长链非编码RNA调控肿瘤能量代谢重编程机制的研究进展

尽管目前普遍认为肿瘤细胞内存在能量代谢异常且影响肿瘤的生物学行为, 但能量代谢重编程的确切机制及对肿瘤细胞增殖、侵袭、转移影响的具体机制尚不明确。近年来, 有研究显示长链非编码RNA(lncRNA)在转录及转录后水平通过与特定核酸和蛋白结合, 能够特异性地通过转录干扰、基因的表观遗传调控、蛋白活性改变、竞争性结合microRNA(miRNA)等相关机制影响肿瘤细胞能量代谢和发生、发展。lncRNA调控肿瘤能量代谢重编程机制研究的不断深入有望为肿瘤诊断治疗开辟新的标志物和靶点。文章就目前lncRNA调控肿瘤葡萄糖、脂肪酸、蛋白质和核苷酸代谢重编程作用机制的研究进展作一综述, 以期为lncRNA调控能量代谢通路为靶向的抗肿瘤治疗提供新思路。     

沉默lncRNA FTX通过miR-22-3p/NLRP3炎症体通路抑制胃癌细胞增殖

目的探究长非编码RNA(lncRNA)FTX通过miR-22-3p/NOD样受体蛋白3(NLRP3)炎症体通路对胃癌细胞增殖的调控作用。方法将胃癌细胞NCI-N87分为空白对照组、si-FTX-NC组、si-FTX组、si-FTX+miR-22-3p inhibitor-NC组、si-FTX+miR-22-3p inhibitor组。采用实时定量荧光PCR分析lncRNA FTX、miR-22-3p表达量, 克隆形成实验分析NCI-N87细胞增殖能力, 蛋白质印迹法分析NLRP3炎症体通路蛋白表达情况, 双荧光素酶报告实验分析lncRNA FTX和miR-22-3p的靶向关系。结果空白对照组、si-FTX-NC组、si-FTX组、si-FTX+miR-22-3p inhibitor-NC组、si-FTX+miR-22-3p inhibitor组lncRNA FTX相对表达量分别为1.03±0.09、1.01±0.15、0.42±0.08、0.45±0.06、0.46±0.13, 差异有统计学意义(F=52.19, P<0.001);miR-22-3p相对表达量分别为1.04±0....     

miRNA-3653-3p通过抑制PLAC8-Wnt-β-catenin信号通路降低子宫内膜癌细胞的增殖和侵袭能力

目的探讨miRNA-3653-3p(miR-3653-3p)对子宫内膜癌细胞增殖、侵袭能力的影响及其相关机制。方法从OncoLnc数据库中下载356例子宫内膜癌患者资料, 数据更新时间为2020年;采用Kaplan-Meier法分析miR-3653-3p表达水平与子宫内膜癌患者总生存的关系;采用miRGator数据库预测与miR-3653-3p存在结合位点的靶基因。选择人子宫内膜癌细胞株AN3CA、HEC-1A、HEC-1B、Ishikawa和人正常子宫内膜上皮细胞株ESC, 采用实时荧光聚合酶链反应(qRT-PCR)检测miR-3653-3p相对表达量。选取miR-3653-3p表达最低的细胞株为研究对象, 分为阴性对照组和miR-3653-3p组, 分别转染对照空载质粒和miR-3653-3p过表达质粒。采用CCK-8法检测细胞的增殖能力, Transwell法检测细胞的侵袭能力;qRT-PCR和蛋白质印迹法检测miR-3653-3p靶基因的表达。蛋白质印迹法检测miR-3653-3p对Wnt-β-catenin信号通路相关蛋白表达的影响。结果 OncoLnc数据库中数据分析显示,...     

长非编码RNA调控骨肉瘤耐药机制的研究进展

骨肉瘤是最常见的原发性实体骨恶性肿瘤, 化疗药物的耐药是导致骨肉瘤复发和转移的重要因素。长非编码RNA可通过调节上皮间质转化、细胞自噬、凋亡、药物外排、细胞周期等途径影响骨肉瘤耐药, 提示长非编码RNA可能成为治疗骨肉瘤耐药的新靶点。     

