FQ-PCR检测尿道炎病原体的临床应用及评价

目的为临床提供一次反应可同时检测由奈瑟氏淋球菌（Neissria gonorrhea，NG）、解脲支原体（Ureaplasma urealyticurn，UU）及沙眼衣原体（Chlamydia trachomatis，CT）引起的淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎的荧光定量PCR实验方法。对不同的试剂盒进行评价、比较，优化其荧光定量PCR反应条件。方法在一次荧光定量PCR反应中，利用任意一套标准品同时检测三种病原体，进行妒检验。将同样的标本分别用三种不同试剂盒试验，将结果进行妒检验。优化反应条件，比较结果有无差异，进行￡检验。结果用同一厂家试剂盒的一套标准品分别同时检测三种病原体，结果无统计学差异，P〉0．05。三个厂家试剂盒无明显差异，P〉0．05。将某些反应条件优化，结果无显著影响，t=1．1806，P〉0．05。结论用同一厂家试剂盒的一套标准品分别同时检测三种病原体，可减少标准品的使用量，且优化反应条件后又可以节省时间，为临床提供了快速、简便、经济的检测方法。     

荧光定量PCR检测TCR VγI-Jγ基因重排标准品质粒及标准曲线的构建

目的：构建荧光定量PCR检测TCR VγI-Jγ基因标准品重组质粒和标准曲线，为建立实时荧光定量PCR准确检测淋巴系肿瘤微小残留病奠定基础。方法：对TCR VγI-Jγ基因进行序列分析，利用引物设计软件设计出一对引物和一条荧光探针。提取急性淋巴细胞白血病患者的DNA，经PCR扩增，产物纯化后与pMD 18-T Vector连接，转化到大肠杆菌DH5α，筛选得到标准品的质粒。结果：重组质粒进行荧光定量PCR扩增出现强烈的荧光值增长，表明TCR VγI-Jγ基因已成功克隆。以10^0～10^-5不同稀释水平的标准品进行荧光定量PCR扩增，Ct值分别为21．08、24．34、27．53、30．58和33．25。统计学分析显示Ct值与标准品浓度的对数存在良好线性关系，回归系数为0．998。结论：所构建的TCR VγI-Jγ基因荧光定量PCR检测标准品特异性和线性关系好，准确可靠，利于统一标准。     

dUTP/UDG反应体系在荧光定量PCR中抗污染能力评价

目的 探讨dUTP／UDG反应体系在荧光定量PCR中抗PCR产物污染的能力。方法 用TaqMan荧光定量PCR检测方法进行定量检测。将一系列不同浓度的含dUTP的HBV—DNA PCR扩增产物作为污染源，分别加至含dUTP／UDG的PCR反应体系和普通荧光定量PCR反应体系中，在荧光定量PCR仪上进行定量检测，从而得出含dUTP／UDG的PCR反应体系的抗污染能力。结果 1．最佳抗污染实验条件：UDG酶含量0．05U，消化时间37℃5min，灭活时间92℃1min；dUTPl00％代替dITP，四种底物浓度相等。2．含0．05U的UDG抗污染反应体系对每管浓度为10^3拷贝／ml的污染物可完全消化，并随UDG含量的增高及消化时间的延长，抗污染能力增强。结论 dUTP／UDG反应体系的应用能有效防止PCR产物污染，但抗污染能力是有一定限度的，尚需加强实验室标准化管理，才能真正达到抗污染效果。     

