浙江省农村外来婚嫁女HIV亚型感染溯源及家庭内传播研究

目的 分析浙江省外来婚嫁女感染HIV亚型特征和家庭内传播关系.方法 以浙江省艾滋病疫情报告中HIV感染的农村外来婚嫁女及其感染配偶和子女为研究对象,基因序列分析结合个案流行病学分析,采用巢式PCR扩增gag基因区,分析亚型特征和病毒株来源,并利用系统进化树分析夫妻间、母子间传播关系.结果 在118例报告HIV感染外来婚...     

浙江省46对夫妻双方感染艾滋病毒者中病毒株亚型及传播关系的研究

目的 分析研究夫妻双方艾滋病毒(HIV)感染病毒株亚型特征和夫妻间传播关系.方法 以浙江省艾滋病疫情报告中双方均感染HIV的夫妻为研究对象,基因序列分析结合个案危险行为史分析,采用巢式PCR扩增gag基因区,分析亚型特征、夫妻间基因距离,并做系统进化树分析夫妻间传播关系.结果 获得46对夫妻(92例)的样本检测结果,其中39例CRF01_AE、10例CRF07_BC、18例CRF08_BC、18例B、5例C、2例CRF02_AG六种亚型,分别占42.4%、10.9%、19.6%、19.6%、5.4%和2.2%.夫妻双方亚型一致的为44对(95.7%).经系统树分析,41对夫妻序列中,33对(80.5%)提示有夫妻间直接传播关系,其中CRF01_AE、CRF08_BC和CRF02_AG主要为非婚性行为感染后经婚内性行为传播,B亚型和CRF07_BC主要为经血传播感染后经婚内性行为传播.结论 浙江省夫妻双方感染HIV的病毒株亚型呈现多样性,CRF01_AE是主要类型.一方高危行为感染后经婚内性传播是夫妻人群感染的主要模式.     

浙江省湖州市新诊断HIV/AIDS的HIV-1亚型和分子传播特征研究

目的 了解浙江省湖州市HIV-1亚型和分子传播特征,为HIV疫情流行趋势和防治提供科学依据。方法 对408例2019年7月—2021年6月新诊断的HIV感染者/AIDS患者(以下简称HIV/AIDS)开展分子流行病学研究,先后采用反转录-聚合酶链反应和巢式聚合酶链反应扩增其pol区基因,再进行基因测序,通过MEGA6.0软件构建Neighbor-Joining系统进化树,得到初步亚型分析结果,利用Cytoscape3.6. 0软件对遗传距离≤0.01的序列构建HIV分子簇,通过CPR6.0在线软件工具分析耐药突变位点。结果 测序得到277份有效序列,发现14种亚型,流行重组型(CRF)CRF07＿BC占50.5%(140/277),CRF01＿AE亚型占28.5%(79/277)。基因遗传距离为1.0%时形成27个分子簇(簇内例数为2例～10例),其中CRF07＿BC亚型入网率为35.0%(49/140),高于CRF01＿AE亚型入网率为[20.3%(16/79)],差异无统计学意义(χ²=2.464,P=0.117);发现CRF07＿BC亚型3个较大分子簇C1、...     

