昆明市2018年男男性行为者HIV-1基因型及耐药特征分析

目的 了解2018年昆明市MSM的HIV-1基因型及耐药特征。方法 收集昆明市2018年1-12月新报告HIV-1感染的MSM的血浆样品193份,提取病毒RNA,采用巢式PCR扩增gag、pol和env区基因片段,进行基因分型和耐药分析,通过Bayesian Markov Chain Monte Carlo（MCMC）方法分析昆明市MSM感染者中CRF55_01B和CRF68_01B的进化特征。结果 193份样品中发现多个HIV-1基因型,包括CRF07_BC（39.4%,76/193）、CRF01_AE（34.2%,66/193）、独特型重组（20.2%,39/193）、CRF08_BC（3.1%,6/193）、CRF55_01B（1.6%,3/193）、B亚型（1.0%,2/193）和CRF68_01B（0.5%,1/193）。Bayesian进化分析结果显示CRF55_01B从外省进入昆明市后已开始在本地传播,而CRF68_01B可能来自于我国东部地区。2018年昆明市MSM抗病毒治疗前的HIV-1耐药株流行率为2.6%（5/190）,对非核苷类反转录酶抑制剂的耐药突变发生率最高（2.1%,4/190）。结论 昆明市MSM的HIV-1基因型多样性逐年增加。MSM未接受抗病毒治疗HIV-1感染者耐药发生率虽然较低,但存在抗病毒治疗一线药物的多重耐药株。     

广州市2008-2015年未接受抗病毒治疗的注射吸毒人群HIV-1感染者耐药分析

目的 了解广州市未接受抗病毒治疗的注射吸毒人群（IDU）HIV-1感染者耐药株流行情况。方法 收集2008-2015年新确证HIV-1抗体阳性、现住址为广州市、传播途径为注射吸毒、确证时未接受抗病毒治疗的IDU HIV-1感染者的血清样本,提取HIV-1 RNA,采用巢式PCR法扩增pol区蛋白酶（PR）基因全序列与反转录酶（RT）基因部分序列并测序后,提交到美国斯坦福大学HIV耐药数据库做耐药分析。结果 518例HIV感染者中,有407例（78.57%）血清样本成功获得pol区基因片段。年龄18~64（37.44±8.14）岁,男性占89.68%（365/407）,汉族占89.93%（366/407）,未婚者占55.28%（225/407）,文化程度以初中及以下为主（83.78%,341/407）。HIV-1亚型以CRF07_BC为主（47.18%,192/407）,CRF01_AE占23.83%（97/407）和CRF08_BC占22.85%（93/407）,其他亚型占6.14%（25/407）。总耐药率为3.44%（14/407）,蛋白酶抑制剂耐药率为1.47%（6/407）,核苷类反转录酶抑制剂耐药率为0.25%（1/407）,非核苷类反转录酶抑制剂耐药率为1.72%（7/407）。突变发生率为12.29%（50/407）,蛋白酶区和核苷类反转录酶区未检出主要耐药突变,非核苷类反转录酶区中V179E突变率更高的是其他亚型和CRF07_BC亚型,其他亚型中的CRF55_01B亚型8例全部发生此突变;E138A突变率最高的是CRF08_BC亚型,为3.23%。有2例病例对NNRTIs的4种药物全都耐药。结论 2008-2015年广州市未接受抗病毒治疗的IDU HIV-1感染者的耐药率处于较低水平,大多数IDU HIV-1感染者对现有抗病毒治疗药物敏感。应加强IDU HIV-1感染者的耐药监测,控制耐药性毒株多重、交叉耐药的流行。     

