广西壮族自治区2014年登革热暴发疫情流行病学特征和病原溯源

目的 了解2014年广西壮族自治区（广西）登革热暴发疫情流行病学特征和病原来源。方法 描述疫情时间、人群和地区分布特征,应用ELISA方法检测血清标本中的登革病毒（DENV）NS1抗原,用RT-PCR方法对NS1抗原阳性标本进行DENV血清分型、E基因序列扩增和测定,分析E基因序列一致性和进化关系。结果 2014年9-12月广西暴发DENV-1和DENV-2引起的本地登革热疫情,报告登革热病例854例（实验室诊断病例712例,临床诊断病例142例）,79.63%（680/854）病例集中在2014年9月22日至10月21日;所有病例均为典型登革热病例,无重症和死亡病例; 83.61%（714/854）病例年龄为15～59岁,46.60%（398/854）病例职业为干部和商业服务;疫情主要发生在南宁市和梧州市,E基因进化分析表明,中国南宁市本地病例分离株属DENV-1基因Ⅰ型,与新加坡分离毒株（SG EHI D1/529Y13）一致性为100.00%;梧州市本地病例分离株与广东省分离毒株（D14005）同源性最高,属DENV-2 Cosmopolitan基因型。结论 2014年广西登革热暴发疫情可能由输入性病例或媒介引起,中国南宁市本地暴发疫情病原为DENV-1,可能来源于新加坡;梧州市本地暴发疫情病原为DENV-2,可能从广东省输入。应加强输入性登革热病例监测和早期检测,做好蚊媒监测,提高疑似登革热病例诊断意识,以有效防控登革热疫情。     

云南中缅边境一起输入性登革热暴发的分子流行病学研究

目的调查云南中缅边境一起输入性登革热流行状况及其流行病毒株的分子流行病学特点。方法采集医院就诊和口岸入境人员中登革热、疑似登革热和不明原因发热患者血清标本并进行流行病学调查,采用ELISA检测登革病毒IgM抗体,RT-PCR检测登革病毒核酸,核酸阳性标本进行登革病毒PrM．C和NS,区的基因核苷酸序列测定和分析。结果2008年7—11月在云南省瑞丽市共采集急性期患者血清标本103份,经登革病毒IgM抗体和核酸检测,49例确诊为登革热。其中除1例为当地感染病例,其余48例均为输入性病例,其中18例来自缅甸木姐市居民,30例为中国居民到缅甸经商或务工返回后发病者。从缅甸输入病例血清中获得2株病毒(RLB61和RLC31)的PrM．C和NS,区基因核苷酸序列,同源性和系统进化分析表明,RLB61株为登革l型病毒,RLC31株为登革3型病毒,与东南亚登革病毒流行株具有较近的亲缘关系。结论经血清学和分子流行病学证实瑞丽市边境地区发生输入性登革热暴发,并间接证实缅甸木姐市2008年存在登革l和3型病毒流行。     

湖北省2014—2023年登革病毒包膜蛋白基因特征分析

目的 分析2014—2023年湖北省登革热感染病例包膜蛋白（envelope,E）基因特征并进行生物学溯源方法 收集疑似登革热病例血清标本,对标本进行核酸检测及血清分型,核酸阳性标本采用RT-PCR扩增E基因并进行测序分型,获得基因序列用MEGA 11.0软件进行基因特征分析。结果 2014—2023年湖北省共检测登革热核酸阳性病例78份,成功获得44份标本的登革病毒（dengue virus, DENV）E基因序列,其中血清Ⅰ型(DENV-Ⅰ)39份,血清Ⅱ型(DENV-Ⅱ)5份;进化分析显示,DENV-Ⅰ中37例为基因Ⅰ型(GⅠ),分布在三个不同分支上,主要与中国广州、新加坡、印度尼西亚、泰国和缅甸等东南亚国家流行株进化距离较近,2例为基因Ⅴ型(GⅤ)与中国广州和印度流行株进化距离较近;DENV-Ⅱ中5例均为混合型(cosmopolitan型)与输入地流行株进化距离较近。结论 2014—2023年湖北省存在多型登革病毒感染,主要流行株为DENV-Ⅰ的GⅠ亚型,与中国广州和东南亚国家亲缘关系较近,提示湖北省应加强登革热跨省、跨境传播的防控,同时谨防登革重症及死亡病例的出现。     

