应用荧光标记基因分型对中国汉族人群进行遗传多态性研究

目的：为了确定我国汉族人群遗传多态性片段大小范围与法国人群的差异，更好的进行基因组扫描和个体识别等方面研究。方法：400个微卫生位点分别在32个反应管中进行扩增。在5μl反应体系中加6－17对PCR引物，多个微卫生位点同时扩增，产物在AB1377XLDNA测序仪上进行电泳。结果：400个微卫生位点共有306个有满意的结果，其中124个微卫星位点与法国CEPH家系存在片段范围的差异。结论：遗传多态性片段大小范围在种族间存在较大差异；在对中国汉族人群进行基因分型时，应在Genethon提供的范围基础上向两侧各扩大10bp。     

湖北汉族群体9个STR位点遗传多态性分析

目的 :应用荧光标记短串联重复序列 (shorttandemrepeat,STR)位点复合扩增方法 ,了解湖北汉族人 9个STR位点 (D3S135 8、vWA、FGA、D8S1179、D2 1S11、D18S5 1、D5S818、D13S317、D7S82 0 )的遗传多态性分布。方法 :选取2 2 0名无血缘关系的湖北汉族个体。采用Chelex法提取毛球和血液DNA ,将各STR位点引物用三色荧光标记后进行复合扩增 ,PCR产物经PE310遗传分析仪自动分析 ,并进一步进行遗传多态性研究。结果 :9个STR位点基因型观察数 19～ 5 0个 ,等位片段数 7～ 16个 ,多态信息含量介于 0 .7335～ 0 .84 5 2之间 ,个人识别率介于 0 .8971～0 .95 6 4之间。 9个STR位点在中国汉族人群中的等位基因频率分布与白色人种、黑色人种之间差异有显著性。结论 :采用荧光标记引物进行复合扩增 ,结合PE310遗传分析仪自动分析 ,可以有效地区分各位点的扩增产物。 9个STR位点的基因型分布均符合Hardy Weinberg平衡 ,所得到的基因频率等结果为人类群体遗传研究提供了数据     

利用多个微卫星位点判断病例对照关联研究中的人群层化

目的利用多个与脑卒中无关的基因微卫星DNA多态性判断脑卒中病例对照人群的遗传背景。方法多中心病例对照研究,从7个临床中心随机选取294例脑卒中病例和325例对照,采用微卫星荧光标记、半自动基因分型技术,检测8个位于不同染色体上的微卫星多态性位点D11S1361、D19S927、D7S483、D14S990、D15S993、D1S2622、D1S2876和D3S3560,比较各等位基因片段在病例组和对照组的频率分布。结果D11S1361观察到3种等位基因;其余位点的多态性信息含量为0.63～0.81,各等位基因的片段大小、频率分布与白种人(法国人类多态研究中心提供)存在一定差异。7个微卫星多态的各主要等位基因频率在脑卒中病例组和对照组的分布,差异无统计学意义(P>0.05)。结论所选用的微卫星位点具有高度多态性和种族差异性,脑卒中病例对照人群的遗传背景有较好的一致性。     

上海市汉族人群与PKD1基因紧密连锁的微卫星DNA的多态性分析

目的；研究与多囊肾病PKD1基因紧密连锁的4个微卫星DNA的多态性，为家系连锁分析和临床分子诊断提供有用的遗传标记。方法：抽提上海市80名汉族无关个体（均为健康志愿者）的DNA，对其进行4个微卫星位点（KG8，SM6，CW2和SM7）的PCR扩增，采用毛细管电泳分离PCR扩增增加，用GeneScan^TM,Genotyper^TM软件对其进行基因分型。结果：在上海市汉族人群中，发现KG8，SM6，CW2，SM7分别有4，10，11和9个等位基因片段，其杂合度和多态信息含量分别为0.29和0.274,0.852和0.819,0.786和.779,0.85和0．827，群体分布符合Hardy-Weinberg平衡。结论：微卫星位点SM6，CW2，SM7具有较高的杂合度和多态信息含量，在基因连锁分析和群体遗传学中具有产重要的应用价值。     