浙江省义乌市2016年新报告HIV/AIDS的HIV-1亚型和传播簇分析

目的 了解浙江省义乌市HIV亚型分布和传播簇特征,为HIV流行趋势分析和疫情防治提供依据。方法 对该地区2016年新报告HIV/AIDS开展分子流行病学横断面研究,从168例血浆中提取RNA,通过RT-PCR和巢式PCR扩增pol基因并测序。构建系统进化树分析亚型和传播簇,通过CPR 6.0在线软件工具分析耐药突变位点。结果 研究对象年龄（39.1±13.4）岁,男性为主（86.3%,145/168）,外省户籍居多（66.7%,112/168）,感染途径为同性传播（51.2%,86/168）和异性传播（48.8%,82/168）。HIV序列成功获得率为89.9%（151/168）,优势亚型为CRF01_AE 74例（49.0%）和CRF07_BC 64例（42.4%）,其他亚型包括CRF08_BC 5例（3.3%）,CRF55_01B 3例（2.0%）,B、CRF45_cpx、CRF59_01B、CRF85_BC和URF （B/C）各1例。CRF45_cpx和CRF85_BC在浙江省首次发现。共发现26个传播簇（含65个病例）,总成簇比例43.0%（65/151）,CRF01_AE成簇比例54.1%（40/74）,高于CRF07_BC的32.8%（21/64）;各传播簇平均大小为2.5例/簇,CRF01_AE中异性传播的传播簇最大（3.5例/簇）。传播性耐药率为4.6%（7/151）,7例检出监测性耐药突变,包括M46L 5例,F77L和Y181C各1例。结论 义乌市HIV亚型复杂多样,多种传播簇并存且特征多样,应继续加强亚型监测,重点对传播簇病例开展专题调查,实施针对性有效干预。     

天津市2015年HIV流行和传播的分子流行病学特征分析

目的 了解2015年天津市HIV流行株的亚型分布和传播特点。方法 从77例新报告未治疗且CD₄⁺T淋巴细胞计数≥200个/μl的HIV-1感染者,提取血浆中RNA,应用反转录和巢式PCR扩增HIV的pol和env区,并测序进行相关分子生物学分析。结果 共获得63例样本的HIV毒株序列结果,亚型依次为CRF01_AE、CRF07_BC、B、CRF55_01B和其他独特型二代重组毒株,分别占46.03%（29/63）、30.16%（19/63）、11.11%（7/63）、4.76%（3/63）和7.94%（5/63）;感染者以性传播为主,其中又以CRF01_AE和CRF07_BC重组亚型为主,除异性传播无B和CRF55_01B亚型外,同性和异性传播者的亚型分布无明显差别。重组毒株的构成比为88.89%（56/63）,并首次发现的二代重组亚型8例,包括3例CRF55_01B、2例AE/BC、1例AE/B和1例新型的AE/B/C重组均为男男同性传播;1例AE/BC重组为异性传播。HIV感染者中传播耐药率为5.3%,均为NNRTI类监测性耐药突变L100I;进化分析中3对pol区Bootstrap值均≥98%,env区Bootstrap值均≥80%,调查显示3对样本来源确认有性伴传播关系。结论 天津市HIV感染者中重组毒株不断增加并广泛流行,性传播者中HIV新型二代重组和耐药毒株不断产生并在不同人群和不同地区间传播,应引起高度重视。     

泸州市新报告HIV-1感染者基因亚型及分子传播特征研究

目的 分析四川省泸州市2021年新发现人类免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus, HIV）感染者传播情况,了解HIV-1传播网络的危险因素和特点,为本地区艾滋病疫情防控提供数据。方法 收集2021年363份泸州市新报告的HIV-1感染者血样及人口学信息。通过巢式PCR扩增HIV-1 pol区基因序列,根据pol区基因序列进行病毒亚型和传播性耐药分析,基于最适基因距离（d=1.5%）构建分子网络,分析分子传播网络特征及其影响因素。结果 共获得有效序列346份,包括CRF07＿BC亚型113例（32.66%）,CRF01＿AE亚型107例（30.92%）,CRF08＿BC亚型99例（28.61%）,CRF105＿0108亚型18例（5.20%）,其他亚型9例（2.60%）。HIV-1传播性耐药率为15.03%(52/346),4份样本检出双重耐药。以1.5%作为基因阈值构建分子传播网络,共形成34个分子簇,簇内病例数分别在2～25例,入网病例148例,入网率为42.77%。不同年龄、文化程度、感染途径、基因亚型和户籍入网差异有统计学意义（P<0.05...     

