江苏省HIV耐药警戒线的调查

目的:了解江苏省开展艾滋病抗病毒治疗以来,耐药毒株的传播情况和亚型分布?方法:通过横断面调查,采集17~25岁HIV-1感染者的全血样品,测定HIV-1pol区编码蛋白酶和逆转录酶基因的序列,提交到斯坦福大学HIV在线耐药数据库中鉴定耐药位点?用MEGA4.0软件构建进化树,分析亚型?结果:47份样品中,没有发现HIV-1的耐药株?共有CRF01_AE?B?CRF07_BC和CRF08_BC 4种亚型流行,CRF01_AE是主要流行的亚型,占59.6%,其次为B亚型,占25.5%?结论:江苏省还未发现耐药株的传播,个体治疗前尚不需要进行耐药性检测?在江苏省流行的HIV-1亚型与2006年相比,已经发生了显著变化,为掌握目前江苏省HIV-1的亚型分布,应对近2年发现的HIV感染者进行分子流行病学研究?     

江苏省连续3年HIV-1耐药警戒线及流行亚型的调查研究

目的:了解江苏省艾滋病新近感染者在开展艾滋病抗病毒治疗以来HIV-1耐药株的传播水平及亚型分布情况?方法:采用WHO的截断序贯抽样法,连续3年在江苏省部分地区采集16~25岁HIV-1新近感染者的血样本各65?66和49例,提取病毒RNA,采用RT-PCR和巢式PCR扩增HIV-1pol区片段并测定pol区编码蛋白酶和逆转录酶基因的序列,提交到斯坦福大学HIV在线耐药数据库中鉴定耐药位点?用MEGA4.0软件构建进化树,分析亚型?结果:根据采样时间对样本排序,2009—2010年前47例未检出耐药样本数,2011年第28个序列出现1例耐药传播相关的耐药突变,后续一直到第44例均未有耐药样本出现,按传播水平判别表,属HIV耐药株的低度传播水平,采集的样本按pol区分型,2009?2010?2011年调查对象成功获得序列的前47例(2011年为44例)的亚型结果看,亚型以CRF01_AE为主,分别占40.40%?46.80%和56.80%,其次为CRF07_BC,分别为29.80%?25.50%?27.30%,其余还有CRF08_BC?C?B?URFA/B?结论:2009—2011年江苏省HIV-1新近感染者中HIV-1耐药株传播水平属低度,主要亚型流行情况与2006年本省调查结果类似,但与2003年前调查的HIV-1流行亚型比还是发生了显著变化?     

广东省HIV/AIDS患者抗病毒治疗后基因型耐药分析

目的 总结广东省261例HIV/AIDS患者抗病毒治疗1年以上,病毒未被抑制者的耐药基因型特征.方法 采用实验室自建方法,进行HlV-1耐药基因型检测.构建系统进化树确定基因亚型,并通过斯坦福HIV耐药数据库在线序列分析,确定耐药突变位点及药物耐受情况.结果 共检测样本280份,成功获得261条完整序列.序列分析显示:HIV-1病毒株以CRF01 AE亚型(194/261,74.3％)为主;逆转录酶(RT)区耐药位点以M184I/V(108/170,63.5％)、Y181C/V(61/170,35.9％)、K103N/S(56/170,32.9％)和G190A/S(48/170,28.2％)为主;蛋白酶(PR)区未发现主要位点突变,次要耐药位点主要为L10I/V(21/170,12.4％)和A71T/V(13/170,7.6％);未产生针对蛋白酶抑制剂(PI)的耐药;常见核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)拉米夫定(3TC)、恩曲他滨(FTC)的耐药率均为43.7％,高度耐药率均为42.1％;非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)奈韦拉平(NVP)及依非韦伦(EFV)的耐药率均为56.3％,高度耐药率分别为54.8％(143/261)和35.2％(92/261).耐药率随着抗病毒治疗时间增长而增加,初始单一用药人群耐药率76.7％(23/30)高于初始联合用药人群耐药率54.5％(126/231).结论 广东省抗病毒治疗1年以上且病毒未抑制的HIV感染者NRTIs耐药以3TC、FTC为主,NNRTIs耐药以NVP、EFV为主.临床上应及早发现耐药更改方案以保护TDF作为二线药物的有效性;在抗病毒治疗开始时应尽量避免单一用药.     