铜死亡相关差异长链非编码RNA评分公式在肾透明细胞癌中的临床价值

目的探讨基于生物信息学方法构建的肾透明细胞癌(ccRCC)预后相关的铜死亡相关差异长链非编码RNA(lncRNA)评分公式在患者临床诊断、预后预测以及治疗抉择中的价值。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取ccRCC患者的基因矩阵和临床数据(数据更新至2022年3月29日)。基因矩阵收录539例ccRCC组织和72例癌旁正常组织表达数据;临床数据收录530例ccRCC患者资料。采用Pearson相关性分析、Wilcoxon符合秩检验和单因素Cox比例风险模型分析筛选预后相关的铜死亡相关差异lncRNA。采用R软件将530例包含生存资料的ccRCC患者以近似1∶1的比例随机抽样分组, 分为训练集(266例)和验证集(264例)。采用LASSO回归构建铜死亡相关差异lncRNA评分公式并进行交叉验证。采用受试者工作特征(ROC)曲线评估铜死亡相关差异lncRNA评分公式的特异度和灵敏度, 计算曲线下面积(AUC)。根据中位风险值将ccRCC患者分为低风险组和高风险组, 采用Kaplan-Meier法分析高、低风险组患者总生存(OS)的差异。采用t检验分析不同临床病理特征患者的风险值差异...     

长链非编码RNA H19在血液系统恶性肿瘤中的研究进展

随着血液系统恶性肿瘤发病率的上升, 探索其发病机制和新治疗策略已成为新的研究方向。高通量测序技术的发展, 使得长链非编码RNA被人们所认识, 它们在生命的发展和疾病的调控中发挥着重要作用。H19是第一个被报道的长链非编码RNA, 作为癌基因参与肿瘤生长和转移等各种病理过程。然而, H19在血液系统恶性肿瘤中的多重作用尚缺乏系统性的综述。文章就H19在常见血液系统恶性肿瘤发生、进展及耐药机制中的作用进行综述, 以期为后续研究提供指导。     

长链非编码RNA MAFG-AS1通过靶向miR-143-3p/AKT2轴促进胃癌的进展

目的:探讨长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA) MAFG-AS1在胃癌(gastric cancer,GC)的发生和发展中的生物学功能及可能的作用机制.方法: 分别用GEPIA (Gene Expression Profiling Interactive Analysis)和Kap...     

miRNA-4686通过靶向PDIA4影响食管癌细胞增殖和迁移

目的探讨miRNA-4686(miR-4686)和蛋白质二硫键异构酶A4(PDIA4)在食管癌组织和细胞中的表达, 以及miR-4686体外对食管癌细胞增殖和迁移能力的影响及可能机制。方法采用miRWalk version 3在线网站预测到miR-4686与PDIA4 mRNA互补结合。利用从加州大学圣克鲁兹分校基因组(UCSC)数据库获得的miR-4686和PDIA4 mRNA的表达谱, 分析食管癌组织和癌旁组织中miR-4686和PDIA4 mRNA相对表达量。从UCSC数据库获得miR-4686在人体细胞中的定位。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测食管癌细胞Eca109、TE-13、EC9706、KYSE-510与正常食管上皮细胞HET-1A中miR-4686和PDIA4 mRNA的相对表达量。选择miR-4686相对表达量最低的Eca109细胞进行后续研究。将Eca109细胞分为miR-4686组(转染miR-4686模拟物)和miR-NC组(转染miR-4686阴性对照序列模拟物)。通过克隆形成实验检测两组Eca109细胞增殖能力, 划痕愈合实验检测Eca10...     

长链非编码RNA在胃癌临床应用中的研究进展

胃癌是常见的恶性肿瘤之一, 是全球癌症相关死亡的第3大原因, 严重威胁人类健康。长链非编码RNA(lncRNA)在多种层面参与胃癌的发生、发展, 并起到关键性的调节作用, 在胃癌的诊断、治疗以及预后评估方面发挥重要作用。文章就近年来lncRNA在胃癌临床应用中的研究进展进行综述。     

长链非编码RNA HAGLR对乳腺癌预后的影响及其竞争性内源RNA互作网络的构建

目的探究长链非编码RNA(lncRNA)HAGLR在乳腺癌中的表达情况及其对乳腺癌预后的影响, 并构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络。方法采用Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology网站检索HAGLR基因染色体定位及转录本表达情况。采用lnclocater网站预测HAGLR亚细胞定位。通过lnCAR数据库分析HAGLR在乳腺癌组织和癌旁组织的差异表达情况, 按HAGLR表达水平, 将lnCAR数据库患者分为HAGLR高表达组和HAGLR低表达组, 采用Kaplan-Meier法分析两组间总生存(OS)及无转移生存情况, 并通过UCSC Xena数据库进行验证。通过lnCAR数据库检索HAGLR共表达基因, 将排位前200个共表达基因提交至Metascape网站, 进行基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析, 构建蛋白互作网络(PPI)。采用生物信息学在线分析网站starbase预测HAGLR靶向的微RNA(miRNA)和可直接编码蛋白的mRNA, 通过Cytoscape3...     

