云南省德宏傣族景颇族自治州2015年新报告HIV感染者亚型分析

目的 分析云南省德宏傣族景颇族自治州（德宏州）2015年1-11月新报告HIV感染者亚型,掌握德宏州中国籍和缅甸籍HIV感染者亚型分布特征。方法 对德宏州2015年1-11月新报告的HIV感染者且血浆量在200 μl以上的标本进行核酸抽提,使用RT-PCR方法对HIV的gag、env和pol 3个基因进行反转录扩增,所得产物直接测序,确定亚型型别。结果 2015年1-11月德宏州新报告HIV感染者963例,成功测定HIV亚型的感染者499例。独特重组（URFs）比例最大（27.1%,135/499）;其后为C（26.7%,133/499）和CRF01_AE（19.2%,96/499）等亚型。URFs中主要包括4种形式的重组,其中以BC亚型重组最多。中国籍和缅甸籍感染者的亚型分布特征不同,传播方式是唯一与中国籍和缅甸籍感染者亚型分布有关联的因素。结论 德宏州中国籍和缅甸籍HIV感染者亚型分布复杂,URFs首次居分布首位。中国籍和缅甸籍感染者亚型分布有差异,但主要受HIV传播方式的影响。     

云南省2个边境地区新报告艾滋病病毒感染者HIV-1基因亚型分析

目的 了解云南省2个边境地区新报告HIV感染者HIV-1基因亚型分布特征。方法 2015年11月至2016年10月在云南省德宏傣族景颇族自治州（德宏州）和红河哈尼族彝族自治州（红河州）边境地区,连续纳入年龄≥ 18岁新报告HIV感染者共233例,提取病毒RNA,扩增pol和env基因区,进行基因分型检测和序列分析。结果 233份标本共有146份获得HIV-1基因亚型。德宏州有8种HIV-1基因亚型,以独特重组型（URFs）为主（52.8%,57/108）,其中中国籍的URFs占56.8%（21/37）,缅甸籍的占50.7%（36/71）;红河州有4种HIV-1基因亚型,以CRF01_AE为主（71.1%,27/38）,其中越南籍的占81.0%（17/21）,中国籍的占58.8%（10/17）。2个州HIV-1基因亚型总体分布的差异有统计学意义（χ²=61.072,P<0.001）。结论 云南省2个边境地区新报告HIV感染者HIV-1基因亚型分布差异较大,应对中国籍和外国籍HIV感染者采取有针对性的防治措施。     

广州市2008-2015年男男性行为人群HIV-1亚型分布特征及变化趋势

目的 了解2008－2015年广州市MSM人群HIV-1感染者（MSM感染者）HIV-1亚型分布特征及变化趋势。方法 研究对象为2008－2015年确证的HIV-1感染者、男男性行为途径感染、现住址为广州市。收集血清样本提取HIV-1 RNA,采用巢式 PCR法扩增HIV-1 pol区基因片段,测序后构建系统进化树,确定HIV-1亚型,比较不同年份和不同特征样本的HIV-1亚型分布。结果 从2 473份血清样本中成功获得2 210份样本的pol区基因片段。2 210份样本人群的年龄（30.19±8.22）岁;未婚者占73.39%;汉族占90.81%。独特重组形式（URFs）亚型在职业为农民及农民工的构成比高于其他职业者（P＝0.017,99%CI：0.014～0.020）,URFs亚型在多性伴者的构成比高于非多性伴者（ χ²＝5.733,P＝0.017）。HIV-1亚型分布以CRF07_BC（38.10%）和CRF01_AE（34.84%）为主,其次为CRF55_01B（14.62%）、B（6.06%）、URFs（3.58%）、CRF59_01B（2.17%）和其他亚型（0.63%）。B、CRF07_BC、CRF55_01B和URFs亚型在2008－2015年的各年份构成比的差异有统计学意义（B：P＝0.000,99%CI：0.000～0.000;CRF07_BC：χ²＝14.965,P＝0.036;CRF55_01B：χ²＝18.161,P＝0.011;URFs：P＝0.001,99%CI：0.000～0.001）,其中B亚型的构成比呈逐年下降趋势（P＝0.000,99%CI：0.000～0.000）,URFs亚型的构成比呈逐年上升趋势（P＝0.000,99%CI：0.000～0.000）。结论 2008－2015年广州市MSM感染者HIV-1亚型分布表现为CRF07_BC和CRF01_AE为主、多个亚型共存的特点。URFs亚型的构成比呈上升趋势提示HIV-1在MSM感染者中在不断发生重组。应针对MSM感染者农民及农民工、多性伴者加强干预。     

