TNIP1基因多态性与中国北方汉族寻常性银屑病关联性分析

目的 探讨人肿瘤坏死因子α诱导蛋白3（TNFAIP3）相互作用蛋白1（TNIP1）基因多态性与中国北方汉族人寻常性银屑病的遗传关联性。 方法 收集寻常性银屑病患者465例,健康对照476例。受试者知情同意后采集外周静脉血5 ml。选择位于TNIP1基因区域的3个单核苷酸多态性（SNP）,即rs17728338、rs3762999和rs999556,利用连接酶检测反应基因分型。利用PLINK1.07软件进行统计分析,卡方检验比较病例组及对照组等位基因频率及基因型频率,计算等位基因的相对危险度估计值比值比OR及其95%可信区间（95% CI）。对 3个SNP间进行连锁不平衡检验,计算两两间的r2和D′值。 结果 位于TNIP1基因区域的3个SNP在病例组和对照组中等位基因频率分布存在差异,但rs3762999和rs999556未达到Bonferroni校正水平。在显性模式下,rs3762999、rs999556的基因型频率在病例组和对照组间差异有统计学意义,达到Bonferroni校正水平（P < 0.016 7）。分层分析发现,3个SNP的等位基因频率、基因型频率在有家族史寻常性银屑病患者与健康对照组间的差异均具有统计学意义（均P < 0.016 7）,rs17728338等位基因A的频率在寻常性银屑病组及各型（早发型、晚发型、有家族史、无家族史）病例组均显著高于对照组（均P < 0.0167）。rs3762999与 rs999556间存在强连锁不平衡（r2 = 0.910,D′ = 0.982）,rs17728338与rs3762999和rs999556之间有中等程度的连锁不平衡（r2分别为0.371和0.353,D′分别为0.989和1）。 结论 TNIP1基因多态性rs17728338、rs3762999及rs999556与汉族人寻常性银屑病具有相关性。     

IL-12B和IL-23R基因多态性与中国汉族人银屑病易感性关联研究

目的 探讨中国汉族人群中IL-12B和IL-23R基因多态性与银屑病易感性的关系。方法 在217例银屑病患者和288例正常人对照中,采用DNA直接测序法对IL-12B和IL-23R基因的多态性位点进行基因分型,并将阳性结果在一个更大的包括578例银屑病患者和1422例正常人对照的整合样本群中,使用Taqman探针荧光PCR技术进行重复检验。实验数据进行Hardy-Weinberg平衡检验、卡方检验、单倍型分析和Logistic回归模型分析。结果 IL-12B rs6887695位点等位基因频率在病例组与对照组之间差异有统计学意义,OR = 1.33（95% CI 1.03 ~ 1.73）,P = 0.028;IL-23R rs11465817和rs1343152位点等位基因频率在病例组与对照组之间差异无统计学意义（P > 0.05）。连锁不平衡分析发现,rs11465817和rs1343152位点之间有一定的连锁不平衡（D′ = 0.744,r2 = 0.281）。对2个位点进行单倍型分析发现,A-A ∶ OR = 2.890,P = 0.0018,提示这一单倍型具有显著的发病风险。结论 IL-12B基因rs6887695多态性与中国汉族人群银屑病易感性相关;IL-23R基因rs11465817、IL-23R基因rs1343152位点多态性与中国汉族人群银屑病易感性无显著相关性,但是,IL-23R基因rs11465817-rs1343152位点A-A单倍型的中国汉族人具有更高的银屑病发病风险。     