超保守长链非编码RNA uc.77在肺癌中的表达及其调控作用

目的探讨超保守长链非编码RNA uc.77(uc.77)在肺癌中的表达及其分子机制。方法肺癌组织及癌旁正常组织来自2014—2016年解放军南部战区总医院确诊肺癌并行手术的61例肺癌患者。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测肺癌细胞株中uc.77的相对表达水平, 同时在61对肺癌组织及其癌旁正常组织中验证其表达趋势, 分析uc.77的表达与肺癌患者临床病理特征的关系。转染uc.77 siRNA敲低uc.77的表达, 采用细胞计数试剂盒8法和克隆形成实验检测细胞增殖能力, 流式细胞术检测细胞凋亡和细胞周期变化。将转染uc.77 siRNA的肺癌H1299细胞注射至BALB/c裸鼠构建荷瘤模型, 观察uc.77对肿瘤生长的影响, 对肿瘤组织进行HE染色和免疫组化检测, qRT-PCR和Western blot法检测p21 mRNA和蛋白表达水平。结果肺癌细胞系95-D、H1299、A549、H460、H446和16HBE-T中uc.77的表达水平高于正常支气管上皮样细胞16HBE(均P<0.05);61例肺癌组织中uc.77的表达水平高于旁正常组织(P<0.001...     

长链非编码RNA肺腺癌转移相关转录本1在血液系统肿瘤中的研究进展

肺腺癌转移相关转录本1(MALAT1)在多种肿瘤的发生过程中具有重要作用。近年来研究表明MALAT1在血液系统肿瘤中表达升高, 且可以作为竞争性内源RNA从转录和转录后水平等多层面参与血液系统肿瘤的发生、发展及预后, 因此, MALAT1有可能成为新型标志物, 为血液系统肿瘤的诊断、治疗及预后评估提供有价值的依据。     

肾透明细胞癌中miRNA-224-5p靶向NEDD4L调控轴的识别与研究

目的基于生物信息学方法筛选肾透明细胞癌关键基因, 识别可能的微RNA(miRNA)-mRNA作用轴, 探讨相关基因在肾透明细胞癌组织和细胞中的表达。方法选取基因表达综合(GEO)数据库基因表达谱GSE40435、GSE71302数据集, 肾透明细胞癌TCGA-KIRC数据集来自癌症基因组图谱(TCGA)数据库。采用R软件筛选差异表达的mRNA和miRNA, 并对mRNA进行功能富集分析。采用STRING数据库和Cytoscape软件进行蛋白质互作分析。采用Oncomir数据库筛选预后相关的差异表达miRNA。采用TargetScan和miRDB靶基因预测工具筛选miRNA可能调控的靶基因。收集2021年6月至12月山西医科大学第一医院收治的34例肾透明细胞癌患者的组织样本及临床资料, 并选择正常肾细胞株293T和肾透明细胞癌细胞株786O。采用实时荧光定量聚合酶链反应检测基因的相对表达量;蛋白质印迹法、免疫组织化学染色法检测目的蛋白的表达水平;双荧光素酶报告基因实验验证基因间的靶向关系。结果差异分析筛选得到1 351个差异表达mRNA和50个差异表达miRNA。功能富集分析提示肾透明细...     

长链非编码RNA HAGLROS在食管鳞癌组织中的表达及其对食管鳞癌细胞生物学行为的影响

目的 探讨长链非编码RNA HAGLROS在食管鳞癌组织中的表达及其与食管鳞癌患者临床病理参数之间的关系,分析HAGLROS对食管鳞癌细胞增殖及转移的影响.方法 运用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测HAGLROS在42对食管鳞癌组织与癌旁食管正常组织及食管上皮细胞Het1A及食管鳞癌细胞EC109和KYSE30...     

