HIV-1分子传播网络的特点及应用

HIV-1分子传播网络是一种通过比对HIV感染者之间遗传信息的相似性构建网络连接结构的新兴方法,主要用于了解HIV流行特征和指导高效率的干预与防控工作。文章通过综述HIV-1分子传播网络的基本原理、构建方法、分析方法以及应用,旨在为更高效、有针对性地防治HIV提供科学依据。     

HIV感染者的高危行为接触者追踪研究进展

对HIV感染者开展高危行为接触者追踪,能够促进HIV感染者的诊断发现,及时采取诊疗和干预措施,有助于减少二代传播,对控制艾滋病流行具有重要意义。随着HIV基因序列检测和分析技术的发展,将HIV分子传播网络应用于传统流行病学调查的高危行为接触者追踪,有助于准确揭示HIV传播模式、阐明HIV传播特征和识别高传播风险人群,为精准防控提供科学依据。本文对HIV感染者的高危行为接触者追踪研究进行综述,为开展相关工作提供科学参考。     

蚌埠市2021—2022年新报告HIV感染者耐药及分子传播网络研究

目的 分析安徽省蚌埠市2021—2022年新报告HIV感染者基因亚型、治疗前耐药特征和HIV分子传播网络情况,为当地制定干预措施提供依据。方法 收集蚌埠市2021—2022年新报告HIV感染者样本90份,扩增pol基因并测序,借助Blast HIV sequence database对每条序列进行同源性分析,采用MEGA 7.0构建NJ系统进化树判定所有HIV感染者基因亚型。将所得序列上传至美国斯坦福大学HIV耐药数据库,分析基因型耐药情况。利用Cytoscape实现传播网络的可视化,分析新报告HIV感染者耐药传播特点和网络关联情况。结果 蚌埠市85例新报告HIV感染者基因亚型主要为CRF01＿AE(58.82%)和CRF07＿BC(23.53%),耐药率为10.59%(9/85),主要为非核苷类药物耐药(5/85,5.88%)。在0.5%基因距离阈值下的分子传播网络中,CRF01＿AE入网率为44%,存在1个较大的耐药传播簇,耐药位点为L33F;CRF07＿BC入网率为10%。分子传播网络中的HIV感染者主要为五河县50岁及以上男性,文化程度较低。结论 蚌埠市新报告HIV感染者耐药率...     

HIV传播网络分析方法及测量指标研究进展

HIV传播网络分析在艾滋病精准防控工作中发挥重要作用。目前研究方向主要基于社会网络和分子网络方法推断HIV传播网络,采用个体水平和网络水平的测量指标解释其结构特征。本文对HIV传播网络分析方法和测量指标的原理、优缺点和应用进行综述,为后续的深入研究提供参考依据。     

通过HIV溯源和分子网络分析推动艾滋病精准发现与防控

当前我国新发现HIV感染者经性传播模式较为复杂。开展HIV溯源和分子网络分析,尽可能早期发现传染源并开展精准防控,对遏制艾滋病传播具有重大意义。本期重点号结合目前HIV溯源、分子网络分析、精准发现与精准防控进展,重点报告2017-2020年宁波市HIV/AIDS流行病学特征,通过HIV溯源调查分析HIV/AIDS与其性伴的HIV传播关系,将社会网络和分子网络相结合分析HIV传播模式,为我国艾滋病精准发现和精准防控的应用型研究提供科学依据,推动我国艾滋病的科学防控。     

HIV传播簇的风险测量及公共卫生应对研究进展

开展HIV传播簇探测, 及时、精准实施公共卫生应对和干预, 是结束艾滋病流行的重要途径和方法。传播簇风险测量指标可分为基于传播簇既往增长的指标、基于传播簇成员特征分析的指标以及基于传播簇系统进化分析的指标三类。依据传播簇风险测量指标识别风险传播簇, 将卫生服务拓展至与传播簇关联的尚未感染HIV者、既往确诊和尚未确诊的HIV感染者, 可实现精准干预。本文对现有的HIV分子传播簇风险测量指标及其公共卫生应对措施进行综述, 为我国艾滋病精准防控提供参考。     