内蒙古蒙古族和汉族人群白细胞介素12通路相关基因多态性与寻常型银屑病相关性及与HLA-Cw*0602交互作用研究

【摘要】 目的 探讨白细胞介素12（IL-12）通路相关基因多态性与内蒙古蒙古族和汉族寻常型银屑病患者的遗传相关性及与HLA-Cw*0602的交互作用。方法 收集2012年12月至2018年3月于内蒙古医科大学附属医院住院的寻常型银屑病患者1 409例为病例组,其中汉族1 030例,蒙古族379例,健康对照组1 483例,其中汉族965例,蒙古族518例。采集受试者外周静脉血5 ml提取DNA,选择位于IL-12B（rs2082412、rs2288831、rs3212227、rs3213094、rs7709212）、IL-23R（rs11209026、rs2201841、rs7530511）、IL-28RA（rs4649203）基因区域的9个单核苷酸多态性（SNP）,利用二代测序法进行基因多态性检测,利用序列特异性引物PCR对HLA-Cw*0602进行基因分型。利用PLINK1.07软件进行统计分析,χ2检验比较两组等位基因频率,并计算等位基因的相对危险度估计值比值比（OR）,R × C列联表卡方检验进行单倍型分析。结果 IL-12B基因rs2082412、rs2288831、rs3212227、rs3213094、rs7709212等位基因频率在汉族病例组显著低于汉族对照组（P < 0.005）;IL-12B基因rs3213094等位基因频率在蒙古族病例组显著低于蒙古族对照组（P < 0.005）。汉族和蒙古族病例组HLA-Cw*0602阳性率均显著高于相应民族对照组（P < 0.005）。分层分析显示,汉族HLA-Cw*0602阳性病例组IL-12B基因rs2082412、rs2288831、rs3212227、rs3213094、rs7709212等位基因频率显著低于汉族对照组（P < 0.005）,而阴性病例组与汉族对照组各等位基因频率差异无统计学意义（P > 0.05）。蒙古族HLA-Cw*0602阳性或阴性病例组各等位基因频率与相应对照组差异均无统计学意义（P > 0.005）。分析IL-12B基因区域的5个SNP构建单倍型,在汉族、蒙古族病例组和对照组中6个单倍型分析差异均无统计学意义（P > 0.005）。基于HLA-Cw*0602分层的IL-12B基因多态性单倍型分析,蒙古族、汉族7个单倍型无论HLA-Cw*0602阳性和阴性病例组及对照组中的频率差异无统计学意义（P > 0.005）。HLA-Cw*0602阳性和阴性蒙古族病例组和对照组,单倍型GATGT频率在两组间差异均无统计学意义（P > 0.05）。结论 IL-12通路相关基因多态性与内蒙古蒙古族、汉族人群寻常型银屑病具有相关性,且IL-12B与HLA-Cw*0602在寻常型银屑病发病过程中可能存在交互作用。     

内蒙古汉族寻常型银屑病REL基因多态位点检测

目的：检测内蒙古汉族人寻常型银屑病（PsV）患者禽网状内皮组织增殖病毒癌基因V-Rel同源基因（REL）的多态性。方法：提取301例PsV患者及292例正常对照外周血DNA,利用连接酶检测反应检测REL基因区域的4个单核苷酸多态性（SNP）（rs702873、rs842636、rs13031237 和 rs13017599）。结果：PsV患者rs702873和rs842636的等位基因频率分别为0.126和0.128,对照组中分别为0.182和0.181,差异有统计学意义(P<0.05)且rs702873和rs842636间存在强连锁不平衡（D’=0.993,r2=0.980）。rs13031237和rs13017599等位基因频率在PsV患者和对照组中差异无统计学意义(P>0.05)。结论：REL基因位点（rs702873和rs842636）多态性可能与内蒙古汉族人PsV的易感性相关。     