河南省部分地区HIV流行毒株的基因序列测定及亚型分析

目的:了解河南省内HIV-1流行株的亚型及序列变异特征.方法:在河南省尉氏县采集42例有偿献血HIV-1感染者静脉血,分离单个核细胞(PBMC),用套式聚合酶链反应(nest-PCR)对单个核细胞中前病毒脱氧核糖核酸(DNA)的膜蛋白(env)基因进行扩增,并对其C2-V3及邻区350～450个核苷酸序列进行测定和分析.结果:42份样品间的基因离散率为7.4%.与国际A-E亚型参考序列及部分地区B'亚型代表株序列相比较,河南省尉氏县的42个毒株及流行与我国云南德宏、四川等地的B'亚型毒株序列接近,均属于泰国B'亚型,基因离散率为6.72%系统树分析显示,42份样品仍和泰国B'亚型聚集,远离其他国际亚型.对V3环四肽序列的分析表明,具有泰国B'亚型基因型GPGQ的30例,具有欧美B'亚型的GPGR的7例.结论:根据以上数据及其它资料提示,目前河南省尉氏地区的既往献血人群中,泰国B'亚型依然占主导地位,该流行区毒株的传入与流行在云南德宏州的相同亚型HIV-1毒株密切相关.但是根据其离散率及系统树的结果提示,既往献血人群中泰国B'亚型有向其他亚型进一步变异的趋势,应引起有关部门的注意.     

辽宁省99例人类免疫缺陷病毒1感染者gag-pol区基因序列分析

目的 研究辽宁省人类免疫缺陷病毒／艾滋病（HIV／AIDS）患者gag-pol区的基因序列特征。方法采集辽宁省99例HIV-1感染者外周静脉血,提取前病毒DNA,经巢式PCR方法扩增gag—pol区2．6kb片段,与HIVS序列数据库中亚型参考序列共同构建系统进化树以区分亚型,并计算gag—pol区不同编码区域的基因离散率和Ks／Ka比值。结果 在辽宁省99例HIV-1感染者中发现A、B’、B、C、G5种亚型,循环重组型CRF01_AE、CRF03_AB、CRF06_cpx、CRF07_BC、CRF08_BC5种循环重组型和循环重组型间的重组ICR07／08。以B’亚型最多见,其次为CRF01_AE。在gag—pol区内,p17区、p2-p6区基因离散率高于p24区、蛋白酶及逆转录酶编码区。但B亚型p24区基因离散率处于较高水平。CRF07_BC和CRF08_BC在gag-pol各区基因离散率及同义替换、错义替换普遍处于较低水平。各亚型毒株的p2-p6区的Ks／Ka值最低,其均值〈1,而CRF01_AE毒株RT区的Ks／Ka值高达10．45。结论 辽宁省流行的HIV-1 gag—pol区亚型十分复杂。p24、蛋白酶及逆转录酶编码区是更为保守的区域。B亚型毒株的p24区承受较大的正向选择压力,CRF01_AE毒株RT区承受了较大的负向选择压力。CRF07_BC和CRF08_BC传入辽宁省的时间较短,奠基者效应明显。     

湖北省未经抗病毒治疗的HIV-1感染者的耐药基因变异分析

目的了解湖北省部分地区未经抗病毒治疗的HIV感染者的耐药基因变异情况。方法采集HIV—1感染者抗凝全血，提取血浆病毒RNA，用巢式PCR方法（Nested polymerase chain reaction，nested—PCR）扩增HIV—1pol区基因片段的核酸序列，并进行序列测定及耐药基因型分析。结果135份样本中有115份扩增出pol区基因并进行序列测定。在蛋白酶基因上检测到的基因突变有：L63ASP（99．13％），A71TV（32．18％），V77IM（93．04％），193L（90．43％），L10I（1．74％），K20EMR（3．48％），L24V（0，87％），V32AE（1．74％），M36I（2．61％），147M（0．87％）；逆转录酶上针对核苷类逆转录酶抑制剂的突变有：E44K（0．87％），T215S（0.87％）；针对非核苷类逆转录酶抑制剂的突变有：K103INR（3．48％），V106I（1．74％），G190AR（1．74％）。显示115份样本中对NNRTIs的高度耐药突变出现2例，而针对PIs和NRTIs没有出现中度以上的耐药突变。结论湖北省未经抗病毒治疗的HIV感染者多数对现有的免费抗病毒药物敏感，但也发现有少数耐药基因的存在。应加强用药的科学性和抗病毒治疗用药的监管。     

