北京地区2011－2014年致儿童猩红热A组链球菌emm基因型别变化特征分析

目的 了解北京地区致儿童猩红热A组链球菌(GAS)emm基因型别分布,并探讨其型别变化与猩红热病例的关系。方法 收集2011－2014年5－7月北京市36家医院临床诊断为猩红热病例咽拭子GAS分离菌株,采用PCR联合测序方法对分离菌株进行emm分型,选取中国疾病监测信息报告管理系统中北京市猩红热病例报告数据进行分析。结果 共采集咽拭子标本2 161份,分离GAS菌株762株,阳性率为35.3%(762/2 161)。检测到7个emm型别,其中emm12型占69.4%(529/762),emm1型占29.8%(227/762),其他5种emm型别(11、22、75、89、128)占0.8%(6/762)。分析各年份emm型别构成比:2011年emm12型82.2%(295/359),emm1型16.7%(60/359),其他型(11、22、89)1.1%(4/359);2012年emm12型77.3%(123/163),emm1型23.9%(39/163),emm75型0.6%(1/163);2013年emm12型50.7%(38/75),emm1型49.3%(37/75);2014年emm12型44.2%(73/165),emm1型55.2%(91/165),emm128型0.6%(1/165)。不同年份emm型别构成比变化的差异有统计学意义(P<0.001)。2011、2012年emm12为主导菌型,2014年主导型别转换为emm1型。2011－2014年报告猩红热病例分别为6 152、2 908、2 048和3 918例,以2011年报告例数最多,2014年比2013年报告病例数增加91.31%。2011年GAS分离株emm型别存在年龄差异,其中1～5岁组分离的emm12型高于>5岁组(P<0.05)。2011、2013年分离GAS菌株存在地区差异,2011年emm1型分离株为城区高于郊区(P<0.05),2013年emm1型为郊区高于城区(P<0.05)。结论 2011－2014年北京地区GAS菌株优势菌型为emm12和emm1型;不同年份emm12、emm1变换成为主导菌型;emm主导菌型变化与猩红热病例变化趋势有关。     

2011年北京地lt-JL童病例A组链球菌超抗原基因特征研究

目的分析201 1年北京市儿童来源A组链球菌(GAs)临床分离株13种超抗原基因的携带情况及其与病例特征和emm分型间的关系。方法2011年5--7月在北京市36家医院收集儿童来源GAS临床分离株635株。采用实时荧光PCR方法检测菌株超抗原基因speA、speB、speC、speF、speG、spell、speI、speJ、speK、speL、speM、smeZ、ssa的携带情况,PCR法扩增M蛋白N末端基因片段,并对产物测序确定GAS的em／n型别。结果13种超抗原基因的携带率分别为speA(22.4%) speB(100.0%)、speC(99.4%)、speF(99.7%)、speG(99.7%)、speH(76.4%)、speI(76.2%)、speJ(21.7%)、speK(0.6%)、soeL(1,1%)speM(22%)、smeZ(99.7%)、ssa(98.0%),共观察到26种超抗原谱。超抗原speA、speH、speI、speJ在emml和emml2型GAS间分布的差异有统}于学意义(P<0.05)。致咽部感染菌株超抗原speK和speL的检出率高于致猩红热菌株(P结论2011年北京市儿童来源GAS对超抗原基因speB、speF、smeZ、speG、speC和ssa的携带率较高,speM、speL和speK的携带率较低。GAS的emln分型与超抗原基因问存在密切联系。来观察到超抗原基因speA和speC在致猩红热和致咽部感染菌株间的分布差异。     

