北京地区腹泻病患者致泻性大肠埃希菌感染类型及其流行特征

目的：了解北京地区腹泻人群中致泻性大肠埃希菌（DEC）毒力基因的分布及流行特征。方法对2012-2013年监测医院的腹泻患者粪便样本进行分离培养,再采用实时荧光PCR检测毒力基因。结果6370份粪便标本有253份阳性,共分离到DEC 262株,阳性检出率为4.0%（253/6370）,9份标本发现两种不同型别的DEC混合感染。肠致病性大肠埃希菌（EPEC）为42.8%,其中非典型EPEC占42.0%,典型EPEC占0.8%;肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）为38.9%,其中耐热肠毒素基因st阳性占24.8%,不耐热型肠毒素基因lt阳性占9.9%,st和lt均阳性占4.2%;肠聚集性大肠埃希菌（EAEC）为15.3%;肠侵袭性大肠埃希菌（EIEC）为2.7%;检出1株产志贺毒素大肠埃希菌（STEC）,血清型为O26∶K60。ETEC感染具有明显的年龄分布特征;各型DEC全年均有检出,且呈季节性变化。结论北京地区腹泻病患者DEC感染类型以EPEC和ETEC为主,且EPEC分离株多为非典型,并存在混合感染,不同型别DEC感染具有年龄和季节性分布特征。     

深圳市腹泻人群致泻性大肠埃希菌流行及病原特征研究

目的 了解深圳地区腹泻患者中致泻性大肠埃希菌(DEC)的流行状况及病原特征。方法 对2014年深圳市4家哨点医院门诊急性腹泻患者粪便标本进行DEC的分离、分子鉴定、血清分群及PFGE分型。结果 1 823份粪便标本中分离到74株DEC,阳性分离率为4.06%;感染病例年龄分布以 <3岁的婴幼儿及20～39岁中青年为主,病例集中在5-9月夏秋季。以肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)和肠致病性大肠埃希菌(EPEC)为主,分别占45.9%和31.1%。ETEC以O159最多,2株及以上PFGE带型一致的菌株有5簇;其他型别DEC血清型和PFGE带型均较分散。结论 2014年深圳地区腹泻病患者DEC的感染类型以ETEC和EPEC为主,存在年龄及季节分布特征,菌株的血清型及PFGE分子带型较分散,应警惕ETEC的暴发风险。     

浙江省腹泻患者致泻性大肠埃希菌血清型分布及其鉴定效率的评价

目的 了解浙江省致泻性大肠埃希菌（DEC）血清型分布并探讨其血清学鉴定分类方法的鉴定效率。方法 对2009年7月至2013年6月浙江省腹泻症候群病原谱监测网络菌株库中的696株DEC菌株（通过毒力基因鉴定）开展血清学凝集试验,比较毒力基因和血清学鉴定分类的结果。结果 696株DEC中288株（41.4%）能明确O抗原型别,分属于35种O血清群。171株（24.6%）H血清凝集,分属于21种H型。肠集聚性大肠埃希菌（EAEC）、产肠毒素性大肠埃希菌（ETEC）、肠致病性大肠埃希菌（EPEC）和肠出血性大肠埃希菌（EHEC）凝集率分别为31.9%（130/408）、70.6%（127/180）、31.5%（29/92）和14.3%（2/14）,分属于30、18和15种O血清群,1株EHEC为O157∶H7。EAEC和EPEC血清群相对较多样化,而ETEC则相对集中,不同类型DEC可具有同一血清群/型。根据血清学结果可分类的75株DEC中,42株毒力基因和血清学分类结果一致,33株不一致。结论 浙江省DEC血清群/型种类多样,单纯采用血清学筛查可造成极大的漏检或误分,建议采用毒力基因鉴定分类。     

