2017年宁波市食源性疾病主动监测特定病原学和耐药特征分析

目的了解宁波市食源性疾病主动监测中沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌和致泻性大肠埃希菌的感染情况、血清型别和耐药特征。方法对哨点分离的菌株进行复核、血清分型、PCR确认分型和药敏试验。结果 2017年共检测粪便和肛拭子标本3 467份,阳性率为9. 17%,副溶血性弧菌检出率最高(4. 87%),其次是沙门菌(4. 00%);未检出志贺菌。副溶血性弧菌分为18种血清型,以O3∶K6(28. 99%)、O4∶K44(22. 49%)和O4∶KUT(21. 30%)为主;对大部分抗生素敏感,对头孢唑林的耐药率高达98. 82%;检出14株耐药株。沙门菌可分为30种血清型,以鼠伤寒、肠炎和伦敦常见;对头孢唑林敏感率略低,对常用头孢类药物敏感;检出多株多重耐药株。致泻性大肠埃希菌以肠黏附性大肠埃希菌(EAEC)为主;对常用药物耐药率较高,对亚胺培南和复合制剂敏感。结论 2017年宁波地区副溶血性弧菌检出率最高,以O3:K6血清型占优势;致泻性大肠埃希菌以EAEC为主。副溶血性弧菌和沙门菌对除头孢唑林以外的其他常用头孢类药物敏感;致泻性大肠埃希菌对常用药物耐药率较高。     

舟山海岛腹泻病人的病原菌监测及致泻性大肠埃希菌药敏试验

目的：通过监测5～10月份舟山海岛腹泻病患者的大便，以了解病原菌的种类和构成特点，以及致泻性大肠埃希菌对抗菌药物的耐药情况，为预防和临床治疗提供参考依据。方法：病原菌分离鉴定参照文献方法结合API试剂条进行系统鉴定，药敏试验用K—B法。结果：从384例腹泻病患者粪便标本中检出4属66株病原菌，检出率为17．18％。其中检出副溶血弧菌29株，沙门菌2株，志贺菌10株，致泻性大肠埃希菌25株（EPEC15株，ETEC10株）。25株致泻性大肠埃希菌对10种抗菌药物均有不同程度的耐药性，其中对氨苄西林、复方新诺明耐药率最高为80％。结论：副溶血弧菌和致泻性大肠埃希菌为舟山海岛5～10月份腹泻的主要病原菌；致泻性大肠埃希菌出现多重耐药。     

北京市密云地区腹泻病原菌耐药性分析

目的通过对北京市密云地区腹泻患者粪便标本监测结果的分析,了解腹泻致病菌的型别分布及耐药特征,为细菌性腹泻的治疗提供科学依据。方法 2014年1月-2016年9月,以密云区医院和密云中医院为哨点医院,收集腹泻患者粪便标本,分析腹泻致病菌的型别分布及耐药特征。结果共监测腹泻患者1 400例,分离致病菌123株,分离阳性率为8.8%,其中沙门菌56株,致泻性大肠埃希菌29株,副溶血性弧菌38株,未检出志贺菌。仅3株副溶血性弧菌对氨苄西林耐药。沙门菌和致泻性大肠埃希菌对喹诺酮类、四环素类耐药率较高。41.1%的沙门菌和44.8%的致泻性大肠埃希菌为多重耐药,这2种菌有耐药模式重叠情况。结论沙门菌和致泻性大肠埃希菌耐药情况比副溶血性弧菌严重,应加强致病菌耐药趋势的主动监测。     

