广东省非综合征耳聋患者GJA1基因及常见耳聋基因突变分析

目的:研究广东省非综合征耳聋患者常见耳聋基因突变的发病情况.方法:对来自广东省某特殊学校的73例非综合征感觉神经性耳聋患者采集外周血,对GJA1、GJB2、GJB3、SLC26A4、mtDNA12S rRNA基因编码区进行测序.结果:73例患者中检测到GJB2基因突变235delC 5例;GJB3基因突变547G＞A 1例;SLC26A4基因突变IVS7-2 A＞G 7例,2168A＞G杂合突变1例;mtDNA 12S rRNA纯合突变3例.结论:本研究为19.18％的研究对象明确了分子病因;GJB2基因突变不是本研究的主要致病基因,SLC26A4为最常见的耳聋突变基因;未检测到GJA1基因突变.     

HRM筛查PROC基因突变方法的建立和应用

目的 利用高分辨率熔解曲线(HRM)结合PCR技术,建立遗传性蛋白C缺陷症患者的蛋白C基基因(PROC)突变筛查方法.方法 收集仁济医院2010年4月～2011年6月收治的9例蛋白C缺陷的静脉血栓患者(经测序PROC基因均已知)及其6例确认有PROC基因缺陷的患者家属DNA标本,通过设计HRM引物,用已知PROC突变的DNA标本进行构建,建立PROC基因外显子1,2,3,7,8突变HRM筛查方法.同时对3例疑似PROC基因缺陷患者,进行该方法的验证.结果 PROC基因外显子1,2,7,8区,突变体与野生型通过HRM图形可进行区分.对3例疑似PROC基因缺陷标本,HRM均筛查出突变,经测序2例为相同外显子7区杂合突变c.565C＞T,合并外显子2区杂合同义突变c.66T＞C,另1例为外显子7区杂合缺失c.577～579del,合并外显子1区多态性位点rs1799810 A＞T.综合统计15例已知标本和3例验证标本,HRM对于PROC基因外显子1,2,7,8区准确度分别为100％,94.4％,100％和91.7％.外显子3区由于缺乏突变病例,无法构建,改为直接测序法.结论 该研究建立了HRM结合直接测序法筛查PROC基因变异的方法.该方法能较快速、方便、经济地筛查PROC变异,适用于遗传性PC缺陷症基因诊断.     

原发性开角型青光眼家系的MYOC基因突变研究

目的 对来自重庆地区的1个原发性开角型青光眼(POAG)家系进行MYOC基因突变筛查,研究POAG与MYOC基因突变的相关性,探讨MYOC基因突变在中国人POAG发病中的作用.方法 1个4代共39例的青光眼家系,8例为已确诊患者,健康对照者100名.用单链构象多态性分析(SSCP)、PCR.限制性片段长度多态性(RFLP)和基因测序的方法筛选MYOC基因的突变(包括G34C、C136T、G144T、G227A、C624G、G736A、C1009G、A1036G、C1081T、G1099A、G1138A、A1139C、T1430A、C1441A和C1442T等),同时对检测到的突变结果进行生物信息学分析.结果 在该家系中,发现1个G227A(Arg76Lys)突变,该突变存在2例已确诊的POAG患者和1例家系表型正常者中,健康对照者中未榆出.发现1个缺失突变(C1009del),该突变存在于家系中所有发病患者和1例4岁的子代亲属,健康对照者中未检出.未发现其他突变.由于C1009del突变是首次发现,据此我们申请了GenBank号,已发表的GenBank序列号为FJ237047,对应的蛋白序列号为ACI62293.结论 G227A(Arg76Lys)突变为已报道的多态性位点,与该家系青光眼的发病无相关性.移码突变C1009del突变与青光眼的发病密切相关,也可由此推测青光眼患者亲属的发病率较正常人高.     