浙江省2009年随访HIV/AIDS的分子流行病学研究

目的分析2009年浙江省随访艾滋病病毒感染者戊滋病患者(HIV/AIDS)分子流行病学特征。方法以浙江省各地市为单位随机抽样确定303例研究对象,收集个案信息、采集样本并提取基因组DNA,用巢式PCR扩增gdg基因片段,测序并进行生物信息学分析。结果序列成功获得率为74.3% (225/303 )。存在7种亚型,分别为CRFO1_AE (58.7% ), CRF07_BC(13.8%),CRF08_BC(9.8%),B''(15.1%>,C(l.8%>,G(o.4%)和未定义Bc重组(新型独特重组型,0.4% ) o HIV BLAST分析显示,毒株同源性最高的报告地涉及国内辽宁、广西、云南、河南等10个省(区)和泰国、越南、印度、南非和利比亚5个国家。CRFO1_AE系统进化树分为4簇,同性传播感染者序列聚集于簇1,但与异性传播感染者混合并存。结论浙江省HIV毒株的多样性和复杂性进一步增加。以流行重组型占显著优势,存在新型独特重组型和新型别,同性传播与异性传播感染者呈交叉渗透趋势。     

云南省德宏傣族景颇族自治州2015年新报告HIV感染者亚型分析

目的 分析云南省德宏傣族景颇族自治州（德宏州）2015年1-11月新报告HIV感染者亚型,掌握德宏州中国籍和缅甸籍HIV感染者亚型分布特征。方法 对德宏州2015年1-11月新报告的HIV感染者且血浆量在200 μl以上的标本进行核酸抽提,使用RT-PCR方法对HIV的gag、env和pol 3个基因进行反转录扩增,所得产物直接测序,确定亚型型别。结果 2015年1-11月德宏州新报告HIV感染者963例,成功测定HIV亚型的感染者499例。独特重组（URFs）比例最大（27.1%,135/499）;其后为C（26.7%,133/499）和CRF01_AE（19.2%,96/499）等亚型。URFs中主要包括4种形式的重组,其中以BC亚型重组最多。中国籍和缅甸籍感染者的亚型分布特征不同,传播方式是唯一与中国籍和缅甸籍感染者亚型分布有关联的因素。结论 德宏州中国籍和缅甸籍HIV感染者亚型分布复杂,URFs首次居分布首位。中国籍和缅甸籍感染者亚型分布有差异,但主要受HIV传播方式的影响。     

浙江省嘉兴市2017年较大HIV分子传播簇病例流行病学特征分析

目的 分析2017年浙江省嘉兴市新发现的较大HIV分子传播簇和流行病学特征,筛选疑似高危传播者,为传染源管理及干预提供参考依据。方法 对2017年嘉兴市较大HIV分子传播簇所有HIV/AIDS病例采集血样,通过核酸提取、RT-PCR和巢式PCR法扩增pol基因,构建HIV分子传播网络,包括采用Sequencher 5.0软件拼接整理测序结果、BioEdit 7.2.0软件进行序列比对、Mega 6.0软件构建Neighbor-joining系统进化树、Cytoscape 3.6.0软件构建HIV分子传播网络图,形成若干个分子传播簇。对研究对象进行流行病学个案调查。采用EpiData 3.0和SPSS 20.0软件进行统计学分析。结果 2017年1-12月嘉兴市新报告HIV/AIDS病例210例,较大HIV分子传播簇为CRF07_BC亚型,传播簇共30例病例,个案调查26例,80.8%（21/26）为最近2年感染,30.8%（8/26）为最近1年感染。84.6%（22/26）为本市感染。5例疑似高危传播者均为同性性传播感染且≥ 45岁,其中3例有危险性行为时间较久、确诊前临时性伴数较多、MSM活动场所有危险性行为等高危行为特征。结论 2017年浙江省嘉兴市新发现的较大HIV分子传播簇最近2年在本市传播较快,传播和扩散风险较高。3例疑似高危传播者对该HIV分子传播簇的形成起到重要作用。     

