应用多重PCR法对广东地区HBV进行基因型(A-F)分型

目的建立乙型肝炎病毒(HBV)基因型(A-F)多重PCR分型方法,并利用该方法对广东地区HBV PCR阳性血清进行分型。方法将GenBank中114例HBV 全序列进行比较分析,找出每种基因型相对于其他五种基因型的独特序列,并根据这些独特序列设计出六对分别针对A-F基因型的特异引物。利用这六对引物建立HBV的多重PCR分型法。结果多重PCR与以前用PCR-限制温度长度多态型分析法的分型结果一致。对广州周边地区HBV携带者的初步分型结果显示,主要为B型和C型,分别占45.00%和38.75%,另外还有16.25%的D型。结论用多重PCR分型法准确易行,灵敏性高,便于推广应用。     

型特异性引物PCR技术在HBV基因分型中的应用

目的 应用乙型肝炎病毒（HBV）型特异性引物PCR的基因分型方法，了解武汉地区HBV基因型的分布及其临床意义。方法 选择298例HBV感染者，分成表面抗原携带者（ASC）、急性肝炎（AH）、慢性肝炎（CH）、重型肝炎（SH）、肝硬化（LC）和原发性肝癌（HCC）6组，用多对型特异性引物PCR方法检测HBV的基因型；并对4份血清HBVDNA进行序列分析。结果多对型特异性引物PCR法可简便、快速、准确地鉴定HBV基因型；298份HBVDNA阳性的血清标本中，B基因型197例（66．1％），BC混合型68例（22．8%），C基因型33例（11．1％）；B基因型在ASC、AH、CH、SH和HCC组患者中均占绝对优势，分别为63．6％、71．9％、68．7％、89．5％和65．9%，C基因型在各组患者中的分布差异无显著性意义，BC混合基因型在各组患者中的分布存在差异，更多见于肝硬化患者；各基因型在ALT水平、HBeAg阳性率及HBV DNA水平上差异无显著性意义（均P〉0．05）。结论 多对型特异性引物PCR扩增法能快速准确地进行HBV基因分型检测，可用于大规模的流行病学调查；武汉地区HBV感染者中，优势基因型为B型，其次为BC混合型和c型，BC混合型更多见于肝硬化患者。     

实时荧光聚合酶链反应检测HBV基因型B～D方法的建立

目的建立实时荧光聚合酶链反应检测乙型肝炎病毒(HBV)基因型B～D方法并验证其准确性。方法比较GenBank中已发表的明确分型的143株HBV全序列，设计特异的组合引物探针，应用实时荧光聚合酶链反应HBV基因分型法对兰州地区128例慢性乙型肝炎患血清标本进行基因型B、C、D检测，并随机对检测的基因型各3株标本进行S基因测序验证。结果128例标本中B型检出率为20.3％(26／128)，C型71．9％(92／128)，D型7．8％(10／128)：18株HBV克隆标本S基因测序结果与本分型法完全一致。结论实时荧光聚合酶链反应HBV基因分型法能够简便、灵敏、快速、准确地鉴定HBV基因型，适宜用于HBV基因型的大规模临床和流行病学调查。     

实时荧光聚合酶链反应检测HBV基因型B～D方法的建立

目的 建立实时荧光聚合酶链反应检测乙型肝炎病毒(HBV)基因型B~D方法并验证其准确性。方法 比较GenBank中已发表的明确分型的143株HBV全序列,设计特异的组合引物探针,应用实时荧光聚合酶链反应HBV基因分型法对兰州地区128例慢性乙型肝炎患者血清标本进行基因型B、C、D检测,并随机对检测的基因型各3株标本进行S基因测序验证。结果 128例标本中B型检出率为20.3%(26/128),C型71.9%(92/128),D型7.8%(10/128);18株HBV克隆标本S基因测序结果与本分型法完全一致。结论 实时荧光聚合酶链反应HBV基因分型法能够简便、灵敏、快速、准确地鉴定HBV基因型,适宜用于HBV基因型的大规模临床和流行病学调查。     

