5-Aza-CdR对胃癌细胞系BGC823生长及DAPK1基因甲基化的影响

目的观察5．氮杂-2-脱氧胞苷（5-Aza-CaR）对体外培养的胃癌BGC823细胞增生和凋亡的影响及其对此细胞中DAPK1基因的甲基化状态的影响。方法选择浓度为1×10^-6的5-Aza-CdR处理体外培养的BGC823细胞后,用Annexin—v—FITC凋亡检测药物处理后细胞凋亡情况;MSP法检测用药前后细胞中Apaf-1基因的甲基化状态;RT—PCR法检测用药前后细胞中DAPKI的mRNA表达的变化。结果在药物作用24、48、72h后细胞的凋亡率分别为5．83±0．53、9．23±0．58、15．34±0．90,较对照组明显增加（P〈0．05）。DAPK1基因的甲基化状态得到了逆转,DAPK-1基因的mRNA表达得到增加。结论5-Aza—CdR对BGC823细胞具有增生抑制作用,并促进细胞凋亡。DAPK1基因表达情况与其甲基化状态的改变有关。     

5-Aza-CdR对食管鳞癌甲基化基因的影响

目的探讨5-aza-CdR对食管鳞癌甲基化基因的影响。方法应用人类全基因组寡核苷酸微阵列芯片,荧光双交换法检测5-aza-CdR干预的食管鳞癌细胞Eca-109与正常培养的Eca-109细胞中的差异表达基因,并进行生物信息学分析。结果经统计学分析,共筛选获得384个差异表达基因,其中303个基因表达上调,81个基因表达下调;差异基因的功能涉及信号转导、物质合成代谢、细胞周期、细胞增殖、细胞凋亡、DNA转录、DNA复制、DNA修复、氧化还原、物质运输、免疫反应等;上调表达基因中有138个基因分别含有1～5个CpG岛序列,占总上调基因的45.54%。结论5-aza-CdR可以影响食管鳞癌细胞中基因异常的甲基化修饰,调控肿瘤细胞的异常凋亡和分化,为进一步研究食管鳞癌致病分子机制,提供表观遗传学的依据。     

5-Aza-CdR对胃癌细胞系BGC823生长及p27 kipl基因异常甲基化的影响

选择浓度为1×10-6mol/L的5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-Aza-CdR)处理体外培养的BGC823细胞后,用AO染色检测药物处理后细胞增殖情况;MSP法检测用药前后细胞中Apaf-1基因的甲基化状态;RT-PCR法检测用药前后细胞中p27kipl的mRNA表达的变化.结果 显示,药物作用细胞增殖明显受到抑制,p27kipl基因的甲基化状态得到了逆转,p27kipl基因的mRNA表达得到增加.认为5-Aza-CdR对BGC823细胞具有增生抑制作用,p27kipl基因的表达情况与其甲基化状态的改变有关.     

丝裂原活化蛋白激酶特异性小干扰RNA表达载体对结肠癌细胞周期和DNA甲基化的影响

目的 构建丝裂原活化蛋白激酶（MEK）基因的小干扰RNA（siRNA）表达载体，观察其静默效应及对结肠癌细胞SW1116生长周期和DNA甲基化的影响。方法 选择MEK不同靶点寡核苷酸片段，克隆到pGCsilencer真核表达载体中。脂质体转染SW1116细胞，荧光显微镜评估转染效率，G418筛选稳定表达siRNA的细胞。Western印迹法检测siRNA对MEK蛋白表达的静默效果。应用四甲基偶氮唑盐微量酶反应比色法检测细胞生长活力，流式细胞术分析细胞周期，甲基化特异性PCR和DNA测序检测p16^INK4A基因启动子甲基化状态。结果 构建2个靶点的MEK重组质粒，分别转染和联合转染SW1116细胞，转染效率约为72．1％，G418筛选培养2周得到稳定表达MEK siRNA的细胞，MEK蛋白抑制率分别为74．2％和69．1％和90．2％，下游分子ERK蛋白磷酸化水平随之降低；细胞增殖活力下降2～4倍和细胞周期阻滞于G1期，细胞周期负调控冈子p16^INK4A启动子区呈低甲基化状态。结论 MEK特异性siRNA表达载体对结肠癌细胞MEK蛋白表达有一定的静默效果，多靶点联合效果更好，阻滞细胞周期于G1期，促进p16^INK4A基因去甲基化。     

