西安汉族人群CYP2D6基因拷贝数变异与串联重组多态性研究

目的 研究西安汉族人群CYP2D6基因拷贝数变异以及串联重组多态性的分布频率。方法 采用TaqMan^○R定量技术和序列特异性PCR对6 650例西安汉族人群的CYP2D6基因进行拷贝数和CYP2D6*36-*10串联重组多态性分析。结果 西安汉族人群中,4 003人(60.2%)携带有CYP2D6*36-*10串联重组多态性,5人(0.075%)为CYP2D6基因完全缺失,214人(3.22%)有单拷贝的CYP2D6基因,2 088人(31.4%)携带两个拷贝的CYP2D6基因,340人(5.11%)有3个或以上的CYP2D6基因。结论 本研究证实拷贝数变异及CYP2D6*36-*10串联重组多态性在西安汉族人群中呈现高频分布,其在我国其他人群中的分布特点有待研究。     

CYP2D6基因多态性的临床应用概况

细胞色素P450（cytochrome P450,CYP）基因多态性是构成药物代谢个体差异和种族差异的基础,细胞色素P4502D6（CYP2D6）是P450家族中参与肝脏代谢的主要酶类之一,它主要参与三环类抗抑郁药、抗心律失常药、抗精神病药、解热镇痛药、麻醉药、β-肾上腺素能受体阻断剂、选择性5-羟色胺再吸收抑制剂、神经镇静药以及一些抗癌药物等的代谢。研究CYP2D6基因多态性与药物代谢个体差异的相关性,有助于减轻药物不良反应,提高药物治疗效果,实施个体化给药的途径。     

CYP2C19、CYP2D6基因多态性与精神分裂症患者氯氮平代谢的关联研究

目的 探讨精神分裂症患者CYP2C19、CYP2D6基因多态性对氯氮平(CZ)代谢的影响.方法 采用实时荧光定量PCR检测224例精神分裂症患者的CYP2C19与CYP2D6基因型,根据CYP2C19的代谢类型,将患者分为快代谢型、中间代谢型和慢代谢型,根据CYP2D6的代谢类型,将患者分为快代谢、中间代谢型和中低代谢...     

CYP2D6基因多态性与他莫昔芬代谢及疗效的相关性研究进展

他莫昔芬(tamoxifen,TAM)是雌激素受体(estrogen receptor,ER)阳性乳腺癌患者内分泌治疗的标准用药。CYP2D6是TAM代谢的关键酶,其基因多态性与TAM的代谢及其疗效的关系备受关注。现对CYP2D6基因多态性与TAM的代谢及其疗效的关系研究进展做简要综述。     

氟西汀血药浓度与CYP2D6基因多态性的相关性分析

目的:探讨氟西汀血药浓度与CYP2D6基因多态性关系。方法:选取2019年1月至2021年2月深圳市康宁医院就诊的93例住院患者,男30例,女63例,年龄(21.87±11.19)岁,年龄范围为12～58岁。以氟西汀作为抗抑郁治疗,检测CYP2D6基因型在93例患者中的分布及不同基因型患者的氟西汀和去甲氟西汀血药浓度结...     

浙江沿海地区汉族人群CYP2D6基因拷贝数多态性研究

目的 了解浙江沿海地区汉族人群中CYP2D6基因拷贝数多态性分布。方法 使用改良的长模板PCR技术对浙江沿海地区汉族人群中的285例健康人群，进行CYP2D6基因拷贝数多态性进行检测。结果 CYP2D6 ＊ 5缺失型和CYP2D6 ＊×N重复基因在总样本中的发生频率分别为5．09％（n=29）和0．70％（n=4），在4个重复等位的基因中，其中3个为CYP2D6 ＊ 1×2，另外1个为CYP2D6 ＊ 10×2。结论 实验表明本地区CYP2D6基因拷贝数多态性分布不同于其他地区，不同地区呈现出不同的特点，表现出中华民族的遗传多样性。     