云浮市市售3类食品肠道致病菌污染状况调查

目的 了解云浮市市售熟肉类、面包糕点类及水产类等3类食品受5种肠道致病菌的污染状况及各类肠道致病菌的分布及菌株生物学特点,为预防食源性疾病提供科学依据.方法 每月抽取一定数量3类食品样品,依据国标检验方法,对样品分别进行沙门菌、志贺菌、致泻性大肠埃希菌、蜡样芽胞杆菌和副溶血性弧菌的分离培养、生化试验,必要的菌株再作血清学鉴定分型.结果 共检验3类食品样品1 353份,检出肠道致病菌32株,总检出率是2.37%;其中蜡样芽胞杆菌11株,副溶血性弧菌9株,沙门菌5株,致泻性大肠埃希菌4株,志贺菌3株;熟肉类食品、面包糕点类食品及水产类食品肠道致病菌检出率分别是2.95%、1.59%、2.66%;7、8、9月3个月的致病菌检出率相对较高,沙门菌、志贺菌、致泻性大肠埃希菌的主要血清型是鼠伤寒沙门菌,福氏志贺2 a、肠道致病性大肠埃希菌（EPEC）.结论 云浮市市售3类食品均存在肠道致病菌污染,熟肉类食品以蜡样芽胞杆菌和沙门菌为主,面包糕点类食品以蜡样芽胞杆菌为主,水产类食品以副溶血性弧菌为主,3类食品的污染程度虽不算严重,但亦应引起卫生监督管理部门重视,加强监管和监测力度,减少和避免云浮市食源性疾病的发生.     

门诊急性感染性腹泻病原菌及其耐药性

目的分析门诊急性感染性腹泻病原菌分布及药敏试验结果,为提高临床诊断治疗效率提供研究依据。方法选取2016年8月-2019年8月安徽省第二人民医院感染科门诊收治的86例急性感染性腹泻患者作为研究对象,对其流行病学特征及病原菌的分布、血清型、耐药性进行分析。结果男性患者占55.81%,20～40岁年龄占比最高为40.70%,有25.58%的患者出现了发热、脱水、电解质紊乱等全身性症状。采集的样本中共检出105株病原菌,其中,革兰阴性菌98株占93.33%,以沙门菌、志贺菌为主,沙门菌以鼠伤寒型、肠炎型为主;志贺菌以宋内Ⅰ型为主;革兰阳性菌7株占6.67%,均为金黄色葡萄球菌。副溶血性弧菌以O3∶K6血清型为主,占62.50%;致泻性大肠埃希菌以O126血清型为主,占42.86%;金黄色葡萄球菌以SEA血清型为主,占57.14%。沙门菌对氨苄西林、庆大霉素、哌拉西林的耐药率较高,对氯霉素、氨曲南的耐药率较低;志贺菌对氨苄西林、庆大霉素、头孢唑林、阿米卡星、哌拉西林、头孢噻肟的耐药率较高。副溶血性弧菌对氨苄西林、庆大霉素、哌拉西林的耐药株数较多,致泻性大肠埃希菌对氨苄西林、头孢唑林的耐药株数较多,金黄色葡萄球菌对头孢呋辛、头孢噻肟的耐药株数较多。结论沙门菌和志贺菌仍然是导致感染性腹泻的主要病原菌,副溶血性弧菌、致泻性大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌也具有一定的检出率,志贺菌等菌种的耐药性较强,临床医生应依据病原学检测和药敏试验结果合理制订抗感染治疗方案,从而提高治疗效果、改善患者的预后。     

2013-2017年感染性腹泻的病原体特点和流行特征

目的分析2013-2017年医院感染性腹泻的病原体特点和流行特征,为其防治提供科学参考依据。方法收集2013年1月-2017年12月医院肠道门诊腹泻患者1 937例的粪便标本进行病原体检测,对其结果进行分析。结果 1 937例粪便标本中阳性病例376例,阳性率为19.41%,其中致泻性大肠埃希菌110株占29.26%,副溶血性弧菌83株占22.07%,沙门菌119株占31.65%,志贺菌64株占17.02%;<10岁患者无病原菌检出,21～30岁、41～50岁及51～60岁患者阳性检出率均≥15%,其余年龄组检出率均较低;1、2、11和12月病原菌检出率较低,而6～8月检出率较高,6月份检出231例,7月份检出493例,8月份检出462例;64株志贺菌中宋内志贺菌49株占76.56%,其余为F2a(12.50%)、F4c(7.81%)、F2b(3.13%);83株副溶血性弧菌以O3:K6型为主,共60株占72.29%,其余血清型较分散;致泻性大肠埃希菌分为致病性大肠埃希菌和产肠毒素性大肠埃希菌,分别占65.45%和34.55%;沙门菌血清型分布中肠炎39株占32.77%,鼠伤寒28株占23.53%,猪霍乱21株占17.65%。结论感染性病原菌主要以致泻性大肠埃希菌、副溶血性弧菌、沙门菌和志贺菌为主,且存在明显的季节性,应加强优势病原型别的变化。     