上海市2012－2013年4种致泻性大肠埃希菌监测

目的 基于临床医院开展4种致泻性大肠埃希菌(DEC)人群监测,探讨公共卫生实验室对临床实验室需求的直接技术指导的实践模式。方法 设立哨点医院,以标准化方法筛选和鉴定DEC菌型;构建DEC流行特征基线;对疑似暴发病例开展基于实验室和流行病学调查。结果 2012－2013年选择上海地区4家哨点医院检测7 204份腹泻标本确认的712例DEC感染病例,阳性率为9.9%。其中肠致病性大肠埃希菌(EPEC)感染351例;肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)感染292例;肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)感染32例;产志贺样毒素大肠埃希菌(STEC/EHEC)感染6例;DEC混合感染31例。EPEC感染以1～5岁儿童最多见,菌型均为aEPEC;ETEC流行峰值在8月,阳性率>20%,感染病例2012年聚集于1～28日龄和2013年的20～60岁人群(P< 0.05),菌型以耐热肠毒素(ST)型最多(59.6%),其次为不耐热肠毒素(LT)型(27.8%)和ST/LT型(12.6%);2013年儿童感染EIEC病例明显增加(P< 0.01);未监测到EHEC O157 : H7,但确认2例EHEC O26 : H11(eae-hlyA-stx1a)儿童病例;调查确认2012年上海地区15例新生儿ETEC聚集性感染病例与四川省自贡市新生儿病例属于同一克隆(STh-CS21-CFA/I-ClyA-EatA-ST2332- SHNL0005)。结论 上海地区DEC型谱特征已发生改变,ETEC对新生儿院内感染和食源性感染性腹泻构成潜在暴发风险,需加强实验室主动监测。     

4种致泻性大肠埃希菌分子诊断方法的评估及其在监测中的应用

目的评估和建立用于常规监测4种致泻性大肠埃希菌(DEC)的分子诊断方法,并应用于上海市腹泻人群DEC的监测.方法使用丹麦SSI分子诊断试剂盒对DEC参考菌株进行验证试验及制定DEC-PCR诊断、分离的操作规程(DEC-PCR-SOP),并检测2012年6-9月上海市3家临床医院腹泻病例粪便标本.结果经26株DEC参比菌株验证,SSI分子诊断试剂盒的特异性为100%; 1887份腹泻病例标本共分离得到218株DEC(乳糖阳性181株,乳糖阴性37株),其中致病性大肠埃希菌(EPEC) 118株、产毒性大肠埃希菌(ETEC)90株、侵袭性大肠埃希菌(EIEC)9株、产志贺毒素大肠埃希菌(STEC)1株、志贺菌18株,总阳性率为l1.6%;监测地区DEC腹泻病例中以EPEC占优势,而EPEC腹泻病例中又以2岁以下婴幼儿为主;外籍DEC病例以ETEC占优势,新生儿ETEC病例占5岁以下低年龄组腹泻病例的1/3.结论经评估DEC-PCR-SOP用于4种DEC常规监测的数据结果可信.国内食源性监测网络实验室应不断完善4种DEC诊断和参比能力.     

上海市2014-2021年肠道门诊15岁及以上感染性腹泻病例中致泻性大肠埃希菌流行特征分析

目的 了解上海市肠道门诊≥15岁感染性腹泻病例中致泻性大肠埃希菌（DEC）流行特征,为DEC感染性腹泻防控策略的制定提供科学依据。方法 采用多阶段系统抽样方法,在上海市22家监测点医疗机构的肠道门诊开展腹泻症状监测,收集病例的人口学、临床和流行病学资料,同时采集病例粪便标本,送至医疗机构所在区CDC开展DEC检测及鉴定分型,分析比较2014-2021年不同人群和季节的DEC阳性率。统计学分析采用χ²检验。结果 在15 185例感染性腹泻病例中,DEC的总阳性率为8.05%（1 222/15 185）。其中男性阳性率（8.74%,684/7 824）高于女性（7.31%,538/7 361）,15~29岁组人群阳性率最高（9.14%,335/3 665）,2021年阳性率最高（10.21%,83/813）,以上差异有统计学意义（均P<0.05）。DEC阳性PCR菌型鉴定分离出菌株1 264株中,肠产毒性大肠埃希菌为主（50.24%,635/1 264）,其次是肠黏附性大肠埃希菌（27.93%,353/1 264）和肠致病性大肠埃希菌（21.36%,270/1 264）。DEC存在明显季节性流行特征,夏季阳性率最高（13.92%,774/5 562）（χ²=495.73,P<0.001）。结论DEC是2014-2021年上海市感染性腹泻患者重要病原体之一,引起的感染性腹泻全年均可发生,夏秋季高发,流行型别为肠产毒性大肠埃希菌、肠黏附性大肠埃希菌和肠致病性大肠埃希菌。应针对不同年龄、不同季节和不同型别的DEC感染性腹泻采取特异性的防控措施。     