云南省德宏傣族景颇族自治州2012-2016年新报告HIV感染者流行病学特征分析

目的 了解2012-2016年云南省德宏傣族景颇族自治州（德宏州）新报告中国籍和缅甸籍HIV感染者病例流行病学特征,为德宏州有针对性开展艾滋病防控工作提供科学依据。方法 以2012-2016年德宏州所有新报告HIV感染者为研究对象,应用SPSS 22.0软件分析其流行病学特征。结果 2012-2016年,德宏州共新报告HIV感染者5 692例（纳入研究对象5 592例）。中国籍和缅甸籍新报告HIV感染者所占构成比分别为43.3%（2 419例）和56.7%（3 173例）。中国籍和缅甸籍新报告HIV感染者在年份、年龄、性别等社会人口学特征的构成上的差异均具有统计学意义（P<0.05）。两类感染者均以20~49岁、男性、小学及以下文化程度、已婚有配偶、农民、CD₄⁺T淋巴细胞计数≥ 350个/μl等特征为主。中国籍感染者的感染途径以性传播为主,缅甸籍感染者的感染途径以注射吸毒传播为主。结论 2012-2016年德宏州的中国籍和缅甸籍新报告HIV感染者在流行病学特征上存在差异,需要采取不同的防控措施。     

云南省德宏州2014年HIV-1耐药传播警戒线调查

目的 调查2014年云南省德宏州未经抗病毒治疗的HIV感染者的耐药株传播水平。方法 2014年1-8月在德宏州收集70份新报告的16~25岁HIV-1感染者的血浆样品,对符合耐药警戒线调查要求的58份样品进行HIV-1基因型耐药检测和耐药株传播水平分析。结果 50份样品完成了基因型及耐药鉴定,中国籍占34.0%,缅甸籍占66.0%。通过进化分析对pol区进行分型,主要的基因型包括CRF01_AE、C亚型、URFs、CRF62_BC、CRF08_BC、CRF07_BC、CRF64_BC、B亚型和CRF55_01B,分别占28.0%、20.0%、20.0%、10.0%、8.0%、4.0%、4.0%、4.0%和2.0%。在1个序列中检测到1个针对蛋白酶抑制剂类药物的耐药突变位点(M46I),按照耐药警戒线的统计方法估算耐药株流行率<5%。结论 德宏州16~25岁新报告的HIV-1感染人群中外籍比例较高,HIV新型重组开始传播,但HIV-1耐药性传播尚处于低度水平。     

浙江省2015年HIV分子亚型特征及其传播关系研究

目的 了解浙江省现阶段HIV毒株亚型流行分布特征和分子网络传播关系。方法 采用分层随机抽样方法抽取浙江省2015年4-6月新发现HIV感染者302例进行横断面调查,运用RT-PCR和巢式PCR扩增pol基因成功获得276份序列,结合流行病学调查数据开展测序及系统进化树分析。结果 276例HIV感染者毒株亚型构成：CRF07_BC 122例（44.2%）,CRF01_AE 103例（37.3%）,CRF08_BC 17例（6.1%）,B亚型9例（3.2%）,CRF55_01B 6例（2.2%）,C亚型5例（1.8%）,CRF59_01B 1例（0.4%）,CRF67_01B 1例（0.4%）,A1亚型1例（0.4%）,URFs 11例（4.0%）。CRF07_BC、CRF01_AE毒株亚型在进化树上已形成明显的分簇现象,传播簇主要集中分布在MSM人群（76.5%）。MSM人群的成簇比例高于其他人群,且不同传播途径感染人群存在传播联系。结论 2015年浙江省HIV主要流行毒株以CRF07_BC、CRF01_AE为主,亚型构成有复杂化趋势,应加强对HIV毒株亚型和流行簇的监控和预警,开展分类管理,针对高风险人群和传播链开展有效防控。     