系统性红斑狼疮患者CTLA-4基因-1661位点多态性研究

目的　研究细胞毒性T淋巴细胞相关抗原 4 (CTLA 4 )基因启动子区 16 6 1位点 (A/G)多态性在中国南方地区汉族人群中的分布及其与系统性红斑狼疮 (SLE)的相关性。　方法　采用聚合酶链反应 (PCR) 限制性片段长度多态性 (RFLP)方法 ,对 10 3例SLE患者和 110例中国南方地区汉族正常对照者进行CTLA 4基因 16 6 1位点多态性检测。　结果　CTLA 4基因 16 6 1位点多态性在中国南方地区汉族人群中普遍存在 ,SLE患者CT LA 4基因 16 6 1位点基因型和等位基因频率与正常对照组比较差异无显著性 ;而CTLA 4基因 16 6 1位点基因型和等位基因频率分布 ,按性别分层后 ,男性SLE患者与同性别正常对照者之间及正常男性和女性对照者之间分别进行比较 ,差异均有显著性 (P <0 0 5 )。女性SLE患者与同性别正常对照者之间和男性与女性SLE患者之间分别进行比较 ,差异无显著性。在不同人种CTLA 4基因 16 6 1位点基因型分布存在差异 (P <0 0 5 )。　结论　CTLA 4基因 16 6 1位点多态性与SLE的易感性无关。在中国南方地区汉族正常人群CTLA 4基因 16 6 1位点基因型分布存在性别差异。     

中国汉族人群Megsin基因变异与部分多态性位点鉴定

目的：了解中国汉族人群Megsin基因变异,并对部分多态性位点进行鉴定,筛选适合IgA肾病相关研究的多态性位点．方法：从基因库中挑选部分Megsin基因不同功能区域的单核苷酸多态性（SNP）位点,应用聚合酶链式反应．限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）和直接测序的方法,鉴定IgA肾病患者和正常对照组各位点基因型,计算各位点杂合度,根据杂合度大小和疾病组与正常对照组杂合度的差别,筛选适用于IgA肾病相关研究的多态性位点．结果：在12个从基因库挑选的SNP位点中,6个在我国汉族人群中未发现具有多态性,6个具有多态性．在第5内含子发现两个新的SNP位点．在8个确实具有多态性的位点中,3个属少见多态,5个属常见多态,各SNP位点杂合度在IgA肾病组和正常对照组差异无显著性（P〉0．05）．结论：中国汉族人群Megsin基因变异与基因库中高加索人群存在较大差异,这可能与中国汉族人群对IgA肾病的高发病率具有重要联系．     

醛糖还原酶基因5’端微卫星多态性在中国汉族人群中的分布特点

目的 :了解醛糖还原酶 (AR)基因 5’端微卫星多态性在中国北方汉族人群中的分布特点及其在不同种族间分布的差异。方法 :通过同位素放射自显影方法对 1 1 7例正常中国北方汉族AR基因 5’端微卫星多态性进行检测 ,并结合文献对不同种族间该基因位点多态性进行比较分析。结果 :中国北方汉族人群中存在 9个等位基因 ,2 3种基因型 ,各等位基因出现频率与香港中国人群无差异 ,但Z等位基因频率与英国白人间存在明显差异 ,Z/Z纯合子在英国白人中显著增高。结论 :AR基因 5’端微卫星多态性在不同种族间存在着明显差异。这种差异可能是导致AR基因多态性在不同种族糖尿病慢性并发症中有不同结果的原因之一     

河南汉族人群D7S3048基因座遗传多态性分布

目的:了解河南汉族人群中STR基因座D7S3048的遗传多态性.方法:采用PCR扩增、变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染技术分析河南地区119例无血缘关系汉族人群该STR位点的遗传多态性.结果:首次获得河南汉族人群中D7S3048的分布情况.D7S3048基因座检出10个等位基因,基因型为37个,基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡.汉族与蒙古族相比较,等位基因分布有差异.结论:河南地区汉族人群中D7S3048位点具有较高的多态性,在法医学和人类遗传学研究中是很好的遗传标记.     

