先天性眼外肌纤维化一家系致病基因的连锁分析

目的分析一个中国人先天性眼外肌纤维化(congenital fibrosis of extraocularmuscles,CFEOM)家系的临床表型,并通过基因连锁分析的方法对该家系的致病基因进行定位研究。方法收集一个CFEOM家系,对家系所有成员进行详细的临床检查。确定其临床表型及遗传方式后,在位于11号染色体的已知CFEOM基因附近选取微卫星标记物进行连锁分析。运用MILINK软件计算最大优势对数LOD值。结果该家系的遗传方式为常染色体隐性遗传,家系中的5例患者均表现为典型的眼外肌纤维化特征。与该家系连锁的染色体微卫星标记物为D11S4151和D11S1320,其最大的LOD值为1.21。结论此家系为常染色体隐性遗传型CFEOM2型,其致病基因位于11号染色体的D11S4151和D11S1320之间,位于该区间内的已知基因PHOX2A/ARIX的突变可能是导致该家系致病的分子基础。     

先天性眼组织缺损一家系基因排除定位研究

目的对1个3代常染色体显性遗传性先天性眼组织缺损家系进行致病基因的定位。方法对家系所有成员进行详细的临床检查,排除其他系统疾患。提取家系成员外周血DNA,选取20个位于4、7、10、11号染色体上已知与先天性眼组织缺损相关的4个致病基因及已知基因位点20q13.1附近的微卫星标记物进行多重PCR扩增,经ABI3130型遗传分析仪,Genscan2.1收集数据,Genotyper2.1进行基因分型,Linkage软件计算两点LOD值。研究过程遵循赫尔辛基宣言。结果未发现所选微卫星位点与该家系疾病表型共分离,LOD值均为负值。致病基因与已知的先天性眼组织缺损候选基因不存在连锁关系。结论该家系的遗传与目前已知的致病基因无关,是否存在新的致病基因有待进一步研究。     

常染色体显性视网膜色素变性家系基因定位的研究

目的 对一个常染色体显性视网膜色素变性大家系进行基因定位。方法 收集视网膜色素变性家系,并对该家系成员进行详细眼部检查;抽取外周血3－5ml并提取DNA;采用多个已知遗传标记与该家系致病基因位点进行连锁分析。结果 两点连锁分析结果显示该家系致病基因位点与遗传位标D3S1292连锁,在θ＝0．1时间到最大LOD值2．73。结论 D3S1292位于3号染色体长臂2区1带（3q21),从而将该家系致病基因位点大致定位于3q21附近。同时有文献报道视紫红质基因位点也位于3q染色体上,且与D3S1292邻近,因此该家系的致病基因很可能是视紫红质基因。     

东北地区一遗传性白内障家系的临床遗传学及基因定位研究

目的:分析一先天性核型白内障家系的遗传方式及致病基因所在位置。方法:收集一个3代遗传性白内障家系成员的临床资料;提取家系成员外周血DNA,选取62个态性微卫星标记进行连锁分析。应用LINKAGE软件(version 5.2)中的MLINK程序计算两点连锁LOD值,并人工构建家系成员的单体型。结果:确定该家系为一常染色体显性遗传性白内障大家系,在微卫星标记D22S689可获得最大LOD值2.71(θ=0时),单体型提示该家系表型可能与染色体22q11.2-12.1区域连锁。该区域含有CRYBB1,CRYBB2,CRYBB3,CRYBA44个候选基因。结论:本研究先天性核型白内障家系符合常染色体显性遗传规律,其致病基因定位于22q11.2-12.1区域。     

