60Co-γ照射后早期小鼠肝组织基因表达谱

目的:以基因芯片技术研究辐射后小鼠肝脏的基因表达谱,从分子水平探讨辐射引起小鼠肝脏损伤的机制.方法:采用小鼠基因表达谱芯片(4096个基因)对60Co-γ照射后48 h小鼠肝组织基因表达谱进行研究.RT-PCR验证基因芯片结果.结果:与正常小鼠相比,辐射后小鼠肝组织有124条基因差异表达,78条下调,46条上调.其中57条基因的功能已知,这些差异表达的基因按功能可分为6类:DNA修复和应激蛋白,细胞骨架,离子通道和转运蛋白,信号转导,免疫蛋白,代谢调控,其中下调基因主要为细胞骨架基因,而上调基因主要为细胞周期调控蛋白和转录因子.RT-PCR结果表明,Hspa5、Rasa3、Nqol基因的表达和芯片结果一致.结论:辐射造成的肝损伤具有多靶点、多层次及多通路的特点.     

60Co-γ照射后早期小鼠肝组织基因表达谱

目的：以基因芯片技术研究辐射后小鼠肝脏的基因表达谱，从分子水平探讨辐射引起小鼠肝脏损伤的机制。方法：采用小鼠基因表达谱芯片（4096个基因）对^60Co-γ照射后48h小鼠肝组织基因表达谱进行研究。RT-PCR验证基因芯片结果。结杲：与正常小鼠相比，辐射后小鼠肝组织有124条基因差异表达，78条下调，46条上调。其中57条基因的功能已知，这些差异表达的基因按功能可分为6类：DNA修复和应激蛋白，细胞骨架，离子通道和转运蛋白，信号转导，免疫蛋白，代谢调控，其中下调基因主要为细胞骨架基因，而上调基因主要为细胞周期调控蛋白和转录因子。RT-PCR结果表明，Hspa5、Rasa3、Nqol基因的表达和芯片结果一致。结论：辐射造成的肝损伤具有多靶点、多层次及多通路的特点。     

急性重症肝炎小鼠肝脏趋化因子IP-10 mRNA的表达及意义

目的 探讨急性重症肝炎小鼠肝脏趋化因子IP-10 mRNA的表达及意义。方法 通过腹腔注射3型鼠肝炎病毒（MHV-3）建立急性重症肝炎小鼠模型,常规HE染色后进行肝组织HAI积分评估,常规生化检测感染后各时间点血清ALT的水平,实时定量PCR技术检测感染MHV-3 0、24、48、72 h后的Babl/cJ小鼠肝内趋化因子IP-10 mRNA的表达水平。结果 感染后的Balb/cJ小鼠血清ALT的水平以及肝脏HAI积分均显著升高,肝内IP-10 mRNA水平也显著上升,在48h和72h分别为感染前的 99倍和150倍。Persion相关分析证实感染后肝内趋化因子IP-10 mRNA的表达与血清ALT及肝组织HAI积分显著正相关(P<0.05)。结论 趋化因子IP-10在小鼠急性重症肝炎肝内淋巴细胞的募集及随后的坏死性炎症和急性肝衰竭中可能发挥着重要作用。     

不同生存条件下东方田鼠肝脏基因表达谱分析

目的 比较实验室条件下饲养的东方田鼠和野外捕捉东方田鼠肝脏的基因表达差异,寻找可能参与肝脏病变的关键基因.方法 以实验室条件饲养的东方田鼠和野外捕捉东方田鼠为研究对象,分别抽提RNA,逆转录成cDNA,体外转录为cRNA并进行片段化;利用表达谱芯片分别进行杂交,扫描后筛选差异基因,并应用realtime PCR方法对部分基因的表达水平进行进一步测定,验证芯片数据的结果.结果 实验室饲养东方田鼠肝组织与野外捕捉东方田鼠相比,共有99个基因和41个EST差异表达.其中参与机体代谢的基因占主导,约占35.4%;其次为参与信号通路的基因,约占24.2%;参与细胞周期和免疫的基因分别占6.1%和3.0%.结论 利用基因表达谱芯片初步筛选了可能参与东方田鼠脂肪肝形成过程的基因,发现机体代谢通路的基因占主导,肝脏中细胞色素家族基因表达差异明显.     

三种近交系小、鼠脂肪细胞对胰岛素敏感差异性的分析

为了从细胞水平探讨近交系小鼠对胰岛素(Ins)的敏感性,测试了3种近交系小鼠脂肪细胞在Ins刺激下的葡萄糖转运和Ins抑制异丙肾上腺素介导的脂肪细胞分解.结果显示A/J小鼠脂肪细胞对葡萄糖的转运显著高于Balb/cJ和129/J小鼠(分别为P<0.05和P<0.01),而Balb/cJ又显著高于129/J(P<0.05);Ins对A/J小鼠脂肪细胞脂解的抑制作用显著高于Balb/cJ和129/J(P<0.01).表明A/J小鼠脂肪细胞对Ins敏感性高,Balb/cJ次之,129/J较低.这对研究不同种系的近交系小鼠的生理病理特征及是否易于发生与胰岛素抵抗有关的疾病将提供一定的依据.     