1997～2000年我国华东地区HIV-1分离株抗原决定簇氨基酸及其编码核苷酸序列的变化

①目的 对1997-2000年来自华东地区52例HIV-1分离株env基因C2-V3区序列及其V3环顶端主要中和抗原决定簇（PND）氨基酸序列的变化规律进行分析。②方法 以来自同时期上述地区的HIV-1感染者PBMC基因组为模板，采用套式PCR扩增HIV-1env基因C2-V3区片段，产物经克隆，测序。DNA测序结果经DNA Star软件分析HIV-1分离株的基因分型，比较HIV-1膜蛋白V3环顶端PND相关用八肽氨基酸及其编码核苷酸序列的变化特征及出现频率并测其共享序列。③结果 1997-2000年华东地区HIV-1分离株的基因分型有7个，分别属于HIV-1M亚群的A-G亚型。分离株间的基因离散率为1.2%-5.8%。同时发现了env基因双V3区变异的HIV-1自然突变朱（Genbank AF220245)。分析52株PND相关八肽基因序列，其中以第2、3、7位氨基酸及其编码核苷酸的变化最为显著，分别为11.5%，9.6%，9.6%，且3组共享序列相关的八肽亲水性有明显差异。④结论 1997-2000年华东地区HIV-1流行呈现多个型别共同，混合流行的特征，膜蛋白PND的八肽基因序列呈现多样性变化，新的HIV-1膜蛋白双V3区变异株的发现可能与病毒重组，免疫逃避及致病机制有关。     

慢性乙型肝炎患者HBV耐药模式及rtA181变异准种分析

目的 分析慢性乙型肝炎患者HBV逆转录酶区耐药变异情况及rtA181变异准种的分布.方法 提取患者血清中HBV DNA,PCR扩增逆转录酶区域,产物测序后经软件比对分析耐药变异情况和基因型;对部分rtA181变异标本进行克隆后测序分析准种分布.结果 489例标本中,检出明确耐药变异265例,在B、C基因型中分布比例存在差异(56.6％ vs 43.0％,P=0.022).拉米夫定相关耐药138例(52.1％),以M204I、M204I/V+L180M±L80I/V变异为主;阿德福韦相关耐药35例(13.2％),以N236T+ A181T/V较为多见;拉米夫定+阿德福韦相关耐药70例(26.4％),几乎都和A181有关.rtA181准种分析发现1例位于同一病毒株的多耐药组合,且未发现单一A181T变异的病毒准种.结论 HBV耐药变异主要表现为M204和A181相关变异,耐药模式复杂;检测HBV逆转录酶区的变异有助于临床及时发现和确认耐药情况,指导临床合理进行抗病毒用药.     

拉米夫定耐药慢性乙型肝炎患者HBV P基因区突变序列分析

目的 探讨拉米夫定耐药慢性乙型肝炎(CHB)患者HBV P基因逆转录酶区(RT区)序列突变特点.方法 收集115例接受拉米夫定治疗的CHB患者的临床资料,采用PCR产物直接测序法检测HBV P基因RT区序列耐药变异.结果 人选的115例患者中103例检测到拉米夫定基因型耐药变异,最主要的耐药变异模式为rtL180M rtM204V和rtM204I,分别占58.3％和22.3％,其他耐药位点包括rtL80V/I、rtT184S和rtA200V,并在5例患者中检测到RT区3个位点的联合变异.结论 对拉米夫定治疗患者的耐药检测除了HBV P基因区常见的rtL180和rtM204位点变异外,还应考虑其他位点的联合耐药变异.     