浙江省一起非婚非商业异性性传播HIV聚集性疫情调查

目的 明确浙江省一起非婚非商业异性性行为传播模式HIV感染者之间的传播关系。方法 对2020年1月至2022年1月浙江省浦江县新确证的疑似非婚非商业异性性传播HIV聚集性疫情相关HIV感染者及其性伴开展流行病学调查(流调),收集社会人口学特征、流动信息、HIV既往检测史、高危性行为史及性伴侣情况等信息。结合HIV分子传播网络监测进行传播关系分析,采集新确证HIV感染者在抗病毒治疗前的全血样本6~8 ml,分离出血浆。通过核酸提取、PCR扩增pol基因,通过Sequencher 5.0软件拼接整理测序结果,使用Cytoscape 3.6.0软件构建HIV分子传播网络进行分析。结果 2020年1月至2022年1月,浦江县共发现HIV感染者88例,其中异性性传播74例,有31例为非婚非商业性行为感染。初步个案调查发现,其中3例女性均与1例男性发生过无保护的非婚非商业异性性行为。4例感染者中,有2例的配偶HIV抗体检测阳性。对新确证感染者开展分子传播网络分析,共获得异性性传播序列65例,形成9个传播簇,最大传播簇中包含10例HIV感染者。HIV聚集性疫情共涉及HIV感染者11例,男性3例,女性8例;年龄均 ≥ 50岁,职业类型为农民或农村家庭妇女;追踪溯源到7例性伴,其中6例HIV阴性,1例未检测。18例调查对象的性社会网络关系中,夫妻关系6对,固定性伴关系8对,临时性伴关系3对。11例HIV感染者中,非婚非商业异性性传播9例,婚内传播2例。7例非婚非商业异性性伴与病例2(56岁男性农民)的流行病学关联,3例有流调和分子传播簇结果证实,3例有分子传播簇和流调结果证实,另有1例流调结果证实。结论 本起HIV聚集性疫情的传播模式是以病例2为核心,通过非婚非商业异性性行为传播HIV,继而引起婚内和固定性伴间的传播。流调与分子传播网络相结合的溯源调查支持本结论。     

四川省彭州市50岁及以上人群HIV-1分子传播网络特征分析

目的分析HIV-1感染者分子传播网络特征及其传播的相关危险因素, 为HIV-1精准预防提供依据。方法对2019年4月至2021年8月四川省彭州市新报告≥50岁HIV感染者的340份血样, 采用巢式PCR扩增法对pol基因区进行扩增、清理、拼接剪辑, 多序列对比构建系统进化树区分亚型, 计算成对基因距离, 在基因距离阈值为0.90%时成簇数最多(41个), 构建分子传播网络。分析HIV分子传播网络特征及入网危险因素, 进行χ2检验及logistic回归分析。采用SPSS 19.0软件进行统计学分析。结果 340份样本中, 扩增成功330份(97.06%, 330/340)。确定6种HIV-1亚型, 包括CRF01_AE(56.67%, 187/330)、CRF07_BC(27.88%, 92/330)、B(11.21%, 37/330)、CRF08_BC(3.33%, 11/330)、CRF55₀1B(0.61%, 2/330)和C(0.30%, 1/330)。入网率为58.79%(194/330), 研究...     

泸州市新报告HIV-1感染者基因亚型及分子传播特征研究

目的 分析四川省泸州市2021年新发现人类免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus, HIV）感染者传播情况,了解HIV-1传播网络的危险因素和特点,为本地区艾滋病疫情防控提供数据。方法 收集2021年363份泸州市新报告的HIV-1感染者血样及人口学信息。通过巢式PCR扩增HIV-1 pol区基因序列,根据pol区基因序列进行病毒亚型和传播性耐药分析,基于最适基因距离（d=1.5%）构建分子网络,分析分子传播网络特征及其影响因素。结果 共获得有效序列346份,包括CRF07＿BC亚型113例（32.66%）,CRF01＿AE亚型107例（30.92%）,CRF08＿BC亚型99例（28.61%）,CRF105＿0108亚型18例（5.20%）,其他亚型9例（2.60%）。HIV-1传播性耐药率为15.03%(52/346),4份样本检出双重耐药。以1.5%作为基因阈值构建分子传播网络,共形成34个分子簇,簇内病例数分别在2～25例,入网病例148例,入网率为42.77%。不同年龄、文化程度、感染途径、基因亚型和户籍入网差异有统计学意义（P<0.05...     

