2000年中国结核病流行病学抽样调查菌株分子流行病学特征

目的　从分子流行病学角度探讨中国结核分枝杆菌的分布特征。方法　样本的获得采用全国范围等比例分层整群随机抽样 ;构建以IS6 110RFLPDNA指纹方法和以DR为基础的SpoligotypingDNA指纹方法 ;采用Gelcompare4 1软件对DNA指纹图谱进行数字化 ,比较其相似性 ;同时应用该软件行聚类 (cluster)分析 ;用 χ2 检验比较不同组别病人的分离菌株成簇率 (clustering)的差别 ,利用公式 1和 2计算影响结核病近期传播的危险因素 (OR值 )。结果　共获得 4 0 2株可进行DNA指纹分析的结核分枝杆菌 ;其中 5 0 75 % (2 0 4 / 4 0 2 )为“北京基因型”菌株 ;发现 3簇指纹图谱相同的菌株 ,其中 1簇对应的病人来源于同一家庭 ;分组统计显示 :男性组与女性组、年龄≥ 4 0岁组与<4 0岁组成簇率之间差异有显著性 (P <0 0 5 ) ,近期传播的危险因素男性为OR1:2 0 4 95 %CI(1 0 7～ 3 96 ) ,OR2 :4 96 95 %CI(2 77～ 9 0 0 ) ;<4 0岁为OR1:1 6 895 %CI(1 0 1～ 2 80 ) ,OR2 :1 30 95 %CI(0 2～ 0 4 4 ) ,其他各组之间差异无显著性 (P >0 0 5 )。结论　北京基因型结核分枝杆菌在中国呈较高水平的流行 ;男性和年长 (≥ 4 0岁 )可能为结核病近期传播的危险因素。利用结核分枝杆菌的DNA指纹图谱 ,可以实现结核分枝杆菌传染源     

固原地区结核分子流行病学的特点

目的　探讨宁夏固原地区结核分子流行病学的特点。方法　提取结核分枝杆菌基因组DNA ,经限制性内切酶PvuⅡ切割、琼脂糖凝胶电泳和Southern转印后 ,用荧光标记的IS6 110DNA序列中 2 45bp探针杂交 ,以核酸化学发光试剂盒探测荧光信号 ,比较各菌株指纹的IS6 110拷贝数和带型 ,分析流行菌株的特点。结果　固原地区流行结核分枝杆菌临床分离株DNA指纹图谱带型相似 ,IS6 110拷贝数较多。结论　固原地区流行的结核分枝杆菌多态性程度较低 ,在基因上具较近的亲缘关系。     

间隔寡核苷酸分型方法在结核分支杆菌流行病学研究中的应用

目的探讨间隔寡核苷酸分型方法在结核分支杆菌分子流行病学研究中的应用范围。方法查阅国内外分子生物学领域中有关间隔寡核苷酸分型方法的文献,总结间隔寡核苷酸分型方法在结核分支杆菌流行病学研究中的应用。结果间隔寡核苷酸分型作为一种核酸分型方法,在流行病学研究中可以用来调查结核病暴发流行,追踪传染源,确定结核病及耐药结核病的传播机制,鉴定实验室交叉污染或院内感染和阐述结核分枝杆菌菌株分布及优势株的情况。结论间隔寡核苷酸分型方法具有简捷、直观、经济和快速的特点,和其他分型方法联合应用效果更好。     

青海省少数民族地区TT病毒（TTV）分子流行病学研究

目的 :探索青海省少数民族人群间TTV感染状况并进行分子流行病学调查 ;方法 :应用酶联免疫试验、聚合酶链反应 (PCR)技术的方法 ,检测 3个民族血清 ,测序分析一株藏族毒株DNA基因 ;结果 :1 56份血清排除HBV、HCV、HGV感染 ,TTV -IgG阳性率藏族 1 4.9% ;蒙古族 1 .9% ;土族未能测到阳性 ;1 3例TTV阳性血清经PCR检测TTVDNA阳性率 53 .8% ( 7/ 1 3 ) ,70 0个核苷酸分析与BDH1 及型的比较同源性为 90 %以上 ,同属G1a亚型 ;结论 :TTV在少数民族人群有感染性 ,不同民族和地域有显著差异 ( χ2 =7.53 ,P <0 .0 1 ) ,提示有外源性不同途径输入性感染的特征     

