基于网络药理学和分子对接技术探讨附子-白芍配伍治疗抑郁症的作用机制

目的:利用网络药理学方法和分子对接技术探讨附子-白芍配伍治疗抑郁症作用机制.方法:通过TCMSP和TCMID数据库筛选出附子和白芍的活性成分及相关靶点,使用DisGeNET、GeneCards等数据库筛选出抑郁症的潜在靶点,得到活性成分与疾病的交集靶点,以STRING数据库对活性靶点构建蛋白互作网络(PPI),使用R语...     

基于网络药理学探讨白芍治疗贫血的机制

目的基于网络药理学探讨白芍治疗贫血的作用机制。方法通过TCMSP数据库找出白芍主要化学成分,查阅文献进行补充,筛选出候选药效成分,采用Swiss TargetPrediction和Stitch预测与药效成分相关的生物大分子,收集DrugBank上已有的靶点,并利用GeneCards等数据库获取与贫血相关的靶标,筛选出两者之间的共有靶点,选择关键靶点进行GO富集及KEGG分析,分子对接验证网络分析结果。结果白芍主要化学成分有85种,筛选后获得核心靶点14个,TNF、MAKP8、IL?6等可能为关键靶点;生物功能43个,涉及生物合成与代谢、细胞增殖与凋亡、信号通路正/负调节等;通路10个,糖尿病AGE?RAGE信号通路、IL?17信号通路、TNF信号通路等可能为关键通路,百日咳、乙型肝炎等疾病也可能间接影响贫血的过程;分子对接表明白芍多数成分与核心靶点具有较好的对接能力,说明预测结果具有一定的可靠性。结论本研究初步探讨白芍治疗贫血的潜在活性成分和可能的作用机制,可为深入考察其药效物质基础和作用机制提供理论依据。     

基于网络药理学和分子对接探讨鸡血藤治疗肺癌的分子作用机制

通过网络药理学和分子对接方法探讨鸡血藤治疗非小细胞肺癌的分子机制研究.以中药鸡血藤Spatholobi Caulis为对象,通过在中药药理学系统分析平台(TCMSP)数据库中获得鸡血藤中活性成分和相应潜在的药物靶点,利用GeneCards数据库收集癌症相关基因,借助Cytoscape软件构建鸡血藤活性成分-作用靶点-通...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨罗汉果治疗糖尿病的作用机制

目的：运用网络药理学和分子对接技术探讨罗汉果治疗糖尿病的作用机制。方法：通过TCMSP平台和Swiss Target Prediction数据库筛选出罗汉果的活性成分及其靶点;利用GeneCard、TTD、OMIM数据库筛选出糖尿病潜在靶点;采用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-活性成分-疾病-靶点的可视化网络;通过STRING数据库对关键靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用Autodock4和Pymol软件对关键活性成分和关键靶点进行分子对接分析和可视化。结果：筛选出有效成分18种,糖尿病靶点146个。GO功能富集分析得到GO条目572条,KEGG通路富集分析得到信号通路167条。分子对接结果显示β-谷甾醇、山柰酚、罗汉果醇等关键活性成分与原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC)等关键靶点的亲和力较高。结论：罗汉果通过多靶点、多通路发挥抗糖尿病的作用,其关键活性成分通过与SRC、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK-3)等靶点调节晚...     

基于网络药理学探讨白芍治疗慢性萎缩性胃炎的分子机制研究

目的：采用网络药理学方法,对白芍治疗慢性萎缩性胃炎（Chronic Atrophic Gastritis, CAG）的作用机制进行探讨。方法：运用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获得白芍有效活性成分与相应靶点信息。通过GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库搜集CAG的相关靶标信息,并通过Venny 2.1.0取得药物与疾病靶点的交集。分别采用Cytoscape 3.7.1、STRING数据库绘制“药物活性成分-靶点”网络图与蛋白质-蛋白质相互作用网络图,行可视化处理。借助DAVID数据库行基因本体论（GO）功能、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后用软件Cytoscape 3.7.1绘制“药物成分-靶点-通路-疾病”网络。结果：得到白芍活性成分8个、作用靶点72个,疾病靶点972个,二者交集34个。关键活性成分有山柰酚、β-谷甾醇、儿茶素,关键靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、肿瘤坏死因子、白细胞介素-6等;白芍主要通过参与凋亡过程阳性调节、对药物的反应、炎症反应等生物过程...     