C型乙型肝炎病毒基因SOEing法引入228位点突变

目的为获取乙型肝炎病毒(HBV)基因分型芯片病毒靶序列,对C型HBV第228位碱基进行点突变。方法通过不同基因型HBV全基因组的序列比对分析,显示基因型A,C,D,G在228位上的碱基为G,而基因型B,E,F,H为A,所以检测该位点的碱基类型可以实现HBV基因型的初步分型。结果将C型乙肝病毒第228位上的单位碱基由G突变为A,经测序后证明突变成功。结论重叠区扩增基因拼接法(SOEing)是一种简便引入点突变的方法,可以应用此法制备HBV基因分型芯片检测基因片段序列。     

多位点ARMS-PCR法进行HBVS区检测分型

目的：建立一种准确有效的PCR法HBV分型的实验方案。方法对80例包含了 HBV不同型别（B/C/D型）的血清样本进行了 HBV S区测序，通过分析国人 HBV B/C/D型S区碱基固有差异位点，设计得针对各种HBV 型别的高度特异性A RM S引物与探针，并用于另外120例HBV样本的PCR检测实验，同时进行测序进行检测准确度验证。结果多位点ARMS-PCR法与测序法的型别检出吻合率为99．5％，其中一例HBV B/C型混合感染由ARMS-PCR法检出并经追溯确认。结论经验证可见设计于S区型别固有差异位点之上的ARMS引物与探针于PCR检测中能以极高的特异性对 HBV 血清样本进分型，并能检出 HBV 混合型中的劣势病毒株。PCR法以其低成本、结果容易判定以及高灵敏度等优点，于临床HBV分型上是更为推荐的分子诊断学方法。     

HBV拉米呋啶耐药相关基因及HBV基因分型的初步研究

目的：利用基因测序技术，根据HBV S基因序列和HBV P基因区YMDD基因序列的特征，建立一种既可以诊断HBV基因型，又能检测拉米呋啶耐药突变的简便、可靠的方法。方法：采用特异的引物对待检标本进行PCR扩增后作基因序列检测，利用Chromas2．23软件对测序结果进行分析有无突变产生，测序结果用软件DNASIS进行基因分型分析。结果：61例经拉米呋啶治疗的慢性乙肝患者B型11例（18％），C型50例（82％）。发生YMDD变异47例，变异检出率为77．0％。结论：该方法能同时检测HBV基因型和YMDD变异，可以通过准确的P基因序列测定区分YMDD变异的类型，并可根据需要监测其他的伴随突变，进一步进行核苷酸多态性分析，对临床治疗和病情监控均有指导意义。     

Genotyping of hepatitis B virus and its clinical significance in patients with chronic hepatitis B]

OBJECTIVE: To investigate the distribution of hepatitis B virus (HBV) genotypes in Guangdong and explore its clinical significance. METHODS: Fifty-five patients with chronic active hepatitis (CAH) from Guangdong province were included in this study. HBV surface gene amplified by PCR was analyzed by restriction fragments length polymorphism (RFLP) for HBV genotyping, and the relationship of HBV genotype with clinical, serological and histological data of the patients was analyzed. RESULTS: Twenty-eight out of 55 patients were infected with HBV strains of genotype B (51.0%), 18 with genotype C (32.7%), 4 with genotype D (7.3%), 4 with HBV classified as genotype B+C (7.3%), and 1 (1.8%) with HBV that did not conform to any of the genotypes from A to G. No significant differences in clinical, histological, or serological data of HBV DNA loading were detected between genotypes B and C. But in patients older than 30 years, the genotype C was accompanied by significantly higher HBV DNA loading and serum HBeAg level than genotype B (Fisher's exact test, P=0.002). CONCLUSIONS: HBV genotype B and C are the major genotypes prevalent in Guangdong Province. Genotype C is associated with the longer duration of HBeAg and higher HBV DNA level in patients older than 30 years, suggesting the higher risk of HBV genotype C infection to progress into chronic liver disease.     

