甘肃省康县儿童腺病毒7型流行特征与病原学分析

目的 探讨甘肃省陇南市康县儿童腺病毒7型的流行病学及病原学特征。方法 采用统一的流行病学个案调查表对病例进行调查,采集病例咽拭子样本118份,采用实时荧光聚合酶链反应（PCR）方法对流感病毒（influenza virus, Flu）、呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus, RSV）、呼吸道腺病毒（human adenovirus, HAdV）等12种病原进行初筛检测。对HAdV核酸初筛阳性样本进行病毒分离,并对分离到的病毒株进行Hexon基因片段测序,核酸序列采用ClustalⅩ和Mega 6.0软件进行分析。结果 2014年12月20日至2015年2月2日共报告118例感染病例,均为儿童,年龄最小的仅2个月,最大的11岁,分布在康县21个乡镇中的17个乡镇,1岁27例,1～岁37例,2～岁40例;5岁14例,其中男性67人,女性51人,男女性别比为1.31:1。临床特征以发热、咳嗽、咽痛为主,部分病例伴扁桃体发炎、腹泻等症状。实验室确诊为HAdV感染的有33例,分布在13个乡镇。118例病例咽拭子经实时荧光PCR检测,HAdV阳性33例,流感病毒H3N2阳性7例,RSV阳性6例,HAdV和RSV混合感染2例。HAdV阳性标本用Hep-2细胞分离到病毒18株。中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所复核HAdV717株,HAdV31株,毒株测序结果表明,HAdV7毒株同源性高达100%,所有毒株位于同一分支上。结论 该起儿童呼吸道感染疫情的主要病原是HAdV7;疫情初期为H3N2流感病毒感染,后期RSV病毒感染病例使疫情持续时间延长;当地的恶劣气候,医院门诊对发热患者未按要求进行预检分诊,输液大厅、儿科病房等通风条件差,病例拥挤是本次疫情扩散的主要原因。     

住院患儿急性下呼吸道感染病毒学调查

目的了解住院患儿急性下呼吸道感染（acute lower respiratory infection,ALRI）的病毒感染状况,为临床儿童ALRI提供病毒病原学诊断依据。方法选择2008年10月至2009年5月在九江市妇幼保健院呼吸内科住院的ALRI患儿179例,取其入院当天静脉血,进行呼吸道病毒Ig M检测,包括呼吸道合胞病毒（RSV）、腺病毒（ADV）、流感病毒（IV）、副流感病毒（PIV）,并对检测标本阳性的病例进行统计分析。结果 179例送检标本,阳性39例,占21.7%（39/179）。在39例阳性标本中,RSV34例、占87.2%,ADV1例、占2.6%,IV2例、占5.1%,PIV2例、占5.1%。RSV感染的发病高峰在1、12月份,RSV感染多见于3岁以下儿童,男、女发病比例为2.09∶1。结论本院2008年10月至2009年5月住院患儿中,引起ALRI的病毒病原体以RSV为主,IV和PIV次之。     

江西省2438例急性呼吸道感染儿童中人偏肺病毒感染分析

目的了解2010-2016年江西省2438例急性呼吸道感染儿童中人偏肺病毒感染情况和病毒基因型特征。方法于2010年4月至2016年12月采集江西地区呼吸道感染儿童鼻咽拭子或支气管灌洗液标本;采用RT-PCR方法对人偏肺病毒进行核酸检测,对人偏肺病毒核酸阳性样本进行F基因扩增和测序,采用DNAStar和MEGA6.0软件对所得基因序列进行分析。结果 2010-2016年共采集2438例急性呼吸道感染儿童呼吸道标本。其中54例患儿标本人偏肺病毒核酸阳性,阳性率为2.21%,5岁以下儿童占总病例数90.74%。不同月份间人偏肺病毒检出率差异具有统计学意义,主要流行月份在12月和1-3月;阳性率在男女性别分布差异无统计学意义,共测序获得28株人偏肺病毒的F基因序列,系统进化分析显示,江西地区流行的人偏肺病毒有A2,B1,B2基因型,其中以A2基因型为主。结论人偏肺病毒是引起江西省儿童急性呼吸道病毒感染的重要病原体之一,冬春季高发,A2为优势流行的基因型。     

