上海市2015-2017年严重急性呼吸道感染住院病例病原学特征分析

目的 初步了解上海地区≥ 15岁住院严重急性呼吸道感染病例（SARI）的流行病学特征和病原学特征。方法 在2015-2017年期间选取2家监测点医院（二级、三级医院各1家）,对每名≥ 15岁的SARI呼吸道病例采集2份标本,其中1份进行22种呼吸道病原体PCR检测,另1份进行6种常见呼吸道细菌培养鉴定。结果 共对287例SARI病例开展了标本采集与实验室检测,其中≥ 60岁老年人占70.73%。287例病例中119例病例检出≥ 1种呼吸道病原体,阳性率41.46%。流感病毒检出率最高,为17.77%（51/287）,其次为人鼻病毒/肠道病毒和冠状病毒,均为7.32%（21/287）,肺炎支原体检出率为5.57%（16/287）,副流感病毒、博卡病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、人偏肺病毒检出率均<5%。细菌培养阳性7株,分别为肺炎克雷伯菌3株,金黄色葡萄球菌2株,肺炎链球菌和铜绿假单胞菌各1株。119例阳性病例中,40例检出≥ 2种病原体,占33.61%,以流感病毒合并肺炎支原体感染为主（10例）。流感病毒存在冬、春季流行高峰和夏季流行高峰,肺炎支原体存在冬、春季流行高峰,与流感病毒有重叠。15~与≥ 60岁组的SARI病例病原体检出情况差异无统计学意义。结论 ≥ 15岁SARI病例呼吸道样本病原检出种类较多,流感病毒是主要病原体,流感病毒与肺炎支原体混合感染比例较高。     

上海地区2015－2019年急性呼吸道感染病例中腺病毒感染情况分析

目的 研究2015-2019年上海地区急性呼吸道感染病例中腺病毒感染的流行病学特征和混合感染情况,为腺病毒的防控提供科学依据。方法 收集2015-2019年上海地区3家医院内的急性呼吸道感染病例,对纳入病例进行相关信息登记和采样,进行呼吸道病原体的多重PCR检测。结果 共纳入1 543例急性呼吸道感染病例,腺病毒阳性率2.92%（45/1 543）,流感样病例（ILI）和严重急性呼吸道感染病例（SARI）中的阳性率分别为2.74%（29/1 058）和3.30%（16/485）。ILI在2019年1-5月的阳性率5.43%（7/129）高于2015-2018年同期的0.52%~4.48%（Fisher精确检验值=8.92,P=0.036）。45例腺病毒阳性病例的发病时间主要分布在第一、二季度,合计占62.22%（28/45）,各季度发病阳性率的差异有统计学意义（χ²=12.52,P=0.006）,以第二季度的阳性率最高（6.03%）,高于其他季度的1.89%~2.93%。各年龄组间差异有统计学意义（χ²=16.94,P=0.001）,且随着年龄的增加阳性率有降低的趋势（χ²=10.16,P=0.001）,13~19岁组的阳性率（9.43%）高于其他年龄组（1.48%~4.81%）;学生组阳性率（12.07%）高于其他职业（2.61%）,差异有统计学意义（χ²=11.53,P=0.001）。45例腺病毒阳性病例中混合感染占31.11%（14/45）。ILI和SARI的混合感染率分别为34.48%（10/29）和25.00%（4/16）,14例混合感染病例中,腺病毒的主要混合感染病原是甲型流感病毒和冠状病毒。结论 上海地区急性呼吸道感染病例中存在一定比例的阳性病例,需进一步加强青少年人群中的腺病毒监测,重点是关注第二季度的学生等重点人群。     