北京市2006－2015年猩红热发病特征分析

目的 分析北京市2006－2015年猩红热发病趋势,并对高发年份发病特征进行分析。方法 应用描述性流行病学方法对“疾病监测信息报告管理系统”中猩红热病例的三间分布特征和病例转归情况、猩红热、链球菌感染/扁桃体炎/咽峡炎（链感）的应急性病例监测结果进行分析。结果 2006－2015年北京市报告猩红热病例27 987例,除2011年外,其他年份发病率介于7.04/10万～18.53/10万之间。2011年共报告病例6 152例,发病率为31.37/10万,较其他年份的平均水平显著上升,病例多发于夏季和冬季、城乡结合部,好发于儿童,常在儿童集聚的场所（幼托机构、学校）流行。2011年5－12月,对4 332例猩红热病例在发病3周后完成了随访,所有病例均痊愈或好转,未发现并发症,无死亡病例。2011年5－12月,36家哨点医院共报告猩红热病例2 725例,临床诊断的链感病例104 013例,全部猩红热与链感病例数的比值为1：38.17;猩红热病例和链感病例的周报告数之间的相关性较高（Pearson相关系数=0.729,P< 0.001）,推算2011年A组链球菌导致的链感病例数约为2.14万。结论 2011年北京市猩红热发病水平较往年显著上升,但三间分布特征未见明显变化,且预后较好;存在大量A组链球菌导致的链感病例,可能是猩红热重要的传染源之一。     

北京市2007-2016年猩红热流行病学特征分析

目的 分析北京市2007-2016年猩红热流行病学特征和疾病转归情况。方法 应用描述性流行病学方法分析疾病监测信息报告管理系统中猩红热病例的时间、地区和人群分布特征,并根据现场调查结果描述猩红热病例的转归情况。结果 2007-2016年北京市报告猩红热病例28 505例,其中2011年有6 152例,发病率为31.4/10万,高于历年平均水平。猩红热病例有夏、冬季两个发病高峰,男性病例有17 951例（63.0%）,职业以学生（13 488例,占47.3%）、幼托儿童（12 167例,占42.7%）和散居儿童（2 596例,占9.1%）为主。发病年龄主要集中在3~9岁（占90.5%）,在近年3~9岁儿童所占比重呈上升趋势。2011年5月~2013年12月,在发病3周后对7 298例猩红热病例进行了随访,仅8例病例出现并发症,其中中耳炎有2例、鼻窦炎有1例、肺炎有2例、心肌炎有3例,其他病例均痊愈或好转,无死亡病例。结论 近10年间,2011年为北京市猩红热发病水平高峰年,学生和托幼儿童是发病的高危人群,猩红热病例转归良好。     

猩红热A组β型链球菌流行病学及耐药性研究

目的探讨小儿猩红热A组β型链球菌的流行病学特点及其对常见抗生素的耐药情况。方法选取2017年1月至2018年1月在浙江省海宁市人民医院就诊的患猩红热小儿147例为研究对象,取咽拭子标本进行病原体分离培养,分析菌株类别及emm基因类型,并检测8种常用抗生素的耐药性。结果①147例患儿的咽拭子标本中共分离出147株A组β型链球菌,其中婴儿占2.72%,幼儿占10.88%,学龄前儿童占45.58%,学龄初期儿童占38.10%,学龄晚期儿童占2.72%,学龄前及学龄初期儿童占比最高,为高发人群。农村发病率高于城镇;4-7月份为流行高峰期。②猩红热A组β型链球菌对青霉素、头孢曲松等药物敏感,但对克林霉素和克拉霉素不敏感。③在147株A组β型链球菌中共检出5种emm基因型,其中emm1型基因最常见,为53株(36.05%)。结论学龄前及学龄初期儿童易感染A组β型链球菌,青霉素和头孢曲松可作为首选药,但是不推荐克林霉素和克拉霉素。     

2017—2020年北京市猩红热流行病学特征及监测系统代表性分析

目的 分析2017—2020年北京市猩红热流行特征及监测系统代表性,了解猩红热的流行规律,探讨发病影响因素。方法 应用描述性流行病学方法对2017—2020年猩红热发病率、病例分类、人口学特征、发病时间进行描述分析,应用Pearson相关分析对2015—2020年哨点医院报告病例数、哨点医院报告病例病原学检测阳性率、全市报告猩红热病例数进行相关性分析。结果 2017—2020年北京市共报告猩红热病例11 324例,2017年报告病例数及发病率最高(16.77/10万),发病率整体呈下降趋势。冬季发病高峰报告病例数高于春夏季发病高峰(4 298例vs.3 907例)。男性占比(60.65%)高于女性(39.35%),3～9岁年龄组占比最高(93.04%),病例主要为学生(46.55%)和幼托儿童(44.83%)。病例中城区占比(55.64%)高于郊区(39.61%),外省病例中67.78%为北京儿童医院报告。临床诊断病例占比最高(95.90%)。北京市监测系统中哨点医院报告病例数变化趋势与全市猩红热病例变化趋势基本一致(r=0.882,P<0.001)。结论 2017—2020年北...     