基于分子网络方法研究HIV感染者传播特征的相关进展

HIV分子网络是近期被广泛报道的一种研究HIV感染者传播特征的方法,各国利用此方法在传播关系、传播热点、疫情监控等方面进行了大量的研究,有望为实现精确干预和防控提供依据。目前国际上主要报道有3种构建分子网络的方法：基于两两比对基因距离法、基于系统进化树节点校验值法、基于两者联合参数法。本文综述3种构建HIV分子网络方法研究HIV感染者传播特征的相关进展,以期为应用于指导防控HIV提供数据支撑。自分子网络方法出现以来,我国北京市、上海市、浙江省、四川省等陆续报道了应用分子网络方法分析的相关研究结果,为进一步开展精准防控提供了科学数据。近期国际上相关研究也预测基于分子网络的传播簇检测有望成为终结艾滋病流行的一种新方法。     

浙江省男男性行为人群HIV-1新近感染者的毒株亚型和传播簇研究

目的 了解浙江省MSM中的HIV-1新近感染者的毒株亚型组成和传播特征.方法 233例2011年新报告的MSM感染者经BED捕获酶免试验(BED-CEIA)检测为新近感染,其中107例纳入分子流行病学研究,收集血浆样本提取RNA核酸,用反转录/巢式PCR扩增HIV病毒的pol基因片段,测序后进行生物信息学分析.结果 107例研究对象与当年MSM新近感染者在社会人口学特征上差异无统计学意义.序列获得率为94.4％(101/107),CRF01 AE占比最高(62.4％),其次是CRF07 BC(31.7％),另有3例B亚型,1例CRF55_01B和2例独特重组型.毒株在系统进化树上主要分为CRF01 AE的簇1、簇2和CRF07_BC的簇3,杭州地区的毒株散播于各个进化分支.共发现10个传播簇,80％涉及≥2个的地市,90％与现住址为杭州的病例有关; 共发现有3个样本各存在一个监测性耐药突变,分别为M46I、T215S和G190A,传播性耐药率为2.97％.结论 浙江省MSM的HIV亚型呈现复杂性趋势,但传播性耐药处于低度流行水平;HIV的跨地区传播较为普遍,杭州在地域上可能发挥着核心传播作用,全省已形成混杂交织的复杂网络.     

辽宁省艾滋病病毒1流行株膜蛋白V3环氨基酸变异特点

目的　了解辽宁省艾滋病病毒 1(HIV 1)感染者 艾滋病 (AIDS)患者体内不同亚型HIV 1膜蛋白V3环氨基酸序列特征 ,突变种类特点。方法　提取含有整合HIV 1前病毒的基因组DNA ,巢式聚合酶链反应 (nest PCR)扩增后直接测序 ,并做序列排列比对、翻译和分析。结果　辽宁省HIV 1感染者感染病毒分属A、B’、C、G四种亚型 ,AIDS患者体内病毒V3环发生与T嗜性 SI表型有关的氨基酸突变形式 (11位出现R ,13位出现S、T、N ,19位出现V ,2 0位出现Y ,2 5、2 9位出现N等 )高于无症状感染组 (P <0 .0 5 ) ,此外还发现GQGR、APGQ、RPGA、GLGR、RPGA等少见的V3环顶端四肽组成形式及第 5位H ,34位S、F等罕见突变形式。结论　辽宁省AIDS人群中 ,A、B、C、G亚型HIV 1毒株V3环各位置出现氨基酸突变情况与国外对B亚型毒株的研究结果总体上相似 ,但发现一些罕见突变和少见V3环顶端四肽组成形式。     