甘肃省2009-2015年发热呼吸道症候群主要病原的Bayes判别分析法分类研究

目的 了解甘肃省发热呼吸道症候群主要病原体,构建区分主要病原感染病例的Bayes判别函数。方法 以2009-2015年甘肃省各哨点医院监测的发热呼吸道症候群病例为样本,描述其病原谱构成,确定主要病原;并在样本病例中筛选有意义的临床指标进行Bayes判别分析。结果 在发热呼吸道症候群病毒检测中,流感病毒和鼻病毒检测阳性率较高（13.79%和8.63%）,分别占病毒总阳性例数的54.38%和13.73%;细菌中以肺炎链球菌和流感嗜血杆菌检测阳性率较高（44.41%和18.07%）,分别占细菌总阳性例数的66.21%和24.55%。运用筛选后的11个临床指标建立判别函数,其初始验证正确率为73.1%、交叉验证为70.6%。结论 甘肃省发热呼吸道症候群主要病原体为流感病毒、鼻病毒、肺炎链球菌及流感嗜血杆菌;Bayes判别分析在主要病原感染的分类诊断中有较高的正确率,具有一定的应用价值。     

2011-2018年北京市通州区儿童急性呼吸道感染九种病毒性病原体监测研究

目的 了解北京市通州区儿童急性呼吸道感染病毒性病原体感染情况及流行病学特征,为疾病监测和防控策略的制定提供依据。方法 选取2011年1月-2018年6月首都医科大学附属北京潞河医院就诊的儿童急性呼吸道感染病例,使用多重实时荧光PCR检测九种呼吸道病毒性病原体,分析各呼吸道病毒性病原体感染情况。结果 544例急性呼吸道感染儿童中,呼吸道病毒性病原体检测阳性者174例,阳性率为32.0%。其中鼻病毒和流感病毒的阳性率分别为9.4%和8.6%,高于其他病原体。各季节呼吸道病原体阳性率比较,差异无统计学意义;不同季节病原体构成比较,差异有统计学意义。病原体阳性患儿流涕发生率高于阴性患儿（P=0.015）;急性上呼吸道感染患儿中呼吸道病原体阳性率高于肺炎患儿中的阳性率（43.9% vs 22.3%,P<0.001）。相比较肺炎,流感病毒、鼻病毒、偏肺病毒、冠状病毒和肠道病毒更易在急性上呼吸道感染中检出。结论 通州区儿童急性呼吸道感染主要由鼻病毒和流感病毒两种呼吸道病原体所致,呼吸道病毒更易引起急性上呼吸道感染。     

2009－2012 年我国6 省（市）5 岁以下儿童住院肺炎病例的病毒病原学分析

目的 分析2009－2012 年6 个省（直辖市）＜5 岁儿童住院肺炎病例的病毒性病原,并描述其季节性分布。方法 从北京、上海、重庆、广东、甘肃、四川6 个省（直辖市）选取开展全国发热呼吸道症候群监测的8 家医院,对其纳入的＜5 岁儿童住院肺炎病例的人口统计学信息、临床症状和体征以及流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒（RSV）、冠状病毒、偏肺病毒、博卡病毒、腺病毒的实验室检测结果,分不同年份、年龄组对儿童住院肺炎病例的病原谱进行分析,并描述各种病原阳性病例的季节性分布特征。结果 2009－2012 年,8 家监测医院共纳入＜5 岁儿童住院肺炎病例4 508 例,其中至少1 种病毒检测阳性的2 688 例（阳性率59.6%）。RSV 阳性率最高（21.3%）,其次为副流感病毒（7.1%）和流感病毒（5.2%）,博卡病毒、腺病毒和偏肺病毒阳性率分别为3.8%、3.6%和2.6%,冠状病毒最低（1.1%）。RSV、流感病毒、副流感病毒、博卡病毒和偏肺病毒的季节性明显。结论 RSV是我国＜5 岁儿童住院肺炎病例的最常见病毒性病原,应在流行高峰季节采取预防控制措施以降低其对婴幼儿健康的严重危害。     

