肿瘤和白血病的基因组印记

肿瘤和白血病的发生与基因组印记有关,慢粒白血病的abl基因来自父方,bcr基因来自母方。父源和母源染色体上的某些等位基因有时不能互相替代,如果其中相关的基因被印记,就可能发生肿瘤,印记往往是基因发生了甲基化。基因组印记与杂合性缺失常联合促成肿瘤的发生。     

肿瘤和白血病的基因组印记

肿瘤和白血病的发生与基因组印记有关，慢粒白血病的ａｂｌ基因来自父方，ｂｃｒ基因来自母方。父源和母源染色体上的某些等位基因有时不能互相替代，如果其中相关的基因被印记，就可能发生肿瘤，印记往往是基因发生了甲基化。基因组印记与杂合性缺失常联合促成肿瘤的发生。     

范可尼贫血肿瘤相关通路的基因集富集分析

目的 探讨范可尼贫血(FA)患者高肿瘤易感性的潜在机制与原因.方法 采用基因集富集分析(Gene set enrichment analysis,GSEA)对NCBI GEO数据库中21例FA患者和11例健康志愿者的骨髓单个核细胞基因表达谱进行比较研究,分析其在肿瘤相关通路及肿瘤相关基因集中的富集特征与核心富集基因.然后利用对基因本体学(Gene ontology)生物过程和结构基因组相关基因集的富集分析,迸一步阐释了该病高肿瘤易感性的潜在原因.结果 FA患者在抗Bcl-2抑制剂相关基因集和成纤维细胞生长因子、胰岛素及胰岛素样生长因子(IGF)信号通路介导的肿瘤基因集中有显著富集特征.其中核心富集基因D4S234E、SST、FGF、IGFR、FGFR和IGFBP等的高表达与促进肿瘤形成及耐药相关.在生物学过程上,FA患者细胞外分子的生物合成和结构与对照组具有显著差异.在结构基因组相关分析中发现,包含上述IGF2在内的转录起始位点附近具有模体RRCAGGTGNCV及CCTNTMAGA的基因集具有富集特征,其中前者与肿瘤发生的关键转录因子TCF3匹配.结论 FA患者的高肿瘤易感性与其体内在关键转录因子介导下的肿瘤相关细胞因子、激素等内环境变化密切相关.     

IGF2基因在无精子症患者睾丸组织中的印记丢失及意义

目的探讨IGF2基因在无精子症患者睾丸组织中的印记丢失情况及其意义。方法提取60例无精子症患者和10例年龄大于60岁的前列腺癌去势治疗患者的睾丸活检组织的DNA和RNA,经过PCR扩增和ApaⅠ酶切来检测IGF2基因的印记状态。结果 IGF2基因在无精子症患者和前列腺癌去势治疗患者中均表现出较高的印记丢失率,分别为52.00%和60.00%。结论 IGF2基因在无精子症患者睾丸组织中存在较高的印记丢失率,提示IGF2基因可能对睾丸生精功能具有一定的作用。     

IGF2的生物学特性及其与疾病关系的研究进展

胰岛素样生长因子-2(insulin-like growth factor 2,IGF2)基因是最早发现的内源性印迹基因,其表达、调控不遵循孟德尔遗传规律。IFG2是一种多功能细胞增殖调控因子,在细胞的分化、增殖、胚胎的生长发育以及肿瘤细胞增殖中具有重要的促进作用。现就IGF2基因结构与定位、表达机制、生物学意义及其与疾病发生的关系等作一综述。     

长链非编码RNA 91H对食管鳞癌组织中IGF2表达的调控作用及机制研究

目的探索长链非编码RNA(lncRNA)91H对食管鳞癌(ESCC)组织中胰岛素样生长因子2(IGF2)异常表达的调控机制,评价其在ESCC发生、发展中的作用。方法收集232例ESCC患者癌组织和癌旁组织标本以及食管鳞癌细胞系TE-1和Eca-109,用实时荧光定量PCR及免疫荧光法检测其91H和IGF2的表达水平,亚硫酸氢盐修饰后测序法(BSP)检测印记基因H19调控区域(ICR)的甲基化程度。结果肿瘤患者浸润程度越深、肿瘤等级和TNM分期越高,91H的表达量越低而IGF2表达量越高(P0.05),用91H RNA干扰后,TE-1细胞IGF2 mRNA的表达水平为4.91±1.68,明显高于阴性对照组1.38±0.61(P0.05);Eca-109细胞IGF2 mRNA的表达水平为3.62±1.44,明显高于阴性对照组1.75±1.00(P0.05);经5-aza-CdR去甲基化处理后,细胞甲基化程度越低,91H表达水平越高(P0.05)。结论 lncRNA 91H的表达与H19 ICR区甲基化程度密切相关,其对IGF2表达起抑制作用,提示lncRNA 91H可作为一个新的遗传学标志物。     