宜昌地区人群TLR4受体Asp299Gly、Thr399Ile位点多态性研究

目的研究TLR4受体Asp299Gly、Thr399Ile位点多态性在宜昌地区健康汉族人群中的分布。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析技术(PCR—RFLP)法对156例宜昌地区无血缘关系的汉族健康人,进行TLR4受体Asp299Gly、Thr399Ile两位点的基因型检测。结果宜昌地区无血缘关系的汉族健康人TLR4受体基因Asp299Gly位点男女Asp／Asp、Asp／Gly和Gly／Gly的基因型频率分别为0．818,0．148,0．034和0．824,0．147, 0．029:Thr399Ile位点男女Thr／Thr、Thr／Ile和Ile／Ile的基因型频率分别为0．977,0．023,0．000和0．941,0．044, 0．015。与英国、法国等国人群相比,该位点多态性不存在显著性差异。TLR4受体Asp299Gly、Thr399Ile两位点的基因型男女之间也无显著性差异(X2=0．028,P=0．986)(X2=1．894,P=0．388)。结论宜昌地区健康汉族人群存在TLR4受体Asp299Gly、Thr399Ile两位点的基因多态性,并在不同种族和性别间的分布不存在显著性差异。     

湖北汉族人载脂蛋白B基因(TTTA)n微卫星DNA序列分析

目的:探讨湖北汉族人载脂蛋白B基因(TTTA)n微卫星DNA碱基序列特征。方法:采用聚合酶链反应扩增载脂蛋白B基因(TTTA)n微卫星DNA,扩增产物经纯化、测序反应、上机测序等步骤进行序列分析。结果:①对ApoB(TTTA)n扩增片段为147bp的基因序列分析发现,湖北汉族人群ApoB(TTTA)n等位基因为12.8,即该基因位点有12次(TTTA)串联重复,在(TTTA)n串联重复序列间夹有2次(TTTG)串联重复;②湖北汉族人群ApoB基因(TTTA)n微卫星DNA序列第一个(TTTA)前为“C”碱基,最后一个(TTTA)后有连续6个“T”碱基。结论:湖北地区汉族人群ApoB基因(TTTA)n微卫星DNA序列具有自身的碱基序列特征。     

东北汉族群体19个Y-STR基因座多态性和东北亚地区各民族的聚类分析

目的 研究东北汉族群体的19个Y-STR基因座的遗传多态性和东北亚15个群体间的遗传关系,探讨其法医学和群体遗传学研究的应用价值.方法 采用Y-filer复合扩增体系对200例东北汉族无血缘关系的男性个体的19个Y-STR基因座进行扩增,应用ABI310分析仪进行基因分型,采用Arelquin3.11、Mega4.1和SPSS17.0软件进行群体间的AMOVA分析、聚类分析和多维标度分析.结果 东北汉族群体的19个Y-STR基因座的基因多态性普遍较高,共检出200个单倍型,单倍型多态性在0.350 9(DYS391)～0.971 1(DYS385a/b),适合应用于法医学个体识别和亲权鉴定;东北亚15个群体间存在差异,遗传距离在0.000 9～0.643 2,群体间聚类分析和多维度分析结果与民族起源和迁徙史基本相一致.结论 东北汉族群体的19个Y-STR基因座的基因多态性普遍较高,适合应用于法医学个体识别和亲权鉴定中.     