2010—2019年云南省德宏州新报告男男性行为HIV感染者病毒基因亚型分子传播网络分析

【目的】了解2010—2019年间德宏傣族景颇族自治州（德宏州）男男性行为人群（MSM）新报告人类免疫缺陷病毒（HIV）感染者的HIV主要亚型及其分子传播簇和流行病学特征,筛选疑似高危传播者,为传染源筛查、管理与干预提供参考依据。【方法】收集2010—2019年德宏州新报告男男性行为者HIV阳性血浆样本,扩增病毒pol基因区片段并进行基因测序和基因亚型确认,分析、计算两两序列间的基因距离,使用MEGA 7.0和Gephi进行系统进化分析、构建分子传播网络。【结果】2010—2019年德宏州新报告HIV感染者MSM159例,成功测定基因亚型的感染者100例。共有9种HIV-1亚型,最主要亚型为CRF01＿AE亚型52例（52%）,其次为CRF07＿BC亚型31例（31%）、CRF55＿01B亚型10例（10%）、其他7例（7%）。传播簇分析显示总入网率为67.0%,形成了3个传播簇,CRF01＿AE亚型形成了2个传播簇,分别包含38例、3例感染者,CRF07＿BC亚型形成了1个传播簇,包含26例感染者。CRF01＿AE形成的传播簇中传播关系更为复杂。2个主要的传播簇之间文化程度有显著差异...     

2011年柳城县艾滋病疫情分析

目的了解广西柳城县艾滋病感染趋势和流行特点,为进一步预防控制艾滋病流行提供科学依据。方法对2011年柳城县艾滋病疫情资料进行分析。结果 2011年柳城县共发现HIV/AIDS共274例,其中男性205例,女性69例,男女比例为2.97∶1;20～49岁占总病例数52.92%;农民占68.25%;传播途径以性接触传播为主,占91.60%,其次为经静脉注射吸毒占6.57%。结论 2011年柳城县艾滋病感染者以男性青壮年为主,性接触为主要传播途径。该县应根据流行特点,采取相应防治措施。     

自贡市静脉吸毒人群社会网络特点及其与HIV传播关系的研究

[目的]了解城市社区静脉吸毒人群（IDUs）人际网络特点,分析其与HIV传播的关系,以更好的在该人群中开展防制艾滋病工作。[方法]以“滚雪球”方式抽样;采取定性调查为主、定量研究为辅的资料收集方法。[结果]IDUs社会网络的特点：网络中存在“小圈子”并活动频繁;多数“小圈子”有“核心人物”且对圈子成员有重要影响;部分IDUs与家人、朋友保持往来获得经济及生活帮助;IDUs的AIDS高危行为不仅是共用针具,性活动同样值得注意。[结论]IDUs社会网络的特点必然影响HIV在该人群中的传播,并可能使HIV传播曲线呈“S”形。这对制定针对该人群的防制AIDS策略有参考意义。IDUs社会网络特点也要影响HIV从吸毒人群向非吸毒人群的传播;对这种传播途径存在的实际可能性不能低估,且应采取相应对策。     

沈阳市沈北新区2009-2013年艾滋病疫情流行病学分析

目的 了解沈阳市沈北新区艾滋病流行特征,为制定防制策略提供参考依据.方法 应用描述性流行病学方法对沈北新区艾滋病疫情流行情况进行分析.结果 2009-2013年沈北新区累计报告HIV/AIDS病例65例,报告病例数呈明显上升趋势,男女比例为12∶1,以20～50岁青壮年为主,占总病例数的90.77％;大专以上学历占40.00％;男男性传播为主要传播途径,占89.23％.结论 开展艾滋病综合监测以及加强对艾滋病防治知识宣传工作是我们今后工作的重点.     