DNA甲基化及其在肿瘤中的作用

DNA甲基化 (methylatioon)就是加上甲基 (CH3- )基团的碱基修饰过程 ,基因甲基化的过程就是基因表达受到抑制的过程。DNA甲基化与对抗核酶的抗性、细胞防御机制、基因激活与印记、细胞的分化与发育 ,以及衰老和癌变相关。癌基因低甲基化、抑癌基因高甲基化、错配修复基因高甲基化、基因启动子DNA甲基化以及DNA甲基转移酶活性改变等都与肿瘤的发生密切相关。     

DNA甲基化及其在肿瘤中的作用

DNA甲基化（methylation)就是加上甲基（CH3－）基团的碱基修饰过程，基因甲基化的过程就是基因表达受到抑制的过程。DNA甲基化与对抗核酶的抗性、细胞防御机制、基因激活与印记、细胞的分化与发育，以及衰老和癌变相关。癌基因低基化、抑癌基因高甲基化、错配修复基因高甲基化、基因启动子DNA甲基化以及DNA甲基转移酶活性改变等都与肿瘤的发生密切相关。     

m6A RNA甲基化调节基因预测甲状腺癌的临床预后的作用

目的探索m6A RNA甲基化调节基因对THCA的与后续影响。方法分析癌症基因组图谱（TCGA）数据库中的RNA-seq数据及相关临床信息。通过wilcoxon检验分析肿瘤与正常样品之间m6A RNA甲基化调节基因的不同表达,使用lasso Cox回归分析构建m6A RNA甲基化调节基因与THCA的风险预后模型,使用中位风险评分将THCA患者分层为高风险组和低风险组,kaplan-Meier进行生存分析,使用ROC曲线用来评估预测模型的敏感性和特异性。结果肿瘤与正常样品之间m6A RNA甲基化调节基因的不同表达,3个基因上调,14个基因下调。lasso Cox回归分析筛选出4个m6A RNA甲基化调节基因IGF2BP2、FTO、IGF2BP1、RBM15。高风险组与低风险组相比,OS明显较低（P=4.278e-02）。ROC曲线中AUC值为0.783,结果显示预测模型较有效。单因素和多因素Cox回归进行模型效能检验,单因素Cox回归分析中HR值为2.083（P < 0.001）,多因素Cox回归分析中HR值为2.653（P < 0.001）。结论m6A RNA甲基化调节基因IGF2BP2、FTO、IGF2BP1、RBM15可以构建预测模型来预测不同的临床亚群患者的OS。      

IGF2基因组印记介导结直肠癌靶向治疗的实验研究

目的探讨携带胰岛素样生长因子2印记系统(IGF2 imprinting)的重组腺病毒靶向治疗结直肠癌的可行性。方法用PCR扩增H19、enhancer、CTCF、EGFP和E1A片段并克隆至pDC-315中构建成重组腺病毒穿梭质粒,分别与腺病毒骨架共转染包装成腺病毒Ad315-EGFP和Ad315-E1A。Ad315-EGFP分别转染GES-1、HCT-116、HCT-8和HT-29细胞,荧光显微镜观察各组细胞中EGFP的表达。以H101作为阳性对照,用RT-PCR及western blot检测Ad315-E1A和H101转染后各组细胞中E1A基因和蛋白质的表达;用MTT法和流式细胞术检测Ad315-E1A体外抗肿瘤效应。构建皮下移植瘤裸鼠模型,检测Ad315-E1A的体内抑瘤作用。结果 Ad315-EGFP转染各组细胞,EGFP仅在IGF2 LOI细胞HCT-8和HT-29中表达;各组细胞经Ad315-E1A转染后,E1A基因和蛋白质仅在LOI细胞(HCT-8和HT-29)中表达;HCT-8细胞经Ad315-E1A 10 PFU/cell转染72 h后,增殖活力降低至(53.4±6.4)%,凋亡率升高至(23.9±3.7)%;经H101转染的各组细胞,E1A基因和蛋白质仅在p53突变的细胞HT-29中表达;多点注射Ad315-E1A治疗HCT-8移植瘤显示其抑瘤率达32.1%。结论成功构建了携带IGF2印记系统的重组腺病毒;重组腺病毒Ad315-E1A能够有效杀伤IGF2 LOI结直肠癌细胞。     