结核病DNA疫苗研究现状及其应用前景

DNA疫苗是90年代初刚刚兴起的免疫学新技术，目前已成为世界瞩目的传染病防治研究工作的一个重点和热点，DNA疫苗将成为21世纪新疆的结核病预防和治疗性疫苗。本文概述了结核病DNA疫苗研究的现状及其应用前景。     

重庆市区(1997～1998)痢疾流行菌株的分子流行病学研究

目的：了解近半年来重庆市区志贺菌的流行菌型。方法：对近两年收集的３４９株志贺菌进行血清学分型,质粒图谱分析和药敏试验。结果：３３４株细菌的质粒图谱显示;９８．８％的菌株含有质粒,其中２７９株福氏志贺菌共有８种质粒,分为１２种闰图谱模式。所有菌株对常用抗生素均为三重及三重以上耍药,且显示神速氏志加菌的多重耐药较宋内志 力更为严重。结论：福氏志贺菌和宋内志贺菌是本地区当前流行的两大菌群,福氏２ａ血清型     

青岛、淄博地区人轮状病毒分子流行病学研究

用聚丙烯酰胺凝胶电泳法对1983——1984年青岛、淄博两地区的108份轮状病毒标本进行了RNA电泳型分析。发现同一时期两地区流行的轮状病毒亚群不同,同一地区存在两亚群毒株的共同流行。共检出13个不同的电泳型,其中包括五个特殊的电泳型。本文还对轮状病毒核酸电泳型多形性出现的原因及意义进行了讨论。     

结核病感染发病的分子流行病学研究

本文就近年来我院收治的肺结核患者中,采取自愿方式,填写流行病学调查表。同时,采集患者血样送到中国军事医学科学院微生物实验室,进行分子生物学检测,通过流行病学调查及患者问卷,结合患者血样标本的分子生物学检测结果,主要探讨中国汉族人群肺结核发病与CD209基因多态性的关系,并分析其在肺结核发病中与环境因素及遗传因素的交互作用。同时结合国内外相关报道,就肺结核易感基因多态性研究作一综述。     

太原地区TT病毒感染的分子流行病学研究

目的：了解太原地区不同人群TT病毒（TTV）感染状况及基因型的分布情况。方法：采用聚合酶链反应（PCR）法对本地区不同人群血清标本进行检测,并分析其基因型。结果：196例中非甲-庚型肝炎患者31例;职业献血员53例,健康产妇112例,其血清TTV DNA阳性率分别为29.03%、58.49%、8.93%。10例TTV DNA阳性产妇的脐血TTV DNA为阴性。对4株TTV进行部分基因序列检测,结果表明其同源性在90%以上,均属同一基因型。结论：太原地区存在TTV感染,很可能是非甲-庚型肝炎的重要病原,且在职业献血员和慢性肝病患者中存在较高的感染率,本地区TTV主要为1a基因型。     

RAPD技术在武汉地区结核分枝杆菌指纹分型中的应用

目的探讨武汉地区结核病的分子流行病学规律。方法采用DNA随机扩增多态性(RAPD)指纹分型法,对武汉市129例肺结核患者的结核分枝杆菌进行基因指纹分型。结果129株中以Ⅰ型菌株(46株,35．7％)、Ⅱ型菌株(32株,24．8％)、Ⅲ型菌株(26株,20．2％)为主。初治与复治者的RAPD指纹类型的分布有显著性差异(P＜0．05)。所检菌株耐药与否,在RAPD指纹类型中分布也有显著性差异(P＜0．05)。耐药菌株中主要以耐链霉素为主(81．2％)。结论RAPD指纹分型是一种较好的分型方法。武汉地区结核病主要由Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型菌株引起,但耐药病例主要由Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ型菌株引起。     

Molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis in Gansu province of China

Background  Mycobacterial interspersed repetitive units-variable number tandem repeat (MIRU-VNTR) and Beijing family typing based on detecting the deletion of RD105 sequence are two common genotyping methods used to study the molecular epidemiologic characteristics of Mycobacterium (M.) tuberculosis. We collected 218 strains of M. tuberculosis between 2004 and 2006 in the Linxia Hui Autonomous Prefecture of Gansu province in Northwest China.

