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相似文献
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1.
目的:运用生物信息学方法探究GJB3基因在胰腺癌组织中的表达及潜在作用机制,并进一步验证其在胰腺癌组织中的表达水平及其临床意义。方法:利用GEPIA在线数据库分析GJB3在胰腺癌组织中的表达及对预后的影响;从TCGA数据库下载有关GJB3基因的临床样本表达数据,分析GJB3表达与胰腺癌临床病理参数的相关性;采用实时荧光定量PCR法测定15例胰腺癌组织及其癌旁组织中GJB3基因的表达水平,结合数据库临床病理参数分析其表达水平对胰腺癌患者预后的影响。随后通过慢病毒介导的RNA干扰来沉默AsPC-1细胞株中的GJB3表达,进一步检测胰腺癌细胞增殖能力及细胞周期所受到的影响。结果:GJB3在胰腺癌组织中的表达量高于正常胰腺组织(P<0.05)。与低表达患者相比,GJB3高表达患者的总体生存期(P<0.05)和无病生存期(P<0.05)较差。GJB3基因的表达与胰腺癌患者的T分期和TNM分期显著相关(P<0.05)。GJB3在胰腺癌患者的癌组织中表达水平明显增高(P<0.05)。沉默GJB3表达后,胰腺癌AsPC-1细胞的增殖能力受到抑制(P<0.05)。结论:GJB3基因在胰腺癌组织中的表达水平显著增高,与胰腺癌不良的预后相关,沉默GJB3能抑制胰腺癌细胞增殖,同时GJB3可能通过影响细胞周期加速胰腺癌的进展。  相似文献   

2.
目的:研究骨髓瘤过表达基因(MYEOV)对胰腺癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响,以及对上皮间质转化(EMT)相关蛋白和STAT3信号通路相关蛋白的调控作用。方法:利用UCSC Xena数据库分析MYEOV在胰腺癌及正常组织中的表达水平,利用ICGC数据库分析MYEOV与胰腺癌患者预后的关系。使用慢病毒重组构建稳定低表达MYEOV的胰腺癌PaTu8988细胞系,运用实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)检测胰腺癌细胞系中MYEOV mRNA和蛋白的表达情况,采用CCK-8、划痕实验、Transwell迁移及侵袭实验分析细胞的增殖、迁移、侵袭能力。利用Western blot方法检测E-cadherin、Vimentin、MMP2、MMP9、STAT3、p-STAT3的表达情况。结果:经生物信息学分析发现,MYEOV在胰腺癌组织中高表达,且与胰腺癌预后不良有关。与对照组比较,下调MYEOV后胰腺癌细胞株PaTu8988的增殖、迁移和侵袭能力降低;与对照组比较,下调MYEOV后胰腺癌PaTu8988细胞系中E-cadherin蛋白表达水平升高,Vimentin、MMP2、MMP9、p-STAT3蛋白表达水平下降。结论:下调MYEOV的表达抑制胰腺癌细胞的增殖、迁移、侵袭,其机制可能与抑制EMT过程有关,而STAT3通路蛋白在EMT发生过程中出现改变,提示STAT3通路可能参与了该表型的调控。  相似文献   

3.
裴磊  节阳华  胡悦  朱玲  王宁 《实用癌症杂志》2022,(11):1813-1816
目的 利用生物信息学方法分析桥粒斑菲素蛋白3(PKP3)在胰腺癌中的表达、与其预后关系和生物学功能。方法 利用GEPIA数据库中数据,分析不同组织中PKP3蛋白表达差异。通过String和Webgestalt数据库分析与PKP3蛋白表达相关的蛋白及其生物学功能。结果 相比于癌旁组织,PKP3蛋白在胰腺癌组织中呈高表达(P<0.01)。在不同病理分期胰腺癌组织中PKP3蛋白表达无明显差异(P>0.05)。与PKP3低表达组相比,PKP3高表达组OS及DFS均缩短(P<0.05)。与PKP3基因相关的蛋白主要位于细胞膜及囊泡中,参与细胞的多细胞生物进程、细胞发展过程的结合过程,在结合蛋白质、结合离子等方面发挥着作用。结论 PKP3蛋白异常表达与胰腺癌发生发展有关,该基因将来或许能成为胰腺癌的关键治疗靶点,但其发挥具体功能仍需进一步体外研究。  相似文献   

