人大肠癌抗原基因cDNA噬菌体表达文库的构建和鉴定

目的:为获得大肠癌的特异性抗原基因,构建人大肠癌抗原基因的cDNA噬菌体表达文库.方法:从2株人大肠癌细胞CCL-187和CX-1中提取总RNA,分离纯化mRNA,并以此为模板合成第1链cDNA,用置换法合成第2链cDNA.双链cDNA经末端削平、EcoR Ⅰ接头连接、Xho Ⅰ酶切、过柱分级分离,除去＜400 bp片段.收集符合需要的cDNA片段与噬菌体ZAP Express载体连接,体外包装后获得人大肠癌抗原基因的cDNA噬菌体表达文库.结果:构建的人大肠癌抗原基因的cDNA噬菌体文库,原始库容量为2.3×109 pfμ/L,重组率97%.重组子插入cDNA片段平均大小1 kb以上.结论:成功地构建高质量的人大肠癌抗原基因的cDNA噬菌体表达文库,为大肠癌的特异性抗原筛选奠定了基础.     

金仓鼠神经管cDNA文库的建立

目的　构建金仓鼠神经管cDNA文库,以筛选与神经管发育及神经管畸形发生相关的基因。　方法 　用TRIZOLReagent提取金仓鼠神经管总RNA;用LD PCR法反转录合成双链cDNA;经蛋白酶K消化、SfiⅠ酶切、 CHROMASPIN 400柱分离去除小于500bp的片段;将cDNA与载体λTriplEX2按一定比例连接;经体外包装,建立 cDNA的噬菌体表达文库。　结果　cDNA文库容量为1.5×106pfu ml,重组率为99%,平均插入片段大于1kb。　 结论　我们初步构建的金仓鼠神经管cDNA文库为高效的cDNA文库。     

小鼠巨噬细胞cDNA酵母表达文库的构建与鉴定

目的 采用Gateway技术构建适合酵母表达的小鼠巨噬细胞cDNA文库并进行鉴定.方法 将小鼠巨噬细胞的mRNA分离纯化后,以生物素标记的寡聚胸苷酸Oligo(dT)为引物反转录后连接attB衔接子(attB Adapter),层析柱纯化,通过BP重组反应将500 bp以上的片段克隆到含attP衔接子的pDONRTM222载体,电转化入ElectroMAXTM DH10BTMT1 Phage Resistant Cells,构建Gateway入门cDNA文库,并完全随机挑取单菌落,提取质粒酶切鉴定重组子插入片段大小.构建Gateway目的 载体,通过LR重组反应将入门文库转入此目的 载体成为酵母表达文库,挑取单克隆鉴定重组子插入片段大小.结果 经鉴定,入门文库平均滴度为(6.80±0.10)×105 cfu/ml,文库总容量为7.48×106 cfu,平均插入片段为(2.20±0.20)kb,重组率为100%.酵母表达文库平均滴度为(3.24±0.10)×106 cfu/ml,文库总容量为3.89×107 cfu,平均插入的片段为(2.27±0.15)kb,重组率为95.83%(23/24).结论 构建的小鼠巨噬细胞cDNA入门文库和酵母表达文库都符合高质量文库的要求,可用于进一步的研究.     

藜草花粉变应原λ噬菌体cDNA表达文库的构建及初步鉴定

目的:构建藜草花粉变应原λ噬菌体cDNA表达文库,并进行初步鉴定.方法:用TRIzol试剂抽提藜草花粉总RNA并分离mRNA.以纯化的mRNA为模板,以含有Xho I内切酶位点和18 by的Poly(dT)序列的引物,用ZAP Express cDNA合成试剂盒反转录合成cDNA.将cDNA修饰、分级纯化后,获得大于400 by的cDNA片段.将带有黏性末端的双链ds cD-NA与Uni-ZAP XR载体连接,采用ZAP Express cDNA文库合成试剂盒利用λ噬菌体构建藜草花粉λ噬菌体cDNA表达文库,用包装蛋白对合成的ds cDNA进行体外包装,以包装产物感染宿主菌XL1-Blue MRF即获得cDNA表达文库.用PCR方法检测cDNA表达文库的滴度和插人片段的大小.结果:构建的藜草花粉变应原λ噬菌体表达文库的滴度为9.7×10(8)pfu/L,重组率为100%,库容量为4.85pfu.插人片段的长度平均约为1.0 kb.结论:构建的cDNA表达文库的容量及插人片段的大小合适,适用于藜草花粉变应原cDNA克隆的筛选,为制备基因重组藜草花粉变应原疫苗奠定了基础.     