社区腹泻患者感染致泻大肠埃希菌分布与耐药性分析

目的了解社区腹泻患者感染致泻大肠埃希菌(Diarrheagenic E.coli,DEC)的常见类型及耐药性,为制定有效治疗措施提供参考依据。方法收集医院2013年7-11月442例门诊腹泻患者粪便标本,采用针对肠致病性大肠埃希菌(EPEC)、非典型EPEC(ATEC)、肠产毒素性大肠埃希菌(ETEC)、肠凝聚性大肠埃希菌(EAEC)、肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)、产志贺毒素大肠埃希菌(STEC)6种类型DEC共11对致病基因(escV、bfpB、stx1、stx2、elt、estIa、estIb、invE、astA、aggR、pic)的特异性引物对分离得到的大肠埃希菌进行多重PCR测定;应用微量稀释法检测DEC对常用抗菌药物的敏感性。结果 442例门诊腹泻患者中130例分离到DEC,占29.4%,其中10例同时分离到两种致病菌,6例分离到同一种致病菌包括两种基因型;共分离到147株DEC,包括EAEC100株占68.0%、ETEC7株占4.8%、ATEC9株占6.1%、EIEC和STEC各1株,未分型29株占19.7%。结论社区DEC以EAEC最为常见,且出现ATEC感染;DEC对常用抗菌药物的耐药性因致病性不同而异,临床治疗需考虑DEC类型并加强耐药性监测。     

2019—2022年上海市奉贤区哨点医院致泻性大肠埃希菌的耐药性和同源性

【目的】开展上海市奉贤区的致泻性大肠埃希菌（DEC）耐药性和同源性分析,为临床合理用药和风险监测预警提供依据。【方法】收集2019—2022年上海市奉贤区腹泻病检测中分离到的DEC,采用微量肉汤稀释法进行21种抗生素药物敏感试验,采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）进行聚类分型。【结果】腹泻病例DEC检出率为18.99%(131/690)、肠聚集性大肠埃希菌（EAEC）占64.89%(85/131)、肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）占22.14%(29/131)、肠致病性大肠埃希菌（EPEC）占12.21%(16/131)、肠出血性大肠埃希菌（EHEC）占0.76%(1/131),未检出肠侵袭性大肠杆菌（EIEC）。DEC检出具有明显夏季高发的季节性特点。DEC多重耐药率为66.41%,共有65种耐药谱,耐药率最高的5种抗生素是氨苄西林（60.31%）、萘啶酸（51.91%）、头孢唑林（50.38%）、四环素（44.27%）、复方新诺明（35.11%）,2019—2022年DEC对左氧氟沙星的耐药率明显升高。85株EAEC聚类分析相似度为58.4%～100.0%,得到69种带型;29株ETEC...     

2015-2016年江阴市致泻性大肠埃希菌监测及其毒力基因分析

目的了解2015-2016年江阴市致泻性大肠埃希菌[肠致病性大肠埃希菌(EPEC)、肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)、肠侵袭性大肠埃希菌(EIEC)、肠出血性大肠埃希菌(EHEC)、肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)]的感染、分布及其毒力基因的携带情况。方法对2015-2016年哨点医院提供的感染性腹泻样本进行实时荧光定量PCR检测,确定其致病型别及其携带的毒力基因。结果 359份腹泻标本中,检出致泻性大肠埃希菌31份,检出率8.64%,其中EAEC 15份,检出率4.18%,EPEC 13份,检出率3.62%,ETEC 3份,检出率0.84%,未检出EIEC及EHEC。15株EAEC中,携带astA基因8株,携带aggR+pic基因6株,携带astA+aggR+pic基因1株。13株EPEC均携带eae基因,3株ETEC均携带estI基因。致泻性大肠埃希菌主要集中在夏秋季节高发,2015年主要以EPEC为主,2016年主要以EAEC为主。结论江阴市致泻性大肠埃希菌主要以EAEC和EPEC两个型别为主,携带的毒力基因呈多态性,显示其致病力和侵袭力具有多样性和复杂性,应加强监测。     

2018-2019年北京市丰台区腹泻病例感染致泻大肠埃希菌PFGE分子分型

目的了解北京市丰台区腹泻病例致泻大肠埃希菌(Diarrheagenic Escherichia coli,DEC)分布与分子分型特征,为DEC分子流行病学调查提供数据。方法对2018-2019年腹泻病例便标本多病原菌分离鉴定,采用脉冲场凝胶电泳法(Pulsed field gel electrophoresis,PFGE)对分离株进行分子分型和聚类分析。结果从954份粪便标本共分离98株DEC(10.5%,98/954),仍是腹泻病例的主要致病菌之一,其基因型以产毒性大肠埃希菌(Enterotoxigenic Escherichia coli,ETEC)为主(54.1%),其次为致病性大肠埃希(Enteropathogenic Escherichia coli,EPEC)(29.6%)和聚集性大肠埃希氏菌(Enteroaggregative Escherichia coli,EAEC)(16.3%)。菌株分子分型带型呈多态性,53株ETEC有3组菌株具有完全一致带型,可分为32种带型;26株EPEC分为23带型、16株EAEC分为14带型,带型间相似度较低。结论 DEC基因型以ETEC为主。通过PFGE分子分型提示ETEC可能存在同源菌株的持续感染,长期持续监测和分子分型,对防控和溯源具有重要意义。     