4.
目的:本研究旨在探究胰腺癌中长链非编码RNA 01089(LINC01089)/miR-27a-3p/TET1轴在胰腺癌进展中的作用及其机制。方法:通过GEPIA数据库分析LINC01089在胰腺癌中的表达及其与预后的相关性。使用定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)检测LINC01089、miR-27a-3p、TET1 mRNA在胰腺癌组织和正常组织中的表达;CCK-8、BrdU和划痕愈合实验检测LINC01089和miR-27a-3p对细胞增殖和迁移的影响。机制上,我们通过StarBase和TargetScan数据库预测、双荧光素酶报告基因验证LINC01089和miR-27a-3p、miR-27a-3p和TET1之间的调控关系。采用Western blot检测LINC01089和miR-27a-3p对TET1表达的影响。结果:GEPIA数据库显示LINC01089在胰腺癌中低表达,其低表达与患者整体生存期(overall survival,OS)和无病生存期(diease free survival,DFS)相关。本研究中,我们发现与正常组织相比,癌组织中LINC01089表达显著下调,并与患者不良预后相关;功能实验显示LINC01089抑制胰腺癌细胞的增殖和迁移。相关机制实验表明LINC01089通过吸附miR-27a-3p上调TET1的表达在胰腺癌中发挥抑制作用。结论:LINC01089通过靶向调控miR-27a-3p促进TET1的表达,从而抑制胰腺癌细胞的增殖和迁移。  相似文献   

5.
目的:分析胰腺癌组织和正常组织差异表达的miRNA,筛选与胰腺癌预后相关的生物标志。方法:下载并整理基因芯片表达汇编数据库(GEO)中GSE32678和GSE71533芯片数据集原始数据,应用R语言筛选差异表达miRNA,结合GSE24279数据集,获得差异表达的miRNA并取交集。应用生物信息学分析工具对交集miRNA进行靶基因预测,进而对靶基因进行功能分析,构建蛋白互作网络(PPI)、miRNA-mRNA调控网络、miRNA-mRNA-pathway调控网络,结合肿瘤基因组图谱数据库(TCGA)中胰腺癌样本的miRNA表达及预后数据,筛选出胰腺癌预后相关标志物。结果:共筛选出胰腺癌组织和正常组织22个交集miRNA,其中hsa-miR-30a-5p、hsa-miR-551a、hsa-miR-375与胰腺癌患者的生存预后密切相关。hsa-miR-125b-5p、hsa-miR-221-3p、hsamiR-31-5p、hsa-miR-222-3p、hsa-miR-10a-5p是miRNA-mRNA调控网络中的核心miRNA。结论:通过对GEO和TCGA数据库胰腺癌相关数据的分析发现hsa-miR-30a-5p、hsa-miR-551a、hsa-miR-375显著影响胰腺癌患者的预后,可以作为判断预后的标志。  相似文献   

6.
目的:通过生物信息学手段筛选乳腺癌中差异表达的关键miRNA及其靶基因,干预其在乳腺癌细胞中的表达并观察对乳腺癌细胞功能的影响.方法:利用GEO数据库筛选在乳腺癌中差异表达的miRNA,ENCORI数据库验证差异miRNA的表达,以选定最显著的差异表达miRNA为研究对象;利用Starbase、miRDB和miRWal...  相似文献   

7.
背景与目的:乳腺癌威胁着全世界女性的健康.虽然已发现大量微小RNA(microRNA,miRNA)在乳腺癌中异常表达,但仍需要构建一个完整的miRNA-信使RNA(messenger RNA,mRNA)网络.方法:利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载乳腺癌相关数据集,...  相似文献   