天津市2015年HIV流行和传播的分子流行病学特征分析

目的 了解2015年天津市HIV流行株的亚型分布和传播特点。方法 从77例新报告未治疗且CD₄⁺T淋巴细胞计数≥200个/μl的HIV-1感染者,提取血浆中RNA,应用反转录和巢式PCR扩增HIV的pol和env区,并测序进行相关分子生物学分析。结果 共获得63例样本的HIV毒株序列结果,亚型依次为CRF01_AE、CRF07_BC、B、CRF55_01B和其他独特型二代重组毒株,分别占46.03%（29/63）、30.16%（19/63）、11.11%（7/63）、4.76%（3/63）和7.94%（5/63）;感染者以性传播为主,其中又以CRF01_AE和CRF07_BC重组亚型为主,除异性传播无B和CRF55_01B亚型外,同性和异性传播者的亚型分布无明显差别。重组毒株的构成比为88.89%（56/63）,并首次发现的二代重组亚型8例,包括3例CRF55_01B、2例AE/BC、1例AE/B和1例新型的AE/B/C重组均为男男同性传播;1例AE/BC重组为异性传播。HIV感染者中传播耐药率为5.3%,均为NNRTI类监测性耐药突变L100I;进化分析中3对pol区Bootstrap值均≥98%,env区Bootstrap值均≥80%,调查显示3对样本来源确认有性伴传播关系。结论 天津市HIV感染者中重组毒株不断增加并广泛流行,性传播者中HIV新型二代重组和耐药毒株不断产生并在不同人群和不同地区间传播,应引起高度重视。     

柳州市1998－2012年新发现HIV基因亚型变化及HIV感染者首次CD4+T淋巴细胞计数比较

目的 分析柳州市1998－2012年新发现HIV基因亚型变化,比较HIV感染者首次CD₄⁺T淋巴细胞计数（CD₄）,为艾滋病防治提供参考依据。方法 选取我国艾滋病综合防治信息系统中1998－2012年柳州市新发现HIV感染者,对其血浆进行RNA提取、扩增、测序和分型。采用Coharan-Armitage趋势检验法分析HIV基因亚型变化的趋势,采用Wilcoxon秩和检验法分析比较HIV感染者的首次CD₄。结果 研究对象共有1 877例HIV感染者。1998－2012年,CRF01_AE、CRF01_AE（Cluster 1）和CRF07_BC亚型构成比分别从78.4%（76/97）上升至91.5%（1 441/1 574）、63.9%（62/97）上升至74.0%（1 164/1 574）和17.5%（17/97）下降至4.6%（72/1 574）,趋势性检验差异均有统计学意义（Z=4.632,P<0.001;Z=2.455,P=0.014;Z=-5.943,P<0.001）。CRF01_AE（Cluster 1）、CRF01_AE（Cluster 2）、CRF07_BC和CRF08_BC亚型HIV感染者首次CD₄的中位数及四分位数间距分别是230（83～375）、215（48～351）、365（254～503）和334（206～479）个/μl。CRF01_AE（Cluster 1）和CRF01_AE（Cluster 2）亚型HIV感染者的首次CD₄均Z=-4.795,P<0.001;Z=-4.238,P<0.001）。结论 1998－2012年柳州市新发现HIV感染者以CRF01_AE亚型为主并呈上升趋势,其首次CD₄较低,且新发现CRF01_AE亚簇的种类在增加,其亚簇构成比存在变化趋势。     

台州市2016-2018年新报告HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药及亚型流行特征分析

目的 了解台州市新报告HIV/AIDS抗病毒治疗（ART）前HIV-1耐药情况及亚型流行特点。方法 于2016年1月至2018年12月在台州市开展新报告HIV/AIDS在ART前HIV-1耐药的横断面调查,RT-PCR扩增获得HIV-1 pol基因片段并测序,提交序列至斯坦福大学耐药数据库,根据2014年WHO耐药监测指南的推荐标准,确定耐药突变位点以及HIV-1毒株对抗病毒药物的敏感性。结果 2016-2018年台州市新报告HIV/AIDS中成功获得HIV-1 pol基因区序列的研究对象806例,ART前HIV-1耐药率为2.9%（23/806）,其中,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）、核苷类反转录酶抑制剂（NRTIs）和蛋白酶抑制剂（PIs）耐药率分别为1.9%（15/806）、0.6%（5/806）和0.0%。2016-2018年新报告HIV/AIDS在ART前HIV-1耐药率依次分别为1.6%、1.8%和4.8%。NNRTIs和NRTIs耐药突变位点以K103 N（0.7%）和M184I/V（0.5%）为主。HIV-1亚型以CRF01_AE（42.7%,344/806）、CRF07_BC（28.9%,233/806）和CRF08_BC（11.2%,90/806）为主。同性性传播者HIV-1亚型以CRF01_AE（53.3%,136/255）和CRF07_BC（32.2%,82/255）为主;异性性传播者HIV-1亚型以CRF01_AE（37.7%,203/539）、CRF07_BC（27.5%,148/539）和CRF08_BC（16.1%,87/539）为主。结论 2016-2018年台州市新报告HIV/AIDS在ART前HIV-1耐药率处于低流行状态,但存在上升趋势,需加强对HIV-1耐药型毒株的监测工作。     