补体C1q基因簇rs631090多态性与女性系统性红斑狼疮的相关性研究

目的:确定补体C1q基因簇单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与中国女性人群系统性红斑狼疮(SLE)的易感性。方法:111例女性SLE患者及120名女性正常对照者。提取样本基因组DNA后,经普通PCR扩增目的基因,采用二代测序分析C1q基因簇上三个位点(rs631090、rs292001、rs294223)的基因型及等位基因分布。在不同的遗传模式下分析三个位点基因多态性与SLE的相关性。结果:位点rs631090(C1qB)病例组与对照组基因型频率和等位基因分布比较差异均具有统计学意义(P=0.034和P=0.008)。位点rs292001(C1qA)和rs294223(C1qB)的基因型频率及等位基因分布结果在两组间不具统计学差异(P值均大于0.05)。位点rs631090在显性遗传模型下CT/CC基因型在统计学上具有显著保护性作用(OR=0.470,95%CI=0.268-0.823,P0.05)。rs292001和rs294223在三种遗传模型下分析均未发现相关性(P值均大于0.05)。结论:在中国女性人群中rs631090位点SNPs与SLE相关,基因型CT/CC可能为女性SLE保护基因型。     

NOD2基因单核苷酸多态性与彝族麻风病相关性研究

【摘要】 目的 探讨NOD2基因单核苷酸多态性（SNP）位点与中国彝族人群麻风病的关系。方法 单碱基延伸法（SNaP shot）检测300例彝族麻风病患者和300例彝族健康对照NOD2基因的4个SNP位点：rs9302752、rs7194886、rs8057341、rs3135499的基因型。 结果 4个位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡（P > 0.05）,rs3135499位点的基因型频率和等位基因频率在麻风病组和对照组间的差异有统计学意义（均P < 0.01）。rs9302752、rs7194886、rs8057341位点的基因型频率和等位基因频率在麻风病组和对照组间的差异无统计学意义（均P > 0.05）。 结论 NOD2基因单核甘酸多态性位点rs3135499与中国彝族人群麻风病发病相关。 【关键词】 麻风; 彝族; 多态性,单核苷酸; 基因,NOD2     

内质网氨基肽酶1基因rs27044、rs30187和rs26653多态性与汉族寻常性银屑病相关性研究

目的 探讨内质网氨基肽酶1（ERAP1）基因多态性与汉族人寻常性银屑病的遗传关联性。 方法 收集寻常性银屑病患者289例,对照组292例,知情同意后采集外周静脉血5 ml。选择位于ERAP1基因编码区域的3个单核苷酸多态性（SNP）,利用连接酶检测反应进行基因分型（rs27044、rs30187和rs26653）。利用PLINK1.07软件进行统计分析,χ2检验比较患者组与对照组等位基因频率及基因型频率,计算等位基因的相对危险度估计值比值比（OR）及其95%可信区间（95% CI）。利用Haploview软件进行单倍型分析。 结果 rs30187等位基因C及rs26653等位基因G在患者组的频率（分别为0.460 2和0.430 8）、尤其是早发型组中的频率（0.448 5和0.422 7）均明显低于对照组（0.534 2和0.501 7）,差异均有统计学意义（均P < 0.05）。rs27044、rs30187及rs26653这3个SNP两两间均存在强连锁不平衡（r2 ≥ 0.717,D′ ≥ 0.962）。基因型分析结果显示,在隐性遗传模式下,rs30187在患者组及早发型组的基因型频率均显著低于对照组,差异均有统计学意义（P值分别 < 0.05和 < 0.016 7）。单倍型分析发现,单倍型（H4：CTC）在患者组的频率（0.050）、尤其是早发型组的频率（0.052）均明显高于对照组（0.022）,差异均有统计学意义（P值分别 < 0.05、 < 0.016 7）。 结论 ERAP1基因多态性与汉族人寻常性银屑病可能相关,特别是早发型患者。危险单倍型（H4：CTC）可能是寻常性银屑病一个重要的易感因素。     