2017—2022年淮安市社区门诊腹泻病人病原学分析

目的 掌握淮安市社区腹泻病人病原微生物感染情况,为疾病防治提供科学依据。方法 采集2017—2022年淮安市社区腹泻粪便标本,采用国标法检测致泻大肠埃希菌、副溶血性弧菌、沙门菌、志贺菌和诺如病毒,对检出的阳性菌株和阳性毒株进行PFGE分型或测序比对。结果 共采集标本306份,检出阳性59株,检出率为19.28%。其中致泻大肠埃希菌54株、沙门菌5株、诺如病毒22株,志贺菌、副溶血性弧菌未检出;诺如病毒GⅡ基因型21株,GⅠ基因型1株。病原菌分子分型显示多样化条带,致泻大肠埃希菌最大同源性为95.35%,沙门菌间最大同源性为83.33%;诺如病毒测序比对显示型别多样化,基因型每年均有变化。结论 淮安市社区腹泻病人细菌感染以致泻大肠埃希菌为主,其次是沙门菌,未检出副溶血性弧菌和志贺菌;PFGE分型比对显示基因图谱呈多态性分布,多数菌株之间有流行相关性。诺如病毒感染以GⅡ为主,优势基因型由GⅡ.4型向GⅡ.8型转变。     

CRISPR1上游侧翼序列用于大肠埃希菌和志贺菌鉴定的效果评价

目的 探讨基于成簇规律间隔的短回文重复序列（CRISPR）1上游侧翼序列对大肠埃希菌和志贺菌鉴定和评价效果。方法 通过BLAST重复序列识别并获得全基因组测序大肠埃希菌和志贺菌的CRISPRs和CRISPR相关基因（CRISPR-associated,cas）,并分析其种系;选取CRISPRs上、下游各500 bp侧翼序列,使用Clustal X进行序列比对;采用PCR方法扩增CRISPR1上游侧翼序列,以确定其对大肠埃希菌和志贺菌鉴定和评价效果。结果 73.4%（149/203）的大肠埃希菌存在I-E型CRISPR/Cas系统,包含了A、B1、D种系;8.4%（17/203）的大肠埃希菌存在I-F型CRISPR/Cas、17.2%（35/203）的大肠埃希菌不存在CRISPR/Cas,这2种大肠埃希菌均属于B2种系;9株志贺菌均存在I-E型CRISPR/Cas。在大肠埃希菌（B2种系外）、志贺菌CRISPR1上游和大肠埃希菌（B2种系）各存在61 bp侧翼序列,序列一致性为99%,且有种属特异性,PCR扩增此区域鉴定大肠埃希菌和志贺菌的灵敏度和特异度均>91%。结论 基于CRISPR1上游序列可用来鉴定大肠埃希菌和志贺菌,且具有很好的效果。     

2012—2013年深圳市光明新区感染性腹泻病原体监测结果分析

目的了解深圳市光明新区感染性腹泻的病原学及流行病学特征,为感染性腹泻的预防和控制提供依据。方法哨点医院采集门诊未使用抗生素腹泻监测患者的大便样本、肛拭子或呕吐物标本,进行常见肠道致病菌的分离培养,疾病预防控制中心对阳性菌株进行复核和分析。结果共检测863份标本,分离出163株致病菌,分离率为18.89%,检测出沙门菌(SM)、肠致病性大肠埃希菌(EPEC)、肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)、肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)、副溶血弧菌(VP)、志贺菌(SH)、类志贺邻单胞菌。阳性菌株中以SM感染为主(80株),占49.08%;其次为致泻性大肠埃希菌(61株),占37.42%。病原菌的检出具有明显的季节性,6-9月是高峰。SM是辖区内引起婴幼儿腹泻最主要的病原微生物。检出的SM的优势血清型分别为鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌。结论光明新区细菌性腹泻病原菌主要以SM和致泻性大肠埃希菌为主,应加强主动监测,做好腹泻的防治工作。     