8.
目的:数据挖掘分析GALNT5在胰腺癌中的表达水平,并评价其与病理分期的关系及对预后的影响。方法:利用Oncomine和THPA等肿瘤生物信息学在线分析网站,挖掘大型癌症公共数据库TCGA中胰腺癌患者GALNT5基因的mRNA及蛋白质表达信息。基于Kaplan-Meier方法和Log-rank检验,利用 GEPIA 数据库分析GALNT5基因的表达水平与胰腺癌病理分期和预后之间的关系。String-DB数据库用于构建GALNT5基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络。结果:与正常胰腺组织相比,胰腺癌组织中GALNT5基因的mRNA和蛋白表达明显升高。GALNT5基因表达水平越高,肿瘤病理分期越高。生存分析表明,与低表达组相比,GALNT5高表达组胰腺癌患者的总生存期和无病生存期明显降低。蛋白质相互作用网络结果表明,GALNT5蛋白表达与黏蛋白家族成员密切相关。结论:胰腺癌组织中GALNT5基因的高表达表明胰腺癌患者预后较差,并且与肿瘤病理分期呈正相关。 GALNT5基因可能是将来治疗胰腺癌的潜在新靶标。  相似文献   

9.
目的 探究胰腺癌相关性成纤维细胞(CAFs)中的前列腺环素合成酶(PGIS/PTGIS)对胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响及相关作用机制。方法 利用GEPIA、Kaplan-Meier等数据库分析PGIS在胰腺癌及正常胰腺组织中的表达差异;通过q-PCR检测PGIS在CAFs及人胰腺星状细胞(HPSC)中的表达差异;通过CoCl2化学诱导构建肿瘤微环境缺氧模型,检测胰腺癌及CAFs细胞的PGIS表达水平;利用siRNA转染、慢病毒感染的方式分别构建敲低和过表达PGIS的CAFs细胞,通过CCK-8增殖、Transwell迁移及侵袭等实验探究敲低和过表达PGIS的CAFs细胞对胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响;通过小鼠胰腺原位成瘤探究过表达PGIS的CAFs细胞在体内对胰腺癌细胞增殖的影响;通过Western blot检测过表达PGIS的CAFs细胞对胰腺癌PI3K/Akt通路相关蛋白表达的影响。结果GEPIA、Kaplan-Meier数据库分析显示,与正常胰腺组织相比,PGIS在胰腺癌组织中高表达,并且与患者不良预后相关(P<0.05);与HPSC细...  相似文献   

10.
目的:探讨PTGER3在肠型胃癌中的表达及临床意义。方法:从GEO数据库的GSE29272数据集中下载58对肠型胃癌组织和癌旁组织的基因表达谱数据,筛选出差异表达基因,并利用DAVID数据库进行基因的功能富集分析。采用WGCNA软件对差异表达基因进行权重基因共表达网络分析,以挖掘出肠型胃癌发生发展过程中的关键调控基因。分析关键调控基因表达水平与肠型胃癌预后的相关性,并在Kaplan-Meier Plotter数据库中验证其预后意义。结果:共获得393个差异表达基因,DAVID 功能富集分析显示它们主要涉及ECM受体相互作用、p53信号通路、PI3K-Akt信号通路和癌症信号通路等。PTGER3是癌症信号通路上的一个重要成员,在肠型胃癌组织中的表达明显上调。差异基因的共表达网络分析发现PTGER3是模块枢纽基因,与胃癌的发生发展关系密切。GSE29272数据集和Kaplan-Meier Plotter数据库的生存分析均显示PTGER3高表达与预后不良显著相关(P=0.034;P<0.001)。结论:PTGER3表达上调可能参与了肠型胃癌的发生发展,而且其高表达提示患者预后不良。  相似文献   