A组链球菌基因分型方法最新进展及应用

A组链球菌(group A Streptococcus,GAs)或酿脓链球菌(Streptococcus pyogenes)能引起多种疾病,包括猩红热、毒素休克样综合征、风湿热、咽炎及急性肾小球肾炎等.随着抗生素的广泛使用,在发达国家和地区GAS引起的重症感染其发病率曾明显下降,但20世纪80年代中后期,欧美各国也包括发展中国家相继报道风湿热的局部暴发以及侵袭性感染的发病率显著上升,使得GAS感染再次受到高度重视[1].在我国,猩红热、急性风湿热以及急性肾小球肾炎等GAS疾病的流行及暴发仍不容忽视,近年来每年均有猩红热和急性肾小球肾炎暴发的报道[2-7].而且我国依然足受风湿热危害严重的国家之一,根据1992-1995年全国调查显示,其发病率为20.05/10万,是美国的40倍[8],因此GAS疾病对我国公共卫生所造成的危害较为严重.     

猩红热患儿A族链球菌emm基因分型及地域与毒力基因分布相关研究

 目的 探讨猩红热儿童分离来源的A族链球菌（GAS）emm分型、地域与毒力基因分布的相关性。方法 采集北京和上海地区猩红热患儿标本进行GAS分离鉴定,应用聚合酶链式反应（PCR）方法检测emm基因型以及13种毒力基因（speA、speB、speC、speF、speG、speH、speI、speJ、speK、speL、speM、ssa和smeZ）携带情况,分析GAS菌株毒力基因分布与地域、emm基因型的关系。结果 114株GAS分离株中,emm1.0型60株,emm12.0型54株;52株分离自北京（emm1.0型31株,emm12.0型21株）,62株分离自上海（emm1.0型29株,emm12.0型33株）。speA、speC、speG、speH、speI、speJ、speK、ssa和smeZ基因携带率分别为52.6％、76.3％、80.7％、43.9％、55.3％、57.0％、75.4％、97.4％、93.0％,speB和speF携带率均为98.2%,未检出speL、speM基因。北京地区emm1.0型与emm12.0 GAS菌株speA、speH、speI和speJ基因携带率比较,上海地区emm1.0型与emm12.0 GAS菌株speA、speH、speI、speJ和speK基因携带率比较,差异均有统计学意义（均P<0.05）。emm1.0型GAS菌株speC、speH、speJ和speK基因携带率北京与上海两地区比较,差异均有统计学意义（均P<0.05）,emm12.0型GAS菌株speC、speH、speI、speJ和speK基因北京与上海两地区比较,差异均有统计学意义（均P<0.05）。结论 GAS菌株毒力基因的分布状态因emm基因分型及地域不同存在差异。     