张家港地区乙型肝炎病毒基因分型及其意义

目的了解张家港地区乙型肝炎病毒基因型的流行情况及其临床意义。方法随机选择HBVDNA阳性乙肝病毒感染者110例,其中无症状病毒携带者(ASC)21例,慢性乙型肝炎(CHB)65例,重型肝炎(FHF)24例。通过设计共同的上游引物和不同的下游引物进行聚合酶链反应,根据扩增产物的长度判别基因型。结果110例血清标本中,B基因型32例(29·1%),C基因型71例(64·5%),未分型者7例(6·4%),未发现B和C以外其他基因型。无症状病毒携带者中以B基因型为主,而在慢性肝病和重型肝炎者中C基因型占优势,差异有显著性(P<0·05);且C基因型组与B基因型组相比较,C型患者ALT水平明显高于B型患者,差异有显著性(P<0·05),但两者的HBV-DNA定量差异无显著性(P>0·05)。结论张家港地区HBV-DNA基因型为B型和C型,优势基因型为C,与较严重肝脏疾病的发生有关,B基因型则与慢性乙肝病毒携带有关。     

巢式PCR检测北京地区乙型肝炎病毒基因型的分布

目的了解北京地区乙型肝炎病毒(HBV)感染者HBV基因型分布情况。方法从前S1基因到S基因中的保守序列设计出10条内外引物,将其中8条内引物分成A、B组,分别扩增A、B、C、D、E、F型HBV,根据PCR产物片断判定HBV基因型。结果用此种方法检测HBV感染的不同转归类型患者血清728份,对HBV DNA阳性标本进行基因型分析。HBV DNA阳性者276例,其中自限性感染者阳性率为5.8%(14/243),慢性无症状HBV携带者血清HBV阳性率为42.6%(113/265),慢性肝炎患者HBV阳性率为67.7%(149/220)。慢性肝炎组HBV DNA检出率与其他2组比较差异有统计学意义(P<0.05)。在276例HBV DNA阳性标本中,各基因型在不同组分布不同,但差异无统计学意义。HBV基因型总检出率以C型为主,占76.8%,B型占21·7%,同时检出B型和C型为1.5%,未检出A、D、E、F基因型。结论北京地区感染HBV基因型为B型和C型,以C型为主,感染结局不同组间基因型分布比较差异无统计学意义。     

巢氏PCR—RFLP和多重PCR检测HBV基因型、基因亚型方法的比较

目的:建立HBV基因型和亚型的分型方法,并分析相关的两种方法特异性和敏感性。方法:采用型特异性引物的巢氏PCR-RFLP和六种主要的HBV型特异性引物和亚型特异性引物的多重PCR方法,分别检测了100例患者标本。结果:两法不一致率为50%(27/54)。型特异性引物巢氏PCR-RFLP法检测出B基因型41例(41%),C基因型25例(25%),B C基因型34例(34%),B j亚型3例(7.3%),Ba亚型为38例(92.7%),Cs亚型为21例(84%),Ce亚型为3例(12%),1例C型未分出亚型(4%)。多重PCR法检出B型18例(33.3%),C型7例(13%),B C混和型5例(9.3%),B2亚型2例(11%),C1亚型2例(28.5%)。巢氏PCR-RFLP法型检出率100%亚型检出率98.5%,多重PCR法型检出率55.6%,亚型检出率仅为16%,前者高于后者(P<0.05)。结论:巢氏PCR-RFLP鉴定HBV基因型、基因亚型较多重PCR敏感性高,重复性好,但耗时长,费用高。     

乙型肝炎病毒基因生物信息学分析及特异片段的制备

目的制备HBV基因分型芯片模板。方法通过不同基因型HBV全基因组的序列比对,选取6个碱基位点作为分型位点,应用重叠区扩增基因拼接法(SOEing法)对C型HBV片段进行点突变。结果在所选位点上成功引入点突变。结论SOEing法是一种简便引入点突变的方法,可以应用此法制备HBV基因分型检测基因所需的模板DNA。     