11.
目的:探讨miR-192-5p靶向E盒锌指结合同源框2(ZEB2)对胰腺癌PANC-1细胞增殖、迁移、侵袭和上皮间质转化(EMT)的影响及其作用机制。方法:利用TCGA数据库数据分析miR-192-5p和ZEB2在胰腺癌组织中的表达及两者的相关性。采用qPCR法和WB法分别检测人正常胰腺上皮细胞HPNE和胰腺癌PANC-1细胞中miR-192-5p和ZEB2的表达水平。利用脂质体转染技术转染PANC-1细胞,实验分为miR-192-5p mimic组、Mimic NC组、miR-192-5p inhibitor组、Inhibitor NC组、Mimic NC+pcDNA3.1组、miR-192-5p mimic+pcDNA3.1组、miR-192-5p mimic+pcDNA3.1-ZEB2组。CCK-8法、克隆形成、划痕愈合、Transwell实验分别检测转染PANC-1细胞的增殖、克隆形成、迁移和侵袭能力。qPCR法、WB法、双重免疫荧光实验检测PANC-1细胞中ZEB2、E-cadherin、vimentin的表达水平。通过生物信息学网站预测miR-192-5p的靶基因,并利用双...  相似文献   

12.
背景与目的:生物信息学分析提示GATA6是miR-203a-3p的潜在靶基因,明确miR-203a-3p通过靶向调控GATA6抑制食管鳞癌细胞的增殖和侵袭。方法:采用Lipofectamine TM RNAiMAX对培养的KYSE-70和KYSE-180细胞瞬时转染。采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)检测miR-203a-3p和GATA6的表达水平。采用蛋白质印迹法(Western blot)检测GATA6蛋白的水平。质粒联合转染后检测相对萤光素酶活性。对食管鳞癌患者标本进行恶性肿瘤与异型增生组织miR-203a-3p和GATA6的表达检测。结果:RTFQ-PCR及Western blot检测结果显示,与对照组比较,GATA6基因和蛋白的表达在miR-203a-3p转染组中降低,在miR-203a-3p inhibitor组却升高,差异均有统计学意义(P<0.05)。与对照组比较,miR-203a-3p转染组KYSE-70细胞增殖能力下降,miR-203a-3p inhibitor组中却升高,差异均有统计学意义(P<0.05)。在KYSE-180中虽然差异无统计学意义,但其趋势却与KYSE-70一致。与对照组比较,在KYSE-70和KYSE-180细胞系中,侵袭细胞数值/视野在miR-203a-3p转染组中均明显下降(P<0.01),在miR-203a-3p inhibitor组中却明显升高(P<0.05)。与miR-203a-3p掠夺型+GATA6野生型组和miR-203a-3p野生型+GATA6突变型组比较,相对萤光素酶活性在miR-203a-3p野生型+GATA6野生型组中降低,差异有统计学意义(P<0.05)。与异型增生组织相比较,100%(10/10)食管鳞癌患者miR-203a-3p在恶性肿瘤组织的表达下调,而GATA6表达水平上调。结论:miR-203a-3p通过靶向调控GATA6抑制食管鳞癌细胞的增殖和侵袭能力。  相似文献   

13.
目的:探究miR-323a-3p、四次穿膜蛋白超家族成员1(TM4SF1)在NSCLC组织和细胞中的表达及两者间的靶向调控关系,观察两者表达对A549细胞增殖、迁移、侵袭和裸鼠移植瘤生长的影响。方法:收集2014年1月至12月间青海省人民医院手术切除的20例NSCLC组织及其相应的癌旁组织,qPCR和WB法检测癌组织中miR-323a-3p、TM4SF1 mRNA和TM4SF1蛋白的表达。向A549细胞转染miR-323a-3p mimic,采用MTT法、Transwell法、WB法检测miR-323a-3p过表达对细胞的增殖、迁移和侵袭以及TM4SF1、细胞周期蛋白D1(cyclin D1)、p21、MMP-2、MMP-9蛋白表达的影响。采用生物信息学预测工具StarBase和双荧光素酶报告基因实验分析miR-323a-3p与TM4SF1靶向关系。将si-TM4SF1转染至A549细胞,以及分别将miR-323a-3p mimic与pcDNA或pcDNA-TM4SF1共转染A549细胞,评估细胞增殖、迁移和侵袭能力的变化;同时建立各组细胞的BALB/c裸鼠移植瘤模型,在14、21和2...  相似文献   