实验性肝纤维化大鼠肝组织CTGF基因DNA甲基化的变化

目的：研究实验性肝纤维化大鼠肝组织结缔组织生长因子（CTGF）启动子DNA甲基化变化及其对CTGF基因表达的影响。方法建立大鼠四氯化碳肝纤维化模型,以HE染色和Sirius red染色评估大鼠肝组织学变化;采用RT-PCR和Western blot法分别检测肝组织CTGF mRNA和蛋白质表达;采用亚硫酸氢盐修饰后测序评估肝组织CTGF基因DNA甲基化水平变化。结果在皮下注射四氯化碳6周时模型组大鼠肝组织呈III级纤维化改变;模型组大鼠肝组织CTGF mRNA及蛋白表达分别为（1.581±0.276）和（0.875±0.102）,均显著高于正常对照组分别为（0.415±0.041）和（0.115±0.083）,（P值均＆lt;0.01）;模型组CTGF基因启动子DNA甲基化率为（1.8±1.8）%,显著低于对照组（11.6±3.8）%,（P＜0.01）。结论肝纤维化大鼠肝组织CTGF基因表达上调,其机制可能与CTGF基因DNA低甲基化改变相关。     

5-Aza-CdR体外诱导胃癌细胞系p16基因去甲基化及表达增强

目的: 观察去甲基化制剂--5-Aza-CdR对体外培养的胃癌细胞SGC7901 p16基因启动子区甲基化状态及表达的影响, 探讨胃癌细胞p16基因失活的机制及去甲基化制剂对p16基因表达的调控.方法:应用不同浓度的5-Aza-CdR(1×10-7, 5×10-7, 1×10-6, 5×10-6 mol/L)处理体外培养的胃癌细胞SGC7901后, MSP法检测用药前后细胞中p16基因的甲基化状态, RT-PCR及 Western-blot法检测用药前后细胞中p16基因mRNA及蛋白表达的变化.结果: p16基因在胃癌细胞系SGC7901中启动子区呈异常甲基化状态, 在mRNA及蛋白水平低表达. 经过1×10-7, 5×10-7, 1×10-6, 5×10-6 mol/L 5-Aza-CdR处理后, p16基因启动子区呈去甲基化状态, 各组mRNA及蛋白表达相应的比值分别与处理前的比例为2.21±0.36, 2.01±0.31;2.82±0.39, 2.22±0.33;2.98±0.42, 3.15±0.43及3.35±0.55, 3.75±0.61.结论:5-Aza-CdR能逆转胃癌细胞p16基因甲基化状态, 调控p16基因表达.     