2015年无锡市崇安区食源性疾病监测结果

目的了解和掌握无锡市崇安区食源性疾病的流行病学特征。方法对2015年哨点医院肠道门诊的腹泻病患者进行信息采集,粪便或肛拭子样本开展沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、致泻性大肠埃希菌和霍乱弧菌检测。结果 2015年共监测肠道门诊病人101例,病原不明的占绝大多数;从22例患者粪便中分离出病原菌23株,阳性检出率为22.77%,其中致泻大肠埃希菌检出率最高,为14.85%,其次沙门菌检出率为4.95%;6-8月为发病高峰,≥60岁年龄组为高发人群,可疑食品中肉与肉制品和水果蔬类所占比例较大。结论致泻大肠埃希菌是目前崇安区食源性疾病致病的主要病原,沙门菌和副溶血性弧菌的致病风险仍然存在。     

A 5-year study of the bacterial pathogens associated with acute diarrhoea on the island of Crete,Greece, and their resistance to antibiotics

During a 5-year period (1995–1999) a total of 7090 stool samples obtained from patients with acute diarrhoea, mostly community-acquired, were examined for bacterial pathogens, in the Greek island of Crete. One or more enteric pathogens were isolated from 987 patients (14%). Salmonella enterica were the most commonly isolated bacteria (6%), followed by Campylobacter spp. (4.2%), and enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) (1.8%). Yersinia enterocolitica (0.6%), Shigella spp. (0.3%), and Aeromonas hydrophila (0.04%), were less frequently isolated. Clostridium difficile was isolated from 65 out of 451 diarrhoeal specimens examined (14.4%). Toxin B was detected in all cases. No verotoxigenic E. coli strains were identified. Resistance to ampicillin was observed in 31.5% of the Salmonella, 58.3% of the Shigella and 31.5% of the EPEC isolates. Resistance to trimethoprim-sulfamethoxazole was observed in 4.4% of the Salmonella, 30.5% of the Shigella, and 18.5% of the EPEC isolates. High percentages of resistance to quinolones (44.5% to norfloxacin, and 40.5% to ciprofloxacin), were found among Campylobacter isolates, while resistance to erythromycin was observed in 14.9% of them. With the present study we continue the surveillance of bacterial pathogens associated with diarrhoeal disease on the island of Crete.     

全国细菌耐药监测网2014-2019年粪便标本细菌耐药监测报告

目的 了解全国粪便标本分离病原菌的菌群分布及耐药情况.方法 从2014-2019年全国细菌耐药监测网报告中提取粪便标本的相关数据(去除肠道正常定植菌群),分析肠道致病菌及其耐药率的变迁.结果 共分离菌株61 809株,居前3位的是沙门菌属(82.12％)、志贺菌属(8.08％)、弧菌属(4.03％),沙门菌属在每年粪便...     

基于微球液态阵列分子技术的沙门菌血清分型研究

目的 了解基于微球液态阵列分子技术对广东省腹泻病例沙门菌分离株的分型效果。方法 在微球液态阵列分子平台上应用SSA试剂盒对沙门菌人源株进行分子血清分型。结果 2010-2014年广东省人源沙门菌4 942株分为189种血清型,前100种血清型占所有菌株的98.08%（4 847/4 942）,其中98%可用SSA试剂盒完整分型;采用SSA试剂盒检测198株菌O抗原,可检出181株;用SSA检测H抗原的结果（98.32%,528/537）与传统血清凝集试验结果相符;fljB基因的符合率为93.09%（175/188）,fljB基因假阴性率为7.35%（9/134）,假阳性率为7.41%（4/54）;sdf基因和Vi基因符合率均为100%;用SSA试剂盒检测12株血清不能分型的沙门菌,有11株能成功分型。结论 SSA试剂盒能对96%以上的广东省人源沙门菌株进行分子血清分型,其结果与传统方法符合率超过98%。基于微球液态阵列分子技术的血清分型法比传统方法更具有高通量且快速的特点。     

Detection of Escherichia coli O157:H7 and other intestinal pathogens in patients with diarrhoeal disease

Six hundred and six faeces specimens from patients with diarrhoea, aged 0–>60 and living in the area of Fano (Italy), were examined for Escherichia coli 0157:H7, Salmonella, Shigellaand thermophilic Campylobacterspp. E. coli 0157:H7 was not found, confirming the limited circulation of this bacterium in our country. On the other hand, Salmonellae were the most frequent pathogens (5.6%), followed by Campylobacters (2.3%) and Shigellae (0.3%).     

