成都市发热呼吸道症候群患者病毒感染调查

目的了解成都市发热呼吸道感染病例常见病毒的感染状况,探讨发热呼吸道症候群的病原谱构成情况。方法 2010-07/2011-03,采集成都市3家哨点医院具备发热、咳嗽以及胸部X线片提示肺部炎性改变等临床症状的呼吸道感染病例标本302份;采用多重RT-PCR方法,对302份呼吸道标本同时进行流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、冠状病毒、人偏肺病毒、人博卡病毒、人腺病毒、人鼻病毒和肠道病毒等常见呼吸道病毒核酸检测。结果 302份标本中检出阳性标本72份,核酸阳性率为23.84%（72/302）,其中两种病毒混合感染6份,占阳性标本的8.33%（6/72）;5岁以下儿童患者标本病毒核酸阳性检出率为39.33%（59/150）,其中偏肺病毒的检出率最高;6～18岁患者标本病毒核酸阳性检出率为15.15%（5/33）,其中呼吸道合胞病毒检出率最高;18岁以上患者标本阳性检出率为11.76%（14/119）,其中流感病毒检出率最高。3月份病毒核酸检出率最高为74.36%（29/39）,不同性别患者之间病毒核酸检出率差异无统计学意义。结论成都市发热呼吸道病毒感染病例的病原体以偏肺病毒、鼻病毒和呼吸道合胞病毒为主。     

台州地区2378例流感样病例呼吸道感染病毒病原学分析

目的了解台州地区流感样病例(ILI)呼吸道病毒的病原特征及流行趋势,为临床诊疗和防控策略的制订提供病原学依据。方法采用多重实时荧光定量RT-PCR法同时检测2 378份咽拭子标本人流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒、副流感病毒、鼻病毒、人偏肺病毒、人博卡病毒、人冠状病毒等常见呼吸道病毒核酸并分析。结果 2 378份标本中共检出阳性标本644份,流感病毒检出率最高,其次为鼻病毒;台州地区各年龄段患者流感病毒、鼻病毒、人偏肺病毒、副流感病毒3型、呼吸道合胞病毒以及人偏肺病毒的阳性率有显著差异,且病毒流行呈现一定的季节性。结论台州地区流感样病例呼吸道病毒感染以流感病毒和鼻病毒为主,并呈现季节性和年龄段偏好性。快速发现呼吸道感染的病原体,不仅对流感样病例的早期诊断有指导价值,同时可以为掌握疾病的流行特征提供依据。     

门诊发热患者秋冬季呼吸道病毒感染的病原学分布与快速诊断

目的了解门诊发热患者秋冬季呼吸道病毒感染的病原构成,建立门诊发热患者呼吸道病毒的快速诊断方法,提高呼吸道传染病病原快速检测能力。方法收集医院2013年11月-2014年1月205例患者咽拭子,采用荧光定量RT-PCR法对流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、人冠状病毒、人偏肺病毒、腺病毒、人博卡病毒和鼻病毒等进行核酸检测。结果 205份标本中有70份标本病毒阳性,阳性检出率为34.1%;病毒阳性标本中,流感病毒检出率最高,以甲型流感病毒为主、鼻病毒位居第2、冠状病毒位居第3;5份标本检出两种病毒混合感染,以冠状病毒混合感染为主;性别与病毒检出差异无统计学意义;75~89岁患者病毒检出率最高为57.1%,乙型流感病毒在不同年龄段感染差异有统计学意义(P<0.05);各种病毒引起的上呼吸道感染和肺炎差异均无统计学意义;患者体温37~37.9℃时病毒检出率最高。结论甲型流感病毒是秋冬季引起呼吸道感染的主要病原体,荧光定量RT-PCR可快速明确呼吸道感染病毒。     

2012年-2014年阳山县急性呼吸道感染儿童流行病毒检测分析

目的了解2012年-2014年阳山县7种常见流行病毒对急性呼吸道感染儿童的感染情况以及病毒的流行特征。方法收集0岁~6岁急性呼吸道感染患儿鼻咽拭子标本,采用多重荧光PCR方法分别检测标本中的7种流行病毒(博卡病毒、鼻病毒、Ⅲ型副流感病毒、甲型流感病毒、呼吸道合胞病毒、人偏肺病毒、人冠状病毒)。结果共采集标本240份,其中鼻病毒阳性率最高,人偏肺病毒次之,博卡病毒阳性率最低。博卡病毒和鼻病毒在阳山县的感染情况逐年下降,且在女性急性呼吸道感染儿童中没有检出博卡病毒。结论 2012年-2014年里阳山县急性呼吸道感染儿童以鼻病毒感染最为流行,且在秋季多发。     