脱氧核糖核酸甲基化对肝细胞核因子4α表达的影响

目的 探讨DNA甲基化对肝细胞核因子4α(HNF4α)表达的影响,及其在转化生长因子-β1 (TGF-β1)调节HNF4α表达过程中所起的作用.方法 用实时RT-PCR方法检测6种人肝癌细胞株(HepG2、Huh-7、Hep3B、SMMC-7721、BEL-7405、FOCUS)、20份人肝癌和相应癌旁组织中HNF4αP1 mRNA的表达.用亚硫酸盐测序法(BSP法)检测6种人肝癌细胞株中HNF4αP1启动子区甲基化程度.用5-脱氧杂氮胞苷(5-AZA-CdR)处理FOCUS细胞株,用BSP法检测HNF4αP1启动子区甲基化程度,用实时RT-PCR法检测HNF4αP1 mRNA的表达.用TGF-β1处理6种人肝癌细胞株,用实时RT-PCR法检测HNF4αP1 mRNA的表达.分别用5-AZA-CdR、TGF-β1、5-AZA-CdR联合TGF-β1处理FOCUS细胞株,用实时RT-PCR法检测HNF4αP1 mRNA的表达.采用f检验进行统计学分析.结果 在20份人肝癌和癌旁组织中,13份肝癌组织的HNF4αP1 mRNA相对表达量低于癌旁组织(f=2.350,P＜0.05).HepG2、Huh-7、Hep3B中的HNF4αP1 mRNA相对表达量较高,SMMC-7721、BEL-7405、FOCUS中则相对较低.HepG2、Huh-7、Hep3B中HNF4αP1启动子区甲基化程度较低,SMMC-7721、BEL-7405、FOCUS中则较高.随着5-AZA-CdR浓度上升(分别为0、0.1、1.0、2.5 μmol/L),FOCUS的HNF4αP1启动子甲基化程度逐渐降低(分别为61％、46％、32％、27％),而HNF4αP1 mRNA相对表达量则逐渐增加(分别为[(9.661±0.336)×10-7、(2.001±0.432)×10-6、(3.689±0.714)×10-6、(4.732±2.451)×10-6].经TGF-β1刺激后,启动子区甲基化程度较低的HepG2、Huh-7、Hep3B的HNF4αP1 mRNA相对表达量下调(t=12.994、8.441、9.032,P均＜0.01),启动子区甲基化程度较高的SMMC-7721、BEL-7405、FOCUS的HNF4αP1 mRNA相对表达量变化差异均无统计学意义(P均＞0.05).经5-AZA-CdR处理的FOCUS细胞株的HNF4αP1 mRNA相对表达量[(4.972±0.035)×10-6]高于空白对照组[(1.411±0.104)×10-6],差异有统计学意义(t=13.212,P＜0.01).经5-AZA-CdR联合TGF-β1处理的FOCUS细胞株的HNF4αP1 mRNA相对表达量[(1.181±0.132)×10-6]低于单用5-AZA-CdR处理组[(4.972±0.035)×10-6],差异有统计学意义(t=13.873,P＜0.01).结论 肝癌组织中HNF4αP1表达水平下调.DNA甲基化可调控HNF4αP1在人肝癌细胞株中的表达.HNF4αP1启动子区甲基化可抑制TGF-β1对HNF4αP1表达的调节作用.     

多基因甲基化的检测在肝癌早期诊断中的价值

目的检测肝癌患者癌组织中p14、p15、p16、RB基因启动子异常甲基化状况,探讨其在肝癌诊断中的价值。方法采用甲基化特异性PCR（MSP）方法检测44例肝癌组织及其相对应41例肝硬化组织、44例癌旁组织中p14、p15、p16、RB的甲基化状况。对所得结果进行卡方检验,Fisher精准概率分析。结果肝硬化组织中p14、p15、p16、RB 4种基因的甲基化检出率分别为17.1%（7/41）、28.9%（11/41）、36.6%（15/41）和7.3%（3/41）;肝癌组织中4种基因的甲基化检出率分别为34.1%（15/44）,56.8%（25/44）,70.5%（31/44）和27.3%（12/44）。癌旁组织中检测出p16甲基化阳性产物4例,p15阳性产物1例。癌组织和肝硬化组织中4种基因的甲基化率明显高于癌旁组织（P〈0.05）;不同年龄、性别、肿瘤分化程度和临床分期的肝癌患者各个基因甲基化率没有明显差异。结论 p14、p15、p16、RB基因甲基化在肝癌中频发;多基因甲基化的联合检测在肝癌的早期诊断中有一定的价值。     

5-Aza-CdR对人食管癌细胞株中T-cadherin基因表达和细胞增殖的影响

背景：T-cadherin在肿瘤的发生中可能扮演肿瘤抑制基因的角色．在食管癌等多种肿瘤中的表达明显下降。目的：探讨去甲基化制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷（5-Aza-CdR）对人食管癌细胞株EC109中T—cadherin基因表达和细胞增殖的影响。方法：常规培养人食管癌细胞株EC109．并分为5μmol／L5-Aza-CdR组和对照组。以甲基化特异性PCR（MSP）法检测T-cadherin基因启动子区甲基化状态．RT-PCR和蛋白质印迹法分别检测T-cadherinmRNA和蛋白表达,MTr法检测EC109细胞增殖。结果：对照组EC109细胞中T-cadhefin基因启动子区呈异常甲基化状态．5-Aza-CdR干预可逆转甲基化状态。与对照组相比,5-Aza-CdR组T-cadherin基因mRNA和蛋白表达均显著增高（P〈0．01）．细胞增殖明显受到抑制。结论：去甲基化制剂5-Aza-CdR通过逆转食管癌细胞中T-cadherin基因启动子区甲基化状态来增强其表达．并抑制肿瘤细胞增殖．     

