2009年-2010年广东省风疹病毒分离株基因特征分析

目的:对2009年-2010年广东省两起疑似麻疹暴发疫情进行病原学鉴定,并对分离到的风疹病毒进行基因型别鉴定和分子流行病学特征的分析。方法:采集两起疑似麻疹暴发病例的血清学标本和病原学标本,使用ELISA法检测血清麻疹和风疹IgM抗体;同时将临床标本接种至Vero/Slam细胞进行病毒分离,通过逆转录-聚合酶链反应和序列测定与分析鉴定其基因型别。结果:2009年-2010年在广东省发生的两起疑似麻疹暴发证实是由风疹病毒引起,从暴发疫情中分离到的8株风疹病毒均为1E基因型,并且2009年和2010分离株之间的同源性为99.5%。结论:2009年-2010年广东省流行1E基因型风疹病毒,在广东省持续循环。1E基因型风疹病毒在我国广泛分布和流行,说明广东省的风疹病毒不是独立进化,而是与我国其他省份风疹病毒在共同进化。     

漳州市2005-2011年风疹流行特征分析

目的 分析漳州市2005-2011年风疹的流行特点,为制定防控策略和措施提供依据.方法 采用描述流行病学方法对疫情资料进行回顾性分析.结果 漳州市2005-2011年累计报告风疹1 612例,年均发病率4.77/10万,4～6月为发病高峰(77.5％);男、女发病率分别为5.60/10万和3.90/10万;发病集中在0～19岁(85.2％),学生和学龄前儿童占84.1％;风疹暴发均发生在中小学.结论 漳州市风疹发病率呈上升趋势,儿童和青少年是风疹发病的重点人群,应加强对该人群风疹减毒活疫苗的预防接种,落实学校等人群聚集场所的防控措施.     

2006 - 2015年江西省风疹病毒野毒株基因特性研究

目的 研究江西省近10年风疹病毒野毒株的基因特性,为江西省的风疹防控提供技术支撑。方法 采集江西省2006 - 2015年风疹疑似病例咽拭子标本,用Vero/SLAM细胞对标本进行病毒分离培养,再对细胞分离物进行核酸的提取,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）对细胞分离物进行风疹病毒核酸鉴定,采用RT-PCR对风疹病毒核酸检测阳性标本扩增病毒糖蛋白E1基因,对其核苷酸序列进行测定,运用生物学软件对测定序列进行处理分析。结果 江西省2006 - 2015年风疹病毒野毒株分属于2个基因型:1E基因型（14株）和2B基因型（20株）,1E基因型为江西省2005 - 2013年风疹病毒流行唯一基因型,并在2015年被2B基因型替代。1E和2B基因型各毒株之间E1基因核苷酸同源性分别为97.6%～99.9%和99.2%～99.9%,与疫苗株BRDII株核苷酸同源性分别为89.4%～89.9%和92.6%-93.0%,氨基酸同源性为98.8%～99.6%;氨基酸序列相对保守,未发现重要抗原位点的改变。结论 1E基因型和2B基因型为江西省2006 - 2015年风疹病毒流行的基因型,2B基因型为2015年首次在江西省发现,并为当年的绝对优势基因型。     

2019年河南省1E基因型风疹病毒结构蛋白基因特征分析

目的 分析2019年河南省1E基因型风疹病毒分离株结构蛋白基因特征,探讨抗原位点变异情况,为河南省风疹防控提供支持.方法 对河南省2019年风疹病毒分离株采用RT-PCR方法扩增结构蛋白基因片段并测序,截取C、E2、E1蛋白序列,使用Mega7.0.26软件进行进化树分析、同源性分析和氨基酸特征分析.结果 对5株1E基...     

逆转录-聚合酶链反应检测风疹病毒基因

针对风疹患者发病早期血清中特异性风疹IgM抗体阳性率低的特点 ,以及对胎儿风疹病毒感染检测的需要 ,采用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)直接从风疹减毒活疫苗BRDⅡ株、风疹GOS株、临床风疹患者的含漱液和咽拭子中检测出 411bp特异性片段 ;而麻疹、流行性腮腺炎、流行性感冒病毒均未检测出相应片段。通过对RT PCR一次产物的再次扩增 ,可以使检测的灵敏度达到 0 1TCID50 。该技术可作为风疹酶联免疫吸附试验 (ELISA)的一种补充 ,同时对控制先天性风疹综合征与优生优育工作具有积极的作用。     