2015-2019年北京市肺炎衣原体流行特征分析

目的 分析北京市2015-2019年急性呼吸道感染患者中肺炎衣原体感染者的流行特征。方法 利用北京市呼吸道病原体监测系统,收集全市35家哨点医院就诊的急性呼吸道感染患者流行病学资料,采集临床标本开展肺炎衣原体检测,并对阳性标本ompA基因的VD4区序列做进化分析。结果 2015-2019年,北京市急性呼吸道感染就诊患者中肺炎衣原体总体阳性率为0.34%（129/37 460）,肺炎衣原体阳性率在每年3月升高,5月达到峰值,7月回落,持续时间约5~8个月,不同年份流行季可能提前或推迟1~2个月;每年流行季肺炎衣原体月阳性率均≥ 0.30%。5~44岁人群高发,其中10~14岁组肺炎衣原体阳性率最高;<25岁患者中,随年龄增加,感染肺炎衣原体的风险增加,≥ 25岁患者,随年龄增加,感染肺炎衣原体的风险降低;男、女性患者阳性率分别为0.33%（68/20 830）和0.37%（61/16 528）,组间差异无统计学意义（χ²=0.486,P=0.486）;普通肺炎患者中的肺炎衣原体阳性率高于上呼吸道感染患者与重症肺炎患者（χ²=36.797,P<0.01）;40.31%（52/129）肺炎衣原体感染者标本中检出≥ 1种其他呼吸道病原体,排名前4位依次是：流感嗜血杆菌（15份）、肺炎链球菌（13份）、鼻病毒（8份）、嗜麦芽窄食单胞菌（7份）;129份肺炎衣原体阳性标本中的101株经测序鉴定均为A型。结论 北京市肺炎衣原体每年呈单峰流行模式,流行季一般为3-7月,流行季节特征可用于与其他呼吸道病原体的鉴别诊断,5~44岁人群好发,基因型以A型为主;如果连续2个月肺炎衣原体核酸阳性率超过0.30%,可初步认为进入肺炎衣原体高流行期;肺炎衣原体感染发生肺炎后进展为重症肺炎的概率较高。     

2012 - 2018年张掖市发热呼吸道症候群哨点监测结果及分析

目的 了解张掖市发热呼吸道症候群的流行特征及病原种类。方法 收集《传染病监测技术平台信息管理系统》中2012 - 2018年张掖市发热呼吸道症候群病例信息及标本病原学结果，釆用描述性流行病学方法对病例和病原学结果进行统计学分析。结果 对304例发热呼吸道症候群病例标本进行检测，共检出14种呼吸道病原体。206例病例至少检出1种呼吸道病原体，阳性检出率67.76%，任1病毒阳性率33.11%，任1细菌阳性率54.52%，混合感染病例占42.75%；呼吸道病原体阳性检出率男性66.49%，女性69.91%，性别间阳性率差异无统计学意义（χ2 = 0.380，P＞0.05）；各年龄组阳性率检出中，10～14岁组最高（88.89 %），其次为0～4岁组（84.38%），6个年龄组检出阳性率差异有统计学意义（χ2 = 34.221、34.131，P＜0.05）；不同月份呼吸道病原体阳性检出率以1 - 3月最高（81.63%），其次为4 - 6月（75.44%），不同月份病原体阳性率差异有统计学意义（χ2 = 10.371、10.011，P＜0.05）。讨论 引起张掖市发热呼吸道症候群的主要病原为肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、鼻病毒、冠状病毒和人流感病毒；肺炎链球菌合并其他病原感染率最高；每年1 - 3月为发病高峰期。     