鸡B淋巴细胞cDNA T7噬菌体表达文库的构建与鉴定

目的:构建鸡B淋巴细胞cDNAT7噬菌体表达文库并对文库质量进行鉴定。方法:利用oligo(dT)-纤维素亲和层析从SPF雏鸡法氏囊细胞制备mRNA,合成的双链cDNA定向克隆到T7EcoR I/HindIII载体臂,包装并构建cDNA表达文库。对文库进行滴度测定和重组子测定。扩增文库并进行PCR鉴定插入序列的长度及分布。结果:文库初始滴度为5×107pfu/mL,扩增后滴度达到1.88×1010pfu/mL。插入片段平均长度1440bp,主要分布在750～2000bp之间。结论:构建的鸡B淋巴细胞cDNAT7噬菌体表达文库具有很高的质量,为进一步研究鸡B细胞发育以及传染性法氏囊病毒(IBDV)的分子致病机制奠定了实验基础。     

白纹伊蚊T7噬茵体展示cDNA文库的构建

为筛选白纹伊蚊与相关蚊媒病毒相互作用的基因,本文构建了白纹伊蚊Aedes albopictusT7噬菌体展示eDNA文库,分离与纯化白纹伊蚊mRNA,所得mRNA经反转录合成双链cDNA后,在双链cDNA末端加上定向EcoRI／HindIn接头使其两端分别带EcoRI和Hind11I黏性末端;接着用MiniColumn纯化收集300bp以上的双链cDNA片段连接于T7 Select 10—3b载体;经体外包装后,以BLT5403为受体菌构建1v7噬菌体展示cDNA文库。所建文库的库容量经测定为1．7×10’pfu／mL,扩增后文库滴度为2．5×10^（15）pfu／mL。对从原始文库中随机挑取的50个噬菌斑进行PCR鉴定,重组率为95％以上;阳性克隆片段长度分布在200～2000bp,其中有90％的插入片段大于300bp。本文所构建的白纹伊蚊T7噬菌体展示cDNA文库,满足cDNA文库的基本要求,可以用于筛选白纹伊蚊与相关蚊病毒相互作用的基因。     

类风湿关节炎滑膜组织T7噬菌体展示cDNA文库的构建

目的构建类风湿关节炎(RA)滑膜组织T7噬菌体展示cDNA文库,为筛选和鉴定RA特异性基因的研究奠定基础。方法取确诊RA患者的滑膜组织,用Trizol试剂提取总RNA,Oligotex离心柱分离mRNA,电泳检测其质量,逆转录合成双链cDNA,经末端修平、接头连接、酶切后去除过多接头,收集>300bp的cDNA片段,与T7Select10-3载体连接,体外包装并扩增得到类风湿关节炎滑膜组织T7噬菌体展示cDNA文库。最后,通过铺平板滴度测定及PCR技术鉴定文库质量。结果所构建原始文库重组克隆数为2×107pfu,扩增滴度8.9×1010pfu/ml。PCR法检测片段插入率为90%,插入片段在300～2000bp之间。文库噬菌体裂解液PCR扩增得到BiP基因片段。结论成功构建了高质量的RA滑膜T7噬菌体展示cDNA文库,为下一步RA自身抗原的筛选奠定了基础。     

高温致畸金黄地鼠神经管cDNA文库的构建与鉴定

目的:构建高温致畸金黄地鼠神经管cDNA文库。方法:在高温致神经管畸形动物模型上,提取高温致畸金黄地鼠胚胎神经管总RNA,用SMARTTMcDNA文库构建试剂盒反转录合成cDNA第1链,经LD-PCR合成全长双链cDNA,去除小于500 bp的片断后与λTriplEx2噬菌体左、右臂连接,体外包装,构建成未扩增cDNA文库,再进行文库扩增。测定未扩增和扩增文库的滴度及重组率;随机挑取噬菌斑,经PCR扩增,电泳检测所构建cDNA文库的质量。结果:未扩增文库滴度为2.03×106pfu/ml,重组率为98.4%,文库扩增后滴度达2.503×109pfu/ml,重组率为97.6%。插入片段长度分布于500~3 000 bp之间。结论:成功地构建了高质量的高温致畸金黄地鼠神经管cDNA文库。     

人类心脏发育相关基因的初步筛选

从人胎儿心脏cDNA文库和成人心脏cDNA文库，通过差减杂交，筛选心脏发育相关基因。方法：①用23周和27周的人胚胎心脏组织构建2个cDNA文库，分别命名为LibF和LibS，用成人心脏组织构建了1个cDNA文库，命名为LibA。②探针的合成、纯化和比放射活性测定。③差减杂交和特异性探针的富集。④菌落原位杂交。⑤差减阳性克隆的斑点杂交。结果：①所构建的人胎儿心脏cDNA文库和成人心脏cDNA文库的容量LibF为1×109，LibS为3.7×108，LibA为2×108，重组子的片段大小为0．9~4．6kb。②经差减杂交和原位杂交，获得有差异克隆48个。结论：构建高质量的人胎儿心脏cDNA文库和成人心脏cDNA文库为筛选心脏发育相关基因奠定可靠的基础，并初步说明随着发育过程的推移，整体基因的表达有逐步减少的趋势。     

