基于网络药理学与分子对接的加减香砂六君子汤治疗新型冠状病毒肺炎恢复期肺脾气虚证的机制研究

目的 探讨加减香砂六君子汤治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）恢复期肺脾气虚证的作用机制。方法 利用TCMSP数据库筛选中药活性成分和靶点，利用Gendcars、OMIM数据库筛选疾病靶点，STRING平台对靶点进行PPI网络构建，并进行GO和KEGG分析，利用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络图，然后通过拓扑学参数分析获得加减香砂六君子汤主要活性成分和靶点，最后将主要活性成分与靶点进行分子对接验证。结果 得到槲皮素、木犀草素、山柰酚、柚皮素等115个活性成分，PTGS2、NOS2、PPARG、PTGS1、MAPK14等48个靶点，主要涉及IL-17、TNF、T细胞受体、MAPK、VEGF等155条通路。分子对接显示，槲皮素、木犀草素、山柰酚、柚皮素与3CL水解酶、ACE2、PTGS2具有较好的结合活性，与第七版推荐抗病毒药物结合能相近。结论 加减香砂六君子汤活性成分可通过与3CL水解酶、ACE2、PTGS2结合，调控IL-17、TNF、T细胞受体、MAPK、VEGF等信号通路来抑制炎症反应，调节机体免疫，减轻肺损伤，促进细胞生长分化和肺血管生成，从而改善患者症状，促进恢复期患者康复，提高机体免疫力，降低疾病复发或再感染的风险。     

基于网络药理学和分子对接探讨参苓白术散治疗代谢相关脂肪性肝病作用机制

目的 应用网络药理学方法和分子对接探讨参苓白术散治疗代谢相关脂肪性肝病的潜在作用机制。方法 根据TCMSP数据库搜集中药活性成分及其作用靶点,GeneCards、Drugbank数据库搜集疾病靶点,借助Cytoscape 3.9.1软件预测关键活性成分及核心靶点。交集靶点通过STRING数据库进行蛋白互作分析,Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析,最后借助AutoDock Vina 1.1.2软件进行分子对接验证。结果 筛得关键活性成分有槲皮素、豆甾醇、山柰酚、木犀草素、β-谷甾醇、7-甲氧基-2甲基异黄酮、柚皮素等,核心靶点有AKT1、TNF、IL6、TP53、VEGFA、IL1B、CASP3、ESR1、MAPK3、PTGS2,潜在作用靶点主要富集在P53、TNF、IL17、Th17细胞分化等信号通路。分子对接结果显示结合力均良好。结论 参苓白术散治疗代谢相关脂肪性肝病具有多成分、多靶点、多通路的特点。     

橘红痰咳液联合复方甲氧那明治疗感染后咳嗽的疗效观察

目的 运用网络药理学研究芍药甘草汤治疗乙型病毒性肝炎所致肝损伤的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取芍药甘草汤的化合物及靶点,以口服生物利用度（OB）≥30%和类药（DL）≥0.18为阈值进行化合物筛选,将靶点输入Uniprot获取靶点对应的基因Symbol;从TTD、OMIM等数据库获取乙型病毒性肝炎的相关靶点并筛选出与芍药甘草汤靶点基因的交集基因;运用Cytoscape3.8.0软件绘制活性成分-靶点、疾病-中药-化合物-交集靶点（基因）网络图;运用String构建蛋白相互作用网络,再用R语言的Bioconductor安装包,进行GO富集及KEGG通路富集分析,并联合主要化合物、交集基因与通路分析结果,绘制成分-靶点-通路网络图;用Vina软件对筛选出来的结果进行分子对接。结果 筛选得到芍药甘草汤有效成分105种、有效成分靶点214个;筛选得到乙型病毒性肝炎疾病靶点5 984个,药物-疾病交集基因198个;经蛋白互作网络及拓扑结构分析得到21个核心靶点,121条相互作用关系;槲皮素、山柰酚、柚皮素等为芍药甘草汤的主要活性成分,PPARA、RB1、TP53、MAPK3、AKT1、STAT3、JUN等为主要作用靶点。GO富集分析显示靶点所在的细胞组分主要为薄膜筏、膜微域、膜区域;生物学过程主要富集在有对金属离子的响应、对脂多糖的反应;分子功能主要为核受体活性、转录因子活性。KEGG富集发现膜区由糖基化终末产物介导的AGE-RAGE通路、乙型肝炎通路等为主要通路。进一步筛选核心靶点及化合物成分进行分子对接显示MAPK3、AKT1、STAT3、JUN作为核心靶点可与槲皮素、山柰酚、柚皮素稳定对接。结论 通过网络药理学及分子对接的方法,找到了芍药甘草汤治疗慢性乙型病毒性肝炎肝损伤可能的潜在靶点,预测了其发挥药理作用的关键通路。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨十九畏药对“郁金-丁香”抗肝纤维化作用机制