先天性广泛眼外肌纤维化综合征一家系临床表型及基因连锁定位分析

目的 分析一个先天性广泛眼外肌纤维化综合征(CFEOM)家系的临床表型，并通过连锁分析方法来定位该家系的致病基因。方法 对家系中的所有患者进行临床检查。根据目前已知的两种常染色体显性遗传类型的CFEOM的遗传学位点12p11．2-q12(FEOM1)和16q24(FEOM3)选取微卫星进行连锁分析研究。结果 家系中4名患者具有典型的CFEOM表现。连锁分析显示，微卫星D12S59、D12S1048、D12S1648在所有患者中与疾病呈现共分离现象，其中D12S1048最大Lod值为1．91，而在微卫星D12S61和D12S1090处出现重组，表明该家系的致病基因位于这两个微卫星之间。结论此家系属常染色体显性遗传的CFEOM 1型，其致病基因定位于12p11．2-q12的D12S61和D12S1090之间。     

常染色体显性遗传白内障一家系基因排除定位研究

目的 对一个4代常染色体显性遗传性先天性白内障（ADCC）家系进行致病基因的定位。方法 对家系所有成员进行眼部检查。选取位于1、2、3、10、11、12、13、16、17、21及22号染色体上已知与ADCC相关的14个致病基因附近的微卫星标记物，并进行多重PCR扩增，经ABI3130型遗传分析仪，Genscan 2．1收集数据，Genotyper 2．1进行基因分型，Linkage软件计算两点LOD值。结果 未发现所选微卫星位点与该家系疾病表型共分离，LOD值均为负值。致病基因与已知的ADCC14个候选基因不存在连锁关系。结论 在此家系中存在新的致病基因有待于进一步的研究。     

Avellino角膜营养不良家系致病基因的定位研究

目的：对收集到的一个常染色体显性遗传性Avellino角膜营养不良家系的致病基因进行初步定位。
　　方法：采集家系中所有成员的外周静脉血,从中提取基因组DNA样本。在热点区域内选取微卫星标记进行基因扫描,分别利用LINKAGE软件和CYRILLIC软件进行连锁分析及单体型分析,以确定候选基因所在的染色体区域。
　　结果：该Avellino角膜营养不良家系的连锁分析结果在D5 S396和D5 S393这两个微卫星标记处获得最大优势对数计分(LOD)值,Zmax=3.01(θ=0.00)。单体型分析将致病基因定位于微卫星标记D5 S808和D5 S638之间。
　　结论：该Avellino角膜营养不良家系的致病基因初步定位于染色体5q上的遗传距离约为11.2厘摩( cM)的一段区域内。     

常染色体显性遗传性白内障一家系的临床遗传学及基因定位研究

目的 鉴定导致一个4代遗传性核性白内障大家系的遗传学缺陷.方法 详细收集家族史及临床资料.提取所有家系成员外周血DNA,应用微卫星标记进行基因型建立,并应用连锁分析软件包进行连锁分析.结果 在微卫星标记D1S1 156(LOD score[z]=2.36,recombination fraction[θ]=0.00)和D1S514(LOD score[z]=2.12,recombination frac-tion[θ]=0.00)得到有意义的连锁结果 .单倍体图形的建立显示致病基因位于D1S2 888和D1S3 466之间40 Mb的区域内.该区段内含有位于1q21-25编码缝隙连接蛋白50的GJA8.结论 本研究家系的遗传性核性白内障发生符合常染色体显性遗传规律,并将导致这个大家系发生常染色体显性遗传性白内障的致病基因定位在1q21-25的40 Mb范围内.     

先天性广泛眼外肌纤维化综合征一家系的连锁分析和候选基因研究

目的探讨先天性广泛眼外肌纤维化综合征(CFEOM)一家系的临床表型特征和致病基因。方法收集CFEOM一家系,对全部患者进行临床检查和全基因组扫描及连锁分析(1inkage analysis),对连锁区域内的候选基因KIf21A进行基因序列分析。结果此家系中4例患者具有典型CFEOM临床表现。连锁分析显示微卫星标记物D12S1648、D12s345、D12S1692、D12S59、D12S1090、D12S2194、D12S1048、D12S1668在家系中与全部患者的疾病表型共分离,并在D12S1090取得最大LOD值(2．12)。KIf21A基因测序未发现突变,仅在外显子21发现一单个碱基多态性改变。结论此家系属常染色体显性遗传CFEOM1型,致病基因定位于染色体带12p11．2-q12微卫星标记物D12S1648和D12S1668之间约4cM的区域。KIF21A基因可能不是此家系的致病基因。(中华眼科杂志,2005,41：594-599)     