代谢综合征相关基因多态性与蒙古族寻常型银屑病的相关性及与HLA-C*06：02交互作用研究

【摘要】 目的 探讨代谢综合征相关基因多态性与蒙古族寻常型银屑病（PsV）的相关性及其与HLA-C*06：02的交互作用。方法 内蒙古医科大学附属医院2012年12月至2018年3月住院的379例蒙古族PsV患者及518例蒙古族健康对照。选择16个既往报道的与代谢综合征及其包含疾病相关的单核苷酸多态性（SNP）及HLA-C*06：02，利用二代测序法和聚合酶链反应-序列特异性引物（PCR-SSP）对受试者进行基因分型。计算蒙古族PsV组及对照组16个变异位点及HLA-C*06：02的最小等位基因频率，χ2检验比较两组各SNP位点的最小等位基因频率差异。结果 蒙古族PsV患者中16个代谢综合征易感SNP位点最小等位基因频率与健康对照比较，差异无统计学意义（均P > 0.05），而HLA-C*06：02位点的最小等位基因频率差异有统计学意义（P = 4.09 × 10-35，OR = 3.41）。HLA-C* 06：02阳性受试者中，252例PsV患者的rs7593730_T和rs6931514_G最小等位基因频率与191例健康对照相比差异有统计学意义（P = 0.016，OR = 0.64；P = 0.041，OR = 1.33）；而在HLA-C*06：02阴性受试者中，两组间16个SNP位点的最小等位基因频率差异均无统计学意义（P > 0.05）。结论 rs7593730和rs6931514与内蒙古地区蒙古族寻常型银屑病可能相关，与HLA-C*06：02可能存在交互作用。     

CD40基因多态性及血清水平与系统性红斑狼疮发病机制的相关研究

目的 探讨CD40基因单核苷酸多态性（SNP）及其单倍型与SLE易感性的相关性,分析CD40基因型及血清水平与系统性红斑狼疮（SLE）的相关性。 方法 单碱基延伸的PCR技术（PCR-SBE）和DNA测序法分析205例SLE患者和220例健康对照CD40基因rs1883832 C/T、 rs13040307 C/T、rs752118 C/T 和rs3765459 G/A的多态性,同时用ELISA检测血清CD40水平。 结果 与健康对照组相比,SLE组血清CD40水平显著增高（P < 0.05）。SLE组与健康对照组CD40基因rs1883832 C/T位点基因型和等位基因频率比较,差异有统计学意义（P < 0.01）。等位基因频率的相对风险分析后发现,携带有rs1883832 T等位基因的受试者患有SLE的风险是rs1883832 C等位基因的1.517倍（OR = 1.517,95% CI 1.157 ~ 1.990,P = 0.003）;携带rs1883832 T等位基因的SLE患者血清CD40水平与不携带者相比,结果显著增高（P < 0.01）。通过联合基因型分析发现,SLE组中携带单倍型TCCA的患者较健康对照组显著增加了发病的风险（OR = 2.322,95% CI 1.181 ~ 4.564,P = 0.012）。 结论 CD40基因rs1883832 C/T多态性和TCCA单倍型与SLE的发病有相关性,其中rs1883832 T等位基因可能是SLE的遗传易感基因。     

广西壮族、汉族系统性红斑狼疮与Toll样受体9基因多态性研究

目的 探讨TLR9单核苷酸多态性与广西系统性红斑狼疮（SLE）患者发病的相关性,以及其在壮族、汉两个民族间的差异。 方法 聚合酶链反应-限制性酶切技术、聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析技术（PCR-RFLP）对97例广西SLE患者和202例广西健康对照者的TLR9基因多态性进行检测,分析其基因型和等位基因频率与SLE部分临床实验室指标的关联性,并比较两民族间的差异。 结果 TLR9 rs352140CC、CT、TT基因型频率在汉族SLE组与汉族对照组中分别为42.9%、41.1%、16.1%和38.3%、55.8%、5.8%,差异有统计学意义（P < 0.05）,其C、T等位基因频率差异无统计学意义（P > 0.05）。TLR9rs352140 C/T基因型频率和等位基因频率在壮族SLE组与壮族健康对照组间、壮族SLE组与汉族SLE组间差异无统计学意义（均P > 0.05）。TLR9 rs352140TT基因型频率在ds-DNA阳性组比阴性组高（P < 0.05）,而T等位基因频率在两组间差异无统计学意义（P > 0.05）。TLR9 rs352140TT基因型频率和T等位基因的频率在SLEDAI ≥ 9组比SLEDAI < 9组高,差异有统计学意义（均P < 0.05）。TLR9 rs352140TT基因型频率和T等位基因的频率在ANA阳性组与阴性组间差异无统计学意义（均P > 0.05）。 结论 TLR9 rs352140基因多态性可能与广西汉族人SLE的易感性有关, TLR9基因多态性与部分SLE指标可能具有相关性。     