急性呼吸道感染患者220例非细菌性病原体流行特征分析

目的了解2011年3月—2012年2月北京市丰台区急性呼吸道感染非细菌性病原谱构成及其流行特征,为该区呼吸道传染病的预防控制以及临床诊断、治疗提供实验室依据。方法随机采集哨点医院发热门诊就诊的急性呼吸道感染病例咽拭子标本220例,利用多重实时-聚合酶链反应、聚合酶链反应(RT-PCR、PCR)方法进行流行性感冒(流感)病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、肠道病毒、博卡病毒、偏肺病毒、冠状病毒、鼻病毒和腺病毒9种病毒性病原体的检测和支原体检测,并进行统计分析。结果从220份咽拭子标本中共检出125份阳性标本,阳性率为56.82%。其中有6份标本为双重感染,阳性率较高的为流感病毒(65/131,49.62%)、支原体和副流感病毒(均为26/131,19.85%)。其他病原体的检出率均小于5%。不同病原体检出在季节分布上存在差异:流感病毒冬季检出率最高,支原体秋季检出较多,而副流感病毒感染的高峰期发生在夏季,病原体检出率在季节分布上总体呈现冬季(12—2月)较高,夏季较低的特点。不同性别间病原体检出率无统计学差异。发病3 d内采集的标本流感病毒检出率高于3 d后采集的标本,而支原体相反。结论北京市丰台区急性呼吸道感染非细菌性病原体主要为流感病毒、支原体和副流感病毒。在对急性呼吸道感染病例的诊断治疗中应考虑到不同病原体的高发季节。     

丽水地区2020年住院儿童9种呼吸道病毒病原学特征分析

目的 了解丽水地区2020年9种常见儿童呼吸道病毒的病原学分布特点,为儿童呼吸道病毒感染的防治提供参考依据.方法 2020年住院儿童共送检呼吸道病毒标本1092份,通过RT-PCT法进行鼻病毒(HRV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、副流感病毒(PIV)、偏肺病毒(MPV)、博卡病毒(BoY)、腺病毒(ADV)、冠状病毒(...     

2010年哈尔滨市发热呼吸道症候群的病原学研究

目的建立黑龙江省呼吸道传染病病原监测平台,了解发热呼吸道病症候群病原谱的构成。方法在哈尔滨市儿童医院、社区医院及3家综合医院的内科、儿科、感染科的门急诊和住院病例中发现符合发热呼吸道症候群监测病例定义的患者进行信息收集和采集咽拭子,采用多重RT-PCR方法检测七种呼吸道病毒:流感病毒(FLU A、B型)、副流感病毒(PIV 1-4型)、呼吸道合胞病毒(RSV A、B型)、冠状病毒(HCoV)、偏肺病毒(hMPV)、博卡病毒(HBoV)、腺病毒(ADV)。结果 2010年4月-12月共采集标本208份,检出各种呼吸道病毒16份,阳性率为7.69%,其中PIV阳性率最高4.33%(9/208),其次为ADV 1.92%(4/208),HBoV、HCoV、FLUA各检出1例(0.48%),PIV1-4型均有检出,但以PIV3为主,未见混合感染或多重感染。阳性感染率在性别上统计学上无显著差异(x2=2.36,P>0.05)。年龄分布主要是5岁以下儿童,占总阳性数的43.75%(7/16),其次是5～10岁年龄组25%(4/16)。流行季节在5-8月份,PIV感染高峰是5月份,ADV感染高峰是8月份。结论哈尔滨市呼吸道病毒的主要感染人群是10岁以下儿童,在春夏季节PIV和ADV是主要的病原。     

2016—2020年湖北省荆州市严重急性呼吸道感染病毒病原谱分析

目的 了解湖北省荆州市严重急性呼吸道感染（sever acute respiratory infection,SARI）住院病例的呼吸道病毒感染情况,分析病毒病原谱特征。方法 收集2016—2020年湖北省荆州市哨点医院SARI病例咽拭子样本,采用实时荧光定量PCR方法检测流感病毒、人鼻病毒、人腺病毒、人副流感病毒、人呼吸道合胞病毒、人偏肺病毒、人冠状病毒及人博卡病毒8种常见呼吸道病毒,分析SARI病原谱构成、季节分布规律及易感人群。结果 共收集并检测SARI病例样本1 506份,阳性检出率为55.11%,8种病原均有检出,其中病原谱前三的病毒为流感病毒（15.34%）、人呼吸道合胞病毒（9.83%）及人腺病毒（6.44%）。病毒混合感染率为7.97%,以人鼻病毒或人腺病毒合并感染最常见。病毒检出高峰在秋季（63.27%）和冬季（58.54%）,不同的病毒呈现出其特征性季节流行规律,冬春季节主要流行流感病毒及人呼吸道合胞病毒,夏季为人腺病毒,秋季为人鼻病毒。5岁以下婴幼儿（60.69%）发病率高于成人。结论 荆州市SARI病毒性病原谱构成复杂,人呼吸道合胞病毒、人腺病毒及流感病毒是荆州...     