基于网络药理学和分子对接技术的银柴胡解热作用机制探讨

目的：采用网络药理学与分子对接技术探讨银柴胡解热作用的机制。方法：借助中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、中医药整合药理学研究平台（TCMIP）和中药分子机制生物信息学分析工具（BATMANTCM）筛选银柴胡活性成分和相关作用靶点;使用GeneCards、OMIM和TTD数据库筛选发热相关靶点;通过STRING数据库构建活性成分靶点与发热疾病靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;利用Cytoscape软件的Network Analysis插件对获得的PPI网络进行拓扑分析,筛选核心节点;使用Venny软件获得银柴胡活性成分靶点、发热疾病靶点和核心节点的交集靶点,并通过进一步的拓扑分析筛选得到关键成分和关键靶点;通过DAVID数据库进行基因本体（GO）功能注释和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用Schr?dinger软件对关键靶点与对应的关键成分进行分子对接。结果：银柴胡解热关键成分为银柴胡胺D和银柴胡新木质素-β-D-葡萄糖苷A～D,71个关键靶点主要包括促丝裂原活化蛋白激酶10 (MAPK10)、蛋白激酶B1 (Akt1)、热休克蛋白90AA1(HS...     

基于网络药理学和分子对接探讨逍遥散抗抑郁的作用机制

目的：采用网络药理学和分子对接技术深入研究逍遥散抗抑郁的机制，为临床诊断与治疗提供理论上的依据。方法：首先使用TCMSP检索柴胡、当归、白芍、白术、茯苓、甘草、干姜、薄荷的主要活性成分，并筛选出口服生物利用度≥30%、类药性≥0.18的中药作用靶点，再使用GeneCards、Pharm Gkb、TTD、DrugBank等数据库系统筛选出抑郁症的有关靶点，并获取交集基因，将抑郁症的相关基因与逍遥散的有效活性成分进行交集，最后使用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络，使用Cytoscape 3.8.0应用软件查找PPI网络系统核心，构建“中药-疾病-靶点”通路，进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后运用Pymol软件对逍遥散的有效活性成分与抑郁症疾病靶点进行分子对接。结果：获得逍遥散有效活性成分161种；逍遥散抗抑郁靶点2588个，其中核心靶点6个；GO生物过程2247条，KEGG通路179条。分子对接结果显示，逍遥散中柚皮素、利可查尔酮、木犀草素、槲皮素均能较好地与抑郁症靶蛋白结合。结论：逍遥散抗抑郁的潜在药理学机制及其活性化合物...     

基于网络药理学和分子对接探讨左金丸治疗肝癌的作用机制

目的:运用网络药理学和分子对接方法探讨左金丸治疗肝癌的作用机制.方法:从TCMSP和BATMAN-TCM数据库获取左金丸的化合物及其相应靶点,检索GeneCards、OMIM和TTD 3个数据库获得肝癌的相关靶基因,取两者靶基因交集得到左金丸治疗肝癌的预测靶基因;运用Cytoscape 3.7.1软件构建左金丸-化合物-靶点-肝癌和PPI网络图;运用R软件对预测靶基因进行GO和KEGG富集分析;最后运用分子对接技术对关键化合物和靶点进行验证.结果:共获取左金丸35个化合物及173个相应靶点,左金丸与肝癌的共同靶点有103个.PPI结果表明AKT1、MAPK1、TP53、JUN和RELA可能为左金丸治疗肝癌的关键靶点.富集分析示左金丸可能通过乙型肝炎、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、人巨细胞病毒感染、丙型肝炎、MAPK信号通路、肝癌等信号通路抗肝癌.分子对接结果示槲皮素和黄连素均能与AKT1和MAPK1稳定结合.结论:本研究初步揭示了左金丸通过多成分、多靶点、多通路治疗肝癌的作用机制,为后续左金丸治疗肝癌提供理论参考.     