5-Aza-CdR对胃癌细胞系生长及Apaf-1基因异常甲基化的影响

目的:观察5-氮杂-2′-脱氧胞苷(5-aza-2′-deoxycitydine,5-Aza-CdR)对体外培养的胃癌SGC7901细胞和BGC823细胞增生、细胞周期和凋亡的影响及其对此两株细胞中Apaf-1基因的甲基化状态的影响.方法:不同浓度5-Aza-CdR处理体外培养的SGC7901细胞和BGC823细胞后,用MTT法检测处理24,48和72 h的细胞增殖活性;PI染色和流式细胞仪检测药物处理后72 h细胞周期分布和细胞凋亡率;MSP法检测用药前后细胞中Apaf-1基因的甲基化状态;RT-PCR法及Western blot法检测用药前后细胞中Apaf-1的mRNA及蛋白表达的变化.结果:1×10-7,5×10-7,1×10-6和5×10-6 mol/L5-Aza-CdR处理SGC7901和BGC823细胞24,48,72 h后,细胞增生受到抑制,有时间和剂量的依赖性.流式细胞仪分析表明,各药物浓度处理72 h后凋亡率增加明显:SGC7901细胞5×10-7,1×10-6和5×10-6 mol/L组分别为2.53%±1.19%,5.93%±0.86%,10.14%±1.51%,与对照组(0.12%±0.03%)相比差异显著(P＜0.05);BGC823细胞5×10-7,1×10-6和5×10-6 mol/L组分别为1.57%±0.26%,4.64%±1.05%,8.21%±1.46%,与对照组(0.57%±0.03%)相比差异显著(P＜0.05).在5-Aza-CdR处理前未检测到SGC7901细胞系及BGC823细胞系的Apaf-1基因的mRNA及蛋白表达,经过5-Aza-CdR处理后,Apaf-1基因在SGC7901细胞系及BGC823细胞系中甲基化状态得到了逆转,Apaf-1基因的mRNA及蛋白重新表达.结论:5-Aza-CdR对SGC7901细胞和BGC823细胞具有增生抑制作用;Apaf-1基因的表达情况与其甲基化状态的改变有关.     

5-氮杂-2′-脱氧胞苷对肺癌SPC-A-1细胞p16、MGMT基因甲基化及其表达的影响

目的观察5-氮杂-2′-脱氧胞苷（5-Aza-CdR）对体外培养的肺癌SPC-A-1细胞p16、MGMT基因启动子区DNA甲基化状态及其表达的影响,探讨肺癌细胞p16、MGMT基因失活的机制及去甲基化制剂对p16、MGMT基因表达的调控。方法 5-Aza-CdR处理体外培养的肺癌SPC-A-1细胞,甲基化特异性PCR（MSP）法检测用药前后细胞p16、MGMT基因的甲基化状态,RT-PCR法检测用药前后细胞p16、MGMT mRNA。结果加入5-Aza-CdR前,SPC-A-1细胞p16、MGMTmRNA表达缺失,其启动子区域表现为DNA甲基化。加入5-Aza-CdR后,SPC-A-1细胞中p16、MGMT基因呈现DNA去甲基化,而且表达缺失的p16、MGMT mRNA重新表达。结论启动子区高甲基化是肺癌细胞p16、MGMT基因失活的主要原因之一,去甲基化制剂5-Aza-CdR能逆转p16、MGMT基因甲基化状态,从而调控p16、MGMT基因表达。     