慢性乙型肝炎患者HBV基因型及其临床意义

目的 了解广东地区慢性乙型肝炎患者HBV基因型特点及其临床意义。方法 用特异性引物扩增乙型肝炎病毒S基因区,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)基因分型方法,对该地区55例慢性活动性乙型肝炎(CAH)患者感染的HBV进行基因分型,并与其临床生化结果、病毒定量和肝组织病理进行相关性分析。结果 B基因型28例(51.0%),C基因型18例(32.7%),D基因型4例(7.3%),B+C型4例(7.3%),未分型1例(1.8%)。其中年龄大于30岁的26例患者B和C基因型的丙氨酸转氨酶水平分别为(190.9±270.3)IU和(141.0±83.0)IU(t=0.532,P>0.05),肝脏病理炎症分级的平均秩次为10.4和11.8(Z=0.561,P>0.05),肝脏病理纤维化分期的平均秩次为10.5和11.7(Z=0.483,P>0.05),HBVDNA含量分别为106.8±1.4和108.5±1.1(t=2.989,P<0.05),HBeAg阳性数分别为2/12和8/9(Fisher’s精确概率P=0.002)。结论 广东地区HBV基因型主要为B型和C型;两种基因型感染者丙氨酸转氨酶水平、病毒复制水平、HBeAg表达水平以及肝脏病理炎症和纤维化程度无显著性差异;然而在年龄大于30岁的CAH患者中,感染C基因型的HBV病毒复制水平和HBeAg表达水平比感染B基因型者显著增高。     

慢性乙型肝炎病毒基因型与血清病毒载量的关系

目的探讨徐州地区慢性乙型肝炎（CHB）患者血清中乙型肝炎病毒（HBV）基因型与病毒载量的关系。方法采用型特异性引物多重PCR方法对徐州地区160例CHB患者的HBV进行基因分型，用荧光定量PCR方法检测HBVDNA水平。结果B型14例（8．7％），C型88例（55．0％），BC混合型51例（31．9％），未分型7例（4．4％），未发现A、D、E、F型。不同基因型之间HBVDNA载量无明显差别。结论徐州地区CHB患者中HBV基因型主要是C型和BC混合型，感染的HBV基因型与血清病毒载量之间无明显相关。     

中国安徽地区肝癌组织中HBV基因型的分布研究

目的研究中国安徽地区肝癌组织中HBV基因型的分布状况。方法应用基因型特异性引物PCR法对96份肝细胞癌组织和90份HBV携带者血清进行HBV基因型检测。结果在65份分型的肝癌组织标本中，B基因型23份（35．4％），C基因型28份（43．1％），B＋C混合基因型8例（12．3％），B＋D混合基因型6例（9．2％）。在90份HBV携带者血清中，B基因型39份（43．3％），C基因型35份（38．9％），B＋C混合基因型12例（13.3％），B＋D混合基因型4例（4．4％）。C基因型在肝癌组织中占优势，而HBV携带者血清以B基因型为主。结论中国安徽地区肝细胞癌组织中存在基因型B、C及混合基因型B＋C与B＋D，以C基因型为主，其次为B基因型。     

不良结局家族聚集性乙肝感染者HBV基因分型

目的 探讨不良结局家族聚集性乙肝感染者HBV基因分型情况。方法 A组选择15个家系中54份HBV感染者血清,其中HBV携带者（ASC）30例,慢性乙型肝炎（CHB）7例,肝硬化（LC）13例,肝细胞癌（HCC）4例。B组选择非家族聚集性乙肝感染者60份血清,其中HBV携带者（ASC）36例,慢性乙型肝炎（CHB）10例,肝硬化（LC）9例,肝细胞癌（HCC）5例;应用HBV基因型特异性引物进行聚合酶链反应,经琼脂糖凝胶电泳分析其基因型并进行HBVDNA定量检测。结果 114份血清标本中109份HBVDNA阳性,A组有5份血清HBVDNA检测失败,余49份血清标本中,HBV基因型为C型46例,B/C混合型3例,未检测到其他基因型。B组60份血清标本中,HBV基因型为C型44例,B/C混合型5例,B型11例。两组相比在不同临床类型分布方面均无显著差异。但在肝硬化及肝细胞癌患者中,C型所占比例高,分别为80%和100%。结论 不良结局家族聚集性乙肝感染者,以C型为主,基因型与乙肝病情发展有一定关系。     