应用抑制性消减杂交技术鉴定肿瘤转移抑制相关基因

目的 克隆与肿瘤转移抑制相关的基因，探讨成骨肉瘤转移的分子机理。方法 采用抑制性消减杂交技术构建了人成骨肉瘤低转移细胞株SOSP－9607的消减文库，对部分克隆进行了测序和同源性分析，用Northern杂交及后转录PCR技术证实了克隆的表达情况。结果 在低转移细胞株SOSP－9607中高表达的克隆中有2个克隆与人端粒结合因子2（telomeric repeat binding factor 2,TERF2)同源。Northern杂交及反转录PCR证实这个基因只在低转移细胞中表达，而在高转移人成骨肉瘤细胞株SOSP－M和裸鼠肺转移结节中均未表达。结论 TERF2可能在维持肿瘤细胞自身相对稳定、抑制骨肉瘤演进中起重要作用。     

Construction of cDNA library from NPC tissue and screening of antigenic genes

To construct cDNA library of nasopharyngeal carcinoma (NPC) and obtain the NPC associated or specific antigens from it, we used a powerful new method to identify the antigens eliciting humoral immune response, which is SEREX (serological identification of antigen by recombinant cDNA expression library). Autologous serum of NPC patient was used to screen the reactive clones in the human NPC tissue cDNA library consisted of 3.64×106 recombinants. The 23 exact positive clones were subcloned to monoclonality and the size of cDNA inserts was identified by PCR. Then the nucleotide sequence of cDNA inserts was determined, and the sequence alignments were performed with BLAST software on GenBank database. They represented 16 different antigens. A detailed sequence analysis showed that 10 of 16 genes were high homologous to genes known in GenBank, such as RPL31, S100 A2, MT2A, etc. However, there were also 6 genes with low homology to genes in GenBank. Furthermore, 3 of 6 genes may be novel genes. The associations of these genes to NPC and the roles that they played in the occurrence and development of NPC should be further revealed.     

云南个旧肺鳞癌YTMLC-90细胞株cDNA文库构建和鉴定

目的 :构建云南个旧肺鳞癌YTMLC 90细胞株的cDNA文库。方法 :从培养的人肺鳞癌YTMLC 90细胞株中提取总RNA ,利用经修饰的oligo(dT)引物 (含SfiⅠB酶切位点 )合成cDNA第1链。同时 ,根据真核生物mRNA 5′端帽子结构的特点 ,利用SMART核苷酸 (含SfiⅠA酶切位点 )作为cDNA第 1链在mR NA 5′端延伸出去的模板。以此序列为引物 ,利用LD PCR(long distancePCR)合成双链cDNA。双链cDNA经SfiⅠ (ⅠA和ⅠB)酶切和过柱分级分离后 ,克隆入经SfiⅠ酶切的载体λTripIE× 2 ,经体外包装即为cDNA文库。结果 :人肺癌细胞株YTMLC 90的cDNA文库中 ,含有 1.0 1× 10 9pfu/L个重组子 ,重组率为 93.2 %。将该文库扩增后 ,克隆数可达 5 .2 4× 10 12 pfu/L ,插入cDNA的长度为 75 0～ 30 0 0bp。结论 :所构建的cDNA文库具有较好的质量 ,为进一步筛选、克隆肺癌特异性表达基因奠定了基础。     

LIM矿化蛋白1过表达对骨肉瘤细胞系OS-9901细胞增殖的影响

目的　探讨骨肉瘤细胞系OS-9901细胞中LIM矿化蛋白1（LMP-1）过表达对该细胞增殖的影响。 方法　构建LMP-1过表达慢病毒载体,通过脂质体转染进骨肉瘤细胞系OS-9901细胞。通过荧光定量PCR和Western blot检测LMP-1过表达情况,并通过BrdU掺入实验比较LMP-1过表达前后细胞增殖情况。 结果　转染了LMP-1过表达慢病毒载体6 h后细胞内LMP-1 mRNA和蛋白表达均无显著变化（P>0.05）,且DNA合成量无显著变化。而当LMP-1过表达慢病毒载体转染细胞12、24和48 h后细胞内LMP-1 mRNA和蛋白表达量均显著提高的同时,DNA合成量显著降低（P<0.05）。 结论　LMP-1过表达可抑制骨肉瘤细胞系OS-9901细胞增殖。     