吉林省2012年风疹野病毒分离株的基因特征分析

目的了解致吉林省2012年多起风疹爆发及散发的风疹病毒（Rubella Virus,RV）的基因型和特征。方法对采集的患者咽拭子标本进行病毒分离,通过逆转录．聚合酶链反应及序列分析方法、利用生物信息学软件确定基因型。结果30株RV核酸鉴定呈现阳性,基因型鉴定均为1E基因型,与世界卫生组织RV1E基因型参考株、中国RV编号为RVIDezhou（德州1）CHN（China,中国）021E的核苷酸同源性为97．9％～98．6％,氨基酸同源性100％。结论吉林省2012年多起风疹爆发及散发均由1E基因型的Rv引起,为吉林省RV分子流行病学研究提供了基础资料。     

辽宁省风疹野病毒基因特征分析

目的 了解辽宁省现阶段流行的风疹野病毒基因特征,为风疹的控制和消除提供科学依据。方法 用Vero/Slam细胞从2007-2008年采集的风疹暴发和散发患者标本中分离到22株风疹野病毒(Rubella Virus,RV),应用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)针对RV分离株的E 1基因739个核苷酸片段进行PCR扩增,再对扩增产物进行核苷酸序列测定,与世界卫生组织(WHO)RV基因型参考株进行分子流行病学比较分析。结果 核苷酸和氨基酸同源性比对及构建亲缘关系树结果显示,22株RV分离株属1 E基因型,核苷酸和氨基酸同源性分别为97.6%～100.0%和99.1%～100.0%;与1 E基因型参考株序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.0%～99.1%和99.1%～100.0%结论辽宁省分离的22株RV均为1 E基因型,并且可能是辽宁省现阶段的优势基因型。     

2013—2019年辽宁省流行风疹野病毒基因特征分析

目的 了解辽宁省2013—2019年风疹野病毒基因特征,为控制和消除风疹提供实验室依据。方法 采集2013—2019年辽宁省风疹疑似病例咽拭子标本,用Vero/Slam细胞进行病毒分离培养,通过逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增风疹病毒E1基因的739个核苷酸片段进行序列测定分析。结果 2013—2019年辽宁省共分离出31株风疹野病毒。其中29株为1E基因型,2株为2B基因型。29株1E基因型风疹野病毒分成2簇,2013—2015年6株病毒为Cluster1,与世界卫生组织（world health organization,WHO）参考株RVi-Shandong.CHN-0.02核苷酸与氨基酸同源性分别为98.1%～98.8%和95.7%～97.5%;2019年的23株病毒为Cluster2,与WHO参考株RVi-Kuala Lumpur-MYS-0.01核苷酸与氨基酸同源性分别为97.7%～98.1%和94.0%～94.9%。结论 辽宁省2013—2019年1E基因型仍为优势基因型,但2019年监测到的基因型与辽宁省之前流行的并不相同,之前的1E基因型可能已被阻断。2018...     

南平市2004-2019年风疹流行特征

目的 研究2004-2019年南平市风疹流行特征,为防控提供科学依据.方法 采用描述性流行病学方法,分析2004-2019年南平市风疹流行特征.结果 南平市2004-2019年累计报告风疹1 908例,年均发病率4.30/10万;全市10个县(市、区)均有风疹病例报告,3～6月为发病高峰(77.7％,1 482/1 9...     

2013年风疹病毒株标准命名的更新

风疹病毒（Rubella Virus,RV）的病毒学监测数据可以用来跟踪实现消除风疹目标的进程,有助于风疹病例分类,证实RV的传播途径。本文对以往RV标准命名的资料进行了更新,同时增加了世界卫生组织（World Health Organization,WHO）麻疹和风疹实验室网络（Measles/Rubella Laboratory Network,M/RLN）在过去5年中所获得的数据。RV的标准命名最初在2005年提出,以描述风疹野病毒（Wild RV,WRV）的遗传多样性,随后在2007年进行了修订。WRV的标准命名有助于风疹病毒学监测,它为描述RV基因特征定义了标准方法,对病毒进行标准命名,并将RV株序列划分到认可和临时的基因型中。标准命名系统必须能够适合于RV新基因型的发现,已知病毒的进化,以及周期性病毒株的更替。     

2018-2021年云南省手足口病病例柯萨奇病毒A4型流行株基因特征

目的 分析云南省手足口病(Hand, foot and mouth disease, HFMD)病例柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CVA4)分离株基因特征。方法 在云南省7个市州采集2018-2021年HFMD病例粪便标本,进行肠道病毒RNA提取、VP1区基因扩增、序列测定和基因型别鉴定;构建CVA4分离株与基因库中参考株系统进化树,分析核苷酸和氨基酸相似性。结果 从28 565例HFMD病例粪便标本中获得13株CVA4,其中2018年1株、2019年1株、2020年6株、2021年5株;C2基因亚型11株、C4基因亚型2株。C4和C2基因亚型之间核苷酸、氨基酸平均相似性分别为85.77%、93.27%;与原型株HighPoint相比,C2基因亚型核苷酸、氨基酸平均相似性分别为84.51%、93.27%,C4基因亚型分别为84.44%、93.78%。结论 2018-2021年云南省HFMD病例CVA4的优势流行株为C2基因亚型;需继续加强CVA4分子流行病学监测。     