北京地区儿童急性上呼吸道感染病毒病原学调查

目的:了解北京地区儿童急性上呼吸道感染病毒病原学现况,探讨不同年龄组、不同月份病毒检出情况,为预防策略制定、临床诊断、治疗提供病原学依据.方法:采用多重RT-PCR法,对365份咽拭子样本同时检测腺病毒,偏肺病毒,冠状病毒229E,1、2、3型副流感病毒;甲、乙型流感病毒,甲、乙型呼吸道合胞病毒,甲型鼻病毒,冠状病毒OC43共12种常见呼吸道病毒.结果:365份样本中有阳性检出结果的有246份,阳性率为63.08%,其中有2种以上病毒混合感染65份,占17.80%;6个月以下患儿以甲型呼吸道合胞病毒检出阳性率最高;6个月以上至14岁患儿中以甲型流感病毒检出阳性率最高;2006年10月及2007年4月腺病毒检出率最高,11月份与2月份以呼吸道合胞病毒检出率最高,12月与1月份以流感病毒检出率最高;在阳性检出样本中流感病毒占52.85%、呼吸道合胞病毒占26.42%、腺病毒占18.70%.结论:流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒为北京地区儿童急性上呼吸道病毒感染主要致病原.随年龄不同、流行季节中月份不同而有一定的流行规律.     

荧光定量PCR检测急性呼吸道感染患者常见呼吸道病毒的研究

目的分析2011年8月至2012年8月期间惠州市急性呼吸道感染病毒性病原谱的构成及流行特征,为临床诊断、治疗和呼吸道传染病的预防控制提供病原学依据。方法应用荧光定量PCR方法,对485例鼻咽拭子样本同时进行甲型流感病毒、乙型流感病毒、腺病毒、博卡病毒、副流感病毒、鼻病毒、呼吸道合胞病毒、人偏肺病毒、人冠状病毒的检测,并进行统计学分析。结果 485份样本中检出228份呼吸道病毒阳性的样本,阳性率为47.01%,其中混合感染20份,占阳性样本的8.77%。病毒病原谱构成前三位为乙型流感病毒、鼻病毒和甲型流感病毒。病毒检出阳性率的时间分布有一定规律性：1月至次年2月阳性率较高,不同月份检出的优势病毒不同。各年龄组病毒阳性率差异有统计学意义（χ2=19.414,P〈0.05）,不同年龄组病毒感染的病原谱构成也不同：0～5岁年龄组以鼻病毒为主;5岁以上各年龄组均以流感病毒为主。不同性别患者之间病毒核酸检出率差异无统计学意义（χ2=0.522,P〉0.05）。结论乙型流感病毒、鼻病毒和甲型流感病毒是惠州市急性呼吸道感染主要病原体。部分病原体的感染与年龄和季节有一定的关联;ARTI患者中部分合并感染其他呼吸道病毒,应长期监测呼吸道病毒的活动水平。     

深圳地区2011年流感样病例的病毒病原学调查

目的:了解深圳地区流感样病例的病毒病原学现况,为呼吸道传染病的诊断和预防控制提供病原学依据。方法:采用实时荧光定量PCR法,对269份咽拭子样本同时检测流感病毒、腺病毒、鼻病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、冠状病毒和人偏肺病毒共7种15个亚型常见呼吸道病毒。结果:2011年深圳流感样病例的病毒阳性检出率为50.2%(135/269),在检出的呼吸道病毒中鼻病毒检出最多,其次是流感病毒、冠状病毒和腺病毒。夏季和秋季都是鼻病毒占优势,分别为57.6%(19/33)和52.6%(20/38);冬季则以流感病毒为优势,占60.5%(23/38)。儿童中鼻病毒检出率最高,青少年和成人中流感病毒检出率最高。结论:鼻病毒、流感病毒、冠状病毒和腺病毒是深圳地区流感样病例的主要病原体,随着季节、月份的不同和年龄的不同而具有一定的流行规律。     

Isolation of influenza viruses in MDCK 33016PF cells and clearance of contaminating respiratory viruses