荧光定量PCR检测梅毒螺旋体方法的建立及初步应用

目的采用二聚体蝎型探针技术建立一种高敏感性和特异性的检测梅毒螺旋体(TP)的荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法。方法根据TP特异性外膜蛋白Gpd的基因序列设计引物和荧光探针,采用基因工程技术构建可用于TP定量的标准品,优化荧光定量PCR的反应体系和反应条件,建立检测TP的二聚体蝎型探针定量PCR。采用本研究建立方法和商品化荧光定量PCR试剂盒检测40例临床标本,对比分析检测结果的统计学差异。结果成功构建了TP重组质粒标准品和TP的二聚体蝎型探针定量PCR,该方法线性范围为101~108 copy/mL,灵敏度为10copy/mL,特异性和敏感性均为100.0%;二聚体蝎型探针定量PCR对疑似梅毒病例阳性检出率显著高于目前商品化Taqman荧光定量PCR试剂盒(82.5%vs 62.5%,P0.05)。结论成功建立了二聚体蝎型探针荧光定量PCR快速检测TP的方法,为临床上TP的早期诊断和防控奠定了基础。     

一种快速检测HBV基因的荧光定量PCR法的建立

目的：利用二聚体蝎型荧光探针技术,建立一种能用于临床的快捷、敏感、特异、价格低廉的HBV实时荧光定量PCR检测方法。方法：根据HBV基因组保守区域precore／core设计二聚体蝎型荧光探针和引物,构建质粒标准品,优化荧光定量PCR条件,并进行方法学评价。结果：所建方法的检测范围为10^1～10^8 copies／μl,灵敏度达到10copies／μl,低拷贝样品的批内和日间重复性（CV）分别为1．71％和2．57％,高拷贝样品的批内和日间GV,分别为3．00％和3．86％。与商品化TaqMan试剂盒相比,本法阳性检出率较高,且检测时间缩短了45min（约减少1／3）,成本降低50％。结论：成功建立了快速检测HBVDNA的二聚体蝎型荧光定量PCR方法,为研发适合临床应用的HBV基因定量检测试剂盒奠定了基础。     

时间分辨荧光免疫法检测HBVPreSIAg试剂盒的应用评价

目的建立乙型肝炎病毒前S1抗原（HBVPreSlAg）时间分辨荧光免疫法（TrFIA）,并对自研试剂盒检测PreSlAg的应用价值进行评价。方法对自研试剂盒的精密度、灵敏度、特异度、稳定性和参考值等分析性能指标进行评价;与对照试剂盒平行检测l020例样本,检验结果的一致性采用Kappa检验。采用时间分辨荧光免疫法检测PreSlAg和乙型肝炎病毒标志物（HBVDNA）,用荧光定量聚合酶链反应（PCR）检测HBVDNA,探讨PreSlAg与HBVDNA之间的相关性并对比三者在临床样本中的阳性检出率。结果自研试剂盒符合企业内部栓定标准,批内变异系数小于10％,自研试剂盒灵敏度较酶联免疫法高,有效期为12个月;自研试剂盒与对照试剂盒检测结果的总符合率达98．82％,Kappa指数达0．9763;350例样本中PreSlAg检出率与HBVDNA检出率差异无统计学意义（x2=1．69,P〉0．05）;在HBVDNA阳性时PreSIAg与HBeAg的检出灵敏度一致（x2=0．21,P〉0．05）;但在HBVDNA阴性时特异性PreSlAg不及HBeAg（x2=50．24,P〈0．05）。PreSlAg和HBeAg的检出率均随HBVDNA浓度升高而升高;PreSIAg和HBeAg联合应用检出率（66．00％）高于HBVDNA检出率（49．43％）（x2=20．88,P〈o．05）。结论PreSlAg是反应HBV复制和传染性的一个重要补充标志物。自研试剂盒在预示HBV的感染、复制和传染性等方面具有重要的价值。     

自身猝灭探针定量PCR检测HCV方法的建立

目的 建立自身猝灭荧光探针定量PCR技术检测HCV方法.方法 构建重组质粒pMD18-T-HCV5'NCR作为标准品,并通过Sigma在线软件设计自身猝灭探针,优化定量PCR体系,并进行方法学评价.结果 建立了自身猝灭荧光探针的定量PCR方法,线性为101～1010copies/μl;灵敏度达50 copies/μl;批内CV为6.1%,批间CV为6.5%,日间CV为6.8%;特异性为100%,与其他肝炎病毒无交叉反应.与紫外定量方法比较,结果差异无显著性,且高度相关.结论 以自身猝灭荧光探针建立的HCV荧光定量PCR检测方法,灵敏度高、特异性强,为新型试剂盒的开发奠定了基础.     