长链非编码RNA LOC101927476抑制卵巢癌细胞侵袭迁移和增殖

目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)LOC101927476在卵巢癌细胞中的表达及其对卵巢癌生物学特征的影响。方法选取2018—2019年于中国医学科学院肿瘤医院手术治疗的卵巢癌患者。采用实时荧光定量PCR(real-time PCR)检测卵巢癌细胞系3AO、OVCA429、TOV21G、A2780、SKOV3以及22例卵巢癌原发瘤和转移瘤组织中LncRNA LOC101927476的表达水平, 采用TCGA数据库中卵巢癌转录组测序数据验证LncRNA LOC101927476和GATA4的表达, 采用慢病毒包装体系构建过表达LOC101927476(OE-LOC101927476组)和空载(OE-EV组)慢病毒并转染至3AO细胞。设计单链向导RNA(sgRNA), 利用CRISPR/Cas9构建LncRNA LOC101927476敲除细胞系。采用Transwell法和划痕实验检测LncRNA LOC101927476对卵巢癌细胞侵袭和转移能力的影响。采用细胞计数盒8(CCK-8)法检测细胞的增殖能力。结果 real-time PCR显示, 22例卵巢癌患者中, 20例转移灶中L...     

肾癌索拉非尼耐药相关长链非编码RNA诱导骨肉瘤U2OS细胞侵袭和转移的机制

目的探讨肾癌索拉非尼耐药相关长链非编码RNA(lncRNA-SRLR)对骨肉瘤U2OS细胞侵袭和转移的机制。方法应用慢病毒空载对照(LV-NC)和慢病毒lncRNA-SRLR过表达载体(LV-over/SRLR)转染U2OS细胞, 并建立细胞稳转株U2OS/NC和U2OS/SRLR。应用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测lncRNA-SRLR和赖氨酸羟化酶(PLOD2)mRNA的相对表达量。采用transwell和划痕实验检测细胞迁移和侵袭能力。采用酶联免疫吸附法(ELISA)法检测白细胞介素6(IL-6)的表达情况。采用荧光原位杂交技术(FISH)检测lncRNA-SRLR细胞定位。采用免疫荧光法检测PLOD2蛋白的表达情况。采用Western blot法检测PLOD2和FAK/STAT3通路相关蛋白的表达情况。结果 qRT-PCR检测结果显示, U2OS/NC和U2OS/SRLR细胞中lncRNA-SRLR mRNA的相对表达量分别为1.00±0.01和3 964.97±0.05, 差异有统计学意义(P<0.001)。PLOD2 mRNA在U2OS/SRLR细胞中的表...     

长链非编码RNA在舌癌细胞上皮间质转化过程中的调节作用

舌癌恶性程度高,浸润性较强,易早期发生淋巴结转移。上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transformation,EMT)是生物胚胎发育中的基础过程,在肿瘤细胞的迁移与侵袭过程中发挥关键作用。长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)是一类参与多种生物学进程的非编码RNA,部分lncRNA在恶性肿瘤的发生发展过程中异常表达,并通过多种方式参与调节肿瘤细胞的EMT。全文就近年来lncRNA在舌癌细胞EMT过程中的调节作用作一综述。     

E2F1与lncRNA在恶性肿瘤发生发展中的作用

E2F1作为转录因子类的核蛋白基因, 与恶性肿瘤发生发展密切相关。长非编码RNA(lncRNA)在多种肿瘤中存在异常表达。在lncRNA与肿瘤相关分子机制研究中, E2F1是一个关键的因子, 可作为lncRNA的上游调控因子或下游靶标发挥作用, 甚至可以互为调控形成正反馈环。进一步研究E2F1与lncRNA在恶性肿瘤发生发展中的作用, 可为肿瘤机制研究提供思路。     

miRNA-221-3p对胰腺癌细胞凋亡的影响及机制研究

目的探讨miRNA-221-3p(miR-221-3p)在胰腺癌细胞中的表达及其对胰腺癌细胞凋亡的影响, 以及可能相关机制。方法选择胰腺癌PATU8988T细胞株, 使用Lipofectamine 3000分别转染miR-221-3p模拟物、miR-221-3p抑制剂及相应阴性对照序列, 将PATU8988T细胞分为阴性对照组(未进行任何处理)、miR-221-3p模拟物阴性对照组、miR-221-3p模拟物组、miR-221-3p抑制剂阴性对照组、miR-221-3p抑制剂组。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测miR-221-3p的相对表达水平, 流式细胞术检测miR-221-3p对胰腺癌细胞凋亡的影响, 蛋白质印迹法检测P53、PTEN蛋白在PATU8988T细胞株中的表达情况。结果阴性对照组、miR-221-3p模拟物阴性对照组、miR-221-3p模拟物组、miR-221-3p抑制剂阴性对照组、miR-221-3p抑制剂组miR-221-3p相对表达水平分别为1.02±0.18、1.50±0.33、2.96±0.70、1.62±0.30、0.36±0.05, 差...