基于网络药理学和分子对接技术探究半夏治疗肺癌的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接技术探究半夏治疗肺癌的关键作用靶点。方法：在TCMSP数据库中检索半夏的活性成分和靶点,以“lung cancer”为关键词在DisGeNET数据库检索,物种为“Homo sapiens”,检索出肺癌的相关基因,构建靶标蛋白互作（PPI）网络。分别在Metascape平台和HIPLOT数据库平台对核心靶点进行分析,将物种设置为人,进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析,并用AutoDock Tools进行分子对接验证。结果：通过TCMSP数据库,检索到半夏活性化合物13种,潜在基因97个靶点。半夏治疗肺癌潜在作用靶点39个,主要有TP53、AKT1、HIF-1α和VEGFA等。按照P <0.05进行筛选,GO功能富集分析涉及对氧化应激、活性氧、缺氧反应等生物过程,细胞组分及分子功能主要涉及蛋白激酶调节活性、激酶调节活性、蛋白磷酸酶2A结合、过氧化物酶活性、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶复合物和蛋白激酶复合物等。KEGG信号通路富集分析,按照P <0.05进行筛选,主要涉及癌症通路、肿瘤蛋白多糖、PI3K/Akt信号通路、癌症的MicroRNAs...     

基于HPLC指纹图谱的白芍及酒白芍比较分析

目的:建立白芍及酒白芍的高效液相色谱法(HPLC)指纹图谱,结合出膏率和指标性成分含量测定,评价白芍炮制前后的质量属性。方法:采用HPLC,以InertSustainSwift~(TM)C_(18)(250 mm×4.6 mm,5μm)为色谱柱,乙腈-0.1%磷酸溶液为流动相梯度洗脱,检测波长为230 nm,柱温为30℃,体积流量为1.0 m L·min~(–1),进样量为15μL,分别建立白芍药材及炮制品酒白芍的指纹图谱;采用HPLC测定炮制前后样品中芍药苷的含量;运用指纹图谱相似度评价方法,结合出膏率及指标性成分含量测定对白芍和酒白芍进行比较研究。结果:建立了白芍及酒白芍的HPLC指纹图谱,标定了30批次样品的8个共有峰。15批白芍及15批酒白芍与各自的对照图谱比较相似度分别为0.988～0.999和0.991～0.999,生品与炮制品比较相似度达0.999。炮制前后出膏率平均变化幅度为2.45%。含量测定结果表明,炮制前后芍药苷质量分数变化为–2.13%～0.49%。结论:建立的方法可对白芍及酒白芍的质量属性进行有效评价,具有一定的应用价值。     

赤芍与白芍的药理作用比较

目的:对赤芍和白芍的80%乙醇提取物及其脂溶性成分和水溶性成分进行药理活性比较,为阐明其药效物质奠定基础。方法:以二甲苯致小鼠耳肿胀法和醋酸致小鼠腹腔毛细血管渗出法比较赤芍和白芍的抗炎作用;以血液流变学指标和ADP诱导血小板聚集比较赤芍和白芍的活血化瘀作用。结果:赤芍与白芍的提取物及其脂溶性和水溶性成分均有不同程度的抗炎以及抑制血小板聚集作用,均有明显延长部分凝血活酶时间的作用,而均无明显延长凝血酶原时间的作用。结论:白芍总提物对抑制炎性水肿和炎性渗出均有很好的效果,而在抑制血小板聚集方面,赤芍总提物的作用明显优于白芍总提物。     