m6A甲基转移酶样3基因在泛癌中的表达及对肿瘤微环境的影响

目的 分析METTL3在泛癌中的表达及对肿瘤微环境的影响。方法 使用癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas, TCGA）数据库下载各种癌症患者的测序结果及临床资料,分析METTL3基因在各类型肿瘤中的表达以及其与预后、肿瘤微环境相关细胞浸润水平的综合分析。结果 METTL3在大多数恶性肿瘤中表达上调,但仅与肝细胞癌（PFI：HR=2.20,P=8.7e-7）和前列腺癌（PFI：HR=1.65,P=0.02）患者的不良预后关联。METTL3的表达与肝细胞癌和前列腺癌中的调节性T细胞、M2型巨噬细胞和/或成纤维细胞浸润水平以及抑制性免疫检查点基因的表达水平呈显著相关。结论 METTL3的表达与一些类型肿瘤患者的不良预后关联,且与调节性T细胞、M2型巨噬细胞和/或成纤维细胞的浸润以及抑制性免疫检查点基因的表达密切相关。本研究将有助于从临床肿瘤样本的角度理解METTL3在肿瘤发生、发展中的作用,并为肿瘤的靶向治疗提供新策略。     

IGF2BP3基因表达水平在急性髓系白血病患者中的预后价值

目的:探寻IGF2BP3基因表达水平与急性髓系白血病(AML)患者预后的关系。方法:通过对本中心27例AML患者骨髓原代白血病细胞进行转录组高通量测序,分析IGF2BP3基因表达水平与患者临床特征之间的关系,并在初治AML患者及难治AML(Refractory AML)患者样本中验证。分析20例健康对照者和26例AML患者中IGF2BP3基因表达水平的差异。采用RT-qPCR、Western blot检测两种蒽环类耐药细胞系(HL60/ADR、K562/ADR)中IGF2BP3表达水平,比较其与敏感细胞(HL60、K562)的表达差异。通过3个数据集,分析IGF2BP3在AML患者中的表达水平及与预后的关系,进一步使用Cox生存分析IGF2BP3在AML中的预后价值。结果:在本中心27例AML患者骨髓原代白血病细胞中,难治性AML患者的IGF2BP3表达量明显高于化疗敏感的患者(P=0.0343),白血病细胞髓外浸润(extramedullary infiltration, EMI)患者的IGF2BP3表达量明显高于无髓外浸润的AML患者(P=0.0049)。与健康人比较,IGF2BP...     

印记基因与小于胎龄儿研究进展

基因组印记是令一对等位基因仅表达父源或母源基因的一种表观遗传性修饰, 多在胎盘中存在, 对胎盘和胚胎发育至关重要。在对小于胎龄儿发病机制的研究中, 印记基因是不可缺少的一部分。但相关研究争议很大, 尚未得出统一的结论。本文就近些年印记基因与小于胎龄儿的研究予以综述。     

软组织肿瘤的比较基因组杂交研究进展

比较基因组杂交(comparative genomic hybridization,CGH)是1992年建立起来的重大分子细胞遗传学分析技术,它在对整个基因组DNA拷贝数变异的检测方面是一种有效的方法。通过CGH检测,可找出染色体DNA拷贝数的变异特点,即基因拷贝数的扩增或丢失,从而确定相关的癌基因和抑癌基因所在的区域,为探讨肿瘤的发病机制提供依据。在过去的十几年中,用CGH对各种软组织肿瘤进行研究,已探测到了各种各样的有不同程度特异性的基因组的不平衡性,不仅开辟了探测各种癌症相关基因的新途径,并且找到了一些与临床相关的基因改变,可用于肿瘤的发生、发展、鉴别诊断、预后以及治疗等研究。     

小RNA在血液肿瘤研究中应用的新进展

小RNA包括siRNA和miRNA两种，前者是伴随着RNAi现象发现的，是对外源基因剪切加工形成的，是生物维持自身基因组稳定性的一种机制，而miRNA是基因组中固有的，是在转录后水平调节基因表达的重要机制。小RNA的作用方式有两种：介导目标RNA降解和抑制蛋白质翻译。前者要求小RNA与目标RNA精确互补，而后者只要求部分互补，采取何种机制取决于互补程度而不是其来源。RNAi作为下调基因表达的手段，在功能基因组学中已有广泛的应用。对血液肿瘤发病相关基因，尤其对染色体易位造成的相关融合基因、凋亡相关基因及多药耐药基因的干扰研究表明，该技术不但是研究机制的有力手段，而且具有临床应用前景。对microRNA的研究发现，它在多种血液肿瘤如多种淋巴瘤和白血病中存在表达的变化，并与多种癌基因相关，提示它广泛参与血液肿瘤的发病机制。本文就RNA干扰和小RNA的发现和作用，以及小RNA在血液肿瘤研究中的应用作一综述。     

DNA甲基化异常与皮肤肿瘤

DNA甲基化（DNA methylation）异常主要指基因组中CpG岛发生甲基化修饰,引起基因表达异常。近几年的研究表明,DNA甲基化异常与肿瘤的发生关系密切。其主要的致癌机制为：抑癌基因启动子区被异常甲基化导致基因表达沉默进而导致肿瘤的发生;细胞周期调控基因甲基化异常致使细胞调控周期紊乱使得肿瘤细胞增殖过速;肿瘤侵袭相关基因甲基化异常致使肿瘤扩散转移以及DNA损伤修复基因异常甲基化使得肿瘤的发生机率增加。     