14.
目的:探讨长链非编码RNA BLACAT1(lncRNA BLACAT1)调控microRNA-29a-3p(miR-29a-3p)对甲状腺癌细胞恶性生物学行为的作用及其可能机制。方法:收集2018年06月至2019年03月在我院行甲状腺癌切除术的31例患者的肿瘤组织和相应的癌旁组织。采用qRT-PCR检测lncRNA BLACAT1、miR-29a-3p在甲状腺癌组织、癌旁组织、5种甲状腺癌细胞系(SW579、 PDTC-1、 HMGA1、 TPC-1、 KAT-5)及正常甲状腺细胞Nthy-ori 3-1中的表达水平;调控TPC-1甲状腺癌细胞系中lncRNA BLACAT1、miR-29a-3p的表达,采用CCK-8法检测细胞增殖情况,Transwell法检测细胞的迁移和侵袭能力。用生物信息分析和双荧光素酶报告基因法预测和验证lncRNA BLACAT1与miR-29a-3p的靶向关系。结果:与癌旁组织和正常甲状腺细胞相比,甲状腺癌组织和细胞系中lncRNA BLACAT1的表达水平显著上调,miR-29a-3p的表达水平显著下调(P<0.05);过表达lncRNA BLACAT1促进TPC-1细胞的增殖、迁移和侵袭;在甲状腺癌组织中lncRNA BLACAT1的表达水平与miR-29a-3p的表达水平呈负相关(r2 =0.492,P<0.001);双荧光素酶分析证实lncRNA BLACAT1能特异性结合miR-29a-3p,并能降低其表达;过表达miR-29a-3p抑制TPC-1细胞的增殖、迁移和侵袭,且miR-29a-3p可以抑制由lncRNA BLACAT1过表达引起的TPC-1细胞增殖、迁移和侵袭能力的增强。结论:lncRNA BLACAT1通过靶向调控miR-29a-3p表达影响甲状腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭,从而促进甲状腺癌的发展。  相似文献   

15.
背景与目的:多种微小RNA(microRNA,miRNA)在乳腺癌中异常表达,在乳腺癌的发生、发展中起重要作用。miRNA可能是治疗乳腺癌的新靶点。该研究旨在探讨miR-199a-3p在乳腺癌中的表达水平,及其对乳腺癌癌细胞增殖和凋亡的影响。方法:运用实时定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,QRT-PCR)检测乳腺癌患者癌组织、癌旁正常组织、人乳腺癌细胞和人乳腺细胞中miRNA-199a-3p的表达水平,miR-199a-3p mimic(或inhibitor)转染乳腺癌细胞MDA-MB-231过表达(或沉默)miR-199a-3p的表达后,通过MTT法检测细胞增殖能力,Hoechst染色法和caspase-3活力测试检测细胞凋亡情况。结果:相对癌旁正常组织和人正常乳腺细胞,miR-199a-3p在乳腺癌患者癌组织和人乳腺癌细胞中表达下调。在MDA-MB-231中转染miR-199a-3p mimic过表达miR-199a-3p可抑制细胞增殖,促进其凋亡;在MDA-MB-231中转染miR-199a-3p inhibitor沉默miR-199a-3p可促进细胞增殖,抑制其凋亡。结论:miR-199a-3p在乳腺癌中表达下调,并通过调节乳腺癌细胞增殖和凋亡发挥抑癌作用。  相似文献   