2018年广西壮族自治区防城港市流行性腮腺炎疫情K基因型病毒SH基因特征北大核心

目的分析2018年广西壮族自治区防城港市流行性腮腺炎(流腮)疫情中K基因型腮腺炎病毒(Mumps virus,MuV)分离株的SH基因特征。方法从2018年防城港市小学流腮疫情中采集病例血清和口腔拭子,分别采用酶联免疫吸附试验和实时荧光逆转录-聚合酶链反应检测MuV IgM/IgG抗体和核酸,对阳性核酸样本的SH基因进行扩增和测序,分析其基因特征。结果在采集样本的流腮病例中,MuV IgM、IgG抗体阳性率分别为68.2%(15/22)、100%(22/22),MuV核酸阳性率为80.8%(21/26)。选取10株MuV进行SH基因核苷酸序列分析,经鉴定均为K基因型,核苷酸同源性为99.6%-100%;其与2016年中国广西和越南K基因型株、中国S79疫苗株的核苷酸同源性分别为99.0%-99.6%、84.4%-84.8%。MuV分离株的某些氨基酸位点发生了突变。结论2018年广西防城港市流腮疫情为K基因型MuV引起;与越南K基因型MuV亲缘关系密切。需加强中越边境地区含腮腺炎成分疫苗接种和流腮监测处置工作。     

长春市2018—2022年丙肝流行特征

目的 分析长春市丙型病毒性肝炎(丙肝)流行特征,为制定防控措施提供依据。方法 用描述性流行病学方法分析长春市2018—2022年丙肝病例资料。结果 长春市2018—2022年共报告丙肝4 684例,年均发病率11.51/10万,5年来发病率呈下降趋势(趋势χ²=54.25,P<0.01);各月均有病例报告,无明显季节性;全市15个县(区、市)均有病例报告,农安县、公主岭市和榆树市的病例数共占63.5%(2 973例),农安县年均发病率最高(41.4/10万);男性(11.86/10万)与女性(10.93/10万)年均发病率差异无统计学意义(χ²=3.76,P>0.05);发病主要在50～79岁(77.9%,3 651例),以农民居多(62.5%,2 928例)。结论 长春市丙肝发病水平虽呈下降趋势,但仍需加强防治政策宣传,对重点地区和人群加大宣教力度,扩大筛查范围,尽早发现和规范治疗患者。     

2016年-2018年无锡惠山区手足口病流行特征及CVA6型肠道病毒VP1基因特征

目的 了解2016年-2018年无锡惠山区手足口病肠道病毒流行特征,并对CVA6型肠道病毒VP1基因进行分子进化特征分析.方法 采集疑似手足口病咽、肛拭子标本,采用实时荧光RT-PCR方法检测肠道病毒,对非EV71非CVA16其他肠道病毒扩增VP1基因,测序比对分析,获得肠道病毒谱;对CVA6型肠道病毒构建系统进化树,...     

2011—2021年云南省风疹病毒分子流行病学研究

目的了解云南省流行风疹病毒(RuV)基因型分布及传播模式。方法采集云南省2011—2021年9个州/地级市的风疹暴发和散发病例的咽拭子标本, 对RuV阳性标本进行病毒分离、靶基因的扩增和序列测定, 并与基因型和亚型参考株进行比对确定基因型别, 同时与同期我国其他省份流行的RuV病毒株进行系统发育分析。结果 2011—2021年间在云南省流行的RuV呈现明显的基因多样性, 监测到1E-L1、2B-L1和1E-L2三种基因亚型;发现RuV发生两次基因亚型转换, 包括2012—2013年间1E-L1至2B-L1基因亚型流行的转换, 以及2018年后2B-L1至1E-L2基因亚型的替换, 两次基因亚型转换的时间与云南省2012年以及2018—2019年间风疹暴发流行的时间基本吻合;RuV病毒株氨基酸序列水平高度保守, 重要功能区域均未发生改变。结论云南省RuV的传播模式与全国各省流行趋势基本一致。     

风疹病毒研究进展（综述）

风疹病毒是披膜病毒科风疹病毒属的惟一成员，是第一个被证明具有致畸性的病毒。如果在妊娠的前3个月感染了风疹病毒，具有很高的先天性风疹综合症（CRS）的风险，特别是那些没有免疫保护的妇女。应用先进的产前诊断技术鉴别鉴别诊断胎儿有无损伤是非常必要的，因为当在妊娠前3个月被诊断为原发性风疹病毒感染，孕妇要考虑是否妊娠终止。在这篇文章里我们主要综述了风疹病毒（RV）的流行病学、基因结果、临床特征和RV的实验室诊断。     