新型人冠状病毒NL63在急性呼吸道感染婴幼儿中的检出及鉴定

目的了解深圳和汕头地区婴幼儿急性呼吸道感染病原体中新型人冠状病毒NL63(HCoV NL63)的存在状况,初步探讨其流行规律及其所致疾病的临床特征。方法收集急性呼吸道感染婴幼儿呼吸道分泌物标本690份。应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术检测HCoV-NL63的1b基因,筛选出的阳性标本再进行HCoV-NL63的1a基因检测,未检测出HCoV-NL631a基因的阳性标本再进行核苷酸测序鉴定。同时,在所有HCoV-NL63阳性标本中检测流感病毒A、B型,副流感病毒1、3型,呼吸道合胞病毒、鼻病毒、人偏肺病毒、腺病毒和人博卡病毒。结果 690份标本中,共检出HCoV-NL63阳性7份,阳性率为1.0%(7/690),均为单一病毒感染。7份HCoV-NL63阳性产物的核苷酸序列同源性为86.0%～97.4%,分属两种不同的基因簇。婴幼儿感染者可表现为上呼吸道或下呼吸道感染症状;感染高峰期在夏、秋季节,以10月感染率最高(3.8%)。结论深圳、汕头地区婴幼儿急性呼吸道感染病原体中存在HCoV-NL63。     

引起一起发热疫情的人腺病毒4a型基因特征分析

目的了解引起一起发热疫情的人腺病毒4a型基因特征。方法2019年10月,北京市通州区某小学出现发热疫情,采集病例的咽拭子标本,提取标本核酸作为模板,利用实时荧光PCR方法检测32种呼吸道病毒和细菌。 对于腺病毒检测阳性的标本核酸,利用腺病毒特异性引物扩增3个基因（Fiber、Hexon和Penton）的片段并测序,采用局部序列比对基本检索工具（BLAST）比对序列,进行进化关系分析。结果采集的6份病例标本中,腺病毒全部阳性,其他检测的呼吸道病毒和细菌均为阴性。 Fiber、Hexon和Penton基因序列比对结果显示,6份标本中的腺病毒均为4a基因型。进化分析显示,该病毒与近年来美国流行的4a型腺病毒高度同源。结论人腺病毒4a型在北京市可以引起呼吸道发热疫情。     

常德地区小儿呼吸道病毒性感染病原学分析

目的探讨常德地区小儿呼吸道病毒性感染的病原学概况,为临床诊治工作提供参考.方法应用免疫荧光法检测患儿早期咽拭子标本中7项病毒[合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV )、流感病毒 A (FLuA )、流感病毒B(FLuB)、副流感病毒1(PIV1)、副流感病毒2(PIV2)、副流感病毒3(PIV3)],以了解病原学分布.结果从2778例患儿咽拭子标本中,检出相关病毒阳性1260例,总阳性率为45.4%.含单项病毒感染占89.0%,2项混合感染占11.0%.单一病毒感染中 RSV 占首位(57.40%),其余依次为 PIV1(11.31%)、PIV2(8.91%)、FLuB(6.33%)、ADV(5.97%)、PIV3(5.53%)、FLuA(4.55%).结论RSV 、PIV1、PIV2为常德地区致小儿呼吸道感染的主要流行病原体.对疑似病例早期进行7项呼吸道病毒检测,尽早为临床提供病原学诊断,使患儿得到及时诊治.     

2013－2019年浙江省湖州市急性胃肠炎病例GⅡ.P7-GⅡ.6型诺如病毒基因特征分析

  目的  分析2013 — 2019年浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒基因特征,为疾病监测和防控提供参考。  方法  采用荧光定量反转录聚合酶链式反应（RT-PCR）方法对2013年12月、2014年4、12月、2019年3月发生的4起学校/托幼机构急性胃肠炎患者送检粪便标本进行诺如病毒核酸检测。 采用RT-PCR法对核酸阳性标本的多聚酶和衣壳蛋白部分区域进行扩增,并对扩增产物进行序列测定。 利用在线分型工具和系统进化分析对病原序列进行基因特征分析。  结果  共计28份标本中分别有5、4、2、5份为GⅡ型诺如病毒核酸阳性,阳性率为57.1%（16/28）。 4次疫情各有1份标本测序成功;在线分型和系统进化分支分析显示,4起疫情的病原均为GⅡ.P7-GⅡ.6重组型诺如病毒,但进化分支不同,其中2013年疫情标本检出GⅡ.P7-GⅡ.6c型;2014年2起疫情均为GⅡ.P7-GⅡ.6b型,2019年疫情中检出的GⅡ.P7-GⅡ.6a型。  结论  GⅡ.P7-GⅡ.6型重组型诺如病毒是引起湖州市2013 — 2019年4起急性胃肠炎暴发疫情的病原体,每年毒株存在一定基因进化分支的差异。 鉴于该病毒在全球范围内具有持续和广泛的流行能力,应进一步加强对该型别重组型诺如病毒的监测。     

