肺炎衣原体荧光PCR检测方法的建立和应用

目的采用Taqman探针技术,组建肺炎支原体荧光PCR基因检测方法。方法对GenBank登录的肺炎衣原体的基因序列进行生物信息学分析,针对保守区域设计引物和探针,组建实时荧光PCR检测方法。对来自本院的560份临床咽拭子样本和肺泡冲洗液样本进行检测。采用流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒和腺病毒进行特异性评价。结果本实时荧光PCR方法对甲型流感病毒(甲型、乙型)、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、呼吸道腺病毒无特异性反应。本院的临床样本检出26份,其中咽拭子9份,肺泡冲洗液17份。结论肺炎支原体荧光PCR检测方法可用于肺炎衣原体感染的辅助诊断。     

2011-2013年龙岗区常见7种呼吸道病毒监测结果分析

目的对龙岗区呼吸道病毒感染病例样品进行检测,并对其流行特征进行分析。方法在区内哨点医院采集呼吸道感染病例咽拭子889份,用实时荧光定量PCR法对流感病毒(A型、B型)、腺病毒(ADV)、人鼻病毒(HRV)、副流感病毒(PIV-1、PIV-2和PIV-3亚型)、呼吸道合胞病毒(RSV-A和RSV-B亚型)、冠状病毒(CoV-229E、CoV-OC43、CoVNL63和CoV-HKU1亚型)和人偏肺病毒(hMPV-A和hMPV-B亚型)共7种呼吸道病毒15个亚型进行检测。结果流感病毒是龙岗区最常见的呼吸道感染病原,其次是人鼻病毒;1~7月呼吸道病毒阳性率保持较高水平;≤5岁儿童对各种病毒易感;鼻病毒和腺病毒是混合感染中最常见的病原。结论应继续加强常见呼吸道病毒的监测,对呼吸道传染病的预防和控制具有重要意义。     

银川市6种呼吸道病毒感染监测分析

目的 了解银川市1100例急性呼吸道感染患者中6种呼吸道病毒的感染情况，为疾病监测和疫情防控的制定提供依据。方法 选取2021年银川市2家流感监测哨点医院采集的流感样病例咽拭子标本，使用多重实时荧光定量PCR检测6种呼吸道病毒(呼吸道副流感病毒Ⅰ/Ⅲ型、呼吸道腺病毒、人偏肺病毒、人鼻病毒、呼吸道合胞病毒),分析各呼吸道病毒病原体的感染情况。结果 1100例呼吸道标本中共检出248例阳性标本(22.55%),其中混合感染检出14例(1.27%),共有8种混合类型。单一病毒感染的阳性标本中，鼻病毒最为常见，阳性率为7.64%,其次为合胞病毒，阳性率为4.64%。0～5岁患儿感染总阳性率较高，不同性别的呼吸道病毒感染总阳性率比较，差异无统计学意义(P>0.05)。各年龄组间阳性率比较，差异有统计学意义(P<0.05)。不同季节间阳性率比较，差异有统计学意义(P<0.05)。结论 银川地区引起患者呼吸道感染的主要病毒为鼻病毒，多发生于5岁以下儿童，建议加强宣传常见呼吸道传染病防控知识，利用流感监测网络实验室开展呼吸道多病原的监测。     

深圳市儿童呼吸道腺病毒4型暴发流行的病原学研究

目的探讨深圳市某幼儿园一起急性呼吸道感染暴发的流行特征及病因。方法使用荧光定量PCR方法对采集的17份患儿咽拭子进行流感样病例筛查,筛查后的阴性样本进一步进行呼吸道腺病毒核酸检测,对检测出的5份腺病毒阳性标本进行病毒分离,感染Hep-2受体细胞后共获得4份腺病毒稳定细胞毒株,用腺病毒六邻体基因作为靶基因进行序列扩增及测定,测序结果在GenBank上进行序列比较,确定其病毒亚型并进行系统进化分析。结果 17份咽拭子中5份为腺病毒PCR阳性,阳性率为29.4%,用分型引物检测并分析序列确定均为腺病毒4型。结论本次急性呼吸道病毒疫情暴发由腺病毒4型引起。     

2015-2016年某区部队呼吸道传染病病原监测数据分析

目的监测某区部队急性呼吸道传染病病原活动水平和流行动态,了解急性呼吸道传染病的病原谱构成,为部队卫生防病工作提供科学依据。方法对某区疾控中心和基层医院采集的流感样(influenza-like illness,ILI)病例进行监测分析,并完成病原谱的构建。结果某区疾控中心与基层医院共接收流感样病例鼻咽拭子1 161份,PCR检出阳性312份,总阳性检出率26.87%。其中疾控中心接收鼻咽拭子样本570份,检出阳性145份,阳性检出率25.44%;样本采集量于1、2月达到高峰。阳性率在3月左右达到高峰,比ILI病例高峰出现时间延后1~2个月。基层医院接收样本591份,检出阳性167份,阳性检出率28.26%。样本采集量近3月左右达到高峰。阳性率在2月左右达到高峰。病原主要以乙型流感病毒和甲型流感病毒为主,腺病毒及其他病毒亚型为辅,其中甲型以H3和H1N1两种亚型为主。结论本研究初步描述了某区部队发热病例常见呼吸道病毒病原谱,分析了呼吸道病毒性感染的流行病学分布,将对部队呼吸道病毒性疾病的临床诊治、传染病防控提供基础资料和参考。     