中山地区难治性精神类疾病患者CYP2D6基因多态性及代谢表型的分布研究

目的探讨中山地区难治性精神类疾病患者CYP2D6基因多态性及代谢表型分布,并分析性别之间的差异。方法选取2018年1月至2020年4月在该院住院的难治性精神类疾病患者175例,根据《国际疾病分类》第10版疾病诊断标准将患者分为精神分裂症组(A组,106例)、心境障碍组(B组,38例)和其他精神疾病组(C组,31例)。采用Agena Bioscience Mass ARRAY DNA质谱基因分型方法,分析175例难治性精神类疾病患者的CYP2D6基因多态性(rs5030865、rs5030867、rs201377835、rs35742686、rs1080985、rs5030655、rs5030862、rs1135835、rs1081003、rs5030656、rs28371706、rs1065852、rs3892097、rs28371725、rs16947和rs1135840)及代谢表型(超快代谢型、广泛代谢型、中间代谢型和慢代谢型),比较3组CYP2D6基因型及表型分布频率和特征。结果所有检测对象中,CYP2D6基因16个位点中14个位点(rs16947、rs1080985、rs503...     

基因拷贝数变异与先天性心脏病关系研究进展

基因拷贝数变异(copy number variations,CNVs)是指长度介于1千碱基对和数兆碱基对间的DNA片段的重复、缺失、插入和复杂多位点的变异。基因CNVs通过改变基因活性和剂量来影响基因表达、表型差异和表型适应,可引起先天性心脏病等一系列疾病。本文就基因CNVs与先天性心脏病关系的研究进展作一综述。     

CYP2D6基因分型影响因素研究进展

细胞色素P450家族2亚科D成员6(CYP2D6)是细胞色素P450酶家族中的重要药物代谢酶,是抗抑郁药物、抗精神病药物和阿片类镇痛药物等主要的代谢酶。CYP2D6基因位点的复杂性和诸多等位基因突变体造成了CYP2D6表型的多态性,目前已报道170余种等位基因突变体。CYP2D6酶活性变化很大,从无活性到超快代谢均存在,根据酶活性可将不同表型携带者分为超快代谢者、正常代谢者、中间代谢者和弱代谢者。随着个体化医疗的发展,CYP2D6基因分型试验可以辅助药物遗传学和基因分型技术的研究和临床应用。然而,由于CYP2D6基因存在复杂的突变,包括单核苷酸突变、插入、缺失、基因拷贝数变异和基因重组。CYP2D6基因不仅存在个体化差异,且在不同种族之间等位基因的频率也明显不同。另外,人体内同时存在与CYP2D6同源性很高的非功能性基因CYP2D7,通过基因检测分析CYP2D6表型是一项非常具有挑战性的工作。文章总结了CYP2D6基因的多态性和基因分型的复杂性,并分析了部分不同的基因型突变对CYP2D6基因分型的影响,以帮助临床通过基因分型方法对CYP2D6酶活性进行预测。     

乳腺癌CYP2D6、SULT1A1基因多态性与他莫昔芬疗效的关系

目的 探讨乳腺癌患者CYP2D6、SULT1A1基因多态性与他莫昔芬疗效相关性.方法 2018年1月至2019年1月接受他莫昔芬治疗的乳腺癌患者,检测CYP2D6(100C>T)、SULT1A1638(G>A)基因型,分析其与临床病理参数、生存的关系;Kaplan-meier生存分析,Log-rank检验生存差异.结果...     

微阵列比较基因组杂交技术与二代基因测序检测拷贝数变异的对比

目的 对比分析微阵列比较基因组杂交技术(array-based comparative genomic hybridization,aCGH)和第二代基因测序技术(next generation sequencing,NGS)在基因组拷贝数变异(copy number variation,CNV)上的一致性,为临床检测CNV提供新的检测方法. 方法 提取15例流产组织临床样本的基因组DNA,然后分别使用aCGH和NGS 2种方法对上述DNA进行检测,分析对比每个样本的CNV的数目. 结果 aCGH共检测到CNV数有109个,最小的片段有16 kb,最大的片段有34Mb,其中小于200 kb的有20个,大于200 kb小于1 Mb的有34个,大于1 Mb小于5 Mb的有26个,大于5 Mb小于34Mb的有29个.NGS共检出68个CNV,其中小于200 kb的有3个,检出率为15.0％;大于200 kb小于1 Mb的有22个,检出率为64.7％;大于1 Mb小于5 Mb的有20个,检出率为76.9％;大于5 Mb小于34 Mb的有29个,检出率为100.0％. 结论 对于目前的数据量来说,NGS在检测大于5Mb的大片段CNV上检出率较高,与aCGH具有一定的一致性,可以应用于流产组织中CNV的检测.对于小片段的CNV的检测,需要增加相应的读取的数据量进行检测.     