目的 通过网络药理学和分子对接技术探讨郁金-丁香药对抗肝纤维化的作用机制。方法 于2022年1月8日检索中药系统药理学数据平台（TCMSP）获取郁金和丁香的有效活性成分及相关靶点并进行筛选和预测;肝纤维化相关靶点的数据通过NCBI基因数据、OMIM数据库和Genecards数据库获取;运用软件Venny 2.1绘制药物-疾病靶点韦恩图,得到药物抗肝纤维化的作用靶点;运用Cytoscape 3.8.2软件构建药物-活性成分-靶点相互作用网络并分析其拓扑结构;运用String数据库构建蛋白质相互作用（PPI）网络图;利用David和Metascape数据库对关键靶点分别进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析;利用PubChem和RCSBPDB数据库对关键成分和靶点进行分子对接。结果 筛选得到郁金-丁香药活性成分44个,对应作用靶点200个,肝纤维化候选靶点3 951个,药物与疾病交集靶点155个。药物-活性成分-靶点网络和PPI网络分析显示槲皮素、山柰酚、柚皮素、β-谷甾醇等是药对治疗肝纤维化的关键成分,蛋白激酶B1(AKT1)、白细胞介素（IL）-6、IL-1...     

基于网络药理学与分子对接探讨小儿豉翘清热颗粒治疗甲型流感的作用机制

目的 探讨小儿豉翘清热颗粒治疗甲型流感的网络药理学的作用机制。方法：运用TCMSP数据库筛选药物成分及靶点,并借助GeneCards、OMIM、TTD、PharmGkb数据库检索疾病靶点,利用Cytoscape 3.9.1构建“药物-活性成分-靶点”网络图,借助STRING构建蛋白互作网络图,筛选出核心靶点,通过DAVID数据库进行基因本体（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析,借助AutoDockTool运算分子对接结合能。结果 筛选出245种药物活性成分,269个药物靶点,2 045个疾病靶点,交集靶点131个。确定槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-谷甾醇、豆甾醇、黄芩素、汉黄芩素、柚皮素为药物的关键成分,确定核心靶点为蛋白激酶B1（AKT1）、肿瘤坏死因子（TNF）、TP53、白细胞介素-6（IL-6）、IL-1B、血管内皮生长因子A（VEGFA）、信号转导和转录激活因子3（STAT3）、胱天蛋白酶3（CASP3）。分子对接结果显示各活性成分与潜在靶点结合能力良好。结论 小儿豉翘清热颗粒作用机制复杂,可能与Toll样受体信号通路相关,可通过联合多靶点、多通路、多效应达到治疗甲型流感的作用。     

基于网络药理学和分子对接技术的金卷升板胶囊治疗血小板减少症作用机制探讨

目的 运用网络药理学和分子对接技术预测金卷升板胶囊治疗血小板减少症的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）及GeneCards数据库筛选金卷升板胶囊治疗血小板减少症的相关化合物及其靶点。利用Cytoscape 3.9. 1软件构建活性成分-靶点网络;利用String数据库构建蛋白-蛋白互作（PPI）网络;利用Metascape平台进行基因本体论（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用Autodock Vina软件进行分子对接。结果 共获得88个活性成分及159个共有靶点;关键通路包括癌症通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物的多配体受体（AGE-RAGE）信号通路及脂质和动脉粥样硬化信号通路等。获得槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇3个重要化合物,以及TP53,AKT1,JUN 3个核心靶点;分子对接最小结合能均小于-5.0 kcal/mol。结论 金卷升板胶囊可能通过槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等关键活性成分,作用于TP53,AKT1,JUN等潜在核心靶点,调控癌症通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路...     