男性尿道分泌物淋球菌培养漏检情况分析

目的了解细菌培养法对男性尿道分泌物淋球菌培养检查的漏检情况。方法同时用荧光定量PCR法、细菌培养法及直接涂片法对362例男性尿道分泌物检测,然后对3种方法检测结果进行统计学处理。结果362例男性尿道分泌物荧光定量PCR阳性率为29．56％（107／362）;与直接涂片法阳性率26．52％（96／362）较接近（X^2=0．83,P〉0．05）;而细菌培养法阳性率4．42％（16／362）明显低于PCR法（X^2=81．10,P〈0．01）和直接涂片法（X^2=67．60,P〈0．01）。结论单纯淋菌培养对男性病例的潺检率高,达80％以上;保证分析前标本的质量和采用两种以上方法同时进行检测是提高淋菌检出率的有效措施。     

BCR-ABL融合基因检测试剂盒（荧光PCR法）的评价

目的 评价不同公司的BCR-ABL融合基因检测试剂盒(荧光PCR法)的性能。方法提取BCR-ABL定量标准品WS1～WS4的RNA,分别加入BCR-ABL反应液和ABL反应液,然后使用荧光定量PCR仪进行检测。通过软件分析获得标准品的BCR-ABL融合基因检测结果。结果 准确度标准品WS2和WS3的融合比例绝对偏差均不超过±0.5个对数数量级,检测限标准品WS4能检出BCR-ABL融合突变阳性,重复性标准品WS1和WS4的Ct值变异系数(CV,%)均<5.0%,WS1～WS4标准品的线性相关系数︱r︱不低于0.980 0。结论 BCR-ABL融合基因检测试剂盒(荧光PCR法)能够准确检出BCR-ABL定量标准品,符合断裂点簇集区-艾贝尔逊白血病病毒(BCR-ABL)融合基因检测试剂盒标准的准确度、检出限、重复性和线性要求。     

五种结核病实验室检测方法对结核病诊断价值的效果评价

目的评价涂片法、BACTECMGIT960快速培养法、改良罗氏培养法、荧光定量PCR法和斑点免疫层析法在结核病实验室快速诊断方法中的作用和地位。方法对1260例结核病患者（结核病组）和100例非结核病患者（非结核病组）的各类标本采用涂片法、快速培养法、改良罗氏培养法、荧光定量PCR法进行检测,同时分离患者外周血血清进行结核抗体检测,并对这五种检测方法的结果进行分析比较。结果五种实验室检测方法对结核病组阳性标本和非结核病组阴性标本的检测结果差异均有统计学意义（χ2=466．31,χ2=216．14,P均〈0．05）。对于结核病组的涂阳和涂阴标本,快速培养法和荧光定量PCR法检测的灵敏度及准确度均高于其他三种方法,而涂片法、改良罗氏培养法、快速培养法的特异性均为100．0％,高于荧光定量PCR法和斑点免疫层析法;快速培养法的阳性检出率均较改良罗氏培养法高,差异均有统计学意义（χ2=3387．00,χ2=4233．00,P均〈0．05）,平均培养时间也较改良罗氏培养法短;但快速培养法与荧光定量PCR法的阳性检出率差异均无统计学意义（P均〉0．05）。结论BACTECMGIT960快速培养法和荧光定量PCR法是诊断结核病快速、有效的检测方法,其阳性检出率高,且能缩短培养时间,BACTECMGIT960快速检测系统还能进行快速药物敏感性试验,为结核病的快速诊断提供依据。     

