泰州市腹泻病人中致泻大肠埃希氏菌感染状况及 病原学特征分析

摘要:目的　了解泰州市腹泻病人中致泻大肠埃希氏菌感染状况、毒力基因、分子分型以及耐药性情况,为致泻大肠埃希氏菌防治提供依据。方法　对2013年泰州市215份腹泻病人粪便标本进行多重PCR鉴定和分离培养,并对分离的致泻大肠埃希氏菌菌株进行生化鉴定、脉冲场凝胶电泳（Pulsed Field Gel Electrophoresis,PFGE）分子分型以及药敏试验。结果　215份腹泻病人粪便标本共检测出致泻大肠埃希氏菌30株,其中EPEC 20株（占9.30%）,EAEC 5株（占2.33%）,ETEC 5株（占2.33%）;PFGE结果表明,30株致泻大肠埃希氏菌PFGE带型种类多,各亲缘关系较近,但无100%的同源菌,同时PFGE分析结果表明在同一个粪便中有2种不同致泻大肠埃希氏菌感染情况存在;药敏试验表明,30株致泻大肠埃希氏菌对阿莫西林、四环素耐药性最高,3耐以及以上占63.33%。结论　泰州市腹泻病人中致泻大肠埃希氏菌感染普遍存在,并以EPEC、EAEC、ETEC感染为主,菌株的耐药性较强,耐药谱广;基因型呈多态分布,且具有流行相关性。     

2021年浙江省湖州市致泻性大肠埃希菌病原学特征分析

目的 研究2021年浙江省湖州市致泻性大肠埃希菌分离株的检出情况、主要毒力基因、耐药性以及分子分型特征。方法 对2021年哨点医院腹泻患者粪便标本和市场采集的食品标本进行分离,运用多重荧光定量PCR方法检测其毒力基因,并对其中104株进行耐药性检测和脉冲场凝胶电泳分子分型。结果 病例源中肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)检出率最高为60.66%,食品源中也是EAEC检出率最高,为92.86%。DEC引起的发病人群以20岁～39岁年龄组最高,发病高峰在6月—8月。耐药率最高依次为氨苄西林(63.46%)、四环素(62.50%)、萘啶酸(57.69%)。经Xba I酶切后,对EAEC和ETEC进行分别聚类,EAEC相似度为41.7%～100.0%,ETEC相似度为40.7%～100.0%。结论 2021年湖州市检出的致泻性大肠埃希菌以EAEC为主,对氨苄西林的耐药率最高。建立本地PFGE分子分型数据库,为DEC防控提供数据支撑。     

2014—2015年淮安市腹泻患者致泻大肠埃希氏菌病原学特征分析

目的了解淮安市腹泻患者中致泻大肠埃希菌感染情况、毒力基因、耐药性以及分子分型,为致泻大肠埃希氏菌防治提供依据。方法对2014—2015年淮安市各哨点医院和社区医院腹泻门诊患者的粪便标本运用多重PCR筛查和生化试验检测致泻大肠埃希菌,检测出菌株的进一步做药敏试验和分子分型。结果在549份腹泻标本中共检出致泻大肠埃希菌39株,检出率为7.10%。其中肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)18株(46.15%)检出最高,其余依次为肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)8株(20.51%)、肠致病性大肠埃希菌(EPEC)7株(17.95%)、肠出血性大肠埃希菌(EHEC)5株(12.82%)和侵袭性大肠埃希菌(EIEC)1株(2.56%)。药敏结果显示,39株致泻大肠埃希菌中1种以上耐药菌27株,占41.25%;最高耐药达到9耐,其中四环素和萘啶酸耐药率,分别为53.84%、51.28%。脉冲场凝胶电泳(PFGE)结果显示,39株致病性大肠埃希菌有不同的带型,且带型有密切的亲缘关系。EAEC单独聚类,除zx14352和zx14395外,其他带型的相似度都超过50%。结论淮安市2014—2015年致泻大肠埃希菌感染主要以EAEC为主。菌株耐药性强,多重耐药谱广。菌株的基因型呈多态性分布,有流行相关性。     