两个先天性珊瑚状白内障家系CRYGD基因P23T突变的检测

背景先天性白内障的致病基因及临床表型具有明显的异质性,通过连锁分析进行基因定位,直接测序法筛选致病基因是目前常用的分析方法。目的对2个先天性珊瑚状白内障家系（CCl和CC2）进行致病基因研究。方法收集确诊为常染色体显性遗传的2个先天性珊瑚状白内障家系17名成员的外周静脉血各5ml,包括ll例患者、4名正常成员和2名配偶,提取基因组DNA。选取与已知常染色体显性遗传先天性白内障相关的位点进行基因组扫描,利用微卫星标记物进行PCR扩增并进行序列分析。采用两点法计算LOD值对致病基因进行连锁分析。采用直接测序法对候选致病基因以及3个单核苷酸多态性（sNP）位点（rs2305429,rs2305430,rs2242074）进行序列分析。利用SNP对2个家系的先证者进行单体型分析。结果CCl和CC2家系中的先证者裂隙灯下均可见双眼晶状体核中央混浊区呈珊瑚状,经两点法计算LOD值,家系CCl在微卫星位点D2S325获得的最大LOD值为3．28,而CC2家系在D2S325获得的最大LOD值为1．50,连锁分析结果支持2个家系均与位于2q的候选致病基因CRYGC和CRYGD连锁。基因序列分析发现2个珊瑚状白内障家系均携带CRYGD基因c．C70A．（P．P23T）突变体,而2个家系中的正常人及100名正常对照则无此基因突变。2个家系先证者携带不同类型的单体型结构。结论CRYGD基因C．C70A．（P．P23T）突变是导致2个不同祖先来源的先天性珊瑚状白内障家系CCl和CC2致病的丰要原因。     

先天性白内障一家系全基因组扫描基因定位及候选基因序列分析

目的应用全基因组扫描、连锁分析的方法对常染色体显性遗传性先天性白内障（ADCC）一家系进行基因定位、寻找候选基因并进行突变筛查。方法提取该家系成员外周血DNA,进行全基因组扫描。在ABI 3130-avant全自动遗传分析仪上读取370对微卫星标记物的等位基因片段大小,并采用Genescan 3.1和Genotyper 2.0软件进行两点法计算LOD值并构建单体型。根据连锁分析的结果,对该区域内在晶状体中呈高表达,且对维持晶状体纤维细胞的分化状态起重要作用的基因-BFSP1进行直接的序列分析。结果该家系的致病基因位于20p12-20p11.2的13.96 cm区域内。在该区域内的基因-BFSP1全部外显子及外显子与内含子交界处均未发现任何突变。结论首次将一常染色体显性遗传绕核型先天性白内障家系的致病基因定位于20p12-20p11.2的13.96 cm区域内。     

遗传性核性金黄色结晶样白内障患者γ晶状体蛋白基因错义突变

目的确定中国北方常染色体显性遗传性白内障（ADCC）-家系的致病基因。方法收集ADCC-家系资料,提取血液白细胞DNA,运用微卫星位点多态性连锁分析,对提示连锁的染色体区域内的候选基因测序,寻找突变。结果该家系致病基因定位在2q33．3-34区域内,对其候选基因γ晶体蛋白基因簇各基因进行测序,发现γD晶体蛋白基因第二外显子有一个杂合子的错义突变（109C→A）与家系患者共分离,此突变可导致其编码的第36位精氨酸被丝氨酸取代。结论此γ晶体蛋白基因突变引起该家系核性结晶样先天性白内障,是由1D晶体蛋白基因109C→A（R36S）突变引起的。（中华腰群杂志,2006,42：913—917）     