16.
目的:探讨miR-203a-3p在胃癌中的表达及其对胃癌细胞增殖的影响.方法:收集胃癌组织标本44例,采用Real-time PCR方法检测胃癌组织标本中miR-203a-3p的表达,并分析其表达水平与临床病理参数的关系;生物信息学预测miR-203a-3p的靶基因,并采用荧光素酶报告基因实验进行验证;免疫组化检测胃癌组织标本中PRMT5的表达情况,分析其表达水平与miR-203a-3p表达的相关性;利用脂质体介导的瞬时转染方法过表达miR-203a-3p或同时过表达miR-203a-3p和PRMT5,并通过CCK-8实验检测胃癌细胞的增殖情况.结果:胃癌组织中miR-203a-3p的表达水平与正常组织对照相比显著降低(P<0.01),并且miR-203a-3p的表达水平与肿瘤细胞的分化程度显著相关;荧光素酶报告基因实验证实miR-203a-3p可以直接结合在PRMT5 3'-UTR上,即PRMT5是miR-203a-3p的直接靶基因;在胃癌组织标本中,PRMT5表达水平显著高于正常组织对照(P<0.01),并且其表达水平与miR-203a-3p表达呈显著负相关(r=-0.4124,P<0.01);过表达miR-203a-3p后,胃癌BGC823细胞的增殖能力显著低于miR-NC对照组(P<0.01),并且,"挽救"实验表明在过表达miR-203a-3p的细胞中同时过表达PRMT5后会部分恢复miR-203a-3p对细胞增殖的抑制(P<0.01).结论:miR-203a-3p可通过下调靶基因PRMT5的表达,进而抑制胃癌细胞增殖.因此,miR-203a-3p可作为胃癌疾病临床治疗的潜在靶点.  相似文献   

17.
目的:探讨lncRNA FLJ26245在前列腺癌组织和细胞中的表达及其对PC-3细胞增殖与迁移能力的影响及其分子机制.方法:选用2017年3月至2019年5月在洛阳中心医院手术切除的52例前列腺癌及相应的癌旁组织标本,以及前列腺细胞系LNCaP、C4-2B、PC-3、DU-145和正常前列腺上皮细胞RWPE-1,用q...  相似文献   

18.
目的 明确microRNA-122(miR-122)在胰腺癌中的表达及miR-122对胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的作用.方法 采用RT-qPCR方法检测20例胰腺癌组织、胰腺癌细胞株(ASPC1、PANC1、MP和SW1990)和人源正常胰腺导管上皮细胞株(HPDE)中miR-122的表达量.将miR-122模拟类似物...  相似文献   

19.
目的:探究lncRNA HOTAIR/miR-519d-3p/CCND1 分子轴对乳腺癌细胞增殖和转移的影响及其可能机制。方法:收集2017 年3 月至2019 年2 月南昌市第三医院乳腺外科手术切除的乳腺癌患者的乳腺癌组织及配对癌旁组织各50 例,qPCR检测癌及癌旁组织中HOTAIR 的表达水平,乳腺正常上皮细胞及乳腺癌细胞系中HOTAIR 和miR-519d-3p 的表达水平。将乳腺癌SKBR3 细胞分为NC 组、si-HOTAIR 组、miR-519d-3p mimics 组,miR-519d-3p mimics+pcHOTAIR 组、miR-519d-3p mimics+pcCCND1 组和si-HOTAIR+pcCCND1 组,CCK-8 法检测各组SKBR3 细胞增殖能力、Transwell 检测细胞侵袭和迁移能力、Western blotting 检测SKBR3 细胞中E-cadherin、N-cadherin、Vimentin 以及CCND1 表达水平。双荧光素酶报告基因检测HOTAIR 和miR-519d-3p 以及miR-519d-3p 和CCND1 的靶向关系。结果:HOTAIR在癌组织以及乳腺癌细胞系中呈高表达,且在SKBR3 细胞系中表达最高。敲降HOTAIR可显著抑制SKBR3 细胞增殖、侵袭和迁移,并显著增加E-cadherin 的表达水平、降低N-cadherin 和Vimentin的表达水平(均P<0.05)。双荧光素酶报告基因检测显示,HOTAIR 靶向下调miR-519d-3p 的表达,miR-519d-3p 靶向下调CCND1 的表达。敲降HOTAIR可增强miR-519d-3p 对CCND1 的下调作用,抑制SKBR3 细胞EMT、增殖、侵袭和迁移能力(均P<0.05)。结论:敲降HOTAIR可抑制SKBR3 细胞增殖和转移,其机制是通过调控miR-519d-3p/CCND1 分子轴实现的。  相似文献   

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