酶联免疫吸附法与定量聚合酶链反应对乙肝两对半测定的比较分析

目的探讨酶联免疫吸附法（ELISA）与定量聚合酶链反应（Q—PCR）检测乙型肝炎血清标志物（乙肝两对半）的应用价值。方法225例疑似乙肝患者分别采用ELISA与274例Q—PCR进行乙肝两对半检测，对结果进行对比分析。结果ELISA的检出率为88．9％，Q—PCR的检出率为94．2％，两组相比差异无显著性（P〉0．05）。结论ELISA与Q—PCR检测乙肝两对半的符合率高，结果基本一致，但是Q—PCR法快速简单，更适合于急诊检验。     

实时荧光定量PCR法检测产气荚膜梭菌

目的:运用实时荧光定量PCR法检测产气荚膜梭菌,为早期快速诊断气性坏疽提供新方法.方法:以产气荚膜梭菌16s rDNA基因序列为模板,在其保守区域设计特异性引物与探针,将PCR扩增所得产物片段克隆,作为定量检测的标准品,绘制标准曲线.并对荧光定量PCR体系与反应条件进行优化,验证方法的特异性、敏感性、重复性及可行性.结果:实时荧光定量PCR法对产气荚膜梭菌的检测具有高度特异性,与创伤弧菌等24种相关细菌等均无交叉反应;检测灵敏度以纯菌计数达9×102cfu/mL,相当于9 cfu/反应;反应体系有较高稳定性;整个操作过程仅需3 h;300例创伤可疑分泌物样本的荧光定量PCR检测结果与细菌培养结果一致.结论:实时荧光定量PCR法特异、灵敏、快速,适用于产气荚膜梭菌的临床检测及突发事件的批量检测.     

结直肠癌组织cripto基因mRNA水平及临床意义

目的检测cripto基因mRNA在结直肠癌及其癌旁组织中mRNA表达情况，并探讨其在结直肠癌发生发展中的意义。方法提取36例人大肠癌及癌旁正常组织中总mRNA，采用实时荧光定量PCR法检测其中cripto mRNA表达情况；并分析其表达与患者淋巴结转移、肿瘤分化程度和Dukes’s分期相关性。结果cripto mRNA表达在大肠癌组织中阳性表达率为86．1％（31／36），而正常肠组织未见cripto mRNA表达，统计学差异显著（P〈0．0001）。criptomRNA表达与浆膜侵袭、淋巴结转移和Duke’s分期密切相关（P〈0．05，P〈0．05，P〉0．05），而与患者肿瘤发生部位和分化程度无关（P〉0．05，P〉0．05）。结论cripto基因在结直肠癌组织中高表达，可能与大肠侵袭痈转移有关。     

梅毒螺旋体荧光定量PCR检测方法的建立和初步临床应用

目的 建立一种利用MGB-Taqman探针的快速、灵敏、特异、准确定量检测梅毒螺旋体的方法。方法选择梅毒螺旋体的基因组的保守区域，设计合成引物和MGB-Taqman探针，构建质粒标准品pMD18-T-TP．优化定量PCR反应体系，并进行方法学评价。结果1）成功构建了重组质粒pMD18-T-TP。2）建立了利用MGB-Taqman探针的荧光定量PCR方法，其线性范围：10^1～10^10％opies／μl；灵敏度：10copies／μl；重复性：批内CV为2．02％，批间CV为2．83％，日间CV为4．23％；特异性：100％。3）初步临床应用证明：该方法比血清学检测方法灵敏度更高，假阳性率低。结论利用MGB-Taqman探针定量检测梅毒螺旋体的方法灵敏度高，特异性高，操作简便，适合临床检验诊断的要求。     