合肥地区急性呼吸系统感染病原体的流行病学调查

目的 了解合肥地区急性呼吸道感染(ARI)病原体分布情况和影响其病原体分布的因素.方法 入选2006年5月-2007年4月急性呼吸道感染患者530例,咽拭子法取鼻咽部分泌物和咳出的深部痰标本,采用直接免疫荧光法检测急性呼吸道感染常见病毒抗原,应用荧光定量PCR法检测肺炎支原体、肺炎农原体核酸.结果 530例急性呼吸道感染患者病原体阳性例数421例,检出阳性率为79.43%;腺病毒抗原阳性例数最多为73例,占受检人群13.77%,其后依次为流感病毒A 68例(12.83%),流感病毒B 56例(10.56%),呼吸道合胞病毒48例(9.05%),副流感病毒1 47例(8.86%),副流感病毒3 42例(7.92%),副流感病毒2 33例(6.22%),肺炎支原体32例(6.03%),肺炎衣原体22例(4.15%);冬季病原体检出阳性率最高(85.07%).结论 合肥地区急性呼吸道感染以急性上呼吸道感染多见,约75%是由病毒引起,其中以腺病毒感染最为多见,一年中又以冬、春季节多发,非典型病原体感染不容忽视.     

Taqman低密度微流体芯片技术在呼吸道传染病病原体快速检测中的应用分析

目的使用Taqman低密度微流体芯片技术(TAC)建立顺义区多种呼吸道传染病病原体构成谱,为制定有效防控措施提供依据。方法利用Taqman低密度微流体芯片技术,对2017年收集的372份呼吸道感染病例标本进行42种呼吸道传染病病原体的检测。结果 372份呼吸道感染患者病例标本共检出16种病原体,检出阳性病原体125例,阳性率为33.6%(125/372)。在所检出的病原体构成谱中,肺炎支原体检出阳性率最高;其次为流感病毒及肺炎链球菌,肺炎克雷伯菌、金黄色葡萄球菌等其他病原体也有检出,并随着年龄和季节变化感染病原体有一定的流行规律。结论肺炎支原体、流感病毒、肺炎链球菌是顺义区呼吸道感染病的主要病原体,今后应继续加强病原学的监测,注重病原体在不同人群、季节感染分布以及防治工作。     

2015 - 2017年上海市黄浦区成人急性呼吸道感染病例病原学监测分析

目的 探索上海市黄浦区成人急性呼吸道感染病例（ARI）的病原体感染分布特征。方法 采集黄浦区监测点369例急性呼吸道感染病例的呼吸道标本进行多重PCR以及细菌培养等检测,分析病原体感染的流行特征。结果 2015 - 2107年共收集了369例ARI病例,检出12种病原体,病原体检出阳性率为55.01%（203/369）。其中甲型流感病毒阳性率最高,为25.56%（98/369）,乙型流感病毒阳性率为9.76%（36/369）,肺炎克雷伯菌为4.61%（17/369）,鼻病毒/肠道病毒为3.79（14/369）。检出的病原体感染中混合感染率为5.42%（20/369）。不同年龄组感染率有所不同,16～24岁年龄组感染率较高（68.00%,17/25）,60岁及以上年龄组感染率较低（44.90%,66/147）。冬季和夏季是呼吸道病原体阳性率较高,检出阳性率分别为69.11%（85/123）、60.32%（76/126）。流感有季节性特征,夏季阳性率为17.34%（64/369）,冬季阳性率为14.36%(53/369）。结论 上海市黄浦区成人呼吸道感染病例中病原体主要以病毒为主,其中季节性流感检出阳性率最高。不同年龄组感染率有差异,冬季和夏季是呼吸道病原体感染流行的高峰。     