台州市2016-2018年新报告HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药及亚型流行特征分析

目的 了解台州市新报告HIV/AIDS抗病毒治疗（ART）前HIV-1耐药情况及亚型流行特点。方法 于2016年1月至2018年12月在台州市开展新报告HIV/AIDS在ART前HIV-1耐药的横断面调查,RT-PCR扩增获得HIV-1 pol基因片段并测序,提交序列至斯坦福大学耐药数据库,根据2014年WHO耐药监测指南的推荐标准,确定耐药突变位点以及HIV-1毒株对抗病毒药物的敏感性。结果 2016-2018年台州市新报告HIV/AIDS中成功获得HIV-1 pol基因区序列的研究对象806例,ART前HIV-1耐药率为2.9%（23/806）,其中,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）、核苷类反转录酶抑制剂（NRTIs）和蛋白酶抑制剂（PIs）耐药率分别为1.9%（15/806）、0.6%（5/806）和0.0%。2016-2018年新报告HIV/AIDS在ART前HIV-1耐药率依次分别为1.6%、1.8%和4.8%。NNRTIs和NRTIs耐药突变位点以K103 N（0.7%）和M184I/V（0.5%）为主。HIV-1亚型以CRF01_AE（42.7%,344/806）、CRF07_BC（28.9%,233/806）和CRF08_BC（11.2%,90/806）为主。同性性传播者HIV-1亚型以CRF01_AE（53.3%,136/255）和CRF07_BC（32.2%,82/255）为主;异性性传播者HIV-1亚型以CRF01_AE（37.7%,203/539）、CRF07_BC（27.5%,148/539）和CRF08_BC（16.1%,87/539）为主。结论 2016-2018年台州市新报告HIV/AIDS在ART前HIV-1耐药率处于低流行状态,但存在上升趋势,需加强对HIV-1耐药型毒株的监测工作。     

天津市2014－2017年男男性行为人群艾滋病病毒感染者原发性耐药分析

目的 了解2014－2017年天津市MSM人群HIV感染者（MSM感染者）原发性耐药（transmitted drug resistance,TDR）的流行特点和相关因素。方法 收集2014－2017年天津市未经抗病毒治疗的MSM人群中HIV感染者的血浆样本共225例,采用巢式PCR法扩增pol区基因片段,进行基因型耐药检测和相关因素分析。结果 205例样本获得pol区基因序列,完成HIV亚型和耐药检测。基因型依次为CRF01_AE占53.2%（109/205）,CRF07_BC占28.8%（59/205）,B亚型占10.2%（21/205）,CRF55_01B亚型占4.9%（10/205）,其他独特型二代重组亚型占2.9%（6/205）。75例样本成簇分布在20个传播簇内,62.5%（10/16）的TDR样本分布在5个传播簇中。耐药株的TDR流行率为7.8%,2014－2017年每年的TDR流行率逐年上升,分别为3.9%（2/51）、5.7%（3/53）、9.6%（5/52）和12.2%（6/49）,但差异无统计学意义（χ²=2.504,P=0.127）,CRF01_AE亚型和B亚型TDR流行率最高,分别为3.4%（7/205）和2.9%（6/205）。TDR突变以非核苷酸反转录酶抑制剂（NNRTIs）为主,TDR流行率为6.3%（13/205）,核苷酸反转录酶抑制剂（NRTIs）和蛋白酶抑制剂（PIs）的TDR流行率分别为1.5%（3/205）和1.0%（2/205）。结论 天津市MSM感染者的TDR毒株的TDR流行形势较严重,需采取有针对性的预防和控制措施。     

珠海市男男性行为人群HIV-1感染者原发性耐药基因突变分析

目的 研究珠海市男男性行为（MSM）人群中未经治疗的HIV-1感染者耐药突变发生和基因亚型分布。方法 采集2011—2016年珠海市386名未经治疗的MSM人群HIV-1抗体阳性血浆标本,提取病毒RNA,采用In-house方法扩增HIV-1 pol基因并进行测序,通过系统进化树和数据库分析基因亚型和耐药情况。结果 共得到309份样本的pol区序列。CRF07_BC（占48.87%,151/309）和CRF01_AE（占32.03%,99/309）重组亚型占主要地位,其次是CRF55_01B亚型（30/309,占9.71%）。原发性耐药率为1.29%（4/309）,传播性耐药（TDR）相关突变率为15.53%（48/309）,30例CRF55_01B亚型中有25例出现TDR相关突变,位点均在非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）的V179E。结论 珠海市MSM人群HIV-1基因亚型以CRF01_AE和CRF07_BC重组亚型为主,其他多种基因亚型共同流行;该人群HIV-1耐药率处于低度水平,应关注复杂的亚型组成、CRF55_01B亚型高占比及大部分携带V179E突变等特点,加强对该人群耐药株的监测。     