淮南市2019-2020年食源性疾病病原体检测结果分析

目的 通过分析2019-2020年淮南市食源性疾病病原体的检测结果,了解其病原学特征,为有效控制食源性疾病提供科学依据.方法 参考《国家食源性疾病监测手册》,采集淮南市哨点医院食源性疾病病例的相关标本,进行致泻大肠埃希氏菌、沙门氏菌、副溶血弧菌和志贺氏菌的分离培养,对诺如病毒进行核酸检测,同时对沙门氏菌和部分致泻大肠埃希氏菌阳性菌株进行耐药性分析.结果 2019-2020年共采集检测粪便标本240份,检出病原体111份,检出率46.25％,2019年与2020年分别检出阳性标本64份与47份,检出率差异有统计学意义(x2=4.844,P=0.028).其中混合感染9份,检出率3.75％.检出致泻大肠埃希氏菌44株、诺如病毒核酸阳性36份、沙门氏菌26株、副溶血弧菌11株,未检出志贺氏菌.30株致泻大肠埃希氏菌和26株沙门氏菌中有54株存在不同程度耐药,部分菌株出现多重耐药.结论 2019-2020年淮南市食源性疾病病原体以致泻大肠埃希氏菌和诺如病毒为主,存在混合感染和多重耐药菌株.     

提高致泻性大肠埃希菌检出率的研究

目的提高食源性疾病监测中致泻性大肠埃希菌的检出率。方法采集2017年-2018年无锡市梁溪区食源性疾病监测标本272份,采用不同的方法进行可疑菌落的挑选,比较大肠埃希菌、致泻性大肠埃希菌检出率。结果 2017年、2018年分别检测食源性疾病监测标本170份、102份,筛选出大肠埃希菌100株、96株,大肠埃希菌检出率分别为58. 8%和94. 1%;采用多重实时荧光PCR分别检出致泻性大肠埃希菌15株、32株,致泻性大肠埃希菌检出率分别为8. 8%和31. 3%。2018年在ECC显色培养基上呈蓝色和无色菌落中分别检出致泻性大肠埃希菌28株和4株。结论 ECC显色培养基用于食源性疾病监测中致泻性大肠埃希菌筛选,用多重实时荧光PCR进行食源性疾病监测中致泻性大肠埃希菌确认试验,2018年大肠埃希菌、致泻性大肠埃希菌检出率较2017年有显著提高。     

2015-2016年江阴市致泻性大肠埃希菌监测及其毒力基因分析

目的了解2015-2016年江阴市致泻性大肠埃希菌[肠致病性大肠埃希菌(EPEC)、肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)、肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)、肠出血性大肠埃希菌(EHEC)、肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)]的感染、分布及其毒力基因的携带情况。方法对2015-2016年哨点医院提供的感染性腹泻样本进行实时荧光定量PCR检测,确定其致病型别及其携带的毒力基因。结果 359份腹泻标本中,检出致泻性大肠埃希菌31份,检出率8.64%,其中EAEC 15份,检出率4.18%,EPEC 13份,检出率3.62%,ETEC 3份,检出率0.84%,未检出EIEC及EHEC。15株EAEC中,携带astA基因8株,携带aggR+pic基因6株,携带astA+aggR+pic基因1株。13株EPEC均携带eae基因,3株ETEC均携带estI基因。致泻性大肠埃希菌主要集中在夏秋季节高发,2015年主要以EPEC为主,2016年主要以EAEC为主。结论江阴市致泻性大肠埃希菌主要以EAEC和EPEC两个型别为主,携带的毒力基因呈多态性,显示其致病力和侵袭力具有多样性和复杂性,应加强监测。     

2016-2017年江西省食源性疾病病原学监测结果分析

目的 对2016-2017 年江西省食源性疾病病原学监测结果进行分析,为食源性疾病诊断及防控提供科学的参考依据。方法 对江西省36家哨点医院监测的食源性疾病病例标本开展沙门氏菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌、志贺氏菌和诺如病毒检测。结果 采集5426份病例标本,检出386株致病微生物,总检出率为7.11%。病例数男女比例是1.2[DK]∶1,5岁以下年龄组病原检出率最高（8.56%）。第三季度检出率（9.17%）均最高,不同地区病原的总检出率存在显著性差异（x2=27.259 P=0.002）,沙门氏菌优势血清型为鼠伤寒（33.76%）,致泻大肠埃希菌主要型别是肠黏附型（EAEC,68.6%）。诺如病毒主要是GⅡ型（95.45%）。沙门氏菌的耐药率为88.53%,其中多重耐药菌占耐药菌的60.43%。结论 江西省食源性疾病主要以沙门氏菌和致泻大肠埃希菌感染为主,具有年龄、季节性和地域性分布特点,应进一步加强重点人群的健康宣教,同时强化相关地区实验室检验能力的提升。     