南宁市37例登革病毒1型E基因系统进化分析

目的 对南宁市37例登革病毒1型（DENV1）流行株E基因进行序列测定,分析其分子生物学特征,探讨其可能来源。方法 选取2014年12份、2019年25份,共37份经确证为DENV1感染者阳性血浆样本,RT PCR扩增E基因片段,测序后进行同源性比较、系统进化分析。结果 测序后共获得37条长度为1437bp的E基因核苷酸序列,与各参考株E基因序列构建系统进化树后共形成Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ,3个较大的进化簇,进化簇Ⅰ包括10条2019年DENV1 E基因序列,与参考序列Singapore 2017遗传距离最近,序列相似度99.4%~99.5%;进化簇Ⅱ包括8条2019年DENV1 E基因序列,与参考序列GuangZhou 2018遗传距离最近,序列相似度99.3%~99.5%;进化簇Ⅲ包括7条2019年DENV1 E基因序列和8条2014年DENV1 E基因序列,与参考序列Vietnam 2016遗传距离最近,序列相似度98.4%~98.8%。结论 2019年南宁市输入性DENV1流行株最有可能来源于广州和越南,推断南宁市2019年出现的DENV1本地流行由2014年以来本地进化毒株和新输入毒株共同引起。     

广州市2001-2015年登革病毒2型E基因进化分析

目的 了解2001-2015年广州市登革病毒2型（DENV2）的流行情况;通过对分离DENV2 E基因的进化树和分子钟分析,掌握毒株的进化情况和趋势。方法 将登革热确诊病例的血清用荧光PCR进行检测,DENV阳性血清用C6/36细胞进行病毒分离,测定分离毒株的E基因序列,利用Mega 4.0软件构建进化树,采用BEASTv1.8.2绘制分子进化钟。结果 2001-2015年共分离到26株DENV2,从基因型上分类属于全球型和亚洲1型,并与东南亚地区分离到的毒株相似率较高;BEASTv1.8.2计算出广州市DENV2全球型在46年前和35年前进一步出现亚型的分化,广州市DENV2的平均变异率为每年每位点7.1×10^-4。结论 广州市DENV2与东南亚地区的毒株有较高同源性和进化上的联系,广州市DENV的输入压力较大,存在重症登革热暴发的潜在风险。流行于广州市的全球型DENV2可能存在2个不同输入来源,广州市DENV2的变异率与周边地区基本持平。     

2014—2019年东莞市Ⅰ型登革病毒E基因进化特征分析

目的了解东莞市2014—2019年登革热流行情况和血清型Ⅰ型登革病毒(DENV-1)基因型及E基因特征。方法收集2014—2019年东莞市各镇街医院上送的经临床诊断为疑似登革热病例血清样本共962份,其中的729份样本应用酶联免疫吸附试验(ELISA)进行登革IgM抗体检测,全部962份血清样本采用实时荧光PCR进行检测,核酸阳性样本中的血清型Ⅰ型样本用细胞培养方法进行病毒分离鉴定,并对其E基因序列进行测序及系统进化树分析。结果2014—2019年东莞市登革热7—11月为流行期,9—10月为发病高峰。检出IgM抗体阳性样本261份,阳性率35.90%。962份急性期血清中登革病毒核酸阳性362份,阳性率37.6%,其中DENV-1阳性311份,占85.9%。分离获得35株DENV-1毒株,E基因序列比对和系统进化分析显示,35株DENV-1分离株间核苷酸相似度为89.8%~100.0%,分属基因Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅴ型,分别为29、1和5株。所有35株分离株与广州、浙江等地及越南、菲律宾、印度等东南亚国家当年或往年流行株同源性较高。结论2014—2019年东莞市流行的DENV-1优势型别为基因Ⅰ型。流行方式可能为广州等周边城市及东南亚国家输入病例引起的本地暴发流行。须警惕基因Ⅴ型DENV-1输入引起登革热暴发流行。     