检测肺炎支原体的实时荧光PCR方法的建立

目的 采用Taqman探针技术,组建肺炎支原体荧光PCR基因检测方法.方法 对GenBank登录的肺炎支原体的基因序列进行生物信息学分析.针对16s核糖体蛋白基因的保守区域设计引物和探针,组建实时荧光PCR方法检测.采用流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒和腺病毒进行特异性评价.采用倍数稀释的方法进行灵敏度的评价.对来自南方医院的522份临床咽拭子样本进行检测.结果 用实时荧光PCR方法检测甲型流感病毒(甲型、乙型)、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、呼吸道腺病毒均无特异性反应.该方法可以检测出稀释浓度约为103/mL的肺炎支原体样本.对本院的临床样本检出39份.结论 实时荧光PCR检测肺炎支原体具有较高的特异性和灵敏度,可用于肺炎支原体感染的诊断.     

深圳市一起腺病毒4型感染聚集性疫情的分子流行病学调查

目的 分析2019年2月22-28日深圳市宝安区某小学一起急性呼吸道病毒感染聚集性疫情的流行病学及病原学特点.方法 采用流行病学个案调查表对疫情进行现场调查,使用荧光定量PCR方法对采集的咽拭子标本进行流感样病例病原学筛查,筛查阴性标本进行6种常见呼吸道病毒核酸检测.对腺病毒核酸阳性的标本,用腺病毒六邻体基因作为靶基因...     

部队常见的几种呼吸道传染病病原研究进展

流感病毒、腺病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒和冠状病毒是军队呼吸道传染病的常见病原类型。为给军队传染病监测和防控提供理论依据,笔者对以上几种常见的呼吸道病毒最新研究进展进行了总结,以期为有效控制军队呼吸道传染病疫情提供科学指导。     

2009年海南省甲型H1N1流感病毒核酸检测结果

目的及时了解海南省2009年流感样病例及其密切接触者中甲型H1N1流感病毒感染情况。方法应用实时荧光定量PCR法对呼吸道鼻咽拭子标本中的流感病毒核酸进行定性检测。结果全年共检测哨点监测和爆发疫情标本1 148份,荧光定量PCR法检测结果：流感病毒A型核酸阳性为686份,B型核酸阳性为7份。流感样病例中流行型别以A型为主,占59.6%;A型中甲型H1N1流感病毒核酸阳性为500例,占72.9%（500/686）,其中学生占84.8%（424/500）。10月-11月份达到流行高峰。随机抽取30份核酸阳性标本进行核酸序列测定,27份为甲型H1N1流感病毒。结论 2009年海南省流感样病例中甲型H1N1流感病毒感染主要以学生为主,开展流感病毒核酸检测,有助于尽早了解流感样病例中流感病毒感染情况,为及时了解甲型H1N1流感疫情的动态变化以及制定科学有效的甲型H1N1流感防控策略提供可靠的实验室依据。     

深圳市龙岗区2011～2012年流感样病例呼吸道病毒病原学分析

目的 了解深圳市龙岗区流感样病例病原学现况,为呼吸道传染病的预防控制提供依据. 方法 2011 ～2012年采用实时荧光定量PCR法,检测龙岗区801份流感样病例咽拭子样本的流感病毒、腺病毒、鼻病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、冠状病毒和人偏肺病毒等7种病毒共15个亚型. 结果 流感样病例的病毒总阳性率为52.4％(420/801),其中FLU-A检出率最高(27.8％),其后依次为FLU-B(15.7％)、HRV(3.6％)、ADV(2.2％)、RSV-A(1.0％)、PIV-1(0.6％)、RSV-B和CoV-OC43(0.4％)、CoV-229E和hMPV-A(0.2％)、hMPV-B(0.1％),而PIV-2、PIV-3、CoV-NL63和CoV-HKU1四个亚型未检出.7种常见呼吸道病毒检出率高峰分别在2011年2月(69.9％)和2012年1月(85.0％).7种常见呼吸道病毒以春夏季多发,春夏季与秋冬季比较差异有统计学意义(p＜0.05).FLU以春夏季多发,春夏季与秋冬季比较差异有统计学意义(P＜0.05); HRV以冬季多发,冬季与春夏秋季比较差异有统计学意义(P＜0.05);ADV、PIV、RSV、CoV、hMPV全年基本为散发分布.不同年龄组的病毒阳性率差别有统计学意义(P＜0.05),其中,其中0～4岁组7种常见呼吸道病毒均有检出,5岁以上组主要以FLU为主. 结论 加强常见呼吸道病毒监测对呼吸道传染病的防控具有重要意义.