视网膜色素变性显性遗传家系3号染色体连锁分析

目的：用连锁分析法对三个显性视网膜色素变性家系(CY、WN、ZH)3号染色体进行分析，确定致病基因。方法：随机选取3号染色体视紫红质(rhodopsin，RH0)基因上下约5厘摩(centimorgan cM)范围内的6对微卫星标记(marker)，确立单倍体型，用两点法计算最大优势对数(LOD SCORE)值。结果：所选微卫星标记与CY、WN家系表型间LOD值呈负相关关系，而ZH家系与位点D3S3606间LOD值为2．52。结论：RH0基因为CY、WN家系的非候选基因，RHO基因可能是家系ZF致病基因。     

常染色体显性先天性白内障一家系致病基因的连锁分析

背景先天性白内障约1／3的病例是由遗传所致,已发现遗传性白内障有着极为明显的遗传异质性,了解先天性白内障的致病基因对其基因治疗极为重要。目的分析一个具有常染色体显性遗传特点的先天性白内障家系的临床表型特征,进行已知致病基因的筛查定位。方法对遗传性先天性白内障一家系共16名成员眼部进行详细的临床检查,包括6例患者,确定为本家系白内障患者的临床表型。收集其中11名家系成员的血液样本提取DNA,包括3名正常家系成员及其配偶、5例患者。利用连锁分析进行排除定位,并采用Schuelke报道的新方法,只合成普通引物及一种荧光标记的通用引物M13,进行聚合酶链反应（PCR）,对连锁区域内的候选基因进行基因序列分析。结果本家系的白内障遗传方式符合常染色体显性遗传特征。基因连锁分析表明,在D22S315得到最高LOD值为1．20,在D16S3068得到LOD值为0．6。CRYBB2基因所有编码区及外显子与内含子交界处未发现基因序列突变。结论本家系初步排除了CRYBB2基因与此家系先天性白内障的相关性。对这个家系的基因定位需要更进一步的全基因组扫描,以发现致病基因在染色体上的可疑区间。连锁分析中进行微卫星位点的PCR扩增时,利用合成荧光标记的通用引物M13,可以显著降低成本,并取得同样的实验结果。     

A clinical and molecular genetic study of a rare dominantly inherited syndrome (MRCS) comprising of microcornea,rod-cone dystrophy,cataract, and posterior staphyloma

AIM: To phenotype and genetically map the disease locus in a family presenting with autosomal dominant microcornea, rod-cone dystrophy, cataract, and posterior staphyloma. METHODS: Six affected and three unaffected members of the pedigree were examined. All individuals provided a history and underwent a full clinical examination with A-scan and B-scan ultrasonography and electrophysiological testing where appropriate. PCR based microsatellite marker genotyping using a positional candidate gene approach was then performed on DNA samples extracted from venous blood provided by each subject. RESULTS: The disorder is inherited as an autosomal dominant trait with variable expressivity and has a complex phenotype. Affected individuals had bilateral microcornea, pulverulent-like lens opacities, a rod-cone dystrophy and posterior staphyloma (MRCS). Using a positional candidate gene approach, the authors have evidence suggestive of linkage of this disorder to a region on 11q13 within the nanophthalmos 1 (NNO1) genetic interval. The small family size militates against achieving a LOD score of 3, but the haplotype data and the position of the putative MRCS locus within a known nanophthalmos locus are suggestive of linkage. A candidate gene within this region (ROM1) was screened and no mutations were found in affected members of the family. CONCLUSION: This rare developmental disorder has some phenotypic similarities to nanophthalmos and possibly maps to a locus within the genetic interval encompassing the NNO1 locus. Screening of candidate genes within this region continues.     