肝癌细胞对5-氮杂-2'-脱氧胞苷的敏感性与细胞总DNA甲基化水平无关

目的 比较不同肝癌细胞株对5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-aza-dC)的敏感性,探讨肝癌细胞对5-aza-dC的敏感性是否与细胞总DNA甲基化水平有关.方法 用不同剂量(0.5、5.0、10.0μmol/L)的5-aza-dC处理肝癌细胞株(HepG2、QGY7701和HepG2.2.15细胞)及正常肝细胞株L02,比较不同浓度处理前后的细胞增殖抑制率,比较10 μmol/L 5-aza-dC处理前后的Caspase-3活性及细胞DNA片段化水平(5-溴脱氧尿嘧啶核苷掺入率),比较不同细胞总DNA甲基化水平.组间检测结果比较采用t检验.结果 5-aza-dC对HepG2、QGY7701、HepG2.2.15、L02细胞的半数抑制浓度分别为0.5、0.5、4.5、11.4μmol/L,与HepG2细胞和QGY7701细胞相比,HepG2.2.15绌胞和L02细胞对5-aza-dC不敏感.HepG2和QGY7701细胞中Caspase-3的活性升高较L02和HepG2.2.15细胞明显(P值均＜0.05),QGY7701细胞中5-溴脱氧尿嘧啶核苷掺入率升高较L02细胞明显(P＜0.05).L02、HepG2、QGY7701和HepG 2.2.15细胞的DNA总甲基化水平分别为11.7%±0.9%、10.9%±1.3%、11.7%±1.7%和12.2%±1.0%,差异无统计学意义(P值均＞0.05).结论 细胞对5-aza-dC的敏感性与细胞总DNA甲基化水平无关.     

瘦素启动子甲基化在骨关节炎发病中的作用

目的 探讨瘦素启动子甲基化在骨关节炎(OA)发病中的作用.方法 取OA组和对照组(创伤行截肢手术,除外OA等关节炎性疾病)患者膝骨关节标本,培养膝关节软骨细胞,采用不同浓度(5.0 μmol/L、10.0 μmol/L、20.0 μmol/L)不同时间(12 h、24 h、48 h、72 h、96h、120 h、168 h)5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-Aza-CdR)刺激软骨细胞,实时定量PCR检测膝关节软骨细胞瘦素mRNA表达,同时使用Epityper DNA甲基化分析技术枪测该基因启动子部分区域(-280～+79)的甲基化状态.结果 (1)10μmol/L 5-Aza-CdR刺激OA组软骨细胞,其瘦素mRNA表达水平增高,72 h最为显著.(2)OA组5-Aza-CdR刺激72 h后软骨细胞瘦素mRNA表达最高,对照组无5-Aza-CdR刺激软骨细胞瘦素mRNA表达最低.(3)使用非先导分层聚类分析法对瘦素启动子区域进行分析,2组甲基化模式存在差异,且 5-Aza-CdR刺激前后甲基化模式也不相同.结论 瘦素启动子部分位点的去甲基化可能是引起该基因异常表达导致OA发生的始动因素之一.

Abstract：

Objective To investigate the effects of 5-Aza-CdR( methylation transferase inhibitor) on the expression levels of leptin gene in chondrocytes and methylation states of leptin promoter region between osteoarthritis (OA) group and control. Methods The chondrocytes in osteoarthritis group were treated with 5-Aza-CdR with different doses and time-points, and the expression level of leptin was detected by real-time polymerase chain reaction for picking up the optimum dose and time-point. Next, the chondrocytes in 5 osteoarthritis patients and 5 control patients (amputation due to severe trauma) were treated with 5-Aza-CdR. Lastly, leptin mRNA expression levels in the four groups osteoarthritis and control chondrocytes treated with/without 5-Aza-CdR were measured by real-time PCR and the methylation state of promoter region ( - 280- + 79) was detected by epityper quantitative DNA methylation analysis. Results ( 1 ) After treating the chondrocytes in OA groups with 10 μmol/L 5-Aza-CdR for 72 h, the mRNA expression levels of leptin were increased significantly. ( 2 ) The mRNA expression levels of leptin were significantly different among the four groups ( P ＜ 0. 05 ), and the chondrocytes in osteoarthritis groups treated with 5-Aza-CdR showed a marked induction of leptin mRNA expression. (3) Analysis of quantitative methylation data using an unsupervised hierarchical clustering algorithm, showed that methylation patterns of leptin promoter was different between control and osteoarthritis chondrocyte treated with/without 5-Aza-CdR. Conclusion Demethylation of leptin promoter might up-regulate leptin gene expression level and it might contribute to osteoarthritis.     