应用变性高效液相色谱技术检测肥大细胞病c-kit基因突变

本研究检测7例肥大细胞病患者c—kit基因激酶编码区突变情况，以探讨该基因变异在肥大细胞病诊断及治疗中的意义。应用PCR测定、变性高效液相色谱技术及DNA测序方法对患者进行c—kit基因外显子17～外显子19突变检测。结果表明：1例患者外显子17扩增产物在DHPLC中出现异常色谱峰，测序结果显示在外显子17出现A→T突变，即D816V；另2例患者外显子18／19经DHPLC检测，结果显示1个额外的色谱峰，测序结果证实在外显子18出现G→C改变，为同义突变L862L。结论：变性高效液相色谱技术是一种高效、可靠的突变检测方法，c—kit基因突变检测对肥大细胞病临床治疗有指导意义。     

沧州市非综合征性耳聋患者常见耳聋基因突变的分析

目的：筛查沧州市非综合征青少年耳聋患者常见耳聋基因热点突变,初步了解该地区耳聋基因热点发生频率和突变谱系。方法对沧州市特殊教育学校的30例非综合征感觉神经性耳聋患者采集外周血5 mL,通过基因芯片检测技术对GJB2、GJB3、SLC26A4、线粒体12SrRNA基因20个位点进行测序。结果30例患者中共检出耳聋基因热点突变阳性者6例,阳性率为20%。其中GJB2基因突变235delC纯合突变2例,235delC杂合突变1例,299-300delAT 杂合突变1例, SLC26A4 IVS7-2A〉G 纯合突变1例,SLC26A4IVS7-2A〉G 合并 IVS7-2A〉G 杂合突变1例。结论 GJB2基因突变是引起非综合征性耳聋的主要致病基因,SLC26A4为最常见的耳聋突变基因。未检测到线粒体12SrRNA基因突变。     

1例成骨不全患者Ⅰ型胶原基因突变的检测

目的对1例成骨不全(OI)患者Ⅰ型胶原基因(COL1A1和COL1A2)进行基因突变检测,为研究中国人群的OI基因突变特点提供线索。方法患者具有OI典型的蓝巩膜、易骨折、牙本质发育不全等临床表现,临床诊断为OI,提取患者外周血基因组DNA,对所有启动子区、外显子及外显子-内含子边界区进行DNA测序,通过序列特异引物PCR(PCR-SSP)法进一步验证,以患者的父母、妹妹及200例体检健康者作为对照。结果 DNA测序结果显示,OI患者COL1A1基因45号外显子发生单核苷酸替代突变(c.3263 GA,p.Gly1088Glu),而患者的父母、妹妹及200例健康对照者未发现相同的突变位点。同时PCRSSP也证明了此位点的杂合性。结论 c.3263 GA突变位点是一个OI患者COL1A1基因的新突变位点,与OI临床表型具有一定相关性。     

广西玉林特殊教育学校耳聋相关基因突变分析

目的 分析广西玉林地区耳聋患者相关致病基因突变,初步了解玉林地区耳聋患者发病的分子机制.方法 对玉林地区2个特殊教育学校191例耳聋患者进行分子病因信息采集,对6岁以上患者行纯音测听和声导抗进行听力评估;小于6岁的患儿行40Hz相关电位、畸变产物耳声发射(distortion product otoacoustic emission,DPOAE)和听性脑干反应(auditory brainstem response,ABR)进行听力评估.采集外周血4mL并提取基因组DNA,用耳聋基因微阵列芯片技术对4个致聋基因的9个突变位点(GJB2基因:c.35delG、c.235delC、c.176de116、c.299delAT;GJB3基因:c.538C＞T;SLC26A4基因:c.919-2A＞G、c.2168A＞G;线粒体DNA 12SrRNA基因:m.1494C＞T、m.1555A＞G)进行基因突变分析.结果 在28例耳聋患者中检出GJB2、SLC26A4和线粒体DNA 12SrRNA基因突变,总检出率为14.66％(28/191),其中GJB2基因c.235delC纯合突变3例,c.176_191de116和c.235delC复合杂合突变1例,c.235delC杂合突变2例,c.299_300delAT杂合突变合并SLC26A4基因c.919-2A＞G杂合突变1例;SLC26A4基因c.919-2A＞G纯合突变4例,c.919-2A＞G杂合突变13例,c.919-2A＞G和c.2168A＞G复合杂合突变2例;线粒体DNA 12SrRNA基因m.1555A＞G均质突变2例. 结论 广西玉林地区耳聋患者热点突变基因以SLC26A4基因最为常见.玉林地区耳聋患者的相关基因检出阳性率、GJB2基因、SLC26A4基因及线粒体DNA 12SrRNA基因的携带率均低于全国平均水平.     