厚朴提取物对大鼠CYP2D6亚型酶的影响

目的观察厚朴提取物对大鼠CYP2D6亚型酶的影响。方法将16只成年雄性Wistar大鼠随机分为对照组和实验组,2组分别经口给予生理盐水和厚朴提取物1周,采用高效液相色潜法（HPLC）测定大鼠尿样及肝微粒体中CYP2D6的探针药物右美沙芬（DM）的代谢率,观察厚朴提取物对CYP2D6亚型酶活性的影响,并通过特异性抑制剂确定肝微粒体重组系统中厚朴提取物对CYP2D6亚型酶活性的影响。结果实验组大鼠尿样及体外肝微粒体中DM代谢率均明显低于对照组,差异有统计学意义;厚朴提取物组肝微粒体中DM代谢率显著低于西咪替丁组和对照组,差异有统计学意义,而西咪替丁组和对照组比较,差异无统计学意义。结论厚朴提取物可有效抑制CYP2D6亚型酶的活性,且抑制能力优于西咪替丁。     

VIPR2拷贝数变异检测方法的建立及应用

目的：建立 VIPR2基因拷贝数变异检测方法,并应用于 VIPR2拷贝数变异与精神分裂症的相关性研究中。方法将2010年11月至2012年8月南京医科大学附属无锡市精神卫生中心收治的310例精神分裂症住院患者纳入精神分裂症组,同期选择300例健康志愿者纳入健康对照组。采用多重竞争性实时荧光定量聚合酶链反应法,对610例受试者进行 VIPR2微重复分析。结果精神分裂症组中 VIPR2拷贝数变异检测阳性率为0．97％（3/310）,健康对照组 VIPR2拷贝数变异检测阳性率为0．00％（0/300）,两组比较差异无统计学意义（χ2＝1．275,P＝0．259）。结论多重竞争性聚合酶链反应法能对多位点拷贝数变异进行快速分型,是验证拷贝数变异的有效方法。     

CYP2B6基因多态性与成年人急性髓系白血病易感性的相关性

目的 探讨CYP2B6基因多态性与成年人急性髓系白血病(AML)易感性的相关性.方法 选取87例首次确诊AML的患者作为AML组,191例健康体检者作为对照组,运用Sanger测序法对CYP2B6785A>G与516G>T两个单核苷酸多态性位点进行基因分型.结果 CYP2B6785A>G位点在显性模型下(AG+GG v...     

儿童急性髓系白血病基因拷贝数变异的临床研究

目的:研究儿童急性髓系白血病(AML)中基因拷贝数变异的发生率及其与临床特征及预后的相关性。方法:回顾性分析130例AML患儿临床资料,包括临床特征、FAB分型及细胞遗传学改变等。收集130例AML患儿和38例健康志愿儿童的骨髓或外周血,常规提取基因组DNA。应用多重连接探针扩增法(MLPA)检测多个基因拷贝数变异的情况。利用SPSS16.0软件进行统计学分析。结果:在130例患儿中,超过10%的拷贝数变异涉及的染色体区段为2p24.3(MYCN)、10q23(PTEN)和13q14(RB1,MIR15A,DLEU);在49例(37.7%)患者中检测到基因探针的扩增和缺失,涉及改变的基因探针个数的中位数为4个。TP53探针发生缺失/扩增的患儿复发率高。各探针发生缺失/扩增对EFS、DFS及OS均无影响。12%的患儿存在基因组异常,用常规染色体核型的方法不能检出。结论:MLPA技术可作为染色体核型检测的补充。TP53拷贝数异常的儿童AML患者易发生复发。     

广东东莞地区心血管疾病患者CYP2C19基因多态性分析

目的研究广东东莞地区心血管病患者CYP2C19基因的多态性分布。方法选取心内科心血管疾病患者1 662例,抽取外周血并提取基因组DNA,用PCR技术结合基因芯片技术检测患者的CYP2C19基因型。对年龄45岁和年龄≥45岁冠心病患者CYP2C19等位基因频率和代谢表型频率进行比较。结果在1 662例患者中,CYP2C19代谢型713例(42.90%),中间代谢型740例(44.52%),慢代谢209例(12.58%)。CYP2C19*1、CYP2C19*2、CYP2C19*3等位基因频率分别为65.16%、30.08%、4.75%。45岁组检出快代谢型104例(40.00%),中间代谢型104例(45.38%),慢代谢型38例(14.62%)。≥45岁冠心病组检出快代谢型609例(43.44%),中间代谢型622例(44.37%),慢代谢171例(12.20%)。45岁与≥45岁组各基因型的比例比较,差异无统计学意义(P0.05)。结论通过检测CYP2C19基因型确定患者遗传特征,可以评估其氯吡格雷抵抗风险,为患者制订个体化的抗血小板治疗方案。     