连云区腹泻人群致泄性大肠埃希氏菌感染和分子分型特征分析

目的 了解连云港市连云区2015 - 2018年腹泻人群中致泄性大肠埃希氏菌（DEC）感染和分子分型特征,为本地DEC科学防控提供指导。方法 收集2015 - 2018年连云区腹泻患者粪便标本,采用分离培养、核酸检测,结合病例信息及脉冲场凝胶电泳结果,分析DEC的流行和菌株特征。结果 分离DEC菌株84株,其中EPEC 21株、EAEC 38株、ETEC 22株、EIEC 2株、EHEC 1株;DEC感染年龄以15～55岁为主,不同年龄段感染谱不同;DEC总检出率为13.17%（84/638）,2017年DEC检出率最高;84株DEC菌株分型检测可分为79个带型,种内相似度最高为100%,最低为0.84%。结论 连云区腹泻人群DEC感染以EAEC、EPEC和ETEC为主,青壮年为高危人群、PFGE指纹图谱具有多样性,ETEC菌株存在聚集性趋势,应加强连云区DEC检测和指纹图谱数据库构建。     

2010年福建南平及永安监测点致泻大肠杆菌的监测报告

目的:为了解福建省腹泻病人中致泻大肠杆菌的感染情况。方法:应用多重PCR或单重PCR方法检测致泻大肠杆菌的EPEC/EHEC eaeA基因、EHEC stx基因、EAEC aggR基因、EIEC ipaH、EIEC virA、ETEC ST、ETEC LT、EPEC bfp基因。API 20E生化鉴定条进行生化试验。血清学鉴定。结果:2010年度共分离得19株致泻大肠杆菌,检出率为10.9%。1株EAEC;1株tEPEC;4株aEPEC;13株ETEC。19株分离的致泻大肠杆菌经API 20E鉴定均为大肠埃希菌。1株tEPEC与EPEC三种多价诊断血清型均不凝集,而1株aEPEC血清型为O111:K58(B4)。13株ETEC菌株血清型:多数为O6:K15,1株O25:K19(L),3株未能分型。结论:监测结果对于我们了解福建省致泻大肠杆菌感染情况,预警潜在发生疫情的可能性有其重要性。这些菌种的获得可以为下一步研究其毒力特征、分子分型及耐药性积累原始材料。     

实时荧光PCR检测肠致泻性大肠杆菌在腹泻人群中的分布

目的调查致泻性大肠杆菌(DEC)在福建省腹泻人群中的分布情况,为做好防治工作提供本底资料。方法对监测医院腹泻患者的粪便样本提取增菌液的DNA,再用实时荧光PCR(RT-PCR)技术进行相关病原菌检测,以了解5种病原菌在腹泻人群中的分布情况。结果检测206份样本,DEC总检出率为18.9%,各相关病原菌检出率:肠致病性大肠杆菌(EPEC)为8.3%,均为不典型肠致病性大肠杆菌;肠产毒性大肠杆菌(ETEC)为1.5%,均为产耐热肠毒素-SL阴性、不耐热型肠毒素-LT阳性;肠侵袭性大肠杆菌(EIEC)为1.9%,肠黏附性大肠杆菌(EAEC)为7.3%,肠出血性大肠杆菌(EHEC)未检出。结论 DEC相关病原菌以EPEC和EAEC为主,其次为EIEC和ETEC,未检出EHEC,与20世纪80年代相比,病原谱发生了变化。     

HEp-2-adherent Escherichia coli strains associated with acute infantile diarrhea,São Paulo,Brazil

In this paired case-control study of infants with diarrhea in São Paulo, we examined the association between HEp-2–adherent Escherichia coli strains and diarrhea. We tested isolates from stool specimens of infants with diarrhea and matched controls in an HEp-2 cell adherence assay; we then hybridized isolates with DNA probes and identified enteropathogenic E. coli (EPEC), enteroaggregative E. coli (EAEC), and diffusely adherent E. coli (DAEC). From 100 patient-control pairs, we isolated 78 HEp-2–adherent strains; of these, 61 strains were single pathogens identified in stools of infants with diarrhea. While typical EPEC was significantly associated with diarrhea (p<0.001), EAEC was more frequently associated with diarrhea in clinical cases (20%) compared with healthy controls (3%) (p<0.001). Atypical EPEC, showing a localized adherence-like pattern, was also more common in patients than controls (p>0.1). DAEC was isolated with equal frequency from patients and controls (p>0.1).     