荧光定量PCR技术在结核杆菌检测中的应用

目的：建立结核病荧光定量PCR快速检测方法。方法：建立检测结核杆菌的荧光定量PCR方法并进行特异性、敏感性、重复性实验，对临床样品进行检测分析。结果：该方法的敏感性达到了1Pg，且特异性高．重复性好。应用荧光定量PCR法及抗酸染色、结核杆菌培养法，对332例活动性肺结核患者晨痰、215例活动性肺结核患者外周血、187例结核性胸膜炎患者胸水进行检测．荧光定量PCR技术阳性率分别为53．0％（176／332）、34．4％（74／215）、36．9％（69／187），经统计学比较分析，3种方法检测率差异有统计学意义（P〈0．01）。结论：荧光定量PCR技术具有简便、快速、防污染、敏感性与特异性高等优点，是结核病诊断的有效方法之一。[著者文摘]     

大鼠agrin基因实时定量聚合酶链反应的检测方法

目的：agrin基因对神经肌肉接l头的形成、维持起着决定作用，也对神经元轴突的形成、延长、维持有重要作用．其表达产物在机体内分布广泛。设计绝对定量嵌合荧光法检测大鼠agrin基因mRNA的实时定量聚合酶链反应方法，并检测其特异性、敏感性和可重复性。 方法：实验于2007—04／11在吉林大学基础医学院三综合实验室和吉林大学第一医院传染科实验室完成。以Primer 3软件设计大鼠agrin基因、ACTB基因mRNA嵌合荧光实时定量聚合酶链反应检测引物，经检索Blast验证特异性，并以Primer5设计构建agrin基因标准品引物。选择清洁级Wistar大鼠交配，获取3日龄乳鼠，取脑，获取mRNA、cDNA，常规反转录一聚合酶链反应获取agrin554个碱基DNA片断。PCR填加T7启动子后，T7 RNA Polymerase合成agrin基因标准品，消化模板。分光光度计测定其浓度，1：5倍比稀释3次；经反转录反应合成agrin基因cDNA标准品，测序验证特异性。以ACTB引物反转录cDNA，1：5倍稀释3次，构建ACTB基因标准品。常规聚合酶链反应确定、优化反应条件。标准曲线确定实时定量聚合酶链反应标准曲线的相关性，融解曲线验证检测方法的特异性，作重复性检测。 结果：①agrin基因有意义链引物序列：GAA GGC CAG GTG CGA ATC A，反义链引物序列：CAC AGG TAG CAG TGG AGC CAA G，内标：ACTB基因有意义链引物序列：GGA GAT TAC TGC CCT GGC TCC TA，反义链引物序列：GAC TCA TCG TAC TCC TGC TTG CTG，优化反应条件：95℃变性5S，60℃退火20S，72℃延伸20s。②agrin基因、ACTB基因标准品所获得的标准曲线确定实时定量聚合酶链反应标准曲线的相关性均〉0．95。③聚合酶链反应产物电泳、测序、实时定量聚合酶链反应融解曲线证明特异性高、重复性好、灵敏度达到精确定量要求。 结论：绝对定量嵌合荧光法检测大鼠agrin基因mRNA的实时定量聚合酶链反应方法可以作为大鼠agrin基因mRNA检测的标准方法。     

乙型肝炎病毒SYBR Green I 实时荧光定量PCR方法的建立及临床应用

目的 建立SYBR Green I实时荧光定量PCR检测乙型肝炎病毒DNA的快速方法,并探讨其临床应用价值。方法 根据GenBank公布的Hepatitis B virus gp1基因序列设计引物,建立SYBR Green I实时荧光定量PCR,并对反应体系和扩增程序进行优化。定量标准品通过基因克隆方法获得,同时以浙江省夸克公司HBV DNA定量检测试剂盒作对照,应用于随机选取的100份乙型肝炎患者血清检测。结果 SYBR Green I实时荧光定量PCR检出限范围为5×10²copies/ml～5×10⁸copies/ml,HBV DNA浓度与CT值有良好线性关系,无交叉反应,整个过程仅需2.5 h。在随机抽取的100份临床标本应用中,与浙江省夸克公司的HBV荧光定量PCR检测试剂相比,建立的SYBR Green I实时荧光定量PCR体系灵敏度100%,特异度92.5%。结论SYBR Green实时荧光定量PCR快速、简便、灵敏度高、特异度强,可用于乙型肝炎患者病情监测,有效指导临床用药,准确评价HBV感染者的病情。     