核苷(酸)类似物抗HBV过程中出现短暂性病毒学突破与逆转录酶区基因变异的关系

目的探讨慢性乙型肝炎患者经核苷(酸)类似物抗病毒治疗后出现短暂性病毒学突破与逆转录酶区基因变异的关系。方法在随访门诊中抽取16例接受核苷(酸)类似物抗病毒治疗出现短暂性病毒学突破者的预留血清,并提取HBV DNA,采用巢式PCR方法扩增HBV逆转录酶区基因,PCR产物回收纯化后直接测序,将直接测序结果用DNASTAR进行分析,找出HBV逆转录酶区基因的变异位点和相应的氨基酸。结果 16例短暂性病毒学突破患者HBV逆转录酶区均出现不同程度的点突变,其中主要的变异位点rtI/F122L、rtQ130P、rtS135Y、rtK149Q、rtW275替换为终止密码子(TAG)、rtV266I、rtH/Q271E的发生频率分别为56.3%、37.5%、43.8%、56.3%、50.0%、37.5%和37.5%,但无一例出现既往报道的常见耐药位点(rtI169T、rtV173L、rtL180M、rtA181V/T、rtT184G、rtA194T、rtS202I/G、rtM204I/V、rtI233V、rtN236T、rtM250V/L)变异。结论短暂性病毒学突破者逆转录酶区可出现不同程度的核苷酸位点变异及氨基酸替换,但均未检测到核苷(酸)类似物相关的常见耐药位点的变异。     

云南省HIV-1 CRF01_AE毒株基因型耐药研究

目的 了解云南省HIV-1 CRF01_AE毒株的流行分布及基因型耐药情况。 方法 收集2018—2021年云南省抗病毒治疗失败的HIV/AIDS患者的人口学资料,采集患者血浆,逆转录聚合酶链反应扩增HIV-1 pol基因蛋白酶和逆转录酶区并进行序列测定,对基因型为CRF01_AE的序列进行耐药情况分析。结果 通过基因型耐药检测共获得967例亚型为CRF01_AE序列,其中男性682例（占70.5%）,耐药509例,耐药率为52.6%,异性性传播813例（占84.1%）,同性性传播95例（占9.8%）。同性性传播的耐药率最高,为65.3%;治疗时长<12个月的耐药率最低,为35.9%,36~<48个月耐药率最高,为58.1%。核苷类反转录酶抑制剂（NRTIs）耐药率为33.9%,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）的耐药率为48.5%,蛋白酶抑制剂（PIs）的耐药率较低为1.3%。NRTIs类药物中阿巴卡韦（ABC）、恩曲他滨（FTC）和拉米夫定（3TC）耐药率较高,分别为为32.9%、32.4%和32.4%;NNRTIs类药物中奈韦拉平（NVP）和依非韦仑（EFV）耐药率较高,分别为47.6%和47.5%,均以高度耐药为主。一线治疗方案耐药率56.2%高于二线治疗方案耐药率29.5%,差异有统计学意义（P<0.001）。NRTIs耐药突变位点中,以M184V/I突变位点为主,突变率为30.0%;NNRTIs耐药突变位点中,以K103N/Q/S突变位点为主,突变率为28.1%;PIs耐药位点突变率相对较低,主要的耐药突变位点是L33F,突变率为3.7%。结论 云南省抗病毒治疗失败亚型CRF01_AE的患者耐药率有所降低,但部分地区及人群的耐药率仍较高,应加强对重点地区和人群的管理,加强耐药监测,对治疗失败的患者及时掌握耐药情况,合理调整治疗方案。     

海南省抗病毒治疗失败HIV/AIDS患者HIV-1亚型及基因型耐药分析

目的 了解海南省经艾滋病抗病毒治疗(antiretroviral therapy,ART)失败HIV/AIDS患者的HIV-1基因型耐药特点,为海南省HIV/AIDS患者有效抗病毒治疗提供基础依据.方法 采集2014-2019年ART治疗失败的患者血样进行基因型耐药检测,分析HIV-1毒株亚型与耐药突变特点.结果 17...     

贵州省艾滋病患者耐药基因突变研究

目的研究艾滋病(AIDS)患者耐药基因突变情况,为防止AIDS耐药传播及流行提供科学依据。方法采用NueliSens EasyQ荧光实时定量PCR系统对治疗1年以上的AIDS患者进行病毒载量检测,病毒载量>1 000 U/ml者采用Abbott公司ViroSeqTMHIV-1 Genotyping System V2.0系统进行扩增、测序和基因突变分析。结果 1 088例AIDS患者中病毒载量>1 000 U/ml者45例,获得POL区基因序列30例,且均有不同程度基因突变,仅7例产生耐药,总耐药率为0.64%(7/1 088);发现交叉耐药2例。7例耐药的AIDS患者均出现至少1种耐药相关基因突变位点,突变率为23.3%(7/30)。7例AIDS患者均对非核苷类逆转录酶抑制剂产生耐药基因突变,其耐药突变位点为K103N 4例、G190A 2例、V179D 1例、Y181C 1例、K101E 1例、M230L 1例,临床主要表现为对地拉韦定、依非韦仑及奈韦拉平高度耐药,其中有2例对核苷类逆转录酶抑制剂产生耐药基因突变,突变位点为M184V,临床上表现为对拉米夫定和恩曲他滨高度耐药。未见蛋白酶抑制剂耐药基因突变。结论贵州省AIDS患者的耐药情况目前仍处于较低水平且耐药形式较为单一;核苷类逆转录酶抑制剂及非核苷类逆转录酶抑制剂对贵州省AIDS患者的广泛治疗和使用仍然有效;及时监控和掌握AIDS患者的耐药基因突变情况,对于指导临床用药尤为重要。     