基于网络药理学及分子对接技术探讨柏子养心丸治疗失眠症的作用机制

目的 采用网络药理学方法及分子对接技术探讨柏子养心丸治疗失眠症的潜在分子机制。方法 通过TCMSP数据库收集柏子养心丸的主要化学成分,经ADME筛选活性化合物并获取其作用靶点;搜索GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD、DrugBank数据库归并失眠症相关疾病基因;使用R语言程序对药物与疾病靶点取交集并上传至STRING平台构建蛋白相互作用（PPI）网络,应用Cytoscape软件进一步判别其核心模块;基于R语言平台对交集靶点进行基因本体（GO）功能与京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用Cytoscape软件构筑“柏子养心丸活性成分–失眠症基因”网络,并使用CytoNCA工具分析其关键药效组分与核心靶点;运用AutoDock套件进行网络关键成分与靶点的分子对接验证,并追溯PPI核心模块与其关联成分实行潜在成分与靶标的二次挖掘。结果 共筛选出槲皮素、山柰酚、木犀草素、黄芩素、柚皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、7-O-甲基异微凸剑叶莎醇、7-甲氧基-2-甲基异黄酮等柏子养心丸的有效成分,治疗失眠症的作用靶点为前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、雌激素受体1(...     

枳椇子抗肝纤维化作用网络药理学研究

目的 探讨枳椇子抗肝纤维化的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取枳椇子的活性成分,构建活性成分库。利用GeneCards和人类孟德尔遗传数据库（OMIM）获取肝纤维化的潜在靶点,利用Venny平台与枳椇子活性成分靶点取交集,通过Cytoscape软件构建成分-靶点网络,并根据节点度值筛选得到核心成分。将共有靶点导入String构建蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络,并根据节点度值筛选得核心靶点;采用R语言软件进行基因本体论（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果 共获得活性成分7个,对应靶点183个,与肝纤维化共同靶点166个;枳椇子中槲皮素、山柰酚、柚皮素等6个成分为抗肝纤维化的核心成分;PPI网络分析得到AKT1,JUN,MAPK3等10个核心靶点;GO功能富集分析主要涉及金属离子应答、药物应答及化学刺激细胞应答等生物学过程,KEGG通路富集分析主要涉及肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素17(IL-17)及晚期糖基化终末产物及其受体等信号通路。结论 枳椇子可能通过槲皮素、山柰酚及柚皮素等多种成分,作用于AKT1,JU...     

基于网络药理学和分子对接探究柴胡清肝汤治疗肉芽肿性乳腺炎的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨柴胡清肝汤治疗肉芽肿性乳腺炎的作用机制。方法 利用TCMSP数据库和Uniprot数据库筛选柴胡清肝汤的有效活性成分和作用靶点信息,利用GeneCards数据库获取肉芽肿性乳腺炎的相关靶点,并利用Cytoscape 3.9.1软件构建药物-成分-共同靶点关系网络。通过Venny 2.1.0构建韦恩图获取药物和疾病的共同靶点,利用STRING数据库获取核心蛋白的相互作用网络,运用DAVID数据库对关键靶点进行GO富集和KEGG通路富集分析,运用AutoDock及Pymol对关键靶点与相应活性成分进行分子对接验证,分析柴胡清肝汤治疗肉芽肿性乳腺炎的潜在作用机制。结果 共获得柴胡清肝汤有效活性成分199个,药物-疾病作用靶点23个,其中槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、豆甾醇、黄芩素等关键有效活性成分与IL-6、TNF、ALB、IL-1β、CXCL8、STAT3、CCL2、IL-4等靶点相互作用,调控IL-17、Toll样受体、细胞因子受体相互作用、NF-κB、TNF等信号通路,分子对接结果显示筛选的主要活性成分与其对应靶蛋白具有较好的结合活性。结论 柴胡清肝...     