武汉地区冬春季儿童急性呼吸道感染病原学研究

目的 了解武汉地区冬春季儿童急性呼吸道感染不同病原体的检出率、构成等相关流行病学特征.方法 对6348例于2010年10月-2011年3月到医院就诊,诊断为呼吸道感染的儿童,用间接免疫荧光法检测9种呼吸道病原体IgM抗体.结果 病原体总阳性检出率为34.40％,9种病原体检出率由高到低依次为:肺炎支原体占21.88％、腺病毒占10.41％、乙型流感病毒占10.03％、呼吸道合胞病毒占7.36％、副流感病毒占5.01％、肺炎军团菌血清1型占1.02％、甲型流感病毒占0.72％、Q热立克次体占0.09％、肺炎衣原体0.02％;肺炎支原体在整个冬春季其间检出率均较高,腺病毒在10月份检出率较低,但在随后月份中其检出率均比较高,乙型流感病毒在2011年1月呈暴发态势,阳性病例数和检出率上升5倍,呼吸道合胞病毒阳性检出率在2010年12月份达到最高.结论 引起武汉地区冬春季急性呼吸道感染患儿的主要病原体为肺炎支原体、腺病毒、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、副流感病毒,且乙型流感病毒在2011年1月有暴发流行的趋势.     

Incidence of acute respiratory tract infections (2006–2015) and influenza (2006–2013) among French armed forces

ObjectivesWe aimed to assess the incidence of respiratory tract infections in military settings between 2006 and 2015.Patients and methodsWe performed a retrospective epidemiological study of the entire military population from 2006 to 2015. Comprehensive data was collected from all medical centers, operational medical units, naval services, and army training hospitals and provided by the epidemiological surveillance of the armies.ResultsThe annual average population of the study was 331,394 soldiers. For acute respiratory tract infections (2006–2015), 22,818 cases were reported in metropolitan France, 3,211 cases in French overseas territories, 1,595 cases in the French Navy, and 1,318 cases in external military operations for a total of 28,942 cases. For influenza (2006–2013), 934 cases were reported in metropolitan France, 101 cases in French overseas territories, and 23 cases in external operations, for a total of 1,058 cases. The mean incidence rate of acute respiratory tract infections expressed as case number per 1,000 person-years (PY) was 8.7 PY (95% CI [8.6–8.8]) with an exceptional increased incidence rate in 2009 (25.9 PY, 95% CI [25.4–26.4]). The mean incidence rate of influenza was 0.35 PY (95% CI [0.33–0.37]) with a peak incidence rate of 1.9 PY in 2009.ConclusionAcute respiratory tract infections are at the forefront of infectious episodes in the French armies. Although not necessarily severe, current prevention measures are not enough to reduce the incidence threshold of these infections and need to be improved.     

某部急性呼吸道感染病原谱的流行特征

目的调查了解某部队急性呼吸道感染病原体流行情况,为疫情防控提供依据。方法采集该部队急性呼吸道症候群病例咽拭子、血清等标本,采用荧光定量PCR检测呼吸道常见病毒。结果 2年共检测呼吸道感染病例标本801份,阳性299份,阳性率为37.3%。其中2014年检测536份,阳性率为39.9%,病原体主要为季节性H3N2病毒(占57.5%)、腺病毒55型(占40.6%)和乙型流感病毒(占1.9%)。2015年检测265份,阳性率为32.08%,病原体主要为乙型流感病毒(占30.1%)、腺病毒7型(占27.1%)和甲型H1N1病毒(占23.5%),其他为冠状病毒OC43型(占16.5%)和NL63型(占1.2%)。结论当前该部急性呼吸道感染病原体以甲、乙型流感病毒、腺病毒为主,也有冠状病毒检出。做好部队呼吸道病原监测工作,对部队传染病的防控有重要意义。     