2015—2019年北京市食源性致泻大肠埃希氏菌感染病例流行特征分析

目的分析2015—2019年北京市食源性致泻大肠埃希氏菌(diarrheagenic Escherichia coli,DEC)感染病例的流行病学特征和发病规律,为制定相应的防控策略与措施提供科学依据。方法收集2015—2019年北京市36家食源性疾病主动监测医院腹泻病例的粪便或肛拭子标本及其个人信息,采用χ^(2)检验对率或构成比进行比较。结果共收集27619份病例标本,其中有2485份为DEC阳性病例,检出率为9.00%,不同分型中肠产毒性大肠埃希菌检出率最高,为3.10%,其次为肠聚集性大肠埃希菌,检出率为3.02%。不同年龄组DEC检出率差异有统计学意义(χ^(2)=32.923,P<0.001),20~39岁年龄组DEC检出率最高,为9.81%,40~59岁年龄组感染肠产毒性大肠埃希菌高于其他年龄组,0~5岁年龄组肠致病性大肠埃希菌的检出率最高。时间分布上,第三季度为高发期,不同季度间DEC检出率差异有统计学意义(χ^(2)=606.032,P<0.001)。空间分布上,远郊的DEC检出率最高,且城区、近郊和远郊的DEC检出率差异有统计学意义(χ^(2)=28.034,P<0.001),肠产毒性大肠埃希菌的检出主要分布在城区和近郊,肠聚集性大肠埃希菌主要分布在远郊。结论2015—2019年北京市食源性DEC的检出率呈逐年上升趋势,应在夏秋高发季节针对重点人群积极开展防控工作。     

安徽省临床分离致泻性大肠埃希菌主要流行基因型及同源性分析

目的 了解安徽地区临床分离致泻性大肠埃希菌(DEC)的耐药状况、基因同源性及主要基因型.方法 采用微量肉汤稀释法进行药物敏感性试验,采用多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型进行基因型检测和同源性分析.结果 268株DEC中,57.1％为多重耐药菌,其中肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)118株,肠毒素...     

Aetiology of Diarrhoea and Virulence Properties of Diarrhoeagenic Escherichia coli among Patients and Healthy Subjects in Southeast Nigeria

Diarrhoeal diseases are one of the most important causes of illness and death all over the world. In Nigeria, the aetiology of diarrhoeagenic bacteria and the virulence of various Escherichia coli pathotypes have not been well-studied because most currently-published data were from the southwestern axis of the country. In total, 520 stool samples were collected from infants, young children, and other age-groups with acute diarrhoeal diseases in Enugu and Onitsha, southeastern Nigeria. Stool samples were collected from 250 apparently-healthy individuals, with similar age distribution and locality, who were considered control subjects. The stool samples were screened for diarrhea-causing bacterial agents. E. coli strains were isolated from both the groups and were examined by polymerase chain reaction (PCR) for 16 virulence genes. Of the 520 stool samples in the diarrhoea group, 119 (44.74%) were E. coli. Fifty (49.02%) were enteropathogenic E. coli (EPEC), 22 (21.57%) were enterotoxigenic E. coli (ETEC) while 7.84% was enteroaggregative E. coli (EAEC). Sex had no effect on the distribution of diarrhoeagenic bacteria, except for EIEC. The E. coli strains isolated from the diarrhoea and healthy asymptomatic age-matched control groups examined by PCR for 16 virulence genes indicate that the detection of EAEC, ETEC, EPEC, and EIEC was significantly associated with diarrhoea (p=0.0002). The study confirmed that several bacterial pathogens, such as E. coli, play an important role in the aetiology of acute diarrhoea in southeastern Nigeria. A routine surveillance, especially for diarrhoeagenic E. coli, would be useful in identifying outbreaks and help identify the potential reservoirs and transmission routes.Key words: Diarrhoea, Escherichia coli, Virulence, Nigeria     

产志贺样毒素且具侵袭力的大肠杆菌的研究

我国临床腹泻病人粪便标本中，约有６０％检不出任何已知病原，而能分离出几乎纯培养的大肠杆菌。这些大肠杆菌过去被误认为是肠道正常菌样，我们对在北京西城区三个医院从腹泻病患者粪便本本中分离的１７２株所谓正肠杆菌，进行质粒ＤＮＡ，Ｈｅｐ－２细胞粘附试验，和１０种ＤＮＡ探针分析，结果表发现这些所谓的肠道正常大肠杆菌并不正常，其中４４％可为致泻性大肠杆菌，包括ＥＨＥＣ１６株，占所检查菌株的９．３％；ＥＰＥＣ８