北京市儿童A组链球菌分离株耐药特征及相关因素研究

目的 分析北京市儿童A组链球菌临床分离株对抗菌药物的耐药特点,为临床用药提供依据.方法 2011年5-7月从北京市36家医院收集儿童A组链球菌临床分离株.采用VITEK 2全自动生化分析仪测定上述菌株对10种抗菌药物的最低抑菌浓度(MIC),计算敏感率(S％)、中介率(I％)、耐药率(R％);用双纸片法(D实验)检测菌株对大环内酯类抗菌药物的耐药表型.结果 共采集咽拭子3315份,分离A组链球菌633株,咽拭子培养阳性率为19.1％.菌株对青霉素、氨苄西林、链阳霉素、利奈唑胺、替加环素和万古霉素的敏感率达100％,其次为左氧氟沙星(96.5％,611/633).对红霉素、四环素和克林霉素有较高的耐药率,依次为96.1％ (608/633)、93.7％(593/633)和79.3％ (502/633).共观察到9种耐药模式,以红霉素、克林霉素和四环素联合耐药为主(72.7％,460/633),其次为红霉素和四环素联合耐药(18.0％,114/633).608株对大环内酯类耐药的菌株中,83.2％(506/608)表现为固有型耐药(cLMS),诱导型耐药(iLMS)占16.0％(97/608),5株表现为主动外排型耐药.学龄儿童和菌株为郊区来源是A组链球菌对四环素耐药率的相关因素,OR值及其95％CI分别为2.43(1.16～5.09)和2.35(1.47～3.73);菌株为郊区来源是A组链球菌对克林霉素的耐药率的相关因素,OR值及其95％CI为0.48(0.25～0.92).结论 北京市儿童分离的A组链球菌对青霉素、氨苄西林全部敏感,对红霉素、四环素和克林霉素耐药水平较高,耐药表型以固有型耐药为主.研究对象职业和菌株为郊区来源是四环素耐药率相关因素,后者也是克林霉素耐药率相关因素.     

山东省2013年致猩红热及无症状携带者A群链球菌分子分型研究

目的 描述2013年山东省致猩红热及无症状携带者A群链球菌(GAS)分子分型特征,探讨各分型方法与emm型别的关联.方法 自猩红热、无症状携带者咽拭分离获得GAS 72株,利用emm、多位点序列分型(MLST)、超抗原(SAg)基因(speA、speC、speG、speH、speI、speJ、smeZ、ssa、speK、speM、speL)检测和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对其进行分型检测.结果 72株GAS中,以emm1型(41.67%)和emm12型(56.94%)为主;共检出两种ST型别,其中ST28型31株(43.06%),ST36型41株(56.94%);ST28型与emm1相关(P<0.05),而ST36型与emm12相关(P<0.05);speA、speC、speG、speH、speI、speJ、smeZ、ssa的检出率分别为38.89%、95.83%、97.22%、38.89%、54.17%、41.67%、100.00%、100.00%,speK、speM、speL未检出;emm1型菌株倾向于含有speA、speJ,不含有speH、speI(P<0.05);emm12恰好相反,倾向于含有speH、speI,不含有speA、speJ(P<0.05);PFGE共检出20种型别.结论 2013年山东省致猩红热和无症状携带者中GAS型别分布较为单一,emm型别以emm1和emm12为主;ST型别主要为ST28和ST36,超抗原基因携带以speC、speG、smeZ、ssa为主.各分型方法间存在一定关联.     

上海市2005--20 1 2年猩红热流行特征和发病趋势分析

目的系统分析2005-2012年上海市猩红热发病特征及健康人群A组链球菌(GAS)携带状况, 探讨健康人群GAS监测和组合模型预测技术在猩红热早期预警中的应用。方法使用国家法定传染病报告数据分析上海市猩红热的流行特征。构建自回归移动平均模型(ARIMA)和人工神经网络(ANN)组合模型, 对猩红热月度报告发病率进行分析和预测。采用GAS分离培养、菌型鉴定试验、emm分型和超抗原基因检测技术, 监测猩红热流行期间健康人群GAS携带状况, 并计算GAS标准化带菌率。结果2005--2012年上海市共报告猩红热病例9410例, 以散发为主, 发病呈现季节性和周期性。2011年报告发病率达到高峰, 年均报告发病率6.012/10万, 患者以4。8岁年龄段托幼儿童和学生为主, 郊区人群发病率显著高于市区, 发病的性别差异无统计学意义。单纯ARIMA模型、ARIMA-GRNN组合模型和ARIMA.BPNN组合模型的平均相对误差(MER)分别为0.268、0.432和0.131。使用预测效果最优的ARIMA．BPNN组合模型进行预测, 2013年l-6月上海市猩红热月度发病率将波动在o.446/10万至3.467/10万。2008年和2010年上海市<15岁社区健康人群未发现GAS带菌者, 而2012年带菌率为1.180%, 标准化带菌率为1.092%。2012年分离获得18株GAS, 其中15株为emm 12.0型(83.33%)。结论上海市猩红热报告发病率将继续小幅上升。社区健康人群GAS带菌率监测和组合模型预测技术可用于猩红热的早期预警。     