朝鲜族和汉族男性DYS441和DYS442基因座多态性分析

[目的]研究Y染色体微卫星基因座DYS441,DYS442在吉林省朝鲜族和汉族男性人群中的分布特征.[方法]采用PCR扩增结合聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和银染显带方法对205名朝鲜族男性和207名汉族男性DYS441,DYS442基因座进行检测,并用Arlequin 2000软件进行数据分析.[结果]在朝鲜族男性人群DYS441基因座中检测到8个等位基因,个人识别能力为0.749 3,DYS442基因座中检测到7种等位基因,个人识别能力为0.508 3;在汉族男性人群DYS441基因座中检测到8个等位基因,个人识别能力为0.803 1,DYS442基因座中检测到5种等位基因,个人识别能力为0.627 3.分析由2个基因座共同构成的单倍型,在朝鲜族人群中检测到23种,在汉族人群中为31种,其单倍型变异度分别为0.874 6和0.927 2.[结论]DYS441和DYS442基因座具有较高的遗传多态性,是较理想的遗传标志,可为朝鲜族和汉族人群法医学个人识别、亲权鉴定及父系遗传学研究提供基础资料.     

CTLA-4基因微卫星多态性与广西地区壮、汉族Graves病的相关性研究

目的:研究CTLA-4基因微卫星多态性与广西地区壮、汉族Graves 病(GD)的相关性.方法:112例广西地区壮、汉族GD患者和94例正常对照组,应用聚合酶链反应技术,检测CTLA-4外显子4的3'非翻译区包含(AT)n[CTLA-4(AT)n]重复序列的特异性等位基因.结果:①广西地区壮族人细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4(CTLA-4)微卫星多态性有19种等位基因,汉族人有18种等位基因;②壮、汉族GD组与正常对照组比较,106 bp等位基因频率显著增高(P＜0.05),汉族正常对照组104 bp等位基因频率较GD组高(P＝0.01);③壮族正常对照组未发现104 bp等位基因高于GD组.结论:CTLA-4基因与广西壮、汉族GD患者明显相关,CTLA-4(AT)n 106 bp可能是广西壮、汉族GD的易感等位基因,104 bp可能是广西汉族GD的保护基因.     

江苏汉族24个Y-STR基因座遗传多态性及遗传关系研究

目的:分析24个Y染色体短串联重复序列(STR)基因座在江苏汉族群体的基因多态性?基因频率和其他地域人群之间的遗传距离?方法:取2011~2012年来自江苏省的262份无血缘关系的汉族个体,对24个STR位点进行复合扩增,ABI 3130自动基因分析仪进行片段分析并进行基因分型?结果:共发现172个STR等位基因,其中DYS385b?DYS449基因座发现14种等位基因,单倍型共发现262个,单倍型多样性为0.999 9,统计10个群体遗传距离Rst矩阵,提示江苏人群更偏向于以天津(-0.001 8)?河南(-0.001 76)?山西(-0.001 6)为群体的中原人群,而与湖南(0.017 54)和辽宁(0.014 64)人群的遗传距离最远(P < 0.05)?结论:获得具有江苏汉族人群特征的遗传学和法医学客观基础数据,对建立具有江苏地区特点的Y-STR数据库有重要意义?     

吉林地区汉族人群4个Y-STR基因座的遗传多态性调查

目的调查吉林地区汉族人群4个Y染色体短串联重复序列（Y-STR）基因座的遗传多态性。方法利用PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对吉林地区汉族群体无关男性血样进行4个Y-STR基因座的分型。结果4个Y-STR基因座在吉林地区汉族群体分别发现4～5个等位基因,GD值最低为0.645 1（DYS389I）,最高为0.716 7（DYS19）。结论4个Y-STR基因座在吉林地区汉族群体均具有较高的遗传多态性,可应用于法医学个体识别和亲子鉴定。     