构建不稳定型心绞痛淋巴细胞差异表达cDNA消减文库

目的:构建不稳定型心绞痛淋巴细胞差异表达cDNA消减文库。方法:将不稳定型心绞痛病人(n=15)和稳定型心绞痛病人(n=15)的淋巴细胞的RNA进行抑制性消减杂交(SSH), 将获得的顺向和逆向消减产物分别与T/A载体连接, 采用1×TSS一步法转化大肠杆菌JM109, 获得消减cDNA文库, 采用蓝白斑筛选和菌落PCR筛选有插入片段的克隆。结果:各组cDNA文库各获得2000个阳性克隆, cDNA片段大部分分布于(200-600)bp之间。结论:本研究构建了不稳定型心绞痛淋巴细胞消减cDNA文库, 此cDNA文库有助于进一步筛选不稳定型心绞痛淋巴细胞中的差异表达基因。     

Pregnancy-specific beta 1 glycoprotein mRNA is present in placental as well as non-placental tissues

Six human SP1 clones were isolated from a term placental cDNA library by immunological screening. All six cDNA clones cross-hybridized. However, at least two classes of cDNA could be distinguished, based on the presence or absence of an EcoRI site in the insert. Northern blot analysis of human term placental mRNA with all six cloned inserts demonstrated the presence of two mRNA species of 1.6 and 2.4 kb, respectively. The amino acid sequences of tryptic fragments of pure human SP1 protein were determined for confirmation of the identity of these cDNA clones. Using one of the cloned cDNA as probe, two and ten hybridizing clones were isolated from a human testicular cDNA library and a HeLa cell cDNA library, respectively. Southern blot analysis of these clones showed strong hybridization with the SP1 cDNA probe under high stringency, indicating the presence of highly homologous mRNA species in these tissues.     

日本血吸虫线粒体大亚基核糖体基因的亚克隆、测序及同源性分析

目的将筛选日本血吸虫成虫cDNA文库得到基因克隆并测序。方法体外将以阳性克隆为模板的PCR产物和 pGEM T载体连接 ,转化大肠杆菌XL1 blue,经抗生素及生色底物X gal初筛 ,再用限制性内切酶酶切法进一步鉴定和用DNA自动测序仪测序。序列送blast基因服务站进行同源性分析。结果构建了3个含日本血吸虫cDNA基因片段的重组子 ,其中1个阳性克隆序列为编码日本血吸虫线粒体大亚基核糖体rRNA的基因序列 ,另2个序列与已知的日本血吸虫基因序列无同源性。结论获得了日本血吸虫线粒体大亚基核糖体rRNA基因片段 ,为进一步分析其一级结构和功能打下了基础。     

A human cDNA expression library in yeast enriched for open reading frames

We developed a high-throughput technique for the generation of cDNA libraries in the yeast Saccharomyces cerevisiae which enables the selection of cloned cDNA inserts containing open reading frames (ORFs). For direct screening of random-primed cDNA libraries, we have constructed a yeast shuttle/expression vector, the so-called ORF vector pYEXTSH3, which allows the enriched growth of protein expression clones. The selection system is based on the HIS3 marker gene fused to the C terminus of the cDNA insert. The cDNAs cloned in-frame result in histidine prototrophic yeast cells growing on minimal medium, whereas clones bearing the vector without insert or out-of-frame inserts should not grow on this medium. A randomly primed cDNA library from human fetal brain tissue was cloned in this novel vector, and using robot technology the selected clones were arrayed in microtiter plates and were analyzed by sequencing and for protein expression. In the constructed cDNA expression library, about 60% of clones bear an insert in the correct reading frame. In comparison to unselected libraries it was possible to increase the clones with inserts in the correct reading frame more than fourfold, from 14% to 60%. With the expression system described here, we could avoid time-consuming and costly techniques for identification of clones expressing protein by using antibody screening on high-density filters and subsequently rearraying the selected clones in a new "daughter" library. The advantage of this ORF vector is that, in a one-step screening procedure, it allows the generation of expression libraries enriched for clones with correct reading frames as sources of recombinant proteins.     

抗人SARS病毒单链抗体库的构建

目的:利用细胞内重组的方法,构建大库容量的人源性抗SARS病毒单链抗体(scFv)库,为筛选SARS病毒抗原的人源性抗体奠定基础。方法:取6例SARS康复患者的80mL外周血,分离淋巴细胞后提取总RNA。分离纯化mRNA并反转录成cDNA后,扩增抗体重链、轻链可变区基因片段。然后经重叠延伸PCR装配成scFv基因并克隆入噬粒载体pDAN5中,电转化大肠杆菌TG1构建初级抗体库。制备初级库噬菌体后,感染大肠杆菌BS1365进行细胞内重组制备次级抗体库。结果:初级库库容量为3×109,在大肠杆菌BS1365中重组后得到3×1011的次级抗体库。结论:细胞内重组方法的应用可使大库容量抗体库的构建变得简单易行。构建的抗SARS病毒单链抗体次库不仅接近人类天然抗体库的水平,而且多样性好,为筛选抗SARS病毒抗原的抗体提供了保证。