糖尿病伴耳聋患者四例临床及线粒体基因分析

目的对4例2型糖尿病伴耳聋患者行线粒体基因测序,明确线粒体基因与临床表型之间的关系。方法对山东省内分泌与代谢病医院2014至2015年期间收治的4例有母系遗传糖尿病家族史伴耳聋的2型糖尿病患者进行研究,用聚合酶链反应对线粒体3069~3842片段进行直接测序,有突变或有意义者行线粒体全基因(除D环区外)测序,以明确是否有线粒体基因突变。结果在1例患者中发现有T3535C同义突变,由稀有密码子突变为常用密码子。对此患者进一步行线粒体全基因测序(除D环区外),发现G9053A、T10609C、C10920T、G13759A、G13928C、A15326G共6个错义突变。结论本研究发现了6个线粒体错义突变,其中C10920T突变与患者母系遗传糖尿病伴耳聋临床表型相关。     

β-珠蛋白基因新突变导致的β-珠蛋白生成障碍性贫血

本研究对1例轻型β-珠蛋白生成障碍性贫血患者的β-珠蛋白基因进行序列分析,寻找基因的致病突变。提取患者外周血基因组DNA,扩增全长β-珠蛋白基因,然后对扩增产物进行DNA测序。结果显示,患者的β-珠蛋白基因1号内含子存在杂合IVS-I-129(A→G)突变。结论:IVS-I-129(A→G)突变为剪接突变使未成熟的β-珠蛋白基因mRNA产生剪接异常,导致其后的β-珠蛋白基因翻译错误。该突变为首次报道。     

脱落细胞线粒体基因A1555G突变在诊断线粒体耳聋中的应用

目的用PCR-RFLP技术检测脱落细胞(尿液沉渣细胞和颊黏膜细胞)线粒体基因A1555G突变,探讨脱落细胞用于诊断线粒体基因突变相关耳聋的可行性。方法收集福建省某特殊教育学校126名聋哑学生和1个线粒体基因A1555G突变的遗传性耳聋家系6例患者外周血及尿液沉渣细胞和颊黏膜细胞,用PCR-RFLP技术筛查患者是否携带线粒体DNA A1555G突变,并与测序法进行比较。结果尿液沉渣细胞检测线粒体DNA A1555G突变的检出率最高(9/132),颊黏膜细胞和外周血细胞均为7/132。PCR-RFLP筛查结果与直接测序法基本相符。结论脱落细胞适用于耳聋相关线粒体DNA A1555G突变检测。     

Abraxas c.1082G＞A突变与中国散发性乳腺癌易感相关性研究

目的 通过对中国乳腺癌患者Abraxas c.1082G＞A点突变的检测,初步研究此突变基因在我国乳腺癌患者中的发生情况,探讨Abraxasc.1082G＞A突变与乳腺癌患者易感性的关系. 方法 利用PCR和DNA测序法对129例散发性乳腺癌患者的Abraxasc.1082G＞A突变进行检测. 结果 所有乳腺癌患者...     

难治性颞叶癫痫患者钠离子通道SCN1A基因突变分析

目的 对难治性颞叶癫痫(TLE)患者钠离子通道SCNlA基因进行序列分析,查找突变位点.方法 采用聚合酶链反应及测序技术对10例难治性TLE患者和50例健康者进行SCNlA基因26个外显子和部分侧翼内含子序列分析.结果 1例患者SCNlA基因外显子10检出1个同义突变c.1410 T＞C.在所有标本中另检出4个碱基突变,即c.1212 A＞G、c.965-21C＞T、c.1028+21 T＞C和c.1377+52 G＞A.结论 经查阅国内外相关文献及SCN1A突变数据库,c.1410 T＞C为新发现的突变,其他4个碱基突变为多态性.     