红霉素致小鼠肝脏毒性效应的基因表达谱变化

目的 利用小鼠毒理基因芯片观察红霉素致balb/c小鼠肝脏毒性效应的基因表达谱变化.方法 建立红霉素致balb/c小鼠肝毒性效应模型,利用本室构建的小鼠毒理基因芯片检测1、3、7d小鼠肝脏基因表达谱变化,结合层次聚类和生物信息数据库检索对差异表达基因进行初步信息分析.结果 各时相组共发现239个差异表达基因,其基本表达模式分为4群,结合功能分析涉及脂肪分解代谢、蛋白质合成与降解、氧化应激、炎症发生、凋亡相关信号转导等多方面机制.结论 毒理芯片的检测展示了红霉素致肝脏毒性效应的基因表达谱变化基本轮廓,为进一步阐明其肝毒性机制提供了众多线索.     

小鼠胸膜间皮细胞免疫相关基因表达谱与中医藏象理论相关性研究

目的:研究小鼠胸膜间皮细胞(pleural mesothelial cell,PMC)免疫相关基因表达谱的状况。从而探索用现代免疫及基因芯片技术评价解释中医藏象理论的新方法。方法:取8只BALB/c小鼠胸膜组织块剪切成碎块,提取mRNA,经标记、杂交、清洗、芯片扫描、图象采集与数据分析等过程获得基因表达谱。结果:共筛选出小鼠胸膜间皮细胞免疫相关表达基因204条。其中主要有免疫应答及调节基因56条;炎性反应基因32条;非特异性免疫基因14条;T细胞增殖、活化、调节等相关基因23条,B细胞活化、分化、调节等相关基因9条;急性反应期基因5条;抗原加工与提呈基因4条;Ⅱ型超敏反应正向调节基因5条。结论:胸膜间皮细胞既表达免疫相关的正向调节基因亦表达负向免疫相关的调节基因。提示胸膜可能为一免疫协调器官,这对丰富中医藏象理论与肺气的实质将提供分子生物学的基础研究依据与新的思路。     

应用表达谱芯片研究胶质母细胞瘤相关基因的表达及功能

目的:应用基因表达谱芯片筛选研究人脑胶质母细胞瘤发生,发展中相关基因的表达及生物信息分析功能.方法:采用含13 939条基因(设置173个对照点)的BioStarH140S型表达谱芯片;用改良的"一步法"抽提2例正常脑及6例胶质母细胞瘤组织总RNA,制备杂交探针;杂交芯片后用ScanArray4000扫描芯片荧光信号,提取正常脑及胶质母细胞瘤组织差异基因;对差异基因进行生物信息分析,初步分类及Northern杂交研究.结果:按照差异显著标准,在胶质母细胞瘤中共有198条(1.42%)基因表达差异显著,其中77条(0.55%)表达上调,121条(0.87%)表达下调,55条新基因尚未在GenBank登录;生物信息分析发现肿瘤相关基因与细胞信号和传递蛋白、代谢、蛋白翻译合成、细胞骨架和运动、免疫、原癌基因和抑癌基因、细胞周期、细胞凋亡等9类基因密切相关;Northern杂交结果与表达谱芯片一致.结论:基因表达谱芯片可低成本、高通量、高效率筛选胶质瘤相关基因,并为基因群功能研究提供了方向;本研究结果有助于揭示胶质母细胞瘤分子机制,为指导肿瘤的临床诊断、治疗和预后判断提供依据.     

疏风宣肺解毒方对流感病毒性肺炎小鼠基因表达谱的影响

目的:采用基因表达谱芯片技术筛选疏风宣肺解毒方治疗流感病毒感染小鼠相关的差异表达基因,初步探讨方药治疗流感的作用机制。方法:流感病毒肺适应株FM1滴鼻感染小鼠,建立小鼠流感病毒性肺炎模型,方药灌胃治疗4 d,提取肺组织总RNA,与小鼠全基因表达谱芯片杂交后进行检测。对筛选得到的药物治疗过程中的差异表达基因进行生物信息学分析。结果:基因芯片结果显示,与模型组相比,给药组表达量发生变化的基因中上调的有2 659条,下调的有2 216条。结论:疏风宣肺解毒方作用涉及免疫学方面的分子功能为:胞内信号级联放大效应,浆膜、免疫应答、细胞增生的调节,免疫防御及细胞程序性死亡等;主要调节的代谢途径有:丝裂原活化蛋白激酶信号通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用、肿瘤信号通路、toll样受体信号通路、信号转导及转录激活因子途径、自然杀伤细胞介导的细胞毒作用及趋化因子信号通路等。     

Cdx2基因过表达对胃癌细胞免疫相关基因表达的影响

目的 利用基因表达谱芯片技术筛选过表达Cdx2的胃癌MGC-803细胞与对照组间差异表达的免疫相关基因. 探讨Cdx2对胃癌细胞免疫相关基因表达的影响。 方法 分别抽取Cdx2转染组和对照组的细胞总RNA,分离纯化mRNA并逆转录合成荧光分子(Cy3/ Cy5)标记cDNA 探针,与含有21522条人类22k基因表达谱芯片进行杂交。采用LuxScan 10K/A双通道激光扫描仪扫描芯片上两种信号,应用LuxScan3.0图像分析软件对芯片图像进行处理和分析。 结果 在21522条基因中,胃癌细胞间差异性表达基因为有551条,其中302条上调,249条下调。其中与免疫相关的基因共有7个,分别为HLA-E、RRAS、ULBP2、HLA-G、HLA-C、CTSB、CTSL,均表达上调。结论 Cdx2过表达上调了胃癌MGC803细胞免疫相关基因的表达,这可能与胃癌细胞生物学行为的改变有关。