2015-2019年北京市肺炎衣原体流行特征分析

目的:分析北京市2015-2019年急性呼吸道感染患者中肺炎衣原体感染者的流行特征。方法:利用北京市呼吸道病原体监测系统,收集全市35 家哨点医院就诊的急性呼吸道感染患者流行病学资料,采集临床标本开展肺炎衣原体检测,并对阳性标本 ompA基因的VD4区序列做进化分析。 结果:2015-2019年,...     

医院感染和社区感染患者分离肺炎克雷伯菌的耐药性差异及变迁

目的 了解某三甲综合医院连续3年分离医院感染和社区感染肺炎克雷伯菌（KP）的分布情况及耐药性差异,为临床抗菌药物合理应用提供依据。方法 回顾性分析2016年11月—2019年10月住院患者分离的社区感染和医院感染KP,比较两组KP在不同科室、不同标本来源的构成比及耐药性差异,分析耐药变化趋势。结果 共检出KP 1 104株,其中医院感染组410株,社区感染组694株。两组KP均主要来源于痰标本,主要来源科室均为重症监护病房（ICU）。两组KP除对替加环素的耐药率均为0外,对其他抗菌药物的耐药率医院感染组均高于社区感染组（均P<0.05）。社区感染组KP对抗菌药物的耐药率均<30%,医院感染组KP对头孢曲松、复方磺胺甲口恶唑的耐药率达50%以上,对亚胺培南的耐药率为18.54%。经趋势χ²检验,医院感染组检出KP对头孢曲松、头孢吡肟、头孢西丁、头孢哌酮/舒巴坦、亚胺培南、阿米卡星、妥布霉素、左氧氟沙星和环丙沙星的耐药率均呈上升趋势,差异有统计学意义（均P<0.05）;社区感染组检出KP对哌拉西林/他唑巴坦、头孢西丁、头孢哌酮/舒巴坦、亚胺培南和环丙沙星的耐药率呈上升趋势,差异有统计学意义（均P<0.05）,对庆大霉素的耐药率呈下降趋势,差异有统计学意义（P=0.004）。结论 医院感染KP耐药率高于社区感染,且医院感染组对多种抗菌药物的耐药率呈逐年上升趋势,对KP医院感染和社区感染应区别进行治疗。     

2015-2021年北京市霍乱弧菌病原学和流行特征分析

目的:分析2015-2021年北京市霍乱弧菌的病原学和流行特征,为霍乱防控提供参考。方法:对北京市2015-2021年分离到的霍乱弧菌,进行血清分型、毒力基因检测和PFGE实验;对收集的霍乱病例流行病学和临床资料,用描述性流行病学方法分析其流行特征。结果:北京市2015-2021年共分离76株O1群霍乱弧菌（来源分别为...     

Multidrug resistance in Salmonella enterica serovar typhi isolated from patients with typhoid fever complications in Lagos, Nigeria