Methods  MIRU-VNTR analysis and Beijing family typing based on detecting the deletion of RD105 sequence were used to type the 218 strains, and their typing power was evaluated to look for practical and efficient genotyping methods suitable for the region.

Results  The MIRU typing yielded 115 distinct genotypes, including 98 unique isolates and 17 different clusters containing 120 isolates (55.05%); the cluster rate was 47.25%. By detecting the deletion of RD105 sequence, 188 of 218 (86.23%) isolates belonged to Beijing family. Combination of Beijing family typing and MIRU typing yielded 118 distinct patterns, including 101 unique isolates and 17 clusters containing 117 isolates (54.13%). The largest cluster contained 58 strains with MIRU genotype of 223325173533 which contained 50 strains belonging to Beijing family and 8 strains belonging to non-Beijing family.

Conclusions  The Beijing family strains occupied a large proportion and the Beijing family MIRU genotype 223325173533 is a dominant strain in Linxia of Gansu. Combining detecting the deletion of RD105 and MIRU typing together provides a simple, fast, and effective method which is low in cost and might be practical and suitable for M. tuberculosis genotyping in China.

     

北京昌平区北京/W系结核分枝杆菌的流行特征

目的:探讨北京/W系结核分枝杆菌在北京市昌平区的流行特征。方法:连续收集北京市昌平区2004年1月1日至2006年12月31日的结核分枝杆菌分离株336株,采用Spoligotyping和多重PCR法对其进行分型及亚分型;同时采用谱系定义靶标RD105、RD181、RD150、RD142和Real-timePCR方法进行分型和亚分型,并分析北京/W系的2个亚系与其对应患者年龄、出生地、抗结核药物敏感谱和卡介苗(BCG)接种情况之间的关系。结果:2种方法对该地区结核分枝杆菌分型及亚分型结果完全一致,均为:299株为北京/W系和37株为非北京/W系结核分枝杆菌;在北京/W系结核分枝杆菌中,存在RD181的非典型北京菌株47株(15.7%),而相对现代的缺失RD181的W菌/典型北京家族菌株252株(84.3%);在W菌/典型北京家族菌株中,RD150和RD142缺失的菌株分别为168和173株。W菌/典型北京家族菌株和非典型北京菌株2个亚系的分布与患者出生地、BCG接种情况、年龄以及抗结核药物敏感谱(链霉素、异烟肼、利福平和乙胺丁醇)均无关(χ2分别为0.530、1.623、2.180、<0.001、0.849、...     

分子信标荧光定量PCR技术检测结核分枝杆菌方法建立及其临床应用

目的 建立结核分枝杆菌的分子信标荧光定量PCR检测方法 ,探讨该方法 检测结核分枝杆菌的临床应用价值.方法 针对结核分枝杆菌Ag85B DNA特异保守序列设计引物和分子信标探针,并构建标准品.采用分子信标荧光定量PCR法、抗酸染色法、集菌培养法检测158例肺结核患者痰液标本,比较3种方法 的检出率.结果 所建立方法 最低检测限度为2个基因拷贝/反应,在2×10~2～2×10~8基因拷贝/mL范围内,Ct值同DNA量的对数呈线性关系.该方法 检测5株非分枝杆菌和6株非结核分枝杆菌结果 均为阴性,检测结核分枝杆菌H37Rv出现75 bp特异条带.分子信标荧光定量PCR法、抗酸染色法、集菌培养法阳性检出率分别为60.13%、16.46%、31.01%,荧光定量PCR法检出率明显高于抗酸染色法和集菌培养法.结论 分子信标荧光定量PCR法具有较高的灵敏度和特异度,对结核病的诊断有一定的临床意义.     