2019年珠海市登革病毒流行情况及E基因演化分析

目的 通过对2019年珠海市登革热流行病学数据及及登革病毒包膜蛋白基因（E基因）序列进行分析,了解珠海市登革热流行规律和病毒遗传进化特点。方法 2019年珠海疾病预防控制中心采集登革热临床诊断病例的血液标本,对病例进行流行病学调查,磁珠法提取病毒核酸,用Real-time RT-PCR进行检测,阳性标本用RT-PCR扩增E基因并进行测序分型获得的基因序列,采用MEGA6.0软件进行系统进化分析。结果 共收集登革热临床诊断病例185例,实验室诊断病例99例,实验室诊断病例较2018年同期增长154%。其中输入性病例53例,本地感染病例46例,男性61例,女性38例,进入9月份本地感染病例增多,以散发状态为主,其中本地暴发疫情2起;75例成功测序,以DENV-1型为主,占88.00%,全部属于基因Ⅰ亚型,分布在3个不同分支上,分别与2017年越南、2015柬埔寨、2014年马来西亚、新加坡,2012、2014年斯里兰卡等流行株高度同源;DENV-2和DENV-3病例均为输入病例。结论 珠海市登革热主要由东南亚输入,极易发生输入性病例引起本地暴发流行,定期对流行的登革病毒进行序列分析有利于分析该病毒的基因进化方向。     

河南省2018年输入性登革热的病原监测分析

目的 分析2018年河南省输入性登革热的病原监测情况。方法 利用国家传染病报告信息管理系统,收集2018年河南省登革热疑似病例,开展个案调查同时采集血清,检测登革病毒NS1抗原、IgM和IgG抗体以及病毒RNA;对于病毒RNA检测阳性的样本进行荧光PCR分型诊断和E基因序列扩增,阳性扩增产物测序后进行同源性比对和系统进化分析。结果 2018年河南省累计报告登革热病例29例,均为输入性病例,来自东南亚地区(25/27,92.6%)和非洲地区(2/27,7.4%),以<45岁中青年农民为主,男性明显多于女性,输入性病例时间空间分布分散。29例报告病例中NS1抗原和/或IgM检测阳性的22例。8例病例标本进行核酸检测,其中6例阳性且基因分型成功,其中登革病毒1型、2型各3例。1例由马尔代夫输入的2型登革病毒进行了测序和系统进化分析,与2008年柬埔寨2型登革病毒JF730046一致性最高,属于AsianⅠ基因亚型。结论 2018年河南省输入性登革热病例较2017年明显上升,但未引起河南省本地流行。     

湖南省2018年登革热本地暴发流行病学和病毒分子特征分析

目的 对湖南省2018年登革热本地暴发疫情进行流行病学及病原学特征研究。方法 对报告的8例疑似登革热病例进行实验室诊断,对病例密切接触者搜索出的186例疑似登革热病例和发热病例开展病原学监测,应用C6/36细胞对病例急性期血清开展病毒分离,对15株登革病毒株E基因测序,分析病毒的血清型别和基因亚型,构建系统发生树,分析可能的传播来源。在疫点开展蚊媒密度应急监测和健康人群回顾性血清流行病学调查。结果 8例疑似病例血清标本,6例登革病毒核酸阳性,4例登革病毒NS1抗原阳性。186例疑似登革热病例,96例病原学检测结果阳性,分离到登革病毒株64株,经鉴定全部为登革病毒2型全球型,来源于广东和浙江省的可能性较大。应急蚊媒密度监测,疫点布雷图指数最高达65,具有极高的登革热传播风险。回顾性调查377名健康人群进行登革热抗体水平监测,IgG抗体阳性率为0.53%（2/377）。结论 现场流行病学调查和分子遗传分析提示,湖南省2018年本地暴发疫情由输入性病例引起,由单一的登革病毒2型全球型引起。     

2019年珠海市登革病毒传播影响因素分析

目的 根据2019年珠海市登革病毒（DENV）的流行病学数据统计分析、DENV包膜蛋白（E）基因序列测定、登革抗体水平回顾分析及蚊媒密度监测,分析珠海市登革病毒传播的影响因素。方法 收集2019年登革热流行病学资料开展统计学分析;采集登革热临床诊断病例的血清标本,提取RNA,用RT - PCR方法检测,阳性标本针对E基因测序分型,构建进化树分析样品来源;采集2017—2019年珠海市200份/年的健康人群血清进行登革热抗体IgG检测;开展珠海市2019年蚊媒监测。结果 珠海2019年DENV流行的血清型主要为DENV - 1型,全部属于基因Ⅰ亚型,并分布在3个不同的分支上,分别与2017年越南、2015年柬埔寨,2014年马来西亚、新加坡,2014、2012年斯里兰卡等流行株高度同源;少数感染DENV - 2与DENV - 3病例均为输入病例,核酸序列与分别输入国的流行株序列高度同源;登革病毒IgG抗体阳性率逐年提高（2017年的1.5%到2019年12%）;2019年全市BI指数月平均值处在1.4～3.6之间。结论 目前珠海市登革病毒流行方式属于输入性引起的本地暴发流行,鉴于珠海登革疫情预警机制和蚊媒密度监测等工作推断,我市未来几年大范围暴发本地登革热疫情几率不高。     

Dengue 3 epidemic, Havana, 2001

In June 2001, dengue transmission was detected in Havana, Cuba; 12,889 cases were reported. Dengue 3, the etiologic agent of the epidemic, caused the dengue hemorrhagic fever only in adults, with 78 cases and 3 deaths. After intensive vector control efforts, no new cases have been detected.     

