂A1亚型2。结论:SAP患者血清有差异蛋白质表达,这可能和SAP发病机制相关。  相似文献   

14.
目的分析下咽癌患者与健康人血浆中差异表达的蛋白质组,筛选潜在的与下咽癌诊断密切相关的血浆肿瘤标志物。方法取下咽癌患者与健康人空腹血浆标本各6例分别等量混合成2组样本,去除血浆高丰度蛋白后,利用双向电泳(2-DE)进行分离,经软件分析后找出表达量变化2倍以上的差异蛋白点,接着利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)进行差异蛋白质鉴定,然后利用Western blotting对α2-HS-糖蛋白的表达量进行验证。结果下咽癌患者与健康人血浆相比较,筛选出表达量差异2倍以上的差异蛋白点共11个,其中表达上调的有5个,表达下调的有6个,进行质谱分析后,表达上调的蛋白有α2-HS-糖蛋白、结合珠蛋白;表达下调的蛋白有免疫球蛋白κ链C结构域、载脂蛋白A1。Western blotting结果表明,α-2-HS-糖蛋白的表达上调,与双向电泳结果一致。结论下咽癌患者与健康人血浆的蛋白质表达谱表现出一定差异,这些差异蛋白有可能成为下咽癌患者早期诊断的特异性血浆肿瘤标志物。  相似文献   

15.
目的:探讨术前血清癌胚抗原(CEA)阳性对结直肠癌临床诊断、术前评估及预后意义。方法:统计并比较不同消化道肿瘤、不同分期及不同病理分型以及有肝转移结直肠癌患者血清CEA阳性率之间差异,通过随访获得比较术前CEA阳性患者和阴性患者的1、3、5年的生存率,比较其相同时间段之间的差异。结果:不同消化道肿瘤血清CEA阳性率并无统计学差异,不同分期、不同病理分化类型以及有无肝转移分组患者的术前CEA阳性率比较有统计学差异。术前血清CEA阳性患者与阴性患者相同时间段生存率比较有统计学差异。结论:血清CEA的检测在结直肠癌的肿瘤分期、肿瘤病理类型、有无肝转移以及预后的预测上有一定的临床意义,可以作为结直肠癌术前分期、有无转移以及预后评估的一项参考依据。但是作为单一指标检测因为存在着特异性不强、阳性率低等不足的特点,对于结直肠癌的特异性诊断并无重要意义。  相似文献   

16.
目的 通过生物信息学方法探讨结直肠癌转移的分子机制,为结直肠癌转移提供潜在的治疗靶点。方法 从高通量基因表达数据库(GEO)下载GSE41568数据集,用Limma软件包筛选转移性和原发性结直肠癌的差异表达基因;通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与结直肠癌不同转移部位相关的核心模块和核心基因;使用STRING和Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用PROGgenesV2数据库进行预后分析。通过基因集富集分析(GSEA)预测基因参与结直肠癌的潜在分子机制。结果 共获得1 159个差异表达基因,由703个上调基因和456个下调基因组成。共表达模块中,前50个核心基因的基因本体(GO)功能富集分析表明,基因主要与创伤反应和急性炎症反应相关。通过PPI网络筛选的3个核心基因APOH、KNG1和FGG对结直肠癌患者的预后有显著影响。结论 APOH、KNG1和FGG与结直肠癌患者的预后呈负相关,这些基因有望成为结直肠癌的诊断生物标志物或治疗靶点。  相似文献   

17.
新生儿神经管畸形的血清蛋白组学研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的 寻找神经管畸形新生儿血清中异常表达的蛋白质。 方法 通过二维凝胶电泳分离神经管畸形新生儿及正常新生儿血清,用PDQuest图像软件比较电泳图谱中的异常蛋白质点,用MALDI TOF/ TOF串联质谱仪分析蛋白质,所得的质谱图通过GPS软件在Mascot数据库中检索并鉴定蛋白质。结果 筛选出35个表达差异的蛋白质点,其中有8个蛋白质点表达上调,27个蛋白质点表达下调。选取四个蛋白质点进行鉴定,其中结合珠蛋白前体表达升高, HP protein, 血清载脂蛋白A-1前体及immunoglobulin heavy constant gamma 1三种蛋白表达均降低。 结论 神经管畸形可以导致血清中多种蛋白的的异常表达。  相似文献   