心血管疾病与勃起功能障碍相关流行病学研究的文献计量学分析

目的 了解广州市外籍HIV-1感染者病毒亚型分布特征。方法 从广州市2008－2010年报告和2015年新确诊的外籍HIV-1感染者151份血清样本中成功获得共114份pol区基因片段,测序后构建系统进化树确定亚型。结果 114名外籍HIV-1感染者中,男性占57.9%（66/114）,女性占42.1%（48/114）;平均年龄（35.21±9.63）岁;来自非洲地区占65.8%（75/114）。HIV-1各亚型构成比居前3位的分别为CRF02_AG重组型、G亚型和C亚型,分别占30.7%（35/114）、14.9%（17/114）和12.3%（14/114）。与2008－2010年相比,2015年以A1亚型（20.0%,5/25）和CRF01_AE重组型（24.0%,6/25）为主,其他亚型占比较少。男性的CRF01_AE亚型和G亚型的构成比分别为12.1%（8/66）和18.2%（12/66）,均高于女性的2.1%（1/48）和10.4%（5/48）;女性的A1亚型、CRF02_AG亚型和URF亚型的构成比分别为12.5%（6/48）、35.4%（17/48）和10.4%（5/48）,均高于男性的3.0%（2/66）、27.3%（18/66）和6.1%（4/66）。来自非洲地区的以CRF02_AG亚型（32.0%,24/75）和G亚型（17.3%,13/75）为主。来自东南亚地区的以CRF01_AE为主（50.0%,5/10）。对蛋白酶抑制剂（PIs）和反转录酶抑制剂（RTIs）任意1种的耐药率为21.9%（25/114）,对PIs、核苷类反转录酶抑制剂（NRTIs）和非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）的耐药率分别为12.3%（14/114）、6.1%（7/114）和7.0%（8/114）。1例CRF01_AE亚型外籍感染者与本地感染者在进化树上关系密切（bootstrap=0.855）。结论 广州市的外籍HIV-1感染者带来了不同于广州本地的流行亚型,增加了国外毒株本地化和耐药毒株传播的风险。     

云南省德宏傣族景颇族自治州2015年HIV-1耐药传播警戒线调查

目的 了解2015年云南省德宏傣族景颇族自治州（德宏州）未接受抗病毒治疗的HIV感染者的耐药株传播水平。方法 2015年1-7月在德宏州收集72份新报告的16~25岁HIV-1感染者的血浆样品,进行HIV-1基因型耐药检测和耐药株传播水平分析。结果 48份完成了基因型及耐药鉴定,其中中国籍占31.2%（15/48）,缅甸籍占68.8%（33/48）。通过进化分析对pol区进行分型,主要的基因型包括URF（52.08%,25/48）、CRF01_AE（16.67%,8/48）、CRF07_BC（10.42%,5/48）、B亚型（6.25%,3/48）、C亚型（6.25%,3/48）、CRF57_BC（6.25%,3/48）和CRF08_BC（2.08%,1/48）。在4个序列中分别检测到1个针对非核苷类反转录酶抑制剂的耐药突变位点（K103N）和2个针对核苷类反转录酶抑制剂的耐药突变位点（T69D和T215I）,按照耐药警戒线的统计方法估算耐药株流行率为5%~15%。结论 2015年德宏州16~25岁新报告的HIV-1感染人群中外籍比例较高,HIV-1基因型复杂,HIV-1传播性耐药达中度水平。     

凉山彝族自治州HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药情况及其影响因素分析

目的 了解凉山彝族自治州（凉山州）HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药情况及其影响因素,为预防HIV-1耐药毒株的传播提供参考依据。方法 分别于2017年1月1日至6月30日、2018年1月1日至6月30日在凉山州开展HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药的横断面调查。提取获得HIV-1 pol基因区序列,根据2014年WHO耐药监测指南的推荐标准,应用HyPhy 2.2.4和Cytoscape 3.6.1软件进行HIV-1耐药毒株传播网络分析。结果 研究对象464例HIV/AIDS,HIV-1毒株为CRF07_BC亚型的占88.6%（411/464）,总的HIV-1耐药率为9.9%（46/464）,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTI）、核苷类反转录酶抑制剂（NRTI）和蛋白酶抑制剂（PI）耐药率分别为6.7%（31/464）、1.9%（9/464）和0.4%（2/464）;有1组HIV-1新型重组毒株URF_01BC亚型独立成簇并携带相关耐药突变位点;多因素logistic回归分析结果显示,与异性性传播人群相比,注射吸毒人群的HIV-1耐药风险较高（aOR=3.03,95% CI：1.40～6.54）。结论 凉山州HIV/AIDS抗病毒治疗前的HIV-1耐药率较高,且有新型重组毒株URF_01BC亚型携带相关耐药突变位点的成簇传播,建议加强HIV-1耐药毒株传播的预防工作。     