全球结核病的流行与控制

结核病是一个全球性的疾病,在被忽略近20年后又死灰复燃,成为当今世界一个主要的公共卫生问题.1993年,世界卫生组织因结核病的流行规模及控制全球结核病的迫切需要,宣布全球进入结核病紧急状态.中国是世界上人口最多的国家,位居全球结核病感染最严重的22个国家之首位.在20世纪80年代中晚期,美国也终止了其长期以来结核病的下降趋势,1992年美国结核病的发病率达到一个高峰.撒哈拉以南非洲地区是世界结核病例分布最多的三个区域之一,世界结核病发病率最高的15个国家有13个在这个地区内,并且HIV是这一区域结核病发病率最主要的单一预计因子.世界最严重的HIV相关结核病发病也是在这个区域.全球持续的严重结核感染状态,是由于贫困人口的增加和来自于结核高发病率国家的人口流动和HIV的影响,最主要的是没有维持必需的公共卫生组织及设施,以及错误的认为结核病已成为一个过去的问题.依靠现有的诊断和治疗方法,WHO推荐的DOT方案有效而经济,适用于全球在不同条件下的结核控制.     

结核分枝杆菌L型感染对结核病患者痰菌阴转率的影响

目的分析深圳市罗湖辖区结核病患者结核分枝杆菌（Mycobacteriumtuberculosis,MTB）及其L型（MTB—L）的感染状况,探讨MTB—L感染对结核病患者痰菌阴转率的影响。方法采用抗酸染色法检测辖区内2010—2011年收治的960例结核病确诊患者（初治916例、复治44例）的痰液标本并分析其治疗期间MTB和MTB—L的阳性检出率。计算结核病痰菌涂阳患者2、3月末痰菌阴转率,比较MTB阳性、MTB＋MTB．L阳性以及MTB．L阳性患者痰菌阴转率的差异。结果916例初治患者中MTB阳性患者411例、MTB＋MTB．L阳性患者130例、MTB-L阳性患者129例,初治结核病患者中MTB阳性患者2、3月末痰菌阴转率（90．3％、99．5％）均分别高于MTB＋MTB-L阳性患者（46．9％、89．2％）及MTB-L阳性患者（45．7％、89．1％）,差异均有统计学意义（Pl〈0．05）;而MTB＋MTB-L阳性患者2、3月末痰菌阴转率与MTB-L阳性患者比较差异均无统计学意义（尸〉0．05）。44例复治结核病患者中MTB阳性患者12例、MTB＋MTB-L阳性患者19例、MTB-L阳性患者13例,MTB阳性患者2月末痰菌阴转率（83．3％）分别高于MTB＋MTB-L阳性患者（42．1％）及MTB．L阳性患者（38．5％）,差异均有统计学意义（P〈0．05）;MTB阳性患者3月末痰菌阴转率（91．7％）分别略高于MTB＋MTB-L阳性患者（73．7％）及MTB-L阳性患者（76．9％）,但差异均无统计学意义（P〉O．05）;MTB＋MTB-L阳性患者2、3月末痰菌阴转率与MTB-L阳性患者比较差异均无统计学意义（尸〉0．05）。结论MTB-L感染可能是结核病患者痰菌阴转率低的重要原因．加强MTB-L感染监测是当前结核病防控的重要策略之一．     

应用分子线性探针技术快速筛查耐多药结核病的研究

目的应用分子线性探针(Geno Type MTBDRplus·GTplus)技术检测绵阳地区结核分枝杆菌的耐药性,了解耐多药结核病的状况,为制定地区结核病的预防控制策略提供科学依据。方法应用病例对照研究方法,对绵阳市9个县(市、区)送检的235株结核分枝杆菌同时运用GTplus和国际标准法-比例法检测利福平(RFP)和异烟肼(INH)的耐药性,分析GTplus诊断耐多药结核病的敏感性和特异性。结果 228株样本的结果有效,GTplus检测绵阳地区结核病耐多药率为14.04%(32/228),与比例法14.47%(33/228)相比,诊断耐多药结核病的结果差异无统计学意义(P0.05),敏感性和特异性分别为81.82%(27/33)和97.44%(190/195);结果报告时间1 d,明显快于比例法的42 d。结论 GTplus诊断耐多药结核菌特异、敏感、快速、方便,对控制结核病的传播具有重要意义。