内蒙古地区艾滋病感染态势和应对策略的分析

目的通过对内蒙古地区艾滋病感染情况的统计分析,为下一步制定科学的防控策略提供依据。方法对内蒙古地区历年艾滋病感染者的流行病学资料进行统计分析。结果内蒙古地区的艾滋病感染率整体处于低流行状态,但在某些特定人群处于高流行态势,感染者以注射毒品和异性传播为主,比例分别为26%和20%,从2006年以来,男女性接触的艾滋病感染者的比例明显上升。结论内蒙古地区艾滋病感染率呈逐年上升的趋势,必须有针对性的采取切实有效的措施加强防控。将全区的艾滋病感染率控制到最低水平。     

广州市艾滋病流行状况与控制策略分析

目的 分析广州市艾滋病流行和防治现状,探讨对策。方法 对１９８６~２０００年广州市艾滋病监测结果和防治情况进行分析。结果１９８６年广州市报告首例国外输入的ＨＩＶ感染者,１９９１年报告首例ＡＩＤＳ病人,至２０００年底累计报告ＨＩＶ感染者４０６例,在广州死亡２９例,其中ＡＩＤＳ病人６８例,在广州死亡２５例。流行经历了传入期(１９８６~１９８９年)、扩散期(１９９０~１９９４年)和快速增长期(１９９５~２０００年),分别发现ＨＩＶ感染者４例、２４例和３７８例。流行特征是ＨＩＶ感染者主要以男性(８６．９５%)、２０~４９岁中青年(９１．８７%)为主;传播途径主要以静脉吸毒为主,占５７．６４%,性传播途径占２３．１５%,尚未发现母婴传播。结论 广州市ＨＩＶ广泛流行,形势严峻。今后防治对策应加强领导,多部门合作,全社会参与,继续加强艾滋病监测和预防控制网络建设,加紧实施以宣传教育为主的艾滋病综合性预防策略。     

2002-2012年张家港市流动人口艾滋病流行特征分析

目的分析张家港市流动人口艾滋病流行特征,为国家科技重大专项江苏省传染病防治示范区艾滋病防控工作提供策略依据。方法收集2002--2012年间报告的流动人口人类免疫缺陷病毒感染者／艾滋病患者（HIV／AIDS）病例个案和疫情监测资料,进行描述流行病学分析。结果自2002年首次发现HIV感染者以来,至2012年底累计发现流动人口HIV／AIDS125例,其中AIDS12例。男女性别比为3．31,以20—40岁、初中及以下文化程度的民工和无业人员居多。以性传播途径为主,占75．20％;男男性途径感染占24．80％。在感染者的发现上,医疗卫生机构的常规筛查、主动开展HIV咨询和检测（PITC）和自愿咨询和检测（VCT）工作起到了重要作用。结论2002--2011年张家港市流动人口艾滋病疫情上升明显,2012年有所下降,性接触为主要传播途径,需进一步强化示范区各项防控工作,保持遏制艾滋病传播和流行的势头。     

厦门市艾滋病流行特征和趋势分析

[目的]探索厦门市HIV／AIDS的流行特征和趋势，为制定本地区艾滋病防治策略提供依据。[方法]对我市1990-2004年艾滋病血清学监测、国家哨点监测及各人群行为调查进行分析。[结果]15年共监测各类重点及高危人群266536人，累计报告HIV感染者56例，其中AIDS病人9例；性接触是主要传播途径(58．9％)；吸毒人群有56．1％为注射吸毒，其中共用注射器者占34．8％；工人、小业主有多性伴的比例分别为17．2％和22．5％；媒体调查同性性行为发生率5．0％，多性伴的发生率为27．0％。[结论]我市艾滋病流行已至快速增长期，扩散蔓延的因素不断增加，建议加大防控力度，遏制艾滋病疫情上升的势头。