Campylobacter enteritis in Portugal: Epidemiological features and biological markers

From 1984 to 1989, stool samples from 2811 gastroenteritis cases were examined for the presence ofCampylobacter jejuni andC. Coli, Salmonella, Shigella andYersinia species. Isolation rates were:Campylobacter jejuni andC. Coli, 5.3%,Salmonella spp., 14.8%,Shigella spp., 4.6% andYersinia enterocolitica, 1.1%. Age group distribution analysis shows a higherCampylobacter isolation rate in children under one year of age. Seasonal distribution revealed a peak incidence in winter as in other Meditteranean countries. Predominant biotypes wereC. jejuni I (51%),C. jejuni II (21.5%) andC. coli I (18.8%). Antimicrobial susceptibility testing did not reveal resistance to erythromycin. Thirty of the strains harboured plasmids with 7 different profiles.     

广东省2018-2022年侵袭性非伤寒沙门菌病原学特征分析

目的 了解2018-2022年广东省侵袭性非伤寒沙门菌（iNTS）的血清型分布、耐药性以及分子流行情况,为沙门菌侵袭性感染的防治提供科学依据。方法 对2018-2022年广东省分离自血液和粪便样本的沙门菌进行血清学鉴定、药敏试验、多位点序列分型（MLST）和全基因组测序。同时利用微生物基因注释系统对测序结果开展耐药基因与毒力因子注释。结果 136株iNTS分为25种血清型,肠炎沙门菌占38.24%（52/136）。以鼠伤寒变种沙门菌作为对照计算其余iNTS血清型的OR值,奥雷宁堡、里森和波摩那3种沙门菌血清型的OR值较高,分别为423.50、352.92和211.75。iNTS耐药率在0.74%~66.91%之间,普遍低于非iNTS株（3.90%~77.21%）。iNTS耐药以氨苄西林和四环素为主,耐药率分别为66.91%（91/136）和50.00%（68/136）,而对环丙沙星（5.88%,8/136）、头孢他啶（5.88%,8/136）、庆大霉素（5.13%,7/136）和头孢西丁（0.74%,1/136）耐药率较低。iNTS携带多种耐药基因与毒力因子,但尚未发现共同毒力因子分布特征。MLST聚类分析显示,iNTS分为26种序列型别,ST11型占38.24%（52/136）。结论 2018-2022年广东省iNTS以肠炎沙门菌为主,其中奥雷宁堡、里森和波摩那3种血清型可能与更高的侵袭性感染风险有关。iNTS对临床一线治疗药物（头孢类和氟喹诺酮类抗生素）敏感,序列呈现高度多样性且具有明确的系统发育分支,以ST11型为本地优势克隆群。     

Surveillance of antibiotic resistance in South East Asia

Antibiotic resistance in Gram-negative bacteria, particularly Salmonella and Shigella, requires surveillance worldwide. This study describes results of surveys in Hong Kong, Bangkok and Kuala Lumpur. All strains were isolated in hospitals which have large community catchment areas in addition to specialised hospital units. The prevalence of resistant strains was high in all areas. Gram-negative bacteria such as Enterobacter associated with hospital infections were resistant to penicillins and cephalosporins, with gentamicin resistance ranging from about 20% in Kuala Lumpur and Hong Kong, to 35% in Bangkok. Ninety-seven percent of Shigella isolated in Thailand were resistant to ampicillin. About 10% of Salmonella were resistant to chloramphenicol in all three centres.     

产志贺样毒素且具侵袭力的大肠杆菌的研究

我国临床腹泻病人粪便标本中，约有６０％检不出任何已知病原，而能分离出几乎纯培养的大肠杆菌。这些大肠杆菌过去被误认为是肠道正常菌样，我们对在北京西城区三个医院从腹泻病患者粪便本本中分离的１７２株所谓正肠杆菌，进行质粒ＤＮＡ，Ｈｅｐ－２细胞粘附试验，和１０种ＤＮＡ探针分析，结果表发现这些所谓的肠道正常大肠杆菌并不正常，其中４４％可为致泻性大肠杆菌，包括ＥＨＥＣ１６株，占所检查菌株的９．３％；ＥＰＥＣ８