18.
目的研究FAT10 mRNA在结直肠癌组织中的表达及其与结直肠癌临床病理学间的关系。方法应用逆转录聚合酶链反应法(RT-PCR)检测FAT10 mRNA在51例结直肠癌组织、结直肠癌旁组织和正常结直肠黏膜组织的表达水平,并观察其与临床病理特征的关系。结果(1)RT-PCR法检测FAT10在结直肠癌组织病例中表达阳性率为68.6%,在结直肠癌旁组织及正常结直肠黏膜中表达阳性率分别为17.6%和13.7%;(2)结直肠癌组织FAT10表达水平与结直肠癌旁组织及正常结直肠黏膜组织比较,差异均有显著性(P<0.05);结直肠癌淋巴结转移组患者FAT10表达水平与未转移组相比较,差异有显著性(P<0.05);伴肝转移组的结直肠癌与无肝转移组结直肠癌FAT10表达水平差异有显著性(P<0.05);组织FAT10表达水平还与临床分期密切相关,FAT10水平随分期升高而升高。与患者年龄、性别、肿瘤所在部位、肿瘤大小及病理分化程度等,临床病理特性之间无相关性(P>0.05)。结论FAT10在结直肠癌组织中的表达明显上调,对应的癌旁组织及正常结直肠黏膜组织无表达或弱表达;测定FAT10的表达可能预测结直肠癌的发生潜能;结直肠癌组织中FAT10的阳性表达与肿瘤临床分期、有无淋巴结转移及肝转移有关,提示FAT10基因与肿瘤的侵袭、转移密切相关。  相似文献   

19.
董惠  王卫峰  冯玉良  朱琴  丛衍群  张虹  郑培奋 《浙江医学》2020,42(11):1154-1157
目的探讨血管紧张素转化酶2(ACE2)在结直肠癌中的表达及意义。方法利用Oncomine数据库(http://www.oncomine.org/resource)、人类蛋白质图谱(HPA)数据库(http://www.proteinatlas.org/)、GEPIA数据库(http://gepia.cancer-pku.cn)提取数据,比较结直肠癌组织与正常结直肠组织中ACE2表达,分析ACE2基因表达量与错配修复基因表达量的相关性,同时比较结直肠癌患者ACE2基因高、低表达组生存率。结果结直肠癌组织中ACE2基因表达量较正常结直肠组织明显下调(P<0.05),ACE2蛋白表达较正常结直肠组织明显上调。通过GEPIA数据库分析发现,ACE2基因表达量与错配修复基因MLH1、MSH2、MSH6、PMS1和PMS2表达量均有明显相关性(均P<0.05);结直肠癌患者ACE2基因高、低表达组总生存率及无病生存率比较,差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论ACE2蛋白在结直肠癌组织中呈高表达,对结直肠癌患者的生存无明显影响,但与涉及结直肠癌发生的错配修复基因表达关系密切。  相似文献   

20.
目的:探索大黄蒽醌化合物抗猴免疫缺陷病毒可能的作用靶点与转导信号通路。方法:大黄蒽醌化合物干预48 h后,提取两组细胞的总蛋白,利用iTRAQ技术对表达差异的蛋白进行筛选后,使用GO数据库、KEGG数据库进行分析,确定差异蛋白涉及的生物学过程、细胞组件及分子功能,分析目标蛋白质参与的主要疾病和信号转导途径。结果:两组共筛选出235个差异蛋白,其中可能与艾滋病相关的差异蛋白18个,7个蛋白表达上调,11个蛋白表达下调。差异蛋白主要涉及免疫反应、白细胞介素-1的合成与应答、病毒感染等8种生物学过程;参与蛋白结合、DNA结合、RNA结合等11个方面的细胞功能;涉及胞外区、细胞质、质膜、细胞核等11个方面的细胞组件;并主要参与系统性红斑狼疮、金黄色葡萄球菌感染、吞噬作用等9条信号转导通路。结论:利用iTRAQ技术筛选、鉴定差异蛋白表达,诠释大黄蒽醌化合物抗猴免疫缺陷病毒可能的作用靶点与转导信号通路,为临床治疗提供新的研究思路。  相似文献   

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