大连市2020年甲型肝炎病毒流行株基因特征

目的 分析大连市甲型肝炎(甲肝)病毒(Hepatitis A virus, HAV)流行株基因特征。方法 采集大连市2020年部分甲肝病例急性期血清或粪便标本,提取HAV核酸,采用巢式RT-PCR扩增目的基因,构建HAV获得序列与GenBank中参考序列的系统进化树,分析HAV序列VP1-2A区核苷酸和氨基酸同源性,确定基因型。结果 从甲肝病例标本中获得54条HAV序列,核苷酸、氨基酸同源性分别为97.15%-100%、98.13%-100%,属于ⅠA基因亚型。获得序列与中国大陆序列中2014年辽宁省丹东市、2019-2020年山东省烟台市和威海市序列的核苷酸同源性最高,为98.42%-99.69%;与其他国家序列中日本、意大利HAV序列的核苷酸同源性最高,为99.07%-100%。在获得序列中,53条序列的氨基酸同源性为100%,1条序列与其存在2个氨基酸差异。结论 大连市2020年HAV优势流行株为ⅠA基因亚型,甲肝可能具有多个传播链和相同感染来源。HAV基因型监测有助于HAV溯源和及时采取应对措施。     

新疆和田地区2016年甲型肝炎病毒流行株基因特征

目的了解新疆和田地区甲型肝炎病毒(Hepatitis A virus,HAV)流行株基因特征。方法收集新疆和田地区2016年甲型肝炎病例急性期血清标本,经核酸提取、逆转录、套式PCR、序列测定,进行HAV基因分型、主要中和抗原位点氨基酸序列分析,并与GenBank中HAV基因型和亚型代表株构建系统进化树,分析核苷酸和氨基酸序列差异或同源性。结果获得和田地区43株2016年IA基因亚型HAV流行株和2株减毒活疫苗株序列。43株流行株在VP1-2A区的核苷酸、氨基酸序列差异分别为0.0%-2.9%、0.0%-1.9%,在VP3-VP1-2A区分别为0.0%-2.2%、0.0%-0.7%;与2株减毒活疫苗株的氨基酸序列差异为0.5%-0.9%。HAV流行株的主要中和抗原位点未发现氨基酸变异,处于负向选择压力;与GenBank中中国新疆、中国四川或日本HAV序列的同源性最高。结论2016年和田地区HAV流行株为基因IA亚型且分为不同基因簇;HAV流行株和减毒活疫苗株的主要中和抗原位点氨基酸序列保守。     

中国2018-2019年风疹流行病学特征

目的分析中国2018-2019年风疹流行病学特征。方法利用全国麻疹/风疹监测信息报告管理系统收集中国2018-2019年风疹发病数据,描述性分析风疹发病特征。结果中国2018年、2019年分别报告风疹3930例(0.28/10万)、32539例(2.33/10万)。2018年10-19岁、20-29岁病例分别占45.12%、29.87%,2019年分别占68.98%、18.79%。2018年10-19岁、≥20岁病例中无或不详风疹免疫史分别占91.67%、98.49%,2019年分别占93.77%、98.41%。结论中国2018-2019年风疹发病水平持续上升,无风疹免疫史的10-29岁人群发病风险高;建议开展中学生风疹补充免疫工作。     

宁波市2018-2022年精神分裂症流行特征和时空聚集性分析

目的 探讨2018-2022年宁波市精神分裂症报告发病率时空分布特征,为精神卫生资源合理配置和精神分裂症综合防治提供科学依据。方法 收集宁波市精神卫生信息管理系统中2018-2022年精神分裂症报告发病数据,以镇（街道、乡）为单位计算报告发病率。采用空间相关分析和时空扫描分析方法,研究精神分裂症的时空聚集性。结果 2018-2022年宁波市精神分裂症报告发病率呈下降趋势,共报告4 133例新发病例,年平均报告发病率为9.76/10万。全局和局部空间自相关分析显示,2018-2020年存在空间正相关性和热点地区。时空扫描分析发现1个发病聚集区,聚集时间为2018-2019年,集群中心为宁波市海曙区洞桥镇,RR值为2.46,对数似然比为256.89。结论 宁波市精神分裂症发病存在明显的时空聚集性,探索出的高发区域能够为进一步研究环境因素与精神分裂症发病关联提供线索,对宁波市精神卫生资源合理分配具有指导意义。