德宏傣族景颇族自治州2017年HIV-1感染者抗病毒治疗前耐药和病毒基因亚型研究

目的 了解德宏傣族景颇族自治州（德宏州）抗病毒治疗（ART）前的HIV-1感染者基因型和耐药株的流行水平。方法 2017年1-6月在德宏州收集初始ART的HIV-1感染者170例,扩增pol基因,进行HIV-1基因分型和基因型耐药分析。结果 147份样品获得了pol基因,通过进化分析,发现12种HIV-1基因型,居于前3位包括C亚型（29.9%,44/147）、独特型重组形式（URFs）（27.2%,40/147）和CRF01_AE（19.7%,29/147）,还检测到了近年该地区新鉴定出的流行重组形式（CRFs）,包括CRF62_BC、CRF64_BC、CRF86_BC和CRF96_cpx。基因型在异性性传播和注射吸毒传播人群中的分布差异有统计学意义。发现耐药突变的比例为8.8%（13/147）。注射吸毒的HIV-1感染者中耐药株的比例（25.0%,8/32）,高于异性性传播的HIV-1感染者（4.6%,5/109）（χ²=10.166,P=0.002）。结论 2017年德宏州初始ART的HIV-1感染者中病毒基因型高度复杂,HIV-1耐药株的流行达中度水平。     

Phylodynamics of HIV-1 unique recombinant forms in China–Myanmar border: Implication for HIV-1 transmission to Myanmar from Dehong,China

China–Myanmar border plays a crucial role in HIV-1 transmission in Asia. Here, we performed Bayesian phylodynamics analyses on p17 gene using BEAST to investigate HIV-1 transmission in this region. Maximum clade credibility trees of subtype C and CRF01_AE show that majority of unique recombinant forms (URFs) and pure subtype strains from Dehong and Myanmar cluster together, forming large clades with ancestral geographical states of Dehong. Bayes factor tests support the statistically significant geographic diffusion link between Dehong and Myanmar. The estimated time to the most recent common ancestor of Myanmar URFs_BC (1999.2) was later than that of Dehong URFs_BC (1998.0), but earlier than that of Myanmar URFs_01BC (2004.3). Since 1998, HIV-1 recombination between subtypes B, C and CRF01_AE has been continuously occurring in China–Myanmar border region. These results suggest that HIV-1 subtypes B, C and CRF01_AE were most likely transmitted from Dehong to Myanmar, and predict that URFs_01BC should be also prevalent in Dehong, Yunnan.     

浙江省义乌市2016年新报告HIV/AIDS的HIV-1亚型和传播簇分析

目的 了解浙江省义乌市HIV亚型分布和传播簇特征，为HIV流行趋势分析和疫情防治提供依据。方法 对该地区2016年新报告HIV/AIDS开展分子流行病学横断面研究，从168例血浆中提取RNA，通过RT-PCR和巢式PCR扩增pol基因并测序。构建系统进化树分析亚型和传播簇，通过CPR 6.0在线软件工具分析耐药突变位点。结果 研究对象年龄（39.1±13.4）岁，男性为主（86.3%，145/168），外省户籍居多（66.7%，112/168），感染途径为同性传播（51.2%，86/168）和异性传播（48.8%，82/168）。HIV序列成功获得率为89.9%（151/168），优势亚型为CRF01_AE 74例（49.0%）和CRF07_BC 64例（42.4%），其他亚型包括CRF08_BC 5例（3.3%），CRF55_01B 3例（2.0%），B、CRF45_cpx、CRF59_01B、CRF85_BC和URF （B/C）各1例。CRF45_cpx和CRF85_BC在浙江省首次发现。共发现26个传播簇（含65个病例），总成簇比例43.0%（65/151），CRF01_AE成簇比例54.1%（40/74），高于CRF07_BC的32.8%（21/64）；各传播簇平均大小为2.5例/簇，CRF01_AE中异性传播的传播簇最大（3.5例/簇）。传播性耐药率为4.6%（7/151），7例检出监测性耐药突变，包括M46L 5例，F77L和Y181C各1例。结论 义乌市HIV亚型复杂多样，多种传播簇并存且特征多样，应继续加强亚型监测，重点对传播簇病例开展专题调查，实施针对性有效干预。     