1991年中山市沙溪镇登革热局部流行的调查

1991年8月下旬,中山市沙溪镇圣狮村发生登革热。流行初期,由于患者症状不够典型及调查工作不够深入细致,致误诊,未能及时采取有效的防疫措施,造成疫情扩散蔓延,波及紧邻的龙头环、龙聚环、象角三村及圩镇。整个流行历时64天,共发生112例。本次流行经病原学证实为I型登革病毒所引起。本文还就传染来源、传播因素及临床表现与致病毒株型别的关系等问题进行了讨论。     

Effectiveness of a single-dose mass dengue vaccination in Cebu,Philippines: A case-control study

BackgroundDengue fever is an important public health problem in the Philippines. In April 2016, the Department of Health launched a three-dose school based dengue vaccination program of nine- to fourteen-year-old children in three regions with the highest number of dengue cases using CYD-TDV (Dengvaxia, Sanofi Pasteur). In July 2017, a community-based dengue vaccination program was implemented in Cebu province. The program was discontinued in December 2017 amidst public controversy, after the first dose had been administered. We assessed the effectiveness of a single dose of CYD-TDV against hospitalized virologically confirmed dengue (VCD).MethodsWe conducted a case-control study in Cebu province following the dengue mass vaccination. Children who were nine to fourteen years of age during the mass vaccination and subsequently admitted to any of four participating public hospitals with suspected dengue were enrolled in the study as cases. Blood for RT-PCR and clinical and socio-demographic information were obtained. To estimate the level of vaccine protection, vaccination status was compared between children with hospitalized virologically confirmed dengue and controls of the same six-year age-group as the cases, matched on sex, neighborhood and time of occurrence of cases.FindingsWe enrolled 490 cases and 980 controls. Receipt of one dose of CYD-TDV was associated with 26% (95 % CI, −2 to 47%; p = 0 0675) overall protection against hospitalized virologically confirmed dengue and 51% (95 % CI, 23 to 68; p = 0 0016) protection against dengue with warning signs.InterpretationA single dose of CYD-TDV given to nine to fourteen-year-old children through a community-based mass vaccination program conferred protection against dengue with warning signs and severe dengue but we were unable to conclude on protection against milder illness.     

广东省1990～2000年登革热流行病学分析

目的 明确广东省登革热流行因素。探讨预防控制对策。方法 调查分析1990-2000年登革热病例的分布特征和流行因素，测定登革Ⅰ型病毒地方分离株E/NS1基因片段核苷酸序列。结果 1990-2000年间，广东省共报告登革热病例9747例，死亡3例。年发病率在0/10万-9.75/10万之间，平均为1.27/10万。流行多呈爆发，疫情涉及13个市（占全省21个市的61.9%)。主要集中在广州，潮州，肇庆和佛山市，呈现高度集中而相对分散特点，敏月均有登革热病例报告，其中1-6月份为散发输入病例，7-12月份为流行期，男性：女性为1.04:1，所有年龄组均易感，四个型别的登革病毒均发生过流行，同一地区不同年份可流行不同型别病毒，同一年份不同地区也可流行不同型别病毒，广东省12株登革Ⅰ型病毒地方分离株E/NS1基因片段核苷酸序列，显示广东省登革Ⅰ型代表毒株可分为两个基因亚型。临床表现以典型登革热为主，广东省存在有利于登革热流行的自然因素和社会因素。结论 广东省登革热疫情同国外登革热流行程度相关联。流行呈输入性流行的特征，至今仍无证据表明已成为地方性疾病。     

Dengue and dengue hemorrhagic fever, Brazil, 1981-2002

In the last 5 years, Brazil has accounted for approximately 70% of reported dengue fever cases in the Americas. We analyzed trends of dengue and dengue hemorrhagic fever (DHF) from the early 1980s to 2002 by using surveillance data from the Brazilian Ministry of Health. Two distinct epidemiologic patterns for dengue were observed: localized epidemics (1986-1993), and endemic and epidemic virus circulation countrywide (1994-2002). Currently, serotypes 1, 2, and 3 cocirculate in 22 of 27 states. Dengue and DHF affected mainly adults; however, an increase in occurrence of DHF among children has been recently detected in northern Brazil, which suggests a shift in the occurrence of severe disease to younger age groups. In 2002, hospitalizations increased, which points out the change in disease severity compared to that seen in the 1990s. We describe the epidemiology of dengue in Brazil, characterizing the changing patterns of it and DHF during the last 20 years.     