基于靶基因捕获测序法对海南省汉族寻常型银屑病与维生素D受体基因关系的研究

目的:探讨维生素D受体（VDR）基因多态性与寻常型银屑病的关系。方法:2018年3月至2020年2月在海南医学院第二附属医院皮肤性病科和体检中心分别收集101例海南籍汉族寻常型银屑病患者与79例海南籍健康对照。采用靶基因捕获测序法对VDR基因及其上、下游各2 kb进行全长测序,对于最小等位基因频率大于1%的单核苷酸多态...     

新疆汉族SPRR2E基因单核苷酸多态性与寻常性银屑病的关系

目的通过测定中国新疆汉族非家系寻常性银屑病SPRR2E基因的外显子编码区序列,研究SPRR2E基因与新疆汉族银屑病发病的关系。方法从新疆汉族正常人和寻常性银屑病患者的外周血中提取基因组DNA,用自动测序的方法测定SPRR2E基因的外显子编码区序列,对结果进行统计学分析处理。结果SPRR2E基因编码区第156核苷酸(+156bp)处存在A或G二态性,可表现为AA纯合、GG纯合和AG杂合三种基因型,病例组AA基因型频率明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论SPRR2E基因外显子编码区序列的第156核苷酸多态性与新疆汉族非家系寻常性银屑病的发病有关。     

白介素12B基因rs6887695多态性与汉族人寻常性银屑病临床表型的相关性

目的 探讨白介素12B（IL-12B）基因多态性位点rs6887695与汉族人寻常性银屑病临床表型（发病年龄、家族史、临床类型、性别）的相关性。 方法　采用ABI Taqman探针荧光PCR技术,对575例寻常性银屑病患者和1403例健康对照的DNA样本进行IL-12B基因多态位点rs6887695的基因分型。使用SPSS14.0分析软件,χ2检验比较患者组和健康对照组间、不同临床表型组间的基因型和等位基因频率分布的差异性。 结果 IL-12B基因多态性位点rs6887695三种基因型（GG、GC、CC）频率在寻常性银屑病患者组分别为42.61%、45.39%和12.0%,健康对照组分别为34.42%、47.83%和17.75%;等位基因频率（G、C）患者组分别为65.30%和34.70%,健康对照组分别为58.34%和41.66%,基因型和等位基因频率分布在患者组和健康对照组间差异均有统计学意义（χ2值分别为16.31和16.54,P值均 < 0.01）,在慢性斑块状（543例）和急性滴状银屑病患者（32例）组间的差异均有统计学意义（χ2值分别为18.11和12.19,P值均 < 0.01）。等位基因G和基因型GG在患者组中的频率明显高于健康对照组,等位基因G和基因型GG在斑块状患者中的频率高于滴状患者。少儿发病组（35例）与成人发病组（540例）、家族史阳性组（102例）与家族史阴性组（440例）、男性患者组（341例）与女性患者组（234例）的基因型和等位基因频率分布差异均无统计学意义（P值均 > 0.05）。 结论 IL-12B（rs6887695）基因多态性与汉族人寻常性银屑病易感性相关联,特别是与斑块状银屑病相关,但与患者的发病年龄、家族史及性别可能无关联。     