实时荧光定量PCR快速检测BCR-ABL融合基因激酶区M244V突变方法的建立

本研究建立一种敏感性好、特异性高的BCR-ABL融合基因M244V突变的检测方法。设计突变点特异性引物,优化实时荧光定量PCR反应体系和条件,建立检测BCR-ABL融合基因M244V点突变的定量PCR方法。结果表明,成功构建了M244V突变及野生的重组质粒标准品和M244V点突变的实时荧光定量PCR方法;验证结果表明该法具有较好敏感性、特异性和准确性。结论：BCR-ABL融合基因M244V突变的实时荧光定量PCR检测方法可用于临床CML患者M244V突变的检查。     

乳腺癌组织KLK7 mRNA的表达及其与临床病理特征的关系

目的建立人KLK7mRNA荧光定量检测方法,对正常乳腺组织和癌组织KLK7 mRNA进行定量,分析其表达与部分临床病理特征的关系,探讨其临床意义。方法应用实时荧光定量PCR检测48例乳腺癌切除的组织中KLK7基因mRNA的表达量,并分析KLK7 mRNA的表达量与年龄、TNM分期、组织学类型、淋巴结转移、雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）等临床病理特征的关系。结果KLK7 mRNA在乳腺正常组织相对表达水平为0．091±0．139,在乳腺癌组织中的相对表达水平为0．107±0．122,无统计学意义（P〉0．05）。但KLK7 mRNA在有淋巴结转移的患者乳腺癌组织中的表达水平高于未转移组（P〈0．05）;在Ⅲ-Ⅳ期患者乳腺癌组织中高于Ⅰ．Ⅱ期患者（P〈0．05）;ER（＋）阳性乳腺癌组织明显低于ER（-）乳腺癌组织（P〈0．05）。KLK7 mRNA表达水平与患者年龄、组织病理分类以及孕激素受体状态无相关性（P〉0．05）。结论乳腺癌组织KLK7 mRNA表达与TNM分期、ER状态及肿瘤转移情况有关。     

时间分辨荧光免疫法和电化学发光法检测AFP的比较

目的对时间分辨荧光免疫分析法（TRFIA法）国产试剂盒与电化学发光免疫分析法（ECLIA法）检测血清AFP作比较分析。了解两种方法特点。方法分别采用国产TRFIA法试剂盒与ECLIA法检测正常人50例、肝癌患者40例血清AFP的含量;用高、中、低3种浓度AFP标准品采用两种方法进行批内测定,n=10,观察重复性,所得结果计算CV值：将高值标准品血清（250ng／ml）按1：1比例加入每份正常对照组血清中,肝癌组病人血清与生理盐水按1：1稀释后再按1：1比例加入高值标准品血清（250ng／ml）,每份检测2次（TRFIA法）取平均值,计算回收率。结果肝癌组AFP值（TRFIA法：558±319．10ng／ml;ECLIA法：552．31±302．67ng／ml）明显高于正常组（TRFIA法：6．51±5．42ng／ml;ECLIA法：6．32±5．14ng／m）（P〈0．05）,两种方法结果无显著差异（P〉0．05）,其相关系数为0．9150,测定结果呈正相关。高、中、低3种浓度标准品的重复性试验TRFIA法与ECLIA批内变异系数分别低于7．9％和3．1％,后者优于前者,两种方法略有不同,无明显差异（P〉0．05）。回收试验结果,TRFIA法回收率在92．3％～103．9％。结论国产TRFIA法试剂盒和ECLIA法检测AFP相比较具有良好的相关性。灵敏度和稳定性也较好．可应用于临床血清AFP检测。