胰腺癌细胞株HOXA7基因表达及其启动子区甲基化状态

目的 检测HOXA7 mRNA在胰腺癌细胞株中的表达及其启动子区的甲基化状态,探讨两者的相关性.方法 采用RT-PCR法检测人胰腺癌细胞株BxPC3、CFPAC1、PANC1和SW1990细胞的HOXA7 mRNA的表达水平.采用重亚硫酸盐测序PCR(bisulfite sequencing PCR,BSP)和结合重亚硫酸盐的限制性内切酶法(combined bisulfite restriction analysis,COBRA)检测启动子区域甲基化状态.应用去甲基化药物5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-aza-2-deoxycytidine,5-aza-dC)处理各细胞株,检测处理前后细胞HOXA7 mRNA表达和甲基化状态的变化.结果 胰腺癌细胞株BxPC3、CFPAC1和SW1990细胞均表达HOXA7 mRNA,而PANC1细胞不表达HOXA7 mRNA.CFPAC1、BxPC3、PANC1和SW1990中HOXA7启动子甲基化率分别为93.16%、90.65%、90.09%、52.30%,SW1990细胞的HOXA7甲基化率较其他三株细胞均明显降低(P值均＜0.01).经5-aza-dC处理后,PANC1细胞的HOXA7 mRNA重新表达,BxPC3的HOXA7 mRNA表达增强;而CFPAC1和SW1990细胞的HOXA7 mRNA在5-aza-dC处理前后无明显变化.结论 胰腺癌细胞株BxPC3和PANC1细胞的HOXA7mRNA表达与启动子区甲基化状态密切相关,而CFPAC 1和SW1990细胞两者无明显相关性.     

5-脱氧杂氮胞苷预防二甲基肼诱发小鼠大肠癌的研究

目的探讨二甲基肼（DMH）诱导小鼠大肠癌模型中5-脱氧杂氮胞苷（5-aza—dC）预防肿瘤发生的作用机制。方法80只ICR小鼠分为4组，每组20只。包括空白对照组、5-aza—dC对照组、DMH诱癌组和5-aza-dC干预组。处理20周后观察其对肿瘤发生率的影响。实时定量PCR检测Dnmt1、Dnmt3a、Dnmt3b基因和抑癌基因p27^Kip1的表达。结果通过5-aza-dC干预能使诱导的大肠肿瘤发生率从95％降至35％，肿瘤数目（个）由9．43±4．21减少到3．98±2．95，肿瘤最大直径（单位：mm）由6．43±5．12缩小到3．44±2．11，差异有统计学意义（P〈0．05）。实时定量PCR检测发现肿瘤组织中存在Dnmt1和Dnmt3b的高表达，而p27^Kip1的表达量降低。5-aza—dC可以通过抑制甲基化酶活性，防止p27^Kip1基因的高甲基化失活。结论5-aza-dC可以显著降低DMH诱发小鼠大肠癌的发生率，阻止抑癌基因的高甲基化失活可能是5-aza-dC预防肿瘤的重要机制。     

APC promoter methylation and protein expression in hepatocellular carcinoma

Purpose We investigated the impact of promoter methylation on APC protein expression in patients with hepatocellular carcinoma (HCC). Materials and methods 50 patients [HCC (n=19), liver metastasis (n=19), cholangiocellular cancer (n=7), and benign liver tumors (n=5)] were studied for methylation using Methylight analysis. APC mutation was investigated by protein truncation test and direct sequencing of genomic DNA. The protein expression was evaluated by immunohistochemistry and Western blot analysis. Results The APC promoter was hypermethylated in 81.8% of non-cancerous liver tissue samples. All HCC samples and ten patients with liver metastasis (52.6%) exhibited APC promoter methylation. The degree of methylation was significantly higher in samples from HCC compared to the non-cancerous liver tissue samples (63.1% vs. 24.98%; p=0.001). The level of APC protein expression was significantly reduced in HCC samples compared to that of the corresponding non-tumor liver tissue (p<0.05). Conclusions Promoter methylation of the APC gene seems to be of significance in hepatocarcinogenesis and results in reduced protein expression in HCC. Interestingly, APC promoter methylation is also present in the vast majority of non-cancerous liver tissue whose (patho)physiological function remains unresolved.