基于网络药理学与分子对接技术探讨齿痛消炎灵颗粒治疗牙周炎的作用机制

目的 基于网络药理学与分子对接方法探究齿痛消炎灵颗粒治疗牙周炎的活性成分及潜在靶点，并探讨其可能的作用机制。方法 通过TCMSP数据库、ETCM数据库并结合文献报道筛选齿痛消炎灵颗粒潜在的活性成分及靶点，利用Cytoscape 3.9.1构建"中药-活性成分-靶点"的网络图；在GeneCards、TTD、OMIM、DisGeNET、DrugBank数据库获取牙周炎疾病相关靶点，利用Cytoscape 3.9.1构建"化合物-靶点-疾病"相互作用网络；采用STRING数据平台构建蛋白相互作用（PPI）网络并使用Cytoscape 3.9.1软件对其进行拓扑学分析；进一步利用Metascape网站对筛选得到的靶点进行基因本体（GO）和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析；选取degree值排名前5位的关键靶点和有效成分作为受体蛋白和配体小分子，使用AutoDockTools 1.5.6对配体和受体进行分子对接，并使用Pymol将分子对接结果可视化。结果 共筛选得到齿痛消炎灵颗粒的264个潜在活性成分，得到齿痛消炎灵颗粒治疗牙周炎的作用靶点157个；拓扑学分析发现关键活性成分以槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、柚皮素、木犀草素等为主；PPI网络中关键靶点为肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-6（IL-6）、白细胞介素-1β（IL-1β）、蛋白激酶B1（Akt1）、肿瘤蛋白p53（TP53）、血管内皮生长因子A （VEGFA）、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3（CASP3）、丝裂原活化蛋白激酶3（MAPK3）、表皮生长因子受体（EGFR）、低氧诱导因子-1（HIF-1A）、前列腺素内过氧化物合酶2（PTGS2）等。GO富集分析筛选出2 137个条目，涉及生物过程1 884条，细胞组成93条，分子功能160条；KEGG富集到基因通路206条；分子对接结果发现核心成分与核心靶点能够较好的结合。结论 首次预测了齿痛消炎灵颗粒多成分、多靶点、多通路治疗牙周炎的作用机制，为齿痛消炎灵颗粒的药效物质基础研究提供了理论依据。     

基于网络药理学结合分子对接技术分析血平片治疗月经不调的作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨血平片治疗月经不调的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索血平片有效成分的活性靶点,GeneCard和Disgenet数据库检索与“irregular menstruation”相关的疾病靶点,筛选出交集靶点并输入String数据库构建蛋白互作网络,利用Cypscape数据库分析并筛选出核心靶点,构建疾病–通路–靶点–化学成分网络。使用David数据库对交集靶点进行基因本体(GO)和京东基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 通过网络拓扑关系图筛选出了柚皮素、大黄酚、山柰酚、甲基异茜草素、大黄素和大黄素甲醚6个主要成分与丝苏氨酸特异性蛋白激酶(Akt1)、肿瘤坏死因子(TNF)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC)、雌激素受体1(ESR1)、表皮生长因子受体(EGFR)和过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)6个核心靶点进行分子对接验证。结果显示,血平片活性成分大黄素、甲基异茜草素、山柰酚等与Akt1、TNF、SRC、ESR1、EGFR、PPARG均有较好的结合活性。结论 血平片可通过多成分作用多靶点治疗月...     