基于特征图谱结合色彩图像技术的白芍与炒白芍差异研究

目的 通过超高效液相色谱法（UPLC）特征图谱、色度值,比较白芍与炒白芍的差异。方法 采用UPLC建立白芍药材与炒白芍的特征图谱,并采用SIMCA 14.0软件进行主成分分析（PCA）、正交偏最小二法乘-判别分析（OPLS-DA）;采用色差仪获取白芍药材与炒白芍的色度值（L^*、a^*、b^*）,获取色差范围。结果 白芍药材的UPLC特征图谱共标定15个共有峰,炒白芍的UPLC特征图谱共标定17个共有峰。PCA共提取4个主成分,累积方差贡献率为86.7%,15批白芍药材与炒白芍在OPLS-DA模型中分类聚集明显。色彩图像分析中炒白芍与白芍药材的色差值（△E^*）为8~20,白芍药材的b^*_白芍为1~7,炒白芍的b^*_炒白芍为9~21。结论 该方法稳定、可靠、精密度高、重复性好、色彩图像分析简单直观,可量化炮制程度,并为炮制品质量控制研究提供参考。     

基于网络药理学的白芍-柴胡药对治疗肝细胞癌作用机制探析

目的探究白芍-柴胡药对治疗肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的有效活性化合物及其靶点的作用机制。方法本研究通过TCMSP数据库筛选出白芍-柴胡药对中的化合物以及相关靶点蛋白,并运用Uniprot数据库和Genecard数据库查询与靶点蛋白相对应的人类基因名称,进行标准化处理;通过Genecards数据库挖掘肝细胞癌疾病靶点,将其与中药靶点蛋白映射;将映射出的药对治疗HCC的有效靶点导入Cytoscape 3.2.1构建网络图,并运用CTD数据库进行GO富集和KEGG通路富集。结果获得白芍-柴胡药对治疗HCC的共22个成分和170个有效靶点;获得16条GO生物过程和7条相关信号通路,涉及代谢通路(Metabolic pathways)、Ras通路(Ras signaling pathway)、PI3K-Akt信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)等。结论白芍-柴胡药对活性靶点主要通过代谢通路、Ras信号通路、PI3K-Akt信号通路调控肝癌细胞过程及其代谢来发挥治疗作用,为后续实验提供了思路与依据。     

An Exploration in the Potential Substance Basis and Mechanism of Chuanxiong Rhizoma and Angelicae Dahuricae Radix on Analgesia Based on Network Pharmacology and Molecular Docking

Objective: The objective was to study the potential substance basis and action mechanism of Chuanxiong Rhizoma(CX) and Angelicae Dahuricae Radix(AD) on analgesia through network pharmacology and molecular docking. Materials and Methods: The active components and targets of CX and AD and pain-related genes were retrieved through Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform(TCMSP) and GeneCards database. Then, the co-action targets were found, protein–protein interaction network was constructed by the String database. The Cytoscape 3.7.1 was used to construct "CX-AD-active components-pain" network. Further enrichment analysis of Gene Ontology(GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG) was carried out to predict its mechanism of action, the top four active components in the network were docked with the targets. Results: There are 26 compounds, 45 targets in the network. Among them,(Z)-ligustilide and beta-sitosterol, respectively, have more potential targets in CX and AD, and prostaglandin-endoperoxide synthase(PTGS2), PTGS1 have more ligands. GO analysis shows that molecular functions of CX and AD mainly performed through the G protein-coupled amine receptor activity, adrenergic receptor activity, and catecholamine binding. KEGG analysis indicates that they could exert analgesic effect on the pathways of regulating neuroactive ligand-receptor interaction, serotonergic synapse, and cGMP-PKG signaling pathway. Molecular docking results show that the active compounds are highly compatible with the structure of the protein receptor, and they interact through the hydrogen bond and π–π bond between the ligand and the active site residues. Conclusions: Through network pharmacology and molecular docking, this study preliminarily revealed the main active components, targets, and potential regulation network of CX and AD, providing a reference for the subsequent experimental research.     