重庆市新确证HIV-1感染者传播性耐药突变研究

目的 通过对重庆市新确证人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)感染者耐药基因型的研究,了解我市耐药病毒株的传播水平.方法 采集2014年5月至2017年6月我院新确证未治疗的HIV-1感染者的外周血175例,分离血浆后,使用一步法RT-PCR和巢式PCR扩增HIV-1 pol区的基因,PCR产物经纯化后测序,将获得的基因序列与美国雅培公司的耐药数据库对比,得出患者对药物的耐药性解释.结果 PCR扩增阳性且测序成功168例,发现16例患者存在耐药突变,传播性耐药突变检出率达9.5％ (16/168),其中2014-2017年的耐药比例分别为7.0％、8.0％、9.1％、12.5％,属中度流行.非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)和蛋白酶抑制剂(PIs)耐药突变率分别为9.5％、2.4％和0％.V179D/E(7.1％)和M184V(2.4％)分别是出现最多的NNRTI和NRTI耐药突变位点.168例感染者中,CRF07_BC亚型是主要流行亚型(42.8％),其次为CRF01_AE (38.7％)和CRF08_BC亚型(10.1％).结论 重庆市新确证未治疗HIV-1感染者耐药比例有逐年上升的趋势,应加强监测,预防原发性耐药和耐药毒株的传播.     

深圳地区新近诊断HIV-1感染者的传播耐药性检测

目的:通过对深圳地区人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)新近感染者耐药基因型的研究,了解当地HIV-1耐药株传播水平。方法:收集198例2009年3月～2011年10月新确诊的、年龄>20岁的HIV-1感染者的血浆样本,使用一步法RT-PCR和巢式PCR扩增Pol区蛋白酶基因全长(1～99aa)和逆转录酶区前部分基因(1～300aa),并进行耐药基因变异分析。结果:PCR扩增阳性且测序成功163例,总的耐药比例为17.2%(28/163,95%CI 11.4%～22.9%),其中3.7%(6/163,95%CI 1.1%～6.5%)对蛋白酶抑制剂(PIs)耐药,10.4%(17/163,95%CI 5.7%～15.1%)对核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)耐药,11.7%(19/163,95%CI 6.8%～16.6%)对非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)耐药。结论:深圳地区HIV-1新近感染者中耐药率高达17.2%,对新近HIV-1感染者进行连续耐药性检测是有必要的。     

我国部分地区抗HIV治疗效果实验室评估和耐药变异的初步研究

目的研究中国HIV/AIDS患者应用高效抗逆转录病毒治疗后,其病毒学、免疫学疗效以及对耐药变异的影响。方法对辽宁、吉林、河南三省HIV/AIDS患者采用三种治疗方案治疗前后进行病毒载量、CD4+T淋巴细胞数、耐药变异基因型监测。结果经HAART治疗6个月,辽宁病例病毒载量下降5.7log10拷贝/ml,有8/11的病例病毒载量达到最低检测限(LDL)以下,病毒抑制率为72.7%。吉林病例病毒载量下降幅度3.8log10拷贝/ml,有11/24的病例病毒载量达到LDL以下,病毒抑制率为45.8%。差异均有统计学意义(P<0.05)。辽宁HIV/AIDS患者治疗6个月后CD4+T淋巴淋巴细胞平均增加164个/mm3,吉林患者平均增加24个/mm3,个体差异很大。在应用逆转录酶抑制剂后有耐药变异发生,且交叉耐药、多药耐药常见。结论在应用逆转录酶抑制剂时一定要加强监测,规范化管理,及时调整用药以节省有限的药物资源并防止耐药株的传播。