2018-2021年山东省潍坊市食源性疾病病例病原学监测结果分析

目的 了解2018-2021年山东省潍坊市哨点医院报告的食源性疾病病例中主要病原微生物的流行病学特征,为预防和控制食源性疾病的发生提供有效依据。方法 对哨点医院监测的病例标本开展沙门氏菌、志贺氏菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌和诺如病毒检测,对病例标本中病原体的时间分布、年龄分布、型别分布等进行分析。结果 811份病例标本中检出阳性菌株153株,总阳性检出率为18.87%,其中,沙门氏菌为9.25%,致泻大肠埃希氏菌为4.07%,诺如病毒为5.55%。第二季度的病原体检出率较高(25.74%)。4～6岁组沙门氏菌和诺如病毒检出率最高(31.37%和11.76%),<1岁组致泻大肠埃希氏菌检出率最高(9.30%)。沙门氏菌的优势血清型为肠炎沙门氏菌。致泻大肠埃希菌的主要型别是黏附性大肠埃希氏菌属(EAEC)。诺如病毒主要是GⅡ型。结论 山东省潍坊市食源性疾病病原体以沙门氏菌为主,病原体的分布呈较明显的夏秋季高峰,应针对不同病原体的分布特征开展相适应的预防控制措施。     

河南省腹泻病人5种致泻大肠埃希菌感染调查

[目的]应用多重PCR技术筛查自腹泻病人中分离的致泻大肠埃希菌,了解5种致泻大肠埃希菌的感染情况。[方法]用常规方法分离培养粪便标本中的大肠埃希菌,提取DNA,采用多重PCR扩增12对目的基因,电泳检测扩增产物,确定病原检出情况,并进行统计学分析。[结果]2007年河南省1534份标本中致泻大肠埃希菌检出率10.37%,其中EAEC(3.59%)居首位,其余依次检出EPEC(2.67%)、STEC(2.15%)、ETEC(1.63%)、EIEC(0.33%)。合并感染检出率0.78%,以ETEC合并感染居多。感染高峰在5月(19.85%),城市与农村的检出率差异无统计学意义,45～60岁组腹泻病人的检出率最高(17.00%)。[结论]应用多重PCR技术能快速鉴别粪便标本中的致泻大肠埃希菌。致泻大肠埃希菌是河南省常见的腹泻病原。     

北京市通州区致泻性大肠埃希菌病原特征分析

目的 了解北京市通州区2016年—2019年腹泻患者致泻性大肠埃希菌病原学特征和耐药情况。方法 对通州区2016年—2019年门诊腹泻监测病例的粪便标本进行致泻性大肠埃希菌的分离培养,利用荧光PCR方法进行菌株毒力基因检测,应用MIC法进行耐药试验。结果 2016年—2019年通州区DEC菌株检出率为13.05%(217/1 663),检出率逐年增高。20岁～39岁年龄组DEC检出率最高,其次为0岁～5岁组和≥60岁组。EAEC为主要型别,其次为ETEC和EPEC,不同年龄组的DEC型别构成不同。ast A和pic是EAEC主要的毒力因子,ETEC以lt、sth、stp基因为主,部分菌株也含有ast A和pic基因。DEC菌株对头孢唑林、氨苄西林、磺胺异恶唑耐药率较高,对碳青霉烯类、多肽类及三代头孢较为敏感,多重耐药菌株占60.37%。结论 通州区DEC以EAEC为主,毒力基因组合具有多样性,ast A和pic可在不同型别菌株中转移。菌株多重耐药情况比较严重,耐药基因易传播,应重视临床抗生素的使用。     

安徽省临床分离致泻性大肠埃希菌主要流行基因型及同源性分析

目的 了解安徽地区临床分离致泻性大肠埃希菌(DEC)的耐药状况、基因同源性及主要基因型.方法 采用微量肉汤稀释法进行药物敏感性试验,采用多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型进行基因型检测和同源性分析.结果 268株DEC中,57.1％为多重耐药菌,其中肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)118株,肠毒素...     