赤芍与白芍脐中穴给药的药理作用比较研究

目的：探讨赤芍与白芍脐中穴给药药理作用差异。方法：选择脐中穴为给药部位,考察赤芍、白芍贴膏剂脐中穴贴敷对二甲苯所致小鼠耳肿胀、醋酸致小鼠扭体反应以及ADP和凝血酶诱导的血小板聚集的影响。结果：与空白对照组比较,赤芍贴膏剂组有显著的镇痛和抑制血小板聚集作用（P〈0.05）,白芍贴膏剂组具有显著的镇痛作用（P〈0.05）,散结镇痛胶囊及桂枝茯苓贴膏剂有显著的抗炎、镇痛及抗血小板聚集作用（P〈0.05）,赤芍、白芍贴膏剂组对二甲苯致小鼠耳肿胀和空白组相比虽无显著性差异,但都呈一定作用趋势。桂枝茯苓贴膏剂组与赤芍贴膏剂组相比,也都有作用增强趋势,但无显著性差异。结论：赤芍脐中穴给药具有止痛、抗血小板聚集作用,白芍脐中穴给药具有止痛作用。     

白芍高效液相色谱指纹图谱的研究

目的研究白芍的高效液相色谱指纹图谱,为科学评价及有效控制其质量提供可靠方法。方法利用HPLC方法,梯度洗脱,测定了21批白芍样品。色谱条件为:Hypersil C18柱(4.6 mm×200 mm,5μm),流速1.0 ml/min,柱温25℃,流动相A为乙腈;流动相B为0.05%磷酸水,流动相A梯度洗脱(95%~65%乙腈),分析时间为60 min,时间为0,15,25,60 min,A(%)为95%,86%,86%,65%。结果21批白芍样品获得包括芍药苷(7号峰)在内的14个共有峰。聚类分析和相似度分析结果一致。结论白芍的指纹图谱特征性及专属性强,可用于全面控制白芍的质量,确保每批产品的均一性。     

赤芍与白芍抗血小板凝集作用的UPLC-MS代谢组学初步研究

目的:利用代谢组学方法研究赤芍和白芍的抗血小板凝集功能及对大鼠内源性代谢物的影响.方法:赤芍和白芍各给药6d后,观察赤芍和白芍对大鼠血小板凝聚功能的影响,并采用超高效液相色谱-电喷雾质谱(UPLC-MS)技术分析大鼠血清代谢物指纹图谱,采用偏最小二乘判别分析法研究给药组与正常组之间的代谢物组差异,寻找可能的生物标识物.结果:连续给予赤芍和白芍提取物6d后,能显著降低大鼠血小板最大凝集率水平,且赤芍组与白芍组组间有明显差别(P<0.01).α-酮戊二酸、苹果酸、白细胞三烯A4、前列腺素E2、前列腺素F2.等内源性生物标识物对于表征赤芍、白芍的抗血小板凝聚作用具有重要的作用.结论:代谢组学研究可以深人探讨赤芍和白芍的抗血小板凝聚机制.     

赤芍与白芍的化学成分含量比较研究

 目的通过对不同产地赤芍和白芍主要化学成分的含量测定及比较，进一步完善芍药野生品与栽培品药材的质量控制标准。方法采用高效毛细管电泳法(HPCE)的胶束电动色谱(MEKC)分离模式，测定了16个产地20个赤、白芍样品中的4个有代表性的活性成分：芍药苷、苯甲酸、D-儿茶素和没食子酸，并比较各成分之间的比例关系。结果①野生芍药根(赤芍)中芍药苷含量大于6％，D-儿茶素含量高于0.05％。未加工的栽培芍药根中芍药苷含量小于6％，未检测到D-儿茶素。在同样条件下，加工后的栽培芍药根(白芍)中芍药苷含量下降了37%～56%，仍未检测到D-儿茶素，苯甲酸的变化最大，下降达83%～92%。②内蒙古多伦赤芍与大、小兴安岭所产赤芍在化学成分的种类和含量上存在差异。③不同产地、特别是道地与非道地的白芍药材之间，化学成分的比例有所不同。结论运用HPCE技术，可以快速准确地对野生与栽培芍药根的活性成分差异进行定量分析。从而为区别同为芍药来源的赤芍和白芍的临床应用提供实验依据。