广西壮族自治区低档场所中老年嫖客与暗娼HIV-1感染者基因亚型研究

目的 了解广西壮族自治区低档场所中老年嫖客与暗娼的HIV-1感染者病毒基因亚型特征及传播规律。方法 采用方便抽样的方法,于2012年对广西壮族自治区4个城市和9个县（区）低档场所的嫖客（年龄≥50岁）与暗娼开展分子流行病学调查,进行HIV-1抗体筛查,对HIV-1抗体阳性者血浆进行pol区基因片段扩增和序列测定,对获得的基因序列进行系统进化树构建并鉴定毒株的基因亚型,分析毒株亚型分布特征及传播规律。结果 共招募4 048例中老年嫖客和784例低档暗娼,共发现116例HIV-1抗体阳性,中老年嫖客与暗娼的HIV-1抗体阳性检出率分别为2.5%（103/4 048）、1.7%（13/784）,对其中84例HIV-1抗体阳性者进行基因扩增和序列测定,53例获得基因序列（中老年嫖客48例、暗娼5例）。发现3种基因亚型,均为重组株,CRF01_AE占90.6%（48/53）,CRF08_BC占7.5%（4/53）,CRF07_BC占1.9%（1/53）。经系统进化树分析发现,48例CRF01_AE流行毒株聚集成2个传播簇Cluster 1和2;4例CRF08_BC聚集成1个传播簇。在CRF01_AE Cluster 1中又形成4个亚簇C1-SC1、2、3、4,各亚簇对象来源于同一处或相邻低档场所、或与同一省道毗邻乡镇的低档场所。结论 广西壮族自治区低档场所中老年嫖客与暗娼HIV-1感染者流行毒株仍以CRF01_AE为主,以同一处或相邻低档场所或毗邻乡镇呈小范围聚集,当地HIV-1阳性的中老年嫖客与暗娼可能是该人群易感者毒株快速传播的重要传染源。     

河南省1157份人免疫缺陷病毒1型毒株亚型分析

目的 了解河南省人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株的亚型状况及序列变异、流行特征,分析其传染来源及传播规律,为河南省艾滋病防治策略提供依据.方法 对2005-2006年在河南全省收集的1157例HIV-1感染者抽取静脉血,分离单个核细胞(PBMC),用套式聚合酶链反应(nest-PCR)对单个核细胞中前病毒脱氧核糖核酸(DNA)的膜蛋白(env)基因进行扩增,并对其C2V3区核苷酸序列进行了测定和分析.结果 1157份样本中存在B'、C亚型及BC、AE 2个重组亚型.其在所有分析样本中的比例分别为96.456%(1116/1157)、0.346%(4/1157)、2.593%(30/1157)、0.605%(7/1157).与国内及国际的参考毒株RL42、C.95in21068、07-BC.CN.97.C54A、01AE.TH.90.CM240间的离散率分别为(8.971±3.182)%、(5.109±0.112)%、(3.568 4±0.254)%、(4.775±0.128)%.B'亚型以既往有偿献血人员为主,BC亚型以性传播为主,AE亚型以性传播及既往献血途径为主,C亚型以性传播为主.结论 目前河南省艾滋病感染者中有B'、C亚型及BC、AE两个重组亚型.泰国B'亚型依然占主导地位.在局部地区,非B'亚型有聚集的现象,应引起当地卫生机构的注意,加大对流动人员的检测.     

河南省人免疫缺陷病毒1型流行现状研究

目的 了解河南省人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株的亚型状况及序列变异、流行特征,分析其传播来源和传播规律.方法 对2006-2007年在河南省采集的1287例HIV-1感染者抽取静脉血,用巢式聚合酶链反应(nest-PCR)对单个核细胞中前病毒脱氧核糖核酸的env基因和gag基因进行扩增,并测定和分析核苷酸序列.结果 1287份样本中存在B'、C亚型及BC、AE两个重组亚型,其在所有分析样本中的比例分别为95.882%(1234/1287)、0.466%(6/1287)、2.875%(37/1287)、0.777%(10/1287).与国内及国际的参考毒株RL42、C.95in21068、07-BC.CN.97.C54A、01AE.TH.90.CM240间的离散率分别为(9.327±0.245)%、(5.214±0.183)%、(6.278±0.194)%、(5.332±0.1 58)%.结论 目前河南省艾滋病感染者中有B'、C亚型及BC、AE两个重组亚型.泰国B'亚型依然占主导地位.B'亚型以既往有偿献血人员为主,BC亚型以性传播为主,AE亚型以性传播及既往献血途径为主,C亚型以性传播为主.