2010-2012年河南省致泻大肠埃希菌监测

目的建立河南省致泻大肠埃希菌多重PCR分型的基线数据,分析致泻大肠埃希菌感染的流行病学特征。方法在河南省郑州、登封、周口、睢县4个地区的多家医疗机构设立监测哨点,收集可疑致泻大肠菌感染样本,采用多重PCR方法进行分型,并对致泻大肠菌分型结果和病例个人信息进行统计分析。结果 2010-2012年河南省共检测可疑致泻大肠埃希菌病例样本数1 934例,检出致泻大肠菌阳性样本为139例,检出率为7.19%。其中EPEC检出率最高为67例（3.46%）,之后依次为EAEC 56例（2.90%）、ETEC 9例（0.47%）、EHEC 7例（0.36%）、EIEC未检出。致泻大肠埃希菌感染高峰在4-5月,1-2岁组腹泻患者的检出率最高（10.81%）。结论 EAEH和EPEC是河南主要的致泻大肠菌型,应用多重PCR技术能快速鉴别粪便标本中的致泻大肠埃希菌。     

我国2012－2015年门诊腹泻患者中致泻性大肠埃希菌流行特征分析

目的 了解我国门诊腹泻患者中致泻性大肠埃希菌（DEC）流行特征。方法 2012－2015年在27省（直辖市、自治区）170家医院门、急诊中开展腹泻病监测,收集腹泻病例的临床和流行病学资料,同时采集粪便标本,送往92家网络实验室开展DEC检测。结果 在46 721例腹泻监测病例中,DEC的总检出率为7.7%,且各地区检出率存在较大差异。在2 982例（6.4%）报告了PCR菌型鉴定分类信息的DEC阳性病例中,肠集聚性黏附大肠埃希菌（EAEC）是最主要的类型（1 205例,40.4%）,其次是肠致病性大肠埃希菌（EPEC）（815例,27.3%）和肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）（653例,21.9%）。整体分析,25～34岁青壮年、暖温带地区和黏液便的DEC检出率较高,检出率分别为10.1%、11.1%和9.4%。DEC的季节性发病特征明显,各菌型的流行高峰均在夏季。结论 DEC是我国腹泻病门诊重要病原体之一,流行菌型以EAEC、EPEC和ETEC为主,不同地区、不同年龄人群、不同季节的流行特征存在差异。     

Phenotypic and Genotypic Antibiotic Resistant diarrheagenic Escherichia coli pathotypes isolated from Children with Diarrhea in Nairobi City,Kenya

BackgroundThe marked genome plasticity of diarrheagenic Escherichia coli promotes emergence of pathotypes displaying unique phenotypic and genotypic resistance. This study examined phenotypic and genotypic antibiotic resistant diarrheagenic Escherichia coli pathotypes among children in Nairobi City, Kenya.MethodsIn a cross-sectional study, diarrheagenic Escherichia coli pathotypes were isolated from stool samples and their phenotypic and genotypic resistance against eight antimicrobial agents assayed.ResultsDiarrheagenic Escherichia coli was detected in 136(36.4%) children. Most of diarrheagenic Escherichia coli that were resistant to ampicillin, ceftriaxone, streptomycin, gentamycin, ciprofloxacin, chloramphenicol, erythromycin and tetracycline, harbored citm, bla CMY, aadA1, aac(3)-IV, qnr, catA, ere(A) and tet(A) corresponding resistant genes.ConclusionAntimicrobial-resistant genes are highly prevalent among phenotypic resistant ETEC pathotypes indicating a possibility of horizontal gene transfer in spreading antibiotic resistant genes among E. coli pathotypes.     

2010年福建南平及永安监测点致泻大肠杆菌的监测报告

目的:为了解福建省腹泻病人中致泻大肠杆菌的感染情况。方法:应用多重PCR或单重PCR方法检测致泻大肠杆菌的EPEC/EHEC eaeA基因、EHEC stx基因、EAEC aggR基因、EIEC ipaH、EIEC virA、ETEC ST、ETEC LT、EPEC bfp基因。API 20E生化鉴定条进行生化试验。血清学鉴定。结果:2010年度共分离得19株致泻大肠杆菌,检出率为10.9%。1株EAEC;1株tEPEC;4株aEPEC;13株ETEC。19株分离的致泻大肠杆菌经API 20E鉴定均为大肠埃希菌。1株tEPEC与EPEC三种多价诊断血清型均不凝集,而1株aEPEC血清型为O111:K58(B4)。13株ETEC菌株血清型:多数为O6:K15,1株O25:K19(L),3株未能分型。结论:监测结果对于我们了解福建省致泻大肠杆菌感染情况,预警潜在发生疫情的可能性有其重要性。这些菌种的获得可以为下一步研究其毒力特征、分子分型及耐药性积累原始材料。     