Development of a recombinant,chimeric tetravalent dengue vaccine candidate

Dengue is a significant threat to public health worldwide. Currently, there are no licensed vaccines available for dengue. Takeda Vaccines Inc. is developing a live, attenuated tetravalent dengue vaccine candidate (TDV) that consists of an attenuated DENV-2 strain (TDV-2) and three chimeric viruses containing the prM and E protein genes of DENV-1, -3 and -4 expressed in the context of the attenuated TDV-2 genome backbone (TDV-1, TDV-3, and TDV-4, respectively). TDV has been shown to be immunogenic and efficacious in nonclinical animal models. In interferon-receptor deficient mice, the vaccine induces humoral neutralizing antibody responses and cellular immune responses that are sufficient to protect from lethal challenge with DENV-1, DENV-2 or DENV-4. In non-human primates, administration of TDV induces innate immune responses as well as long lasting antibody and cellular immunity. In Phase 1 clinical trials, the safety and immunogenicity of two different formulations were assessed after intradermal or subcutaneous administration to healthy, flavivirus-naïve adults. TDV administration was generally well-tolerated independent of dose and route. The vaccine induced neutralizing antibody responses to all four DENV serotypes: after a single administration of the higher formulation, 24–67%% of the subjects seroconverted to all four DENV and >80% seroconverted to three or more viruses. In addition, TDV induced CD8⁺ T cell responses to the non-structural NS1, NS3 and NS5 proteins of DENV. TDV has been also shown to be generally well tolerated and immunogenic in a Phase 2 clinical trial in dengue endemic countries in adults and children as young as 18 months. Additional clinical studies are ongoing in preparation for a Phase 3 safety and efficacy study.     

Four dengue virus serotypes found circulating during an outbreak of dengue fever and dengue haemorrhagic fever in Jakarta, Indonesia, during 2004

Periodic outbreaks of dengue have emerged in Indonesia since 1968, with the severity of resulting disease increasing in subsequent years. In early 2004, a purported dengue outbreak erupted across the archipelago, with over 50,000 cases and 603 deaths reported. To confirm the disease aetiology and to provide an epidemiological framework of this epidemic, an investigation was conducted in ten hospitals within the capital city of Jakarta. Clinical and laboratory findings were determined from a cohort of 272 hospitalised patients. Exposure to dengue virus was determined in 180 (66.2%) patients. When clinically assessed, 100 (55.6%) of the 180 patients were classified as having dengue fever (DF), 31 (17.2%) as DF with haemorrhagic manifestations and 49 (27.2%) as dengue haemorrhagic fever (DHF). Evidence from haemagglutination inhibition assays suggested that 33/40 (82.5%) of those with DHF from which laboratory evidence was available suffered from a secondary dengue infection. All four dengue viruses were identified upon viral isolation, with DEN-3 being the most predominant serotype recovered, followed by DEN-4, DEN-2 and DEN-1. In summary, the 2004 outbreak of dengue in Jakarta, Indonesia, was characterised by the circulation of multiple virus serotypes and resulted in a relatively high percentage of a representative population of hospitalised patients developing DHF.     

Next generation dengue vaccines: a review of candidates in preclinical development

Dengue represents a major public health problem of growing global importance. In the absence of specific dengue therapeutics, strategies for disease control have increasingly focused on the development of dengue vaccines. While a licensed dengue vaccine is not yet available, several vaccine candidates are currently being evaluated in clinical trials and are described in detail in accompanying articles. In addition, there are a large variety of candidates in preclinical development, which are based on diverse technologies, ensuring a continued influx of innovation into the development pipeline. Potentially, some of the current preclinical candidates may become next generation dengue vaccines with superior product profiles. This review provides an overview of the various technological approaches to dengue vaccine development and specifically focuses on candidates in preclinical development.