杭州地区部分乙型肝炎患者HBV基因型分析

目的了解浙江杭州地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型分布,初步评价基因芯片技术在HBV基因分型中的应用特点。方法设计多条寡核苷酸探针,用点样仪将探针固定于芯片特定位置上,并与PCR扩增的106例HBV感染者血清HBV基因相应区段杂交,经过显色反应,分析杂交结果,判定基因类型。结果106例HBV感染者中,基因型B者37例,占34.91%,基因型C者69例,占65.09%,未发现其他基因型。结论杭州地区存在HBV基因型B、C型,基因型A、D、E、F是否存在须扩大样本,进一步深入研究。基因芯片技术在同类检测方法中具有灵敏、准确、快速的优势,适用于临床。     

乙肝病毒基因分型检测芯片的构建及初步应用

目的:构建乙肝病毒(HBV)常见基因型的分型芯片,并应用分型芯片调查HBV基因型分布。方法:应用生物信息学软件针对乙肝病毒4种常见基因型的特征区域和保守区域分别设计分型探针和通用探针,在优化条件下通过重复杂交及分型测序检验芯片的重复性与可靠性后应用于临床,对150例不同类型的乙肝患者进行HBV基因分型。结果:分型探针和通用探针检测重现率分别为94.7%及100%,反馈的测序结果与芯片分型结果完全一致;经芯片分型发现辽宁省HBV基因型分别为C型占68.7%,B型占22.7%,B、C混合型占8.7%,未发现A、D型。结论:基因芯片技术为乙肝病毒基因分型提供了快速准确的检测方法,辽宁地区HBV基因型分布以B、C两型为主,C型占主要优势。     

HBV基因型与聚乙二醇干扰素疗效关系及病理变化

目的 研究乙型肝炎病毒(HBV)基因型与聚乙二醇干扰素(PEG-IFN)疗效关系及不同基因型治疗后的肝脏病理改变.方法 采用实时荧光PCR基因分型法,分析48例用聚乙二醇干扰素治疗的CHB患者基因型对抗病毒疗效的影响和病理改变情况.结果 在治疗结束时,B型与C型对比,两种基因型的ALT复常率、HBeAg阴转率、HBeAg转换率、HBV DNA转阴率及病理结果改善率无明显差异(P>0.05);在随访48周后,B基因型的持续应答率明显高于C基因型(P<0.05).结论 HBV基因型是预测聚乙二醇干扰素疗效的重要因素,B基因型的持续应答率明显高于C基因型.     

多重PCR技术检测病毒性肝炎相关病毒的研究

目的建立一种快速、特异的可同时检测血中多种病毒性肝炎相关病毒的多重PCR方法。方法参照各病毒特异性核酸序列,按多重PCR引物设计的特殊要求设计引物,以核酸测序确证扩增产物,用标准病毒株及临床阳性血清样本DNA、RNA为模板优化PCR反应体系和反应条件,建立病毒性肝炎相关病毒多重PCR检测方法。应用建立的多重检测方法对120例ALT升高的血清标本进行多重检测,并将检测结果与单一PCR检测结果进行比较。结果采用多重PCR技术可同时对EBV、TTV、HBV、HSV 4种DNA病毒进行扩增;采用多重RT-PCR技术可同时对Cox-V、HEV、HCV 3种RNA病毒进行扩增。各病原体单一及多重扩增条带均清晰、均一,无非特异性扩增条带,片段长度与理论值一致;核酸测序证实各扩增产物属各病原体特异性基因片段。临床标本检测多重感染率为19.2%,与单一检测结果一致。结论建立的多重PCR检测方法稳定可靠,敏感度、特异度好,适用于病毒性肝炎相关病毒的实验室诊断与临床筛查。