太原地区携带OI一28毒力基因组岛致泻大肠埃希菌性小儿腹泻

目的探讨携带OI-28毒力基因组岛致泻大肠埃希菌在小儿腹泻中的病原学作用。方法在山西省儿童医院采集257例腹泻病患儿粪便,做肠道病原菌常规培养和致泻大肠埃希菌血清学分型鉴定,用PCR和DNA斑点杂交检测致泻大肠埃希菌EHEC OI-28毒力基因组岛中与RTX相关的5个毒力基因。结果257例腹泻病患儿检出病原菌206株(80.16%)。其中大肠埃希菌149株(57.98%),其他肠道致病菌57株(22.18%)。血清分型检出致泻大肠埃希菌EPEC 3株(2.01%)、ETEC 2株(1.34%)、EHEC 2株(1.34%),其余142株为"疑似致泻大肠埃希菌"(55.25%)。149株大肠埃希菌中OI-28 5个基因全阳性者21株(14.09%),1个基因阳性者8株(5.37%),2个基因阳性者2株(1.34%)。21例携带OI-28毒力基因组岛大肠埃希菌感染的腹泻患儿,以3岁以下小儿为主(80.95%)。结论携带OI-28毒力基因组岛大肠埃希菌是夏季小儿腹泻的重要病原菌之一。     

2015—2019年北京市食源性致泻大肠埃希氏菌感染病例流行特征分析

目的分析2015—2019年北京市食源性致泻大肠埃希氏菌(diarrheagenic Escherichia coli,DEC)感染病例的流行病学特征和发病规律,为制定相应的防控策略与措施提供科学依据。方法收集2015—2019年北京市36家食源性疾病主动监测医院腹泻病例的粪便或肛拭子标本及其个人信息,采用χ^(2)检验对率或构成比进行比较。结果共收集27619份病例标本,其中有2485份为DEC阳性病例,检出率为9.00%,不同分型中肠产毒性大肠埃希菌检出率最高,为3.10%,其次为肠聚集性大肠埃希菌,检出率为3.02%。不同年龄组DEC检出率差异有统计学意义(χ^(2)=32.923,P<0.001),20~39岁年龄组DEC检出率最高,为9.81%,40~59岁年龄组感染肠产毒性大肠埃希菌高于其他年龄组,0~5岁年龄组肠致病性大肠埃希菌的检出率最高。时间分布上,第三季度为高发期,不同季度间DEC检出率差异有统计学意义(χ^(2)=606.032,P<0.001)。空间分布上,远郊的DEC检出率最高,且城区、近郊和远郊的DEC检出率差异有统计学意义(χ^(2)=28.034,P<0.001),肠产毒性大肠埃希菌的检出主要分布在城区和近郊,肠聚集性大肠埃希菌主要分布在远郊。结论2015—2019年北京市食源性DEC的检出率呈逐年上升趋势,应在夏秋高发季节针对重点人群积极开展防控工作。     

Characterization of Salmonella enterica and detection of the virulence genes specific to diarrheagenic Escherichia coli from poultry carcasses in Ouagadougou, Burkina Faso

One hundred chicken carcasses purchased from three markets selling poultry in Ouagadougou, Burkina Faso, between June 2010 and October 2010 were examined for their microbiological quality. The presence of Salmonella was investigated using standard bacteriological procedures, and the isolates obtained were serotyped and tested for antimicrobial susceptibility. The presence of virulence-associated genes of the five main pathogroups of diarrheagenic Escherichia coli-Shiga toxin-producing E. coli (STEC), enteropathogenic E. coli (EPEC), enteroaggregative E. coli (EAEC), enterotoxigenic E. coli, and enteroinvasive E. coli-was investigated using 16-plex polymerase chain reaction (PCR) on the mixed bacterial cultures from the poultry samples. Of the 100 chicken carcasses studied, 57 were contaminated by Salmonella; 16 different serotypes were identified, the most frequent being Salmonella Derby, found in 28 samples. Four Salmonella strains were resistant to tetracycline, and two were resistant to streptomycin. Based on the PCR detection of the virulence genes, in total, 45 carcasses were contaminated by three pathogroups of E. coli: STEC, EPEC, or EAEC. The STEC and EPEC virulence genes were detected on six and 39 carcasses, respectively. EAEC virulence genes were only detected in combination with those of EPEC (on 11 carcasses) or STEC (on two carcasses). The STEC-positive carcasses contained the genes stx(1), stx(2), eaeA, escV, and ent in different combinations. None of the EPEC-positive carcasses contained the bfp gene, indicating that only atypical EPEC was present. EAEC virulence genes detected were aggR and/or pic. The high proportion of chicken carcasses contaminated by Salmonella and diarrheagenic E. coli indicates a potential food safety risk for consumers and highlights the necessity of public awareness of these pathogens.