应用微阵列比较基因组杂交技术检测乳腺癌患者共有拷贝数变异的初步研究

目的 探讨乳腺癌患者基因组中共有的拷贝数变异与乳腺癌发生发展的关系,为乳腺癌的预防、治疗和预后提供基本依据. 方法 使用微阵列比较基因组杂交技术检测样本基因组DNA的拷贝数变异.将得到的拷贝数变异在人类基因组变异数据库和孟德尔遗传数据库进行变异分析,寻找样本共有的拷贝数变异并分析其与乳腺癌的关系.结果 发现1q21、8p11、8p12、8q11、14q32、14q32.33(其中包含2个片段),20q13和22q11共9个共有拷贝数变异,其中4个拷贝数变异通过人类基因组变异数据库证实为正常多态性拷贝数变异.有5个拷贝数变异在人类基因组变异数据库中不存在相似片段并且在孟德尔遗传数据库中有致病基因,包括4个扩增片段和1个缺失片段. 结论 1q21.1q42.2、8q21.12q23.3和20q13.2q13.31 3个片段的扩增及8p12p11.23的缺失与乳腺癌的发生和发展有一定联系,但8q11.22q11.23的扩增与乳腺癌的发生、发展的相关性尚有待于进一步验证.     

基因组拷贝数变异与肺癌关系的研究进展

正肺癌是中国乃至全世界最常见的恶性肿瘤之一,截止2013年的调查显示其病死率在中国死亡病种中位列第4位~([1])。越来越多的研究证实,基因组DNA拷贝数变异(CNVs)对于探究基因结构改变、基因表达以及肿瘤的发病机制有很大帮助。CNVs在包括肺癌在内的肿瘤的发生发展过程中扮演了重要的角色,因此研究DNA拷贝数改变对肺癌的影响已成为目前研究肺癌发病机制、探讨病因的热点之一,研究者期望用这些研究来提高对肺癌的干预措施的有效性,降低     

CPY1A2基因多态性对药物代谢的影响

人类细胞色素P450酶1A2（CYP1A2）是肝脏中重要的CYP酶之一,约占肝脏中CYP酶的13%-15%.CYP1A2参与咖啡因、茶碱、华法林、普萘洛尔、美西津、维拉帕米、硝苯地平等多种药物的代谢,而且许多前致癌物如多环芳烃、杂环胺类、芳香胺类化合物、黄曲霉毒素等均由其代谢活化.     

无创产前检测技术对胎儿染色体拷贝数变异检测的临床意义

目的 探讨无创产前检测技术(NIPT)对胎儿染色体拷贝数变异(CNV)的临床意义。方法 选择2018年1月至2020年8月在该院行NIPT筛查的22 998例单胎妊娠且筛查结果提示为CNV的90例孕妇为研究对象,经介入性产前诊断行胎儿染色体核型分析、拷贝数变异测序(CNV-Seq),随访妊娠结局,评估NIPT对胎儿CNV的检测效能,探讨其临床意义。结果 90例NIPT提示CNV的孕妇中60例接受介入性产前诊断,其中31例(51.67%)未发现致病性CNV或其他染色体异常,28例(46.67%)发现CNV(27例与NIPT检测结果一致,1例不一致),1例仅行胎儿染色体核型分析未见异常,但未进行CNV-Seq。NIPT检测CNV的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为77.14%、99.85%、49.23%、99.90%。28例介入性产前诊断结果异常的孕妇17例引产,11例顺产;31例介入性产前诊断未见异常的孕妇1例引产,1例顺产多趾,其余新生儿出生时表型未见异常。30例未行介入性产前诊断的孕妇4例引产,1例出生表型U型嘴,1例失访,余24例新生儿表型正常。结论 NIPT对胎儿CNV...