基于网络药理学及分子对接的五子衍宗丸治疗肝纤维化作用机制探讨

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨补肾复方五子衍宗丸治疗肝纤维化的作用机制。方法 使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP,http://lsp.nwu.edu.cn/tcmspsearch.php)数据库预测五子衍宗丸有效成分的靶点并通过Uniprot数据库进行靶点名称标准化;通过OMIM、Gene Cards、DisGeNET数据库收集肝纤维化靶点,通过韦恩图筛选活性成分靶点和疾病靶点基因的交集,获取五子衍宗丸治疗肝纤维化的潜在靶点;运用Cytoscape 3.9.0构建有效成分-靶点-肝纤维化网络,预测核心靶点,构建基于STRING平台的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用微生信平台进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;使用AutoDockTools软件,结合PPI网络及GO功能、KEGG通路分析,将核心靶点与有效成分进行对接验证。结果 获得五子衍宗丸活性成分84个,筛选出有效成分作用靶点179个,肝纤维化靶点798个,五子衍宗丸与肝纤维化交集靶点81个,经拓扑属性分析筛选得到五子衍宗丸26个活性成分、37个治疗肝纤维化关键靶点;根据“活性成分-靶点-通路”网络图,预测槲皮素、山柰酚、苦参碱、黄豆黄素为五子衍宗丸作用于肝纤维化的重要活性成分;RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL6)、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等为核心靶点。GO功能富集分析的生物学过程(BP)主要与RNA聚合酶II启动子转录的正调控、基因表达的正调控等关联;细胞组分(CC)主要与细胞外空间、细胞核等关系密切;分子功能(MF)主要与大分子复合物结合、蛋白激酶活性、RNA聚合酶II核心启动子近端序列特异性DNA结合等相关。五子衍宗丸治疗肝纤维化途径主要包括化学致癌-活性氧信号通路、JAK-STAT信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等。核心成分槲皮素、山柰酚、苦参碱、黄豆黄素与核心作用靶点AKT1、TNF、IL6、VEGFA、CASP3等对接结合稳定,分子对接初步证明关键成分自发地与多个核心蛋白结合,可对多个关键靶点进行调控。结论 通过网络药理学及分子对接初步揭示补肾复方五子衍宗丸影响凋亡过程的正负调控、氧化应激、炎症因子、血管生成等反应过程,具有多成分、多靶点、多通路等作用特点,可为临床肝纤维化治疗中重视补肾法提供参考依据。     

基于网络药理学及分子对接探讨仙鹤草改善慢性萎缩性胃炎的作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨仙鹤草改善慢性萎缩性胃炎的物质基础及作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选仙鹤草的活性成分并预测其作用靶点；通过GeneCards、OMIM数据库筛选慢性萎缩性胃炎相关靶点；将活性成分靶点与慢性萎缩性胃炎靶点取交集，通过String 12.0数据库构建蛋白相互作用（PPI）网络，并运用Cytoscape 3.10.1软件构建“中药–疾病–化合物–交集靶标”网络图；通过R软件对核心靶点进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析以预测作用机制；通过AutoDock软件进行分子对接验证。结果 从仙鹤草中筛选出5个活性成分，作用于90个靶点，其中仙鹤草改善慢性萎缩性胃炎的核心活性成分为鞣花酸、山柰酚、儿茶素、木犀草素、槲皮素；核心靶点为B淋巴细胞瘤-2（Bcl-2）、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3（CASP3）、表皮生长因子受体（EGFR）、缺氧诱导因子-1A（HIF-1A）、原癌基因（MYC）等；作用机制主要涉及抗肿瘤、调节免疫、调节脂代谢、抗病毒等多条信号通路；分子对接显示，仙鹤草核心活性成分与核心靶点具有较高亲和力。结论 仙鹤草可能通过调节细胞增殖、凋亡、炎症、代谢等相关基因及通路发挥多靶点、多通路的治疗作用。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨沙棘治疗癌症的关联机制

目的:通过网络药理学及分子对接技术预测沙棘治疗癌症的作用机制。方法:利用TCMSP、Unipro数据库收集有效成分及其作用靶标,Venny 2.1寻找交集靶点,通过Gene Cards及OMIM数据库收集和筛选选疾病靶点,STRING v11.0数据库进行PPI网络分析,PDB及Pub Chem进行蛋白质结构及小分子结构确认,通过Cytoscape(Version 3.7. 1)软件网络图构建沙棘治疗癌症关联网络。结果:共筛选沙棘22个活性成分节点,100个靶基因节点,沙棘治疗癌症的潜在机制可能是由槲皮素、山奈酚、β-胡萝卜素、异鼠李素等多个成分作用于TP53、AKT1、MYC、CASP3、VEGFA等关键靶标,对接结果良好。结论:沙棘可能通过多成分、多靶点、多通路的共同作用来发挥其治疗癌症的作用。     