OBJECTIVE: The aim of this study was to determine the prevalence of Salmonella enterica serovar typhi in patients with pyrexia of unknown origin (PUO), and antimicrobial resistance in strains isolated from patients with S. typhi in Lagos, Nigeria. STUDY DESIGN: In total, 103 patients were included in this study, subdivided into two categories. Category A comprised 74 patients presenting with PUO, and Category B comprised 29 patients harbouring S. typhi who did not respond to initial treatment. METHODS: Blood samples were cultured for bacterial isolates and identified by standard procedures. Susceptibility testing was performed according to the National Committee for Clinical Laboratory Standards. Plasmid DNA extraction was performed using the alkaline lysis method with Escherichia coli v517 used as the standard. Conjugation and transformation experiments were performed using standard methods. For the latter, E. coli K12 HB 101 (ara-14, galK2, hsd 520, lacyl, leu, mtl-1, Pro A2, rec A13, rps L20, sup E44, thii xyl-5) was used as the recipient and plasmid PBR 322 was used as the positive control. RESULTS: The prevalence of S. typhi in PUO was 16.2% (12/74). In all, 25 of 41 (61.0%) cases were multidrug resistant (MDR) with phenotypic-resistant patterns: ACoCT, ACTCeS, ACTCoCe and ACTS were commonly encountered among the strains. Interestingly, four of the strains harbouring similar plasmid DNA were isolated from patients with hepatosplenomegaly, and a strain harbouring a large transferable plasmid of 81.2MDa was isolated from a psychosis patient. CONCLUSIONS: Our study confirmed the circulation of MDR S. typhi in Lagos, Nigeria. Periodic review of antibiotics used in hospitals is essential as the efficacies of chloramphenicol, ampicillin and cotrimoxazole are now doubtful. Ciprofloxacin and ofloxacin are effective drugs for treatment of typhoid fever, but with current trends of drug abuse in Nigeria, resistance is likely to develop. These results, therefore, provide an early warning signal for the prudent use of fluoroquinolone antimicrobials to preserve their usefulness.     

河南省登封市2009-2015年甲型副伤寒沙门菌耐药性及PFGE分型研究

目的 分析2009-2015年河南省登封市甲型副伤寒沙门菌临床分离株耐药性与PFGE分子型别特征。方法 采集登封市2家医院临床诊断为副伤寒病例患者静脉血,利用沙门菌科玛嘉选择性培养基分离培养,API20E肠杆菌科系统生化板条鉴定后使用丹麦SSI分型血清进行沙门菌O抗原及H1/2相鞭毛诱导血清凝集试验。根据PulseNet China病原体分子分型网络实验室公布的沙门菌PFGE操作指南与美国临床实验室标准化协会沙门菌K-B法药敏测试方案,对其进行PFGE分子分型与聚类分析及8类13种抗生素药敏测试。结果 从248例患者血培养物中共分离到126株甲型副伤寒沙门菌,血清抗原式为1,2,12:a:-。126株甲型副伤寒沙门菌对广谱合成类青霉素氨苄西林(AMP)的耐药率为83.3%,对三代头孢类抗生素头孢他啶(CAZ)、头孢噻肟(CTX)的耐药率分别为29.4%和31.2%;对四代头孢类抗生素头孢吡肟(FEP)的耐药率为17.5%;对一代喹诺酮类抗生素萘啶酸(NAL)的耐药率为62.6%,对三代氟喹诺酮类抗生素环丙沙星(CIP)、诺氟沙星(NOR)的耐药率为19.3%和26.4%;对氨基糖苷类抗生素庆大霉素(GEN)、链霉素(STR)的耐药率为22.8%和47.9%;对氯霉素类抗生素(CHL)的耐药率为19.2%;对增效磺胺类抗生素甲氧苄氨嘧啶(TMP)与复方新诺明(SXT)的耐药率为24.2%和58.6%;对四环素(TET)的耐药率为46.7%。126株甲型副伤寒沙门菌中耐2种以上抗生素的多重耐药菌株为109株(86.5%),其中耐2~3种的为9株(7.1%),耐5~8种的为76株(60.3%),耐9~10种的为17株(13.5%),耐11~12种的为7株(5.6%);三代头孢类抗生素CAZ、CTX,一代与三代喹诺酮类抗生素NAL、CIP、NOR,氨基糖苷类抗生素STR耐药率总体呈年份上升趋势;经Xba Ⅰ酶切与PFGE后,126株甲副菌株获得14种带型,每种带型包含菌株数1~98株不等,相似度为64.10%~100.00%,PTYA1、6、9、10为其主要优势带型。结论 河南省登封市临床分离的甲型副伤寒沙门菌耐药状况比较严重,PFGE带型呈现多样性的同时又具有较显著的优势带型特点,部分带型与其对应的耐药谱具有一定的关联性与聚集性。