南充地区汉族群体15个STR基因座遗传多态性研究

目的获取15个短串联重复序列（STR）基因座在四川南充地区汉族人群的群体遗传学数据。方法160份EDTA抗凝血样采自南充地区无血缘关系的汉族个体。Chelex法提取DNA，AmpFISTR IdentifilerTM kit荧光标记试剂盒进行复合扩增，自动基因分析仪电泳并收集电泳结果数据，基因扫描分析软件计算扩增产物片段相对大小，基因分型软件进行样本基因型分型。结果在南充地区汉族人群160名无血缘关系的个体中共检出140个等位基因，其频率分布介于0．004～0．528之间。15个STR基因座的杂合度介于0．151～0．905之间，累积个人识别率和累积非父排除率分别达到0．999998和0．999999。结论该15个STR基因座具有高度多态性，是较理想的遗传标记，所得到的等位基因频率等数据可为南充地区汉族人群的法医学个人识别、亲子鉴定及群体遗传学研究提供基础依据。     

内蒙古地区汉族新生儿呼吸窘迫综合征与SP-B 1580位点基因多态性的相关性研究

目的 研究肺表面活性物质蛋白B（SP-B）基因1580位点与内蒙古地区汉族新生儿呼吸窘迫综合征（NRDS）的关系.方法 采用前瞻性研究方法,选择100例汉族NRDS患儿（病例组）与100例汉族正常新生儿（对照组）作为研究对象,应用PCR基因分析技术检测SP-B 1580位点基因多态性,分析多态性与NRDS的关系.结果 内蒙古地区汉族SP-B 1580位点基因型均可检出3种基因型：即TT、CT及CC型.汉族NRDS组此3种基因型频率分别为：9.0％、27.0％和64.0％,T等位基因频率为19.5％,C等位基因频率为80.5％.汉族正常对照组3种基因型分别为13.0％、40.0％和47.0％,T等位基因频率为33.0％,C等位基因频率为67.0％.汉族NRDS组SP-B 1580位点基因型以C等位基因分布频率显著增高,关于SP-B 1580位点基因多态性汉族NRDS组与汉族正常对照组相比有统计学差异（x2=5.499,P=0.019）.结论 内蒙古汉族新生儿SP-B基因型及等位基因频率在不同性别、出生体质量、胎龄、生产方式等无明显关联;SP-B 1580C等位基因可能是内蒙古地区汉族新生儿患RDS的易感基因之一.     

马鞍山地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性调查

目的:调查292名马鞍山地区汉族无关个体15个STR基因座的等位基因类型及其频率。方法:用硅珠法提取DNA,采用AmpFISTR Identifiler荧光标记复合扩增系统进行复合扩增;扩增产物用ABI3130xl型遗传分析仪检测,得到STR分型结果后统计15个基因座的基因频率。结果:15个STR基因座,累计个人识别率达0.999 999 999 999 999 985,累计非父排除率为0.999 998 96。结论:该系统在马鞍山地区汉族人群中具有高度多态性,适用于法医学亲权鉴定、个体识别以及DNA数据库的建立。     

陕西汉族35个插入/缺失位点的多态性与遗传结构分析

目的 分型并评估35个插入/缺失多态性(DIP)位点在陕西汉族中的多态性及法医学应用效能,并探索陕西汉族的群体遗传结构。方法 收集来自陕西地区汉族305名无关健康个体血样,基于课题组前期甄选并构建的包含35个DIP位点的复合扩增体系进行检测和分型,并计算35个DIP位点的等位基因频率和法医学参数。通过分子方差分析、系统发育树的构建、多维尺度分析、主成分分析和遗传结构分析,进一步探索陕西汉族与29个参考群体之间的群体遗传关系。结果 35个DIP位点在陕西汉族中累积的个体识别率和非父排除率值分别为0.999 999 999 999 991 119和0.9991。群体遗传学分析结果显示陕西汉族与我国不同地区的汉族群体遗传关系更近。结论 35个DIP位点在陕西汉族的多态性较高,可应用于法医学个体识别,也为陕西汉族的群体遗传学研究提供了基础数据。