早发糖尿病合并肝囊肿家系肝细胞核因子1β基因的突变研究

目的探讨早发糖尿病合并肝囊肿家系临床表型与肝细胞核因子(hepatocyte nuclear factor,HNF)1β基因突变的关系,以明确糖尿病合并肝囊肿与青少年起病的成人型糖尿病(MODY)5亚型的关系。方法采集9例早发糖尿病合并肝囊肿家系先证者及16例健康对照者外周血样,提取基因组DNA,应用聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)技术对HNF1β基因序列扩增并测序分析,如先证者发现突变,则进一步对其家属进行研究。结果 9例先证者均未发现HNF1β基因编码区突变,但发现6种非编码区多态性,分别为:IVS7-115G>A,IVS8+102G>A,IVS8+155delA,IVS9-22T>C,+99A>C,+100G>A。其中+99A>C仅见于一个先证者及其子,在对照组没有发现;余5种多肽变异同时出现在患病组和健康对照组。结论该9个早发糖尿病合并肝囊肿家系不是MODY5家系。HNF1β基因下游调控序列+99A>C变异可能与早发糖尿病合并肝囊肿相关。     

1例遗传性多发性外生骨疣家系的EXT基因突变检测

摘要：目的：对1例遗传性多发性外生骨疣(hereditary multiple exostoses, EXT)家系的EXT1和EXT2基因编码序列进行突变检测,寻找引起该病的致病基因突变。 方法：利用与 EXT1、EXT2紧密连锁的短串联重复序列（short tandem repeat, STR）对该家系进行连锁分析,确定候选基因,用PCR-测序法对候选基因的编码区及外显子与内含子交界处进行突变分析。 结果：DNA测序分析发现,先证者致病基因EXT2第3外显子有一新的637G>A无义突变,致使编码第192位的氨基酸的密码子提前出现终止密码,使编码蛋白成为只有191个氨基酸的截断型蛋白,其余外显子未发现突变。家系调查发现,该突变来自于先证者父亲。先证者EXT1基因未发现变异。 结论：EXT2基因637G>A突变是导致这个家系发生多发性骨疣的分子机制。     

中国汉族人FUT2基因点突变初步研究

目的　了解中国汉族人分泌型基因 (FUT2 )点突变的情况。方法　采用直接测序法及分子克隆测序法对 4 1名中国汉族个体的FUT2基因进行检测 ,并与Kelly报道的分泌型基因的序列作比较分析。 结果　 4 1名中国汉族个体中未见G4 2 8A突变 ,但发现A385T和C35 7T突变 ,其中 2 4人有A385T突变 ,17人无A385T突变 ,而所有个体都有C35 7T的同义突变。结论　在 4 1名中国汉族人群中没有发现在非洲和高加索人非分泌型中常见的G4 2 8A点突变 ,但存在着A385T、C35 7T两种不同于白种人的FUT2基因点突变。     

口周色素沉着-肠道息肉综合征STK11基因突变检测研究

[目的]研究1例口周色素沉着-肠道息肉综合征( PJS)患者STK11基因的突变.[方法]收集1例PJS患者血样,采取聚合酶链反应(PCR)结合DNA直接测序的方法,检测了该患者及其父母和50例无亲缘关系健康个体的STK11基因突变情况.[结果]检测到该患者存在STK11基因(I)VS1+1G＞A突变,而在其父母及正常对照者中均未发现该突变.[结论]本研究中PJS患者STK11基因1号外显子存在的剪切位点突变,这可能是导致STK11发病的分子机制之一.     