广州市2008-2015年男男性行为人群HIV-1亚型分布特征及变化趋势

目的 了解2008－2015年广州市MSM人群HIV-1感染者（MSM感染者）HIV-1亚型分布特征及变化趋势。方法 研究对象为2008－2015年确证的HIV-1感染者、男男性行为途径感染、现住址为广州市。收集血清样本提取HIV-1 RNA,采用巢式 PCR法扩增HIV-1 pol区基因片段,测序后构建系统进化树,确定HIV-1亚型,比较不同年份和不同特征样本的HIV-1亚型分布。结果 从2 473份血清样本中成功获得2 210份样本的pol区基因片段。2 210份样本人群的年龄（30.19±8.22）岁;未婚者占73.39%;汉族占90.81%。独特重组形式（URFs）亚型在职业为农民及农民工的构成比高于其他职业者（P＝0.017,99%CI：0.014～0.020）,URFs亚型在多性伴者的构成比高于非多性伴者（ χ²＝5.733,P＝0.017）。HIV-1亚型分布以CRF07_BC（38.10%）和CRF01_AE（34.84%）为主,其次为CRF55_01B（14.62%）、B（6.06%）、URFs（3.58%）、CRF59_01B（2.17%）和其他亚型（0.63%）。B、CRF07_BC、CRF55_01B和URFs亚型在2008－2015年的各年份构成比的差异有统计学意义（B：P＝0.000,99%CI：0.000～0.000;CRF07_BC：χ²＝14.965,P＝0.036;CRF55_01B：χ²＝18.161,P＝0.011;URFs：P＝0.001,99%CI：0.000～0.001）,其中B亚型的构成比呈逐年下降趋势（P＝0.000,99%CI：0.000～0.000）,URFs亚型的构成比呈逐年上升趋势（P＝0.000,99%CI：0.000～0.000）。结论 2008－2015年广州市MSM感染者HIV-1亚型分布表现为CRF07_BC和CRF01_AE为主、多个亚型共存的特点。URFs亚型的构成比呈上升趋势提示HIV-1在MSM感染者中在不断发生重组。应针对MSM感染者农民及农民工、多性伴者加强干预。     

2016—2019年深圳市龙岗区16～25岁HIV感染者病毒亚型及耐药特征分析

目的 了解深圳市龙岗区抗病毒治疗前HIV - 1感染者基因亚型和耐药株流行现况。方法 HIV/AIDS流行病学数据来源于全国艾滋病综合防治数据信息管理系统。采用描述性研究方法,对HIV感染者的流行特征进行统计分析,率和构成比的比较采用χ2检验或Fisher精确检验。收集2016—2019年新报告的16～25岁的HIV感染者血清样品,扩增HIV pol区全部蛋白酶基因和部分逆转录酶基因区域,测序后进行HIV - 1基因分型和耐药突变位点分析。结果 173份血清样品成功获得pol序列片段,男性占93.64%(162/173),单身占95.95%(166/173),外省户籍者占65.32%(112/173),同性性传播占67.63%(117/173)。HIV - 1亚型以CRF07_BC(43.35%)和CRF01_AE(32.95%)为主,其次为CRF55_01B(13.87%)、B(5.78%)和其他亚型(4.05%)。不同年份HIV - 1亚型分布差异有统计学意义(H = 9.456,P = 0.042)。总传播耐药率为5.78%（10/173）,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）耐药率为4.62%(8/173),核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)为2.31%(4/173)。同性性传播的耐药率为7.69%(9/117),异性性传播为1.79%(1/56)。突变发生率为21.97%(38/173),未检测出PIs突变,主要耐药突变位点中5个针对NNRTIs和4个针对NRTIs。次要突变V179D/E高达17.34%(30/173),主要发生在CRF55_01B亚型,不同HIV - 1亚型检测出V179D/E突变差异有统计学意义(χ2 = 91.733,P＜0.001)。5例病例对一线治疗药物NNRTIs耐药,1例对NNRTIs和NRTIs双重耐药。结论 2016—2019年深圳市龙岗区HIV - 1亚型分布表现为以CRF07_BC和CRF01_AE为主,多个亚型共存的特点。HIV - 1感染者原发耐药率已达到中度水平,MSM人群中NNRTIs类药物的耐药需引起重视。应加强年轻的MSM人群的耐药监测。     