This paper summarizes results obtained by multiplex PCR screening of human clinical samples for respiratory viruses and corresponding data obtained after passaging of virus-positive samples in MDCK 33016PF cells. Using the ResPlexII v2.0 (Qiagen) multiplex PCR, 393 positive results were obtained in 468 clinical samples collected during an influenza season in Germany. The overall distribution of positive results was influenza A 42.0%, influenza B 38.7%, adenovirus 1.5%, bocavirus 0.5%, coronavirus 3.3%, enterovirus 5.6%, metapneumovirus 1.0%, parainfluenza virus 0.8%, rhinovirus 4.1%, and respiratory syncytial virus (RSV) 2.5%. Double infections of influenza virus together with another virus were found for adenovirus B and E, bocavirus, coronavirus, enterovirus and for rhinovirus. These other viruses were rapidly lost upon passages in MDCK 33016PF cells and under conditions as applied to influenza virus passaging. Clinical samples, in which no influenza virus but other viruses were found, were also subject to passages in MDCK 33016PF cells. Using lower inoculum dilutions than those normally applied for preparations containing influenza virus (total dilution of the original sample of ∼10⁴), the positive results for the different viruses turned negative already after 2 or 3 passages in MDCK 33016PF cells. These results demonstrate that, under practical conditions as applied to grow influenza viruses, contaminating viruses can be effectively removed by passages in MDCK cells. In combination with their superior isolation efficiency, MDCK cells appear highly suitable to be used as an alternative to embryonated eggs to isolate and propagate influenza vaccine candidate viruses.     

Effects of Nonpharmaceutical COVID-19 Interventions on Pediatric Hospitalizations for Other Respiratory Virus Infections,Hong Kong

To determine the effects of nonpharmaceutical interventions (NPIs) for coronavirus disease on pediatric hospitalizations for infection with respiratory viruses other than severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, we analyzed hospital data for 2017–2021. Compared with 2017–2019, age-specific hospitalization rates associated with respiratory viruses greatly decreased in 2020, when NPIs were in place. Also when NPIs were in place, rates of hospitalization decreased among children of all ages for infection with influenza A and B viruses, respiratory syncytial virus, adenovirus, parainfluenza viruses, human metapneumovirus, and rhinovirus/enterovirus. Regression models adjusted for age and seasonality indicated that hospitalization rates for acute febrile illness/respiratory symptoms of any cause were reduced by 76% and by 85%–99% for hospitalization for infection with these viruses. NPIs in Hong Kong were clearly associated with reduced pediatric hospitalizations for respiratory viruses; implementing NPIs and reopening schools were associated with only a small increase in hospitalizations for rhinovirus/enterovirus infections.     

西宁地区儿童急性呼吸道感染病毒病原学检测分析

目的:探讨西宁市儿童常见呼吸道病毒感染的病原学特点和分布特征。方法:采集141例急性呼吸道感染住院患儿的咽拭子标本,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)进行合胞病毒(RSV),流感病毒A、B型(IFV A、B),副流感病毒Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型(PIVⅠ、Ⅱ、Ⅲ),腺病毒(ADV),冠状病毒(HCoV)OC43/HKU1、229E/NL63,博卡病毒(HBoV),偏肺病毒(hMPV)检测。结果:从141份鼻咽拭子样本中检测出呼吸道病毒阳性22例,阳性率为15.6%。检出4种呼吸道病毒,其构成比分别为ADV 45.5%、PIVⅡ26.1%、HCoV-229E/NL63 17.4%、IFV A 13.0%。不同性别间患儿呼吸道病毒阳性率无统计学差异(P>0.05)。<6个月组阳性率最低(6.3%),3～6岁年龄组阳性率最高(29.2%)。结论:西宁地区急性呼吸道感染病毒病原检出率低于全国水平,ADV为西宁地区急性呼吸道感染的首位病毒病原体,HCoV-229E/NL63是该地区急性呼吸道感染的病原之一。     

长春地区冬季儿童上呼吸道感染病毒病原学检测结果分析

目的了解长春地区冬春季急性上呼吸道感染患儿6种呼吸道病毒感染情况。方法采集门诊119例患儿咽拭子,应用(RT)-PCR方法检测甲型流感病毒(IVA)、A亚型呼吸道合胞病毒(RSVA)、副流感病毒(PIV)3型、腺病毒(ADV)、博卡病毒(HBoV)以及人偏肺病毒(hMPV)等6种常见呼吸道病毒。结果检测出阳性标本53例,阳性率44.54%,以流感病毒最高(19.33%)。经χ2检验,病毒总检出率在性别间差异有统计学意义(χ2=7.96,P<0.05)。结论流感病毒是长春地区2008年冬季患儿急性上呼吸道感染的主要病毒病原,男性患儿较女性患儿对呼吸道病毒易感。     