原发性肝癌表皮生长因子受体突变的研究

目的 对原发性肝癌患者EGFR基因进行检测,分析EGFR基因突变与原发性肝癌及患者年龄组成的关系. 方法 对2507例确诊原发性肝癌的石蜡包埋组织样本用PCR扩增法和双向测序法检测EGFR基因突变状态. 结果 2507例患者仅检测出620例(24.74％)EGFR基因20外显子同义突变Q787Q (2361G＞A)和263例(10.49％) 19内含子点突变(2284-60T＞C);EGFR基因突变与患者性别、病理类型无关(P＞0.05),与患者的年龄段组成明显相关(P＜0.05),且基于年龄段的分布,20外显子突变与19内含子突变呈显著正相关(P＜0.05). 结论 本研究中未发现EGFR基因热点突变.同义突变位点Q787Q尚存在进一步需要被证实的功能.20外显子突变和19内含子突变与患者年龄分布有明显相关性,可为原发性肝癌患者提供更具体的个体化治疗方案.     

高甘油三酯血症患者脂蛋白脂肪酶基因检测意义

目的探讨脂蛋白脂肪酶（1ipoproteinlipase,LPL）基因突变与高甘油三酯血症的相关性。方法采用Primer5．0软件针对I。PI,基因分片段设计特异性引物。高甘油三脂血症患者12例,抽取外周静脉血提取基因组DNA,扩增LPI。基因1～9号外显子及相邻部分内含子,进行核苷酸测序,并与LPI。基因全序列进行比对分析。结果12例患者中1例LPL基因第4外显子存在错义杂合突变;1例I。PL基因第8外显子存在同义杂合突变;8例LPI。基因第6内含子5’端的几个位点处发生相同的碱基置换（1388＋73T〉G,1388＋108G〉A,1388＋82C〉A）;2例患者未检出核苷酸变化。结论I．PL基因缺陷与高甘油三脂血症密切相关,LPL基因检测可用于临床上有遗传倾向的严重高甘油三脂血症患者的基因诊断。     

等位基因特异PCR结合熔解曲线分析快速检测线粒体DNA A1555G突变

目的建立一种线粒体DNA A1555G突变的快速检测方法。方法以45例线粒体耳聋患者为研究对象,采用等位基因特异PCR结合熔解曲线分析对线粒体DNA A1555G突变位点进行检测,根据得到的熔解曲线分析线粒体DNA A1555G突变。并与PCR产物直接测序法结果进行比较。结果线粒体DNA A1555G同质性突变时只出现一个峰且峰尖所对应的Tm为(82±0.5)℃;线粒体DNA A1555G未发生突变时只出现一个峰且峰尖所对应的Tm为(79±0.5)℃;线粒体DNA A1555G异质性突变时出现2个峰且各自峰尖所对应的Tm为(82±0.5)℃和(79±0.5)℃。45例样本的检测结果与PCR产物直接测序法的结果符合率达100%。结论等位基因特异PCR结合熔解曲线分析具有操作简便、结果准确、快速等特点,可作为线粒体DNA A1555G突变检测的常规方法。     

1个X-连锁迟发性脊椎骨骺发育不良家系的TRAPPC2基因突变分析

目的确定1个迟发性脊椎骨骺发育不良(spondyloepiphyseal dysplasia tarda,SEDT)家系的致病基因。方法收集先证者及家系的临床资料,提取先证者及亲属外周血DNA,用高通量测序技术对先证者的COL2A1、COL1A1、MATN3、TRAPPC2、FGFR3等189个骨骼相关基因的外显子编码区测序,对发现的致病突变进行Sanger测序验证,并对家系其他成员进行该突变的检测。结果在先证者TRAPPC2基因第5外显子上发现了1个移码突变c.271_275del CAAGA半合子缺失,为X-SEDT的致病性突变,同时发现患者母亲为该突变的携带者,而患者父亲和妹妹未检测到该突变。结论用靶向二代测序和Sanger测序结合的方法确定了1个X-SEDT家系的移码突变c.271_275del CAAGA半合子缺失,为临床遗传咨询提供了分子依据。