基于网络药理学和分子对接探究涤痰汤治疗冠心病的作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接探讨涤痰汤作用于冠心病（CHD）的机制。方法 检索涤痰汤活性化合物,筛选CHD和正常人的差异基因,筛选疾病靶点。利用Cytoscape构建“中药-活性成分-基因靶点”网络图,将涤痰汤和CHD交集靶点构建相互作用网络图,进行分子对接生物活性验证。结果 涤痰汤治疗CHD的核心活性成分是柚皮素、槲皮素等,核心靶点有RELA、MAPK1等;涤痰汤治疗CHD的生物学通路主要依赖于MAPK信号、PI3K-AKT相关信号通路等,其功能主要为调节脂质代谢及调控细胞凋亡、炎症反应等,分子对接结果显示,活性成分与其靶点之间有较好的结合活性,β-谷甾醇与MAPK3的对接分数最高。结论 涤痰汤可通过多活性成分、多基因靶点、多通路治疗CHD,其网络药理学研究可为涤痰汤今后广泛使用提供理论支撑。     

基于网络药理学及分子对接研究黄芪-党参治疗胃癌的分子生物学机制

目的 采用网络药理学及分子对接研究黄芪-党参有效成分治疗胃癌的分子生物学机制。方法 采用中药系统药理学数据库与分析平台检索并收集黄芪与党参的活性成分及其对应靶点。通过人类孟德尔遗传数据库和人类基因组注释数据库收集与胃癌相关靶点,并与药物成分所对应的靶点相比较,筛选出相同部分,即获得黄芪-党参与胃癌重合的潜在靶点。采用可视化Cytoscape3.9.0软件建立对药物与疾病靶点相映射得到黄芪-党参治疗胃癌的作用靶点,运用STRING软件构建“化合物-靶点”作用网络与蛋白质相互作用网络,筛选发挥治疗作用的关键成分与关键靶点,对关键靶点进行基因本体和京都基因与基因组百科全书富集分析获知其潜在的作用机制。结果 共筛选出黄芪-党参63个候选活性成分,主要发挥抗胃癌的活性成分有木犀草素、槲皮素、山柰酚、异鼠李素等6个,主要作用靶点有CCND1、MYC、TP53、FOS、MCL1、CDK4、RUNX2等13个。主要集中于有丝分裂细胞周期的调控、DNA转录的激活、多种肽酶活性等生物学过程,以及磷酸肌醇-3激酶/蛋白激酶B信号通路、P53信号通路等生物学通路。分子对接结果表明药物有效成分与对应靶点均具有较...     

基于网络药理学和分子对接技术探究脾积丸治疗胰腺癌的分子机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术探究脾积丸治疗胰腺癌的潜在通路与物质基础。方法 以口服生物利用度（OB）≥30%与类药性（DL）≥0.18为筛选条件,在中药系统药理学平台（TCMSP）数据库获取脾积丸主要活性成分及关键靶点,利用GeneCards、OMIM、PharmGkb和TDD数据库获得胰腺癌主要靶点;绘制Venn图,构建主要成分–关键靶点网络图,绘制蛋白互作（PPI）网络;进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,最后以分子对接来验证所得靶点。结果 筛选得到32个活性成分,预测获得210个靶点,核心基因17个;脾积丸治疗胰腺癌的活性成分是槲皮素、山柰酚、柚皮素、芒柄花黄素、川陈皮素。GO功能富集分析得到生物过程（BP）2 409个、细胞组成（CC）91个、分子功能（MF）14个;KEGG通路富集分析获得179条通路。核心成分与主要核心靶点有一定的结合活性,其中槲皮素与HIF1A靶点对接活性最好。结论 脾积丸可通过多成分、多靶点和多通路发挥治疗胰腺癌的作用,为后续探究脾积丸治疗胰腺癌提供研究思路。     

基于网络药理学和验证实验探讨蒲黄治疗脊髓损伤的分子机制

目的 利用网络药理学和实验验证探讨蒲黄治疗脊髓损伤的分子机制。方法 使用TCMSP数据库及文献资料筛选蒲黄的有效成分及其对应靶点,使用DrugBank、OMIM、TTD、GeneCard数据库获得脊髓损伤相关靶点。Cytoscape构建蒲黄抗脊髓损伤靶点蛋白相互作用（PPI）网络图及“药物–化合物–靶点”网络图,根据网络图中各靶点的拓扑学参数筛选出蒲黄抗脊髓损伤关键靶点及关键成分。使用DAVID数据库对蒲黄抗脊髓损伤靶点进行基因本体论（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。采用AutodockVina软件对关键化合物与关键靶点蛋白进行分子对接验证。动物实验观察蒲黄对脊髓损伤大鼠后肢运动神经功能的影响及对关键靶点蛋白m RNA表达的影响。结果 共筛选出花生四烯酸、异鼠李素、β谷甾醇、山柰酚、棕榈酸睾酮、山柰酚-3-O-α-L-鼠李糖基（1→2）-β-D-葡萄糖苷、槲皮素、异鼠李素-3-O-新橙皮苷、香蒲新苷等活性成分。PPI网络分析显示,肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素（IL）-6、蛋白激酶B(AKT1)、IL-1B、胱天蛋白酶3(CASP3)等蛋白可能在脊髓损伤的...     