广州地区儿童呼吸道病毒感染流行情况及混合感染调查

目的:了解广州地区儿童呼吸道感染的病毒流行特征及病毒混合感染的病原学构成。方法:2006年9月～2009年8月共收集720例起病3天内的呼吸道感染患儿鼻、咽拭子,应用荧光定量PCR方法检测标本中流感病毒(Flu)、副流感病毒(HPIV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、鼻病毒(HRV)、偏肺病毒(MPV)及冠状病毒(HCoV)等7种病毒的核酸。结果:①病毒总检出率为69.7%(502/720),检出率最高的前3种病毒为RSV(19.4%)、Flu(16.9%)和HRV(14.2%)。不同年龄组患儿同种病毒检出率比较差异有统计学意义(P<0.05)。②502例阳性标本中,83例(16.5%)检出两种病毒混合感染,7例(1.4%)检出3种病毒混合感染。不同年龄组患儿混合感染发生率比较差异有统计学意义(P<0.05)。③病毒混合感染高峰季节是春季和夏季,其中春季以RSV、HRV、Flu和MPV混合感染为主,夏季则以Flu、HRV和ADV混合感染为主。结论:RSV、Flu和HRV是广州地区儿童呼吸道感染的主要病原体,病毒混合感染以RSV和Flu最为常见,随不同年龄、不同季节有一定变化规律。     

河北省2013-2015年急性上呼吸道感染病毒病原学构成研究

目的 了解河北省2013-2015年引起急性上呼吸道感染（acute upper respiratory infection,AURI）的病原学构成和流行病学特征,为呼吸道感染的诊断和防治工作提供科学依据。方法 采集河北省4家医院门诊就诊的AURI患者的咽拭子标本1 551份,提取核酸后采用多重实时荧光定量聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）方法检测15种呼吸道病毒。结果 采集1 551份临床咽拭子标本,检测出阳性标本714例,阳性率为46.03%,其中鼻病毒阳性率最高,为186（11.99%）例,其次为副流感病毒3型167（10.77%）例、呼吸道合胞病毒122（7.87%）例、腺病毒108（6.96%）例、乙型流感病毒56（3.61%）例、人偏肺病毒40（2.58%）例、甲型流感病毒39（2.51%）例、人博卡病毒38（2.45%）例、副流感病毒1型35（2.26%）例、冠状病毒229E/NL63型33（2.13%）例、肠道病毒32（2.06%）例、副流感病毒4型31（2.00%）例、冠状病毒OC43型30（1.93%）例、副流感病毒2型11（0.71%）例。病毒混合感染病例176例,检出率为11.35%。5岁以下年龄组病毒阳性率最高为56.07%（337/601）。结论 河北省AURI主要以鼻病毒、副流感病毒3型、呼吸道合胞病毒、腺病毒、流感病毒为主,各病毒有各自的流行特征。     

急性下呼吸道感染患者支气管肺泡灌洗液非典型病原体与病毒检测

目的探讨急性下呼吸道感染患者非典型病原体与病毒感染情况。方法采集71例社区获得性肺炎和21例急性气管一支气管炎患者支气管肺泡灌洗液（BALF），采用多重PCR技术与Luminex xMAP多重分析技术平台相结合，以荧光微球为载体检测非典型病原体与多种病毒。结果10种（14个亚型）病原体阳性检出率为50．00％，其中病毒阳性检出率为33．69％，以流感病毒A为主，其占病毒阳性检出的67．74％f非典型病原体阳性检出率为16．30％，以肺炎支原体（MP）为多，其占非典型病原体阳性检出的73．33％IMP、病毒和细菌混合感染率为13．04％。结论多重荧光微球检测技术具有高通量、敏感性高、特异性强、检测速度快、价格便宜的优点，可实用于临床病原微生物的快速检测；流感病毒A和肺炎支原体是本地区社区获得性肺炎和急性气管-支气管炎重要的病原体，并有相互混合感染或与细菌混合感染，临床应予重视。     

SARS and common viral infections

In California, molecular testing was useful in decreasing suspicion for severe acute respiratory syndrome (SARS), by detecting common respiratory pathogens (influenza A/B, human metapneumovirus, picornavirus, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia spp., parainfluenza virus, respiratory syncytial virus, and adenovirus) in 23 (45%) of 51 patients with suspected SARS and 9 (47%) of 19 patients with probable SARS.