The benign concentric annular macular dystrophy locus maps to 6p12.3-q16

PURPOSE: To describe the clinical findings and to identify the genetic locus in a Dutch family with autosomal dominant benign concentric annular macular dystrophy (BCAMD). METHODS: All family members underwent ophthalmic examination. Linkage analysis of candidate retinal dystrophy loci and a whole genome scan were performed. Five candidate genes from the linked locus were analyzed for mutations by direct sequencing. RESULTS: The BCAMD phenotype is initially characterized by parafoveal hypopigmentation and good visual acuity, but progresses to a retinitis pigmentosa-like phenotype. Linkage analysis established complete segregation of the BCAMD phenotype (maximum multipoint LOD score, 3.8) with DNA markers at chromosome 6, region p12.3-q16. Recombination events defined a critical interval spanning 30.7 cM at the long arm of chromosome 6 between markers D6S269 and D6S300. This interval encompasses several retinal dystrophy loci, including the ELOVL4 gene, mutated in autosomal dominant Stargardt disease, and the RIM1 gene, mutated in autosomal dominant cone-rod dystrophy, as well as the retinally expressed GABRR1 and -2 genes. Mutation screening of these four genes revealed no mutations. Sequence analysis of the interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 gene IMPG1, also residing in the BCAMD locus, revealed a single base-pair change (T-->C) of nucleotide 1866 in exon 13, resulting in a Leu579Pro amino acid substitution. This mutation was absent in 190 control individuals. CONCLUSIONS: Significant linkage was found for the BCAMD defect with chromosomal 6, region p12.3-q16. A Leu579Pro mutation in the IMPG1 gene may play a causal role.     

先天性前极白内障家系致病基因的定位与候选基因突变检测

目的 对中国一常染色体显性遗传先天性前极白内障家系进行致病基因的定位与候选基因突变检测.方法 采集家系成员外周静脉血,提取基因组DNA.选用ABI公司提供的约400个遗传标记物进行基因扫描.基因扫描分初步扫描和精细扫描两步进行.首先对已报道的先天性白内障候选区域进行初步扫描,之后在阳性区域内进行精细扫描.数据经连锁分析,初步确定致病基因所在染色体区域.在阳性区域内选取更高密度的荧光标记物进行精细扫描,并进行单体型分析.候选基因直接测序检测基因突变.结果 两点间连锁分析在微卫星标记D21S1252处获得最大对数优势计分(LOD)值Zmax=3.23(θmax=0.00).精细定位和单体型分析将致病基因定位于微卫星标记D21S263和D21S266之间,遗传距离约18.47厘摩(cM),染色体位置为21q22.11-q22.3.候选基因直接测序发现CRYAA基因第3外显子第347碱基一个G→A的点突变.结论 本研究将一中国先天性前极白内障家系的致病基因定位于21号染色体21q22.11-q22.3区域内,并在CRYAA基因发现一个点突变与此家系共分离.

Abstract：

Objective To map the gene mutation responsible for autosomal dominant inherited congenital anterior polar cataract in a Chinese family. Methods Peripheral blood samples were collected from the members in this congenital cataract family. DNA was extracted from the blood samples. A genescan was performed using approximately 400 microsatellite markers (ABI). Linkage analysis was processed to define the region of mutated gene. High density primers labeled with fluorescent stain for the positive region were adopted for fine targeting and haplotype analysis was performed. Mutation detection was carried out by sequencing candidate genes. Results The maximum two-point LOD score was obtained at D21S1252,Zmax = 3. 23 ( θmax = 0. 00). After fine targeting and haplotype analysis,the mutated gene was located within a 18. 47 cM region between D21S263 and D21S266 on chromosome 21q22.11 -q22.3. Direct sequencing of the candidate gene revealed a G→ A transition in exon 3 of CRYAA. Conclusion The present study has identified a missense mutation in CRYAA associated with congenital anterior polar cataract in a Chinese family.