SPRR2E基因编码区单核苷酸多态性与银屑病

目的通过测定32个中国汉族人寻常性银屑病家系共157人SPRR2E基因的外显子编码区序列,研究SPRR2E基因与银屑病发病的关系。方法提取基因组DNA,对32个银屑病家系DNA进行扩增,产物经377DNA测序电泳仪电泳,用自动测序的方法测定SPRR2E基因的外显子编码区序列,并以ETDT及GENEHUNTER软件进行统计处理。结果SPRR2E基因编码区第156核苷酸( 156bp)处存在A或G二态性,可表现为AA纯合、GG纯合和AG杂合三种基因型,虽然该SNP不改变蛋白质编码,但它与银屑病存在传递不平衡,等位基因A优先传递给患病子代(P<0.05)。结论SPRR2E基因的外显子编码区中的一个核苷酸多态性与中国汉族人寻常性银屑病的发病相关联。     

云南汉族痤疮与CYP11B1基因多态性的相关性研究

【摘要】 目的 探讨CYP11B1基因多态性与痤疮发病风险之间的相关性。 方法 SNaPshot法对云南汉族403例痤疮患者（包括轻型痤疮166例 、重型痤疮237例）和207例健康对照CYP11B1基因2个单核苷酸多态性位点：rs4736312和rs4534位点进行分型,ABI 3730XL扫描分型结果。结果 rs4736312位点：男性轻型痤疮组AA、AC和CC基因型频率分别为0、20.6%、79.4%,重型痤疮组为1.8%、26.8%、71.4%,男性健康对照组为7.6%、34.8%、57.6%。A等位基因的频率分布在男性痤疮组与健康对照组间、男性轻型痤疮与健康对照组间以及男性重型痤疮与健康对照组间,差异均具有统计学意义（分别为P < 0.01、< 0.05、< 0.05）,而女性痤疮组、女性轻型痤疮组、女性重型痤疮组A、G等位基因频率分布与健康对照组相比,差异均无统计学意义（P > 0.05）。rs4534位点：男性、女性两组别的痤疮组、轻型痤疮组及重型痤疮组的AA、AG、GG基因型频率分布和A、G等位基因频率分布与各自健康对照组间,差异均无统计学意义（P > 0.05）。 结论 CYP11B1基因中rs4736312位点与云南汉族男性痤疮发病相关,而rs4534位点与云南汉族痤疮的发病无相关。 【关键词】 痤疮,寻常; 11β-羟化酶; 多态性,单核苷酸     

TNIP1基因多态性与汉族人系统性红斑狼疮相关性研究

目的 探讨人肿瘤坏死因子α诱导蛋白3（TNFAIP3）相互作用蛋白1（TNIP1）基因多态性与汉族人系统性红斑狼疮（SLE）的遗传关联性。 方法 收集284例汉族人SLE和630例汉族人对照,选择TNIP1基因区域120个单核苷酸多态性（SNP）,利用连接酶检测反应（LDR）对其进行基因分型,对分型数据利用PLINK 1.07和Haploview软件进行统计分析。 结果 经过数据质控,最终105个SNP的分型数据进入最终统计分析。rs3805433 C、rs12516176 C、rs6869605 C和rs4958882 G的等位基因频率在SLE组（参考等位基因频率0.301 ~ 0.306）高于对照组（参考等位基因频率0.221 ~ 0.225）,差异有统计学意义（OR：1.50 ~ 1.53,均P < 4.72 × 10-4）。这4个SNP间存在强连锁不平衡（r2 ≥ 0.871,D′ ≥ 0.938）,且与既往报道的SLE相关SNP rs10036748间存在中等程度的连锁不平衡（r2 ≥ 0.073,D′ ≥ 0.868）。单倍型分析发现,单倍型（H2：CCCGT）在病例组中的频率（0.290）显著高于对照组（0.210）,差异有统计学意义（OR = 1.54,P < 4.72 × 10-4）。 结论 TNIP1基因多态性与汉族人SLE具有相关性。