胰岛素样生长因子Ⅱ及其受体基因与汉族人高度近视的关联研究

目的探讨胰岛素样生长因子Ⅱ(IGF2)、胰岛素样生长因子Ⅱ受体(IGF2R)基因与中国汉族人高度近视(HM)发病之间的相关性。方法采用Sequenom MassARRAY方法检测基因的12个单核苷酸多态性(SNPs),对基因分型测试数据进行了χ~2分析和利用Haploview软件进行连锁不平衡分析。结果 IGF2基因的SNP rs1003483与HM具有显著相关性(等位基因P=0. 0023)。未发现IGF2R基因的单核苷酸多态性与HM相关。结论胰岛素样生长因子Ⅱ基因变异会增加中国汉族人群高度近视易感性。     

死亡相关蛋白激酶与肿瘤关系的研究进展

死亡相关蛋白激酶（death—associated protein kinase，DAPK）是以色列Kimchi及其同事于1995年在基因组中扫描启动细胞凋亡的基因和抑癌基因时发现的一种钙调蛋白（CaM）调节的丝氨酸／苏氨酸蛋白激酶，是凋亡的正性调节因子之一，广泛参与多种途径介导的细胞凋亡，被认为是肿瘤的抑制剂，因其启动子区CpG岛高甲基化使基因转录沉默而失去功能，与肿瘤细胞的形成转移有关等原因备受人们的关注。本文将对DAPK的结构、功能、介导凋亡的途径及与肿瘤的关系作一综述。     

人脑胶质瘤组织Six1、IGF2蛋白表达与临床病理特征、细胞增殖和预后的关系

目的 探讨人脑胶质瘤组织同源异形框基因Six1、胰岛素样生长因子-2(IGF2)蛋白表达与临床病理特征、细胞增殖和预后的关系。方法 选取2016年1月至2018年1月该院切除的80例人脑胶质瘤组织设为观察组,另选取同期该院切除的40例非肿瘤脑组织设为对照组。采用免疫组化法检测两组患者脑组织Six1、IGF2蛋白的阳性表达水平,对比蛋白阳性表达和阴性表达患者的Ki-67、增殖细胞核抗原(PCNA)标记指数(LI),并分析Six1、IGF2蛋白表达与患者临床病理特征的关系,用Pearson相关分析Six1与IGF2表达水平的相关性,Kaplan-Meier生存分析研究Six1、IGF2蛋白表达与患者预后的关系,多因素COX回归模型分析人脑胶质瘤患者预后的影响因素。结果 观察组Six1、IGF2蛋白阳性表达率分别为65.00%、47.50%,均明显高于对照组的22.50%、12.50%,差异均有统计学意义(P<0.05)。人脑胶质瘤患者肿瘤分化程度越低,Six1、IGF2蛋白阳性表达率越高(P<0.05)。Six1、IGF2蛋白阳性表达患者的Ki-67 LI、PCNA LI均明显...     

细胞因子对早孕滋养层细胞侵袭性相关基因表达的调节

目的:观察表皮生长因子等多种细胞因子对滋养层细胞表达基质金属蛋白酶等侵袭相关基因的影响.方法:将分离纯化的原代培养早孕滋养层细胞分别予10 ng/mL的表皮生长因子、白细胞介素1α、白细胞介素10,5 ng/mL的肿瘤坏死因子α处理48 h后.采用RT-PCR方法检测肿瘤转移相关蛋白1和肿瘤转移抑制基因的转录表达,用ELISA检测基质金属蛋白酶-2和黏附分子CD44v6蛋白的表达.结果:表皮生长因子使早孕滋养层细胞中肿瘤转移相关蛋白1 mRNA的表达减少,肿瘤转移抑制基因KAI1 mRNA表达增加,并诱导基质金属蛋白酶-2和黏附分子CD44v6蛋白的表达;肿瘤坏死因子α可使早孕滋养层细胞中肿瘤转移相关蛋白1 mRNA表达增加,肿瘤转移抑制基因KAI1mRNA表达降低,而对早孕滋养层细胞中基质金属蛋白酶-2和黏附分子CD44v6蛋白的表达影响不明显;而白细胞介素1α、白细胞介素10抑制早孕滋养层细胞中基质金属蛋白酶-2和黏附分子CD44v6蛋白的表达.结论:表皮生长因子、白细胞介素1α、白细胞介素10和肿瘤坏死因子α可能通过改变基质金属蛋白酶-2、肿瘤转移相关蛋白1、肿瘤转移抑制基因KAI1、黏附分子CD44v6等侵袭相关基因的表达,在滋养层细胞侵入的调节中扮演不同的角色.