消食颗粒化学成分鉴定及其治疗功能性消化不良的潜在作用机制研究

目的 对消食颗粒进行化学成分鉴定,并探讨其治疗功能性消化不良（FD）的潜在作用机制。方法 首先采用超高效液相色谱串联四极杆飞行时间质谱对消食颗粒进行成分分析,再利用网络药理学方法筛选消食颗粒治疗FD的潜在作用靶点。利用AutoDock Tools 1.5.6软件对核心成分、靶点进行分子对接。结果 从消食颗粒中共鉴定出53种主要化学成分,主要是黄酮类与有机酸类化合物。网络药理学筛选出槲皮素、异鼠李素、山柰酚、芦丁等核心成分与雌激素受体（ESR1）、信号转导与转录激活因子（STAT3）、雄激素受体（AR）、细胞肿瘤抗原（TP53）、乳腺癌组织中缺氧诱导因子1亚基α(HIF1A)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶（SRC）6个核心靶点,获得磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）-蛋白激酶B(Akt)、晚期糖基化产物（AGE）-晚期糖基化终末产物受体（RAGE）、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）等主要信号通路。分子对接结果表明,核心成分与核心靶点间具有较好的对接活性。结论 消食颗粒可能是通过槲皮素、异鼠李素、山柰酚等活性成分作用于STAT3、HIF1A、SRC等靶点,调节PI3K-Akt、AGE-RAGE、MAP...     

基于网络药理学和分子对接探讨康艾注射液治疗乳腺癌的作用机制

目的利用网络药理学和分子对接探讨康艾注射液治疗乳腺癌的分子机制。方法该研究起止时间为 2021年 3—6月。资料来源是通过中药系统药理学数据库与分析平台( TCMSP)、 Swiss Target Prediction数据库挖掘康艾注射液的化学成分及靶点，借助 Uniprot数据库进行基因名称校正，在 GeneCards、OMIM数据库中检索乳腺癌疾病的相关靶点，利用 Venny 2.1在线软件获取药物与疾病的共同靶点，由 Cytoscape 3.7.2绘制药物 -成分 -靶点 -疾病网络， STRING数据库在线绘制蛋白互作网络，基于 DAVID数据库对靶点进行基因本体( GO)和京都基因与基因组百科全书( KEGG)富集分析，运用 AutoDock Vina软件对康艾注射液的关键的活性成分和作用靶点进行分子对接验证。结果康艾注射液的 32个有效成分通过调控 125个靶点和 104条通路对乳腺癌产生作用， 4个关键的化合物分别为异鼠李素、槲皮素、山柰酚、氧化苦参碱，可通过肿瘤抑制蛋白( TP53)、消旋 -α丝氨酸 /苏氨酸蛋白激酶( AKT1)、核转录因子激活蛋白 -1(JUN)、丝裂原活化蛋白激酶 1(MAPK1)、肿瘤坏死因子(TNF)外等关键靶蛋白介导癌症途径、 TNF、低氧诱导因子 -1(HIF-1)、磷脂酰肌醇 -3-激酶 -丝氨酸 /苏氨酸蛋白激酶( PI3K-Akt)、凋亡途径、核苷酸结合寡聚化结构域( NOD)样受体、 T细胞受体等信号通路发挥抗乳腺癌作用。分子对接表明筛选的靶点蛋白与有效活性成分具有较好的结合活性。结论康艾注射液治疗乳腺癌具有多成分、多靶点、多途径的作用特点，该研究结果为康艾注射液的临床应用及其机制研究提供了理论依据。