我国6个省19个城市男男性行为人群HIV-1 基因亚型及抗病毒治疗前耐药分析

目的分析我国6个省19个城市男男性行为人群(MSM)HIV-1基因亚型分布及抗病毒治疗前耐药情况。方法 2019年4-11月, 在河北、山东、江苏、浙江、福建和广东6个省19个城市收集未接受抗病毒治疗MSM HIV-1感染者的血浆样本574份, 提取RNA, 反转录后经巢式PCR扩增HIV-1pol 基因区片段。PCR 产物测序后进行序列分析, 构建系统进化树判定病毒基因亚型, 提交斯坦福耐药数据库分析耐药。结果有479份样本PCR扩增成功并获得核酸序列, 检出的HIV-1基因亚型有9种, 其中CRF01_AE(43.4%)和CRF07_BC(36.3%)所占比例较大, 随后依次为B(6.3%)、CRF55₀1B(5.9%)、CRF59₀1B(0.8%)、CRF65_cpx(0.8%)、CRF103₀1B(0.4%)、CRF67₀1B(0.4%)和CRF68₀1B(0.2%);另有26份(5.5%)样本的基因亚型为未知...     

浙江省男男性行为人群HIV-1新近感染者的毒株亚型和传播簇研究

目的 了解浙江省MSM中的HIV-1新近感染者的毒株亚型组成和传播特征.方法 233例2011年新报告的MSM感染者经BED捕获酶免试验(BED-CEIA)检测为新近感染,其中107例纳入分子流行病学研究,收集血浆样本提取RNA核酸,用反转录/巢式PCR扩增HIV病毒的pol基因片段,测序后进行生物信息学分析.结果 107例研究对象与当年MSM新近感染者在社会人口学特征上差异无统计学意义.序列获得率为94.4％(101/107),CRF01 AE占比最高(62.4％),其次是CRF07 BC(31.7％),另有3例B亚型,1例CRF55_01B和2例独特重组型.毒株在系统进化树上主要分为CRF01 AE的簇1、簇2和CRF07_BC的簇3,杭州地区的毒株散播于各个进化分支.共发现10个传播簇,80％涉及≥2个的地市,90％与现住址为杭州的病例有关; 共发现有3个样本各存在一个监测性耐药突变,分别为M46I、T215S和G190A,传播性耐药率为2.97％.结论 浙江省MSM的HIV亚型呈现复杂性趋势,但传播性耐药处于低度流行水平;HIV的跨地区传播较为普遍,杭州在地域上可能发挥着核心传播作用,全省已形成混杂交织的复杂网络.     

云南省德宏州2012年HIV-1耐药传播警戒线调查

目的 调查2012年云南省艾滋病高流行区德宏州未经抗病毒治疗的HIV感染者的基因型分布和耐药株传播水平。方法 根据HIV耐药警戒线调查实施方案,对2012年1-8月德宏州符合要求的60份年龄在16～25岁新发现的HIV-1感染者的血浆样本进行HIV-1耐药基因型检测和耐药株传播水平分析。结果 52份样本完成基因型及耐药鉴定,其中中国籍占59.6%,缅甸籍占40.4%。通过进化分析对pol区进行分型,38.5%的样本为独特型重组（URF）,其他依次为C 亚型（34.6%）、CRF01_AE（21.2%）、CRF08_BC（3.8%）和B亚型（1.9%）。在2个序列中各检测到1个针对非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTI）类药物的耐药突变位点,按照耐药警戒线的统计方法估算耐药株流行率为5%～15%,属于中度水平。结论 德宏州新感染人群中存在复杂的HIV-1基因型,HIV-1耐药株已处于中度流行水平。     

2018年珠海市HIV-1基因型及耐药分析

目的 了解2018年广东省珠海市新确诊且未接受抗病毒治疗的HIV-1抗体阳性病例不同感染途径病毒亚型分布和耐药情况。 方法 收集研究对象血浆标本207份,提取病毒RNA,采用巢氏RT-PCR扩增HIV -1多聚酶pol区,测序定型和耐药分析。 结果 在男男性行为者中流行基因型为CRF07_BC(43.3%)、CRF01_AE(36.1%)和CRF55_01B(13.4%);在异性性感染人群优势基因型为CRF01_AE(52.5%)、CRF07_BC(31.1%)和CRF08_BC(6.6%);在3例注射吸毒感染人群检出CRF01_AE;有1例血源性感染病例检测基因型为H亚型;在MSM和异性性感染人群产生低度耐药,低度耐药率分别为4.1%和4.9%;在注射吸毒和血源性传播感染人群未检出耐药病例。 结论 在经性传播途径感染HIV-1多种基因型共同流行,以CRF01_AE和CRF07_BC基因型为主;在四类人群未检出低度以上耐药病例,总体传播性耐药呈低度流行。