我国HIV亚型与耐药性Meta分析

目的 系统评价我国HIV感染者不同亚型与耐药的关系。方法 计算机检索维普中文科技期刊全文数据库（VIP）、万方数据库（Wangfang Data）、中国期刊全文数据库（CNKI）、PubMed、Web of Science等数据库中2005-2015年与HIV亚型耐药相关研究,同时手工检索相关资料。严格按照纳入标准和排除标准对所获文献进行筛选、提取资料和质量评价,然后用Stata 12.0软件进行Meta分析。结果 最终纳入文献43篇,整体耐药率为15.1%,原发耐药率为9.5%,与耐药相关的亚型主要有CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、B/B''和C亚型,在整个人群中,各亚型合并耐药率分别为12.8%、7.4%、14.3%、25.7%、34.9%;各亚型原发耐药率分别为7.3%、5.7%、11.5%、15.5%和23.9%。亚组分析结果显示,处理和区域亚组组内差异有统计学意义（P<0.05）;各亚型原发耐药率在区域上呈现华北、西南地区高于中南地区。结论 我国不同的HIV亚型地区分布较为广泛,各亚型原发性耐药率较高,呈现较大差异,需要加强对我国不同亚型耐药毒株监测,以防止耐药毒株间的重组与传播。     

北京男男性行为人群HIV-1序列和流行趋势分析

目的 分析北京MSM人群HIV序列特征,预测北京该人群中HIV流行趋势。方法 汇总本实验室获得的北京MSM人群HIV序列,下载Los Alamos HIV Database中我国MSM人群及其他人群中流行的HIV序列,利用PhyML 3.0、BEAST等软件重建北京MSM人群系统发育树、估算突变速率、推断tMRCA、重建群体流行动态参数、计算再生指数R₀值,分析北京MSM人群与其他人群HIV流行的相关关系,推断进化和流行特征。结果 北京MSM人群中流行的HIV-1亚型包括B、CRF01_AE和CRF07_BC。在全国HIV毒株ML进化树中,北京MSM簇(北京MSM人群所占比例≥40%)共有3簇,即B-1簇、CRF01_AE-1簇、CRF01_AE-2簇。B1簇毒株是由至少3次传入事件进入北京MSM人群的,传入时间分别为1991年3月(1984年7月至1997年2月)、1994年1月(1989年1月至1998年1月)、1991年4月(1984年8月至1996年8月)。CRF01_AE毒株由2次传入事件进入北京MSM人群,传入时间分别为2000年12月(1998年3月至2003年1月)和2001年12月(2000年1月至2003年7月)。流行特征重塑分析显示,CRF01_AE-1簇近年来增长速度较快、突变速率较高。结论 北京MSM人群中存在多种HIV亚型毒株流行,其中B亚型毒株传入时间最早,但增长趋势趋于平稳;CRF01_AE毒株传入时间较晚、但增长迅速,对HIV在北京地区的流行具有明显的推动作用,因此对CRF01_AE毒株的防控有助于减少该地区HIV的流行。     

2000—2012年中国HIV基因亚型时空分布的系统综述

目的了解2000年以来我国艾滋病病毒（human immunodeficiency virus,HIV）基因亚型的时间和空间分布特征。方法计算机检索中国知网期刊全文数据库和PubMed数据库,按纳入和排除标准选取文献,提取资料,描述分析HIV亚型在不同时间、不同地区和不同传播途径感染人群中的分布。结果纳入78篇文献,涵盖我国20个省、直辖市和特区。研究结果显示：我国目前存在A、B、B’、C、D、E、G、K、CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、CRF02_AG、CRF03_AB、CRF12_BF、CRF14_BG、CRF02_AG／CRF01_AE、CRF08_BC／B、CRF07_BC／CRF01_AE、G／CRF12_BF、A／CRFIO_CD、CRF01_AE／B’、U／CRF01_AE、B／C、U／G等多种亚型,其中CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、B’、B为主要流行亚型;HIV的基因亚型与传播途径相关,近年来,我国流行的重组毒株增多且出现多种独特重组型。结论过去10年,随着HIV流行形势的变化,我国HIV基因亚型分布特征发生变化并日趋多样化,必须予以高度重视。