上海市实施急性呼吸道感染综合监测应对新发呼吸道传染病的实践与思考

上海市CDC试点实施了成年人急性呼吸道感染综合监测,对流感样病例（ILI）和严重急性呼吸道感染（SARI）开展主动监测和多种呼吸道病原体的检测鉴定。在2019年172例ILI中以流感病毒感染为主,其中新甲型H1N1型、H3N2亚型和B/V亚型流感病毒的检出阳性率分别为30.81%、14.53%和30.55%,新甲型H1N1型的流行高峰为第一季度。肠道病毒/人鼻病毒总检出阳性率为6.40%,高峰在第三季度。腺病毒总检出阳性率为4.65%,高峰在第二季度。人类冠状病毒OC43型2份、HKU1型和NL63型各1份、229E型未检出;金黄色葡萄球菌检出率为17.44%,肺炎克雷伯菌检出率为9.88%;1 447例SARI病例也以流感病毒感染为主,其中新甲型H1N1型、H3N2和B/V亚型流感病毒的检出率分别为5.46%、1.73%和0.30%,新甲型H1N1型流感流行高峰也为第一季度,检出阳性率为17.50%。肠道病毒/人鼻病毒总检出阳性率为2.97%,高峰在第一季度。肺炎支原体检出阳性率为3.25%,军团菌检出阳性率为1.04%。检出人类冠状病毒229E型5份、OC43型10份、HKU1型7份、NL63型6份;细菌培养检出金黄色葡萄球菌8株,铜绿假单胞菌4株,肺炎克雷伯菌3株。通过开展主动监测,不仅发现了个别少见的新发传染病如人感染H7N9禽流感病例,同时也初步掌握了上海市急性呼吸道感染病例的流行病学特征、病原谱特征及其季节性变化趋势。近年来,通过逐步增加监测哨点医院,不断改进监测方法,尤其是在应对新型冠状病毒肺炎过程中在全市推广了基于医院HIS系统的监测信息上报系统,初步建立了覆盖全市的急性呼吸道感染综合监测网络,为开展新发呼吸道传染病主动监测预警打下了基础。     

上海市浦东新区2013－2017年感染性腹泻病原流行特征分析

目的 了解2013-2017年上海市浦东新区感染性腹泻病原流行特征,为制定监测方案和开展感染性腹泻防治工作提供科学依据。方法 2013年1月至2017年12月,根据地理位置、覆盖人群和就诊量,在本区3所三级医院、9所二级医院和2所社区卫生服务中心开展腹泻病原主动监测,填写门诊病例个案调查表,采集粪便样品进行5类病毒和8类细菌的病原学检测。结果 共纳入感染性腹泻病例9 301例,病原阳性率为55.7%（5 179）。单一病毒、单一细菌和混合感染的阳性率分别为26.7%（2 481）、17.0%（1 579）和12.0%（1 119）。单一病毒阳性病例中,诺如病毒阳性率最高（15.4%,1 428/9 301）,其次为轮状病毒（7.2%,667/9 301）;单一细菌阳性病例中,致泻性大肠埃希菌阳性率最高（6.7%,619/9 301）,其次为非伤寒沙门菌（3.3%,305/9 301）;混合感染病例中,病毒-细菌阳性率最高（4.9%,459/9 301）。诺如病毒（17.0%,838/4 938）和致泻性大肠埃希菌（7.2%,354/4 938）阳性率在20~59岁年龄组最高,轮状病毒（9.4%,178/1 896）和非伤寒沙门菌（4.9%,93/1 896）阳性率在0~4岁年龄组最高。诺如病毒年度流行呈现春季和秋季2个高峰,轮状病毒呈现冬季高峰,致泻性大肠埃希菌呈现夏季高峰,非伤寒沙门菌呈现夏季小高峰。结论 2013-2017年上海市浦东新区感染性腹泻病原阳性率高,诺如病毒、轮状病毒和致泻性大肠埃希菌是本地区优势病原体,病原在不同年龄组分布存在差异,优势病原季节性流行特征明显。     

江苏海安地区老年急性呼吸道感染患者病原体谱感染的流行病学调查

目的 对海安地区老年急性呼吸道感染(ARI)患者病原体谱感染情况进行流行病学调查分析.方法 选择2017年1月至2019年12月江苏省海安市人民医院收集的547例老年ARI患者呼吸道标本,采用RT-PCR法对标本中多种病原体进行检测,分析各病原体感染的流行病学特征.结果 547份标本中阳性检出率为47.71％(261/...