大足地区儿童呼吸道病毒感染病原学分析

目的了解大足地区住院患儿常见呼吸道病毒感染病原体及其感染特点。方法对2013年2月至2014年4月共7 403例因呼吸道感染收治住院患儿进行回顾性分析,采用直接免疫荧光法检测患儿鼻咽分泌物中的7种常见呼吸道病毒,同时检测患儿肺炎支原体感染情况。分析不同性别、年龄段、季度患儿病毒感染率及合并肺炎支原体感染情况。结果 (1)7 403份标本中检测出病毒阳性1 315例(17.76%),各病毒阳性率分别为呼吸道合胞病毒(RSV)8.63%、腺病毒(ADV)1.49%、流感病毒A(IVA)1.99%、流感病毒B(IVB)1.24%、副流感病毒(PIV)Ⅰ1.35%、PIVⅡ0.41%、PIVⅢ2.66%。检出肺炎支原体阳性750例(10.13%)。(2)不同性别呼吸道病毒感染差异无统计学意义(χ2=0.746,P0.05),而不同年龄及季节呼吸道病毒感染差异有统计学意义(χ2=58.124,P0.01;χ2=428.724,P0.01)。(3)检出病毒混合感染阳性标本17例(0.23%)。单一病毒合并肺炎支原体感染168例(13.11%),IVA、IVB及PIVⅡ型感染合并肺炎支原体感染率较高,分别为18.75%、25.27%和17.86%。结论儿童呼吸道病毒感染率与年龄和季节密切相关,且病毒感染后患儿合并肺炎支原体感染率较高。     

湘潭地区6537例呼吸道感染儿童病毒抗原七联检的结果分析

目的 通过对2020年至2021年湘潭市中心医院就诊的6 537例急性呼吸道感染儿童(0～14岁)行抗原检测,回顾性分析各类病毒在我院就诊儿童呼吸道感染中的分布情况,为儿童呼吸道感染的早期诊治提供流行病学依据;同时与2020年之前两年的感染情况进行对比,分析近两年病原体检出率与既往的变化。方法 采集患儿鼻咽拭子,采用直接免疫荧光法(DFA)检测7种呼吸道病毒抗原,包括A型流感病毒(FluA)、副流感病毒1型(PIV1)、B型流感病毒(FluB)、副流感病毒3型(PIV3)、副流感病毒2型(PIV2)、呼吸道合胞病毒(RSV)和腺病毒(ADV)。结果 6 537例急性呼吸道感染患儿中,1 289例呼吸道病毒抗原检测结果为阳性,阳性率为19.15%,其中两项检测结果同时为阳性7例。以合并RSV感染最常见,占总阳性标本的0.54%;阳性率最高的是RSV(10.63%),其次为PIV 1(3.44%), PIV 3(2.29%),Flu B(1.48%),Flu A(0.67%), ADV(0.52%),PIV2(0.12%)。小于1岁组与1～4岁组、4～7岁组、7～14岁组儿童七项检出率比较...     

人肠道病毒D68型在儿童急性呼吸道感染中的临床特征与分子生物学特征分析

目的 了解人肠病毒D68 (EV-D68)在儿童急性呼吸道感染(acute respiratory tract infection,ARTI)中的临床特征及分子流行病学特征. 方法 采集2014年3月至2016年3月年深圳市妇幼保健院住院及门诊年龄1月至14岁符合急性呼吸道感染(ARTI)患儿共13 472份咽拭子分泌物,使用EV通用核酸试剂盒进行肠道病毒检测,EV病毒通用核酸阳性标本通过RT-PCR扩增并测序分型. 结果 在13 472份鼻咽部拭子标本中,EV阳性病例1 222例,阳性率为9.10％,EV-D68感染患儿7例,阳性率0.05％,其VP1扩增序列分离的5株D68均与进化簇1病毒序列具有高同源性,2例与进化簇2有高同源性. 结论 EV-D68可能是急性呼吸道感染的一种新的主要病原体,感染高峰季节可能在秋冬季节,以急性下呼吸道感染(acute lower respiratory tract infections,ALRTI)为主要表现.